4Q33A

Crystal structure of inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from clostridium perfringens complexed with imp and a110
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
357
structure length
344
Chain Sequence
MARILKTAYTFDDVLLVPNKSEVLPNEVSLKTQLTKKIQLNIPLMSASMDTVTESKMAIAMAREGGIGIIHKNMTIEDQAREVDRVKRSGGLLCGASIGVTNDMMERVDAVVKAKVDVIVLDTAHGHSKGVIEGVKRIKAKYPELQVIAGNIATPEAVRDLAEAGADCVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQLTAVMDCAEEGKKLGIPVIADGGLKYSGDIVKALAAGACAAMMGSIFAGCEEAPGAIEIYQGRSYKVYRGMGSLGAMAKFVPEGVEGRIAYKGHLADTIYQLIGGIKSGMGYLGAPTLENLYENANFVVQTSAGFRESHPHDINITKEAPNYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase from Clostridium perfringens Complexed with IMP and A110
rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Clostridium perfringens
total genus 102
structure length 344
sequence length 357
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4q33A00
3MJYA 3BW4A 2CLFA 1ZFJA 1TQXA 3PBUA 3TR2A 3QPYA 4JXCA 3S5YA 3MHUA 4X9SA 2Y7EA 5H91A 5K9CA 4M5PA 1GOXA 5I3HA 3ELFA 4UTIA 5DN1A 1KBIA 4NXSA 1GG0A 4PH6A 3W7HA 1RQBA 4BWLC 3EWBX 4JTHA 3QRHA 4IQLA 4WJEA 3PBVA 3KRUA 3V75A 4CQ8A 2R8WA 3FEMA 3PBYA 1SZNA 2XN0A 3B04A 3GXPA 3Q94A 4O16A 4E2DA 3EX1A 5D2TA 2DZWA 2FDSA 1N8FA 1RZMA 4UMBA 5CZJA 2GQAA 4LUJA 4O15A 1KFKA 1CW2A 4FXSA 2EGZA 3KRSA 1FUYA 2YSWA 3ABOA 1OFOA 2Y70A 2GJLA 4JIQA 3DHFA 4LW7A 3A5VA 4FX6M 2WOQA 4XUGA 3NQMA 2ZQ0A 2Q8LA 5F2IA 3G8EA 1LOSA 3KHJA 5L9FA 3O15A 4NVTA 3N9SA 2Y63A 4O57A 1TRIA 3SY5A 1VLWA 3M5VA 4EF8A 3NL2A 1GVFA 2F84A 3B4UA 3DFQA 5IM51 3MO7A 4TMCA 4AH7A 3BLIA 4O54A 2B0MA 1UASA 3CU2A 2XN1A 1B4KA 2VOMA 3LHTA 3VNDA 2YZRA 3VE7A 3GKFA 4GWEA 1QPRA 3IVUA 1EP3A 3C2EA 2CLLA 1VCGA 2PRLA 3M47A 2XN2A 1EPXA 1JUEA 2R14A 3H53A 2CWNA 3S5OA 3GDMA 3KFTA 3CEPA 4HNTA 5F2GA 1XBXA 3PM6A 1TPH1 2CLMA 4MLRA 3UWZA 2A2IA 2VEMA 5LNSA 1WDWA 1I2RA 4R7JA 1LBFA 4AB4A 1ADOA 3L2IA 2EKCA 2WNNA 3QPZA 1O95A 3WFAA 4LTSA 1OVDA 3PR2A 1TPDA 3NPXA 4W9TA 4HSOA 2NX3A 2ZTJA 4GE8A 3TUUA 1VJIA 3CIXA 3LCXA 3PSVA 5I3GA 4FNRA 1BEUA 1SR9A 3STGA 3W84A 1NVMA 