4O1A | Genus

Total Genus 174

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	174
sequence length	480
structure length	471
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKRTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structural Basis for Resistance to Diverse Classes of NAMPT Inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	174
structure length	471
sequence length	480
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2013-12-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4o1aA02

1JRCA 3NZ1A 1C9DA 2RDUA 5EKYA 3HBLA 3O6YX 1QMLA 2QCLA 3RLUA 3LBCA 3TFXA 2V8ZA 3M44A 3ATZA 3B06A 3UWVA 2QCGA 4XUGA 2CLKA 3P5YA 5FF3A 4AMAA 3RF9A 2BLEA 2E09A 1SO6A 1VCGA 2DJLA 3BG3A 3RK8A 1GYLA 1LRNA 1TO3A 3VCRA 1TTQA 3QW4B 2E6DA 1LM1A 4DQWA 3LTYA 1OFOA 2ZRZA 4O50A 3NEVA 5CPNA 2ABAA 2V5BA 2TRSA 3NNTA 5HMSA 4A21A 4ZVJA 5DCBA 3CEPA 3R2GA 1GYNA 3LGEA 1F6KA 2ALDA 3W88A 5HUOA 4HNTA 1I4NA 2GUUA 5C55A 3GYEA 5F2IA 3HPXA 3LHUA 1FCQA 1UASA 4RX0A 5LZLA 4P2VA 5K9DA 2NZLA 3C2EA 3GNDA 3TK7A 1SFLA 3QPYA 4S1FA 3TR2A 4EF8A 3WJWA 4E2DA 2QCNA 4JS3A 1TQXA 2QJGA 4O1CA 4NJGA 3GR7A 4ZQRA 5F2LA 4E2BA 2C0AA 5CSSA 3U8GA 4IUOA 2CZDA 3KVMA 2ZCGA 2Y85A 3KRZA 4W9TA 3HG5A 3EX3A 3LI0A 4NU7A 4MZYA 3ABOA 3TFCA 4JTGA 2VFGA 1RVGA 5C6MA 4JX5A 4JGDA 1DOSA 2NWRA 4WXZA 5CPLA 5IBXC 4Z1DA 5KTLA 4EIVA 1X1OA 3NR0A 3E49A 2FQIA 3BW2A 3PAJA 3LCHA 1NSJA 1A5BA 2ISSA 4QAIA 3DFTA 1YTKA 1G7UA 3BW4A 4LY8A 3ANYA 3W2KA 5LSMA 1W37A 4AHPA 2YXGA 1TPUA 4XBKA 1EUAA 2Y88A 1OK4A 3DFSA 3NAVA 3EX2A 4UTUA 3E96A 4UC5A 1HG3A 3BVJA 2OMAA 1GG1A 2NX9A 3MUXA 4JTSA 1M7PA 3MI3A 5F2GA 2TYSA 2BWGA 1Q6QA 1EX5A 2E5BA 3CU2A 4Z1AA 2NLIA 2GQ9A 5BOOA 1JQXA 3LV6A 3C52A 4CQ8A 1LBLA 3O05A 3C8FA 1H7WA 5K9XA 3KXQA 3DI0A 3G8EA 3ZR4A 2H3BA 1H7RA 1MEHA 2HS8A 3JRKA 3I7RA 4LVFA 2FPTA 3S42A 2NV2A 1D3HA 5G5IA 2A7NA 3W70A 3CHVA 4ONVA 3QMTA 5HINA 4MLJA 4RZ5A 4RJEA 1H61A 3ZS4A 3LHVA 4PL1A 1GOXA 2R91A 3GKAA 4GRSA 2Y62A 1OF6A 4I7UA 5KITA 3RMJA 3KVLA 4LVGA 