4QAIA

P. stipitis oye2.6-y78w
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
404
structure length
404
Chain Sequence
SSVKISPLKDSEAFQSIKVGNNTLQTKIVYPPTTRFRALEDHTPSDLQLQYYGDRSTFPGTLLITEATFVSPQASGWEGAAPGIWTDKHAKAWKVITDKVHANGSFVSTQLIFLGRVADPAVMKTRGLNPVSASATYESDAAKEAAEAVGNPVRALTTQEVKDLVYEAYTNAAQKAMDAGFDYIELHAAHGYLLDQFLQPCTNQRTDEYGGSIENRARLILELIDHLSTIVGADKIGIRISPWATFQNMKAHKDTVHPLTTFSYLVHELQQRADKGQGIAYISVVEPRVSGNVDVSEEDQAGDNEFVSKIWKGVILKAGNYSYDAPEFKTLKEDIADKRTLVGFSRYFTSNPNLVWKLRDGIDLVPYDRNTFYSDNNYGYNTFSMDSEEVDKELEIKRVPSAIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Residues Controlling Facial Selectivity in an Alkene Reductase and Semirational Alterations to Create Stereocomplementary Variants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NADPH dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Scheffersomyces stipitis
total genus 142
structure length 404
sequence length 404
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4qaiA00
3QC3A 4DF0A 5AFDA 3MBFA 2NV2A 3TJLA 1H7RA 4L4MA 4MFEA 2O7QA 1LRQA 2QUVA 4JTHA 4CNPA 1YXCA 1TPH1 3NQ8A 2C14A 1ZHAA 1LRNA 2C19A 3GR8A 1SZFA 4NT0A 1RQBA 3W70A 1SSGA 1I2OA 2H90A 4JEQA 4HNNA 3TIMA 2OMAA 4DEFA 3M43A 3THQA 1RVGA 4PA8A 1ZENA 4JTSA 3EXSA 1A50A 4AAJA 1SFJA 2E5BA 3TW7A 1TCDA 5K4XA 3N2XA 1RPXA 3C2VA 3BV4A 5TQLA 1H63A 1MEWA 4GUFA 3LTYA 2BZNA 3C3NA 3IIVA 2DZTA 3G0XA 2NWSA 4Q4KA 5E0KA 3Q58A 3W74A 5F1UA 3UWWA 3TXZA 1A53A 4FNPA 3G1VA 2YW4A 2H8ZA 5J5RA 3E49A 3SW6A 3B0VC 1DJQA 3QRHA 3PY2A 5KZDA 3QW4B 4JICA 1ICPA 3TX9A 1VS1A 4CCEA 1SUXA 5I3FA 4Y9AA 3I68A 3BG3A 2ABAA 1O5XA 1SZGA 2EHHA 4AEOA 4P2VA 4DO6A 2W79A 4XUGA 4CQ9A 2NZLA 1OYAA 5AHIA 2DZSA 1KBJA 3S1XA 4LC8A 4N6FA 4QITA 3P74A 1LOQA 5FEXA 1H1ZA 2OJPA 1LOLA 1ZJIA 3GDRA 3DFSA 1VLIA 5HR6A 4O11A 4N2YA 3QH2A 3C52A 4G1KA 3R12A 5AYXA 1AW1A 3LCXA 1M6JA 2A7NA 3UPWA 3SZ8A 3NL6A 3BO9A 3S5OA 4XKYB 5CSRA 3NM1A 3IIZA 1DV7A 1HUVA 2Z0IA 3NGJA 4MOZA 3N2MA 4AHQA 3KRUA 3NPXA 2WNNA 1P0NA 3W1MA 5HWJA 4A3UA 2A5HA 3G1YA 4RKAA 3HIJA 2C15A 5HINA 3GNNA 2B7OA 4FNUA 3LV6A 3I7QA 4AWTA 5K2ZA 1TPWA 1C9DA 2UV8G 