4QNEA

Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from vibrio cholerae, deletion mutant, in complex with nad and imp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
358
structure length
342
Chain Sequence
RIAKEALTFDDVLLVPAHSTVLPNTADLRTRLTKNIALNIPMVSASMDTVTEARLAIALAQEGGIGFIHKNMSIEQQAAQVHQVKISGGLRVGAAVGAAPGNEERVKALVEAGVDVLLIDSSHGHSEGVLQRIRETRAAYPHLEIIGGNVATAEGARALIEAGVSAVKVGIGPGSICTTRIVTGVGVPQITAIADAAGVANEYGIPVIADGGIRFSGDISKAIAAGASCVMVGSMFAGTEEAPGEVILYQGRSYKAYRGMGSLGAMSLVPEGIEGRIAYKGHLKEIIHQQMGGLRSCMGLTGSATVEDLRTKAQFVRISGAGMKESHVHDVQITKEAPNYRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from Vibrio cholerae, deletion mutant, in complex with NAD and IMP
rcsb
molecule keywords Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Vibrio cholerae o1 biovar el tor
total genus 105
structure length 342
sequence length 358
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2014-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4qneA00
1TCDA 3L21A 2NV2A 5BMWA 4RKAA 3IGSA 3NL5A 3QMRA 2EPHA 1DBTA 3G1SA 5F1VA 4Z1DA 1M7OA 4E38A 4GXMA 3GXPA 4NXSA 2TRSA 4JDBA 1SW7A 2RKXA 4NZFA 2CLKA 3TE9A 5D02A 1HO4A 3HF3A 4IWWA 1MEWA 1SW0A 4UTWC 4B5NA 2ALDA 5DCEA 3NEVA 3P67A 2CZ5A 4IGHA 1IIHA 4MY9A 5CPLA 2WO5A 1T99A 1G4EA 3TXVA 2OZ0A 4FNSA 5CZSA 3TV8A 4LNYA 4EF8A 5LHFA 4YCPA 1SSDA 2CFFA 5BNKA 4JX5A 3DKLA 2EF9A 2CLFA 2RHGA 3W6YA 5KTLA 1TREA 3GDLA 5FF7A 4YL2A 4N02A 1F73A 3QEZA 4ADSA 3THQA 3N3MA 3LXBA 2CLIA 4QAIA 2ZQ0A 5D03A 4DO6A 2NWSA 2Y85A 3W72A 5K9CA 2ZZ5A 3EWBX 3M16A 3NAVA 2RFGA 2EGZA 4LVGA 4OWGA 3W2KA 1G4SA 3CPRA 5G1YA 3W7JA 1TPEA 5HWNA 3IRDA 3I7RA 3TXZA 4S2CA 3GDRA 1FDJA 3MUXA 5IBXA 2ZRUA 3O05A 2X1RA 3TC7A 3W7IA 1SFJA 2C1HA 2C14A 4Y96A 3LDVA 3S9YA 3LCWA 1FCVA 3EX3A 4K8HA 4A22A 1EUNA 5FEZA 4CQ9A 6TIMA 1QR7A 3LERA 5HNRA 3G18A 3L2IA 3QPYA 4AXKA 4O53A 4P2VA 1JUBA 4JD4A 3MBFA 3NQGA 3W87A 2KZHA 