4PUEA

Extracellulr xylanase from geobacillus stearothermophilus: e159q mutant, with xylotetraose in active site
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
371
structure length
371
Chain Sequence
KPHISALNAPQLDQRYKNEFTIGAAVEPYQLQNEKDVQMLKRHFNSIVAENVMKPISIQPEEGKFNFEQADRIVKFAKANGMDIRFHTLVWHSQVPQWFFLDKEGKPMVNETDPVKREQNKQLLLKRLETHIKTIVERYKDDIKYWDVVNQVVGDDGKLRNSPWYQIAGIDYIKVAFQAARKYGGDNIKLYMNDYNTEVEPKRTALYNLVKQLKEEGVPIDGIGHQSHIQIGWPSEAEIEKTINMFAALGLDNQITELDVSMYGWPPRAYPTYDAIPKQKFLDQAARYDRLFKLYEKLSDKISNVTFWGIADNHTWLDSRADVYYDANGNVVVDPNAPYAKVEKGKGKDAPFVFGPDYKVKPAYWAIIDHK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Geobacillus stearothermophilus
publication title Extracellulr Xylanase from Geobacillus stearothermophilus: E159Q mutant, with xylotetraose in active site.
rcsb
molecule keywords Endo-1,4-beta-xylanase
total genus 148
structure length 371
sequence length 371
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2014-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4pueA00
3DYOA 3OZOA 4PMZA 1NWRA 3CLWA 3O2LA 3WMSA 1LWHA 4UFKA 2BHUA 1DEDA 3RJYA 3OBAA 1MXGA 5FKYA 3OLIA 4Q7NA 4UQCA 1H5VA 2DT0A 1CDGA 2V5CA 4X0NA 1A47A 3IJ7A 3CUFA 1MWOA 5AYBA 1E72M 2D0GA 1JXKA 2W61A 5IXEA 1CTNA 5E70A 3WUFA 2BVDA 5F7UA 2WANA 2VQTA 5E6ZA 3SUWA 1ESWA 3T0DA 5JIPA 2JE8A 1MVYA 4MB5A 3BMWA 2JF6A 3GZAA 3QR3A 4U2YA 1PIGA 4DM1A 1ZS2A 5BRPA 3KZSA 1XH1A 4FF5A 5M03A 1QHZA 1UR0A 3K4DA 4GZJA 4OJYA 2WPGA 4NRSA 3WFZA 5JBDA 1N82A 3VX1A 3W4RA 1HVXA 3POCA 4PRWA 3W24A 1C93A 2VRQA 3EYPA 1FA2A 4F9JA 1HJWA 3LPOA 1TVNA 4WSKA 5HOSA 2QMJA 5E9AA 3VU2A 4NRRA 5JUVA 2CKRA 1JZ3A 4ATDA 1VFUA 4BQ5A 2VVSA 3VMPA 1DWIM 3BLKA 1E43A 1VENA 1VRXA 1XYZA 5D9MA 1EGZA 1Q6CA 3RMEA 2YDSA 1GPFA 3CZLA 1QNPA 1R8LA 2VQUA 3OLDA 3VIGA 2YIHA 4Z2LA 3GBDA 3VNZA 1VAHA 3I3DA 4J3UA 4EAMA 1EO7A 1ZU8A 1QW8A 2OYLA 1E6PA 2ZICA 3AZRA 4AD0A 2VT0A 4W8BA 3ZMRA 3W81A 