4PUE | Genus

Total Genus 148

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	148
sequence length	371
structure length	371
Chain Sequence	KPHISALNAPQLDQRYKNEFTIGAAVEPYQLQNEKDVQMLKRHFNSIVAENVMKPISIQPEEGKFNFEQADRIVKFAKANGMDIRFHTLVWHSQVPQWFFLDKEGKPMVNETDPVKREQNKQLLLKRLETHIKTIVERYKDDIKYWDVVNQVVGDDGKLRNSPWYQIAGIDYIKVAFQAARKYGGDNIKLYMNDYNTEVEPKRTALYNLVKQLKEEGVPIDGIGHQSHIQIGWPSEAEIEKTINMFAALGLDNQITELDVSMYGWPPRAYPTYDAIPKQKFLDQAARYDRLFKLYEKLSDKISNVTFWGIADNHTWLDSRADVYYDANGNVVVDPNAPYAKVEKGKGKDAPFVFGPDYKVKPAYWAIIDHK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Geobacillus stearothermophilus
publication title	Extracellulr Xylanase from Geobacillus stearothermophilus: E159Q mutant, with xylotetraose in active site. rcsb
molecule keywords	Endo-1,4-beta-xylanase
total genus	148
structure length	371
sequence length	371
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2014-03-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4pueA00

2PWFA 4S3JA 4AZ5A 1KR0A 1X6NA 4BCEA 1E70M 5KZ6A 4LGXA 2V3FA 2JF6A 3RM8A 2C0HA 1Q6DA 3AIWA 2C8NA 4H04A 2EEXA 1E6NA 1QPKA 1K9FA 4GO8A 4CVUA 3PZOA 4M80A 1J12A 1R85A 3K8LA 4RE4A 2OSYA 1EH9A 1OT2A 2G3NA 1MW3A 2WXDM 2G4FA 4KGJA 1E5JA 5DT7A 3WIJA 1HKMA 5JUVA 4NSBA 4CKQA 4JHZA 4UTFA 1J0IA 1UD6A 3OZOA 2GJXA 2J47A 1R86A 2TAAA 2D3NA 2JEQA 1KCKA 1OGBA 3U7VA 5E09A 1EOKA 3GZAA 3EBVA 1BFNA 1H0IA 2BY0A 1OIMA 2E9LA 1GOKA 3W6LA 3ARRA 1PZ3A 2YA0A 2FHCA 5HPOA 1QI5A 1ZB5A 3EDDA 1JI2A 1OINA 3WH8A 3WFZA 5GQBA 3OZPA 5AY7A 3IJ9A 3WNPA 3VD9A 3GTNA 3PN8A 1E0WA 3UCQA 5ABEA 4J3TA 2CHOA 2J4GA 2PI6A 1XRVA 5CGMA 3TA9A 2XM2A 5FKYA 3ZT7A 1CGVA 2J78A 5EBAA 2Y5EA 3KE0A 4V27A 5DEZA 2OYLA 1J10A 2XVPA 3WELA 1PZ2A 1JZ4A 1HP4A 3ARVA 1XH2A 3WQ4A 2QPUA 4HU8A 1CPUA 2PC8A 1KWGA 1AQMA 3PZ9A 3JUGA 4QP0A 5A8OA 2VR5A 3OIHA 2PB1A 1A3HA 1Z32X 2Y8VA 3ARSA 1TA3A 3UR8A 3ALFA 2X0HA 3WH7A 4X9YA 3AZSA 4W7WA 3THCA 4GI8A 1NOWA 4DWSA 2VX4A 3FW6A 1BYAA 2QHAA 1FP9A 2WANA 3A4WA 2AOSA 1FH9A 1C92A 1WDQA 1PIGA 3N18A 4MTVA 3VDBA 1Q6GA 4XZWA 1MQQA 1K9TA 2YDSA 4UOJA 5M17A 2EPNA 2YJQA 2WMIA 2PBOA 1DWHM 3EDKA 4AIEA 1C91A 