4QM1 | Genus

Total Genus 94

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	94
sequence length	357
structure length	337
Chain Sequence	FQSNAMWESKFVKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPREVSVKTVLSESLQLNIPLISAGMDTVTEADMAIAMARQGGLGIIHKNMSIEQQAEQVDKVKRSGGLLVGAAVGVTADAMTRIDALVKASVDAIVLDTAHGHSQGVIDKVKEVRAKYPSLNIIAGNVATAEATKALIEAGANVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQLTAVYDCATEARKHGIPVIADGGIKYSGDMVKALAAGAHVVMLGSMFAGVAESPGETEIYQGRQFKVYRGMGSVGAMEKVPEGIEGRVPYKGPLADTVHQLVGGLRAGMGYCGAQDLEFLRENAQFIRMSGAGLLVQIT

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of the Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase with an Internal Deletion of the CBS Domain from Bacillus anthracis str. Ames complexed with inhibitor D67 rcsb
molecule keywords	Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Bacillus anthracis
total genus	94
structure length	337
sequence length	357
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2014-06-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4qm1A00

1VJIA 1SW7A 1YDNA 1VHNA 3PBYA 3DBPA 5D33A 3S0CA 5BNKA 2HMCA 4WOQA 3HQ1A 4FNQA 3NO5A 2ATMA 1WBJA 2A6NA 5EA9A 1MSSA 5J5DA 3V1PA 3LTYA 5K2ZA 5F1VA 3TA6A 3R8RA 5LNRA 1VGAA 2JGYA 3W1MA 4ICNA 3W7GA 3DI0A 3MUXA 3W1QA 7TIMA 1GVSA 3E12A 4H6KA 3P60A 4AB4A 1SW3A 4CQ8A 4JN6A 2QJGA 1RV8A 1P0NA 2TSYA 2WQPA 4IJBA 4JTHA 1R2TA 5LNUA 2DZVA 1C8VA 1NSJA 3CQ0A 3GDLA 4K36A 1A53A 5I3KA 3W1NA 3HMJG 2J24A 4IX0A 3GDKA 1K8YA 3DU0A 3WJSA 3GZ3A 1OABA 1G6CA 1GEQA 2F7FA 2Z2UA 1PCKA 1F2JA 1WOAA 1EX5A 4O54A 5G2WA 1OK4A 4Y96A 1DVJA 4AMAA 3MI3A 2Y62A 1SU5A 4WZHA 1Q3NA 3IVUA 4UR7A 3GVGA 4LU0A 5D03A 1J5TA 3CPRA 1WX0A 4FX8A 5C54A 5AYXA 2PCQA 1UJPA 4FF7A 5FEPA 1W3NA 2RHGA 3IGUA 1JQXA 2W6RA 3O6YX 1VRDA 3EWWA 2E1DA 3QJAA 3EX1A 5KZDA 1OHLA 1RQBA 1KM1A 2DU2A 3CT7A 5L9FA 3HG4A 3EWXA 5K9DA 1H1ZA 2R14A 3ABRA 1EB3A 3ATYA 5BMWA 3STFA 3W88A 3GKFA 5AN7A 2W0UA 5AOUA 1TYGA 1OFBA 1XUUA 2F84A 2P10A 1P0KA 3NPVA 2Z0IA 4UFHA 2Y61A 1JR1A 1QPQA 4PL2A 1WQ5A 3DFPA 4FIRA 1LROA 5LHFA 3WK1A 3BV4A 3TQKA 2GJLA 1AL7A 2XN0A 3W2MA 5TIMA 4MUZA 