4PRWA

Xylanase t6 (xt6) from geobacillus stearothermophilus in complex with xylohexaose
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
371
structure length
371
Chain Sequence
KPHISALNAPQLDQRYKNEFTIGAAVEPYQLQNEKDVQMLKRHFNSIVAENVMKPISIQPEEGKFNFEQADRIVKFAKANGMDIRFHTLVWHSQVPQWFFLDKEGKPMVNETDPVKREQNKQLLLKRLETHIKTIVERYKDDIKYWDVVNQVVGDDGKLRNSPWYQIAGIDYIKVAFQAARKYGGDNIKLYMNDYNTEVEPKRTALYNLVKQLKEEGVPIDGIGHQSHIQIGWPSEAEIEKTINMFAALGLDNQITELDVSMYGWPPRAYPTYDAIPKQKFLDQAARYDRLFKLYEKLSDKISNVTFWGIADNHTWLDSRADVYYDANGNVVVDPNAPYAKVEKGKGKDAPFVFGPDYKVKPAYWAIIDHK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Xylanase T6 (XT6) from Geobacillus Stearothermophilus in complex with xylohexaose
rcsb
molecule keywords Endo-1,4-beta-xylanase
molecule tags Hydrolase
source organism Geobacillus stearothermophilus
total genus 150
structure length 371
sequence length 371
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2014-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4prwA00
4XZWA 1CNVA 5A6MA 2ZUNA 1DWFM 5E6YA 3N9KA 1UZ4A 1OGSA 5M03A 2QF8A 3CZ8A 4E8DA 2WCAA 1SMAA 4ZEPA 4QLJA 3AICA 5IFPA 1CXEA 1GOQA 4TTGA 1NH6A 3W81A 3IJ8A 2VZVA 3I3EA 5AYBA 2J7DA 3ARQA 4AD5A 3WBEA 4OZOA 3ZIZA 2YA0A 3BAIA 2GDVA 1B3YA 3W53A 3WUFA 3ZR5A 3L2MA 3POCA 1H1NA 4P8WA 1WCGA 1EHAA 3OZOA 2V3EA 3KL3A 4ATWA 1JG9A 2OSYA 3TOPA 5DMYA 3FY1A 4FLRA 4V28A 1JD7A 1C8QA 1QHPA 2WVUA 3F5LA 2PWEA 5JIWA 1E9LA 1CYGA 3D5HA 4UQ9A 4MJ2A 1W32A 4ML4A 1CGUA 4GZJA 3OBAA 1WDRA 5A95A 3T2PA 4U2YA 5CPTA 3B8SA 1W3JA 1W1TA 1V6YA 2D0HA 2X8RA 4OBRA 1V0NA 1HNYA 3DHPA 1R85A 2W67A 5DF0A 2J7GA 2VT0A 5A6KA 2WMKA 4WIWA 1TFVA 2XWEA 3MSGA 1UD8A 5A8OA 1UR9A 2CETA 2WMJA 1H41A 2BVDA 2VX6A 2XUCA 1V0LA 3SCNA 3K4AA 3T09A 3SCPA 1VIWA 1UA7A 3G6MA 1J0JA 1V08A 2F2HA 1J01A 5BROA 1JF6A 2X0YA 1B2YA 4CUCA 4FLSA 1QI2A 3TA9A 1E6RA 1LG1A 1CGVA 3IAPA 3VX1A 2FDMA 1HKIA 2GJXB 1E5NA 2BXYA 