4QITA

Crystal structure of nitroalkane oxidase from pseudomonas aeruginosa in mutant complex form
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
350
structure length
350
Chain Sequence
MTDRFTRLLGIQQPIIQAPMLGVSTPALAAAVSNAGGLGSIAITGSAAEKGRALIREVRGLTDKPFNVNLFCHRPGQADPARERAWLDYLKPLFAEFGAEPPVRLKNIYLSFLEDPTLLPMLLEERPAAVSFHFGAPPRDQVRALQAVGIRVLVCATTPEEAALVEAAGADAVVAQGIEAGGSRGVFEPERGDAAIGTLALVRLLAARGSLPVVAAGGIMDGRGIRAALELGASAVQMGTAFVLCPESSANAAYREALKGPRAARTALTVTMSGRSARGLPNRMFFDAAAPGVPPLPDYPFVYDATKALQTAALARGNHDFAAQWAGQGAALARELPAAELLRTLVEELR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and reaction mechanisms of nitroalkane oxidase (NAO) from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords Nitronate monooxygenase family protein
total genus 124
structure length 350
sequence length 350
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.7.3.1: Nitroalkane oxidase.
pdb deposition date 2014-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03060 NMO Nitronate monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4qitA00
2WPBA 1ME9A 5A8GA 5C6MA 1H51A 2BZNA 3R12A 4JIPA 3MW7A 5L9FA 5D2TA 4MJZA 4FF7A 1GTEA 3C6CA 2F84A 4MOZA 4NJJA 5BMXA 2VFDA 3MUXA 4DPQA 1H7OA 3LXCA 1AW2A 4FX6M 3AO0A 4AWUA 3R5EA 3MP3A 5E0KA 4OE7A 1DJNA 2A4AA 3DFNA 5I3IA 4XBSA 4N6FA 2V8ZA 3G8EA 2PRHA 3E96A 1FXPA 4LTSA 4UTMA 4IPJA 2GQAA 5HQEA 1NFBA 4N9CA 4MUZA 3BW4A 4O54A 2WSRA 2ZBTA 3QMRA 3KRSA 3M44A 2QCDB 1KFKA 4RXFA 1I2NA 2OT1A 2R91A 1AG1O 5CPOA 2R94A 3W7QA 3E0IA 3NQMA 4FB7A 4R7JA 4WXZA 1XBXA 1VYRA 4O4WA 2NX1A 1FCBA 1HG3A 5I3GA 3IVSA 1EUAA 1L9WA 2AGKA 3DFSA 3VE7A 2FB3A 3UYCA 5U4NA 5LZLA 3DI1A 1GVQA 3W1MA 2WKJA 3CIXA 2NXGA 4ZQRA 3W2UA 4E2BA 3EXSA 1QCWA 4RK8A 3W9ZA 3S8HA 1R2SA 1DBTA 3LHUA 2Q3RA 4FXSA 5FF2A 1QPQA 1J2WA 2DP3A 2X1UA 3DXIA 2RHGA 2I1OA 3W2NA 4AMAA 3GK0A 3G1AA 3QSRA 3CWNA 3T55A 3NM3A 2TPSA 2CFFA 4UFMA 3LBCA 3G1DA 1M7PA 4PH6A 1FQ0A 1VH7A 4XKYB 3B4UA 5G2IA 2O7SA 4GUGA 3NNTA 4HKPA 2YXGA 3I7QA 1G4EA 4QSHA 3E12A 2WNNA 4Q33A 1X1OA 2QCFA 2V5BA 3V75A 1RD5A 1KM2A 4BK9A 2QJIA 4GUJA 2VEIA 1L2UA 3SGUA 3EWYA 4UTTA 4OWGA 