2CLEA 1CI1A 5F4WA 1MO0A 4K6AA 5G1YA 3RFAA 4O13A 1SPQA 1QMLA 1WOBA 2RDWA 2G97A 4FEZA 1TRDA 1OX5A 4FNPA 2YFNA 2ZFAA 1L2UA 1UUOA 4TR9A 5AC8A 2FTPA 4CQ9A 3TH6A 1QOQA 1KTNA 2V8ZA 2H3BA 3SI9A 5HJLA 2ZZ6A 4PH6A 1VYRA 2J27A 3PVFA 1I2PA 4AEOA 3LXBA 1FBAA 1IXQA 1QO2A 4ZQOA 4M19A 3G8RA 1W0MA 3O8AA 3OG3A 2ZZ3A 2DP3A 3I7QA 1P4CA 1TPFA 3L0KA 1I2QA 2CZEA 4OV4A 3MHUA 1ZALA 1RR2A 2JK2A 3QSTA 1OJXA 1EWDA 1VZWA 3F03K 3LGEA 5CZJA 4NU7A 3HOJA 3M7WA 2PRHA 3EXTA 4K8EA 3CEUA 4LRSA 5CZSA 1X7FA 3KVKA 1VHCA 4O1DA 2I9EA 1T0OA 1RQEA 4DXVA 3R89A 1JCMP 3VFLA 2X16A 1AK5A 2WV8A 4KFOA 3HG3A 4UTIA 4JYFA 4RR4A 3USBA 2Q3OA 3EWZA 1FCVA 5F4SA 5AYYA 2A7NA 2QKFA 5FF3A 4JXCA 2BXVA 1LRTA 4TO8A 4IGHA 1TIMA 4JTLA 4EVZA 1I4NA 4QM1A 2RDTA 1GT8A 4HPJA 4GRSA 1ICQA 4NJGA 1WBHA 1K8XA 3CWNA 1FUYA 1H50A 4BWLC 4O16A 4OQVA 4MVAA 2ZZ1A 4HNNA 2BWGA 3N2XA 6ALDA 2TPSA 1YYAA 2ALDA 1M5WA 2NXHA 3E0IA 2VEKA 3BGJA 4E2BA 3PB2A 3GR7A 3MI2A 2YR1A 4I7UA 5J5RA 1HTIA 1OF8A 1LBFA 4MJMA 3B05A 3P80A 4N4PA 3TCEA 2QCEA 3GXNA 3HIJA 3W1LA 3LHYA 4FXRA 3P7YA 1SSDA 4UNKA 5FESA 2A21A 4A22A 3I6RA 3W9ZA 3UNDA 1Q6RA 3W74A 4A2SA 3KRSA 4LV4A 1GVRA 1JRCA 1Q6OA 3W71A 5AHIA 2C19A 1LOSA 3NDOA 1HL2A 1TPC1 5D2XA 1TPH1 4X9SA 1S5TA 3WK2A 1E51A 1LTDA 4GBUA 3EWYA 4KWWA 1CW2A 2AQWA 4Z1CA 2Q3RA 5D2TA 2QUUA 3DKLA 4UTKA 3PY2A 3CTLA 4RXFA 1B57A 4LC6A 2ISWA 2X1UA 3S1XA 4UTTA 1P5BA 3L5AA 3UWVA 4ZQNA 3JR2A 2O7QA 4QITA 3WK0A 1Z42A 1P1XA 4FNTA 3CC1A 4FNUA 1F7BA 4A21A 5T26A 5FF0A 2QCLA 5LSMA 2OZ0A 3W87A 3G1DA 1UUMA 1XDMA 3L68A 2EF9A 3C2RA 4JNMA 2B7QA 1FWTA 1VQTA 1YTDA 4OE7A 3DFQA 3PB0A 3RLVA 4N9BA 2JKPA 3RF9A 5AC7A 1YTEA 4N4QA 1HG3A 3FIGA 3P84A 4O12A 1D3HA 1YXYA 2QCMA 1KW1A 3L0GA 4MKNA 1LCOA 4UTJA 4ZQCA 3QQ0A 3W7OA 1OYBA 3UXDA 2C3ZA 3EX6A 3N3MA 1S5VA 3W7PA 4LNYA 3PG8A 3P61A 1A5CA 3TQVA 2Z6IA 3W2KA 1TTJA 3TR2A 3SFKA 4NNBA 2QCDB 4AF0A 1FDZA 4MPQA 1FCBA 4UTUA 3M6YA 3P81A 3G1XA 3HO8A 2OJPA 3LXAA 1KM6A 2H8XA 2ZA1A 1H61A 4HN4A 4DO4A 1UCWA 2BX7A 2VFDA 4ALDA 3M41A 4O11A 4M7SA 2E5DA 1EIXA 3GDMA 2B7PA 1KV5A 3PBWA 3G24A 3LB0A 4MIMA 2CLLA 2YX0A 2P1FA 1DKWA 1H7PA 5MHBA 3NQ7A 1I2OA 5KMYA 1PL9A 5G1TA 4PEKA 3S1VA 