1J10A 2ZX6A 1ZBKA 1JGIA 2GDUA 2XIBA 1QHZA 3MMWA 4M24A 2G3JA 2CNCA 2WVSA 2D3NA 1QI0A 3I3BA 2VX5A 3CUJA 3WD2A 2W66A 4OIFA 2WC3A 1B90A 3WQ4A 1V3IA 2EO7A 1BYDA 1W9XA 1BG9A 1FHDA 5E09A 3W25A 2RGLA 1MVYA 3VD7A 3CZLA 1CBGA 4P8VA 2VCBA 4MNMA 5ABFA 1JZ3A 1HJSA 2J47A 1UD5A 3A47A 5D8ZA 3W0KA 2ZICA 2JIWA 1KXHA 1E55A 3CHDA 3DYPA 3WFZA 1CDGA 1W3HA 3FXYA 4J3TA 3CUIA 3WDIA 3BAKA 4GI9A 3WH8A 3MUZ1 2WHJA 5EB8A 1B1YA 1RD6A 2Z1SA 2JFEX 2OYKA 3AHYA 3SEPA 1FH8A 1ZL1A 3PTMA 1GOKA 3BXWA 4ZENA 2E40A 4PMOA 4N42A 3EDFA 4H8UA 3AHZA 4AZCB 2CPUA 4N0RA 1UH4A 1B0IA 2A3EA 1J12A 2TAAA 3CH9A 3T0BA 4J3UA 3RMEA 1BAGA 3MS8A 2Y5EA 2BHUA 4YHGA 1GJUA 2DSUA 4JL2A 1PX3A 2ZOXA 2PWFA 2OWCA 2UY3A 1B3ZA 4CD7A 4TVDA 3QHOA 1K9DA 1WZLA 1J18A 1NOWA 1BLIA 3SURA 3VGEA 5E0FA 5FCZA 2EQDA 1JFXA 3VIOA 4AD3A 1C92A 1KBBA 3A3HA 1W9PA 4A3YA 4RE4A 2CBJA 4TVUA 4CVWA 3NDZA 2WHLA 3K4DA 3WDJA 4H8VA 2X2YA 2ZX9A 4W8LA 2XJ7A 3WMBA 1BYAA 2MANA 4HA3A 3VTRA 5JBEA 1UQZA 1CGTA 2ZIDA 1QNSA 1E70M 3RO8A 5AC5A 1ZBWA 3LPFA 3A4XA 3ARRA 2XVKA 1I75A 1IZKA 1E73M 1KQYA 1JYXA 3TONA 5FIPA 1F4AA 3MKKA 2QMKA 1JDDA 3A4WA 4AXNA 2W63A 2ZX5A 1QBBA 4W8AA 5A8PA 3VDBA 3ZM8A 1PIGA 5A3HA 2HVMA 3AI0A 2GFTA 2DT3A 4MADA 3MV11 5D4YA 2D23A 2YA2A 3BAXA 3VNYA 3VD3A 2W5FA 4AEFA 1YHTA 2VTFA 3E1F1 1HJXA 2E8ZA 1JAKA 4F79A 1BQCA 1PX4A 2E9LA 1EDQA 5GPRA 3KZSA 3UG3A 1TVNA 4WSJA 1NWRA 3T0AA 3VIHA 3U7VA 2Y2WA 1JFHA 4CN1A 2C8NA 5ECUA 3JUGA 1LL7A 2WBGA 4FLQA 4QCEA 3WNOA 3T2QA 4AZIA 3AROA 2D20A 1DHKA 2FGLA 4Q22A 3CPUA 2OWXA 3QOMA 1MW1A 1H2JA 1X1NA 2YL8A 2BXZA 3F4VA 2DGAA 3L2LA 3BCDA 5CSUA 2XVLA 4MB3A 1XH1A 2VCAA 2E0PA 3SUUA 1UKTA 1DTUA 5FOOA 4A4AA 1VFFA 2YLAA 1KFWA 4LYRA 4JIEA 3IJ9A 1PAMA 1XCXA 3WNPA 1E3ZA 1BGGA 3S2CA 3PZGA 2YLLA 1Z32X 5I79A 4MDOA 1B3WA 2GVYA 1V0KA 2GK1A 3WH5A 2VZTA 2XIIA 1NOUA 2WKGA 2DH2A 1CLVA 2J7CA 3WSUA 3WQWA 1OT1A 4PYSA 3OA5A 3AS1A 1BVZA 2CKRA 1SMDA 1FHLA 3GH4A 4QDMA 1JZ4A 1Q6GA 2CXGA 