4QAIA

P. stipitis oye2.6-y78w
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
404
structure length
404
Chain Sequence
SSVKISPLKDSEAFQSIKVGNNTLQTKIVYPPTTRFRALEDHTPSDLQLQYYGDRSTFPGTLLITEATFVSPQASGWEGAAPGIWTDKHAKAWKVITDKVHANGSFVSTQLIFLGRVADPAVMKTRGLNPVSASATYESDAAKEAAEAVGNPVRALTTQEVKDLVYEAYTNAAQKAMDAGFDYIELHAAHGYLLDQFLQPCTNQRTDEYGGSIENRARLILELIDHLSTIVGADKIGIRISPWATFQNMKAHKDTVHPLTTFSYLVHELQQRADKGQGIAYISVVEPRVSGNVDVSEEDQAGDNEFVSKIWKGVILKAGNYSYDAPEFKTLKEDIADKRTLVGFSRYFTSNPNLVWKLRDGIDLVPYDRNTFYSDNNYGYNTFSMDSEEVDKELEIKRVPSAIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Residues Controlling Facial Selectivity in an Alkene Reductase and Semirational Alterations to Create Stereocomplementary Variants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NADPH dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Scheffersomyces stipitis
total genus 142
structure length 404
sequence length 404
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4qaiA00
2WJZA 4YLWA 1ZENA 1E51A 2AGKA 3DHFA 3TXZA 1OF6A 5AHNA 1H51A 1YXDA 4K36A 3BGJA 3VCRA 2WQPA 1EUNA 1VYPX 4LOCA 3I6RA 3C4UA 4MJMA 2R8WA 5HQEA 1K8ZA 1LP6A 4DF0A 1ZJIA 1DKWA 3KXQA 3QW3A 4JX4A 5LNVA 1L6YA 2CFFA 2TMDA 1XL9A 2VELA 5CZSA 1SO4A 4N9DA 3S5OA 4O19A 1B4KA 3GR8A 3HGOA 1IIGA 2DZWA 5G2IA 2V2HA 3LI0A 4JX6A 3W07A 1EPXA 4IX0A 2ZRVA 1EP2A 1OF8A 3PUOA 4GC4A 4MYXA 3THAA 5LZLA 1QOQA 3MMTA 1LDCA 5HUOA 3PC0A 1F73A 4CLMA 3SSJA 3S42A 2UV8G 4FF7A 4JY9A 3FOKA 4R34A 4YCPA 4K7YA 4JICA 4UFJA 2YW4A 3S1UA 1W5MA 3EKZA 1PE1A 1QR7A 3A9IA 3P60A 1S3HA 4YMZA 1RD5A 3U2OA 1PCWA 3TCEA 3W85A 1FY6A 4UTIA 3CC1A 2YYTA 2A21A 4LU0A 2EGZA 2QUUA 5E1QA 1LRTA 3SZ8A 5KINA 3EWWA 2J24A 5AOUA 2NV1A 3ELFA 5CZTA 2VOMA 3EX3A 1EIXA 4UFHA 3W7QA 2PRHA 2VEIA 3PUDA 3NQGA 2E5DA 3P84A 4QQ3A 3LBMA 1W0MA 1G4TA 1VH7A 2D73A 1R2SA 3LM7A 5ABTA 3DFPA 3OIXA 1P4CA 1I2NA 3PBWA 4UXDA 3W22A 1LRQA 1THFD 