4QITA

Crystal structure of nitroalkane oxidase from pseudomonas aeruginosa in mutant complex form
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
350
structure length
350
Chain Sequence
MTDRFTRLLGIQQPIIQAPMLGVSTPALAAAVSNAGGLGSIAITGSAAEKGRALIREVRGLTDKPFNVNLFCHRPGQADPARERAWLDYLKPLFAEFGAEPPVRLKNIYLSFLEDPTLLPMLLEERPAAVSFHFGAPPRDQVRALQAVGIRVLVCATTPEEAALVEAAGADAVVAQGIEAGGSRGVFEPERGDAAIGTLALVRLLAARGSLPVVAAGGIMDGRGIRAALELGASAVQMGTAFVLCPESSANAAYREALKGPRAARTALTVTMSGRSARGLPNRMFFDAAAPGVPPLPDYPFVYDATKALQTAALARGNHDFAAQWAGQGAALARELPAAELLRTLVEELR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and reaction mechanisms of nitroalkane oxidase (NAO) from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords Nitronate monooxygenase family protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 124
structure length 350
sequence length 350
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.7.3.1: Nitroalkane oxidase.
pdb deposition date 2014-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03060 NMO Nitronate monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4qitA00
1OFPA 1Q6QA 2A1YA 4GRSA 4U4MA 1K7FA 4PTNA 1MEIA 2ABBA 5G2WA 1OFOA 4N6EA 1QO5A 4JY9A 1Q6RA 4S2BA 2GJNA 2V82A 3W85A 2Z2UA 1ZJIA 3PVFA 1P0NA 1MZHA 4C1KA 3LI0A 1JCJA 2YSWA 1M7PA 3TXZA 1I45A 1Q45A 4QM1A 1EUAA 2FTPA 2G95A 2QJIA 2W0UA 3UZJA 2YYTA 1YADA 2B7PA 3LBMA 3TCEA 2BTMA 2EKCA 2O7QA 3QYQA 1JUEA 5FF0A 2RH9A 4M7SA 1H1YA 4XBKA 2QAFA 3GVGA 3FJ6A 1FWRA 3HF3A 4PC8A 2B0MA 3B0UX 4O1CA 5D30A 2WPBA 2JGQA 1SW0A 3OA3A 5SWUA 3S0CA 4LC8A 2GJLA 3NZ1A 3SR7A 4TMBA 4GFSA 4O10A 3TV8A 2DZUA 2C18A 4MY1A 2HTMA 1R47A 5HWNA 1FWWA 1TMHA 4AWSA 3G1DA 2FPTA 3B4UA 4EF8A 1J4EA 1JUBA 1ZCOA 2H8XA 3IIZA 3W7NA 8TIMA 2CU0A 4KWWA 2Q3OA 1KV5A 1LOQA 2Z0IA 3QSTA 4JEQA 1MO0A 3M5YA 4WX2A 4JIQA 1IXOA 1U83A 4M6QA 5G1YA 4O1BA 3DHDA 4JTFA 1KFEA 1SZNA 2E5CA 3LCXA 4LUJA 1WQ5A 3NEVA 