4ORMA

Crystal structure of plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenase bound with inhibitor dsm338 (n-[3,5-difluoro-4-(trifluoromethyl)phenyl]-5-methyl-2-(trifluoromethyl)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine)
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
YNPEFFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVSSPNTPGLRDNQEAGKLKNIILSVKEEIDNLEKNNIMNDEFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Fluorine Modulates Species Selectivity in the Triazolopyrimidine Class of Plasmodium falciparum Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Plasmodium falciparum
total genus 149
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2014-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ormA00
3LRKA 2A85A 3KRSA 1XXXA 3LHYA 2C15A 2Q3OA 4JYDA 5TIMA 1K8XA 2NXHA 4RCXA 1W3NA 3DENA 2QCEA 2Z0IA 3G8RA 5D2YA 4IGHA 3ZR4A 3PC0A 3O07A 4UFIA 4N2YA 3FYOA 4DBDA 3LBCA 1ALDA 1YLVA 1YYAA 3DFPA 4YXGA 3F1QA 3WFAA 1OF8A 4RK8A 1IIHA 3NQFA 2A7NA 1Q3NA 2DZWA 4M19A 3G0UA 4UFHA 3IVUA 2XN1A 3PG9A 5F1UA 5LNSA 3PUDA 3P80A 1W3TA 4RX0A 2FPTA 2ZZ3A 4CNPA 4TO8A 3FEMA 3LTSA 3TXVA 4UNKA 3TU9A 5E1QA 2CWNA 1OYCA 2RHGA 4WX2A 2EHHA 3I7SA 4O1CA 4EOUA 4DEFA 4FEZA 3QSTA 3TIMA 5LGZA 3BLIA 3KHJA 2BZNA 5FF2A 2X1SA 5G1YA 1KM2A 2VXNA 5D05A 1ZAHA 1YPIA 3E12A 5C2XA 3W7DA 1OG0A 1WYIA 1TPDA 2GOUA 1KW1A 1OYAA 4AB4A 2OT0A 3MJYA 3OHIA 1F76A 3RLVA 1TB3A 4RLIA 1C9DA 3T44A 1CI1A 2QCDA 2ABBA 2CLFA 3SZ8A 4RZ4A 1FWTA 2FB3A 4JY8A 1YXYA 5A8GA 1IXQA 1W54A 4CQ8A 4UTTA 2J9ZA 3TK7A 3FA5A 5D2WA 2PURA 1VC4A 4Z1BA 3PULA 2VKZG 5C54A 3O6CA 3PB2A 1XL9A 4HPJA 2ABAA 3LV6A 3LCGA 3NGJA 2Y89A 5DXXA 4UTMA 3TAOA 1OFQA 3N14A 4N9EA 1WV2A 5D02A 2W79A 1G7VA 2NV1A 2VFIA 1JCXA 1W0MA 3PSVA 3S9YA 5K9CA 1ZFJA 4O11A 3W85A 3GDLA 3EEGA 1FQ0A 4OBTA 1EWEA 3S42A 4M6PA 4X22A 2QDGA 1QO2A 3OVQA 1KTCA 1FDJA 2B4GA 2E6AA 4JTHA 3B0UX 2UV8G 4IWWA 4IPIA 3QMRA 4YLWA 1F73A 4N02A 1WOAA 2B7PA 1DHPA 5BOOA 4JTSA 1A50A 5FEXA 2ZYFA 3GDRA 1BWKA 3NQ8A 2BXVA 2FQIA 5DELA 3GKFA 1X7FA 