4QSHA 4Z1CA 1Q6OA 1BKSA 1LOSA 3CIWA 1PHWA 5CZ0A 5KZEA 3MHGA 3WK1A 2RDWA 3HPZA 4K38A 1W54A 1GTEA 1G4PA 3IGUA 1ZAJA 1DBTA 3GXTA 4QNWA 1GVFA 1FQ0A 4OV4A 2BLEA 3HJZA 1FWWA 1WV2A 3DI1A 1QOPA 3NPXA 3TK7A 7TIMA 3T7VA 1A5BA 2GQ9A 1WBHA 2RH9A 2A6LA 4I7VA 3NQ6A 1VLIA 2XN2A 4O52A 3VNDA 1XXXA 4RZ5A 3SIZA 1YTEA 1A53A 1X7FA 1PS9A 1RQBA 3T4CA 2QCDB 3IIVA 3QPZA 2RDUA 3OHIA 1OFDA 3HBLA 4Y9AA 5D2TA 3DFNA 4DF1A 3QMSA 2C3ZA 1G4EA 4MPQA 1Q6QA 5F1VA 1YYAA 3O6YX 4IMGA 2CLLA 1BEUA 1TTJA 2Y7EA 3G18A 3NQCA 1GT8A 1U83A 1L6SA 3TE9A 4TO8A 4NJKA 5AFDA 3W7NA 4FEZA 2QCFA 2J9ZA 3TROA 3L65A 4XZ9A 2NXGA 2J9YA 5CPNA 4P2VA 3KAOA 3PB0A 2JKAA 3IIXA 5AB3A 4JGDA 2C16A 3L0GA 3NOEA 3KFTA 3A24A 3GB6A 3MP4A 3O6CA 5FEWA 2V9DA 2Y7DA 3AO0A 3U8GA 3WK0A 2ZA2A 2Y6ZA 1KFEA 3OBKA 4ADTA 4UTKA 3FKKA 1YDNA 4O53A 1TB3A 5L6UA 1F6PA 1TV7A 4EF9A 4AAJA 3GX9A 5F2LA 3TMQA 1GEQA 1SW7A 2QAPA 3B0PA 4MFEA 4H6KA 2H3DA 3NZRA 3W6YA 4NJHA 1S5WA 4RLIA 3O07A 1VS1A 2WNNA 1P0NA 2GQ8A 3A21A 5DBUA 5LGXA 1GVQA 3QMTA 2ZTJA 2HS8A 5KMYA 4LS0A 4AH7A 1RR2A 2ZRZA 3EB2A 4GUJA 4LW7A 5U7SA 3G8RA 1IXPA 2Y85A 3M7WA 3W2KA 4DO6A 1JCLA 1H60A 3TNOA 2RKXA 4HN4A 3NQMA 1ICSA 1V7YA 5D2XA 1DVJA 1X6UA 3W7OA 5I3JA 4LVBA 1TPB1 1YTKA 1JJKA 5EYWA 3LERA 4Z1BA 6ALDA 3P8IA 3NNTA 4R7JA 2ZRYA 3OEXA 4GUIA 3TQ0A 4JN6A 5G1TA 4UFMA 1WX0A 4M6PA 1VLWA 2W79A 4QM1A 1I2OA 3N9SA 1TPH1 1OYCA 3IIOA 4N9BA 4EIVA 4UTLA 4UC5A 1OFBA 3A5VA 3W1NA 3NL6A 3RMJA 1SZFA 5K7JA 1EB3A 2OZ0A 4S2CA 2V81A 3VFLA 2H8ZA 4NXSA 3IVTA 1QFEA 4OHQA 4NNBA 4HNTA 5G4EA 3F03K 1R2TA 3LCLA 2DZSA 3L66A 3PBYA 1PVNA 3QSRA 2GVGA 1JRBA 1ML1A 1KM0A 4GXMA 5AC8A 1KFBA 4QISA 3G22A 3W2UA 1Q45A 4P61A 3NQ7A 3LTYA 1B57A 4CNOA 1OFEA 4MYAA 3WJYA 4O11A 4YL2A 1AW1A 3IIZA 3DFSA 1OYAA 5J5DA 2YCEA 1F2JA 4NU7A 1VHNA 1OK4A 4UIOA 4CNNA 3W7KA 1ICPA 3HMJG 1I45A 2WSQA 1EWDA 1TRDA 1A5CA 3LCFA 5BW6A 1K8YA 2H6RA 1MXSA 1W5OA 2B7NA 1SFJA 4O28A 4XWUA 3EX6A 3W9ZA 5LKYA 