4Q32A

Crystal structure of inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from clostridium perfringens complexed with imp and c91
Total Genus 101

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
352
structure length
337
Chain Sequence
KTAYTFDDVLLVPNKSEVLPNEVSLKTQLTKKIQLNIPLMSASMDTVTESKMAIAMAREGGIGIIHKNMTIEDQAREVDRVKRSGGLLCGASIGVTNDMMERVDAVVKAKVDVIVLDTAHGHSKGVIEGVKRIKAKYPELQVIAGNIATPEAVRDLAEAGADCVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQLTAVMDCAEEGKKLGIPVIADGGLKYSGDIVKALAAGACAAMMGSIFAGCEEAPGAIEIYQGRSYKVYRGMGSLGAMAVPEGVEGRIAYKGHLADTIYQLIGGIKSGMGYLGAPTLENLYENANFVVQTSAGFRESHPHDINITKEAPNYS
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
3H1 (11-13)AH10 (299-317)S1 (14-17)TI1 (24-27)S2 (32-35)AH8 (218-227)EMPTYTI2 (25-28)AH4 (129-141)S3 (38-40)TI3 (35-38)AH1 (55-64)TVIII1 (40-43)S4 (44-46)TI4 (49-52)TIV2 (50-53)AH2 (76-88)3H2 (236-238)TIV3 (89-92)S5 (67-70)O2 (72-74)AH3 (103-114)S6 (95-98)TI5 (142-145)S7 (118-122)TVIII2 (123-126)AH5 (155-163)S8 (146-152)AH7 (191-205)S9 (168-171)TI6 (176-179)TIV5 (172-175)AH9 (265-269)AH6 (180-185)S11 (231-234)TI7 (238-241)S12 (248-251)TI8 (241-244)TIV6 (250-253)S13 (254-260)TI9 (261-264)S14 (290-294)AH11 (322-328)AH12 (336-342)S15 (330-333)O1 (47-49)TIV4 (125-128)S10 (209-212)O3 (99-101)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Clostridium perfringens
publication title Crystal Structure of Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase from Clostridium perfringens Complexed with IMP and C91
rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
total genus 101
structure length 337
sequence length 352
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4q32A00
