4QM1A

Crystal structure of the inosine 5'-monophosphate dehydrogenase with an internal deletion of the cbs domain from bacillus anthracis str. ames complexed with inhibitor d67
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
357
structure length
337
Chain Sequence
FQSNAMWESKFVKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPREVSVKTVLSESLQLNIPLISAGMDTVTEADMAIAMARQGGLGIIHKNMSIEQQAEQVDKVKRSGGLLVGAAVGVTADAMTRIDALVKASVDAIVLDTAHGHSQGVIDKVKEVRAKYPSLNIIAGNVATAEATKALIEAGANVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQLTAVYDCATEARKHGIPVIADGGIKYSGDMVKALAAGAHVVMLGSMFAGVAESPGETEIYQGRQFKVYRGMGSVGAMEKVPEGIEGRVPYKGPLADTVHQLVGGLRAGMGYCGAQDLEFLRENAQFIRMSGAGLLVQIT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase with an Internal Deletion of the CBS Domain from Bacillus anthracis str. Ames complexed with inhibitor D67
rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Bacillus anthracis
total genus 94
structure length 337
sequence length 357
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2014-06-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4qm1A00
3QQ0A 2W6RA 2XN2A 4MJZA 4O18A 1K3UA 2YFOA 4AAJA 4FNPA 2FJKA 3TJXA 3W7LA 1LBLA 4HIBA 5H2ZA 3BG5A 4G1KA 4MY9A 4RXFA 4C1LA 5AC7A 4CNNA 2X16A 3SJ3A 2FQIA 2ZA2A 3LCIA 1NFBA 4TO8A 1KM3A 1QO2A 4LOCA 1O60A 3MI2A 1K02A 4AF0B 3NL5A 4KFPA 2Z0IA 2HSAA 3ZWTA 3O07A 3O6YX 3SGZA 3P8JA 5T26A 2A0NA 2YSWA 3UPWA 3L65A 5FF4A 3GR8A 1ONRA 3ABRA 4WUIA 3EB2A 3FIGA 2XFWA 1RQEA 3TW6A 3S5ZA 4IMEA 3I7QA 1SZFA 5AYYA 4QITA 1TB3A 3K30A 5DELA 1QPRA 3PUOA 4UFLA 1OX6A 1Q3NA 1KW1A 1SSGA 2NV2A 2ZDRA 3A9IA 3I6RA 5TBOA 1BWKA 3G8RA 3GKAA 2DORA 3PWAA 3QW4B 4R7JA 1A5BA 3CIXA 3MUXA 1ZAIA 2JGQA 5EL1A 4A21A 2PE4A 4LVFA 2QCGA 4FXSA 1KFKA 3EX4A 4UTTA 1Y0EA 2A7NA 1JQVA 1KBIA 3LI1A 4RCXA 1JCJA 3Q37A 1GVFA 3ATZA 2EKCA 1O94A 3W73A 2NX9A 3N14A 3Q94A 3P7YA 1DKWA 1G4PA 2FPTA 1NEYA 2RKXA 3NNTA 4JTHA 1WBJA 3M5YA 4N4QA 2DU2A 1O4UA 4N9DA 3BLFA 2EGZA 1KLYA 5HR7A 3SGUA 4PH6A 2I14A 3TAKA 3DXIA 1BKSA 3KVJA 2ZBTA 4GUJA 3W84A 3L5MA 5KTLA 1UASA 4MKNA 4ALDA 3PUEA 3C2RA 1BWLA 1GTEA 4HNNA 4GJ1A 1EWEA 2ZRZA 