3FFSA 3LGEA 2C0AA 3M43A 3OVPA 1WAUA 3W7JA 2YYUA 2X16A 3TAKA 4O50A 1W5NA 1YXYA 2DZSA 4IOTA 4N9DA 1XC4A 4AEOA 3W1PA 3M16A 3FIGA 3EXSA 1NSJA 2GQAA 5CSRA 3TE9A 4PCFA 3I7RA 3GAYA 3MW7A 3GX9A 3P80A 5F4SA 4LWWA 4KWVA 4N4QA 4O0KA 1TIMA 2QJHA 3ZS4A 3LCFA 2E5BA 2Y62A 1ICQA 3IVUA 3M6YA 2QR6A 1XBXA 4XKYB 1VCGA 4Q33A 4ZQPA 5D2VA 1AL8A 2XN2A 1YXCA 1FCVA 3UWUA 3LERA 3MJYA 3M1ZA 2VFDA 4O8RA 1L6YA 3TSMA 1VHNA 1ZAJA 5TIMA 1WXJA 1VC4A 2D73A 3GDLA 5T26A 1Q6LA 4O53A 1W54A 1LP6A 4HNTA 5AN7A 4ICNA 1IXQA 4IX2A 2A85A 2Q8LA 1OABA 4O16A 3RLUA 1X6UA 1XBZA 2UV8G 4WJEA 4XUGA 3W75A 3RLVA 1XXXA 1SR9A 2ZZ5A 3IIOA 4MFDA 1GJPA 3UWYA 2QJGA 3DKLA 2EGZA 5I3GA 2E68A 2V0TA 2ZRXA 3P60A 1HO4A 4CCCA 4ZMGA 2HSAA 4DELA 1JULA 2G5WA 1ZFJA 2OJPA 3HGSA 1GT8A 3G8RA 1LLZA 3LHUA 3RU6A 5AC7A 4O15A 1GTHA 3NQMA 4LVAA 4JTKA 3KRZA 4R53A 1G7VA 2IQTA 4Z1BA 4OHQA 2C15A 4AF0A 1KBIA 2V81A 3PG9A 3TR2A 1EP1A 2CLFA 2E5DA 3E02A 5AHLA 1KM1A 1H7WA 3TW6A 1L2UA 4UTWA 1WA3A 2XN0A 3CQ0A 4UTMA 2H8ZA 1SUXA 2CZDA 2VKZG 4OE7A 5HMSA 4HT3A 3N9SA 4LOCA 1QOPA 1LRNA 2J9ZA 4MY8A 4O1AA 4HSNA 1I2QA 1JCMP 4JYFA 3JR2A 3W1LA 1A5CA 1YDVA 3C0JA 1T8XA 5CZ0A 4DEFA 4N4PA 2ZRWA 3MHFA 2J27A 2A5HA 3ATZA 1K8YA 5FEXA 1SZEA 1PHWA 1SQ7A 3EX6A 4RK8A 3W7LA 1H7RA 4O11A 3MI3A 4YXGA 1P0KA 4H4IA 4UR8A 3OHIA 3L66A 5CGQA 4FX7A 2PCQA 7TIMA 5EPDA 4I7UA 3NQDA 2DZVA 1UUMA 3BG3A 3A23A 1XBYA 3RNDA 4DBDA 5H91A 4TIMA 1OX4B 3W7OA 2JKEA 1W5OA 4GUFA 1OFEA 2A7PA 5G4WA 2NV2A 4HNVA 5MHBA 1F6PA 5I3FA 2ISVA 5E0KA 4D2JA 5LNUA 3MI2A 3FYOA 4LUIA 3WK3A 3FS2A 1R2RA 1TCDA 4GC4A 4FF7A 1I2NA 4FIRA 3HG5A 4XTDA 3QPZA 3BARA 4JYEA 4JN6A 1QR7A 4Z1DA 1Z42A 2CW6A 3WJYA 3WJSA 3B05A 4LRTA 1FDZA 1B57A 2OT1A 2BSLA 3HOJA 3PBUA 4YWIA 2NWRA 1VH7A 4YL2A 2ABAA 3MI6A 3LLDA 3EWWA 2ZYFA 3NO5A 4BR1A 3UWQA 4JTSA 1GTEA 3W84A 4AH7A 4BI7A 3NQCA 4HPXA 1TTQA 4UNKA 1RPXA 1TPC1 3FKRA 2X2GA 4MYXA 1A5AA 4NJJA 1K8ZA 3FKKA 4FXSA 2ZBTA 4X22A 3F4NA 2QDGA 1SO5A 1VZWA 