4Q33A

Crystal structure of inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from clostridium perfringens complexed with imp and a110
Total Genus 102

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
357
structure length
344
Chain Sequence
MARILKTAYTFDDVLLVPNKSEVLPNEVSLKTQLTKKIQLNIPLMSASMDTVTESKMAIAMAREGGIGIIHKNMTIEDQAREVDRVKRSGGLLCGASIGVTNDMMERVDAVVKAKVDVIVLDTAHGHSKGVIEGVKRIKAKYPELQVIAGNIATPEAVRDLAEAGADCVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQLTAVMDCAEEGKKLGIPVIADGGLKYSGDIVKALAAGACAAMMGSIFAGCEEAPGAIEIYQGRSYKVYRGMGSLGAMAKFVPEGVEGRIAYKGHLADTIYQLIGGIKSGMGYLGAPTLENLYENANFVVQTSAGFRESHPHDINITKEAPNYS
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
TI1 (10-13)EMPTYS1 (14-16)AH7 (315-329)TI3 (24-27)S2 (32-33)TIV1 (33-36)TIV2 (35-38)AH3 (227-238)TVIII1 (40-43)S4 (44-46)TIV3 (50-53)TI5 (49-52)AH1 (55-64)TIV4 (88-91)AH2 (76-88)S5 (67-70)TI6 (266-269)S6 (218-222)TIV5 (89-216)S7 (242-246)AH4 (253-265)TVIII2 (247-250)TIV6 (249-252)S8 (270-276)AH5 (279-288)TI7 (300-303)AH8 (342-351)S3 (39-40)TIV7 (290-293)S9 (292-295)AH6 (304-309)TIV8 (296-299)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Clostridium perfringens
publication title Crystal Structure of Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase from Clostridium perfringens Complexed with IMP and A110
rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
total genus 102
structure length 344
sequence length 357
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4q33A00
1ZCOA 2ZZ7A 1J5TA 4Q4KA 1VPXA 1H7PA 5G2HA 5K4XA 1DQWA 4QQ3A 4FX8A 3TE9A 4HNVA 3W7DA 3OVPA 4O16A 3O8AA 3LXAA 1Y0EA 2DZPA 3V75A 4ZQPA 3UYCA 5LNRA 1YPFA 2ZRUA 4EVZA 2JKEA 4IPIA 2ZCGA 3LHVA 4M6PA 4Q33A 1C9DA 1I2QA 3KRUA 5DY2A 3OEXA 1RQHA 3C2RA 5HR7A 3LHTA 4XBKA 3CWOX 4O57A 3TX9A 4LC6A 2ZRZA 5DN1A 1YDOA 2ZYFA 4OBTA 5LHEA 4C1KA 1TREA 2VFIA 2Y70A 4JD4A 3S1WA 1NSJA 2AGKA 2FPVA 2YDAA 1SSGA 5D05A 5FI8A 1VRDA 1ME9A 3N2XA 3FS2A 1MEIA 3UD6A 4N6EA 4O17A 