3HGSA 1ZAIA 3OVQA 1TV5A 3T40A 3EEGA 3BLFA 3E96A 1JCNA 1RR2A 2RDUA 3OA3A 3M7WA 5EYWA 3KX6A 4ICNA 2R91A 1EUNA 4OV4A 4WX2A 2Y7FA 1SW0A 5G4WA 2ZFAA 4MY1A 3B8DA 4JTGA 2Y89A 4MLRA 3P62A 3W73A 7TIMA 4H4IA 1EEPA 1X6UA 2WPBA 1LTDA 2V5BA 2CWNA 1YTDA 4QJ1A 3C2FA 5HWMA 3O6CA 1QDSA 3QYQA 1G4PA 3TSDA 1XL9A 1OFBA 3ZFHA 1OYCA 1OK4A 2ALDA 3STGA 4KKXA 3EWWA 1YADA 3CU2A 1K02A 4AXKA 3NR0A 4XKYA 3VCRA 3TMQA 2DZWA 4Y90A 4DF1A 5CPOA 3LLFA 4OQVA 3DGRA 3W71A 1H1YA 4JR5A 3NNTA 3QMRA 4UMAA 2JGQA 3A21A 4MFDA 4Q32A 4ADUA 1SZEA 2C16A 4UTKA 3PSVA 1WYIA 4OBTA 1WQ5A 2VFEA 5CKSA 1EB3A 5F4XA 1KFEA 4JX4A 4WQ6A 5F2IA 3RNDA 4IGHA 2ISSA 4IPIA 1JULA 3TH6A 4P61A 3MJYA 3NQFA 4ZVJA 4O54A 4NJHA 4BI5A 1EA0A 4O53A 3FS2A 1BTMA 3HF3A 3M1ZA 1S3HA 4AH7A 2I14A 1FXPA 5EBUA 1WXJA 3PULA 3UWVA 3NQ2A 4JD4A 4QQ3A 3LX9A 2Y88A 1VPXA 1YXYA 4A2RA 3L21A 1GVQA 3PBYA 3W9ZA 4HHPA 3HJZA 4TIMA 5CZJA 3W1QA 5FESA 1OF8A 1A5BA 3TFXA 2DP3A 1QPQA 4IUOA 2FDSA 2OZ0A 5TIMA 1UASA 3KVLA 2J27A 2QCNA 1GOXA 1JQXA 3TAOA 1TO3A 4ALDA 3W7MA 3L0NA 1ZALA 4XTIA 3UXDA 3LRMA 1YYAA 3PS7A 4ORMA 1FCQA 1I8JA 3WJSA 5LNVA 3NQ6A 2QJHA 4PEKA 1L6SA 4EF9A 3NQGA 3HO8A 1MEHA 4MJMA 1GYNA 3R13A 4LUIA 1N7KA 1W5QA 3PWAA 4RZ4A 3EWBX 5D2VA 2NXHA 3UY7A 1O94A 1OX4A 3TC6A 3UD6A 1T0OA 4WUIA 3CLMA 4YXGA 1WAUA 3K30A 4O12A 1XCFA 2DZUA 3VKJA 3S0CA 4D2JA 3O07A 3DBPA 1SW7A 1SU5A 1C8VA 5J5DA 3EWXA 3IIXA 3TXVA 3CB8A 1ZAHA 3T55A 2WNQA 5FI8A 5EY5A 4K37A 3UWYA 4O1AA 2C13A 1AMKA 4NUWA 1F74A 1TB3A 2X1SA 5CPNA 1YPIA 4CNOA 3T7VA 4BWLA 3KVMA 3F1QA 2B7PA 2CU0A 4JYEA 1FWWA 5BNKA 3W7QA 4YL2A 3B05A 3LERA 2ZZ3A 3A22A 3GZ3A 1DQXA 3LB0A 3O15A 5G2WA 4C1LA 1K8YA 1VJIA 3NEVA 2ZZ7A 1SR9A 2OX1A 1EWEA 4TX9A 2QCDB 2CLIA 3HGOA 2CW6A 2GPTA 3IGUA 2TPSA 1L6YA 5BOOA 1YDNA 4LC6A 3STEA 1TPVA 4A21A 1GT8A 3TSMA 4GFSA 2EKCA 3G8EA 3GNDA 1ADOA 1FCVA 5L6UA 3S1VA 3W1XA 4IMFA 3MI2A 3LCGA 3HQ1A 3NXFA 2QCLA 1JJKA 3JRKA 4DBDA 1U83A 3S9YA 1DBTA 4HSOA 1IXQA 3WK1A 3QPZA 4Q33A 3GR7A 1R47A 1S5WA 3DU0A 4TR9A 2HS8A 5LKYA 3LHTA 2QEZA 8TIMA 1I2NA 2ZZ1A 3M5YA 3P84A 3HG4A 3MYOA 3O06A 2V2DA 3IEBA 5G2IA 3QQ0A 4GUHA 4LOCA 3DFQA 1ZNNA 4FNSA 3MBDA 