1Z42A 5HWMA 5G1TA 4PL2A 3W7JA 4QNEA 2O7SA 3IVSA 3TSMA 3MHFA 2Y89A 3OVPA 2R14A 1LP6A 3SECA 2NUXA 3G1SA 2GVLA 3CWNA 1DVJA 1LRQA 1OFEA 5EL1A 4LU0A 3EWXA 2Z6JA 2CLIA 3W2JA 1KV8A 3M0ZA 3UYCA 3A5VA 3GDTA 4EF9A 4O15A 1B4KA 1GVRA 6ALDA 4LWWA 1TPWA 4O18A 2GVJA 4FX6M 4PFMA 5AHEA 1YXDA 5D37A 3LBMA 3DFNA 1KFEA 4FEZA 1FWWA 4CQ9A 1UCWA 4WY0B 1F74A 3TQKA 3NYZA 3NM1A 1NF7A 3PBUA 1A5CA 3TA6A 2R94A 4S2BA 1TSIA 1FUYA 1SZEA 1DQWA 3W85A 4CQAA 4CCEA 1FXQA 1H7PA 2ZYFA 1H1YA 4KFNA 2ZZ2A 2QUUA 1TJPA 2ZZ6A 1OX4B 2JGQA 3HPZA 3W7EA 3I6RA 1EPXA 4GFSA 5D2TA 4C1LA 5FEWA 3TQVA 3W07A 3M43A 1RZMA 2RFGA 5HWNA 1G69A 3LHYA 3NQ8A 4JYDA 2YGYA 1KFBA 4BWLC 2C16A 3W3OA 4LUJA 4PODA 1UBSA 2X1RA 5CZTA 3NPWA 4O13A 3TXZA 1O5XA 3GXNA 1TPEA 3B8DA 2E77A 1RQEA 3P84A 1S5TA 5HULA 5KZMA 2FFCA 1YYAA 4IX2A 3PC0A 3IGUA 3IRDA 2J24A 3CT7A 4JDYA 2E6FA 2E5DA 3R89A 4YCOA 4IPIA 4L4LA 2C14A 3PY2A 1EEPA 1SO4A 2QJIA 1IIGA 1VJIA 3N73A 2CZ5A 3EKZA 2VFIA 1SPQA 4HPJA 3L68A 1EP1A 3UWWA 1KBJA 3R13A 3LERA 4HNVA 2QAFA 3GDKA 4DBDA 4TIMA 4UFJA 2A7RA 2RHGA 3FS2A 2I9EA 1O95A 1C8VA 3W72A 2QJHA 2FB3A 4JY8A 1HFBA 1EIXA 2QAPA 3S1XA 5AYXA 4NX5A 4FNSA 3JR2A 3W71A 4ADSA 2J9ZA 4PA8A 1JCYA 3I65A 2CU0A 1XUZA 2QCMA 3CM4A 4Q4KA 5FESA 3PBYA 3THAA 1RD5A 2P10A 2CLEA 1ALDA 2VXNA 1WX0A 1OABA 4N9CA 3DENA 4K38A 2ZTKA 4ZQMA 5K9CA 1EUNA 2V2HA 3L0NA 3N2MA 1B57A 3NGJA 4XKYB 3CTLA 1O94A 4RXGA 3QPZA 4FHAA 2NX3A 3T78A 1FCVA 1AG1O 4MZ1A 2RDTA 2JKEA 1H60A 5CPMA 2VKZG 1ZALA 4LUIA 4IOTA 2VEIA 4BI6A 2B0MA 5AHMA 3IGSA 5HR7A 4GUHA 4LVDA 1P4CA 3DAQA 4YLWA 3MMTA 5EYWA 3G1YA 1W0MA 1JCMP 2PURA 1TTJA 1MEWA 3BGGA 1AMKA 3PB2A 5EY5A 3M41A 3VKJA 1JCNA 3O8AA 1EB3A 3LCIA 3LV5A 3F03K 1VHNA 3I7QA 5F2MA 4A22A 5FEZA 1B4EA 4M7TA 5DBUA 2ZZ4A 3D0CA 1KW1A 2CLHA 3M9YA 8TIMA 5I3JA 4C1KA 3W22A 1DBTA 3P80A 4NZJA 3L66A 4NNBA 2YW4A 3TW6A 4DXVA 1K3UA 1SZFA 1VRDA 3MBFA 3NQAA 2B7OA 3MYPA 3SJ3A 1T8XA 4CNOA 1GZGA 3ZWTA 1QAPA 4I7WA 2VENA 1Q3NA 2Z2UA 3L2IA 1XDLA 4UNKA 3IIXA 4JTEA 3ZFHA 5I3KA 1ZCOA 4OE7A 4H4IA 