3E12A 1A50A 3QW4B 2X2GA 3Q2DA 3NL2A 1EB3A 4K39A 4BFAA 2PCQA 3R89A 1WYIA 2NX3A 5D2TA 4UC5A 4OT7A 4GRSA 1B4KA 1OYCA 1O94A 2OMAA 3DKLA 3EEGA 3ZFHA 1KBIA 2A7RA 5IM51 3ATZA 1OFEA 1JCMP 5DBUA 4OQVA 4YMZA 3BLFA 3O63A 5CSSA 3OVRA 1FDJA 3VFLA 2CLHA 4OU1A 2VFGA 3NQ6A 4QAIA 3NPVA 1KA9F 4DO5A 1TPWA 3ABOA 3KAOA 2E6AA 1QWGA 4N4PA 4RXFA 3W7RA 3LBCA 4NXKA 4UTLA 1W5NA 4DF1A 5KITA 1V7YA 3P5YA 3LTYA 3QQ0A 3MMTA 1N8FA 3G0SA 4CNOA 3U2OA 5AB3A 1TPFA 4CCDA 3NGJA 5C6MA 2QUVA 3N19B 2QCEA 4KWWA 2WSQA 5DY3A 3B06A 3CHVA 1TV7A 3LCFA 3MYPA 3A5VA 2CLFA 4GJ1A 5CSRA 4PFMA 2QEZA 3C52A 4CNNA 1BWKA 3HB9A 5FF0A 3PB2A 3MWAA 2P1FA 3P7YA 4FNTA 1RQEA 3BVJA 4JTHA 4L4LA 1HO1A 1K7XA 1TQXA 3L68A 1LTDA 1LBMA 4FX6M 3UZ5A 1KLZA 1N55A 2DZVA 2QCFA 2CZFA 2YFNA 3LRMA 4FNQA 3TAOA 2VXNA 4GUIA 1ADOA 3R5EA 3W1NA 3VNDA 1VH7A 1NEYA 4MVAA 3HGOA 3R12A 2ATSA 3N73A 1KTNA 4N4QA 1FWNA 4ADSA 1QDSA 1HO4A 3S5OA 5D09A 4M6QA 3V1PA 3DI1A 1SQ7A 4AHQA 3DU0A 3ABQA 4K37A 4JX4A 3W7GA 4LV9A 5F2MA 4PODA 3ZWSA 1K7FA 3N34A 4GXMA 3Q37A 5BMWA 3W1TA 1S5VA 4TO8A 2FTPA 1UUOA 4Z1AA 4CQAA 4ZQMA 4PA8A 4CCEA 1OK6A 4AEOA 4MYAA 1TRDA 3MP3A 3P82A 2YCEA 3TJLA 1BTMA 4Y9AA 1EUAA 3W2NA 2TMDA 4UTTA 1F05A 4IUOA 3IV3A 5E0KA 4AF0A 3PS7A 3HF3A 3G18A 1IXNA 2ISSA 3I68A 3HOJA 3NQAA 3NYZA 1Q45A 2G95A 1KM1A 1SO5A 3M5VA 1FWSA 3QMTA 4FB7A 5AYXA 4N02A 3OVQA 1EP1A 2Q8LA 4WY0F 3UWUA 4ADTA 1LOSA 4IMDA 4NJKA 4IPJA 3W7LA 1KFBA 1WA3A 3OG3A 1JUKA 2DJLA 4UFIA 3LM7A 1OJXA 4WXYA 4W9TA 5DELA 4LUJA 1TJPA 1XKYA 5BOOA 2AQWA 1RQBA 5H91A 3UPWA 1GVSA 3P81A 3EWYA 3NL3A 5HQEA 1KFKA 1A53A 2A1YA 1VJIA 1X7FA 1F6PA 3T7VA 4NJIA 3NQ2A 5LSMA 2Y7EA 4ICNA 4X3ZA 4ZZ9A 1PV8A 2GPTA 4AWUA 2WSRA 3PBVA 1FXQA 3HIJA 1Q6RA 1W37A 1TTJA 2Y89A 5BW6A 4WD0A 2YX0A 2RDWA 1NFBA 3ANYA 3HGRA 3W71A 1X1OA 1AW2A 4I9AA 1LDCA 4OE7A 4A22A 2Y7GA 1DOSA 3G3MA 4FHAA 3B04A 4DPQA 1P0NA 4PC8A 1IXPA 1S5WA 2C16A 2Q8ZA 3QJAA 5AFDA 4PL2A 1TPH1 3LHZA 3NG3A 2ZTKA 2EKCA 5HR6A 4RZ6A 3EWBX 4CQ8A 3GDRA 1MSSA 4JTLA 1Q6OA 8TIMA 4L4MA 2R8WA 3FFSA 3RF9A 2OZ0A 2HTMA 