4RR4A 2RDUA 3GLCA 1T99A 5CZJA 5DLCA 3SFKA 2DORA 1I2RA 1OF6A 1YDOA 2C18A 3G18A 3O05A 2X2GA 2YYUA 4FNUA 4S2BA 3G22A 1GEQA 3R2GA 1LDCA 4TMBA 2G5WA 1QPNA 2W0UA 5LNRA 4JTLA 2WSYA 2CLMA 3HQ1A 3TE9A 3WJSA 3S5ZA 1WXJA 3R8RA 2ZDRA 4DPPA 1XM3A 3EX3A 4AXKA 4JGDA 1YXDA 1T8XA 3BG9A 4JTFA 3TC6A 3V75A 3I6RA 2YW4A 3DFSA 3L5LA 5CPOA 4LC8A 1ME9A 3OIXA 3R12A 3ATYA 3L66A 4GBUA 4U4MA 1I2QA 2CW6A 1PE1A 4K8EA 4IOTA 3SI9A 3WK2A 3KRUA 1SFJA 5BW6A 2ZA1A 1DOSA 1PIIA 2WJZA 1ONRA 3DFTA 1NF0A 1SU5A 5G5IA 1B57A 4O14A 3RFAA 3BARA 5F2GA 4LY8A 4PL1A 2GJNA 5EA9A 1SW0A 4IQLA 4ZMGA 2HMCA 3HF3A 3HG3A 3W70A 4MY1A 3W7GA 5F2MA 3NXFA 4UTWC 4GFSA 3UPBA 2IQTA 2RH9A 3M6YA 3L65A 3GAKA 2H6RA 5G2IA 3STGA 1VPXA 3TW7A 4JTJA 4FHAA 4QQ3A 2FTPA 3NQCA 1CX9A 1UBSA 4DBEA 1TV8A 3QH2A 5D32A 1GVSA 1N55A 3SGZA 4WD0A 5LNVA 1P4CA 3Q94A 4PH6A 2V5BA 3MI6A 3OA3A 3QEZA 1VZWA 4K38A 3THQA 3AJXA 1PCKA 1TQXA 3UZ5A 4AHPA 1IF2A 4S1FA 1H7PA 2Y7EA 1VYPX 1I8JA 3GNNA 3PBUA 4RXGA 3EXSA 4M5PA 2WPBA 3P60A 5J5RA 2QCHA 3NPWA 5I3GA 4GNJA 3VCRA 4IMFA 1OHLA 1M6JA 3U6WA 3B05A 1QWGA 1SO4A 4K8HA 3C52A 2CZFA 2V2HA 4MYXA 5CGQA 4O16A 1Q6RA 3NQEA 3HMJG 3W2JA 2ATSA 5I3HA 1SO6A 3O8AA 1XBXA 4JTEA 1N7KA 3CB8A 4UFMA 1MSSA 1XFBA 1G69A 3MMTA 1TPWA 2ATMA 3S1UA 5TBOA 2V30A 1SZFA 2V8ZA 2GVGA 1UJPA 4LVAA 1EX5A 1PV8A 5IBXA 4MJZA 3VE9A 5LNWA 4GXMA 3EXTA 1H62A 1KFKA 1O5KA 3PSWA 1VCFA 1JRBA 4PEKA 1THFD 1Z41A 2ZZ4A 2A0NA 4NJGA 4O19A 4LRSA 1HTIA 1W5NA 2HS6A 5G4WA 3WJYA 5AN7A 1Z48A 4MOZA 5K9DA 1JCMP 2E68A 1LRQA 5AC7A 1FCBA 1O4UA 4AAJA 3ABQA 5I3FA 1JCNA 1LLZA 1GG1A 3H54A 3NL6A 2ZZ2A 5HNRA 4WY0F 1GTHA 1YDVA 1EP3A 4FF7A 1DBTA 3G1FA 3MW7A 3N73A 5CZ0A 3NL5A 3PY2A 3W1NA 4C1KA 2NWRA 4LV4A 1LYXA 4WUIA 1H1YA 2FPYA 3CEPA 4ZVJA 3EWWA 5AHLA 5AHNA 4GC4A 4IMCA 2BX7A 3YPIA 1LOQA 4AWTA 3P8IA 2RDWA 1VHCA 5EMUA 1K8YA 2ZTKA 2J88A 3TQVA 1JQXA 1TPB1 2XN2A 3B8DA 2RDTA 3TW6A 3CHVA 2OZ0A 2ZRZA 2QCMA 2TMDA 3BVJA 3W7QA 5FF7A 1X1ZA 5H91A 5F2IA 3FOKA 2C6QA 3W87A 3D0CA 4UIOA 3W1QA 4FXSA 3W1RA 3GR7A 4X9SA 2QUVA 3FKKA 4UR7A 3CEUA 4MPQA 4BI5A 1JCYA 3LDVA 1G4PA 