1W3NA 3CWOX 2D73A 3A5FA 5AYYA 4ZQOA 4ZQPA 4O57A 3LHWA 4IMDA 1EWEA 5G1TA 1AMKA 2WNZA 3FYPA 3H53A 2X16A 2WNQA 3TKFA 1B57A 3DI0A 1XUUA 4CNPA 4Z08A 3G0SA 3S0CA 4AHOA 3EXSA 4RJEA 1S3HA 1XL9A 5I3HA 3RFAA 4ONVA 4E2DA 4LTSA 3N9SA 3LHUA 3P7YA 3UXDA 5C6MA 3N19B 1SW3A 3DHFA 3R89A 2FPTA 4BI6A 8TIMA 2YW3A 5EPDA 5HR7A 3TQKA 1H7RA 3LTSA 3U8GA 4HIBA 4JX4A 3C8FA 4UNLA 4FHAA 1O5XA 3BGGA 3E9AA 1TV7A 1G6CA 2QR6A 3O15A 3I68A 2Y7GA 2WNNA 2E6DA 5DY3A 5CPNA 4AWSA 1EP1A 3RNDA 1GVSA 3I65A 4NJJA 3PUOA 3DHDA 2DORA 3M41A 1KM4A 3EB2A 1R2RA 1ONRA 2CLEA 4UFLA 3W1XA 4BR1A 2CW6A 3O06A 4I7UA 1TSIA 3W2NA 5EA9A 4DF2A 5BOOA 4OHQA 4AB4A 2QCFA 1GPWA 4WX2A 4O1AA 3QJAA 1ICPA 3T44A 1PCKA 4PL2A 2Y70A 1LBMA 1FXPA 4YMZA 1F6KA 1IGSA 3MYOA 3EXTA 2C3ZA 4WY0B 1AL8A 3ZWSA 1TJPA 1W5MA 3C2OA 3QPZA 5C55A 3F03K 3W1UA 5G2HA 1K7XA 1PHWA 3W7GA 3G1FA 1SPQA 2YW4A 4BI5A 2O7SA 2X1UA 2E68A 3L0NA 1W5PA 3DENA 4LVBA 5HR6A 4K37A 3CEPA 4LY8A 2CLHA 2WSQA 3H55A 1NFBA 3G3MA 5AHNA 3UPBA 4BWLC 2B7QA 4FX6M 4I7VA 4XQ6A 1OX5A 5D04C 2GVJA 1OX4A 3PULA 1QPQA 2PURA 3F4WA 2V0TA 1KM0A 4FNUA 2YYUA 2ZZ7A 3CHVA 4XBKA 2E6FA 6ALDA 1KFJA 4AMAA 3W1QA 4MYXA 2YPIA 2R14A 2VFDA 1N55A 3BG5A 4S2BA 3IGUA 4JTHA 3UQNA 3IIOA 1R30A 4PODA 2W79A 1JCMP 1XBXA 3FJ6A 3R13A 2BSLA 2V2DA 4NJKA 3KRZA 3NQVA 4LW7A 4LVDA 4HN4A 3PR2A 1OFAA 2VOMA 1XC4A 4NX5A 4UMCA 4RCXA 1EPXA 3MP5A 1B4KA 4H4IA 3MI3A 1L6SA 1C9DA 4JXCA 4OU1A 4X2RA 3P81A 2GVLA 5D32A 2GVGA 2J9XA 1O94A 4WXZA 2C19A 1RQEA 3W3OA 1EIXA 3LTPA 3QF0A 1SFLA 2NXGA 2YSWA 4O50A 2NUYA 1W0MA 4CCCA 4RZ5A 1B3OA 1T8XA 1VR6A 5D2VA 2V8ZA 3UY7A 1WAUA 1JCYA 3W88A 4QJ1A 4OQVA 1A50A 3R8RA 4Q4KA 3L68A 4O18A 3PY2A 3LGEA 3HOJA 4OT7A 4HPJA 4ZMGA 1KTBA 3HG5A 4M6PA 5J5RA 4DPQA 1Q6RA 5DY2A 3TC6A 1VCVA 3L5LA 3EXRA 3QW3A 1PV8A 1R47A 3CQ0A 4LOCA 3FEMA 3DFSA 4OV4A 5HJLA 3SI9A 2DJXA 3WK1A 2YXGA 3C6CA 1SZNA 5CPOA 4UUIA 5DCDA 3TR2A 4TMCA 4GUIA 4UR8A 3D0CA 2Q3RA 2ZDRA 4HT3A 1O60A 