4WD0A 5HR6A 3IGXA 4JICA 3TMQA 5L9FA 3L67A 2X16A 4JN6A 4IMCA 1H51A 4JTKA 3NL3A 4PC8A 4QM1A 4AF0B 1OJXA 3W7PA 3QQ1A 4AB4A 3IIZA 1JJKA 1QPQA 5IBXA 2PRHA 2W79A 3OEXA 1WBJA 1GT8A 4WZHA 3HGRA 1F76A 1K8YA 1QCWA 2H8ZA 3UWQA 1TV8A 2X1UA 4Z0SA 3WJZA 3NQMA 2ZQ0A 2YZRA 2ZZ3A 3OVRA 2CLFA 3EX4A 3B0VC 3MO7A 4GUGA 1G4TA 4IJBA 1KTBA 3G1VA 5I3HA 1CX9A 3UWZA 1LYXA 4AWTA 4N6EA 1ZAIA 1OFDA 4O1AA 4K6AA 3DXIA 3B04A 3FIGA 2ZTJA 3EWBX 2Q8LA 5F4SA 2H6RA 3T44A 2C15A 4O1DA 4IPJA 3TUUA 3SR7A 3GVGA 4JR5A 3Q58A 3LRMA 3USBA 3W7NA 1QPNA 1X6UA 3C0JA 3FOKA 4UFIA 4NJJA 5LHFA 3M16A 3TNOA 3C2FA 1MXSA 5U4NA 3NQDA 1TPB1 3FA5A 3FJ6A 3L5MA 3CIXA 1JVNA 3W74A 1H63A 1SSGA 5DCDA 3W1AA 2NXIA 5BMXA 4UNLA 1TPC1 2H90A 3BGJA 4WOZA 4WJEA 1ML1A 4GBUA 5A5WA 2Y7FA 3W7KA 4TX9A 5D32A 4ZL1A 2E68A 2G95A 5AC6A 1ZAHA 4QSHA 3BG9A 1VPXA 1OVDA 1KBIA 4TMBA 5G4EA 4N4QA 4JY9A 1XI3A 3WJYA 4R34A 5TIMA 3C3NA 1JCXA 1NFBA 1GJPA 2GOUA 4FIQA 3W1MA 2C19A 5KMYA 5I3IA 4JDBA 4O16A 4UTKA 4CNNA 1PVNA 3GAKA 3L0GA 1R47A 1IXPA 4YWIA 3PUEA 1W5MA 3LHWA 1R2TA 4LC8A 5BW6A 3S6DA 4UR8A 3YPIA 3M5VA 2YX0A 2JKPA 1A50A 3KHJA 2OCZA 4U4MA 4E38A 2DZSA 4AEOA 3I7SA 1Z41A 3UXDA 3TU9A 3DKLA 3BK0A 1AW5A 1OK6A 2G97A 4LT9A 4UTWA 1FDYA 3E02A 1F05A 4LS1A 3W1TA 1I45A 3W7LA 3W7HA 3DFOA 4WY0A 3W7MA 1SUXA 4A2RA 4DO5A 2FB2A 4X2RA 1XKYA 2DP3A 3MP5A 2WKJA 3STFA 1XBVA 4B5NA 2YSWA 3TAOA 1B9BA 2VFFA 3G1XA 2WV8A 2FJKA 3B05A 4ICNA 2TSYA 1QFEA 1TPH1 1X7FA 2JBMA 3ATYA 4RV8A 3SSJA 2XFWA 3HJZA 1OX4A 2AAMA 5AN7A 2VOMA 3M5ZA 3P82A 4UUIA 1L2UA 4ORIA 4BK9A 1KLZA 3M47A 4HHPA 3I68A 4JTJA 3WK3A 3LTSA 2OZ0A 4DELA 4MY1A 1QO5A 1Y0EA 1VYSX 3LXAA 3P5ZA 4NXSA 5L6UA 2B7QA 1W3NA 5G2HA 3HGSA 3NQVA 5CPOA 3H54A 2W6RA 3IIVA 5ABTA 4IMGA 1TPDA 1FCUA 5KINA 3U2OA 3RU6A 1TJRA 1RR2A 3W75A 1MZHA 1Q6LA 1YDNA 4ZQCA 2LLEA 3LI1A 3UZ5A 1X1ZA 3EKLA 1C29A 3FYOA 3BARA 2E5CA 3F4NA 2QCHA 3GIYA 3MBDA 3DFPA 2GJLA 5K2ZA 2YDAA 3P62A 5EA9A 3PVFA 2B4GA 3TC6A 1KLYA 3G0SA 2PCQA 5HUPA 3SGUA 4I7VA 5EBUA 3W1XA 3G22A 3KAOA 4ZQNA 3GDRA 