4QITA

Crystal structure of nitroalkane oxidase from pseudomonas aeruginosa in mutant complex form
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
350
structure length
350
Chain Sequence
MTDRFTRLLGIQQPIIQAPMLGVSTPALAAAVSNAGGLGSIAITGSAAEKGRALIREVRGLTDKPFNVNLFCHRPGQADPARERAWLDYLKPLFAEFGAEPPVRLKNIYLSFLEDPTLLPMLLEERPAAVSFHFGAPPRDQVRALQAVGIRVLVCATTPEEAALVEAAGADAVVAQGIEAGGSRGVFEPERGDAAIGTLALVRLLAARGSLPVVAAGGIMDGRGIRAALELGASAVQMGTAFVLCPESSANAAYREALKGPRAARTALTVTMSGRSARGLPNRMFFDAAAPGVPPLPDYPFVYDATKALQTAALARGNHDFAAQWAGQGAALARELPAAELLRTLVEELR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title Crystal structures and reaction mechanisms of nitroalkane oxidase (NAO) from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords Nitronate monooxygenase family protein
total genus 124
structure length 350
sequence length 350
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.7.3.1: Nitroalkane oxidase.
pdb deposition date 2014-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03060 NMO Nitronate monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4qitA00
3PB2A 3NOEA 1L9WA 4K7VA 2BTMA 4NXKA 4CQ9A 5AFDA 2FPYA 1K8YA 1XDLA 5DCDA 1OVDA 3QQ0A 1QNVA 4ORIA 3DBPA 5EKYA 4WXYA 2ATSA 8TIMA 1H7WA 3PG8A 1GVSA 3S5ZA 3FIGA 1WV2A 4FNUA 5G2WA 4BK9A 5FF0A 2GVLA 3R8RA 4BI6A 5D2WA 2V30A 3CQ0A 1SFLA 1TIMA 3G8RA 3NL2A 4IMFA 1XUZA 3TCEA 4LC8A 2FLIA 3P62A 4LU0A 5CZ0A 1IIGA 3M0ZA 4UFHA 1OFEA 3GDLA 1IXNA 5CZTA 1XXXA 4LTSA 2ZRXA 4JYDA 3BV4A 1EWEA 4YMZA 1H1YA 5HINA 1N55A 2FFCA 3L21A 1FDJA 1IIHA 4RX0A 4OBTA 4QAIA 1ADOA 4UC5A 2YZRA 4AWTA 4O18A 4TMBA 2NLIA 3KVMA 2TYSA 1EPXA 2Y62A 5DLCA 3IVUA 5T26A 1RQEA 2VEKA 2YW4A 3MMTA 3U6WA 3GDMA 5D05A 4JTHA 5CGQA 5D33A 5DBTA 2P0OA 1XUUA 3DI1A 4CQAA 1KFBA 3THQA 1Z42A 1D3GA 3QPYA 2WNQA 3VE9A 1EP2A 1L6SA 2J9ZA 1XM3A 1TTQA 3E0IA 3TQ0A 4TR9A 3OIXA 2WSRA 3DZ1A 4YWIA 4L4MA 3LRKA 1O5KA 1AW1A 4ICNA 4R7JA 3FEMA 4N4QA 1VS1A 2V5LA 2A2IA 2X2GA 2XN2A 3LHTA 2WNNA 5IBXC 3S1UA 3STFA 4W9TA 2LLEA 2J88A 1SUXA 1FQ0A 4N4PA 4E0CA 4A22A 4Z1BA 5KMYA 5LNSA 3G3DA 3LHUA 4ZQPA 5ABTA 4CCEA 4WJEA 3KHJA 1FCQA 3NPUA 1C29A 