2QF7A 3W1MA 5LNVA 4LT9A 2DZTA 4MZ8A 3EKZA 3PB0A 3L21A 4UTUA 2DP3A 3WK2A 3LXAA 3BGJA 3TJXA 2NXIA 4MZYA 1QFEA 1SW3A 4M5PA 3P74A 1VS1A 3HIJA 2YGYA 2R14A 4IMFA 3KX6A 1LORA 5DELA 4GWEA 3NYZA 1M5WA 4WZHA 5CPMA 1TPB1 1LYXA 4ORMA 1BWKA 2GVLA 2ZQ0A 3W7EA 4JGDA 1WOAA 3TXVA 3DZ1A 4PA8A 4X3ZA 3ANYA 3U6WA 1LZOA 3OIXA 2A4AA 2QUVA 1QWGA 2BLEA 3JS3A 3PUEA 4MKNA 3LRMA 5DY3A 3S5YA 1H1ZA 3B06A 3I7SA 4GJ1A 3NQEA 1H62A 1YPFA 4QAIA 3W1AA 2TRSA 3MYOA 3F03K 4OBTA 3B03A 3LHWA 4FB7A 3PBYA 3BW2A 3L0GA 3TQVA 3SFKA 3S1UA 5F2LA 4DO5A 4HPJA 3PM6A 2DORA 1N8FA 4IUOA 2ZRYA 1PHQA 3BO9A 3W2UA 3Q58A 1H5YA 2CLIA 3NVTA 3TKFA 1XDMA 3SGUA 3S6DA 3EX3A 3QMRA 2KZHA 2J9YA 1FWTA 3CHVA 5AHNA 2XFWA 4NNCA 2ALDA 4UTHA 1RQBA 1X7FA 1PV8A 5EYWA 1TPVA 4CQ8A 1HFBA 3IRDA 1L6SA 1LOSA 3W83A 3W72A 3WJWA 3TDFA 4K8EA 1F76A 3OVRA 3T55A 3IGSA 5DCBA 2B7QA 1AMKA 3PY2A 4LW7A 2I9EA 1N55A 2Y85A 3HJZA 3LDVA 5AOUA 4ADSA 1LBMA 3GXNA 5AC6A 3DKJA 3IIXA 3H55A 4MLJA 3LX9A 5HJLA 4NZJA 3D0CA 4CNNA 1KLYA 3S8HA 3MMTA 2J6XA 1DJNA 3TQKA 1JCYA 3QEZA 3W1TA 1C29A 4BWLC 4JTLA 1PIIA 4RV8A 2YFOA 4JD4A 4OWGA 1KLZA 4A2SA 2C3ZA 2PURA 1VRDA 3HMJG 1MEHA 1QPQA 4NNAA 1Z44A 3THQA 1QO2A 4ORIA 1I2RA 1WDWA 1KM2A 3NG3A 4N2YA 2PC4A 1TTIA 2OCZA 3ATYA 4LC6A 5E93A 2DZPA 4UUIA 4QNEA 4IX0A 5F2GA 1FCBA 4O18A 3BVJA 1UASA 2Q8ZA 1XFBA 5D2WA 1KBJA 1PE1A 1AK5A 3W7DA 5D32A 3TIMA 5EL1A 3B04A 2QAPA 5KSWA 1TPH1 2ZA2A 4MPQA 4UR7A 4IWWA 3M47A 1H60A 1JR1A 4O14A 1SSDA 2BZNA 1UBSA 4HHPA 4BWLA 1H61A 1Q3NA 5LNWA 1OG0A 3VNDA 3L5MA 1DQWA 1SO6A 3W2NA 3W2MA 1PCWA 2FJKA 2VFGA 1LCOA 4MFEA 4O52A 5HWMA 1Y0EA 1FQ0A 1H7OA 2Y7EA 1DOSA 3UWZA 2H3BA 2TYSA 3HO8A 3LCLA 4LVFA 1OX6A 4HNUA 5DLCA 3STGA 1SFLA 4FEZA 5BNKA 5C55A 1EX5A 1MEWA 2DU2A 3W2KA 5KZEA 2QEZA 3MBDA 1FWSA 1J2WA 3LLFA 2TPSA 3GR8A 3DBPA 1OVDA 5FEWA 1AW5A 5IBXA 3DU0A 3NL3A 1KFKA 2NXGA 5F4WA 3C6CA 2VEKA 1O94A 1U5JA 3TFXA 1OFRA 1PS9A 5F1UA 3ABSA 4K38A 1OFQA 2W6RA 2AAMA 3N2MA 2Y7GA 