4QQ3 | Genus

Total Genus 103

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	103
sequence length	339
structure length	302
Chain Sequence	MLRIAKEALTFDDVLLVPAHSTVLPNTADLRTRLTKNIALNIPMVSASMDTVTEARLAIALAQEGGIGFIHKNMSIEQQAAQVHQVKISGGLRVGAAVGAAPGNEERVKALVEAGVDVLLIDSSHGHSEGVLQRIRETRAAYPHLEIIGGNVATAEGARALIEAGVSAVKVGIGPGSICTTRIVTGVGVPQITAIADAAGVANEYGIPVIADGGIRFSGDISKAIAAGASCVMVGSMFAGTEEAPGRSYKAYRGMGRIAYKGHLKEIIHQQMGGLRSCMGLTGSATVEDLRTKAQFVRISGA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Vibrio cholerae o1 biovar el tor str. n16961
publication title	Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from vibrio cholerae, deletion mutant, in complex with xmp rcsb
molecule keywords	Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
total genus	103
structure length	302
sequence length	339
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2014-06-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4qq3A00

1AK5A 3KOFA 3PUDA 3O63A 4XZ9A 4K8HA 1GWJA 4ORIA 1G4PA 4CNNA 5KZEA 2ZBTA 5EMUA 3G1FA 4UTIA 1H50A 3W7NA 1FWNA 1NEYA 2GQ8A 3MI3A 4JTJA 4JDBA 4M6QA 4IOTA 3UYCA 2FPYA 4ONVA 3I7RA 3E12A 3IIXA 1LBLA 1WXJA 3LI1A 1GEQA 2WKJA 3M16A 3KVKA 3STGA 5DBUA 3SJ3A 4R34A 3G8RA 3KVLA 2PRHA 3W9ZA 4DPPA 2CWNA 1GTEA 2ZRYA 3LX9A 5TIMA 1LLZA 4LVDA 3QW4B 3DHDA 2ZA1A 2C13A 3G3MA 5HUOA 4EF8A 3W07A 3BW4A 1OFDA 3HG2A 3PAJA 1L2UA 3N14A 1H7RA 2NX1A 1EWDA 5AB3A 3PSWA 4MOZA 4FF7A 3C56A 3G24A 5K9DA 1SZNA 1W3TA 3OHIA 3LCGA 3NZRA 2UV8G 1FBAA 4JTFA 4KFNA 2QUVA 3MI2A 5LNVA 1SZEA 3C4UA 4Z1DA 3BARA 3NXFA 5K3VA 1FWSA 3C52A 4AWTA 4D2JA 4JTSA 3UNDA 1IXNA 5F4WA 5D03A 1N8FA 4ADSA 2DZTA 3CIWA 2Y85A 4R53A 2B7QA 4LVBA 1SFLA 4I9AA 3QMSA 1XBZA 3O6CA 3ZWSA 2CZFA 4XTDA 3L66A 1TCDA 1W31A 4JTGA 4MIMA 4GUGA 4JTUA 1D3HA 1TPB1 1SPQA 3BGGA 7TIMA 2TRSA 2QAFA 3HF3A 5C55A 2E6FA 3GYEA 4NJJA 4Q32A 4TIMA 4AHOA 4UFIA 2FLIA 3DH7A 3HGJA 3W1LA 3TFXA 1WQ5A 3L0KA 2HS6A 5E1QA 3LHTA 3BLEA 