1MW1A 4KMQA 4JFVA 4MB1A 5CSYA 1B3WA 1WP6A 3IANA 1ZJBA 4PTMA 4AIEA 2QPSA 2WKGA 3MSDA 3I3EA 3L4ZA 4M29A 3WEZA 4L4PA 5CLWA 3CTTA 4NSBA 1EH9A 1FHLA 1LL7A 1WPCA 3SCQA 2WM0A 1JXJA 2ZUNA 1JG9A 4LPCA 3GBEA 2YJQA 1E40A 3CUJA 4GI9A 4UCFA 4P8UA 1V6UA 4PMVA 4EK7A 2YA0A 1GOKA 3WELA 5CPSA 3SCTA 3S6TA 4UOZA 1H49A 1W1PA 2HISA 3OZPA 1JZ7A 3PHAA 5A94A 3WD1A 1HL9A 3W25A 1QNRA 4QAWA 3SCUA 3MV11 1SMDA 2WYSA 4CCEA 2EPOA 3OIHA 4WIWA 6A3HA 4YHEA 2A3EA 3VGHA 2O92A 4GI6A 3WH7A 4AZCB 4LGXA 1UHVA 4PUEA 2J8GA 4PSRA 4TXEA 2J7EA 1DWGM 5GPRA 3ZT7A 4U5KA 1HNYA 1GJUA 1EO5A 3N11A 3W27A 3VDHA 3GXFA 4PMRA 1WCGA 1GOWA 3W6LA 2WHLA 1JYNA 2J4GA 4TTGA 5FD0A 1GOQA 4QDMA 3PZTA 2CBIA 3AZSA 4PTWA 4S3JA 1WZAA 1CXIA 1C7SA 2XTKA 1XGZA 3VDAA 1QBBA 4W7VA 3CZJA 3VKKA 3WDPP 1NP2A 1JDCA 1CXFA 3L2LA 7TAAA 2WSKA 1MW3A 1E15A 2VR4A 4X0VA 3WDHA 2J47A 3T08A 2QHAA 2W91A 2J7CA 1KBBA 3JUGA 4MDOA 5D8WA 1OD0A 5D9NA 3EMQA 1UKPA 2GUYA 4ATLA 1HKJA 1DWAM 3UR7A 3SCRA 4P8VA 1GOOA 5TD4A 3D5HA 1WDRA 3UCQA 1R7AA 2XGBA 1W1TA 4N42A 2W63A 1E6NA 4HZ8A 1PAMA 4DUVA 1OT2A 4HP5A 3MMDA 4U33A 1JGIA 1SYTA 4WKAA 4GIAA 2NT0A 1MQRA 1XH2A 1HP5A 1QNQA 4HPGA 2DIEA 1GOMA 1Q6GA 1MQQA 4QFUA 2Y8KA 2JALA 2WK2A 1CGVA 4PMOA 2BVYA 5CPQA 4UFIA 2XUCA 2WLYA 4H04A 1XHGA 2FHBA 4A3YA 3SUSA 3WH6A 1OB0A 2GVYA 3M07A 2BHZA 4AEEA 5A6LA 2GJXB 1VJSA 3SUVA 5ABFB 4P7QA 3QHOA 3A4XA 3WD4A 2UY4A 1E4NA 4HA1A 1M53A 5IHRA 3A6OA 3M7SA 4AZ6A 1H11A 4CU6A 1C8QA 1NWSA 2XGIA 3W0KA 5I0DA 1M03A 5LA0A 2Y4SA 1QI5A 1UKTA 3VD9A 3OG2A 3WL1A 5CPTA 3ZOAA 5BCAA 4V2XA 1E0XA 4WKHA 3CUIA 2WNWA 3AZTA 1V08A 3CUHA 3ARVA 3L4YA 4P7RA 4XZBA 2A3BA 4UNIA 2YLAA 3MV01 2YBUA 2G8ZA 1VIWA 1HKMA 2ZUMA 5JIWA 4QLLA 4D6DA 2G3JA 3MUY1 4QCEA 4MPKA 3II1A 3ARPA 1O6IA 4IISA 2ESCA 2VO5A 3AS3A 1GVIA 2J75A 3RM8A 2JIWA 1J18A 2CKSA 1W9VA 2PBOA 5A2CA 3AIEA 4PTVA 2ZX7A 2Y2WA 3NYDA 3GXMA 1BVZA 4UFHA 1EOMA 4AD1A 4URIA 1PBGA 3AHXA 2ZUTA 1R87A 3HU7A 4TUFA 5A6KA 