5D02A 2I9EA 4MZ1A 2TSYA 3LOTA 1SW3A 2DJXA 3LGEA 2QCGA 4ZMGA 1VGAA 3N19B 2XN2A 3GXTA 3DHFA 4OT7A 2P10A 1TPB1 4UCGA 1J4EA 2QCDA 2V2HA 3ABSA 4UTWC 3HPXA 4RXGA 4M6VA 2CZ5A 2V82A 3M44A 3PC0A 3O16A 1JCYA 1QO2A 2W6RA 5LHEA 3IIPA 3CIXA 4FO4A 4CQAA 3LRLA 1LCOA 3TKFA 2FTPA 1KFJA 2FJKA 2JKEA 3U8GA 4HSNA 3KVKA 5DCDA 2FB2A 1O5KA 2YFNA 4E38A 1GEQA 1GTHA 4IWWA 4KFNA 4WY0A 3NL2A 2Z6IA 1UUMA 1VYPX 2JKAA 3Q94A 2ZA1A 3TC7A 5AC6A 5BW6A 3MI6A 3LCWA 4M6QA 3LCHA 1XI3A 1OFDA 3GAYA 4NJKA 1GVRA 3FFSA 4UTTA 2YX0A 4MJZA 3IIOA 4Y96A 1PVNA 5DBTA 4TU1A 4HT3A 1SO6A 3TQ0A 5I3HA 4ADSA 4TMCA 5CZSA 4LVGA 3FEMA 4RR4A 1SPQA 3DI1A 4IQLA 1IIHA 4O1CA 3S5ZA 1YPFA 2X16A 3LCLA 4O1BA 4A2SA 5D32A 3B0UX 1OFAA 4N9EA 2GUUA 3W7EA 5I3KA 5DN1A 2E5CA 1SO4A 3PBWA 2ZTKA 3QZEA 1Q6OA 2QUTA 4LRTA 3W7RA 1J5TA 2YFOA 4IXHA 4Z1AA 3M6YA 5D2XA 2QCFA 1Q45A 3PR2A 4HN4A 3WK2A 1MO0A 4QNWA 1NVMA 1Z41A 3EB2A 3L66A 5I3JA 1D9EA 4IJBA 2YPIA 1OVDA 4N02A 2ISWA 3CEPA 3F4WA 3MI3A 2X1TA 1I4NA 3NPUA 1TJPA 5C5YA 1R46A 3E9AA 1THFD 4WXZA 3B06A 1ICSA 4JN6A 2AGKA 4GUIA 4M19A 3W7CA 2ZRUA 4O17A 4WJEA 2OT1A 5K7JA 4JIQA 4FNRA 3W88A 5A8GA 2QF7A 1G4SA 4UC5A 3E12A 4BI7A 4O57A 5HWNA 3FJ6A 3LTPA 2CLHA 1QO5A 4AWUA 3TQVA 1F6PA 1BKSA 1KTBA 1EIXA 1MZHA 4N9BA 5H91A 1QWGA 1PIIA 3JR2A 3MP5A 2CFFA 3PBVA 3VE7A 2A4AA 3W7JA 2QR6A 3W3OA 1TJRA 2ZZ5A 1LBLA 1W56A 3KXQA 5HQEA 3NM3A 4U4MA 3MWAA 1LBMA 4UXDA 1ME9A 2DU2A 4FNQA 5D38A 4KWWA 3W1UA 4XWUA 1JQVA 4FIRA 1TRIA 1KTNA 4U28A 1CI1A 2E68A 2Q8ZA 3P81A 3ZR4A 3M5VA 3FYOA 4IMGA 2FPTA 4AF0B 3PVFA 4CCDA 4UIOA 3NQVA 5C54A 1QPNA 3B0PA 1IXOA 3DFPA 3LI0A 1KV5A 1S5VA 3I65A 3LCFA 1H60A 1X8FA 3M5XA 1A5CA 4GUJA 5HR7A 3MO7A 2WSYA 3NZRA 4XBKA 2YW3A 4GUGA 2GVGA 3QPYA 1W37A 4Z08A 5EA9A 1CW2A 3EWUA 4LNYA 3INPA 1LP6A 3HPZA 3L5MA 5D2TA 5LNUA 5IBXC 3N14A 1GQNA 3SY5A 2E6AA 4AWSA 3T4CA 1XXXA 4I9AA 2C6QA 4NNAA 1L6WA 5KITA 4OGZA 3LBCA 2WV8A 2GVLA 3M9YA 1OF6A 2Y85A 5EMUA 2BLEA 3IV3A 5G4EA 3LHVA 3BLEA 3O8AA 2XN1A 1PCWA 2PE4A 5L9FA 1VHCA 1W0MA 1GVOA 2ZZ4A 4JNMA 1MXSA 3EX1A 3ATYA 2E1DA 3NYZA 4JYDA 4R34A 4K36A 4AF0A 3DH7A 1TTQA 2QAFA 4JX5A 1GYLA 3OEXA 1SO3A 5C2XA 