2BX7A 4K36A 1J4EA 5AHEA 3SR7A 5HWMA 1NF0A 1WAUA 4UTWC 1YDVA 4O16A 2XN1A 3LCFA 4AWUA 1U5JA 5HWJA 3NYZA 3HG5A 1K7FA 2R94A 3CU2A 2JK2A 3LXAA 3OG3A 3T40A 1H5YA 4YLWA 3W7DA 3W1PA 3QZEA 1IIGA 1YPIA 3DKLA 5HMSA 1PCKA 3CTLA 3NL3A 1TTIA 1Z44A 1H1ZA 5CKSA 1ZCOA 1IXPA 3TQ0A 1PVNA 4JICA 4R33A 1FCVA 1SSGA 2WNZA 3NEVA 4O15A 3PBUA 1H7OA 2RH9A 3EWBX 3U8GA 4E2BA 3W85A 5CSSA 2E6AA 4PODA 3NAVA 4DO5A 1I2PA 3RMJA 1VCFA 2JGYA 1F2JA 3W1TA 1LOQA 2NUYA 3N9RA 2GQ9A 2A7PA 4UFLA 1H63A 1KM0A 3EWUA 3THQA 4CQ9A 1F6PA 1NVMA 2OT0A 3PWAA 1GTHA 2QUTA 4ZQNA 3GR7A 3LERA 3P67A 3FS2A 4O1AA 1XL9A 2GJLA 3W7EA 4GBUA 3HG3A 1F7BA 4WZHA 1H61A 3S0CA 4UTWA 2HSAA 3UQNA 3CPRA 4KKXA 1KLYA 1Z48A 1DVJA 3T78A 1GVRA 3BW2A 1FWRA 4M6PA 1EA0A 1KFBA 3H55A 4RZ6A 4L4LA 1K7XA 1C9DA 5G2WA 2GJNA 1BEUA 3QSTA 4YMZA 5LZLA 4QAIA 2Y70A 3M5YA 4KFOA 5EYWA 3TQKA 2F84A 1HG3A 4Y8FA 3UWWA 2NXIA 1MEWA 2G96A 2P0OA 2O7QA 4PL1A 4MZYA 1RQEA 5D30A 3TQVA 3P74A 4O1BA 1ME9A 3G0XA 2JKEA 1HO4A 1PHWA 3W23A 1T0OA 3PM6A 2YPIA 2B7NA 4Z1BA 5H2ZA 2HS8A 3TCEA 4JTIA 4RZ5A 1YTDA 1XC4A 2C3ZA 1K7EA 2ISVA 4FNSA 1TPDA 2V30A 3W74A 5EBUA 3NR0A 3GLCA 4HKPA 3GKFA 1SFJA 3SSJA 4XKYB 1KTNA 2A0NA 3NOEA 3SGUA 4MY9A 1G6CA 5CGQA 5LHEA 2ATMA 4NNCA 2VENA 3L0NA 3QM3A 3NDOA 4DXVA 1W1ZA 1K8ZA 2ZA2A 3MYOA 3QMRA 1SZGA 2QDHA 5FF2A 1XM3A 1TTJA 4IUOA 4KWVA 3W73A 4QJ1A 4CNOA 3KRSA 1XI3A 3G1HA 5AYZA 3PUEA 1QOPA 2Z1BA 1GT8A 1VYRA 5A5WA 1SSDA 2NV1A 2FPTA 4XUGA 3P80A 1L6SA 4XKYA 2NZLA 2V82A 5I3IA 3QYQA 3LV6A 1EWEA 4QNWA 3W84A 3OEXA 4K6AA 5TQLA 1OK6A 3UXDA 1KM5A 3IVTA 2NXHA 3W7CA 4PA8A 3OVRA 4TMBA 1WBJA 3KFTA 5C6MA 3TMLA 5D2VA 5DXYA 2CZDA 3TKFA 2X16A 4HPJA 4H4IA 3DAQA 4OQVA 4CQ8A 1FXPA 1W5OA 1OABA 5F4SA 4JGDA 1DJNA 1N55A 3W7RA 4AVFA 2E5CA 1XBVA 3GK0A 3K30A 4NXKA 3PULA 4TMCA 6TIMA 1K3UA 3LCXA 2WSQA 4JY8A 1D9EA 2XFWA 2TSYA 3C3NA 3BLFA 3PVFA 5AC7A 3P5ZA 2DZVA 3W76A 3CEPA 1EP2A 1AL7A 1M7PA 5HR6A 2RKXA 4UFMA 5AHNA 2E6YA 5LHFA 2NUWA 3IRDA 5MHBA 2CLMA 3LBMA 