3LTPA 5AOUA 3W7IA 1LLZA 2ZA1A 3W1LA 4JR5A 3DFTA 5G2IA 2IQTA 3P60A 3MI6A 3K30A 3W87A 5CZTA 5E93A 3S5YA 2VC6A 4UCGA 1FY6A 3W22A 3EWXA 1QCWA 3SJ3A 1B3OA 4JYFA 4PEKA 3B0PA 2NXIA 1EP3A 3GKAA 3PVFA 1YTKA 1VQTA 5F4XA 2WKJA 3W1UA 1X1ZA 5EKYA 3S42A 3IEBA 1W5MA 1ME7A 1C8VA 3O05A 3PG8A 3HO8A 4O15A 1RD5A 3UWYA 4Z0SA 1W1ZA 4JEQA 3KXQA 1QMLA 1I2PA 1Z48A 4A29A 5U4NA 1M6JA 5HNRA 2W79A 2F7FA 1H7WA 1L6YA 3EXTA 5K9CA 3QQ1A 3MUXA 4RZ5A 4N6FA 5FEZA 3A21A 1YTDA 3KRZA 3FYPA 3LI1A 4GNJA 1GG0A 3HG2A 1MO0A 2V82A 1KM3A 5D37A 3NZRA 1AW1A 1G69A 5D38A 3LDVA 3W72A 1QFEA 5EL1A 4UR8A 1H50A 3RFAA 2NWRA 3UY7A 1JQXA 3G1XA 4JNMA 3SSJA 1TPVA 2FFCA 5HUOA 4JIPA 4M6VA 3TK7A 2C18A 4XTDA 3M7WA 4BI6A 1OFDA 1G7UA 2FJKA 4LVDA 2A0NA 3BARA 5FESA 2CZ5A 1XC4A 5KMYA 3CLMA 3LCWA 1K8YA 1PCKA 4Z1DA 2FQIA 3O07A 3UPBA 5FF3A 1ICSA 4QNEA 3N9SA 1IIHA 3S0CA 1J2WA 3HJZA 1GYNA 2OT0A 1JJKA 3TMLA 3IVUA 3H54A 2TSYA 4ZQCA 2B0MA 2ZDRA 2J24A 1W5QA 5BNKA 3C2OA 2WNZA 3TC7A 3LLFA 5GVJA 3IIXA 3EX4A 3I6RA 1GZGA 2E77A 4O1BA 1T99A 2B7PA 4PL1A 4E38A 3M41A 5HUPA 1F2JA 2GQAA 1QNVA 2V5LA 3MP5A 2WV8A 2Y88A 5G1TA 1E51A 4UNLA 2J9XA 3FA5A 5TBOA 4JTTA 2WQPA 1TJRA 3S5ZA 3C61A 5I3JA 3LHUA 4JY8A 3EX1A 1NAL1 1QAPA 1CX9A 4K8EA 2QCLA 3QRHA 5AN7A 1YXDA 4MLJA 4LS2A 3NPUA 1GVRA 4O18A 4PH6A 4JS3A 4FIRA 3NQCA 3H55A 3I7QA 1SO3A 3EWZA 4BK9A 2DZSA 2A85A 4O1AA 1ICPA 3LI0A 1YDNA 4UTJA 3M16A 4CCCA 1ZENA 2Y61A 4WJEA 2HMCA 1IXQA 2DJXA 1JUBA 4K7VA 3QMSA 3IIZA 1OFOA 1VR6A 5TQLA 4UTKA 1FWWA 3IGSA 4UFJA 2FLIA 3NXFA 5F4WA 4RXGA 2Y7DA 1W3NA 2PRMA 5FEXA 2R91A 3LV5A 4AH7A 1XL9A 4BI7A 4TU1A 3DHDA 2GVJA 2C1HA 1XBVA 4UTMA 2ZZ5A 2NWSA 4UMBA 3CWNA 5T26A 3A24A 4O1CA 4HIBA 3EX6A 4UFLA 4D2JA 3IIVA 4JTIA 4LVFA 2VKZG 1F7BA 4YLWA 2FDSA 4LY8A 3MHFA 4DPPA 1YLVA 3LBMA 3W3OA 1LYXA 2ZRWA 1R30A 1M7OA 5D30A 4LW7A 4XQ6A 1JRCA 1UCWA 3OBKA 1HL2A 4HNTA 4S2CA 3TCEA 3W84A 4G1KA 4UTIA 4ZL1A 1FXPA 2XN0A 3PG9A 3EX3A 3W73A 1DQXA 1PL9A 3USBA 1UJPA 3LRLA 5KTLA 4AXKA 3GKFA 1L9WA 1DORA 2FB2A 3W1AA 1LBLA 1OFBA 2NLIA 3LGEA 5F1UA 3S8HA 