3GKFA 1YXCA 3LCHA 4QITA 2A6LA 4M7TA 4JIPA 1HTIA 2DJLA 2DZTA 1W37A 3BV4A 3NGJA 3W7EA 2FJKA 2TYSA 3B05A 2H8XA 1T96A 1XI3A 3NQAA 5AHIA 1RV8A 3M43A 3TJXA 1OF6A 5K9XA 5I3FA 2R94A 3CB8A 5F4SA 4ALDA 3UWQA 1WOBA 3MI6A 3ZWTA 3P5ZA 4XKYB 4NJHA 4EIVA 1QFEA 1BKSA 3MMTA 3S8HA 1H1YA 2ISVA 2I1OA 4LV9A 3TW7A 4X22A 1LORA 1VZWA 2H6RA 1OFEA 4NX0A 4EWND 2B7OA 5I3GA 5EKYA 4PC8A 4Y9AA 3BGJA 3NQMA 4ZQCA 2XN0A 4GBUA 3PG9A 1OFRA 4LVFA 5D30A 1XKYA 1HUVA 2VEPA 1KFEA 2FPVA 5CG7A 4GJ1A 5AC8A 1A5SA 4E2BA 2QCDB 3MO7A 2PE4A 3C2FA 3K30A 5AYXA 5K4XA 1RVGA 3C2RA 3LM7A 4LRSA 3STGA 3TIMA 1W56A 4JTSA 4PCFA 3TSDA 1H51A 2YYTA 3QQ1A 3NVTA 4A29A 1I45A 1OFOA 1G69A 4NUWA 4JTEA 3WK0A 1ZNNA 3GKAA 5CZTA 1KA9F 2FTPA 1GVOA 3W7QA 1XBZA 3SJ3A 3BW4A 1LOSA 4DXVA 2WOQA 5LSMA 3LV6A 2FQIA 5CZ0A 1DJQA 1FBAA 3EX6A 2YCEA 4X9SA 3IIPA 4LS1A 3RMJA 3DAQA 1TB3A 3W7PA 3MWAA 1Z44A 5FEWA 1WX0A 3SFKA 4WY0F 3W7NA 2G5WA 2VEIA 3DH7A 3TROA 2CLMA 3CM4A 3LCFA 3DZ1A 3I7SA 1LLZA 1RD5A 1VCGA 2RH9A 2EAWA 4UTJA 1TPC1 4JTIA 1H5YA 1PL9A 3N2MA 1QO2A 3UXAA 3EX2A 3DFQA 3VKJA 5G4EA 3UWZA 4K38A 1FWTA 1KM1A 2CWNA 3LLFA 1AW2A 2ZRVA 1G7VA 3L5AA 4XWUA 5D33A 3W1LA 4FIQA 1LOQA 1ZAIA 3MJYA 3FA5A 3INPA 3NG3A 3QFEA 4ML9A 3M0ZA 1ALDA 1F7BA 3B0PA 3DFOA 4JX6A 4FB7A 2QUVA 4WXYA 4DF0A 1YTEA 1OYCA 4MFDA 4I9AA 1XBVA 1PE1A 3NQCA 3T55A 2C15A 4CQAA 3PG8A 4LUIA 4O14A 3V75A 1LOLA 3PB0A 3QQ0A 2A7PA 1WDWA 3GXTA 1I8JA 1VYPX 5F2MA 1TYGA 2GPTA 5G5IA 4O11A 4JTTA 3PUEA 4Q32A 3NO5A 1LRNA 4NT0A 4FNPA 4WZHA 1W31A 3P82A 5AHEA 4LC6A 2ISSA 4JGDA 3A23A 4HNNA 5K3VA 2A4AA 4JICA 1QOQA 3L0GA 4JS3A 3PM6A 1FCBA 4HSNA 4P61A 4PH6A 4POCA 1KLYA 4ORIA 1UJPA 2ZRYA 4IPIA 2QCGA 3PF3A 3KVMA 5G4WA 3EX4A 4ZQNA 1AW5A 3TAKA 1LM1A 1JR1A 2H8ZA 3THAA 4BF9A 1XDLA 2ABAA 2OJPA 1GVFA 3OBKA 2VC6A 1JCLA 3HG3A 1B9BA 4N4QA 3TNOA 3TSMA 3IV3A 3S1UA 2E5CA 3YPIA 1GG0A 3FKKA 3W75A 3LCLA 4U4MA 5L6UA 2E6YA 1BWKA 3BG9A 3DGRA 3HGRA 5F2IA 5A8GA 