4DQWA 3K30A 4C1LA 3S6DA 4M7TA 3EWWA 5TBOA 3PWAA 4KFNA 1W5NA 2FB3A 4UMCA 4OGZA 4H3DA 3L9CA 1W3IA 3TIMA 3PBWA 4CCEA 6TIMA 3SGUA 3EX4A 4PA8A 4ZQCA 3RK8A 4Y9AA 4ORIA 3BG9A 3B4UA 3NGJA 5G2IA 1KM2A 2V82A 3IGSA 1O5KA 4ADSA 4QNWA 4FNQA 3LTYA 1QO2A 5TQLA 3OVRA 1DL3A 4RX0A 5EYWA 3MBFA 1PE1A 4A29A 4IMDA 1GEQA 2GUUA 2VENA 3LDVA 5HULA 1YXCA 1YPFA 4DO4A 1NF0A 3W84A 3QPYA 4OQVA 4UMBA 5A8GA 4HNTA 3UPBA 2QCCA 1H7WA 1RQEA 1ONRA 4K37A 4Y8FA 1IF2A 2H6RA 3GVGA 3W7HA 2GJLA 5G4EA 4YMZA 3S5YA 5ABTA 4LVBA 3E0IA 1DKWA 5E1QA 4U28A 2YCEA 1SQ7A 5DXYA 4FF7A 3P8IA 4JTLA 3G8RA 4NXKA 1PS9A 4ZMGA 1JVNA 2YXGA 5CPOA 1VS1A 3W7OA 4JS3A 4WD0A 4N9DA 2I14A 5D32A 4UTLA 5G1YA 5FF3A 6ALDA 4JGDA 3P60A 5G4WA 1EWEA 4O52A 1TPH1 1FWRA 3HO8A 4JTJA 4AHQA 3E96A 2ZTKA 1GVRA 2VEPA 1ZENA 4IMFA 1IGSA 4IXXA 4UUIA 2DZSA 3TKFA 2V30A 2B7OA 3O05A 3TROA 5D03A 4MVAA 5SWUA 1I4NA 5F4WA 4YCOA 4TO8A 3KX6A 3N2MA 4JX4A 5U4NA 4NZJA 2HS6A 3VE7A 1SZNA 3S1VA 1AL7A 4PL1A 2ZZ4A 3NOEA 5DBTA 1EP1A 4LVAA 1FX6A 2Q3RA 4LS0A 1CW2A 1EPXA 1VCVA 1LDCA 3U6WA 1GVSA 4LVGA 3HIJA 3TCEA 2BWGA 1DJNA 3C52A 4GUFA 3W7JA 2X1UA 3VE9A 5HNRA 1VHNA 1TPC1 3O16A 3MYOA 2ZTJA 1OYCA 1X1ZA 1Y0EA 1F05A 4HSNA 3W88A 3L0GA 3M47A 3ZWTA 2V2HA 4JIQA 2J9YA 5HUPA 3NL2A 4Z0JA 3O6CA 4RZ4A 3CIWA 1IXPA 3HG5A 3KVKA 3O8AA 1PV8A 1H50A 3LERA 4WOZA 1FCVA 4PTNA 1K03A 3T40A 3CWOX 3TSBA 4TIMA 3N3MA 1YDVA 2E09A 3KHJA 3CC1A 3MHGA 4Z1CA 3I7SA 1SO3A 3BW4A 4ZQPA 3IRDA 5F2GA 4JDYA 1QPRA 3LXCA 3QMTA 3MJYA 1TV7A 4GBUA 2P0OA 3P61A 5KZMA 4NNCA 3W7EA 3P84A 4JTHA 3MBDA 1KBIA 3LCXA 3N14A 5TIMA 2F84A 4A3UA 4LS1A 3UWUA 4E38A 4JIPA 4JXCA 4RJEA 3R12A 1KM0A 3IIZA 5G2HA 3IIOA 3FIGA 4LRTA 4NJGA 3W1AA 3LGEA 2G96A 3V75A 1KFLA 4K7YA 3G1SA 1R30A 1TV8A 2E77A 3AJXA 5LSMA 1RZMA 3M1ZA 4RZ6A 2PRMA 3CIXA 4EF9A 3W23A 1KM5A 5AC7A 4UFLA 3N73A 4M19A 3SSJA 2TSYA 3UNDA 3MHFA 4FNSA 5AHFA 5EKYA 3M7WA 3VFLA 4DBDA 3GXPA 4JTTA 2YR1A 3LBMA 1OFAA 1AW2A 1O95A 4JN6A 3CM4A 4UTTA 3HGRA 3G18A 5E0KA 3LB0A 1VYRA 3BLIA 1SSGA 1IXNA 2QCMA 2Y7EA 1TO3A 2R94A 3NPXA 4FIQA 2PCQA 1F74A 1W3TA 1VLWA 1QDSA 3WJYA 1XDLA 1NSJA 3STCA 2OJPA 1UUMA 2D73A 3QQ1A 3W86A 4CNNA 2QUTA 3P74A 3F4WA 3G1DA 4WQ6A 1O5XA 2WPBA 3TDFA 3B0UX 4K38A 4XQ6A 5D2TA 1LBMA 4LVDA 1OX4A 1AMKA 1NFBA 1JCXA 3DHDA 1EIXA 4R53A 2QR6A 4WY0F 3NQDA 3DI0A 4BWLC 1V5XA 1PHQA 1WOBA 4Y90A 5DELA 3UPWA 1XFBA 1P0NA 2B7NA 5HUOA 