2WVUA 3CHEA 2F2HA 5HNNA 1E6RA 2J62A 3GNPA 4CD6A 3WF2A 2XFYA 3G6LA 1OGSA 5BXPA 1BFNA 1J11A 5D9OA 1UKOA 2WMKA 4TVUA 1UQYA 1L8NA 3VMNA 4AZCA 4AIOA 3CO4A 2WCGA 2VI0A 1FH7A 1ZBCA 2D0HA 2VX4A 3SUUA 1E3XA 4GPNA 4MJ2A 1AMYA 1PX3A 4FLRA 2ZX5A 1NWTA 3W37A 3W6MA 3HJEA 1EHAA 1VB9A 2UY3A 5DMYA 2WC4A 3FHQA 1F4HA 1CWYA 5C71A 1MQPA 3MMWA 1GHRA 1HJXA 2YDRA 4U3AA 5A6BA 1K9DA 3FAXA 4A4AA 3WNKA 1UWQA 4GKLA 5CXPA 4F79A 1YHTA 5ECUA 3BH4A 1OSEA 4KGJA 1E5NA 1ZBVA 1TCMA 5JBFA 3NJ3A 5HPCA 3AYRA 1JZ4A 1JAKA 3WUBA 4B16A 4W93A 4DM2A 5A6SA 4F66A 4YN5A 2VRJA 1YQ2A 1C7TA 1UR2A 2O9PA 2CEQA 5AC5A 2QMKA 3OB8A 5CG0A 1AQHA 4W7UA 1JI2A 2BHYA 5A6BD 2PWDA 2UY2A 3T09A 5A95A 3EMZA 5C8BB 3U57A 2XVKA 1XYFA 3BAJA 1NP0A 2CHNA 4Q22A 2J78A 1E6XM 5ABFA 1VEPA 1BG4A 4H7VA 1OIMA 1B31A 3K4AA 4BQ4A 3WL0A 4EANA 2WMGA 3AQUA 2YA2A 3ARRA 1W32A 1JAEA 1U2YA 1W1YA 2V3DA 1UD2A 1NOWA 2XYLA 1KR1A 1F4AA 4HTYA 2FHCA 1J0YA 1CGWA 1QHPA 3AMKA 2FDMA 4DWSA 5CGTA 2YKKA 2V3EA 2W5FA 4AD3A 4M1RA 2IXVA 4ZXOA 3PBGA 2Q8XA 5HPOA 5BXTA 2CPUA 3VGEA 1TFVA 2RGMA 3BCFA 4E2OA 1XV8A 1C3FA 1GUVA 2VURA 5E0CA 1E5JA 4IM4A 4GQRA 1JNDA 3F5LA 4RE4A 4XZWA 1OIFA 3O6AA 4JAWA 2PB1A 2OSWA 5A8MA 3GNRA 4RE3A 2BXZA 1XSJA 4HMCA 1UR8A 1QI0A 1GCYA 1UR9A 1XRVA 4WKFA 4S3KA 4JKMA 2FGZA 2VVNA 2WBKA 4W87A 4DWSD 1IV8A 3WQ8A 1CXLA 1VFFA 1K9FA 3ZJ8A 2HVMA 1LJYA 1PZ2A 1S46A 4B9YA 2QPUA 4UOJA 3WBEA 3RILA 2VRKA 2D22A 5I24A 3PZUA 4HU0A 3AXHA 4XB3A 3N1AA 3AMDA 1OM0A 4MNLA 3PZVA 3K8MA 2V3FA 1FH8A 2D23A 2GJRA 3UR8A 2EPNA 3N9KA 1V0NA 2WCAA 8CGTA 3VOCA 1SFSA 3CMJA 3ARWA 3CIVA 3EDDA 1W1VA 5LA1A 3RCNA 3OGRA 3VUPA 1U30A 3NSNA 3SEPA 5ABGA 1RD6A 1UH3A 1KQYA 2WLZA 1WAWA 2GDVA 1R7OA 2DT3A 4JCMA 4AZHA 5CGMA 4NI3A 1UD4A 1H3GA 1LWJA 1XD0A 4UQ9A 3THCA 2YBTA 1ISZA 2DPEA 3WQ5A 1UR1A 5A6JA 2VL4A 3L4WA 4PMYA 3GH5A 5IDIA 5BXSA 2VZSA 4PCTA 3KL5A 2YL8A 1RP8A 4D6FA 1DWJM 1E6QM 2PBGA 5EFDA 1MW0A 2A3AA 5E09A 4V28A 3EMCA 3THDA 4J3VA 1V6WA 