1C9DA 1QPOA 3DFTA 4AWUA 4JTFA 4N9EA 4N2YA 3DHDA 3NL5A 3OEXA 3S1WA 1THFD 4PCFA 5BOOA 3HGRA 4XTIA 1H7RA 3M5YA 4AAJA 4I7WA 4K7VA 4LW7A 4LVGA 4NXSA 3P67A 3TV8A 3EB2A 3TXVA 2TYSA 2ZRWA 1EUAA 1NVMA 3M43A 4XUGA 1G4SA 1G7UA 5DN1A 3KAOA 5HWMA 3UD6A 3E49A 1DJQA 2B4GA 2J6XA 1FXPA 3BG3A 3H54A 4HHPA 5D05A 1EP1A 1YDOA 3CB8A 3NEVA 3WJXA 2BZNA 3NNTA 3QQ1A 3GB6A 3GNDA 3VE9A 4PL1A 1XBVA 5CPMA 4N6EA 5D32A 4WY0B 4O1CA 2DZWA 3CWOX 4W9TA 1SR9A 2Y63A 1TRIA 3I7RA 3FYOA 1MEHA 4RV8A 4LTSA 3TW7A 1DV7A 4R34A 1Z41A 1TREA 4XZ9A 2HTMA 4OU1A 4FB7A 4JD4A 2A85A 2E6DA 3N14A 4MY9A 4P61A 1B9BA 3G1VA 3W07A 1RD5A 1NF7A 2YW3A 4NX5A 4QNWA 1GQNA 1XL9A 2G5WA 3FOKA 3SECA 4CNOA 3LV5A 2ZZ4A 4B5NA 4LRTA 4JX5A 4MYAA 3CHVA 5IBXC 1ML1A 4GXMA 1KTCA 4IUOA 4HSNA 1YXDA 4M7TA 4QISA 3W7MA 2VFHA 3A24A 1DBTA 5ABTA 1O4UA 3G0SA 2A2IA 1W5PA 1JCYA 1OFQA 1KFEA 4ORMA 4WD0A 2CFFA 3KRZA 3VKJA 3UYCA 4IX2A 1MXSA 3JRKA 3LBMA 3LLFA 1PV8A 4BWLA 4A29A 4UTWC 3LTSA 2GOUA 3TK7A 2V2CA 3DXIA 3JS3A 4FXSA 4U4MA 4UFJA 4YCPA 1C29A 2NX9A 1G4PA 1TTIA 1VYPX 3LTPA 3SR7A 3TFXA 3QMTA 3TC7A 4JX4A 3EWUA 5L6UA 1SSGA 1QOPA 4MZ1A 1OF6A 3W1AA 1TV5A 3PM6A 4NNCA 4JEQA 3W76A 3MYPA 4MY1A 4UFKA 3YPIA 1KFBA 4GWEA 3LM7A 2HS8A 1A50A 3PWAA 3QSRA 4R7JA 1SZNA 3TAOA 3C4UA 5KZMA 1X1OA 3O06A 4IMDA 3NOEA 5IM51 1W3IA 1XBXA 3TROA 2J9XA 4MLRA 4AH7A 5EBUA 3W3OA 2X2GA 4YCOA 2OT0A 5KZEA 1JUBA 1N8FA 1G7VA 2PE4A 3G0UA 3T78A 4O1AA 3P5ZA 1RPXA 4O4VA 5LGZA 2X1SA 3W72A 1GG0A 3W7DA 4EOUA 1IGSA 1PS9A 3NPUA 2Y7FA 4FX6M 3SY5A 3ZS4A 1OFEA 3HGSA 4NUWA 3C61A 5DCBA 4AHQA 2H3DA 4RJEA 3WJZA 2D73A 2EHHA 1SFJA 2FFCA 1PVNA 1FWWA 1XFBA 2NXGA 3UWUA 5F2MA 1PHQA 3DFSA 2QUVA 4OT7A 1SW0A 4DBDA 2WNQA 1G69A 2RH9A 1TPUA 4ZMGA 4NNAA 1JCLA 3PAJA 3NGJA 2GJNA 5AHEA 3ZFHA 3MYOA 3WFAA 4K37A 3L2IA 3PS7A 5DY3A 1OG0A 4JIQA 3QFEA 1X6UA 2NWSA 4RLIA 4Y8FA 1ADOA 2OMAA 1F6PA 2J88A 1RQHA 4WXYA 4I7VA 1SO4A 3UWYA 3AJXA 3OVQA 4TIMA 2QUTA 2FPTA 4Z08A 1PCWA 3NR0A 3MI6A 1W54A 1G4EA 2ZBTA 3R12A 2VEIA 1LRNA 2CLFA 5E93A 3A23A 1G4TA 4BR1A 4Y6GA 1H51A 2WKJA 5AHLA 4CCDA 1W5MA 3DFOA 4JGDA 3LX9A 1SO3A 5AHFA 2QR6A 1L6YA 4LC8A 3PSWA 3NXFA 2JGQA 5G4EA 3EX4A 4GJ1A 3EX2A 