2J88A 3ZWTA 2ZA3A 3W7RA 1F5ZA 3RLVA 4PL2A 1NAL1 1Z42A 1WAUA 4KWVA 1FDYA 4K39A 3U6WA 3HG4A 5SWUA 3W2LA 1P4CA 1K8ZA 5IBXA 4NNAA 1F74A 1W8SA 3G1VA 4JICA 1M5WA 3C2EA 1GJPA 4MVAA 2VFEA 3P7YA 1VPXA 3N9SA 1B57A 1W0MA 3I6RA 4K8EA 1RPXA 4DO5A 2WO5A 3U2OA 4JR5A 3NQ6A 3NVTA 1QPOA 4LW7A 2CZDA 2XFWA 4MY1A 1R2RA 1OX4B 1O60A 4JTJA 2Z0IA 2OCZA 4UTWA 4LVAA 5EYWA 2X1TA 4Q4KA 4CNPA 1K03A 4MZYA 1YYAA 1FBAA 4O18A 3Q94A 2HS6A 3QF0A 3V1PA 3W7IA 2IQTA 2J24A 4BWLA 2LLEA 4BI6A 3UWYA 2DORA 2TSYA 3TC7A 2YPIA 1SFLA 2P10A 2JKAA 2X30A 4QNEA 3VI2A 2FIQA 5CKSA 2QCEA 3THAA 3RF9A 1YADA 3TJLA 3MBFA 5D33A 1YXCA 4O16A 3C2OA 3IGUA 1SO5A 4MY9A 1I2RA 2FQIA 1FDZA 1EIXA 3OVQA 2HMCA 4JYDA 2NUYA 4C1KA 4QISA 2EHHA 3W74A 1B9BA 2OT0A 2HTMA 4LOCA 2B7OA 1TRIA 2AAMA 3STCA 4LT9A 3YPIA 2ZA2A 4X9SA 4UMBA 4O4VA 4TMBA 4O14A 3M5VA 4FEZA 4CCEA 3W88A 3W1PA 2HSAA 1G7VA 1LZOA 1BKSA 4H6KA 2WSYA 4LVDA 1F73A 4HHPA 3GXPA 3HJZA 1W56A 3P8JA 1KM3A 5DXYA 4ZMGA 3OA3A 1W5MA 1XBYA 2VC6A 1L6WA 2QUUA 5BMWA 3ATYA 1JCNA 3CHVA 3QM3A 3LHZA 2CLHA 5AHNA 3RNDA 1TQXA 2YFNA 2JGQA 1DQWA 3TW6A 3W75A 1LM1A 2FDSA 4NVTA 3SZ8A 1TPFA 3CLMA 1JUKA 3W22A 3W1LA 5F2GA 3EB2A 5G1TA 2B7QA 2GOUA 4QIUA 1PCKA 3LXAA 1SU5A 4LUJA 3F03K 2H8ZA 5AHIA 4LWWA 1JUEA 4IMFA 5D37A 3TXVA 4AHOA 5F1VA 3TXZA 2A6LA 3QC3A 3EX3A 1XCFA 4R53A 2DZSA 2ZFAA 1VHNA 1KLZA 5FF4A 4GJ1A 3QMTA 1KM1A 3O15A 5HINA 1QPNA 1TV5A 3NG3A 1I2PA 1U83A 1J5TA 2NZLA 3TC6A 3QZEA 2Y6ZA 2Y7EA 1EP1A 3TH6A 3TIMA 3T40A 1B4EA 2DJLA 4ZZ9A 3EXTA 4DXVA 1ZENA 2YFOA 1KBJA 3NQ7A 3NPWA 4N6EA 3RLUA 3ATZA 1QFEA 4O8RA 1D3GA 4MPQA 2TMDA 2FB2A 3INPA 3ABQA 4CLMA 4IOTA 1BWKA 2V2CA 2Z2UA 5F2LA 1OABA 4M5PA 1H5YA 3G1HA 4MFDA 1F76A 5F1UA 3LHYA 3WJWA 1IXNA 2E6YA 1LORA 2XN2A 5LNSA 3TJXA 4H3DA 1K3UA 2RH9A 1DV7A 3NPXA 3MP5A 1G6CA 4YL2A 5K2ZA 1TPWA 1XBVA 1LCOA 3EEGA 4E2DA 2C13A 3HB9A 4GXMA 1G4PA 3L66A 4C1LA 1YPFA 5FESA 3OG3A 4LS2A 5CPNA 5LHEA 4JTKA 1O5KA 1TTPA 4LVBA 1X6UA 2EF9A 2GQ8A 1GQNA 5I3KA 4OT7A 5AHMA 4Y9AA 1EPXA 4LC8A 5HWNA 1OVDA 4IJBA 4J9JA 1KM0A 4IXXA 2DU2A 4I9AA 3M6YA 1LYXA 3NYZA 3MHUA 5CPMA 2CZEA 3A22A 1X8FA 4A2SA 1KLYA 1DL3A 1BEUA 3G3DA 4RXGA 1W5NA 1PCWA 1AW1A 