1E6SM 2EO7A 2XWDA 1E6XM 2CBIA 2JEPA 1E3XA 4HZ8A 4JL1A 1GOQA 4B9YA 1LWJA 3ALGA 4C7GA 5A95A 1UOKA 1ZBKA 3UEQA 3VVGA 1XCXA 3L2LA 2MANA 3WDRA 4B3KA 1LWHA 1R7AA 3KEHA 1ISZA 3VTRA 3WQ8A 3WMBA 1UWRA 4J3UA 4P7OA 3VILA 1QI3A 7CGTA 1B31A 1XSJA 1RP9A 1ZS2A 2XFRA 2NW0A 5EMYA 4PMNA 6CGTA 2CEQA 3SURA 3VO0A 1AVAA 2CBJA 1VBRA 2FGLA 1IV8A 3PZMA 2J7CA 2GJPA 2VC9A 4CD5A 2B31A 1HJSA 4AD5A 4BQ5A 3BAIA 2ZWZA 5BXTA 4HU0A 3MUAA 4QDMA 1UKOA 3AIUA 1WP6A 1V08A 1B2YA 2ZX8A 3NJ3A 1E43A 2VUYA 4F79A 3WMCA 1MXGA 1QI0A 1E73M 3MMDA 1VEPA 5D9PA 1HJXA 1LL7A 2D20A 3BMWA 1B3XA 4PTXA 3WBEA 3T0DA 4RE3A 4JFVA 1NWSA 1GOMA 1BYDA 4A4AA 1FFQA 3FAWA 1JXJA 1EHNA 2EBNA 1OGGA 3WQ6A 3FXYA 5I79A 2ESCA 5A69A 1JYXA 3OB8A 5AC4A 1MFUA 3SCNA 3CUJA 3UG4A 4R5EA 1NOUA 1R87A 3VIMA 4Z2JA 4MDPA 1GVYA 3ZJ6A 4GINA 3N15A 5CG0A 2IXVA 3ZT5A 5E0CA 4KRUA 4JCMA 3VIHA 4AZCB 1JAEA 2WHLA 4PTVA 1MWOA 1NARA 4WKFA 2OWXA 4ML4A 3L4ZA 1BTCA 1HP5A 2D0HA 4JCLA 1GZJA 3DECA 2WWDA 5CSYA 4Z2GA 4AW7A 5A3HA 2BY1A 4PCTA 3WH6A 2CHNA 1UH3A 2OWCA 1EQCA 1C7SA 1UR9A 4NZCA 3RILA 3OLEA 2XG9A 1UD4A 3QR3A 9CGTA 4WF7A 1OB0A 3RCNA 4AZBA 3CHCA 3W38A 1CLXA 3WKZA 2ZXDA 1E4IA 1J0JA 1WB0A 3ZOAA 1JD9A 2ZX9A 1QNSA 2CNCA 4ZE5A 4MADA 2XWEA 3WL0A 4E2OA 4XUYA 5EB8A 4P7RA 3PTKA 3VPLA 2V3GA 2WSPA 4MJ2A 4WIWA 1W91A 1M01A 1EOMA 3VMOA 3ECQA 2Q8XA 4OOUA 2A3BA 2XTKA 3K1DA 2VTFA 1JF6A 1BVNP 2DQXA 1UH2A 4M1RA 4AZGA 4E8CA 1DP0A 3M7SA 4CGTA 1D2KA 3O2LA 3GH5A 1JAKA 1ECEA 1XYZA 3AYSA 3FAXA 3TTSA 2WMJA 3AZRA 3A4AA 4URIA 3LPFA 2NSXA 2XHYA 1E1EA 3GYCA 5CPSA 3VGHA 1UWQA 3FY1A 4FMVA 4K68A 3BAYA 1I1XA 1DEDA 1B3VA 4QAWA 4DM2A 1W3JA 3OGSA 3UG3A 1LJYA 2O92A 5FD0A 3EMCA 4BQ3A 4OOZA 3AS2A 1H11A 2G3IA 1C8QA 4PTWA 5CPQA 4ZXOA 4F9JA 2VZVA 3DHPA 5C71A 3DYOA 1JG9A 1ZU8A 1MQRA 4BA0A 4TXEA 3N17A 1FOBA 1HNYA 4W89A 4FF5A 3CHEA 4P7QA 3DYMA 1QNPA 1PX8A 4MNKA 4KH2A 3A4XA 4IISA 3BAXA 4EAMA 4TOQA 3MUIA 1ZJAA 4ATWA 1C3FA 3OLDA 2VCCA 2WBKA 3VNYA 4U3CA 1SFSA 2UY3A 3A6OA 4AZ7A 4ACZA 4AISA 3LPOA 2WHKA 3GXMA 1PX3A 3PZQA 4GXPA 4PTMA 3T2PA 1V6VA 1GOWA 3MUZ1 5KEZA 2YL8A 5A2AA 3WN6A 1R8LA 3AHYA 4GI6A 4E4PA 2E9MA 4XV0A 1GPFA 4WKHA 1L0PA 1QI2A 