3UNDA 4Y8FA 3JS3A 3G1DA 3EWYA 4AXKA 3O8AA 3B0VC 4WX2A 4YLWA 3HF3A 4FX8A 1OABA 2X1SA 1F76A 3NEVA 5HWNA 1NF7A 4K38A 2E77A 4BK9A 2NV1A 3CQ0A 4FNPA 3TSDA 1TV5A 1KFJA 4A21A 4ALDA 1KV8A 1L2UA 3PVFA 1BTMA 1H7RA 2JGQA 5K3VA 4NNBA 4LC6A 4JY8A 2QCCA 3NPUA 1QPOA 2AQWA 4XBSA 1R47A 2IQTA 2NLIA 3TU9A 5HUPA 4B5NA 5EY5A 1G69A 2V2CA 2QCEA 4UFMA 1OHLA 2GVLA 3HJZA 3S1VA 4Y96A 3UPBA 1SZFA 2ZRZA 3UZ5A 1EA0A 2JBMA 3W23A 2CLOA 2V5LA 2WV8A 5D03A 4N9EA 3NPVA 5TQLA 1Q6LA 1WYIA 1OX5A 4RV8A 2VFGA 4DELA 3DH7A 1KBJA 4QSHA 1LROA 4Z0JA 4CCDA 4ZZ9A 2A4AA 1WXJA 4O17A 4IMDA 1MEIA 3W2UA 1YLVA 2QAPA 1S5TA 1A53A 4ONVA 2GVJA 3W7KA 3KVLA 5AHMA 5HJLA 1ML1A 1X6UA 4LS1A 3LCIA 1K7XA 2H6RA 1GWJA 3W1RA 4O1DA 3M43A 4K39A 1PE1A 3LB0A 3LX9A 1C29A 1FWNA 1Z41A 3QF0A 4X2RA 1KM6A 5FF7A 1YDOA 2BXVA 2ZA1A 4LNYA 2B4GA 2HS8A 5CZTA 3TJXA 2ZZ3A 3F4WA 1K8ZA 3Q58A 2DU2A 5L6UA 1X1OA 5ABTA 3TIMA 1SSGA 5T26A 4LVFA 5E93A 4AWUA 4O19A 1TQJA 2E5CA 3HBLA 3THAA 2PURA 4PTNA 3A23A 3LV5A 4IPIA 4NZFA 2WQPA 3NQ6A 1BKSA 3W1NA 4OBTA 1AW2A 1D3GA 2FPTA 1WAUA 3G1VA 2ATSA 1TJPA 1JQXA 4HNNA 5C55A 2LLEA 4GUHA 1FXPA 5D04C 4DF2A 1AW5A 3TK7A 3FIGA 4UTKA 2YDAA 2HTMA 4Z1BA 1X7FA 5LHFA 3E12A 3TJLA 1OFPA 2YPIA 4QQ3A 3FKRA 2C14A 3C6CA 1LM1A 3TW7A 2QDHA 4BI5A 3W7EA 1H7OA 4IX2A 3G3MA 2D73A 4ZQPA 3KXQA 3LHWA 3D0CA 4DBDA 3UWUA 3Q2DA 4ORMA 1W31A 2J27A 3PG9A 4OQVA 3F1QA 4FNSA 2YX0A 3GXNA 4O1BA 3PF3A 1SPQA 2QJGA 1WX0A 1YPIA 2JK2A 2ALDA 3W7GA 3WJYA 1PCKA 1YTDA 3DFNA 1OG0A 3LTYA 3G18A 4JR5A 5HR6A 2BZNA 1G6CA 1MZHA 3UZJA 1ZY9A 1ZNNA 4GFSA 3BG9A 2QCDB 3MP5A 5AC7A 2VFIA 1VYPX 2Y62A 1RPXA 5A8GA 5K7JA 3TXVA 3INPA 3QJAA 2P1FA 4D2JA 2ISVA 3KVJA 1XC4A 2QCDA 1BWLA 2BWGA 4AWTA 5KZDA 3M6YA 3P8IA 4YMZA 4MFEA 1VH7A 1GTEA 2BTMA 3P5YA 3W7LA 4FO4A 4Y90A 4FX7A 1B9BA 1P4CA 1LLZA 4OU1A 2YW4A 4QJ1A 1DJNA 4O13A 4JDYA 1ME9A 3HGJA 2ZZ4A 1MO0A 4MPQA 3USBA 1YXDA 1FDYA 3QQ0A 1AMKA 3N19B 3CPRA 5LNWA 3LDVA 2DZSA 4M19A 1F74A 1TPEA 4QM1A 3R8RA 4MZ8A 4YCPA 4XQ6A 1R2SA 2NUYA 3B03A 4RJEA 1RQEA 1TPWA 3G0XA 3GKAA 5FEWA 4HPJA 1F6PA 1B57A 3NYZA 1DL3A 1NSJA 3TXZA 4NJGA 4GC4A 2FB2A 1W3IA 1RQHA 4RLIA 