2RHGA 1KM3A 3VNDA 1LDCA 1ICQA 4HKPA 3N34A 1KA9F 1I2RA 2H3DA 1W3NA 3S1WA 4PFMA 4FX7A 3C56A 2GQAA 6TIMA 1LOSA 4MVAA 1HO1A 5D03A 3UQNA 5HUPA 3SJ3A 2A7RA 5DXYA 2VKZG 1AW5A 4LRSA 1H5YA 4GXMA 2WOQA 3GKAA 1FCUA 2V30A 3ZWTA 2ZDRA 2E77A 3ZS4A 4DPPA 2E5DA 2V2CA 4GRSA 5DXXA 3OIXA 3ABOA 5D09A 2B4GA 5GVJA 3L0KA 3AO0A 3F03K 3HPSA 4UNLA 1TIMA 1PV8A 3MYPA 3G8RA 1LBFA 3NVTA 4AHOA 2QKFA 3STFA 4IPJA 1T99A 1JCMP 2YYTA 1IGSA 4X2RA 3R2GA 4RLIA 2G5WA 3E0IA 1FY6A 4NNCA 2F84A 3RLVA 3C2RA 4YWIA 5KZMA 3IVUA 4UFIA 4MKNA 3P67A 3C4UA 3KRZA 3RU6A 3PBUA 5AYYA 3LHWA 4Z0SA 3FLUA 1KM5A 2VEKA 3S5NA 2GQ9A 3GAKA 1HL2A 3R5EA 4YCOA 2B7NA 2BSLA 4PL2A 3LHUA 5K9DA 3Q37A 1JR1A 4IOTA 4IMEA 3SECA 2DORA 2XN0A 2X2GA 5K9CA 1F05A 5FF4A 1G4TA 1ZY9A 3D0CA 4BR1A 4O18A 3DHDA 3NA8A 1JVNA 1OX4B 1UCWA 4NXKA 3S6DA 1E51A 2NX9A 4M7TA 5LNRA 5AB3A 3QFEA 3PG9A 3C6CA 5DY3A 3ZWSA 2QJGA 4E2BA 1MSSA 4GE8A 4KWVA 1HFBA 4JTTA 1VYRA 3GVGA 1FDJA 2A1YA 3RF9A 3W86A 4S2BA 4CCCA 1FQ0A 2A21A 3S1UA 4PC8A 1VCGA 1G7VA 1LZOA 1GPWA 3GK0A 3MP3A 1GG0A 4AVFA 3H53A 2WSQA 4MLJA 4PTNA 4K8HA 4FIQA 2KZHA 4UMCA 3L0GA 3W7OA 3P5ZA 5E1QA 2GOUA 1QAPA 3W7LA 1GG1A 3UZJA 4M6PA 2J88A 3GX9A 5KZEA 1B9BA 1TPDA 2CZDA 1KLYA 4QSHA 3CIWA 3BW4A 1XC4A 4UMBA 3VI2A 1JUKA 4JDYA 3SGZA 4OHQA 1NSJA 4RV8A 2VC6A 4RCXA 4GNJA 3QQ1A 3BLIA 3N9RA 3O6YX 1DJNA 1VC4A 1EP3A 1SSDA 3HG5A 1D3GA 4LU0A 1NEYA 2D73A 1C29A 2A0NA 3P60A 4AB4A 3GDKA 3W2KA 3CC1A 4YCPA 2PRMA 1YLVA 1W31A 3QSTA 3A5FA 4RZ6A 1DL3A 1HG3A 3O05A 4HPJA 1X1ZA 1AG1O 4JTJA 4KFOA 5KINA 1KM6A 1TPC1 3TROA 4FX6M 4M7SA 5HULA 1V7YA 1RD5A 3DFTA 1AW2A 1G67A 3QEZA 2RDTA 1YDOA 2J6XA 1J2WA 2B7QA 4ZQCA 3SR7A 3M5ZA 1XDLA 3L68A 2Y6ZA 4MYXA 4LUJA 3G24A 1O4UA 3S8HA 2J9ZA 2QCEA 2TYSA 5FEZA 2YDAA 3G1HA 1VR6A 3OHIA 1LRTA 3EWZA 4EWND 4MZ8A 1K3UA 1R2SA 3C2EA 3GYEA 4QNEA 2JK2A 5AC8A 2ZA3A 3I7RA 1KTCA 1YDVA 5LNSA 4X9SA 4LVAA 4UTMA 2FQIA 1H7PA 1TPFA 3LCIA 1O95A 1F7BA 4YLWA 4UTJA 1W1ZA 4RX0A 4S2CA 1EWDA 2VEMA 2HTMA 2Y7EA 1W3TA 4O8RA 3PG8A 3R8RA 1K8ZA 3G0SA 3UWQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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