2V0TA 2VFIA 3L66A 5LZLA 1FDJA 4HIBA 1LRTA 3WFAA 4RXFA 1I2QA 1UCWA 5LGXA 1C29A 1VRDA 1M7OA 4N6FA 3PS7A 1G4SA 3G1VA 2X1SA 4GNJA 5KZDA 3S5OA 3KVMA 5CPNA 2A85A 1XUUA 5D2VA 5U7SA 3CQ0A 4IMCA 3PBVA 3O07A 1QPOA 4LUIA 4AMAA 4WX2A 4WJEA 2LLEA 3TXZA 2CLOA 2Y61A 2YX0A 2GVGA 5K7JA 1TPVA 3C3NA 4ADTA 1XUZA 1TTJA 2DZPA 1TTPA 5D37A 1UUOA 2V2DA 1SO6A 3S5ZA 4MZYA 4UCGA 2ZZ3A 3GAYA 3SFKA 3LHYA 3DFPA 1WBJA 3W1QA 1GVQA 1EP2A 2E6DA 3GDRA 3GLCA 5LNUA 3VCRA 4K6AA 2CLEA 3H54A 3M5XA 2ZRUA 4MFEA 3M6YA 1D3GA 3FYPA 1IXQA 1RVGA 2FPTA 2A7RA 4YLWA 1XC4A 1TB3A 4MLRA 4UFKA 4O17A 2DZXA 1JUEA 1Q6QA 4YWIA 3T4CA 2RFGA 4NJKA 1S5TA 4MY8A 3BG5A 2C1HA 4Y6GA 3NQCA 3PY2A 1OX4B 2ATSA 3LHUA 1UJPA 4TX9A 4BFAA 3GZ3A 4QITA 3RF9A 2ZFAA 4ALDA 3UQNA 2JBMA 4HKPA 2P1FA 1LCOA 1TRIA 1KM4A 1ZAJA 1WQ5A 2G97A 4TU1A 3FA5A 4FO4A 3LCLA 4QJ1A 1W5QA 3BW3A 4MY1A 2WQPA 3DXIA 3IIXA 1ZAIA 5AFDA 5KSWA 4O15A 5CPLA 3GKFA 1H51A 3QMSA 2JK2A 4XTDA 2CLLA 5BMWA 4OV9A 3WJSA 4KWWA 5C5YA 4AB4A 1FBAA 3W71A 1Q6LA 2J9ZA 4ZVJA 4HNNA 3NM1A 3FOKA 5FI8A 2G5WA 2JKPA 2E5DA 2V2CA 4M7SA 1VYSX 5F4XA 4OBTA 4O13A 3JR2A 1L9WA 1VH7A 4GWEA 2AAMA 1TPDA 2JKAA 5FEXA 3QSRA 2VXNA 2OMAA 1TIMA 2Y62A 3ANYA 1YDOA 3OEXA 1A5SA 3TMLA 4DBEA 4DF2A 1KTBA 2X16A 4I9AA 4FX8A 5KINA 5FESA 3TJLA 3CPRA 4GE8A 5F4SA 4IX2A 4P61A 3BLEA 1JUKA 3W1UA 1FCBA 2WNQA 1XL9A 4Z1BA 3T55A 1SO5A 3TNOA 3QEZA 2E5BA 3LBCA 2CLKA 4U4MA 3INPA 3KVLA 5C54A 4QSHA 2OZ0A 5H91A 1VLIA 4FNUA 5G2WA 1Z44A 1QCWA 1KBJA 3GX9A 3L5AA 2YFNA 3LCIA 2TMDA 4RCXA 4DO6A 4CCCA 3NAVA 2BXVA 1FY6A 3EEGA 1X7FA 3EX1A 5KTLA 3UWZA 5I3HA 2NV1A 3Q2DA 1OVDA 1W5MA 4X9SA 4OT7A 1L6WA 1K7EA 4CNPA 5LNRA 3QZEA 3IIVA 4YL2A 4A22A 1R2SA 4E2DA 4I7UA 3RLUA 3BW2A 4LV9A 2A0NA 4UNLA 1Z42A 4FXSA 3W75A 3F03K 1Q3NA 2VOMA 5F1VA 1GYNA 3M5YA 3G24A 4O11A 5CKSA 2YSWA 3OVPA 2NWSA 2WNZA 3PULA 4RKAA 5T26A 4CCDA 3W1LA 1UB3A 3NXFA 1DJQA 2FIQA 4NU7A 2ZZ2A 2CW6A 4LWWA 2XFWA 4X22A 2BTMA 3CEUA 1OG0A 1W31A 5EMUA 3WK3A 5FF7A 3EX3A 5A5WA 3G1AA 2BSLA 2PURA 3QQ0A 4O28A 1YXYA 1H63A 4JTGA 1AW5A 4K39A 3W85A 1ZAHA 3PR2A 1HTIA 