4OWGA

Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-pep complex
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
SRKFFVGGNWKMNGRKKNLGELITTLNAAKVPADTEVVCAPPTAYIDFARQKLDPKIAVAAQNCYKVTNGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALSEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKVIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-PEP complex
rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
molecule tags Isomerase
total genus 90
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 2014-02-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4owgA00
3F4NA 3M6YA 1JUKA 3G22A 4MYXA 4M7TA 4N9BA 1KV5A 1EUNA 4FNTA 5E93A 2ZBTA 3HGRA 4UTJA 4O4VA 2DJXA 3F4WA 2Q3OA 1Q6OA 3G3MA 2AAMA 3UPWA 1S5WA 2BSLA 1ML1A 4DBEA 2C19A 2CLLA 3G1AA 2DZWA 1QPNA 3LXBA 4A2SA 3QMTA 3PF3A 4NZFA 5FF4A 1W1ZA 1R30A 3USBA 3THQA 4O19A 5D32A 2NX3A 1QO2A 4WOQA 1OG0A 4M6PA 3ZR4A 2HTMA 3GDRA 5U4NA 1KLYA 1WYIA 3NQCA 3TCEA 3WK0A 3UY8A 4NNBA 1THFD 3MW7A 2ZRYA 3DFQA 2YX0A 1OYCA 3W23A 3PM6A 1TO3A 3BARA 5BW6A 2ZA1A 3AJXA 2B7PA 3LCXA 1VYRA 4X2RA 3C4UA 4UTTA 2CZFA 5H91A 3M16A 4JY8A 4R53A 5D2TA 2JGYA 2QCGA 4UTLA 3NOEA 1QNVA 1SR9A 3B04A 3L66A 4AAJA 1RVGA 5G4EA 1FDJA 1R47A 1G6CA 3W1TA 5F1VA 1LTDA 2OX1A 2C18A 1GVOA 1PCWA 4WY0F 3CWNA 3DFNA 2X1TA 5BMWA 1LM1A 3HB9A 4GNJA 1SZEA 2FB3A 2QDGA 3MYOA 4GRSA 1TTPA 2WSQA 2V30A 2RDWA 4M6QA 1KV8A 4PL1A 4XUGA 2CU0A 4LVBA 3WJZA 3IRDA 1ME7A 2NWRA 2QCEA 3BG3A 3ANYA 4JTSA 1J4EA 1DL3A 3DKJA 2RH9A 3TE9A 5I3KA 1XCFA 3GDTA 2Y88A 4RZ4A 2CWNA 3L0NA 5C6MA 5DLCA 5F1UA 2Z0IA 2P10A 3A22A 3SSJA 2V82A 5CSSA 4NX5A 2GQ8A 1I8JA 3A5FA 4AHPA 3CT7A 3TR2A 3NPXA 5F2LA 1WX0A 3B4UA 4S1FA 2A7NA 5CZ0A 2E77A 4PCFA 3GR8A 3ABSA 2ATMA 2NX1A 4HHPA 4RR4A 3LHWA 1SO6A 2ZRZA 2E5BA 4UC5A 3HGJA 1HFBA 2JKAA 3NL5A 1JRCA 4MUZA 3CIWA 4JX4A 3AO0A 1OYAA 4KKXA 3UQNA 3TFXA 1IF2A 3DENA 3S42A 1XL9A 4PEKA 3KVMA 3G1HA 3OBKA 2PCQA 3TFCA 3FIGA 1UJPA 2YFOA 4FNQA 3W7CA 1NF0A 3HJZA 1BWLA 2WV8A 4KWVA 2VFEA 1Q45A 5F2MA 1V5XA 