1NAL1 2QCCA 4M7SA 3TR2A 1F05A 2B0MA 2WKJA 1VJIA 2JKPA 1L9WA 8TIMA 3R12A 2ZFAA 2JGYA 3O15A 5HJLA 3STCA 2QUVA 5D32A 3N2MA 1LORA 3G0SA 5CZJA 2CLFA 4JYDA 3QMRA 1GPWA 2C19A 3LOTA 2WOQA 5EL1A 4LVFA 3STEA 3DU0A 1S5VA 3HGJA 4O15A 2BSLA 1XCFA 5KITA 4DEFA 3FIGA 3TIMA 3NAVA 4O10A 3LCGA 4XBKA 4OBTA 3GXNA 4FNRA 4ZQPA 3VI2A 3A23A 4J9JA 1JUKA 4MOZA 3E9AA 5BMXA 4HSOA 1SPQA 4TIMA 1H7XA 2EKCA 5LNSA 3OA3A 4UNLA 4GRSA 1W8SA 3B06A 3MO7A 3V1PA 1TPEA 1PIIA 3ABRA 3W73A 3LLFA 5FESA 1KW1A 3EEGA 1H62A 1R46A 5LHFA 4FO4A 3MBDA 4JS3A 3UXDA 5LNWA 3HPSA 1RQEA 3NQDA 3B04A 2YW3A 2NUWA 3TW6A 4NQ1A 3W83A 4PEKA 2J88A 3TSBA 1JQVA 1R47A 4NVTA 5DCDA 2VXNA 1G69A 2DJXA 3W1MA 4UMBA 3LHTA 1DQXA 1DORA 3PR2A 4IMCA 2IQTA 3MP3A 3DKLA 3W7EA 2NX1A 2V5LA 3W1PA 1LOLA 1XBYA 3W2LA 1VHCA 3O05A 5CGQA 4FIRA 4JDYA 3UY7A 3QF0A 1LZOA 1OFOA 4RCXA 1NFBA 4AHQA 1QO5A 3ANYA 5EBUA 4PCFA 4XKYA 3L0NA 4IJBA 1W31A 5AYZA 1FCVA 3HO8A 2G96A 1KTCA 4MZYA 4GFSA 1SO6A 4AVFA 1T0OA 3CU2A 2AAMA 3BLEA 5KZMA 3L2IA 2Q8LA 2CLIA 3RF9A 3NQFA 5D33A 3W7JA 3DZ1A 3TAOA 1V5XA 3W2JA 1MEHA 1GYLA 2GVLA 3DENA 1OK6A 5D04C 1W3TA 1LROA 2GJNA 4AHOA 1KLYA 3P81A 1BWLA 3GAKA 4I9AA 1C9DA 1QPNA 4O4WA 5D03A 4K8HA 5DBTA 5IM51 3GLCA 3QRHA 3W1UA 2Y7FA 3LHYA 2O7SA 2E09A 1AMKA 4MKNA 2TPSA 1WOBA 2TRSA 3M44A 4IQLA 2F7FA 4FHAA 4QIUA 3P7YA 3I68A 2ATMA 4WXZA 2WV8A 1TPVA 1XM3A 2V2CA 3W1AA 3S1WA 2ALDA 1JCXA 3LDVA 1TO3A 2DJLA 3LCWA 2QR6A 3G0UA 1XUUA 4XKYB 3QH2A 3MP5A 1SZNA 3QM3A 4MUZA 1FX6A 3EXRA 3W7MA 4LRTA 2QCEA 4AMAA 1KLZA 1H1ZA 5DELA 3O8AA 4L4LA 1LLWA 1A50A 4Q33A 1GJPA 1B9BA 1K7FA 2Y89A 2YSWA 2F84A 3QEZA 3LXCA 3K30A 1FDYA 5H2ZA 3MWAA 1W5NA 5D2VA 2YR1A 2NWSA 1P1XA 1HO4A 3VE7A 3M1ZA 1IGSA 4R53A 1WYIA 2E5BA 4NX0A 2ZZ1A 3LRKA 1G67A 1TJPA 2X1SA 3F1QA 4JTGA 1NF0A 3GDKA 3PAJA 5F2IA 4XTIA 5F1UA 1VRDA 2VEMA 2ZRWA 4JY8A 3UNDA 2BXVA 4ML9A 4NJGA 4ONVA 1SO5A 1VPXA 2P0OA 2CLKA 1N55A 1BTMA 1K8XA 2DZTA 2TYSA 2YGYA 3Q58A 