4PTNA 5DCBA 4H3DA 4UUIA 4XKYB 3W23A 3DGRA 5FI8A 2WNNA 3W2KA 4MY8A 4TR9A 1B3OA 3G1HA 3ABOA 1UUOA 3M9YA 3M16A 3Q2DA 4N9CA 2Z6IA 4TIMA 1SQ7A 1WX0A 4WOQA 4CQ9A 3CC1A 4JN6A 3TQKA 4A29A 3GDMA 5FF0A 4R34A 1G4SA 2GJLA 3NAVA 2LLEA 3MO7A 4LVFA 4JYFA 2Y62A 1LORA 4ZQNA 1OFRA 1AW5A 5BNKA 1V5XA 3O63A 1JR1A 4B5NA 1Q6OA 4ORIA 1HUVA 1O95A 1ZAJA 1L6SA 5LHFA 4NNBA 1VGAA 1JQVA 1GVOA 3TKFA 5HR6A 1H1ZA 1YXCA 2J6XA 4NNCA 3LOTA 4JDYA 4JS3A 1FXPA 3A24A 1JRCA 5K4XA 1X6UA 1LCOA 5A5WA 2PRHA 1VLWA 1ZALA 4LV9A 3W1TA 3G0SA 4QITA 1NEYA 2RKXA 3W7MA 4N9BA 4HIBA 1KFLA 4NJJA 5AYYA 3PS7A 4DO4A 1B9BA 2NUYA 2QCLA 4QNWA 4MYAA 3LX9A 1TSIA 2GUUA 2YPIA 4ALDA 1U5JA 3NR0A 3C61A 3NQMA 1LTDA 3NVTA 1OFAA 3TDFA 1E51A 1WQ5A 3IGUA 3CT7A 1QO5A 3QYQA 3CQ0A 4OQVA 3W74A 5LGXA 4CNNA 3G3DA 3MI2A 5DCDA 3QMTA 4AF0A 2QCNA 4JEQA 4DF2A 3ANYA 2ISVA 4MLRA 1AMKA 3DFQA 4K39A 4P61A 1OVDA 3UPWA 3W88A 3TNOA 3DU0A 1FY6A 1M7OA 1PHWA 3TH6A 5KSWA 3NQGA 2QDHA 1TTJA 1LZOA 2H8ZA 3PVFA 3LRLA 1HO4A 3CPRA 2EKCA 4NU7A 2W6RA 2VC6A 4O15A 5EKYA 3DFOA 1OX5A 1KFCA 3G1SA 3RU6A 1TPC1 1M5WA 3VNDA 3QPYA 1NFBA 2WOQA 4GUHA 5D37A 2I1OA 2E77A 5AYXA 5KINA 4OGZA 4JTIA 2CFFA 1LRNA 3KXQA 1LROA 3A5FA 2KZHA 1F05A 4GUJA 4JICA 3MP4A 4JTTA 4O1BA 4UC5A 1TTPA 1K7XA 5EY5A 1NAL1 3HOJA 4H6KA 4Z1AA 1WBJA 4Y90A 3T7VA 1P0KA 1SZNA 4RZ5A 2NX9A 3USBA 3IEBA 4WOZA 3LLFA 1YPFA 2G96A 1QOPA 3L5MA 3VFLA 3C56A 4N9DA 5EL1A 4UTWA 3GXTA 1SZEA 3MBDA 2FJKA 5LSMA 3I65A 5LZLA 4O50A 4XZ9A 3MHGA 2I9EA 5KZDA 1FDZA 3W73A 1KFBA 3M43A 1SO5A 1XI3A 3PB0A 2DZVA 3HPSA 5EPDA 5G2WA 1RD5A 3N2XA 2G95A 4A2RA 4TMCA 1C8VA 5E93A 2F84A 3EX4A 1P1XA 3W75A 5F4XA 4BI7A 8TIMA 4ZQCA 2VFHA 1S5WA 1ICQA 2JGYA 4K37A 4KFPA 3G1XA 4M6QA 3W7RA 4A2SA 4ZZ9A 2GQ8A 1TPUA 1AL7A 2YXGA 1UASA 4CCCA 5EBUA 2GVJA 4E38A 3LCHA 2J9YA 3BLFA 4D2JA 1D9EA 3E02A 1T0OA 5KMYA 5HINA 3EXRA 3H55A 3IIVA 5CKSA 3WJZA 5J5DA 3TV8A 1RVGA 1XUUA 4FX6M 3BW4A 4Z08A 2QJIA 1PS9A 2PC4A 4O13A 4XTDA 4FNRA 1YTKA 4JX4A 1MEHA 5CPLA 4OU1A 1ZY9A 3R89A 4Z0JA 1WDWA 2NV2A 4UMBA 2V81A 1P0NA 3LV5A 2WSRA 2ZRVA 3QFEA 1YTEA 3MYPA 5HR7A 