1QW9A 4H7VA 2DSVA 1PBGA 4JFUA 2BY3A 4OBRA 4ZE4A 5CGTA 4PMOA 4TX8A 4RL3A 3MU7A 5I77A 5A6MA 3ARQA 2DH3A 2ZE0A 1AQHA 1EXPA 1FHLA 3RPMA 5I0DA 2CESA 1UZ4A 3ARWA 3VUPA 3ZJKA 5ABFA 1JL8A 3M46A 2V3EA 2VZTA 4UFJA 5FCZA 4PUDA 4JAWA 4M24A 5E70A 2HISA 1HT6A 3CZJA 1CIUA 1A47A 2BVTA 1KXQA 4U3AA 1G9HA 2J79A 3PZIA 1JYNA 4TTGA 2F61A 1GQJA 4OKDA 1OCQA 1GONA 2A3EA 4N42A 2BV9A 4PMYA 1JI1A 2J7BA 3AS3A 1KR1A 3NCOA 2WPGA 2ZXQA 4YN5A 1JZ6A 3DYPA 4CCEA 4OBSA 1YHTA 4UR9A 4UQCA 3AFBA 2OSXA 3CMGA 1B9ZA 2DT1A 1XD0A 1D3CA 4HPGA 1ITXA 3EYPA 5D9OA 1UD8A 3AXXA 2CYGA 2WC3A 1V0KA 2WMGA 5A6AA 1X1NA 4X0VA 2F8QA 2CERA 3KWXA 4DM1A 2GSJA 3W53A 4Z2KA 1NQ6A 1WCGA 3GBDA 5C70A 3THDA 4NI3A 2ZICA 2UY2A 4D71A 5CPTA 2XJ7A 2OYMA 3VMNA 5E6YA 4Q22A 1GQIA 4GO9A 2J7GA 1H2JA 3BSHA 1PEZA 1UD3A 1KWKA 4B15A 1UHVA 2YL6A 5DFAA 4AIUA 2ZXBA 3WSUA 1GOOA 3F5LA 1UZ1A 4DUVA 2GK1B 1GHRA 4LYRA 1WDPA 4PMUA 3PTMA 3PZNA 4W8AA 4TVDA 3CBWA 1JDCA 3IAQA 2VQUA 4FLSA 5HOSA 4OZOA 3W27A 3FNDA 1JD7A 3F5JA 1E15A 3NUKA 3SCPA 4JIEA 2VJXA 2EXOA 1LF1A 4IM4A 3SUSA 4AIOA 2XSBA 2WW5A 4CCDA 3NYDA 3S2CA 2XVGA 1WKYA 4KMQA 3BAJA 2ZWYA 4W5ZA 3B9AA 3S6TA 2DEPA 4LX4A 5BWFA 2F2HA 4GIAA 1KCLA 4U2YA 2E8YA 2D3LA 4WSKA 4D1IA 3AISA 4AD1A 4W84A 3WF3A 2WVTA 4AEFA 2GVYA 3ARPA 3UR7A 3OGVA 1V02A 2WWCA 4C7DA 2BHYA 1ZL1A 1QW8A 2JF7A 5FL1A 1CXEA 4LYPA 3GXDA 4EANA 4QLKA 3AIBA 3GM8A 3HU7A 4L4OA 2J7DA 1BQCA 1OD8A 1CXHA 3BC9A 5A6BA 3GXFA 2PWDA 3SIMA 3PHAA 3K8KA 1QBBA 1NOFA 1BG9A 3WDHA 3WL1A 2J8FA 3W29A 4YHEA 2PWEA 2CBUA 4CD8A 1OSEA 2VL4A 1SMAA 4CCCA 1TMQA 1G5AA 1HJVA 3SCOA 1ZBVA 4YHGA 3MSGA 1B3WA 5F7UA 2HVMA 1E0XA 1UG6A 5EFDA 1QVBA 3W24A 4MB1A 5DF0A 4HZ6A 4TTUA 3VIKA 1W1PA 1WDRA 3T0AA 1KGUA 2ZUNA 5LA1A 1JGIA 3BH4A 1EIBA 1RPKA 4V28A 4FLRA 3M6DA 1EDTA 3WNKA 1J01A 2XGBA 1XD1A 3BMVA 3AMCA 3WUGA 1TCMA 1TZ7A 3W81A 3NSNA 2W62A 1VEOA 1WZKA 3O9NA 4HOZA 3MSDA 1HJWA 3CH9A 4P8UA 5A6LA 2C7FA 1BHGA 8A3HA 1HKIA 2E0PA 3OGRA 4AZIA 4GQRA 1KXHA 1V0NA 1E56A 1MW1A 3OBAA 1XH1A 3AHZA 4JHOA 2D22A 2BHUA 4UOQA 3AZTA 4J28A 1LG2A 1J9YA 2J75A 1CXLA 1CLVA 5AC5A 1BAGA 4DWSC 3OLGA 3CUHA 5CSUA 3KL3A 4HPHA 1GVIA 4AD2A 1BG4A 1EHAA 