2QAFA 5I3KA 5I3GA 4OV9A 2BZNA 3NQ2A 3UXAA 4JYEA 3G3DA 2X16A 3HQ1A 3KVMA 3LXBA 4AEOA 1YDVA 1ICQA 2CWNA 1XKYA 2FJKA 3CWOX 3BLIA 3GKFA 2OX1A 5TBOA 1DHPA 1RVGA 2C15A 1Z48A 1G6CA 1ME7A 1T96A 2H3BA 4AWTA 1D3HA 2XN1A 2YFNA 3RNDA 3W2NA 2QCDA 1IXNA 1Q6RA 4IWWA 3R8RA 1TV5A 4NNAA 5F4SA 3UWUA 5DCBA 4WXYA 5HINA 3DAQA 3R5EA 3TW7A 2FQIA 1I8JA 3USBA 3W7DA 3NXFA 3EX2A 1LBFA 3M47A 3S1VA 3GXPA 3GK0A 4TMBA 2V0TA 3LGEA 1UJPA 1I2RA 2E6AA 3L5MA 4LNYA 3NM3A 3W7LA 3HB9A 3TXVA 1KV8A 2ZYFA 4E2DA 4M19A 1GVSA 5AHFA 1C29A 3CEUA 3F4NA 3PBUA 3W2MA 3BPWA 3UD6A 3BLFA 5AC6A 2X30A 2CZ5A 3DH7A 1CW2A 3FJLA 3LHWA 3LX9A 3MW7A 1G4SA 1SQ7A 3C2VA 5K9CA 3YPIA 3TC7A 3TSMA 1TSIA 1W1ZA 1O60A 1ZAHA 2P10A 4IMEA 3MHFA 4XTDA 2NUYA 3LHUA 4X22A 3CQ0A 3HPXA 4ZQNA 1GQNA 5EKYA 5LSMA 3H54A 4WOQA 4AF0B 3QYQA 2Z6JA 2X2GA 1ZFJA 5EPDA 2NWRA 4WZHA 3EX4A 2R94A 4UFLA 3KX6A 4GJ1A 4XBSA 2RFGA 1HG3A 3B8DA 2CZDA 3TJLA 3M6YA 1F5ZA 3GVGA 2ZA3A 5CSSA 2NUXA 1TQXA 4NZJA 1WAUA 1LLZA 3W7HA 2XN0A 3G1XA 4I7WA 5FEZA 4O1AA 3THQA 1WQ5A 3L9CA 5G4WA 2CLEA 3LCIA 4N4QA 2FPVA 4QNEA 1TPC1 4O4VA 3ABQA 1XBZA 2Y62A 1RV8A 1HFBA 3C2FA 5AHEA 1SR9A 3CT7A 3U6WA 4WUIA 1IXOA 3BG9A 3PULA 1JCYA 1SW0A 4IXHA 3C2RA 3N9RA 4LV9A 5G2HA 4AWUA 3W70A 3VKJA 2FPYA 4GUHA 4BWLA 2FFCA 1YDOA 2OCZA 2C14A 3L5AA 1TTIA 3C52A 3RK8A 2ZRXA 3KVJA 4Q4KA 1WXJA 5FEXA 1YLVA 1DL3A 4RXGA 4O8RA 4KFPA 2J6XA 3G0XA 1TJRA 2A7RA 3HG3A 2HTMA 3P61A 4FNTA 3B0UX 4KKXA 3W23A 1TPUA 3LCXA 3TUUA 5CPOA 2B7PA 4BI6A 5MHBA 3WJSA 2H8XA 1ZCOA 3INPA 1F6KA 1T8XA 3EWZA 1W3NA 1M7OA 4LC8A 1YTDA 3UY8A 1OHLA 3LI1A 3PWAA 4BI5A 4EVZA 4FB7A 1OG0A 3L5LA 3WK2A 4BWLC 1GG1A 2OJPA 1OJXA 4A21A 3C3NA 5AYXA 3HG2A 2X1UA 3M5XA 2X1RA 3NZ1A 1KM6A 2I9EA 3PM6A 5BRBA 1QCWA 1UB3A 3ATZA 2Y88A 3R89A 2E68A 3DHDA 5D38A 1DV7A 4MIMA 4HNUA 4IUOA 1X1OA 2PE4A 1F76A 1MEIA 4GUGA 4WY0B 4IPJA 5CG7A 5DN1A 3G1HA 2EHHA 2ZDRA 3EXTA 5E0KA 3WJZA 4UUIA 4HNVA 4GNJA 1M6JA 4QAIA 