1EWDA 2RKXA 4EOUA 2VFHA 3PG8A 3OVRA 4MLJA 4FEZA 3W7PA 3NOEA 3PS7A 1FWWA 3NM3A 4NX5A 4WD0A 2C19A 1YXCA 3NNTA 3HGOA 4JTGA 3RFAA 4L4MA 5FEZA 4N4QA 2ISSA 4CNPA 1FX6A 1LP6A 1G4TA 1WA3A 3TX9A 2C13A 1TPC1 3W72A 5D38A 3QEZA 4RZ6A 1LOLA 1T8XA 3PB0A 2TPSA 5FF2A 2TMDA 3OBKA 4YCOA 3PWAA 2PE4A 2CZEA 4WY0B 3GK0A 4FXRA 3LOTA 3L66A 2QCNA 2VELA 1DKWA 5MHBA 1JJKA 4M7TA 3N2XA 4GJ1A 1SW3A 4WXYA 2WSQA 5D37A 4OWGA 3B06A 4FIRA 2ZZ7A 5BOOA 5HUOA 4JX6A 4WY0A 3MBFA 3PC0A 2NXHA 5D02A 3UPWA 3LTPA 5F2LA 3RNDA 1MEWA 3NQGA 3W1AA 4MYXA 1JQVA 4FF7A 5F1VA 3HPXA 1A5BA 2J9YA 3W71A 4N6EA 1W5OA 2ZRYA 4TO8A 2J9ZA 4AHOA 3QSRA 2QCMA 3TAOA 4JS3A 4HKPA 2NUXA 4HIBA 3NQFA 2Z2UA 1E51A 5EA9A 5D2VA 2QCLA 3MYPA 4EWND 3N34A 3M5ZA 4UFKA 3W3OA 2ZRWA 3N3MA 2DP3A 1YPFA 2R94A 1ZALA 3Q37A 3TA6A 2NV2A 1YDVA 4H3DA 3DHDA 3O16A 3LRMA 1P0KA 3DENA 3BG3A 2DZXA 4EVZA 3BLFA 4UFJA 3SZ8A 1H7XA 1QOQA 2YFNA 5AFDA 1FCUA 3IGXA 4FNUA 3S5NA 3NQ7A 1JCNA 5DBTA 1VGAA 2NXIA 3TC7A 3C2VA 2VKZG 4UNLA 2E09A 3MI6A 3NL5A 1VR6A 1TPB1 3OEXA 4G1KA 1GVQA 2I14A 5J5DA 5D2YA 2VFDA 3ZWTA 1GJPA 1V7YA 3GYEA 4JD4A 2VFFA 1K7EA 2ISWA 2H3DA 3C2OA 3EWUA 2B7NA 1LOQA 1LZOA 2CZFA 4UTWA 3BVJA 4LRSA 4NNCA 4OT7A 3LHZA 4QISA 1W3NA 5EL1A 3G1YA 2GJNA 4YWIA 4DBEA 4UR8A 2A7PA 1UJPA 2JKEA 3W7JA 4AAJA 4R33A 3M1ZA 4MKNA 4JNMA 2I1OA 1WBJA 1MSSA 4AHQA 1W54A 3DKLA 3WJWA 2FIQA 2Z1BA 2PCQA 2V2HA 2O7QA 3W87A 5J5RA 1L6SA 4FNTA 5H2ZA 1XXXA 1LRTA 1RR2A 1EX5A 1VS1A 3BPWA 1C8VA 1VPXA 1LBMA 3W2JA 2WSRA 5BMXA 1AL8A 4IMFA 3TFCA 3KVKA 4KKXA 1HFBA 4O4VA 4ZQCA 1OK4A 3S1UA 2A5HA 3IV3A 5DELA 1KM4A 1DJQA 4HPXA 2ATMA 1FWTA 2A1YA 2YXGA 1OFRA 4K6AA 1K7FA 1LRQA 3C2FA 5LGXA 1GVRA 5FEPA 1R46A 4ZQOA 1Q45A 2H3BA 5AYZA 4J9JA 2Y6ZA 4WZHA 1J4EA 3R89A 2E1DA 3CEUA 3T55A 4JY9A 2OMAA 5DY2A 1EWEA 5EBUA 1GT8A 1VCFA 2WKJA 3MUXA 3HG4A 4JX4A 4RXGA 2E6YA 2Z0IA 1DORA 4O1CA 5K9DA 3NZ1A 1IXQA 1IIGA 1PVNA 2Q3OA 3S1WA 5AHIA 3KVMA 1G67A 3IIZA 5BNKA 5DXXA 2CW6A 1EP2A 3L5AA 5F4SA 5AC8A 3I7SA 4O14A 4LRTA 1Z48A 4GNJA 3RLVA 5BW6A 3R13A 4IMGA 5AHNA 1XUUA 3LCFA 4M6VA 4K7YA 3UD6A 2BLEA 2A7NA 1TTQA 3I6RA 4NXKA 3UWWA 3QQ1A 3EWXA 