4OU1 | Genus

Total Genus 103

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	103
sequence length	247
structure length	247
Chain Sequence	PRYLKGWLEDVVQLSLRRPSVRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKDPSGLDVERDPIEYAKFMERYAVGLFISTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMYDFIVKESQIDDAYNLGADTVALIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIIINDENDLDIALRIGARFIGIAARDWETGEINKENQRKLISMIPSNVVKVAKEGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKELIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Small molecule probes to quantify the functional fraction of a specific protein in a cell with minimal folding equilibrium shifts. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Retro-aldolase, design RA114
molecule tags	Lyase
source organism	Sulfolobus solfataricus
total genus	103
structure length	247
sequence length	247
ec nomenclature	ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2014-02-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00218	IGPS	Indole-3-glycerol phosphate synthase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4ou1A00

3ZR4A 1M7OA 4IJBA 4RCXA 4MFDA 1F76A 3UWVA 1PCWA 5D2TA 1TQXA 1NF0A 3EB2A 3LCGA 1LBMA 2J27A 1YYAA 4UTTA 1DOSA 5I3GA 5FF0A 5F2LA 3S1XA 3LTYA 5H91A 3TE9A 1W3NA 1A5SA 3LCIA 3CLMA 2Y7DA 1X1OA 4ORMA 3W7MA 1G4TA 4MJZA 3NNTA 4NZFA 3QSRA 3UQNA 1FXQA 5LKYA 4HNVA 3TAOA 3ABOA 1H60A 3B8DA 1W5PA 4CCDA 4HN4A 4LVBA 3M6YA 2QJIA 3MYPA 3NYZA 3N3MA 3ABRA 3LBCA 2GUUA 5DCDA 2EHHA 4GE8A 1KFLA 4HNUA 1G6CA 3EWZA 2A21A 3L66A 2Z1BA 3NPVA 3QMTA 2DORA 1H51A 1H7XA 1W5NA 3BLIA 3EX1A 2XFWA 4X9SA 1H50A 4O0ZA 3S0CA 5DLCA 3TKFA 2NX9A 2Q3RA 4O4VA 5K9XA 3YPIA 3B0VC 5F1VA 1K8XA 5I3HA 4U28A 4QJ1A 2FB2A 1WXJA 2V2HA 1P5BA 4P2VA 1RZMA 2VELA 2W79A 1GG1A 2V8ZA 3W1LA 3NQGA 2Q8LA 4QAIA 5L9FA 4AAJA 1FWRA 3DKLA 4HPJA 2R94A 3I68A 3M5ZA 4IPJA 4IWWA 1OK4A 3I7QA 1I8JA 1W1ZA 1TPB1 4A3UA 4HSNA 1LRNA 3DAQA 1DJNA 1XL9A 5HWNA 3FJ6A 3GDKA 2V82A 4ADSA 1S5WA 4WZHA 4UFLA 2ZTKA 4O50A 4IXXA 1LRTA 3MP4A 3HG3A 5AHLA 3M9YA 4XUGA 2VKZG 1Q6QA 4LRTA 1PVNA 2ZZ7A 1D3HA 4Q4KA 3LBMA 1KFCA 2ZDRA 