2NX9A 4O1BA 3W7CA 4NJJA 3LXBA 5CSSA 4KKXA 1LP6A 4K8EA 1JJKA 5K9CA 2QCEA 3LV6A 1R47A 3WK0A 4QISA 3W7RA 3N2XA 5AHLA 3TUUA 2C18A 1VR6A 4NJHA 3A23A 2AGKA 5KMYA 3QMRA 3PAJA 1O94A 2NUWA 2O7SA 1KV8A 3WJZA 1U83A 1TREA 3D0CA 3M16A 3E49A 2X2GA 1FDYA 1OF8A 4M6VA 1WOAA 1B4KA 3NQGA 3NQAA 3UWVA 3EX2A 2Z0IA 1MZHA 4GFSA 1H5YA 1GTEA 1M6JA 1O60A 4FX6M 1OFRA 4CQ9A 1OFBA 1JRBA 3C61A 4Z1DA 3LCWA 4IJBA 3L0KA 2OT1A 2ISVA 4BWLA 1LRQA 5F1UA 3EX6A 1OJXA 2DZWA 2WJZA 2IQTA 3HOJA 3O1NA 5I3KA 3GDKA 2B7QA 3QW4B 1PL9A 3UXDA 5BNKA 3QH2A 3UWWA 1D3HA 3KXQA 3C2EA 4UFIA 4G1KA 3P82A 4ORMA 2RDTA 1M7PA 4LY8A 2NWRA 4DF1A 3W7GA 1RQHA 1SO4A 1MSSA 3W3OA 1LROA 3OG3A 3DKJA 3EWXA 2VFDA 3NQVA 4PFMA 3THAA 1DOSA 4O0KA 1ZY9A 3S42A 1TTIA 1VJIA 4DXVA 5DY3A 2PRHA 3W7MA 3HJZA 3WK2A 2QF7A 1FXPA 3W22A 4QIUA 1FDZA 3HPXA 3SJ3A 2VFGA 4MPQA 4NZFA 1DBTA 3W1XA 3TAOA 3USBA 2FPVA 2A6LA 1ME7A 3T78A 3W87A 5LNSA 1N8FA 4RZ5A 2I9EA 3FFSA 3VKJA 3KVJA 3LI0A 4N6EA 4IMGA 4ZQMA 2A1YA 1GJPA 2QUVA 3KFTA 1W54A 3KRUA 1K8XA 4IOTA 1SFLA 4XTIA 1AK5A 4N9CA 5CG7A 2V8ZA 3TV8A 1K7FA 1W0MA 1A5AA 3L0NA 4RLIA 5FEZA 2VEMA 1GWJA 3OIXA 4BI5A 3M43A 1SW0A 2RDUA 3TJXA 4UTHA 1WYIA 5E93A 1OYBA 4RXGA 5D30A 2EGZA 1FUYA 3FEMA 3EXRA 3CT7A 3W7KA 1I2OA 2CZDA 3SGZA 3W2KA 1DORA 3W7PA 3EXSA 3TC7A 5HINA 2NX1A 2QKFA 3CEPA 1L2UA 1JR1A 3EWUA 3M41A 3P7YA 4WUIA 1NAL1 4JX5A 3EXTA 4RK8A 1H7PA 2VFHA 4JYEA 1YTEA 3ATYA 1G4TA 1XCFA 3QC3A 4X3ZA 2VFFA 3MP3A 2YFOA 3BG3A 3PC0A 4JY9A 3T7VA 3MW7A 3H53A 4XZ9A 4IWWA 2OX1A 5HQEA 3W1RA 3PB2A 3YPIA 2QJHA 3TFCA 3EB2A 3HPZA 1XBXA 3NQFA 5HWMA 2A2IA 5AYYA 2E6AA 3ABOA 4UC5A 3C2FA 5HR7A 2CLIA 4O1CA 4UMAA 3NDOA 4EF8A 2J9XA 3TU9A 5CZSA 2H8ZA 3TAKA 3WJWA 2XN0A 4R7JA 1RQBA 1ZCOA 1B57A 2H3DA 2H8XA 2JKEA 4MYXA 2ZZ1A 3W1NA 2NUYA 2GPTA 3B0VC 3U8GA 4ZZ9A 2C16A 3BGJA 1L6SA 1HFBA 2HMCA 1TV5A 4EIVA 1ICPA 4Q4KA 1R2TA 1YADA 2B0MA 2RHGA 3GB6A 4QM1A 3OVQA 3BARA 1GG0A 1LOSA 3DFQA 1QWGA 1F2JA 3JRKA 1P5BA 3P67A 4FX7A 4JICA 5C2XA 3KAOA 2NXHA 4MYAA 3PBYA 3O6YX 4PH6A 2XN1A 3CWNA 4N9EA 3DGRA 4MFDA 1F5ZA 2OCZA 1KLZA 4XKYA 