3AMLA 5CZKA 5AYIA 2JALA 5M3WA 2FDMA 4Z2LA 4EKJA 1B90A 5BXPA 3QHMA 1Q4NX 5FL0A 4LPCA 2WKGA 4W8BA 3RMEA 3ARUA 2W5FA 5HXMA 1BF2A 1UQYA 2O9OA 3HN3A 4KWUA 4AWEA 1UKQA 4XB3A 1CWYA 4J3XA 4V2XA 1BSIA 1RD6A 3AS0A 1UKSA 5I23A 3NSMA 1JDAA 1UUQA 1VEMA 3AHXA 3SUUA 1XH0A 3WQ5A 3IJ8A 1HVQA 3BLPX 1MXDA 2EPKX 5CLWA 4PN2A 1MQPA 5D4YA 4LQ1A 4UQAA 4W5UA 2CETA 2FHBA 3RM9A 2VZSA 4AYSA 2J77A 1KGXA 4CD6A 2W67A 3DC0A 1CNVA 1W3HA 3CIVA 4MAZA 1SYTA 3ARZA 3E1F1 1HKJA 3GNPA 2V38A 2A3CA 3BGAA 2E40A 5EFFA 1G94A 1TFVA 1KQZA 1VIWA 2BVDA 5E9AA 2VQTA 2YL9A 1W1YA 4PMRA 3N11A 2OLHA 2GJXB 5AYBA 4W8LA 1CEOA 4UNIA 2WZEA 2D0GA 4UFMA 4PMQA 3TONA 3MMWA 5LYRA 3RJXA 5IHSA 3M07A 2J7EA 1ZJBA 2BNJA 2XSAA 4AY1A 4GKLA 1CGTA 2NT1A 5ABGA 1UR2A 1V3MA 5E6ZA 3BCFA 1H4PA 5HDRA 1CGXA 2YKKA 3RO8A 1V3HA 3N9KA 1FFRA 3AI0A 2Y8KA 4TX6A 3WEOA 4UQBA 1E71M 1UQZA 4A3HA 4JFWA 4C7FA 1W32A 1JZ8A 4GI9A 2QMJA 4XX6A 2CPUA 3AOFA 4RE2A 5A2BA 4A3YA 3AIVA 4UQ9A 2VRJA 1UA7A 2DGAA 4B16A 3PZUA 1E6QM 1ODZA 3L4XA 1GQKA 3WH9A 2E9BA 3RM4A 1FH8A 1V03A 3VGDA 2OWWA 1TA3B 4OUEA 4J27A 1WNOA 3WH5A 5BYWA 3B9EA 1F4AA 5IFTA 3L4UA 3VMPA 1KBBA 4NRRA 1C93A 3L4YA 4DWSB 1ZBCA 1JYWA 1FHDA 3ZM8A 5M03A 2WVSA 1EQPA 4HTYA 5CXPA 4UZUA 3BCDA 4PYSA 2J25A 4HOWA 1SMDA 4FK9A 3VGEA 3T08A 2VR4A 3KL5A 2ZUTA 2BFGA 1M53A 1H09A 4WJXA 4AXNA 4CN4A 1OWQA 1BVZA 4CUCA 2A3AA 2FGZA 1VFFA 2X2YA 1PJ9A 4LXFA 3ZJ8A 4B3LA 1VB9A 1XSIA 2WLYA 4D6FA 4BS0A 1MYRA 2O9PA 2YA1A 4LYQA 1QHZA 4GZEA 2CCRA 3VGGA 1Q6EA 2YL5A 3VD4A 1UR4A 5A6KA 4D1JA 4W93A 2VMFA 1DWIM 1UR1A 1PX4A 3W6MA 3BSGA 5FOOA 1GOIA 2J7HA 1UA3A 2PBGA 4M29A 2WC7A 4HA4A 1C8YA 2CKSA 4W88A 3T0BA 3GDBA 4QCFA 3IAPA 1E4LA 5JBEA 1E72M 1US3A 4J7RA 3OG2A 5LA2A 1EDGA 1UKPA 2WSKA 1XYFA 4MB5A 3CPUA 4MDOA 5IFPA 1P6WA 2WHJA 4UFKA 2O9TA 1VJZA 2D0FA 3WQWA 3IJ7A 2GFTA 2WBGA 4AZHA 3II1A 1UWIA 3VINA 1JZ2A 1ESWA 1JF5A 1W9UA 1QI4A 3VDCA 3K8MA 3AMGA 1XCWA 5JBDA 4QLJA 2E3ZA 1H3GA 2J8GA 4P8WA 5DO8A 2D23A 2D2OA 4AZ6A 2WB5A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4PUEA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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