1JUBA 3H53A 3F1QA 3TKFA 3RLVA 4DPQA 1I2PA 1F6PA 2HSAA 4Z0JA 3A22A 1OFRA 3OBKA 1KA9F 4CLMA 1I2RA 5AYZA 2WSYA 4HPXA 4DO4A 2X30A 3NQ7A 5HQEA 1VYRA 2G96A 3QSRA 4Y96A 4Z08A 3EEGA 3CC1A 3S5NA 3UPWA 4FO4A 3HPSA 2EKCA 3CPRA 3FKKA 3KRUA 5CSRA 4MIMA 2FDSA 4HKPA 3QH2A 3A5FA 1VR6A 2E6AA 5DXYA 3TXVA 4UTJA 4O11A 1YDOA 4R53A 4UTTC 1H7XA 5LNVA 5AYYA 1OG0A 5DLCA 2EGZA 4ADUA 1WAUA 2GQAA 3FYPA 3B0UX 4QJ1A 2KZHA 1GTEA 4RKAA 3W7CA 4IGHA 1H62A 4Q33A 2C3ZA 2OT0A 5AHFA 1W1ZA 3DKJA 4XKYA 4MZ8A 2QUTA 1TMHA 1KFKA 4FXSA 4UTIA 2D73A 3IEBA 2ZZ1A 1MEIA 4NXKA 2IQTA 3NQ2A 3PSVA 3NO5A 4L4MA 3NXFA 1W3TA 4FB7A 2YFOA 1H7OA 4KWVA 1THFD 3UY7A 1VZWA 2DORA 2J9XA 3DHFA 3LX9A 3C61A 3JS3A 2NUWA 3T40A 4XWUA 5EMUA 3MJYA 4IQLA 4QQ3A 3IV3A 3MWAA 1ICPA 1QOPA 2ZBTA 3L65A 1L6WA 3W73A 4PEKA 4FX8A 3CB8A 3MHUA 4A29A 1IXQA 3BPWA 1F7BA 1WBHA 4MFDA 2OT1A 1T99A 1ZFJA 1ADOA 5C5YA 4O1BA 4O52A 3QM3A 2WSQA 3NL2A 3V75A 1U5JA 1ICQA 2VEKA 4XTIA 3LCWA 5K4XA 1TPVA 4JIQA 2PE4A 1ME7A 4H6KA 3TW7A 1BWKA 1HTIA 4NUWA 4YXGA 5AB3A 4K7VA 7TIMA 1OYBA 4JTIA 1JCLA 5D02A 3UZJA 1KFCA 4LS0A 1YTDA 2VFDA 2WNNA 4MPQA 1JUEA 3O06A 2B7NA 3FJLA 3LLDA 4KFPA 4AVFA 2WO5A 4J9JA 4MY9A 4NZFA 1W31A 3BLIA 3NQEA 1Q6OA 4RXFA 1G4PA 1KM6A 3EWYA 5E93A 2HTMA 3PUDA 3RNDA 1SW0A 3E9AA 5CZ0A 4LW7A 1IIHA 4K39A 1EP3A 4AF0A 1EWDA 5C2XA 4FNTA 1HO4A 2NXHA 2ZZ5A 1DJQA 2UV8G 3W86A 1OFPA 2CZEA 2AQWA 3EXTA 1T0OA 4JYFA 3NQFA 1PV8A 1GTHA 2ZRWA 3B4UA 3OVQA 4N9EA 4FIRA 4QIUA 5LNUA 1VHCA 2A21A 1G4SA 3L5LA 5DXXA 3W7OA 3W23A 1TV7A 4AH7A 4JTTA 2FTPA 4O14A 3W1NA 2YYUA 4LOCA 4FNPA 3SI9A 5FI8A 2VFEA 1K8XA 3PBVA 2X1TA 2ZRXA 4LVBA 4ORMA 1I2QA 2J88A 2YCEA 5G4WA 3BO9A 1KM2A 3ABSA 2Q3RA 4UTHA 4GUIA 2GJNA 1LOSA 1OYCA 3A21A 1XUUA 3W84A 4CNPA 3G8RA 4UXDA 3CIWA 4MOZA 1FWTA 1QPRA 1W56A 1YPFA 4N6FA 3UQNA 3N34A 1P0NA 4OV4A 3GZ3A 4O8RA 4QISA 4N9DA 1J4EA 3QRHA 5TBOA 2HMCA 2Y6ZA 1HL2A 2V81A 2GPTA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4O1AA

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