4QM1 | Genus

Total Genus 94

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	94
sequence length	357
structure length	337
Chain Sequence	FQSNAMWESKFVKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPREVSVKTVLSESLQLNIPLISAGMDTVTEADMAIAMARQGGLGIIHKNMSIEQQAEQVDKVKRSGGLLVGAAVGVTADAMTRIDALVKASVDAIVLDTAHGHSQGVIDKVKEVRAKYPSLNIIAGNVATAEATKALIEAGANVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQLTAVYDCATEARKHGIPVIADGGIKYSGDMVKALAAGAHVVMLGSMFAGVAESPGETEIYQGRQFKVYRGMGSVGAMEKVPEGIEGRVPYKGPLADTVHQLVGGLRAGMGYCGAQDLEFLRENAQFIRMSGAGLLVQIT

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of the Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase with an Internal Deletion of the CBS Domain from Bacillus anthracis str. Ames complexed with inhibitor D67 rcsb
molecule keywords	Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Bacillus anthracis
total genus	94
structure length	337
sequence length	357
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2014-06-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4qm1A00

4FNRA 5H91A 3AO0A 5F1VA 5EY5A 2FB3A 3M43A 3STEA 1FDZA 3O07A 3QH2A 2RDTA 5EKYA 3GDMA 4NU7A 2ZZ3A 1YTKA 4BI6A 4N6EA 5AB3A 4OWGA 5DELA 1SZEA 2ZA1A 4LT9A 1VZWA 4KFPA 3NL2A 4JXCA 3BW2A 1EUAA 4IX2A 4UIOA 2QUTA 3IIZA 1Q6QA 3E96A 1XBXA 2C1HA 1W31A 2YYTA 1KA9F 1P1XA 3DI1A 3LLFA 4A29A 1I2PA 1TPDA 1JULA 3UWWA 1ZALA 3UNDA 3HJZA 1QWGA 2TSYA 3FYPA 3LCLA 4IXHA 1VRDA 2A7NA 3HGRA 5CPMA 4NXSA 5J5RA 3W83A 2W6RA 4MOZA 2ZZ2A 3DXIA 5LHEA 4DO6A 3DHDA 2ZRVA 3M16A 1DVJA 2O7SA 4BWLC 4BK9A 2EKCA 1KFLA 1D3GA 3EX1A 1W56A 5EL1A 3FKKA 3HO8A 1OFAA 1JRCA 3LCIA 2B7OA 3QYQA 1GQNA 3KRZA 1ZFJA 3VKJA 2VOMA 2C13A 3SY5A 1THFD 4JEQA 4UMAA 1TTPA 3NQCA 4O15A 5I3HA 2G96A 1LOLA 1LRQA 3BLEA 4OV4A 1VPXA 3QRHA 3DKJA 1ICQA 3NQ6A 5A8GA 1VLWA 1UCWA 1QMLA 4MYAA 4RV8A 3A5FA 4UFMA 3S5OA 3SI9A 3PY2A 2B4GA 3GR8A 2C19A 4ZQOA 4UR8A 3SGZA 