2YYUA 1IIGA 2VEKA 4XKYA 1YTEA 1VS1A 3G1FA 5K9CA 3JS3A 4FIRA 4ADSA 1G4TA 4I7VA 3FFSA 3W1RA 2Y63A 3B05A 5G2HA 1FWRA 4PA8A 4RV8A 3O07A 3LCLA 3CWOX 3GNDA 1LLZA 3VNDA 1H60A 3QMSA 4JTEA 1MZHA 4UNKA 4KFOA 4YL2A 2VXNA 3PY2A 3W7EA 4UR8A 1DBTA 1YADA 2VC6A 1WDWA 1GWJA 4OT7A 4Y6GA 1KFLA 1SQ7A 5I3IA 3WK1A 3MP4A 3DFOA 4MZ1A 4LTSA 2ZRWA 1GYNA 4GXMA 3OIXA 4QNEA 4JY9A 3W1QA 2NX9A 2WO5A 3DI0A 3RLUA 2Z1BA 1WBHA 1FWNA 5FESA 1O5XA 3VKJA 1LOLA 3O6CA 3RLVA 1I45A 1A50A 3OG3A 4BI7A 4UTMA 1EWEA 4LC8A 4AF0B 4RZ5A 1PL9A 4A2RA 2JKEA 4UXDA 1KM6A 3BLEA 3IIXA 2BXVA 2YDAA 3D0CA 4JTIA 3QYQA 2DZXA 3W84A 1B9BA 2QEZA 1ZJIA 1FWWA 3R12A 3W83A 3QFEA 1O4UA 2C13A 4JIPA 3GKFA 3S5YA 4NXKA 3W86A 5KINA 3PVFA 1L6SA 3B0UX 4UTWC 4QISA 5LGXA 3W1MA 1XUUA 2FQIA 3FKKA 5HNRA 3QRHA 3N2MA 1K02A 3W7KA 3QPYA 4XBSA 1QMLA 3NDOA 4H6KA 2PURA 4HKPA 4LUIA 3TSMA 4CCDA 2QCHA 1FDZA 3MYPA 3W76A 3N9RA 4TMBA 3UWZA 1F2JA 4AF0A 2QAPA 5D33A 1QAPA 3QSTA 4M5PA 3P80A 1PS9A 3LTPA 3ABOA 5DELA 4LS2A 1OFAA 2R14A 1HTIA 3O15A 3W7JA 2EF9A 4LS0A 4N9CA 1FWTA 5AYYA 3O63A 3T4CA 4MJZA 1P5BA 3C2VA 4LNYA 4AWUA 4LRSA 5L9FA 4O1BA 3ABRA 1GPWA 3O16A 4WZHA 4YLWA 3W1XA 3GDLA 2V2DA 3SR7A 1L6YA 1R2SA 5F4XA 2A7RA 5TIMA 1LYXA 5C54A 5HR6A 3NQDA 2YXGA 1W31A 2RFGA 3G0SA 3QPZA 2F7FA 1R2RA 4LY8A 1VH7A 1QPOA 4X22A 3UZJA 2Q3RA 4FNRA 3M44A 5I3FA 1C8VA 1GG0A 5BOOA 1XDMA 1V7YA 4YWIA 2RDUA 3GX9A 1EPXA 1QPQA 1H63A 1SZFA 2XN0A 5C55A 1LP6A 4Y9AA 5G4WA 5ABTA 5U7SA 1XBZA 4O0KA 3DHDA 2RDTA 3LRKA 4O1AA 1JCJA 1N8FA 3CLMA 3TDFA 4HN4A 1OFEA 4P61A 5FF3A 3VCRA 4LOCA 1QCWA 2FFCA 4OWGA 3Q2DA 5CZTA 3TQ0A 2YW3A 3S1XA 1QFEA 4LVAA 2WNNA 1Z41A 2NUYA 4UFKA 2ZFAA 4J9JA 2OZ0A 1AL8A 4FX7A 3I6RA 3QZEA 3MHUA 4QJ1A 5LNWA 4XZ9A 4BR1A 1F73A 5LSMA 2V8ZA 1BKSA 3C0JA 5EPDA 6TIMA 1R46A 3BO9A 3DFPA 4HIBA 3UXDA 5DCEA 3W7RA 2A0NA 2H3DA 3QQ0A 2E1DA 1ICQA 2DZVA 4JYFA 4DF1A 1J2WA 3OA3A 4HT3A 1KM0A 2A4AA 2XN1A 5L6UA 3LCIA 5F2IA 4KFNA 2EKCA 3IGXA 4Y96A 1W54A 4UFJA 1X1OA 3NPVA 5HINA 2CLHA 3STEA 2VOMA 3S8HA 2Q8ZA 1GQNA 3W2MA 5D2WA 