3BPWA 3TK7A 2KZHA 5DXXA 1Q45A 3C2OA 4M6VA 3N34A 2HMCA 2ISWA 5U4NA 2CZ5A 1YLVA 3LHYA 3PG8A 5FESA 3SIZA 4CNPA 3SY5A 4BWLC 3L5AA 3O1NA 4N4QA 1QPQA 2C19A 1GVSA 5DCDA 3MW7A 2RDUA 4RCXA 2C16A 2H3DA 4LC8A 4O0ZA 4ORMA 4AHQA 1VCGA 5D02A 2GVJA 4WJEA 2VEPA 3B0PA 2RHGA 4O57A 5F2MA 4ZQOA 1Q6LA 1SW3A 3V75A 3P5YA 1OFOA 2WO5A 4TU1A 3NQGA 2ZRXA 1UASA 1G67A 2B4GA 1DQXA 3BW3A 2AGKA 1I2NA 1LOLA 3O07A 5CZJA 1TPWA 5CG7A 4MY8A 3W7QA 2WV8A 2X2GA 2YX0A 3CEUA 1QOQA 3G22A 1S5WA 3GDMA 3SW6A 3M47A 2ZTJA 4NNAA 3S1VA 3INPA 1MO0A 2I1OA 4O50A 4JNMA 4PEKA 4O53A 4FO4A 4FX7A 3ZFHA 3G8EA 2VEKA 4Y9AA 3W22A 1YXCA 4UIOA 4UUIA 1X8FA 1F5ZA 4RJEA 4AH7A 3IIZA 4C1LA 1TPC1 2Y7DA 4UFHA 2WOQA 1JUBA 1KM2A 3TDFA 1XKYA 4BWLA 4FXRA 3S1UA 3NPUA 3ZWTA 1P0NA 1JCJA 1DV7A 1IGSA 1TYGA 3GIYA 4M5PA 3L9CA 3EX2A 1VC4A 3BO9A 1A50A 1MXSA 3GDKA 4KFPA 3NQCA 3B8DA 2Y89A 3NQAA 1DKWA 3DFTA 5DBTA 3TSBA 5AC6A 2OMAA 2PE4A 3WK1A 4JXCA 4DBEA 4LVGA 1PIIA 1X7FA 4NJKA 2CLIA 3B05A 5DCEA 3NG3A 2H8ZA 3IIOA 4RXFA 2QCLA 1GZGA 3U6WA 1H7XA 2X1RA 5EPDA 1HL2A 1YPFA 3C2FA 3KRZA 5G1TA 1PE1A 3GZ3A 3CWNA 4ZMGA 3M9YA 4HN4A 5D2WA 3N19B 1LOSA 2C1HA 4FNTA 2E68A 3CM4A 1O94A 2CLEA 3LOTA 3W7PA 5KITA 1T99A 1QR7A 4X2RA 3LXBA 4TO8A 3W1XA 2V5BA 1LM1A 4E0CA 3NA8A 4LNYA 1KFLA 5D37A 5EA9A 2GVLA 5D33A 5EY5A 4EOUA 4NX5A 5EL1A 2VFIA 2FFCA 1FDZA 1ME7A 1VZWA 2CLFA 2V9DA 2AAMA 1RVGA 4BI5A 2EKCA 1GG1A 1ME8A 3LCLA 4FIRA 4RV8A 3W2KA 4DO6A 3LTPA 4UTTC 3DFQA 3C2RA 4MPQA 1EIXA 1P1XA 1YTKA 1OX4B 2BXVA 3IIVA 1VHCA 5C54A 5LGZA 1XCFA 1LRNA 3KAOA 2DZUA 4OGZA 4OV9A 5U7SA 4PCFA 4IJBA 4UC5A 2Z2UA 1DBTA 2V8ZA 3IVSA 5CPOA 3W7HA 1E51A 2RDTA 1L6YA 2JBMA 1XXXA 4QM1A 3IIPA 2NXGA 1LYXA 5DLCA 3HQ1A 1OFRA 5D32A 3TXZA 1PCWA 1LROA 2QCDB 3GKAA 4JTHA 4CCEA 1OX4A 4H3DA 1CW2A 2YZRA 1Q6RA 3L0GA 4ZVJA 1OVDA 4RK8A 3T4CA 3DI1A 4JIPA 2ZRZA 3NQ6A 3WJXA 5F2GA 5IM51 2D73A 2QCGA 1F76A 5SWUA 4O4WA 5DN1A 4M19A 3C6CA 4LC6A 3NVTA 1WDWA 1RR2A 1Y0EA 2H3BA 4QITA 2A5HA 3VNDA 4XBKA 