4HN4A 3SR7A 3C6CA 5H91A 4FX6M 3SY5A 1RV8A 2DZXA 3M41A 4LV4A 1K03A 4TX9A 3T40A 3W7EA 4GC4A 4H3DA 5AOUA 1SZFA 3GYEA 4IMCA 3HGOA 1E51A 2ZRZA 1UUMA 1UB3A 1OFRA 1FX6A 2QUTA 5AB3A 1TMHA 1XBYA 1DBTA 3CEPA 1LROA 5F4SA 3IIOA 1XBXA 5AHIA 3TC6A 5IBXA 3GR7A 3BARA 5I3IA 1OYAA 4O16A 4RK8A 1W1ZA 2XN1A 1G4EA 4JTKA 2QDGA 2V82A 3HO8A 4YXGA 3NQGA 4PODA 4MFEA 4O0KA 1KW1A 4RKAA 1HFBA 1ME9A 1UJPA 2FTPA 4RXFA 3W1MA 1KA9F 4ALDA 2YPIA 4MY8A 2ZZ3A 2TSYA 2QKFA 2WJZA 3WJYA 1B57A 1OJXA 2JGYA 4MZ8A 2WQPA 2ISSA 2JBMA 1KM4A 5C6MA 5J5DA 4WY0B 2GPTA 3NQAA 3VNDA 1C9DA 5C54A 4BI7A 2WOQA 3VI2A 4GUGA 3BO9A 3GIYA 3OA3A 2OT0A 5TBOA 3ELFA 2ZZ4A 4UFKA 2YSWA 2QCDA 5KTLA 3MI2A 1QDSA 4AF0B 5I3JA 1MO0A 4LW7A 3RNDA 3LCXA 1F2JA 5G2IA 2Y7FA 4FB7A 5K9XA 3F4NA 3L5AA 2G96A 3MYOA 3DI0A 3OVQA 4JXCA 2B4GA 2CFFA 3FLUA 2QCNA 1EWDA 3G0UA 1VLWA 3NR0A 1SO3A 4LS2A 5G4WA 4ZL1A 2NXHA 3IVTA 4O11A 3LHWA 2QCHA 3NL5A 3NO5A 1UCWA 1YADA 1WDWA 4BR1A 2XN0A 2YXGA 1PS9A 2CLEA 1OFOA 4UTLA 3W7HA 3O05A 3I7SA 1LZOA 3P81A 1G4SA 3FYOA 3PBYA 1OK6A 1HTIA 5LHEA 1N7KA 1MZHA 4CLMA 3SSJA 3OBKA 1TTJA 4KFNA 2HSAA 2R14A 1OFDA 4TIMA 1TTIA 3W2MA 3SI9A 3I65A 1VCFA 2QAPA 1KV8A 3DHDA 1GOXA 4GFSA 2KZHA 1FY6A 2BSLA 3GXNA 3SECA 1VYRA 2X30A 3OVRA 3W7CA 3QYQA 3BGJA 4AWUA 5EY5A 4HNTA 4JTLA 3M7WA 2VFDA 3NQCA 1GVOA 5HJLA 3UWYA 4MY9A 2YDAA 1SW0A 4FNRA 2VFFA 1QR7A 3QMTA 4A2SA 4K37A 3NZRA 3TC7A 1ZAHA 2RHGA 2XFWA 1BEUA 4IXHA 4BWLC 1TPDA 1KFEA 3HBLA 3G18A 2ZFAA 3W1TA 1T99A 3N19B 2ZTJA 2ZQ0A 3W1PA 1JCMP 1OFQA 1F74A 3CWNA 2RDTA 5TQLA 3VE7A 3G1SA 3O6YX 3TAKA 3STCA 3TSBA 4E2BA 3NG3A 3GK0A 3FOKA 3NPXA 1GJPA 2CLFA 4OE7A 2GVGA 3KOFA 3B05A 3W22A 4WD0A 3LCHA 2PC4A 1O95A 2W0UA 4KKXA 1LOLA 3NAVA 5E1QA 4O28A 2ABAA 3PC0A 1R30A 2A6LA 1LOSA 4O1BA 4XTDA 1CI1A 1WBJA 4GNJA 4YL2A 1VH7A 1W3IA 4JDBA 1UBSA 1G67A 3SIZA 3DFSA 6TIMA 4DEFA 3NQEA 3L68A 3LLDA 4M19A 4XKYA 5AN7A 2C19A 1QOPA 3M47A 1WX0A 2V8ZA 4AAJA 5EA9A 2ZZ6A 3NQ8A 1LRTA 3C2VA 3NQDA 1GEQA 5D09A 4M7TA 4EF9A 4NVTA 3W7JA 3W84A 1R47A 1WA3A 2V81A 3L66A 3P67A 2CW6A 3AO0A 4HSOA 1YLVA 1W54A 2R94A 4N9BA 2VFEA 3BG3A 1VQTA 4KWVA 1X1ZA 1K7XA 3MI3A 2RH9A 3IV3A 2X1RA 4UTHA 3PY2A 3PVFA 