1K03A 3GKAA 5K9CA 2I14A 1W37A 2Q8LA 3W86A 4O14A 1U5JA 1W31A 3UPWA 2VC6A 5LHEA 2AGKA 3ZWTA 1MEWA 3LI0A 5LNVA 3FJLA 5BW6A 2A7RA 5AYZA 1DHPA 3NQAA 2QCFA 4JR5A 2DJXA 3NQMA 3TJLA 2DZXA 4WJEA 2H8ZA 3EX3A 4JY8A 3AO0A 4IWWA 3C8FA 3T4CA 3T40A 2VEMA 1OX4B 2OCZA 4IXHA 4PTNA 4C1KA 2B7NA 3QEZA 2GUUA 2PRLA 3NL3A 4M6VA 2WO5A 4XTDA 1QFEA 4DPPA 1Z48A 3UQNA 2GVGA 3TNOA 2B7OA 2QCDA 3QZEA 4BK9A 3B0PA 3M5XA 1K7XA 4OWGA 1TTQA 1Q6QA 5U7SA 4CCCA 5K3VA 4NQ1A 3PUOA 3ABSA 1K02A 4P2VA 3G1FA 1TPWA 3L9CA 4PODA 2ISSA 2RKXA 2ZTKA 3ZWSA 1TCDA 1QPRA 3SJ3A 3U2OA 3P74A 4UNLA 4PA8A 3I65A 4LUIA 2QAPA 4L4MA 1ZY9A 5AB3A 3LRKA 3GAKA 4QAIA 2A6LA 3KX6A 1FXQA 5H91A 4PFMA 3W1XA 4TX9A 1SQ7A 3C56A 2WJZA 5DY2A 3A21A 1SZGA 4WX2A 4GUHA 1L9WA 3O15A 1FCQA 2NUWA 4M5PA 3IVSA 3LHTA 3LRLA 1TQJA 4MZYA 4PC8A 3BLEA 3VI2A 3IVTA 1X1ZA 3OA3A 3TU9A 1KTBA 1R30A 4LS0A 5IBXA 3FS2A 3OHIA 3IIXA 3C3NA 1XKYA 1YPFA 3EEGA 3HJZA 2V9DA 2CLMA 2C18A 3BK0A 3FJ6A 3MP5A 4ZQMA 2TMDA 3R5EA 2V30A 3O16A 2ZTJA 5K9XA 3T7VA 2V5LA 3N9RA 2FPYA 4GUFA 2ABAA 4Q33A 4WY0A 1H5YA 5D37A 3D0CA 1H7NA 3W6YA 1OYCA 4UTWA 3FYPA 2X1TA 4EIVA 3I68A 4DO5A 1EP2A 1G67A 3NM1A 2NUXA 4S2BA 1FY6A 3ABOA 4QSHA 4KFPA 4GE8A 1LOQA 2E5BA 3LV6A 4RZ6A 3CU2A 1TPDA 5EL1A 4NJJA 1WYIA 1ZAHA 3ANYA 3RU6A 3H55A 5HUPA 3U6WA 1EP3A 3Q94A 4A2RA 5F4XA 2VXNA 5HWNA 3HG2A 3MMTA 3IV3A 4TMBA 1HO1A 3L65A 1S5WA 2H6RA 3SGUA 2EPHA 2FDSA 5HINA 2A5HA 4OGZA 3SIZA 1FDJA 4CNNA 4DF1A 3EXSA 3M5VA 2CLOA 4GUIA 1F76A 5DXYA 3E9AA 3P8JA 1X8FA 5CKSA 3W1RA 3TX9A 1AL8A 4UXDA 1ALDA 1KM2A 3BW4A 4O0KA 3W7HA 3NQGA 4GUGA 1PE1A 5KINA 5C2XA 4DPQA 3IIVA 4LUJA 3W2LA 4JTSA 3BVJA 3KVJA 4Z0SA 3NQ6A 3W75A 2ABBA 3A5VA 1JJKA 4LS2A 1FCUA 4LOCA 4MFEA 2FQIA 3MWAA 1N7KA 1F05A 2OX1A 2Y7EA 1GJPA 5CPLA 5CGQA 2CLKA 3FKRA 2V5BA 1O5XA 3CEPA 1WV2A 3G3MA 3S5YA 3NQEA 4JY9A 3B8DA 4IXXA 3GLCA 3R13A 1XBZA 4LS1A 1GVQA 3NG3A 4O53A 5FI8A 1KFKA 4XWUA 3MP4A 1JCJA 3W7RA 2NUYA 1KFCA 1ZHAA 2IQTA 4RZ5A 1H63A 4UFIA 2ZRUA 3STGA 2VKZG 3HGJA 3NQ2A 5G4WA 3W23A 3B04A 1I45A 2Y85A 4K8HA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4QM1A

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