4FXSA 1P0NA 4RV8A 3RF9A 3U2OA 3BLIA 3ABOA 4DBEA 3IIXA 3L5MA 3BLEA 3QRHA 3QYQA 3QC3A 2HSAA 4Z0JA 3LRMA 4N6FA 1OYAA 1SZEA 1SO3A 1OFDA 3LI0A 1JULA 3NDOA 5FF3A 2ZTKA 3N9RA 4DQWA 4O15A 4AF0B 3PSVA 4MIMA 1OABA 3GDTA 4UC5A 2Q8ZA 1R2TA 5CZJA 1RZMA 4N9EA 3NNTA 1KV5A 5C2XA 3PBVA 5DBTA 4JEQA 5FF0A 1DQWA 1GTEA 1LYXA 3WJZA 1OFPA 3R12A 4IUOA 2Y62A 1SZFA 3W2LA 5E0KA 2QUUA 1GYLA 3NPVA 3U6WA 2DZUA 3WFAA 1I2OA 3C0JA 5BMXA 2X1SA 5AC6A 1YXYA 5U7SA 5F1UA 2R91A 2FDSA 2H3DA 1M6JA 2B7NA 3HMJG 4EOUA 1X1OA 1FY6A 4KFOA 3TJLA 3IVUA 3NL3A 2J24A 2CLOA 5CSSA 2JKEA 3I6RA 1FCUA 4RXFA 1MSSA 1QPRA 2BWGA 2F84A 3QMTA 1ZCOA 3SGZA 3KXQA 1H7NA 2A1YA 3DKJA 1JVNA 3GX9A 4BK9A 1X1ZA 2ZYFA 2ZZ3A 1YLVA 2CLLA 1P4CA 4QISA 4DEFA 4O0ZA 4MUZA 3W1RA 1ZJIA 4O13A 4K8EA 3LXAA 1W5NA 1TPUA 1VH7A 4UR7A 1CW2A 1MO0A 1XBYA 3KVKA 5CPMA 3WJSA 5LNUA 3W7CA 1NAL1 4MJMA 4JYFA 1PS9A 2DZPA 3HO8A 1TTIA 1QDSA 1EA0A 3NQ6A 1QPOA 3S5ZA 1VHCA 3OHIA 2J27A 4DPPA 1Q6OA 3S6DA 1NSJA 1DORA 2XN1A 3GK0A 3MHFA 1NF7A 5J5DA 1THFD 2RDWA 3BW3A 1CI1A 3E0IA 1HG3A 1PIIA 3NQEA 4WQ6A 3USBA 3UPWA 4QSHA 2JK2A 4Z1AA 1VJIA 3T78A 1GWJA 2NXIA 2I14A 1A5AA 2BLEA 2FB2A 2DZSA 3STEA 4L4LA 2UV8G 4MLRA 5FEPA 2QUTA 3VE9A 4A2RA 4UMBA 2V81A 3LBCA 4GNJA 1QMLA 5FF4A 1N7KA 5I3IA 1GEQA 1IIGA 4JNMA 4O4VA 1K7FA 3HQ1A 3O6DA 4ZQMA 4HNVA 4JY8A 1U5JA 2I9EA 1VCFA 5GVJA 2WPBA 1VLWA 3W23A 3JRKA 3PWAA 4LS0A 2XN2A 1XUZA 4NNBA 2Z1BA 4DBDA 1KM2A 1T0OA 1GVRA 3GIYA 4PA8A 4R33A 3M7WA 3IGXA 1FWRA 3G8RA 1KV8A 1OX6A 3N2XA 3S1WA 3NQFA 3G3DA 3NL2A 3OA3A 3SW6A 3A5VA 4MKNA 3AO0A 1W1ZA 3HPXA 2A2IA 5K9DA 4K7YA 3NL6A 4FX8A 4IJBA 2GOUA 1TTPA 1GYNA 4UFIA 1QAPA 5L9FA 3NQ7A 3M44A 5D09A 3HJZA 3LRKA 1G4TA 2X30A 3W85A 4CNNA 1LTDA 3EWUA 4GUFA 1K03A 4M5PA 4JYEA 3W2UA 4ZVJA 1OHLA 2FLIA 4ICNA 5DELA 5KZEA 1F74A 3Q94A 2ZCGA 2AQWA 4EVZA 1AW1A 3OG3A 4UFMA 1C8VA 3LCXA 4Y90A 5FF2A 3TFXA 3GAKA 4R7JA 3HB9A 4MOZA 5AFDA 5C54A 3W84A 2B0MA 3BW2A 