4JYFA 4O57A 3W1TA 4OQVA 3E12A 1GTHA 2DZXA 4K39A 4N4PA 5C5YA 2VFGA 1ZAIA 4OGZA 4KFOA 1KM4A 3FS2A 1KTBA 3C2OA 2HS6A 1HL2A 2V5BA 1W5QA 5D2WA 1K7XA 3ZR4A 4HNNA 5DY3A 3W84A 3UWYA 4CNPA 3IIPA 5KZDA 3FFSA 1J2WA 2Z2UA 3ZS4A 2LLEA 4O1DA 3UZJA 5CPLA 3N14A 3ZFHA 2ZCGA 3CB8A 3B0VC 1PCKA 3C8FA 3HG5A 5DCEA 3TA6A 1U5JA 3P67A 3W1RA 4FX8A 2ZQ0A 4JTLA 4JTKA 3CEPA 4JX5A 4NJJA 3LHVA 5BOOA 1UUOA 1JR1A 1H63A 4JXCA 4M6QA 3WK3A 3A22A 3QW4B 2EPHA 1JULA 3EKLA 1ONRA 1DJQA 3P5YA 5L9FA 1OFRA 4OU1A 3EXSA 1N8FA 3I7QA 4N2YA 1RQHA 2PURA 3I65A 3MUXA 2ZZ3A 5C54A 2DZVA 3STGA 4X3ZA 1FCUA 4FX6M 4FXRA 4N02A 4LUJA 4FXSA 2C6QA 3QZEA 4A3UA 5I3HA 4TU1A 4X2RA 4N6FA 1JRCA 2NXHA 5FF7A 3W71A 1KM2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1J12 A;  4H6E A;  2X40 A;  2AGK A;  3XIM A;  1QI3 A;  3PP7 A;  4Z2G A;  1H51 A;  4HPN A;  5LIY X;  1VYP X;  3VZZ A;  3C4U A;  2FGB A;  4PMV A;  1PWL A;  3WKZ A;  2ZOX A;  1U5V A;  4DF0 A;  1DKW A;  4JX4 A;  1J18 A;  5GNY A;  3RX2 A;  2TMD A;  1XL9 A;  3FXY A;  2BG5 A;  4F40 A;  5CZS A;  3BAN A;  5B7Z A;  2G0W A;  3GR8 A;  1IIG A;  5G2I A;  4JX6 A;  2NQL A;  3W07 A;  1EPX A;  3THA A;  4YYF A;  4LAZ A;  3WQF A;  3IJ7 A;  4OOZ A;  1V3M A;  3SSJ A;  3S42 A;  1V02 E;  3FOK A;  4R34 A;  4K7Y A;  3DG3 A;  4UFJ A;  2YW4 A;  3S1U A;  3GSM A;  1PE1 A;  4H83 A;  3AIQ A;  3IJQ A;  4ZOA A;  5FJP A;  2F9R A;  3VD7 A;  5A2B A;  3W85 A;  3FST A;  4MB1 A;  5AYI A;  2VJX A;  1V8E A;  4JZ5 A;  3K8K A;  1K77 A;  2ZIC A;  2J24 A;  3UA3 A;  1VFT A;  3GE7 A;  2QVH A;  2VOM A;  1DWJ M;  1WXY A;  1V6U A;  3U48 A;  4MNL A;  3EX3 A;  1J9Y A;  3N2B A;  3W7Q A;  2VEI A;  2J7D A;  2Q02 A;  1G4T A;  1VAH A;  1LWH A;  3SY1 A;  1PZ0 A;  4Z1Y A;  4U3A A;  2Z2B A;  3UXK A;  3KOX A;  3DFP A;  3PTQ A;  2VX6 A;  5ECV A;  2DSZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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