4ZQNA 1DVJA 2E5DA 3CT7A 3STCA 4UFKA 4H4IA 2E6YA 1G67A 2QAPA 4ZVJA 5C55A 4Y8FA 1KFBA 1VYSX 1LCOA 4FX6M 1S5WA 1I45A 4D2JA 1GVQA 3QSRA 3NQMA 4K8EA 2CWNA 1MO0A 2JKAA 3KRUA 4P61A 3QMRA 1KM2A 1OYCA 4UNKA 3KOFA 3LM7A 4ORIA 1F73A 5H91A 3LCHA 5FEZA 1LM1A 5LKYA 3G0UA 1W31A 3O1NA 3FEMA 3INPA 4KFOA 2CLIA 1SO6A 1QMLA 2QDHA 4HPJA 1VH7A 3W7NA 1VYRA 2VFGA 1ICQA 1V7YA 4Y96A 2ZTKA 3WJYA 5KSWA 3PC0A 2FB2A 4CCEA 4I9AA 1FBAA 1I2OA 1W5PA 1ZCOA 2NX1A 1W5NA 4QQ3A 1JCNA 3D0CA 3P60A 5L9FA 3NL2A 4LRTA 5LHFA 2I1OA 1YDNA 4W9TA 1YTDA 1XXXA 4NZJA 1TCDA 3LLDA 4K7YA 1AL8A 2PC4A 1W3NA 1VRDA 4Z1BA 3TCEA 4RZ5A 3M7WA 3DAQA 3FLUA 2ZRXA 1N8FA 4PTNA 3S5OA 2A7RA 4N2YA 4JYDA 5F2LA 4LU0A 1FDZA 1GQNA 1JUEA 3GYEA 1R2SA 3SR7A 4WJEA 2OJPA 5HULA 1OFBA 4S1FA 4JYFA 3TFCA 4M6VA 3AO0A 2A6LA 2YDAA 2YW4A 3IGXA 1Z48A 2C0AA 3W22A 3RLUA 2A5HA 1JRBA 4DXVA 1HTIA 3G18A 1KLZA 2DP3A 1SFLA 1THFD 4K38A 1PE1A 3G1XA 4DELA 3UYCA 1AL7A 1YYAA 1QWGA 4PCFA 3UWUA 4LUJA 3EWWA 1F7BA 3EEGA 1F74A 4JX5A 1TPEA 4PL2A 3VFLA 1HL2A 4H3DA 3TQKA 3I7RA 3LI0A 4QAIA 3IVSA 4A29A 2HS6A 4XKYB 1ME8A 4LT9A 2QKFA 5KZDA 3MJYA 1SPQA 2B7OA 4NZFA 4UTJA 4DO5A 3HPZA 1DOSA 1H60A 1VPXA 2A85A 1OX5A 4GUFA 3DGRA 1H63A 4GRSA 4ADSA 3NQEA 3W7DA 3DENA 1MEHA 1RV8A 5K3VA 4L4MA 3ZFHA 3S5NA 1XBZA 4JS3A 3IV3A 3TXVA 3R2GA 2TYSA 1VHNA 1EB3A 4X9SA 3LHVA 3TMQA 3LHUA 3FOKA 2ATMA 1UB3A 5C5YA 3GB6A 5D09A 3I7SA 1DV7A 5C54A 4UMBA 1M6JA 1GVSA 3BV4A 3TC6A 4IWWA 4TMBA 4WOZA 3QEZA 5DLCA 1K03A 4O15A 4R34A 3QPZA 1GPWA 2JKEA 4TU1A 1LLWA 3A5VA 4ZQMA 5F1UA 1G7UA 1SFJA 2W79A 4JN6A 3LCWA 1LBMA 2X1RA 4K39A 3QMSA 1P5BA 5AN7A 1FWSA 1JUBA 2YPIA 2DZUA 1A5CA 2AGKA 4CNPA 2ZRYA 4UIOA 1FUYA 4X22A 5CPLA 2H6RA 1VC4A 1G4EA 4UXDA 4ZMGA 1KM6A 2VENA 3P62A 1H7NA 1S3HA 2C15A 4HNTA 1LRQA 2ZRUA 4Q32A 4JTKA 3DFNA 1TPWA 1L6WA 3BW4A 4E2BA 4YCPA 2RHGA 4HT3A 3MYPA 2E5BA 3NG3A 4HN4A 3W7JA 1VCFA 3N19B 3LXCA 3A23A 4NXKA 1JR1A 5E1QA 1IGSA 3WK1A 5KINA 4GUGA 4JTLA 4OGZA 3W2LA 1H1ZA 3E49A 4RKAA 3KX6A 4OV9A 1X7FA 1KFLA 3B05A 3ZR4A 4BF9A 2OMAA 3MHUA 3OA3A 4YCOA 3E02A 2YCEA 4MOZA 5J5DA 4BR1A 1K8XA 1D9EA 4Z08A 3RU6A 1QNVA 1TV5A 5K7JA 2DZSA 1AMKA 4JTIA 3L67A 1TPVA 2NUXA 