5FF7A 4DF1A 4GNJA 1LYXA 1GG0A 2QCCA 1KM4A 4MYXA 3VFLA 3W1AA 3FEMA 3IGXA 2Z6JA 3QW3A 2E68A 3VI2A 4EOUA 3LX9A 5E93A 3ZWSA 3TDFA 1XDMA 2Y89A 2YZRA 1KFJA 2WSQA 2C3ZA 3A24A 3MI2A 2ABAA 2CLIA 1IXOA 1DKWA 1FDJA 4NX0A 5D38A 1O5XA 1W3TA 1I2NA 2ZA2A 3NQ7A 2ZZ2A 4DELA 2QDGA 4B5NA 3HG5A 3DI1A 2QCLA 4DO4A 1N8FA 2RDWA 4IMDA 3C0JA 3ABSA 3W6YA 2Y63A 5DY3A 4Y9AA 2V0TA 3ABQA 4CCEA 1I2RA 3BO9A 1KTBA 3EKLA 3CQ0A 1EP2A 4M6PA 3TIMA 1LOLA 1EPXA 1P0KA 2NLIA 2BXVA 2V81A 4N02A 5K2ZA 3MBDA 3HGJA 3IVUA 5F2GA 3DFPA 3W2JA 2NUXA 1RPXA 3NM1A 1K02A 3HO8A 4MKNA 4NJIA 3IIVA 3PR2A 3L5AA 2VOMA 1FX6A 1KLYA 2JBMA 2WJZA 5G5IA 1PV8A 3UWYA 1XCFA 3P82A 2RH9A 2JGQA 3P8IA 1VS1A 3QZEA 4UIOA 2A2IA 3ZWTA 3W1TA 4EF8A 4BI5A 3DKJA 1PIIA 3S5ZA 1O60A 4LY8A 4AWSA 2P10A 1OJXA 1PE1A 2Z2UA 4QNWA 5CPNA 5CSSA 3A21A 1FCUA 2YXGA 1ZAJA 4MJMA 5AYXA 5LZLA 1OX5A 4FNRA 1E51A 1OYBA 3NVTA 1LLWA 1ALDA 4RXFA 2DJXA 2YFOA 1ZENA 4LUIA 1Z48A 1PHWA 1L6YA 3NM3A 3L9CA 2CLFA 3LRKA 1W37A 3FKKA 3IGUA 4KFOA 1XM3A 3C52A 3W7DA 1EB3A 1SW0A 2QR6A 3GKFA 2YSWA 3Q2DA 1Q45A 2HTMA 1VCGA 1XUZA 1MEHA 4UFJA 5EKYA 5CG7A 4RK8A 3BGGA 3LRLA 5MHBA 3M1ZA 2OZ0A 3OVRA 4FNTA 5HR6A 3B0UX 4WOQA 2C1HA 3TX9A 1JCJA 1RV8A 2A85A 2ZA1A 3CC1A 1EIXA 3C2FA 1SZEA 2YW4A 2E6DA 3QW4B 5D32A 2WSRA 4TR9A 2A7NA 1A50A 6ALDA 2GJNA 4K37A 3S1WA 2GPTA 3CIWA 1EUNA 2JKAA 1D3GA 4JXCA 5AFDA 5K3VA 3FFSA 3KRZA 1K7XA 3BARA 1TV5A 3WFAA 3RLUA 4L4MA 2Y7EA 2CZEA 3QFEA 4KWWA 1LZOA 3PB0A 4YLWA 1ME8A 1KBJA 1A53A 5G1YA 1T8XA 2J9XA 4QITA 3P74A 3V75A 4JTGA 2VEIA 4HNTA 2WO5A 5J5RA 4NVTA 4FNQA 3O6CA 1IXPA 1QNVA 4WX2A 5D2VA 2WNNA 3TXVA 4FO4A 1NF7A 1XBVA 5F4SA 3WJXA 1KW1A 1TO3A 4XZ9A 4Z1CA 5D05A 1EWEA 3NL6A 4K6AA 4MZ8A 5SWUA 3JR2A 3AJXA 4LU0A 5LNUA 4N9BA 1TTIA 3P84A 3E9AA 5I3IA 4TIMA 4O1BA 6TIMA 3B05A 1K8ZA 2EAWA 2G97A 4AF0B 4BFAA 4N4PA 2ZZ3A 3W2LA 4UTWC 3VCRA 2QDHA 2X16A 3NXFA 1QMLA 3SW6A 3L68A 5BOOA 5EBUA 4AB4A 2WKJA 1ZNNA 3MO7A 1O4UA 1IGSA 5AHEA 4H4IA 5T26A 1SZGA 4NNAA 4PFMA 3KOFA 3M41A 5I3FA 1XXXA 4AWTA 4MY1A 1VH7A 2G96A 2ZRVA 4QQ3A 4I7VA 2VEPA 4BWLC 1ME7A 3DGRA 4I7WA 2FFCA 1FY6A 1BWKA 2PRLA 2YYUA 4QM1A 2ZTJA 4O4WA 3LCHA 3G3MA 4UXDA 3LERA 3BW4A 1EP1A 