3FLUA 2EF9A 5H2ZA 4A2SA 3BG3A 1L6SA 2QCDB 4NX5A 5DXYA 2CLLA 4FNSA 1ML1A 2A21A 3TC6A 1R2SA 4A21A 2C6QA 4RV8A 1QPNA 3W1MA 2Q3OA 1QPQA 3DENA 3KVKA 3P84A 4JGDA 3OIXA 2ZA2A 3HG4A 1VYPX 1WBJA 1K03A 3DXIA 4H4IA 3W7CA 3L2IA 5I3KA 3A5FA 3W7JA 3CM4A 4RK8A 3MP4A 3VI2A 3BGJA 3QEZA 3NA8A 4DXVA 3HMJG 1B57A 4O11A 4JTSA 1H63A 3DZ1A 3AJXA 1KLYA 1G4SA 1VCVA 3TXVA 5K4ZA 5K7JA 4IQLA 2NX1A 3NNTA 5D03A 4IWWA 4NNCA 2BSLA 1QPOA 3NR0A 3QH2A 3ZR4A 2JGYA 2I1OA 3MBDA 2G96A 3PULA 4FXSA 3NOEA 1W5OA 1I45A 1S3HA 3CU2A 3G1AA 3L21A 5FF7A 1RVGA 4FNUA 2I9EA 4MY8A 1Z42A 3D0CA 2VENA 3F4NA 2O7QA 1IF2A 2J27A 3WK1A 1MZHA 3W7OA 3GLCA 1I2OA 3UWVA 5G1YA 3E9AA 5LGZA 3KHJA 4LVGA 1KM2A 5LNWA 3WK3A 1GG1A 3PBUA 4GE8A 3O6YX 2WNQA 4ORMA 3C6CA 1FQ0A 4IMCA 2R94A 1R2TA 2GOUA 2NV2A 4OWGA 3SY5A 1LROA 1SPQA 2V8ZA 3F1QA 3G3DA 4ZQRA 4N9BA 4AAJA 5AHFA 1MEWA 3HQ1A 3TXZA 3TMQA 5HWMA 4I7UA 1ZAIA 4WOQA 1GWJA 1ICQA 1TPC1 3GZ3A 5HWNA 4GUHA 1OABA 1JULA 3ZS4A 1TPB1 4JTUA 4K6AA 2A2IA 2PRLA 3NEVA 4LV4A 4MFDA 3MW7A 4LNYA 4DELA 3UWQA 5BRBA 4DEFA 4RR4A 1YXCA 4MZ8A 1BKSA 1BWLA 3DFSA 2UV8G 1H7XA 3C2EA 3N9RA 2BZNA 1XFBA 2CLIA 4NXSA 3B0VC 1DV7A 4YCOA 1FCBA 3VCRA 3WK2A 1KM5A 2PE4A 2ZRVA 3G1HA 2PURA 1VS1A 4WY0B 3W86A 4JDYA 2WOQA 1QOQA 2WPBA 3INPA 3W75A 3KVLA 1DJNA 3P74A 3W7HA 5EYWA 1LP6A 2H8ZA 5KINA 1KV5A 3TA6A 4NZJA 1OYAA 3HPXA 5G2WA 4C1LA 1R46A 5FF4A 3TQ0A 2EPHA 3TW6A 2ZZ6A 4O0KA 4UUIA 2B4GA 1HTIA 1I2NA 3SECA 4O14A 3W7PA 1B9BA 1ME8A 2NUXA 2I14A 2ZBTA 5LHFA 1OF6A 2BXVA 4J9JA 4O54A 1GJPA 4LVAA 4POCA 1KM6A 3W2MA 3IVSA 5IBXC 2Q3RA 2Z6IA 1A5CA 3STCA 3PB0A 4AVFA 2X16A 3PSWA 3RNDA 3HG5A 1G7VA 3KOFA 2V9DA 4FNPA 3FKKA 4JTJA 4EOUA 2OX1A 3EWWA 4Z1BA 4LUIA 4LWWA 3STFA 5EA9A 4HPJA 4MFEA 4CQ9A 5DXXA 2J9YA 3EX2A 3QW3A 3NQVA 5LKYA 3NAVA 2QUUA 3MBFA 3N3MA 3YPIA 1T0OA 1O4UA 5TIMA 3TKFA 4A3UA 3P61A 4YL2A 3NQDA 3TW7A 3I7SA 1JCLA 2GJLA 1KM0A 1H51A 4QIUA 4S2BA 3NL6A 5CG7A 2EAWA 1D3HA 4YXGA 4KFPA 1KTBA 4WX2A 5DBTA 3F03K 2QUTA 3N2MA 3BO9A 1JCXA 3M1ZA 3LCIA 2YFOA 5I3IA 1SO6A 3KFTA 4MUZA 