3GXNA 5C6MA 1YXDA 5HINA 5AHIA 1VCGA 3CB8A 3N2XA 3F4NA 1Q6OA 3THQA 4LC8A 3C2EA 3UWWA 1LZOA 3WJXA 5K9DA 3LGEA 2R91A 1IIHA 8TIMA 1K7XA 4IMFA 2Q3OA 4JTUA 1TV7A 1OG0A 3BW2A 4GBUA 4ML9A 1WAUA 3TIMA 3LHTA 3LLFA 3OG3A 5K9XA 2X1SA 3OVQA 4EVZA 5G5IA 1TSIA 4WOQA 2VEIA 3TH6A 4FX8A 3USBA 3NVTA 3B4UA 3HMJG 3W1PA 1A53A 3RMJA 3BLIA 3P61A 2A7PA 1LTDA 3SZ8A 1P4CA 1LOSA 2FFCA 2ISVA 2ZQ0A 1FDJA 4MVAA 3TSBA 5F2IA 2PRLA 4Z0JA 5BOOA 4UNLA 3BO9A 5BW6A 1DL3A 1I2QA 3F4WA 3BG9A 4K36A 2BXVA 3DH7A 3JS3A 3DBPA 1UUOA 4LS0A 3NOEA 4LS2A 3PB0A 1KM1A 1OFAA 2Z1BA 1FXQA 3L5AA 4AB4A 5LZLA 3L9CA 1ZENA 1KTBA 5I3IA 5D2WA 3W83A 4LS1A 4N6EA 3VCRA 3M43A 2JGYA 2ZRWA 4FEZA 1P0KA 1K7FA 3HG5A 3W2KA 3PF3A 3QW3A 3BGGA 2C16A 3W7QA 2WSRA 4EWND 4Y9AA 4O4VA 1T99A 3W7KA 2E6AA 1HUVA 3DZ1A 3PY2A 4NQ1A 4UTLA 3TA6A 4YLWA 5BRBA 3LDVA 5CPMA 1SQ7A 4FO4A 2EPHA 4OQVA 3S1VA 2CZ5A 2C3ZA 1XUZA 3TV8A 5I3HA 3MWAA 5K2ZA 3W1AA 3HF3A 3FS2A 1OHLA 3CWNA 4MFDA 3NPWA 4O19A 4O13A 3UWVA 2Q8LA 3LCGA 3DKJA 3NQVA 2Y6ZA 5DBTA 3TC7A 3S1XA 1GOXA 4MJMA 1WOAA 4CQ9A 4DO4A 1XM3A 3EXRA 1TTPA 3W1TA 4XBSA 5FF3A 1TPB1 4XZ9A 3G1AA 4TX9A 1NF0A 2C1HA 4UFIA 4JY8A 5G1TA 4NVTA 1W3TA 2XN1A 1AK5A 2J6XA 2B7QA 1XBYA 2Z6JA 4JTJA 3P80A 2B0MA 3TKFA 1B9BA 3SI9A 5AHFA 5DXYA 1D3GA 3M41A 3DFPA 5KMYA 4FIRA 3QH2A 4GC4A 2WPBA 3E9AA 4B5NA 3P74A 4K6AA 3GAYA 2DJXA 1VS1A 5TIMA 4GUHA 1UUMA 4M19A 4LV4A 1QAPA 2A6NA 1SZEA 3N2MA 3PBVA 4O50A 3NQDA 3M0ZA 3M5VA 1OX4A 2FDSA 1H7RA 4AHQA 2NZLA 3S8HA 4FNRA 2X30A 3GAKA 4O53A 3GK0A 1VCVA 4MY1A 2CZFA 1R46A 3UQNA 3MW7A 4QNWA 3W72A 3NQ6A 2G96A 4FF7A 3EKLA 3PM6A 1T96A 1M7PA 1AW2A 3M5ZA 3W3OA 4YMZA 3PS7A 3OVPA 2J24A 1TPC1 4MUZA 2YYTA 2F84A 2ZA3A 1YLVA 3CQ0A 1F6KA 4KWWA 2V0TA 3GLCA 3V1PA 1OVDA 1U5JA 3NZRA 3W1NA 4A3UA 3NQGA 3W9ZA 3M44A 3M5XA 4BI7A 2GVLA 2CLOA 1QOQA 1VJIA 3O6CA 3DU0A 5AC8A 3LRLA 1QR7A 1L2UA 4FX7A 3NM1A 3ZWSA 1JCLA 1WXJA 3PVFA 4O4WA 3HOJA 4ORMA 4DF2A 3TJLA 2C18A 1ME9A 2QJGA 2Q8ZA 3SFKA 5EKYA 5ABTA 5FESA 5G2IA 1UBSA 1PIIA 4JNMA 1XCFA 3MBDA 5F2MA 5AB3A 3HG2A 1YPIA 1H51A 3MBFA 1W5OA 3LXBA 1AW5A 1PHQA 2WSYA 5HMSA 5BNKA 1QCWA 5LNVA 3FA5A 2V81A 1W54A 3C52A 1EX5A 3W1LA 1I8JA 4LVBA 