2OSXA 3F4VA 8A3HA 3BAXA 3CGTA 2BY0A 4GZIA 4GQQA 1CXHA 4AZIA 2VTFA 1TMQA 3VINA 4PMDA 4P8XA 3BMVA 1LQ0A 3VM7A 5I77A 2WMIA 2YL9A 2WKLA 2WWDA 4W8AA 3K1DA 1U33A 3TTOA 1PX8A 3N04A 3VDBA 2XIBA 2BY1A 1UWUA 3PZMA 2DSWA 2BS9A 2BXYA 3PZ9A 1QNSA 1W3JA 3U7BA 4TOQA 1CXEA 1CZ1A 1J0ZA 1LL4A 1BGAA 1W9BM 3WF1A 7A3HA 1QI2A 1VEOA 4Y7EA 1E4IA 2MANA 1V6VA 3RPMA 5A2BA 1JL8A 4HU8A 3VD4A 3ARSA 3ALFA 4QCFA 2BV9A 2EO7A 1UA3A 1K9TA 3WF3A 3MSGA 4JIEA 4W89A 3TONA 1XC6A 2GK1B 3AHYA 3AXXA 1C92A 3A3HA 2VZOA 3NDZA 2V5DA 4JL1A 5D8ZA 3OA5A 3ZIZA 2G3IA 2E0PA 3AIWA 2XSBA 3HMCA 3OLEA 4MB3A 3MS8A 1V6XA 3UERA 1X6LA 1GONA 1OD8A 1C90A 1L0PA 3LPGA 3WBAA 4A3HA 1MYRA 3MUZ1 3U7VA 4GINA 4M8UA 1Q6EA 2WVVA 1QNOA 2BY3A 1KWGA 4CN4A 4CU7A 4LQ1A 4OZOA 2QLYA 2WB5A 3CUGA 2EEXA 4D1JA 4V27A 1C91A 1TA3A 1V3JA 2GDUA 3BSHA 3KWXA 3WD2A 2ZE0A 5I23A 2XM2A 3AROA 1JIBA 1V02E 1UWRA 2XWEA 3B9EA 2CBUA 4DUWA 3L4VA 3UG5A 1B3XA 1ZB5A 1CXKA 2EPLX 3S2CA 3WNNA 1W2VA 4C7GA 3TA9A 5FOOA 1HJSA 1TR1A 1OCQA 3SUTA 3A47A 4CD4A 1BQCA 3PZGA 1HL8A 1EOKA 4JKKA 1FFQA 4ATWA 1VFMA 1JDDA 1FOBA 1WNOA 1FP9A 1V03A 4UQAA 1EQPA 3WNLA 5BRQA 3KE0A 1KXTA 4LXFA 3AIUA 1JF6A 1J01A 3IJ9A 3POHA 2DDXA 3FNDA 4W84A 3K8KA 4AZ5A 3WDRA 2E9BA 3AS1A 4AWEA 2RGLA 1VFOA 1R85A 4H2CA 5EFFA 5ABEA 1D7FA 5DO8A 3GYCA 4K68A 2EBNA 4HOXA 2VC9A 1PEZA 2ZUWA 2VCAA 4CVUA 1I1XA 1UD8A 4W7WA 4OUEA 3WDQA 2E9MA 2DQXA 3WDIA 4E4PA 4AZBA 2YL6A 3RM9A 3T0AA 3WUEA 4B15A 2W4XA 1V3HA 2ZUUA 4W5UA 1MFVA 2EQDA 3SIMA 5D4YA 1V3IA 1B2YA 1JDAA 1ISXA 1UD3A 1FHDA 1JYWA 3WF0A 2WZHA 1FH9A 2X2YA 1M7XA 5A8OA 1V0MA 3MANA 4FLQA 3ZQ9A 2G3NA 4MAVA 1ZL1A 4PYSA 3WFLA 3WH8A 4HZ7A 1G0CA 3WMCA 1P6WA 3EDKA 4PCSA 3VNYA 4YPJA 3TTYA 2ZX6A 3I3BA 1I1WA 5A8PA 2JEPA 1H09A 5IHSA 4W85A 2DSUA 4DWSB 2WW5A 4JL2A 2WMHA 1HF6A 4UOQA 3SCVA 3ARTA 1TZ7A 3M46A 4JFUA 1K6AA 4AD5A 1XSKA 4CN6A 3LPPA 1UR4A 2W62A 1PIFA 3EBVA 4HOZA 1KCLA 3WF4A 2VX7A 3UEQA 1UWTA 2E8ZA 2DH3A 1ITCA 2WC7A 