4LW7A 2H8ZA 1MEIA 3P8JA 3TNOA 3ABRA 1G4EA 4Z1AA 4NJGA 3QQ1A 2PRLA 4QSHA 3UWVA 3EB2A 1QNVA 2X16A 5HUPA 4UTUA 4N4PA 1V7YA 5H2ZA 4RZ4A 1O4UA 4JGDA 1EWDA 1K3UA 3TXZA 3W2KA 1C8VA 4MJMA 5GVJA 2QCGA 1QDSA 1F6KA 1GOXA 3OEXA 3TUUA 2Y88A 2CLLA 1FUYA 3MP3A 3LOTA 3C2VA 3TAOA 3GXTA 1I4NA 4C1KA 2QF7A 3VFLA 4W9TA 1XDMA 1KTBA 4K38A 3F03K 3O6YX 1OFBA 2H6RA 4MZ1A 4UTKA 3BO9A 1SR9A 3MI6A 1OYCA 3CLMA 1FCBA 4UTMA 3RNDA 3HG3A 3NPXA 3LB0A 1OFDA 1KBIA 5IBXA 4Y96A 1VCGA 2I14A 4FNQA 4DEFA 2GQAA 3TJXA 1OX6A 3SIZA 5F2GA 5L6UA 1CX9A 3LCWA 1GZGA 5TIMA 4JY8A 5AYXA 3W1MA 1W3IA 4DPPA 3MHGA 3N3MA 3W75A 1WYIA 4EWND 5C55A 1SW7A 2VXNA 2VFDA 1PCWA 2YGYA 5FEZA 4GUJA 4M19A 5F4WA 1UUMA 1K8XA 4O4WA 1W5QA 3W1NA 4UFJA 3KX6A 5K2ZA 1EA0A 1Q6LA 1FBAA 1U83A 5AHFA 5K9CA 1TO3A 1TJPA 1OX5A 1OX4A 3S6DA 4AEOA 3SFKA 2TYSA 4JTHA 2X1TA 4O13A 4AMAA 2FIQA 1BWKA 4LNYA 2B7NA 3BK0A 1Q6OA 2ABBA 3OA3A 3STCA 4HSNA 3HGJA 3O05A 4EVZA 3C3NA 3M1ZA 4K36A 1EEPA 3LHVA 3NO5A 4I7WA 3PG8A 3G0XA 2VEIA 3HBLA 4PC8A 3WK1A 3Q94A 4KKXA 1KFKA 1CI1A 4IQLA 3DFOA 5D38A 5CPNA 2CLOA 3CWOX 1KM6A 4NNBA 1TPVA 4MY1A 1FWTA 1TMHA 3EEGA 3OIXA 4LC6A 1W37A 4O16A 1H7PA 4PEKA 4FHAA 4K7VA 3RU6A 4H3DA 1J2WA 1ME8A 3DBPA 4Q33A 3FKRA 3L66A 4JNMA 5DLCA 1YPIA 4Z1CA 3K30A 4M6VA 1OF8A 2A2IA 1G4PA 2GPTA 5U7SA 4ICNA 4AWTA 3RF9A 5HWNA 5FF0A 2H3BA 2ZRXA 1IF2A 1IXQA 3HQ1A 5DCDA 1F05A 1FDJA 3S1UA 1FWSA 3S5NA 1W3NA 4BI5A 1Y0EA 3TFCA 4ALDA 1NF7A 1ZJIA 4K6AA 4R34A 3M0ZA 5KITA 4DF0A 1KFEA 4JYEA 1VLIA 5D2XA 4GUHA 2QCHA 4N9BA 3W2UA 3SGUA 2GJNA 2C14A 2A7PA 1HO4A 5CZTA 1VS1A 2YFNA 3TKFA 1MXSA 4JIQA 3W73A 3RLVA 4LU0A 5EPDA 3FYOA 4YLWA 2A6NA 1ME7A 1XXXA 1VGAA 3G22A 5G2WA 3LV6A 3ABOA 4HPJA 3MP4A 3VE7A 1AL7A 2BLEA 3TC7A 5BMWA 1T8XA 2R94A 3I7RA 2HS8A 3LXBA 3NGJA 2A6LA 3W1RA 4O53A 4UMCA 1R47A 3GIYA 5FEWA 3PF3A 4L4MA 5CPLA 4XQ6A 3G0SA 3TX9A 3P7YA 1P0NA 3M5ZA 3TR2A 4K37A 3BW3A 1JQXA 1JUEA 1G6CA 3QMSA 3G1HA 3NEVA 1O5KA 1F74A 1J4EA 