1F73A 5CGQA 5KINA 3O15A 4PTNA 1YDNA 1KTNA 3W2MA 4YCOA 3NPWA 4NJGA 1OABA 1ZAHA 2XN1A 1T0OA 4BI6A 1EP3A 1YTKA 1TREA 1K8YA 2Y6ZA 5CZJA 2VC6A 3BG3A 4GUIA 1CX9A 2J24A 5DY2A 4HT3A 4UC5A 3P81A 4RKAA 4OT7A 1ZFJA 2AAMA 1WA3A 3T78A 1TQJA 1TJPA 3LGEA 5D04C 5TIMA 2WQPA 4LC6A 2IQTA 2Z6IA 4JX6A 2J88A 3EWYA 3W9ZA 1H61A 1PS9A 3VKJA 3M44A 4JTIA 1JCYA 4UR7A 3LLFA 5IM51 1M6JA 2ALDA 5L6UA 3PSVA 4LW7A 3W3OA 2DZWA 1D9EA 4U4MA 3C8FA 4IUOA 4DF2A 3W88A 2C0AA 4XTIA 4BK9A 4IX0A 5CZ0A 3UD6A 3NR0A 5H2ZA 4KKXA 1HUVA 1GZGA 5AYYA 3LV5A 1O95A 4Z1AA 1IXNA 3QQ0A 1HTIA 2OMAA 3W86A 1TCDA 3P80A 3H54A 1ZJIA 3CWNA 3I7RA 4K7VA 1TPFA 4XTDA 2PURA 4OE7A 4RZ4A 2A1YA 3W7RA 3LI0A 3NPUA 4FB7A 1FBAA 2OCZA 1TMHA 4TMBA 1W56A 3T44A 3BGJA 2ZRWA 3MI6A 1GYNA 4KFPA 4O18A 3GYEA 4ZQNA 4GXMA 1F6PA 1AW1A 3CHVA 3PSWA 1F05A 4IPIA 4K36A 4MLJA 3BK0A 1LP6A 4I9AA 4MIMA 2I1OA 5HUPA 3O8AA 1B3OA 2FQIA 1VYRA 1K7EA 3W1RA 4M5PA 5FEXA 4DPPA 3TK7A 4BR1A 2BX7A 1VZWA 2QEZA 3IRDA 1GTHA 4ADTA 2GQ8A 2V2CA 3O05A 1F6KA 1YPFA 3G8EA 2WOQA 4Q32A 3WJWA 1KV5A 1LCOA 1SFLA 1KM3A 3IGSA 3GKAA 3GXNA 3NL3A 3NOEA 2QCMA 1Z41A 1OYCA 2E77A 4O17A 3S1UA 3W74A 3UNDA 2BWGA 3W1PA 4IMGA 4RZ5A 4WXZA 4M7TA 2NV2A 4DBEA 5HULA 2KZHA 4TO8A 5F2IA 1JRCA 1J2WA 1BWLA 3PB2A 2NV1A 1P4CA 2NUWA 1LRQA 4JEQA 1GVFA 1CW2A 2YX0A 3TW7A 3GDLA 3D0CA 2E6YA 2C14A 3UZJA 1JQVA 1R47A 1OFDA 1SU5A 3P8JA 3QM3A 3WK2A 4FNSA 3PC0A 4Y96A 4Y6GA 4UTMA 1SZFA 4ZQOA 1WQ5A 4UFKA 3F4WA 2NXGA 2RHGA 4FHAA 1QCWA 3LHVA 3OA3A 3THAA 4L4LA 3M5XA 4QSHA 3W83A 2RFGA 1YLVA 2CZ5A 4MZ1A 4CNNA 3I65A 1GQNA 4ORIA 1H1ZA 5EMUA 3MP5A 1V7YA 4WQ6A 3RNDA 4NJKA 4LTSA 3W07A 1KM6A 3EX2A 3B4UA 3SY5A 2H8XA 2VFFA 1QO2A 5F2MA 3HMJG 4JNMA 1S3HA 1OF8A 2HS6A 1Q6RA 3G22A 3SSJA 4JYFA 3TQ0A 2PRMA 1W54A 4JTTA 5G2WA 5I3JA 2ZZ6A 4LS1A 3S5OA 2TPSA 1AG1O 1TPUA 5CZSA 1L6WA 3W7GA 1UUMA 2H6RA 1I4NA 1XUUA 1I2OA 1KTCA 2OT1A 1GYLA 5IBXC 4WJEA 3KRSA 1TB3A 4UTHA 2PE4A 5LNVA 1TJRA 2CZFA 2VFEA 1TV8A 1MSSA 3NZ1A 3WK1A 4DF0A 1SO5A 1PHQA 3TSMA 3M7WA 3L0NA 3CIXA 1FUYA 2QCEA 3M47A 4O54A 3KFTA 2ATMA 1EUAA 1QOQA 4N9EA 4JTEA 3STCA 3STEA 4LV4A 1HL2A 1VJIA 4ONVA 2LLEA 3LTSA 4N2YA 1AMKA 1ZALA 2FTPA 3UY8A 3DU0A 3UWQA 