2WZIA 3VGDA 3TP4A 3KL0A 1E1EA 2YDQA 4W86A 1G1YA 2AOSA 2WHMA 2D0FA 4HA4A 5HDRA 4KRTA 3ZJ6A 1W91A 2FGLA 1GOIA 3FW6A 3BSGA 4W8LA 4JKLA 1BHGA 4UFLA 3VIFA 3VVGA 2VJXA 1VF8A 4P7OA 5BROA 1KWKA 1CBGA 3FY1A 3ALGA 4UQDA 1UH2A 3WMBA 1GORA 4GZEA 2GK1A 4MNMA 1B9ZA 1CENA 2A3HA 1MW2A 3WKZA 3U5YA 1ITXA 1E71M 4J3XA 2CETA 2ZX8A 3KL3A 2PWEA 3DECA 2J77A 1W3LA 2CBVA 2EPMX 1J0IA 3FN9A 5DT7A 4EE9A 1AVAA 3UG3A 3AS2A 4W5ZA 3CHDA 1UZ1A 1WZLA 4MDPA 2J74A 4QP0A 1EDQA 3RJXA 3VGFA 3W29A 1ODUA 4PBGA 3VGBA 3E1F1 4H8UA 4E8CA 1J0HA 4Z2IA 2XHYA 4LX4A 4TX6A 4U5IA 3UETA 2WHKA 1PX4A 4E8DA 1XCXA 2E4TA 2Y8VA 3ZSSA 4D72A 3SCOA 3AMLA 2DIJA 4AYSA 1KGUA 2DGAA 4WF7A 1CGUA 3UG4A 2F8QA 4J3SA 5A6MA 4MADA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3DYO A;  3OZO A;  4PMZ A;  1NWR A;  3CLW A;  3O2L A;  3WMS A;  1LWH A;  4UFK A;  2BHU A;  1DED A;  3RJY A;  3OBA A;  1MXG A;  5FKY A;  3OLI A;  4Q7N A;  4UQC A;  1H5V A;  2DT0 A;  1CDG A;  2V5C A;  4X0N A;  1A47 A;  3IJ7 A;  3CUF A;  1MWO A;  5AYB A;  1E72 M;  2D0G A;  1JXK A;  2W61 A;  5IXE A;  1CTN A;  5E70 A;  3WUF A;  2BVD A;  5F7U A;  2WAN A;  2VQT A;  5E6Z A;  3SUW A;  1ESW A;  3T0D A;  5JIP A;  2JE8 A;  1MVY A;  4MB5 A;  3BMW A;  2JF6 A;  3GZA A;  3QR3 A;  4U2Y A;  1PIG A;  4DM1 A;  1ZS2 A;  5BRP A;  3KZS A;  1XH1 A;  4FF5 A;  5M03 A;  1QHZ A;  1UR0 A;  3K4D A;  4GZJ A;  4OJY A;  2WPG A;  4NRS A;  3WFZ A;  5JBD A;  1N82 A;  3VX1 A;  3W4R A;  1HVX A;  3POC A;  4PRW A;  3W24 A;  1C93 A;  2VRQ A;  3EYP A;  1FA2 A;  4F9J A;  1HJW A;  3LPO A;  1TVN A;  4WSK A;  5HOS A;  2QMJ A;  5E9A A;  3VU2 A;  4NRR A;  5JUV A;  2CKR A;  1JZ3 A;  4ATD A;  1VFU A;  4BQ5 A;  2VVS A;  3VMP A;  1DWI M;  3BLK A;  1E43 A;  1VEN A;  1VRX A;  1XYZ A;  5D9M A;  1EGZ A;  1Q6C A;  3RME A;  2YDS A;  1GPF A;  3CZL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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