2G97A 1P4CA 4G1KA 2J9ZA 3D0CA 1TJRA 1H63A 2ZA2A 4UFKA 5I3KA 2YSWA 3NL6A 1KM0A 4KFNA 3BPWA 3N73A 2OX1A 4QJ1A 3S1WA 3W74A 1NFBA 1K7XA 2WPBA 1H7RA 5AC7A 1L6WA 3L68A 4NNCA 2ZZ6A 3MHFA 4XBSA 1OVDA 4CNPA 4O19A 3ELFA 3CU2A 5AFDA 4AHOA 3FEMA 4IGHA 1LZOA 1KTNA 1KW1A 1ZY9A 3W7KA 3E49A 1FCVA 4RK8A 1OX4B 4WQ6A 5EA9A 4R53A 4AWUA 1E51A 2AAMA 3UXDA 3LTPA 2V5LA 3I68A 4DBDA 1Z44A 3GAKA 4UTJA 4LUJA 1KFCA 1KFJA 4DPQA 1XDLA 3DU0A 2V81A 1DKWA 1S5WA 1W5OA 1NVMA 3A24A 4JD4A 4N6FA 3PBUA 2BX7A 3EWBX 4MY8A 1FXPA 3W1QA 4CCEA 4OBTA 5FEXA 1HUVA 3NNTA 1GVFA 2VENA 3TMLA 1VCFA 3NG3A 5CSRA 3P80A 2DZWA 1H51A 1YTDA 4UMBA 4JICA 4JX5A 3KAOA 3W1UA 3G1VA 4OV9A 1T99A 2PE4A 2J9YA 1OFEA 2C16A 1XC4A 3LI1A 1F6PA 1SZFA 1RVGA 4IPJA 1EB3A 3G24A 3R2GA 4WXYA 2FJKA 4KWWA 1M7OA 4IUOA 4TMBA 1O94A 1JVNA 3W76A 4CCDA 1XL9A 3F4WA 1GG1A 3LTSA 5HWJA 4LRSA 3LM7A 2IQTA 1K7FA 3VNDA 2QCLA 3HPZA 1YXYA 2YDAA 3W85A 5G1TA 2ISVA 2GQ9A 2Y63A 1TPH1 3E0IA 5HUOA 1V5XA 1M6JA 1Q3NA 3GAYA 3M5VA 3IVUA 3Q37A 2PRMA 2B7QA 3S9YA 2BZNA 1TPC1 1TPFA 3TC6A 4BWLA 1YXDA 2TMDA 5D09A 2HTMA 4IX0A 1AW1A 3EXRA 4NZJA 3TQKA 3LRMA 2H8XA 1H61A 3MYPA 4X9SA 4N9DA 1F5ZA 1TTQA 1QO2A 2VKZG 5L9FA 4NJKA 1SO5A 1WDWA 4UUIA 3G1FA 5CG7A 3UY7A 4ML9A 3QMTA 5K9DA 2HMCA 4ADSA 3DHFA 3B8DA 4N9EA 4WD0A 1O5XA 3JRKA 3THQA 2Y7GA 4UTIA 1H60A 3ZS4A 4JX6A 4YL2A 3G1YA 3I7SA 3ZWTA 4JTKA 4KWVA 3W70A 2QCDA 2ZQ0A 3PS7A 3GNNA 4RXGA 2I9EA 3DFQA 4LTSA 5FF7A 2V0TA 5FF3A 3S1VA 4PH6A 3B06A 2V30A 3C2EA 3ABQA 3LTYA 1EP3A 4TMCA 3W7LA 3GKAA 5CSSA 1XBVA 3EXTA 4FO4A 2EAWA 3NDOA 3WJSA 4LV4A 1FY6A 1X8FA 1GTHA 4YCOA 3IIPA 4TR9A 3W7QA 3TMQA 4QISA 3H55A 3MP5A 3RK8A 1KTCA 3QEZA 5F2MA 4FNTA 4FXRA 1QCWA 1KM4A 4JTFA 3W1PA 5BRBA 3C0JA 4UTWC 3N19B 3GDKA 2VFIA 1U5JA 4K7YA 1DQXA 3PB2A 4WOZA 4TIMA 5KMYA 4WY0F 4HNUA 1T0OA 2GVLA 2QCCA 2NV1A 4S2CA 5AYYA 3MI2A 1KLZA 1O95A 3KOFA 5C6MA 5KSWA 3IIXA 1Z41A 1XFBA 2QUVA 1X7FA 3LCXA 3A23A 4FX8A 2D73A 2B7PA 3IGSA 