1EIXA 3W87A 5E1QA 1YXYA 1GVRA 3CM4A 1MO0A 4M6VA 4NVTA 2A85A 4JTHA 2QUVA 2A6NA 3E0IA 4HNNA 1HG3A 3P8JA 1RQEA 2ZA3A 2V0TA 4BFAA 1JVNA 1OX6A 3H55A 5AOUA 3NPUA 5MHBA 3JRKA 1W5QA 5G1TA 1TTIA 2Y7FA 3HO8A 1H7WA 4YCOA 1I2QA 4NJJA 4BI5A 2CLFA 1FXPA 3EXRA 2WPBA 4MFDA 4ZVJA 1GG1A 4IWWA 2QUUA 5DY3A 4IUOA 1EEPA 1KW1A 2TMDA 3KHJA 4A3UA 3GIYA 3LDVA 1XBVA 3SJ3A 1TTQA 2V5BA 1P1XA 1MSSA 1DVJA 5EMUA 4Z08A 1JRBA 4DELA 5G5IA 1JCNA 5CGQA 1DKWA 3ATZA 2EGZA 4DPPA 3TJLA 5HMSA 4UTTC 3STGA 4RXFA 4UR7A 1DV7A 2X1UA 3C2FA 1W5PA 1JR1A 4E2DA 4GWEA 3W74A 1FBAA 1H1ZA 1NAL1 3S9YA 4CQ8A 3GNNA 3LXAA 2QAFA 1O60A 4JTUA 3YPIA 1G4EA 2RKXA 4DO5A 1G4SA 3O1NA 3UYCA 2X30A 2J24A 1XBXA 4OBTA 3T7VA 3VE9A 4O4WA 3TC6A 5CKSA 3ZS4A 4FB7A 4IGHA 4JTFA 3H54A 3R89A 2YPIA 1JQXA 3HQ1A 3SECA 3A24A 3W85A 4X9SA 5AHFA 3GXNA 1ME9A 5AHMA 2CZDA 4ZL1A 1A5CA 2Z6JA 1G67A 1W3TA 4HNVA 1KM1A 4MJMA 3NG3A 1VZWA 3LX9A 1TPEA 4FNSA 2NZLA 1M6JA 4JICA 4Y90A 1GVQA 3M47A 4FNPA 4I9AA 5DXYA 3RFAA 3C2RA 1Q3NA 4MOZA 3VFLA 5LKYA 2XN2A 2EHHA 1GYLA 1P4CA 5CZJA 2V9DA 1MEWA 3EWUA 5FF0A 3IV3A 4GE8A 1UUOA 3DHFA 1ZENA 3NQ7A 4MFEA 3O6YX 3W1UA 2ISSA 5J5DA 1Y0EA 1EX5A 1I2PA 4BWLA 1WBJA 2FIQA 4UFLA 3IVTA 3I68A 4XWUA 3G3DA 4Z1CA 3RK8A 3R5EA 1ICPA 4O57A 1F6PA 1KFJA 2Y6ZA 4O1CA 1QO5A 3MWAA 1A5AA 2Y85A 2DP3A 2ISVA 4Z1DA 4IX0A 3W7MA 4EWND 5D09A 1DHPA 2ALDA 1OF6A 3NR0A 1LBLA 1G4PA 2C0AA 4AXKA 2E68A 3N9SA 4DF0A 3LRLA 3S5NA 4MLRA 1D9EA 5LHEA 2V2HA 3ATYA 3RF9A 3KFTA 4DPQA 1IXOA 4AHQA 1Z44A 5AFDA 4MKNA 3NQAA 2J9XA 3W7NA 3DH7A 3LCWA 3FYPA 1KM2A 2QCCA 4N4PA 4O28A 3G1DA 3UWVA 1Q6QA 1Q6LA 4Q33A 4ZQPA 1G7UA 4Q32A 1UUMA 4KFPA 1FDYA 4NJIA 2BX7A 2WNQA 3Q37A 4KWWA 3M1ZA 2VEMA 5IM51 4MY9A 1MEHA 5GVJA 1LZOA 3C2OA 3EX2A 5G2WA 4PH6A 3GR7A 2ZA2A 3L67A 3R8RA 2ABAA 3QC3A 3EXSA 3W3OA 1VR6A 2GOUA 1LORA 5HWJA 3WFAA 2RHGA 4FX8A 3LTSA 3O8AA 4ICNA 3WJWA 2PRMA 4M7SA 3PBVA 1O94A 1QOQA 2PRLA 1YPFA 3LHUA 3PUDA 3KVLA 5AC8A 3LXCA 1YXDA 4E38A 2UV8G 3L0GA 2YYTA 1IXQA 3TSDA 3LBMA 1IIHA 1L2UA 1RPXA 2DJLA 2VKZG 5D02A 5EBUA 