4RZ4A 3BO9A 1VLIA 3EX1A 5H91A 3UZJA 1J2WA 1YDNA 3BK0A 2Y7EA 2CZDA 3UD6A 3GNNA 4AVFA 3E96A 2NUWA 2VFFA 4N2YA 3STFA 5D05A 4RR4A 4OBTA 4GRSA 3B4UA 3LLDA 4HKPA 1SU5A 1UUOA 3O16A 3JS3A 2HS8A 1H62A 2VENA 3UNDA 4WOQA 2NX9A 3BLFA 1JQVA 1MZHA 3C3NA 3W71A 1DHPA 4H6KA 2FFCA 2HTMA 3GYEA 1TO3A 5T26A 2GJLA 2GUUA 5D2WA 4UTHA 1XFBA 2QJHA 2RDTA 3O63A 4WJEA 1RPXA 1EEPA 1QCWA 3SIZA 4GUGA 3QZEA 1V7YA 4FXRA 5IBXC 3TFCA 4M19A 1W54A 4ZQRA 3LCGA 5LGZA 4KKXA 1K3UA 5F4XA 2J9ZA 5AC7A 1JUKA 3FKRA 3QH2A 4O1CA 4IQLA 1ML1A 5DXXA 1OK6A 1QPNA 1QO5A 2J88A 3M9YA 3MI2A 1RQHA 2X2GA 4FIRA 4GWEA 1L6YA 1JQXA 2A7NA 1RR2A 1I4NA 5FESA 3P61A 4M6QA 4QIUA 3CC1A 4H3DA 2QCNA 1IXQA 4GE8A 3BVJA 3MW7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1TCD A;  1PBG A;  1QXL A;  1CZ1 A;  4IIG A;  2VC5 A;  3RIT A;  3GDB A;  4N0R A;  1E55 A;  1M7O A;  1JG9 A;  5CQ1 A;  2BHU A;  1SW7 A;  2CLK A;  4QE1 A;  1DWF M;  4DJF C;  1IWB A;  1EYE A;  2Z1V A;  1WUF A;  5M3W A;  3TNB A;  2XWE A;  2X05 A;  2QDE A;  2ALD A;  5DCE A;  4F4R A;  1BSL A;  5CPL A;  2WO5 A;  2AAA A;  4IID A;  3KUM A;  3B3D A;  5A6M A;  5CZS A;  5LHF A;  3IJL A;  1F07 A;  3UBP C;  3W6Y A;  1H3G A;  5FF7 A;  3QEZ A;  4X2P A;  3KTX A;  3THQ A;  1RJQ A;  4D6F A;  3S2J A;  4MWA C;  1DJY A;  4PSP A;  3TON A;  5FD0 A;  1MUW A;  3U2E A;  4IG2 B;  4R7W A;  3VMO A;  3NAV A;  1HL9 A;  1TZ9 A;  2RFG A;  1KQY A;  1FHD A;  2EGZ A;  2XIN A;  2YLA A;  4LVG A;  1EOK A;  3W2K A;  3RLH A;  2JIW A;  3CT2 A;  3BZG A;  3W7J A;  3I6E A;  4W84 A;  5HWN A;  1F3T A;  3I7R A;  4S2C A;  3BE7 A;  2E4T A;  2FJU B;  1RA5 A;  4CNU A;  3MUX A;  5IBX A;  2ZRU A;  3E0F A;  3TC7 A;  4EPE C;  1SFJ A;  3ZJK A;  1DXF A;  4FS9 A;  1FCV A;  3HPA A;  1GQL A;  1EUN A;  4CQ9 A;  2OZ8 A;  3LER A;  3G6M A;  3G18 A;  2Y8V A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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