4U28A 1KFCA 4HPXA 5HINA 2JBMA 1QO5A 4O13A 4DBDA 4HT3A 1GTHA 1J4EA 3ATYA 2QDHA 4RZ4A 4IMFA 4EIVA 1XDLA 3PWAA 4FEZA 4UFMA 4K7YA 1TPDA 1QPRA 2RKXA 1UB3A 1OFPA 4E0CA 3NM1A 4ZVJA 1TCDA 2YYUA 4AWTA 3LERA 1EPXA 1ZFJA 1JUEA 2V2DA 3GDTA 3LCGA 4U4MA 4K8HA 4O50A 1I8JA 3MYOA 3TIMA 3CIWA 3UWWA 2P0OA 2ISVA 4XWUA 1SSDA 1DJQA 3SW6A 4O28A 4NU7A 2WNNA 5F2LA 5L9FA 3WJYA 4JYEA 1RZMA 3OHIA 1PIIA 4XKYB 1SFJA 1AG1O 1O5KA 1VCGA 3F4WA 5AHLA 2H3BA 5CKSA 1XI3A 3EWUA 1GPWA 4JIQA 5C55A 3P80A 3SIZA 1TSIA 4GUJA 1ZJIA 1ALDA 3DBPA 4MY9A 3WJZA 2GVLA 4LVBA 1G4PA 1G67A 3BLIA 4DF2A 3NM3A 4NJGA 5C2XA 3B0UX 3L5LA 4LRTA 1KW1A 3GR8A 1TIMA 5CPOA 2RHGA 3SGZA 5CGQA 3TROA 4A2RA 3TU9A 4O52A 1U83A 3S9YA 1KTCA 2JKPA 5KZEA 3WJWA 1G4TA 4HN4A 1SUXA 1XDMA 4LS0A 3GVGA 1WQ5A 3TH6A 4HHPA 1FDZA 1HG3A 3NQ7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3E0V A;  4YJ5 A;  3SEP A;  1KBL A;  3IAC A;  3WF4 A;  1LQA A;  1VB9 A;  1GYM A;  1O6I A;  3ARP A;  4M1B A;  1PJ9 A;  3TE9 A;  5MKG B;  4IP7 A;  2BHU A;  2GSJ A;  2REQ A;  1ITX A;  4O16 A;  3LXA A;  1NFP A;  1FHU A;  1YPF A;  2ZCG A;  4Q33 A;  4GQB A;  3C2R A;  5HR7 A;  4O57 A;  2J7C A;  3TX9 A;  1E4L A;  1UWT A;  2DSK A;  1U1U A;  2HK0 A;  4ZSU A;  5DN1 A;  3VIL A;  1NY1 A;  3TYU A;  1J5S A;  2Y70 A;  2GSH A;  4LY4 A;  4OFC A;  4L9Z A;  4PMU A;  2FPV A;  4MM1 A;  5D05 A;  4A8L A;  3N2X A;  1MEI A;  4KET A;  3UD6 A;  1GOW A;  4N6E A;  3CMG A;  4O17 A;  3E12 A;  5C9U A;  1RY8 A;  3QW4 B;  1S38 A;  2SFP A;  1LJY A;  1PYF A;  4K39 A;  4Q6X A;  4DUO A;  2PCQ A;  5GPR A;  3T2P A;  2Z26 A;  1KBB A;  4GRS A;  6XIM A;  3ZFH A;  4P7L A;  5IM5 1;  3N6J A;  2VUR A;  3O63 A;  1BF6 A;  4OU1 A;  2KX9 A;  4NYU A;  3CUJ A;  1QWG A;  4RXF A;  3LY0 A;  3W7R A;  1P7T A;  1W5N A;  5KIT A;  1V7Y A;  3GVQ A;  2EPN A;  4WGX A;  3G0S A;  2DGA A;  1DXI A;  2VZS A;  3NGJ A;  2QUV A;  3PJU A;  2D2O A;  3NOY A;  4KWW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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