5LNVA 3NPUA 1SSGA 4XUGA 1GYNA 1I2NA 2CZDA 1GTEA 2ABAA 3MO7A 5HJLA 2CZFA 2WV8A 4Z1DA 4RZ6A 4E2BA 3VCRA 3NL5A 1Q6RA 4CQAA 1IXNA 1WOBA 4JX4A 3CTLA 3NM1A 3CWNA 2VFEA 5DN1A 5AHLA 3W7NA 3KVMA 3ATZA 4PODA 4U28A 5D30A 3LX9A 4RX0A 5F1UA 1XUUA 3W7MA 4GE8A 1DORA 1RQEA 3A22A 3G8EA 4O17A 3THAA 5LGZA 3W7RA 3P8IA 2JBMA 3TJLA 5BOOA 1RV8A 1XBYA 2YCEA 2CZ5A 2BWGA 4WOQA 3M9YA 2ZZ4A 2WNZA 1NF0A 3N2MA 4P2VA 4RJEA 3DI0A 3MW7A 1JQVA 1WX0A 2NX9A 2ZBTA 1GVRA 4GNJA 1PL9A 4GFSA 4M6PA 4O12A 2PRHA 3EWWA 4X22A 3PM6A 2H3DA 4IMFA 3UPWA 3MBFA 1A53A 1WV2A 1ZNNA 4AAJA 2ZRYA 5FF2A 4C1LA 4Q32A 5D03A 4CQ9A 3W22A 4IXXA 3WJZA 3PBVA 3P74A 3W1XA 2A85A 3QQ0A 3TXVA 3PWAA 3M6YA 3W87A 1TPB1 1YDVA 1LTDA 1S5TA 1H7OA 2VEPA 3MBDA 4JN6A 3RLUA 3LHWA 4QNWA 2GJLA 2XN2A 3P5YA 3N9SA 3W2MA 3BG5A 1QOPA 1LROA 4MZ8A 5HINA 3EX2A 3YPIA 1KV5A 4O1DA 3BV4A 3UYCA 5LKYA 4O4VA 2JGQA 5HR7A 3EWZA 4WY0A 1YPFA 5AC6A 4CLMA 5BW6A 1VYRA 2DZVA 4O14A 2R14A 3DGRA 3LLDA 5LNUA 1KV8A 4NUWA 2Y61A 3TFXA 4XKYA 3MMTA 1W54A 1QR7A 1MSSA 4Y8FA 6TIMA 4ZQRA 1H7NA 3MJYA 3EX6A 2QAPA 3NR0A 4TO8A 2V9DA 3W3OA 4A22A 2G5WA 1T96A 3IGXA 3HPXA 3H54A 4GUFA 4K8EA 2YX0A 1KLYA 1N8FA 3LGEA 5K9XA 1L6YA 5AN7A 1A50A 5FESA 3QW4B 2QCDB 2NX1A 5AYZA 3CT7A 2BTMA 1F7BA 4JS3A 5DBTA 2ZTJA 3B0UX 3QC3A 1OFRA 4N4QA 5G5IA 2J6XA 3B04A 3GXPA 1WOAA 1ZAIA 4JTIA 2WSQA 4HSOA 1EPXA 2YPIA 1LRNA 1SZNA 1JCMP 5KZEA 4X3ZA 4ZMGA 5CPOA 4Y90A 2WOQA 5T26A 4PA8A 4LS1A 5LZLA 4UTTC 6ALDA 5DY2A 3W7OA 1GPWA 4LC8A 1A5CA 4RR4A 3M44A 4HNVA 2YZRA 4YCPA 4XWUA 5HULA 4XBKA 3BG9A 3PBYA 2OT0A 2VELA 2X30A 1IIHA 3TH6A 1PHQA 3W1LA 3C61A 1KM2A 3UWUA 4FIRA 5D04C 1KM5A 4LV9A 1GJPA 1YTEA 4MPQA 4GUIA 3CPRA 2QUUA 4UFIA 4ZQPA 1H1ZA 3G3DA 4UCGA 1L6SA 2AQWA 3M47A 1MZHA 4FXSA 3B4UA 1CW2A 3GNDA 2WQPA 1LOSA 3N9RA 3W7GA 3QPYA 1GYLA 4ZQNA 2V5BA 2Y7FA 1QPNA 1SO6A 3QJAA 3T55A 1G7VA 1GVSA 2Y7DA 3GK0A 2NX3A 5D33A 4LVFA 1W8SA 1DJQA 3C52A 5LSMA 3C6CA 4N9CA 3R12A 3OHIA 1TPWA 