2QCFA 2CWNA 3QPZA 4MIMA 1HUVA 1GVOA 2FTPA 3HG2A 1Q6OA 4JTUA 3MYPA 3P80A 3I68A 5I3GA 5AHMA 5DXXA 2OT0A 1QAPA 2GOUA 4OWGA 3Q58A 1I8JA 3QJAA 3DH7A 1H61A 5HMSA 2H3BA 4O12A 4XBKA 3Q37A 1VQTA 1SZFA 4JTFA 4AH7A 3SIZA 1TJRA 3W1TA 4GXMA 4LC6A 4L4MA 2A6NA 2FLIA 4JY8A 4MLJA 1TJPA 1KFKA 2GJNA 5L9FA 2ATMA 1LM1A 1VZWA 1TPWA 3IVSA 3PUDA 3TA6A 4O14A 4MY9A 4GRSA 5HR6A 1K02A 3W7QA 4NXSA 4IX0A 5BW6A 3C2VA 1TMHA 1A5BA 1T99A 4NX5A 1NF7A 2E1DA 1A50A 1R2RA 5D33A 1KFCA 1K7XA 1N55A 3UD6A 2V9DA 1YDNA 3GXTA 4EWND 5LHEA 1WXJA 3N34A 1VCGA 1P1XA 3O63A 4C1KA 3UYCA 3LCFA 1A53A 1BWKA 2CLFA 1JUBA 1T8XA 3A9IA 3FLUA 5AC6A 4XKYB 1ZALA 1I2PA 3GYEA 3W2JA 4QQ3A 3NEVA 4HNUA 3O15A 4UR7A 1BTMA 1SW7A 3MI2A 1RR2A 1G4PA 2C13A 3W2MA 5FF4A 2Z6IA 4M6QA 4AWUA 4FNTA 2CLHA 1F76A 4H4IA 4ZQOA 3M9YA 2FJKA 4UTIA 3LXAA 4IUOA 3JS3A 1F6PA 1WX0A 2ZA3A 5HJLA 5I3IA 3W83A 5G5IA 2TYSA 1G7VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5M5D A;  5ABE A;  1AJZ A;  2HVO A;  4C1L A;  2ZUN A;  3VD7 A;  4I90 A;  4DWS B;  1ZCC A;  1W3J A;  4LEF A;  2F61 A;  3PWA A;  4YYF A;  1W5N A;  5JVL A;  4JTD A;  5AC5 A;  3LBO A;  4O8A A;  3KDN A;  1R38 A;  4ZQC A;  5EFD A;  4Y9A A;  4WVX A;  4ORI A;  5HA7 A;  1VBR A;  5BZA A;  5I6S A;  2DH3 A;  4JEJ A;  3CZJ A;  2OGJ A;  1R3W A;  2AMX A;  4PGL A;  4Q7N A;  5IFT A;  1DWF M;  5C8B B;  2WC3 A;  2VHL A;  4J40 A;  3SRD A;  1EGM A;  4AG0 A;  2FZN A;  3CHE A;  2WZT A;  1G9H A;  1PX3 A;  4IMD A;  2FGB A;  4C5Y A;  1YXC A;  4WRH A;  3TYE A;  3O0K A;  1YPF A;  1KRB C;  3QPY A;  3VIM A;  3BV7 A;  5A8G A;  4K1G A;  1YBQ A;  3KCL A;  3VZY A;  2XZ7 A;  1ONR A;  4Y8F A;  1IEX A;  1YPX A;  2VGI A;  3W7H A;  4YMZ A;  1I1W A;  5CCZ A;  3S5Y A;  1Y5W A;  5ABT A;  1P0E A;  4NI3 A;  2QGY A;  2G4F A;  3T0T A;  1GQI A;  2PWE A;  3OG2 A;  2O9P A;  2YXG A;  2D0G A;  2Y8U A;  3D47 A;  4DLF A;  1MUW A;  2PAJ A;  4N9D A;  3DOP A;  1YE6 A;  4UTL A;  5G1Y A;  5FF3 A;  2PDU A;  4JGD A;  4B3K A;  3P60 A;  5G4W A;  1EWE A; 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