1F76A 1MEWA 3B06A 3DH7A 3W7DA 4LV9A 2QCFA 2V2DA 4NZFA 5LHFA 3R13A 1TPB1 3Q37A 5LGXA 1AL8A 2DZTA 3LCGA 4K8EA 1EUNA 5CKSA 2AAMA 3NVTA 1B4EA 2VEMA 3GKAA 3ZS4A 4WXZA 3GDTA 3TE9A 3W2KA 3PBWA 4JS3A 2QCLA 5F2GA 5HUOA 1LDCA 1WAUA 2FDSA 4JIPA 1W5QA 3ZWTA 3TQKA 5K2ZA 1HUVA 2WNZA 3D0CA 2A1YA 4P2VA 3W2JA 5F4WA 4UMCA 1OX4B 4FNTA 3PULA 3KVLA 2C1HA 1VLIA 3A22A 3B4UA 3HPSA 4AHOA 2DZPA 5F2IA 1FDYA 2V2HA 3B0PA 2C16A 5EYWA 2QR6A 2H8XA 3P80A 2V0TA 5L6UA 1WOBA 3GNDA 5F2MA 5D04C 1KLYA 2QUUA 4RLIA 3KVJA 5LNRA 3EKZA 4AHQA 4O1CA 2YW3A 4CNNA 1TQXA 4M6VA 2QAFA 5DXXA 1H7OA 1QWGA 4EOUA 1DOSA 4RZ4A 3OVPA 2G5WA 3U8GA 4HT3A 3TQVA 1GWJA 3O15A 1F05A 1DKWA 2J9XA 5E0KA 5AYZA 1ZFJA 4PL2A 5LSMA 3NNTA 1QPNA 2Y7EA 2C14A 4M6QA 3UPBA 4HPJA 4WOQA 2ZRWA 3O6DA 1FUYA 3W23A 1AG1O 1LYXA 3PUOA 3TDFA 3SFKA 5CZJA 3NPWA 3KRSA 4HKPA 3LX9A 1EX5A 3TXVA 3C2EA 3TAOA 1PL9A 1YXYA 2ZZ5A 2A7PA 4JY8A 4DO4A 2NV1A 1ZENA 4HHPA 1JUKA 3MHGA 4FIQA 2ZDRA 5FF7A 3W7OA 4QQ3A 1G4PA 4KWWA 1YDVA 5DBUA 4PL1A 1LBMA 4RZ5A 1O94A 1R46A 1LM1A 2B7NA 1S3HA 3A21A 4CQ8A 3EWXA 1BWLA 1YDNA 3BG9A 4N2YA 4O19A 2J27A 4DF0A 4EVZA 3C2FA 4MJMA 3KFTA 4GUHA 2QUVA 4CNOA 1RD5A 4JNMA 3EEGA 5HR7A 3TNOA 4NNAA 1SZEA 1VGAA 3WJWA 3PSWA 4AXKA 4LUJA 2WPBA 3FFSA 1NF7A 3VCRA 4UTMA 3IIZA 3W2NA 3IGXA 3HOJA 2EGZA 1FCBA 3PSVA 3GZ3A 1TRDA 4BF9A 5DY3A 2I9EA 1JCYA 3PB0A 2QF7A 3JS3A 3ABOA 3OEXA 3MI6A 4GBUA 1PHWA 1RR2A 2TPSA 4FXRA 4PCFA 3STEA 3WK2A 3UXDA 1JVNA 3YPIA 1JCNA 1LP6A 4JEQA 4PFMA 3QF0A 1IXPA 3WK1A 1OYCA 4LVFA 3LV5A 3USBA 4O4WA 1DORA 3TMLA 2NXGA 3LM7A 3VKJA 5AC7A 3LRLA 2R91A 4ONVA 3W7MA 3M9YA 3LI1A 4TMCA 3EWYA 3S8HA 2E6DA 3EX4A 2JKPA 4Y6GA 2VENA 4LRSA 4N6FA 3W75A 3G1FA 5I3GA 2TRSA 4N6EA 4ZZ9A 2OCZA 3UZ5A 4RR4A 3W7QA 2FPVA 3W1AA 3B0UX 2O7QA 2CLOA 2C0AA 3BG5A 4MZYA 4M6PA 1MEHA 2CLHA 4NJHA 4MVAA 3W07A 1QPQA 4S2CA 2DZWA 4RV8A 1KM2A 2J6XA 1YPIA 4O53A 5G1TA 1IGSA 4O17A 3EX3A 1O5XA 2D73A 3BK0A 2CZFA 2A4AA 2ZBTA 1TREA 5AC8A 4EIVA 1YTKA 1FWTA 2FIQA 4FHAA 4R33A 1Q6QA 5D30A 4A2RA 3GKFA 4LY8A 5F2LA 4O13A 4OGZA 3QMSA 1P0NA 2QCEA 2VKZG 1H63A 2DORA 2GVJA 4FNSA 3LRMA 4Q32A 5I3KA 4O14A 2ISVA 4C1LA 3MP4A 1XBZA 3NL3A 3ABRA 3L0KA 