1K7XA 3MMTA 1KFLA 1KW1A 1H7RA 1Q3NA 2DJXA 1W3TA 3R2GA 1ICSA 3TROA 4CQAA 5F4WA 2QDHA 3S1VA 4X3ZA 4CCDA 3HGJA 5AHFA 4LNYA 2BWGA 3LCLA 3TUUA 1XFBA 4XQ6A 4BF9A 2ATMA 3HG3A 2ZTJA 3CB8A 1GWJA 2DZVA 4K8HA 4OV9A 1VCFA 5K9CA 3NEVA 1S5WA 5DCDA 5HJLA 4GUIA 1GPWA 1JQVA 2OX1A 4WX2A 3QPYA 2QCLA 2GJNA 1R2TA 3HF3A 3SIZA 4JGDA 3PS7A 3W7LA 3O6YX 4POCA 1T0OA 4DF1A 3H53A 1LROA 4JX4A 3KOFA 2NLIA 2QAFA 4EF9A 5BOOA 3PBYA 4ZQMA 2VFHA 3LV6A 4MIMA 4NUWA 3UWZA 1EB3A 4N4QA 3UY7A 1QNVA 2FPYA 4DPPA 3SJ3A 1YDOA 4ALDA 3C4UA 4A21A 4UTJA 3GXNA 1TTQA 4FNPA 1YTKA 3NL5A 5AHEA 2H6RA 3M41A 3BPWA 4UFHA 2Q8ZA 4YWIA 4ZQNA 2ABAA 3UZ5A 2FTPA 4GC4A 4O0KA 3EWZA 3M1ZA 1KFJA 1PVNA 4RV8A 5LNWA 3LXBA 4WY0F 4NJHA 1ME8A 1VHCA 2ZZ5A 1XUUA 4R33A 3B8DA 1Q6QA 3L0GA 1QOQA 1OFDA 5G2HA 1GVFA 4UTHA 1T8XA 4JTIA 3MI2A 1UB3A 3C2RA 4IMCA 5AC6A 4JTLA 3G0UA 3CC1A 4UTLA 2TYSA 1RVGA 3N19B 4NX0A 5D32A 1D3HA 2ISSA 2NX9A 1HTIA 4M7SA 1IGSA 1OFPA 3L5AA 8TIMA 3GIYA 1H61A 2J9XA 4LUIA 5EL1A 2QCCA 5D09A 4N2YA 1SW0A 5F4SA 3PM6A 3EXRA 1JVNA 2ZTKA 4JTHA 2QCGA 3DZ1A 2YW3A 4D2JA 3BVJA 2VEKA 2C18A 1TV7A 1OX4A 3OIXA 4N9BA 4GRSA 4U28A 3NL3A 1TV8A 4O10A 2JK2A 3WK2A 3MYOA 4FNQA 4CNOA 1IIGA 3G22A 1MEIA 2I14A 3C8FA 2X1SA 1TRDA 4WJEA 3TFXA 2CLOA 4ORMA 3VCRA 4UIOA 1RZMA 4ZL1A 1FXQA 1SSGA 1JCMP 5I3HA 3ABSA 4XUGA 5AFDA 3P74A 4IPIA 3O06A 3UNDA 4NJIA 3NA8A 5ABTA 3KRZA 5CG7A 3GDKA 4KFNA 3TAOA 3WFAA 2W0UA 1SFJA 2CLKA 2ZRYA 3LRLA 3W86A 3ABRA 5HR6A 3P5ZA 3LCIA 3QW4B 5BRBA 4NNBA 2YR1A 5EPDA 4JDYA 1P1XA 5CSRA 3MHGA 1Q6RA 4PEKA 5CGQA 1W3NA 3GAKA 1P0KA 3PSWA 1Z41A 4IX2A 4S2CA 3G1YA 6TIMA 1TJRA 1K8XA 4FX7A 2J6XA 3NZRA 3K30A 3GNDA 1OFBA 2QCNA 3TSMA 4UFIA 3T78A 5D03A 3W2JA 2GVLA 3ZS4A 4IX0A 4X2RA 5LGZA 1NF7A 4UC5A 3W7EA 3KVKA 1X7FA 3CEUA 3BLEA 4ML9A 1F7BA 5A5WA 3N3MA 2CLEA 3LHTA 4TU1A 4HNTA 4O12A 2X1RA 1LRTA 2WJZA 4IGHA 3DBPA 2ZRUA 1B3OA 3C56A 3LCHA 4IMGA 4RZ5A 4PL1A 5K4XA 3CWOX 1MXSA 3HGRA 3GVGA 1LBFA 2A0NA 3LCFA 3HPSA 4MYXA 2C19A 3P61A 1ZALA 4UMAA 1LP6A 1JUBA 3DFPA 4E38A 1H7NA 4H4IA 3A23A 3C2FA 1PE1A 2Y88A 3USBA 3PB0A 1VGAA 5FF7A 3I7RA 3FEMA 3W83A 2CWNA 1SZNA 5DY3A 3L5MA 1OFEA 5FF3A 2CLLA 5BW6A 2ZRVA 