2VX7A 4FF5A 3SCSA 4PTWA 4D6CA 1Q4NX 1ZJBA 2VVSA 5M3WA 3GNPA 8CGTA 1V6VA 4JAWA 4LYPA 2PF0A 2WC7A 4J28A 2J7HA 4MAZA 4OOUA 1G5AA 3ARZA 1UA3A 1UWQA 1JYVA 1J9YA 4CCEA 1W3LA 1ISYA 2J7EA 4HZ7A 3SUSA 1IZJA 2DDXA 3VD9A 2Y4SA 1E5JA 1WE5A 2ZX7A 4WKHA 2JF7A 3VU2A 3SCVA 1C7TA 4UFMA 3W28A 2CCRA 2O92A 4P7OA 4H41A 3AIVA 3VMOA 1NP2A 3ZMRA 4D6DA 1KB3A 3RIKA 2DIEA 2DSVA 1V3JA 4UFJA 1PZ2A 4ZXOA 4AY1A 4AD4A 3AOFA 3AHTA 1LL4A 1EA9C 3AMLA 1UD3A 3QR3A 1MYRA 3AMKA 1DWJM 3WL0A 2W4XA 5FL1A 4GINA 2O9OA 4JFSA 1OIFA 2YBTA 2G41A 2YOCA 3RJXA 3AS2A 5CPSA 2CEQA 3T2OA 2J62A 4TX6A 3HN3A 3AHXA 1KGXA 2XVPA 1TCMA 1C90A 2YKKA 1HXJA 3AHVA 2Y8KA 4CD6A 3FNDA 3WDPP 1MQRA 1V3LA 1XYZA 3OLGA 2QMJA 4TXEA 1KCKA 2QPUA 1WDSA 2YL5A 1KGUA 1UHVA 1BFNA 3WKZA 5BWFA 2UWFA 1JZ5A 2ZUSA 3ZT5A 4AIUA 2VR5A 1XH0A 3MO4A 1JNDA 4E4PA 2UY2A 3AIQA 1C8XA 5E70A 4DM2A 1HKMA 3OLIA 4YN5A 2X09A 1QOXA 1JYNA 1J0ZA 3PHAA 5I2UA 3VX0A 3WF1A 1G0CA 5AC4A 9CGTA 1XRVA 1E1FA 1GVYA 4PN2A 3ZJ7A 1E4LA 4CD5A 5A8NA 1X6LA 2PI6A 1GOIA 3WD3A 1DEDA 2J7FA 3F5KA 1B9ZA 1EQPA 1XHGA 3W38A 2OYMA 2YL6A 4XX6A 3UG5A 1E4NA 3AIRA 2Z1KA 4D6FA 4EAMA 4X0NA 4UNIA 1OGGA 2D0GA 3WNKA 1GUVA 3N11A 5A6LA 1BSIA 1VENA 4AC1X 3AS3A 1UD4A 4X9YA 3VIMA 1W1VA 1GONA 1G94A 4E8CA 2D1ZA 1OWQA 6CGTA 1JI2A 1UD6A 1GORA 4PMVA 1CLXA 3RCNA 4HPHA 3GDBA 4MDPA 3F5JA 1DWIM 4DWSD 1HN1A 1KXTA 3MUY1 1E40A 3BH4A 3A4AA 5JBDA 3EDDA 4HA4A 2WSPA 3WH7A 5ABFB 1GQLA 2XHYA 4AZHA 3O6AA 5LA2A 2WWCA 1PEZA 2AMGA 3THCA 5BXSA 2C7FA 5C8BB 5A2AA 1TG7A 2YDSA 3MMDA 5BYWA 1UWIA 4ATDA 1J0IA 1W9DM 1XSIA 1U30A 1W1YA 4UTFA 1LL6A 1KXQA 3GH7A 1C3FA 1GW1A 2ZX8A 2F61A 2WHKA 2QHAA 1H0GA 1QI3A 5D9OA 1E1EA 1FH7A 1UR8A 4D1IA 2W91A 2WNWA 4NZCA 2QLYA 2DPEA 3PZNA 3T0DA 1R86A 4M1RA 3CUGA 2CESA 4F8XA 1ZBVA 3OLDA 1LQ0A 5CXPA 1HKJA 1UQYA 4RE3A 1QHOA 3ZT7A 3CHEA 2CHOA 4JKLA 3VKKA 1BTCA 2DT1A 4DWSA 5BRPA 5IHSA 4TX8A 1UKOA 3TTYA 4W84A 2WAGA 2XYLA 3FAXA 3RJYA 1ZB5A 1JDCA 