1KM0A 3PUOA 1A5BA 2CLMA 4NXSA 1SZNA 4CNPA 2ZFAA 2B4GA 4JICA 3KX6A 4FXRA 1F5ZA 2GVJA 1C8VA 4LVGA 3EX3A 3FIGA 1VYSX 3F1QA 1OK6A 3WJYA 5CPMA 3G1HA 1DVJA 2I14A 3R12A 3G0SA 3W2KA 3W76A 2C18A 5HQEA 4IOTA 3S5YA 5EL1A 3V1PA 4DXVA 4MVAA 4GUJA 2V9DA 1H1YA 3HPXA 4PH6A 4UFHA 1KFKA 3RF9A 2B0MA 2A4AA 1L2UA 3W73A 5LHEA 3A5FA 2A7RA 3EEGA 3MUXA 3T40A 4TX9A 2YCEA 2H3BA 1TPDA 4LRSA 5DN1A 2Y62A 1OFRA 3O06A 2ISWA 3BLFA 3LI1A 3NQ2A 4JIPA 4HNNA 1QWGA 3G1AA 3QSTA 5K4ZA 1LLZA 3ZS4A 5DXXA 3A9IA 2OJPA 4JDYA 3UZ5A 1AK5A 1SQ7A 1YDOA 3EWXA 2O7QA 4AWUA 3NA8A 4LUJA 3HJZA 1DL3A 3N9SA 4JTSA 4FXSA 3TSDA 3EX6A 3LDVA 5TBOA 2XN2A 3C3NA 3P7YA 1R30A 3WJZA 3SECA 4JN6A 1RR2A 3EX4A 1DV7A 3ANYA 4O19A 4IMFA 5LGXA 2V5LA 3UY7A 2E5DA 5HR7A 3CT7A 1GJPA 1R2SA 3DFQA 3W7OA 1F74A 3U2OA 1AL7A 1OYAA 3G1FA 3E02A 4IMEA 4OU1A 1KM2A 1R46A 3EWUA 5LGZA 3G0XA 1ME9A 1QFEA 2Y88A 3S8HA 1SO4A 3GK0A 3NQEA 3L21A 1JCLA 4JX5A 3G1XA 1X6UA 2EPHA 5DBUA 1VC4A 4XKYA 1TPH1 4UTUA 3BV4A 3EWWA 3QQ1A 1QPOA 1QDSA 3IIXA 4O11A 3PUEA 3CEUA 5KZDA 3G3DA 3R2GA 2Y61A 3B06A 3QC3A 1P0NA 2Y7GA 1HFBA 2BZNA 4XBSA 1TPC1 5D30A 3CPRA 4GJ1A 3P5ZA 5AHNA 3NDOA 4X22A 1G7VA 4CCCA 3W71A 5GVJA 2VXNA 1FQ0A 1JR1A 4GUFA 1L6SA 3T4CA 2Y70A 1VR6A 4UTWA 3TA6A 3W1UA 1YDVA 2WSYA 4PA8A 5HINA 3GDRA 3W85A 1NEYA 3TFCA 3GR7A 3QRHA 1BEUA 3NG3A 2DZVA 4YMZA 3BVJA 4O53A 5HMSA 1OX4B 5CKSA 1JCMP 3MP3A 4AHPA 5KTLA 3LCLA 1WBJA 4RX0A 3M16A 3W2NA 4O12A 1DJQA 1JULA 4O15A 3W75A 4BWLA 4QNEA 2VFHA 3HGRA 4O8RA 1YXYA 3FYOA 3DFOA 5U7SA 3R89A 2Q3OA 3TAKA 3GXPA 1VRDA 4OBTA 3CB8A 1SSGA 1T96A 3QMSA 4OQVA 5AHFA 3L5LA 4WY0B 1YXDA 2J6XA 4CLMA 2NWRA 3LHZA 2ZZ1A 4KFNA 2QCHA 1H5YA 2C13A 4BI7A 3PG9A 2UV8G 3I7SA 2QUUA 5I3KA 4Z1DA 4OGZA 4QIUA 3IIZA 3SI9A 4WD0A 2HSAA 2DZTA 3KRUA 2ISSA 4DO6A 4PCFA 3THQA 3GX9A 3NQMA 4MYAA 2A6NA 3LV6A 8TIMA 3R5EA 3ELFA 3FYPA 3RK8A 3KAOA 1B9BA 1KLZA 2AQWA 3B03A 5A8GA 1KM1A 3UWWA 1W31A 1Z44A 3E12A 4IGHA 4NX5A 1GVQA 2WV8A 2Q8ZA 1XBYA 2RDUA 5LNSA 3BW3A 1WAUA 3C2EA 2J9YA 1G4SA 3IIPA 5U4NA 1TPVA 1M7PA 5LNWA 3Q37A 2E5CA 4ZQCA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4OU1A

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