2WNNA 4AF0B 1T0OA 5G1TA 1P5BA 4O0ZA 3W7QA 2VEPA 4NJKA 5CKSA 2E6AA 4LVDA 1OK6A 4BFAA 5AC8A 1KM3A 3G1SA 1F5ZA 3EEGA 3GAKA 1XM3A 2VELA 1TTJA 1OFAA 4LRSA 6ALDA 3O07A 3VE7A 4OGZA 4ML9A 3HGJA 4MLRA 1KFLA 4MOZA 1GPWA 4A29A 1MXSA 3LM7A 3NQ6A 5CPLA 3P81A 2NUXA 3CC1A 5IM51 1KFJA 2QCDA 1O4UA 1O60A 1GVSA 3BG5A 5D38A 2F7FA 2X30A 3H53A 2WOQA 1ZY9A 3EXTA 5J5DA 3TJLA 4Y90A 3C61A 5GVJA 3S5ZA 4YCPA 2ATSA 3O15A 4N9CA 3STFA 1TJPA 2NX9A 4CNPA 4YCOA 4FNQA 1OF8A 1G4TA 3TC6A 4QIUA 1JUKA 2H3DA 3E49A 2FQIA 3LTPA 5G2HA 4ADUA 3PF3A 1EB3A 3LB0A 1FCQA 3I65A 1OJXA 1VYRA 3A9IA 1VQTA 1ZNNA 2YDAA 2Y89A 1C8VA 2Z1BA 4WXYA 1OF6A 3G1AA 4DF2A 4JICA 4IMGA 4U28A 2CLEA 3BPWA 4B5NA 5K4XA 2VOMA 5HR7A 1X1ZA 1UB3A 5LGZA 2C6QA 1JQVA 5DY2A 3L68A 3EX1A 5TQLA 3ZWSA 1TPFA 4QJ1A 3BV4A 3R89A 1XCFA 1F74A 3W87A 1KFCA 3KAOA 4L4LA 4E38A 3K30A 1R46A 3NQGA 1A53A 1KM0A 4MVAA 4I7VA 1YDNA 3IGXA 1KM4A 2RDUA 1BTMA 2GPTA 1TV7A 5I3JA 5C2XA 2AQWA 1VCVA 2CLMA 2C14A 4TMCA 5AYYA 4KFOA 5KITA 1NVMA 2BX7A 3LI1A 3WJXA 3N2XA 3U8GA 3LRKA 1W5PA 3GXTA 4O1DA 5AHIA 1L6WA 1VYPX 2W79A 3PAJA 5G2IA 5DN1A 2YW4A 5HULA 4ADTA 1F05A 4NZFA 2WNQA 1XUUA 4NJIA 2PE4A 1DORA 3W9ZA 1VR6A 2ZZ6A 3A22A 4IMCA 2X1SA 4RZ6A 3HPSA 4UFKA 1JCNA 3IV3A 4DF0A 2VEMA 2QUUA 3E9AA 3EWZA 2I1OA 1YTEA 5CSSA 2X1RA 5EBUA 2QUTA 5J5RA 3PBWA 4UFMA 1W37A 2GUUA 2B7OA 5AHFA 1SSGA 5LGXA 4EVZA 3NQFA 3ABRA 1NEYA 4Z1CA 3W1UA 1IIHA 2V2CA 4DBEA 1NF7A 4TO8A 5FESA 3EWUA 3NPVA 3HG4A 4O13A 1WBHA 2RDWA 3QH2A 3FLUA 3UXDA 3NL2A 1T96A 1TJRA 3TX9A 2YXGA 4ZQCA 1HUVA 3S1WA 2OT0A 4AWTA 4NJHA 4YMZA 3P5YA 5LHFA 2ZDRA 3SI9A 3TW7A 5D2YA 2B4GA 2ZZ1A 2Y6ZA 3TH6A 3QPYA 3M7WA 4RR4A 2PRMA 5G4EA 2NLIA 3OVQA 4GNJA 2J9XA 1VHCA 1CI1A 4PL1A 2YCEA 5FI8A 2A6NA 5KZDA 1X1OA 4IPJA 5K9DA 4RJEA 2C1HA 2BWGA 3G1XA 1JJKA 4I9AA 1PVNA 4FNUA 3NXFA 1JQXA 3QQ0A 4Q32A 4QNWA 1OYBA 4NQ1A 4JS3A 5FF7A 2NUWA 3BLEA 2ZCGA 2V2HA 1YPIA 3QF0A 5BRBA 3N14A 4M6PA 3DENA 3CTLA 1TPWA 