1LTDA 2TRSA 1YADA 2DORA 5D2WA 4MJMA 1LLWA 4EF9A 3G1AA 4GUJA 3AO0A 4DO6A 3GNDA 5K4ZA 1SW0A 3PY2A 1G4SA 2ZA2A 1SO4A 5F2MA 1UUOA 4CLMA 1VYRA 2QUTA 1F5ZA 1VYSX 2JKPA 4JTIA 1AK5A 3W1LA 3N2MA 1LORA 3GIYA 4GXMA 3VKJA 2CZDA 1IXNA 1K8YA 3W2MA 3LRLA 1YDNA 3I7RA 3W85A 2C15A 3LI0A 5FI8A 3GDLA 3QH2A 1OFBA 2ZDRA 1N7KA 3P80A 4O52A 5KZMA 3NXFA 2J6XA 1FXQA 3G3DA 2Y85A 3NZRA 1SSDA 3THQA 1ICPA 3B0UX 3KX6A 4DPQA 3E9AA 3DI0A 3FJLA 3HOJA 1L9WA 2C3ZA 2YW3A 1TV8A 1P5BA 1OJXA 2NX9A 3QC3A 2X1TA 4JICA 4A2RA 2CU0A 3BW3A 1SUXA 2DJXA 3ANYA 5EPDA 3FS2A 3P82A 3VCRA 3T44A 3T4CA 4S2CA 2ABBA 4H6KA 3RMJA 4HSNA 1VRDA 3W86A 3IVSA 1OF8A 3JR2A 4PEKA 1QO5A 4N9DA 2V5BA 1W5NA 1JR1A 4MY1A 1WBHA 1ALDA 3QM3A 3HMJG 4RKAA 3TKFA 4JEQA 5HMSA 1T99A 2TYSA 2NWRA 4NJJA 3UY8A 2OJPA 3FKKA 3S42A 3TW6A 3DBPA 2RFGA 3O63A 2A85A 1OF6A 3YPIA 2B7QA 1HTIA 5CSRA 4Q33A 3FYOA 5KITA 2NXGA 3W88A 3TSBA 1QO2A 2J9XA 4PODA 1HL2A 3LCWA 1JCJA 2CLIA 1M7PA 1XL9A 4ML9A 5BMWA 1YXYA 3MYOA 4WUIA 2HMCA 4LV4A 2O7SA 3W1QA 3W2NA 2Y7GA 3GDTA 5G5IA 1TO3A 3IIPA 3GAYA 1M5WA 1XBYA 1KM3A 2P0OA 2NZLA 4XTDA 1TPVA 3L67A 3EKZA 4O8RA 1F05A 4O18A 4YXGA 1KV5A 1P0NA 4X22A 3W74A 4DO4A 3DFSA 3NPWA 4L4LA 4UTTA 1OFAA 3LGEA 1Q6OA 1B4EA 3L9CA 3WK0A 1TCDA 3TMQA 2HSAA 3P5ZA 3LCGA 4MYAA 4ZQNA 2C1HA 3UQNA 3P81A 1SO5A 4P61A 2QUUA 6TIMA 4K36A 3LERA 5DCBA 2W6RA 1CI1A 2Y7FA 4CCEA 4Q4KA 3CIWA 2G95A 2G97A 3W70A 2QJHA 1M6JA 3P8JA 3W75A 1K3UA 4LVDA 4DXVA 3HG5A 1SO3A 4UC5A 3NR0A 4JTFA 3DGRA 5HR7A 4XKYB 3QW4B 1MXSA 3DZ1A 3LBMA 1IF2A 4M6PA 1JRBA 3G1XA 3GDKA 4MZ1A 3TROA 3E0IA 3GR7A 3UWQA 1YTEA 1FY6A 1PHQA 3LLFA 3S5ZA 4IXXA 3W7OA 1XI3A 5E1QA 3TNOA 1DHPA 1O60A 4DEFA 1W8SA 3LCHA 3DAQA 4Z1DA 3GLCA 4OE7A 1I4NA 5LSMA 1H5YA 4UFHA 2QDGA 3SJ3A 4HHPA 4XZ9A 3CM4A 1S5WA 5I3FA 1ZAJA 3RF9A 4O12A 2Y88A 2CZ5A 1H1ZA 2ZFAA 5F4WA 2NX1A 5IBXA 2ZBTA 3DFOA 5LNRA 2JKAA 1KLZA 3O1NA 3EX3A 5EMUA 1C9DA 4MUZA 5EKYA 3GB6A 2ZZ1A 3A24A 2JGYA 3S8HA 1KM5A 5C6MA 1Q6QA 1JCLA 4XTIA 1OX6A 5CPMA 1TIMA 4K7VA 3MBDA 1Q6RA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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