2OLHA 3CIVA 2BV9A 1O6IA 3UR8A 3EMCA 1M7XA 4U3AA 1UH3A 3N04A 1WO2A 4JFTA 1UR2A 5M17A 2NW0A 2WKLA 3WBAA 4CVUA 5CZKA 1KXVA 3K8LA 3W27A 1VEPA 1E43A 1GOWA 1FA2A 3VNZA 1PZ3A 2J25A 4W87A 4W7WA 2WWDA 4Z2HA 4BCEA 5LA1A 2WANA 3WNNA 3WQ6A 3EDEA 4URIA 4MJ4A 3GXFA 1HT6A 3CMGA 4W8BA 1JNEA 5CPQA 3G6LA 1BPLB 5CQ1A 3SUTA 4F9DA 1MW0A 4S3KA 1Q6EA 1WNOA 5KEZA 4PMXA 1UG6A 3ALFA 1CXLA 3AMCA 3LPPA 1HP5A 1MFUA 4JHZA 5BXRA 4M56A 3U57A 3ZJ8A 3HMCA 4QFUA 2J74A 4J3SA 4MNKA 2D2OA 3WDQA 4KWUA 4HZ8A 4D1JA 1K9EA 3BCFA 4MPKA 1VFUA 4BS0A 1EDGA 1FFQA 3AMGA 5E6ZA 1G1YA 1NWUA 4GZEA 3W6LA 1RH9A 2XFRA 4Y7EA 1CGYA 1JYWA 1K9TA 1QI4A 4ZE4A 2BY0A 1UWSA 1C7SA 3MMUA 3PZ9A 4KRUA 5HDRA 1ZBCA 1JXJA 4PTMA 1P6WA 1UOKA 3VIPA 4L4OA 3WEOA 1ODZA 2EXOA 1VJSA 4U33A 2EPOA 5TD4A 3M46A 4LYQA 1EDTA 3VVGA 1UKQA 2J8GA 4PCTA 1RP8A 3II1A 1R8LA 1VB9A 2EEXA 5E0CA 4UFKA 2V5CA 1Q6CA 2YL9A 3KWXA 3BSHA 1WB0A 3L4YA 1B31A 2XM2A 3ARUA 2O9PA 4J3XA 1VJZA 4P7NA 3GXDA 1BHGA 2CYGA 4EK7A 1OT2A 3PZQA 5DT5A 1SYTA 3SCWA 1JAEA 3UG4A 4UFLA 3WNLA 1KBKA 4ATLA 1WDQA 2UY4A 1E56A 3ARWA 5I0DA 1OM0A 3ARSA 3BGAA 3NSNA 4GI8A 2W61A 3WF2A 2GK1B 4PRWA 4GO9A 1XSKA 4E2OA 4HMEA 1CTNA 4CU7A 3AISA 1AVAA 4M81A 2YJQA 4C7FA 5GNYA 5JUVA 4BZYA 1AQHA 2XWDA 2J8FA 3WH6A 5BCAA 2FH8A 2VUYA 2XVGA 3VOCA 4PMQA 1H5VA 1C8YA 2CIPA 1RP9A 5GQBA 4XB3A 4P7QA 2JALA 1MQQA 4PBGA 4AW7A 1GJWA 2YIHA 2XFYA 1D3CA 4JHOA 4D6JA 1KR0A 3LMYA 1NP0A 2QPSA 4XUYA 5A8MA 3AZRA 2B31A 1BGAA 3M6DA 2J4GA 1HIZA 4ACZA 2E9MA 4U31A 1V03A 1VFMA 2ESCA 5AYIA 2WMIB 4PUDA 1DWHM 1BYBA 3NYDA 1EOKA 4TTUA 4D6HA 4IISA 4B3KA 2PWDA 3BSGA 2IXUA 5A6JA 1WDPA 1W91A 2XSBA 1NWSA 2G8ZA 4WLCA 1LWJA 3AXXA 4U3CA 5DT7A 3ARPA 4PMZA 3GNRA 4JZ5A 2IUZA 4B3LA 7A3HA 3FAWA 3CZEA 3LPOA 1V6WA 4GQQA 1CECA 3CZKA 3B9DA 4V2XA 1HKKA 1V6UA 2DSKA 2WVVA 3EMQA 4D6GA 1JZ8A 2VR4A 4CKQA 6A3HA 4UR9A 2EPNA 2FHFA 4B9YA 2G3NA 3DYMA 5D9NA 2VL4A 5HBFA 3WH9A 4ZE5A 1WZKA 2DT0A 5DEZA 4WK9A 