1KW1A 2FFCA 4XKYA 2CLLA 5LSMA 1IGSA 5D04C 4OQVA 3C3NA 4E0CA 3ZFHA 3TA6A 1G69A 5F4XA 4UFLA 5HWJA 2QCLA 2TMDA 1EWEA 1K3UA 2R8WA 1TRDA 4JTEA 3O63A 3G1HA 4BI6A 1SZGA 3W22A 3AJXA 2JGYA 1TV5A 3C2VA 3MWAA 1DL3A 2ISSA 3W71A 2E6YA 3DH7A 4X9SA 2QCHA 1F7BA 3W6YA 4CNOA 4MZ1A 1WX0A 2EF9A 2FPYA 4QQ3A 4OV4A 4ONVA 2VFIA 1QOQA 4AB4A 5TBOA 1UJPA 1I4NA 3ZWTA 1DKWA 3TK7A 4PH6A 4O17A 4EWND 3SZ8A 2Z6JA 4AHPA 4RX0A 3W2LA 3C2OA 1LRTA 5FEZA 3EWXA 3LHYA 3W7CA 5D09A 1F6KA 1SO4A 3UWVA 3F1QA 5BW6A 3KRSA 1H7XA 1HG3A 3E12A 2EAWA 1YLVA 4E2DA 1GWJA 1DVJA 3LXCA 1FUYA 3P82A 5DXYA 4P2VA 1FWNA 1XUZA 3G1FA 2E6DA 2YR1A 2AGKA 4ALDA 4HIBA 4O4VA 4I7WA 3M5XA 3DI0A 4JXCA 1HO1A 1RZMA 4N9EA 3GDTA 1TQXA 4K8HA 3PWAA 4UTIA 3UY7A 3W73A 2H6RA 3FOKA 2ZRVA 2ZA3A 4FNPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4BQ4 A;  3AHY A;  2A1Y A;  4GRS A;  1K7F A;  5I09 A;  3WD2 A;  1QO5 A;  4JY9 A;  1MUW A;  1Q6R A;  4S2B A;  4M1B A;  1MZH A;  1KCK A;  1UOZ A;  3A9B A;  3K1D A;  2YSW A;  3TXZ A;  1EUA A;  1YAD A;  3PZT A;  5C2G A;  4H04 A;  5BZA A;  1OGS A;  3VGD A;  3DFH A;  3QYQ A;  2RH9 A;  4XBK A;  4C91 A;  4NYU A;  2J79 A;  2QAF A;  3NZP A;  1FWR A;  3HF3 A;  1L6F A;  1YQ2 A;  2R1M A;  2WPB A;  4HPG A;  5D30 A;  3OOQ A;  3S0C A;  2GJL A;  3NZ1 A;  5I07 A;  4UQA A;  4GIE A;  3SR7 A;  4H8V A;  3HU7 A;  4KWO A;  1FOB A;  2DV0 A;  4FOU A;  4A8I A;  3A4X A;  5C0Q A;  3UVI A;  4MWA D;  4AWS A;  3B4U A;  4L64 A;  3W7N A;  4JN8 A;  1YX1 A;  5BOE A;  2Z0I A;  1HP5 A;  1EJU C;  4JEQ A;  1MO0 A;  2IKI A;  3GH7 A;  4M6Q A;  3EDK A;  1TJ2 A;  4X0V A;  4B4H A;  1TV3 A;  4O1B A;  2POZ A;  1SZN A;  3OZO A;  4IUG A;  3FFS A;  2WK2 A;  2YYU A;  4GZJ A;  2EG8 A;  2X16 A;  3TAK A;  4O50 A;  1S5M A;  4IOT A;  4AEO A;  3AS2 A;  3FIG A;  4QR6 A;  3MB9 A;  4YTU A;  2WC4 A;  1TZZ A;  4C65 A;  3KZS A;  3MW7 A;  5I79 A;  1UZ4 A; 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