1XCFA 3NYZA 1Q6OA 3LCFA 3W7RA 5AC6A 2TMDA 3M5XA 1GG1A 3Q94A 4MLJA 3S1VA 1KM1A 2C6QA 2Q8LA 4ADSA 3ZWSA 1D9EA 3A5VA 4JICA 3ZR4A 2FB2A 2B0MA 3UXAA 4K8HA 3DU0A 3IVSA 4UFIA 3CT7A 2GUUA 1JQVA 3N73A 5C55A 2NZLA 4LT9A 2X1TA 4LNYA 4BI5A 4WUIA 1R2TA 1W5NA 3SGZA 3LXCA 4Z0SA 2Q3OA 1PHQA 3RF9A 4O15A 3W73A 4JTSA 1WBHA 4O57A 4UFJA 4AF0A 4JTFA 3PAJA 3W1UA 1OFPA 3IGSA 2GJNA 4JTTA 4GE8A 3WJSA 5AYXA 3W7IA 4IMEA 1KFLA 3BVJA 3TMQA 3TK7A 1QO2A 2QCGA 3W3OA 1Z48A 3QMRA 2Z6IA 3LXBA 1H60A 1ZNNA 3KVKA 3I68A 1DJQA 1VR6A 3H53A 3CHVA 2HTMA 3MWAA 1SO6A 1JUBA 3PUDA 4GXMA 3UY8A 5LNUA 2YYUA 3V75A 1R2SA 2Q3RA 1PCKA 4LVAA 4CCDA 3STGA 1TYGA 2WSYA 3P60A 4JR5A 4NX0A 4LVGA 2CZ5A 1W0MA 1P0KA 1I2RA 2NX3A 1TCDA 1A50A 3MW7A 2E6FA 2QDHA 2J9YA 3EX2A 2DJLA 3O06A 1Z44A 3UYCA 1W8SA 3MHUA 4MOZA 1ZAIA 1W3NA 3PWAA 4JTUA 1LRNA 3W1NA 3GVGA 4JIQA 2QCMA 3BW2A 2J24A 3NM1A 4PA8A 3F03K 3S5NA 3L65A 3A5FA 3JRKA 3HGRA 1I45A 4JGDA 4UTKA 1FWWA 4UMBA 1WYIA 2OX1A 2O7SA 1L6WA 5MHBA 1TPUA 5HWJA 4IJBA 1AL7A 1F5ZA 1OX6A 1K02A 2Z1BA 3N14A 3HG3A 3TFXA 1DVJA 5EBUA 3UWUA 1XKYA 3PBUA 1EEPA 1KM5A 3SGUA 5HWMA 4U4MA 2DU2A 1FXPA 3RK8A 2V9DA 3QSTA 4DBDA 1M6JA 1X6UA 3ATYA 4A3UA 1GVRA 1TO3A 3DXIA 2GQ8A 3GAKA 4JX4A 1YTDA 1TRIA 3QFEA 5D2YA 4FNQA 3GX9A 3KRUA 3A23A 1TPVA 2ZRYA 1K3UA 2OZ0A 1DHPA 3HMJG 3P7YA 1T0OA 1TQJA 2DP3A 3O16A 5D32A 1EA0A 3CM4A 2ZZ2A 1GT8A 4CCCA 2VC6A 4UTTC 5J5RA 4PH6A 3UD6A 5KZEA 2QJHA 2C18A 5F1VA 3BLEA 3EWBX 2A5HA 5FEZA 1GTHA 3GDKA 3FJ6A 1SQ7A 4WX2A 3TA6A 3CU2A 3RLUA 3QH2A 5IM51 1H51A 1RZMA 1QAPA 2E77A 1PE1A 1H7NA 4C1KA 3ABQA 2VFHA 1KV5A 3E02A 3G24A 4Y8FA 4DO6A 2JK2A 3UWWA 4UMAA 3W86A 3S5YA 2CLMA 3NEVA 3IGUA 1J2WA 3GLCA 3QRHA 4NJKA 4MJZA 2E6YA 3NA8A 4UTTA 4K36A 4Y90A 1A5BA 1VCVA 4LS1A 3PF3A 4S2BA 5HUPA 3NQ6A 2P1FA 3L5LA 3G0XA 3LB0A 1TV7A 2ZYFA 1ONRA 1OFAA 4IQLA 3LHZA 4IPJA 1G69A 4NNCA 4R34A 3DFNA 1M5WA 1F7BA 1QOQA 5FI8A 1DJNA 3W87A 1QFEA 4IOTA 3PG9A 2CZDA 3DENA 4BWLA 3PM6A 3C8FA 5BNKA 1L6YA 2QCCA 2NX9A 3W7NA 4FX7A 4RZ6A 1VYPX 3HPXA 4X2RA 3KXQA 3IIPA 4UTIA 5SWUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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