4ZQCA 3L5MA 3NQDA 1LLWA 4O1CA 3OVQA 1ME9A 5LNRA 1MEHA 4JYDA 3CIXA 1LOQA 2DJXA 5F4XA 1OFPA 1WQ5A 1TYGA 1PIIA 4O28A 1X1OA 3EWYA 3G3MA 4NX0A 3NQVA 3I7QA 1OG0A 3L65A 5G2IA 2R91A 1XUZA 3HG5A 4CNNA 3EWUA 1H5YA 1SFJA 5E93A 3GKFA 3CEUA 1VYSX 3PSVA 3KVLA 4ZQMA 2A7RA 3IVSA 3U6WA 1YXCA 5DCBA 4WJEA 2C18A 2YFOA 1KBJA 3HPSA 3BLFA 4OT7A 2DJLA 2CFFA 4WY0B 1OYBA 3P84A 3UXAA 1JR1A 2FFCA 5ABTA 4BFAA 1AG1O 3NQGA 4N02A 4AH7A 4XKYB 3UPBA 3PUDA 3GLCA 2JKAA 1R2SA 1TPUA 2RKXA 1GEQA 2YR1A 3SSJA 1SW3A 3N14A 3SECA 3FLUA 1ALDA 8TIMA 5BMXA 1ICSA 2ATSA 2Y62A 1X1ZA 4CQ8A 5J5DA 2CWNA 5K4XA 1VCVA 4OGZA 4MLRA 4GC4A 3L21A 1R30A 1F76A 1WAUA 1QPQA 3L9CA 3NPVA 3IEBA 5I3JA 3FOKA 1S5VA 4GJ1A 2CLKA 4M7SA 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3MUXA 3DFPA 4J9JA 4UC5A 3B03A 3G18A 5E1QA 4HNNA 2TRSA 3NAVA 1ZAJA 3LHTA 1H7WA 3NPWA 3M41A 4HIBA 4QAIA 5U4NA 2DP3A 2RDUA 5DY3A 1I8JA 2UV8G 2XFWA 1LLZA 5LNSA 1GT8A 3MHUA 1P5BA 4Y9AA 4FB7A 5AOUA 2CW6A 3UWZA 1G4SA 1B4KA 3W1TA 4NQ1A 4AVFA 1K02A 1R46A 5HNRA 3LXCA 3W1AA 3CB8A 2QCNA 1X6UA 2PURA 4BR1A 1JUKA 4NVTA 3C56A 4JTJA 2ZZ5A 3BLIA 2EPHA 1IXPA 3W6YA 2A5HA 1A5BA 2Z1BA 4IOTA 5KZDA 1OFQA 5EYWA 1F2JA 3N2XA 1LBLA 2QJIA 1B4EA 2G95A 3PBWA 1H7XA 4DELA 1OF6A 3E12A 4RLIA 4O10A 1OHLA 2W79A 1YYAA 1VQTA 1D3HA 4AXKA 4DXVA 2WO5A 2QKFA 3S42A 3G0UA 2OMAA 2I1OA 4H6KA 1W1ZA 1VR6A 1ZCOA 3NQAA 4ZZ9A 4ADTA 3IRDA 2NUWA 1PS9A 1RPXA 4AWSA 3DFTA 3VE9A 4GBUA 3KVJA 4L4LA 2ZTKA 5D02A 3W88A 2A4AA 3G8RA 3FA5A 1PCKA 3R5EA 3OBKA 1B9BA 4AF0A 3STFA 4K8HA 3CQ0A 3FFSA 1LORA 4E38A 1EIXA 3LI0A 1K7EA 5BNKA 1TV8A 5AHEA 4ZVJA 1G67A 1WBJA 2VFGA 1A5AA 3DKLA 4JTTA 5DXYA 3QMRA 4OQVA 2E6YA 1ZENA 3HOJA 1QO5A 4LS2A 4PTNA 3ANYA 3GZ3A 3LCHA 4Z1BA 5K7JA 3W07A 2RFGA 2QEZA 2PCQA 3TDFA 2H90A 5FEPA 2DORA 1TQJA 5CZ0A 2NV2A 2V2DA 3KRSA 1WA3A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4QM1A

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