1H11A 4W93A 5I24A 4Z2IA 1GNXA 1V0MA 3POHA 3T08A 5I3DA 2JIEA 3CBWA 4IPNB 1VBRA 1XGZA 5HNNA 4H2CA 8A3HA 3W26A 4EKJA 5GNZA 1VF8A 4HZ6A 1B3VA 3NJ3A 4BQ2A 2ZUUA 4FMVA 1EIBA 5JIPA 1XSJA 4ZFMA 1ITCA 3TTQA 2PWHA 4NRSA 3BAWA 1M04A 3WELA 2BHZA 4M8UA 1J0YA 1PPIA 1H09A 4PTVA 3OGSA 4NI3A 5A8QA 3AMDA 2V38A 1CPUA 3B9AA 1NARA 1UKSA 1ZS2A 1JI1A 3VPLA 4BF7A 4M82A 3WL1A 1E4MM 4C7GA 3W4RA 4NSBA 4D6EA 1OB0A 2WMIA 3CHFA 4TOQA 1ECEA 1XH2A 3UETA 5CGTA 3ZOAA 4UQDA 1NWTA 1V3KA 4LGXA 4WKAA 2BY3A 3SCTA 5A6AA 3DYOA 1Y7VA 1XD0A 4GPNA 3L4ZA 4UFIA 5CJ5A 1E0XA 3RDKA 2J75A 1V6XA 3DHUA 1ODUA 1OD0A 4GO8A 2BS9A 4UQCA 1E0WA 4J3WA 3RM4A 1UUQA 3WMSA 4M80A 3N15A 3QGVA 3NIYA 4CN4A 3ZSSA 2DQXA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4XZW A;  1CNV A;  5A6M A;  2ZUN A;  1DWF M;  5E6Y A;  3N9K A;  1UZ4 A;  1OGS A;  5M03 A;  2QF8 A;  3CZ8 A;  4E8D A;  2WCA A;  1SMA A;  4ZEP A;  4QLJ A;  3AIC A;  5IFP A;  1CXE A;  1GOQ A;  4TTG A;  1NH6 A;  3W81 A;  3IJ8 A;  2VZV A;  3I3E A;  5AYB A;  2J7D A;  3ARQ A;  4AD5 A;  3WBE A;  4OZO A;  3ZIZ A;  2YA0 A;  3BAI A;  2GDV A;  1B3Y A;  3W53 A;  3WUF A;  3ZR5 A;  3L2M A;  3POC A;  1H1N A;  4P8W A;  1WCG A;  1EHA A;  3OZO A;  2V3E A;  3KL3 A;  4ATW A;  1JG9 A;  2OSY A;  3TOP A;  5DMY A;  3FY1 A;  4FLR A;  4V28 A;  1JD7 A;  1C8Q A;  1QHP A;  2WVU A;  3F5L A;  2PWE A;  5JIW A;  1E9L A;  1CYG A;  3D5H A;  4UQ9 A;  4MJ2 A;  1W32 A;  4ML4 A;  1CGU A;  4GZJ A;  3OBA A;  1WDR A;  5A95 A;  3T2P A;  4U2Y A;  5CPT A;  3B8S A;  1W3J A;  1W1T A;  1V6Y A;  2D0H A;  2X8R A;  4OBR A;  1V0N A;  1HNY A;  3DHP A;  1R85 A;  2W67 A;  5DF0 A;  2J7G A;  2VT0 A;  5A6K A;  2WMK A;  4WIW A;  1TFV A;  2XWE A;  3MSG A;  1UD8 A;  5A8O A;  1UR9 A;  2CET A;  2WMJ A;  1H41 A;  2BVD A;  2VX6 A;  2XUC A;  1V0L A;  3SCN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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