4IOTA 4EF9A 3S1UA 5KZMA 3INPA 3M5VA 5K2ZA 3T44A 2BLEA 3TUUA 4QQ3A 2Y7EA 3LTYA 5LNUA 1DQXA 5AB3A 2J6XA 3DXIA 1VLWA 2ZZ4A 4N02A 4JN6A 2V81A 3MBFA 3I7RA 1TV8A 3E9AA 4C1LA 3MBDA 5J5RA 3NQFA 2Y89A 3MHGA 5F4SA 1TJRA 3M7WA 3OVRA 1FCVA 3NPWA 3EWBX 2P0OA 2WNZA 1P0KA 4JDBA 1G7VA 2NXIA 4JIQA 3W7PA 1LOSA 1W3IA 4N6FA 3B06A 4GUGA 1VQTA 3CU2A 1VGAA 3HGSA 5FEPA 1TPWA 3P74A 3SGZA 1VYSX 5HWNA 4O12A 5DCDA 3C8FA 3W70A 4NQ1A 3UNDA 1T8XA 3GDMA 1OFRA 1EA0A 3DU0A 1OK6A 3E49A 1XBYA 2VFGA 3P61A 3GK0A 3LERA 1NEYA 3L65A 4Y8FA 4UTKA 1W3NA 4JTLA 1O95A 2WKJA 1KM4A 1KA9F 4N4QA 3NQGA 4GUJA 1VCVA 3ZWTA 4S2CA 5HR7A 5AN7A 1GTEA 3G1VA 1M5WA 4DBDA 4CCEA 4JX5A 4L4LA 4FEZA 4GJ1A 4JR5A 3THAA 3P84A 2Z2UA 2NWSA 1SW0A 3NQ6A 1VLIA 4P2VA 1YTKA 1TPDA 4FX6M 4HSOA 3U2OA 1SU5A 3CHVA 3SY5A 2EPHA 4IXXA 3SI9A 4ZMGA 1RR2A 2GVLA 4AWTA 3CQ0A 2A2IA 2H3BA 2Q8LA 1OFOA 3UWUA 2XFWA 3BGJA 2P1FA 3GVGA 4PL2A 3V1PA 1S5TA 2VFIA 5AHEA 4U4MA 3NO5A 4ML9A 1TJPA 3A21A 5FF7A 4MY1A 4RCXA 3LV6A 1TMHA 3Q58A 4NUWA 1KFKA 1JUEA 4MLJA 3TROA 2FPTA 1UCWA 3W6YA 1KFBA 3EWYA 5AC7A 3PB2A 5D2VA 2AGKA 2CLEA 3DFSA 3LOTA 1MXSA 1UB3A 3UWYA 2H90A 3UPBA 3DBPA 2OMAA 1TV7A 3NQVA 2A7PA 1EWDA 1ICSA 3LHZA 3A23A 4LC6A 5K7JA 4XQ6A 3QJAA 3W9ZA 3ELFA 2TSYA 3W2JA 3MI6A 4UCGA 4NNAA 2J27A 4LWWA 3EXTA 1HUVA 2CLKA 4AHOA 2GVGA 4BF9A 1RQBA 2WJZA 1H5YA 3IIOA 3GB6A 4O17A 1KM5A 1GEQA 3R13A 2B7NA 4N6EA 1VYPX 5D2YA 3KX6A 4O8RA 2YR1A 4LRTA 2NV1A 3L5MA 2VENA 1XFBA 4TO8A 1W37A 1SO3A 4MIMA 1H51A 4ADTA 4UMCA 5FF2A 2R94A 3IIVA 2FLIA 3SFKA 5T26A 2GJLA 4IPIA 4EIVA 3TMLA 2E5DA 5D03A 3PBWA 3QW4B 3WK2A 2FTPA 2YFNA 1TV5A 2Z6IA 2TPSA 4ADUA 4HSNA 2QDHA 4NZJA 4L4MA 2YCEA 1XXXA 3HF3A 3N14A 1H50A 3UY7A 3W7GA 3BW4A 1XDLA 1QOPA 5DY2A 1W56A 4YXGA 2ZTKA 1D3GA 4JS3A 4ZZ9A 1B3OA 4ZQCA 1XI3A 1AW5A 2FPYA 1OFPA 5DCBA 4WUIA 2PC4A 5FEZA 1WA3A 4K7VA 1TTJA 3P8IA 3E12A 4O54A 1JULA 8TIMA 1Z48A 4O14A 4LV4A 3LM7A 1VC4A 3BW3A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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