3R8RA 4S2BA 4LY8A 2RH9A 2X1UA 4LUIA 5TQLA 4JXCA 3W88A 2G5WA 2Y88A 1F5ZA 3C0JA 3GDTA 3VE9A 2NUWA 3W2NA 2IQTA 2QDGA 1T0OA 4JR5A 1H7XA 1QPNA 2QCHA 1DHPA 2VFIA 1JUKA 1WBHA 1CX9A 2C6QA 5AC6A 1L9WA 3ABQA 2QCDA 2JBMA 4MPQA 3KFTA 4RJEA 3MP4A 3OEXA 2VXNA 2YW3A 5K9CA 2VEPA 2WJZA 2VFEA 2LLEA 2QCMA 4XBKA 2AAMA 3H53A 3Q58A 4TMCA 3LCFA 1WV2A 4Z0SA 3UXAA 1PCWA 3MMTA 3G1VA 3W6YA 1IXNA 1QO5A 3W1QA 1TTQA 1C8VA 3UZ5A 2OT1A 4ONVA 2TRSA 4WY0B 1CI1A 2QUUA 3JRKA 5A8GA 3LRMA 2H8ZA 3PB2A 4KKXA 4XQ6A 4NNAA 1TQXA 3F03K 3BK0A 3N9SA 1XI3A 3PULA 1YDOA 2GQAA 1KM5A 1SUXA 2V2HA 4AWSA 4EF8A 4CCDA 2NXHA 3CLMA 2CLMA 3NEVA 4UMAA 4NJJA 3IGSA 1P1XA 4JEQA 5HWNA 1MSSA 1V5XA 2BZNA 3B04A 3IRDA 2AQWA 4UTIA 4ZZ9A 2EF9A 2V9DA 4GXMA 2ALDA 2VEMA 3W76A 1G4TA 3EXSA 2FB3A 3GVGA 1Q6RA 3MYOA 5HWMA 4O1BA 4ADUA 1WQ5A 4WD0A 5L6UA 1TIMA 2QCLA 4AF0A 3B06A 3T55A 4WXYA 4QNEA 4XTIA 1ZFJA 3DHDA 1EPXA 3W86A 1FX6A 1NSJA 4AMAA 3QPYA 5F4WA 3RK8A 1MEWA 2CLFA 4AXKA 3W70A 4I7UA 1A5AA 2J88A 3EX6A 5CZSA 1H7WA 2DZPA 1XFBA 5EY5A 1TTJA 3CEUA 3NPVA 2HTMA 2OZ0A 3L68A 3VKJA 2CFFA 5CGQA 4O17A 4DF1A 1G69A 1LORA 3PR2A 3L2IA 2J9XA 3GDKA 3C61A 3LRKA 4O11A 4LNYA 3SSJA 3I65A 5G2HA 2GOUA 3G3DA 2VEKA 4POCA 1OK6A 2J9YA 4QISA 1VYPX 3IEBA 2VFDA 3JR2A 4AEOA 2NWSA 4OT7A 4IQLA 3PBYA 3LERA 3G1FA 2CU0A 3MI3A 3IGUA 3S0CA 2V8ZA 1QOPA 2DJLA 4IMGA 2NV1A 3P5YA 3S1UA 1LRNA 1KM0A 3TW7A 1R2RA 4NJIA 4KFNA 5HWJA 3HPXA 1W3IA 4JD4A 2NWRA 2QJHA 5CSRA 5C2XA 3N34A 3G3MA 3LX9A 2H3BA 4OV4A 3OVRA 3DI0A 3O16A 3QSTA 4AWUA 2H3DA 5E93A 2GQ8A 1L6SA 5DBUA 3TUUA 3RLVA 4RX0A 1W5MA 5DXXA 1KFJA 5DCDA 3KVLA 1GG0A 3U6WA 1ZALA 1QDSA 3KAOA 3W2UA 5KZMA 3QM3A 2R14A 2BSLA 3TSDA 4AHOA 4Y90A 2HS8A 2E68A 4J9JA 2GVGA 3T7VA 3NGJA 3WK0A 5CSSA 5CZ0A 3WJSA 1O5KA 4QSHA 1ICSA 5E0KA 4JX6A 4XWUA 3W85A 4UFMA 1HO4A 2NUYA 2ZTJA 1K7EA 2WNZA 1FCVA 4LWWA 1PL9A 5KITA 1TTIA 3GIYA 3TXZA 2V5BA 3BPWA 4FB7A 2VKZG 1BTMA 1LOQA 1TV8A 3LCLA 4O0KA 4RXGA 4BWLA 2FPVA 1UJPA 2TMDA 4LW7A 4MFEA 3P5ZA 1DJQA 1S5TA 4DPQA 1J2WA 1SW3A 3S1WA 2GQ9A 5BMXA 4M6PA 4GE8A 3O15A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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