1WBHA 1AL8A 2ZRXA 3NM1A 1LOLA 3HIJA 3SR7A 4UR8A 3M5XA 4LV4A 3W3OA 1OYCA 1TPDA 3LCWA 3HG2A 1GG1A 3VKJA 1V5XA 3LDVA 4UUIA 1K8YA 3JRKA 4CQ9A 2YCEA 4LU0A 1S3HA 1J4EA 4FIQA 1I2OA 1ME7A 3BLIA 2RDWA 4DF0A 2C16A 4GBUA 4ADTA 5TQLA 1FCUA 4GWEA 2RDTA 3M9YA 3NO5A 2DZWA 5AYXA 4NJGA 3W1XA 4Z08A 2Y7DA 1R47A 1W3IA 4JX6A 3NQDA 4Q32A 3TNOA 4JDBA 3TKFA 3DHDA 4AH7A 5CZJA 3W07A 3WK1A 2Q8LA 3N2MA 4ZQCA 2D73A 1VCGA 4NXKA 4IQLA 4TO8A 2H8XA 3IVTA 3LBMA 3KRUA 4QJ1A 5I3FA 3P81A 3W7OA 3PG8A 5DBTA 4GUFA 3OHIA 4NQ1A 6ALDA 1QDSA 4AXKA 3O07A 5CPLA 3W7HA 2V9DA 3RU6A 4JIQA 3C3NA 3KHJA 4JY8A 3FJLA 4W9TA 4B5NA 1OK4A 4ZQOA 2DZUA 3TSDA 2Y63A 4G1KA 4Z1BA 4N9DA 1GYLA 1GZGA 2YYTA 3W2KA 2A1YA 2JKPA 1VYPX 1W5OA 1OYBA 3FA5A 3QRHA 3DHFA 5TIMA 3JS3A 2NV1A 1H1ZA 3LCGA 4OQVA 2C3ZA 3TR2A 1PHWA 3P84A 3O05A 4UFLA 3BW2A 4I7WA 1HL2A 3SI9A 2YYUA 1W5PA 3TU9A 4YCPA 1A5CA 3LOTA 2NXIA 3SGZA 4U4MA 1RQHA 3L68A 1DHPA 3NQ2A 2Y61A 1RQBA 2GVGA 4EIVA 3QQ1A 1MEWA 5G1YA 3EX6A 1GVSA 3GZ3A 3E49A 3AJXA 3GDLA 3EWUA 3VE9A 4LY8A 4YXGA 1H7PA 1JRCA 2YSWA 3OVRA 3Q58A 1A5SA 5DXXA 3LGEA 3MI3A 3GDTA 1S5VA 2E77A 1JCLA 4FIRA 2V30A 5GVJA 4X22A 3D0CA 1YTEA 2VFFA 3W2MA 3L21A 4RX0A 4O53A 4UFKA 1KFEA 2Y85A 5LKYA 1ICQA 4JNMA 1HUVA 2ZZ2A 1LLWA 3HMJG 3B0PA 2KZHA 2OZ0A 5BNKA 1WV2A 2GJLA 4MY8A 1RQEA 3PUOA 3QFEA 3B0UX 3LRKA 4WOZA 4FNUA 5F4XA 3G0XA 3WK0A 1OK6A 3GXTA 5LHFA 4I7UA 1GOXA 3DFQA 3GDMA 3W84A 1SO3A 1OJXA 3NQAA 3N14A 1AW5A 3B0VC 3IV3A 3MYPA 5AN7A 3NDOA 2P0OA 1GT8A 3L9CA 3EWXA 5HWMA 1EWDA 4MZ1A 1X1ZA 3LLFA 4WZHA 1YXDA 3G8RA 1K02A 3UWUA 3DKLA 3PBWA 4WXYA 1LTDA 3WK3A 1UCWA 3TMLA 3P62A 1KTNA 4LS1A 1G67A 1Z44A 4N9EA 1EP3A 3R8RA 5DN1A 1SPQA 4LC6A 4HN4A 4WY0A 3MJYA 1DJQA 2ZCGA 4A3UA 1A53A 2QCHA 1SZEA 3T44A 3FLUA 3R89A 2ISWA 4O17A 3KXQA 5D2WA 3PBVA 5C55A 3QSTA 5EKYA 4Y90A 4EF8A 2E1DA 4DO6A 3N9RA 1MZHA 3LRMA 1XBZA 2NWRA 1PV8A 3QJAA 1SZGA 1TPUA 4OHQA 4JN6A 4XTDA 1FWRA 3LERA 3M16A 4UFJA 1DORA 3GNNA 2Z1BA 5LSMA 2R14A 3LM7A 3M47A 4O13A 1WDWA 1FUYA 1MO0A 2AQWA 4UR7A 3S1UA 4FO4A 3W1TA 2FLIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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