3NQ6A 1ICSA 2QJHA 3TC7A 1OFBA 3LHWA 5DCEA 4DF1A 2NXGA 3PM6A 1RPXA 1UB3A 3UZJA 1OYBA 3PUEA 1FWRA 1R47A 1K7FA 2DZPA 3QQ1A 5AHIA 1W5MA 1OABA 3MP3A 1W37A 3LGEA 4JTUA 3EX6A 3NZ1A 5D33A 5F4SA 5AHFA 5H2ZA 1VYSX 1A5SA 1KFEA 1RV8A 1SZGA 3B06A 1RQHA 1D3HA 4WY0B 3LTPA 5FEWA 1W31A 3L67A 2NUWA 2X1RA 5GVJA 2YR1A 1I4NA 5AYZA 3KVKA 2PE4A 3O6DA 5AHEA 3T40A 3W84A 3W3OA 1FDYA 4E2DA 1TPEA 3M5ZA 3FS2A 1EWDA 1W5PA 4IX0A 1PHQA 4XKYA 3W2LA 1UUMA 5LNUA 4OT7A 4QISA 3LM7A 3CM4A 1H61A 2QAPA 2Q8LA 2R14A 1XBYA 2E5DA 2P10A 3L21A 3G8EA 3HIJA 2GQAA 4XBKA 2JKEA 4WXZA 3O15A 3BG3A 1Z44A 3CWOX 4N6FA 3NPXA 4JD4A 3GNDA 2ZCGA 3P5YA 4YL2A 1DKWA 2DP3A 1PVNA 1FBAA 1H51A 4NQ1A 1F74A 2A6NA 1KBJA 4FB7A 3LCFA 2E1DA 3W1MA 3SECA 4NX5A 1BWLA 4XBSA 1VS1A 5HMSA 2HS8A 1FX6A 3A9IA 1AK5A 3W7HA 1QNVA 4KKXA 4G1KA 5FESA 2NX3A 1G4EA 3R5EA 4RXFA 4NUWA 1L6WA 1QR7A 3G3MA 2AGKA 2B7QA 3EKLA 3W7KA 1TO3A 2A7PA 2DZSA 3UXAA 3GX9A 2R91A 4ZL1A 5ABTA 4IUOA 3FLUA 4N6EA 4AWSA 3NM3A 3FJ6A 4GUFA 3W9ZA 3L0GA 3Q58A 2Y85A 2FFCA 1DQXA 5F2LA 4HNVA 2VFEA 2X30A 4JYEA 4S2CA 5D38A 4DXVA 4ML9A 3HGJA 3N3MA 1AG1O 1RQBA 3UY8A 5K9XA 4IPJA 4GJ1A 1R46A 3MP5A 1RZMA 2J24A 4K7VA 4IMDA 3NYZA 4LUJA 2ZRUA 4BR1A 1H63A 1C29A 4UTJA 3DHFA 2Z6JA 4FNTA 4RJEA 2R94A 4HN4A 5F4WA 1ZNNA 2QF7A 4ZQMA 1F6PA 3GK0A 4JNMA 4QIUA 3TX9A 3B0PA 3PF3A 4NJHA 3GDTA 3RLUA 1WAUA 1R2TA 1KBIA 2VELA 4A21A 3N9RA 2Y6ZA 3GAYA 1SSGA 5LKYA 3LHZA 4K7YA 3A23A 1OK4A 2CLOA 3C2VA 5U7SA 2RFGA 5I3KA 4ZQPA 4O0ZA 3CU2A 1GVQA 2V2CA 4JTGA 4HSNA 1N8FA 1F6KA 2J9XA 3HPZA 1H5YA 2NUXA 3G1YA 3SR7A 3DI1A 5U4NA 3NL3A 1FXQA 2YFOA 4XUGA 4O18A 3N9SA 1J2WA 3QM3A 1JCJA 1W3IA 1I2NA 1LRTA 4Y9AA 1R30A 3IVSA 4UNLA 1IGSA 1BEUA 3W76A 4WQ6A 3C2FA 5K7JA 2VOMA 3T55A 4WZHA 4XQ6A 3VKJA 3TJXA 3VI2A 2JKPA 2O7QA 2A4AA 1Q45A 3KX6A 3UWVA 1VRDA 4O52A 5FF3A 3KVJA 3B04A 3P8JA 4M7TA 4FNSA 1O5XA 3M1ZA 5K3VA 3FIGA 1K8ZA 5BMXA 3SJ3A 4HKPA 1VCVA 3IIXA 3TFXA 4WXYA 4UMCA 5L6UA 5AC6A 1GVRA 4IMGA 3P84A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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