4Z08A 3FIGA 1JJKA 5CSRA 1KFCA 5BW6A 5I3GA 3ZR4A 2QCDA 4UTTA 5D09A 3L2IA 3NNTA 5G2HA 2RDWA 3TXVA 1FWWA 1TQXA 4IX0A 4LW7A 1EUAA 4EVZA 2W79A 2QJIA 2PRMA 3S42A 3W70A 1NF7A 1OYBA 2Y62A 3EX3A 3Q58A 4ZL1A 1H1YA 4POCA 4UNKA 1VPXA 2EF9A 3QF0A 4A3UA 2DU2A 1VR6A 1PL9A 3W7MA 1CI1A 3NQFA 3RK8A 4NQ1A 4MKNA 4WXYA 1CX9A 1LLWA 3UY8A 3S5OA 3DGRA 1XUZA 4UFKA 4O54A 4I7WA 1SR9A 4QNEA 1KFJA 4DQWA 5H91A 4K7YA 4O1CA 4Z1CA 2QCCA 5HINA 5BMXA 4DELA 5FEWA 4MJMA 4GNJA 4JN6A 3MP3A 4XBSA 3WFAA 1HFBA 1JCLA 1DQWA 2C14A 5K7JA 3B0VC 1OF6A 3V1PA 2FPVA 3MBFA 1XUUA 2BTMA 4NJGA 1TJPA 2CLLA 4UTMA 1UBSA 4GWEA 5CZ0A 3RLUA 5DCBA 3FA5A 3R89A 1M7OA 1OYAA 5EKYA 1GVOA 1SQ7A 2YGYA 2QR6A 3FEMA 1W5PA 2CLOA 3LRLA 4GJ1A 4W9TA 3LTSA 4Y90A 4Z0SA 2X1SA 4CQAA 4BFAA 4KWWA 3IVUA 3O6YX 3OVPA 4UFJA 1DJQA 3VFLA 3ATYA 4ZQRA 5FF0A 1G4TA 4NJHA 3NL5A 4HSOA 1THFD 2XN0A 3RFAA 2OZ0A 3L68A 1T96A 1V7YA 1VHNA 4FX8A 1EX5A 1V5XA 1LBFA 3HIJA 5D38A 3PY2A 3DFNA 4LUJA 4O0KA 5KSWA 2BWGA 3DBPA 3CQ0A 3QMTA 3F4NA 3LBCA 4FNUA 1B3OA 3W87A 4HNTA 1OFQA 3P7YA 5FEZA 2PC4A 2CW6A 3KRUA 3Q37A 6ALDA 5D2TA 1TPUA 5DELA 3W7GA 2Y7GA 1GPWA 1MEHA 1EUNA 3I68A 3C2VA 3LM7A 3W1AA 1TB3A 3E02A 3MO7A 4UCGA 2YFNA 4Q4KA 4CLMA 1YYAA 3UY7A 5F1VA 3GNDA 2JKPA 1X1OA 3B0UX 4WUIA 4O52A 3LB0A 4GUIA 1L9WA 4JYDA 4O28A 1P0KA 3JR2A 2Y7FA 1SZFA 3Q2DA 2CU0A 3U2OA 1RQBA 4WY0F 4X22A 1ICSA 3D0CA 3UZJA 1QPNA 5F4XA 2B0MA 3GXPA 2NX3A 4A29A 2PCQA 2DJXA 3PUOA 3NQMA 4AMAA 2RFGA 1DL3A 4OU1A 4S2CA 3BGJA 4E2DA 5AFDA 4RKAA 3LRMA 5LSMA 4MZ8A 2H90A 1FWTA 3R8RA 2B7OA 1D3GA 2VFFA 1DOSA 1EB3A 1BWKA 4NUWA 4R7JA 4IPJA 3LLDA 3H54A 3WJYA 3EWWA 3JRKA 3TR2A 1H60A 1W54A 1VRDA 2CFFA 1JUKA 3EKZA 1R46A 4N6EA 3PF3A 2Z6IA 3LI0A 5G4WA 2ABAA 3OBKA 1QAPA 2J9YA 5LNUA 5K9XA 1P4CA 1QNVA 5LNWA 4A21A 3W2JA 1QPRA 4HPXA 1I2RA 5KZMA 1OFBA 3O06A 4DPQA 2YSWA 3MBDA 2NX9A 3BG9A 3JS3A 1TPVA 5F1UA 4K39A 3DFOA 2ZRUA 1W5QA 3LCIA 1Q3NA 5AHLA 4AHPA 3BV4A 4RR4A 5FI8A 2WPBA 1VGAA 4FNPA 3F1QA 3L21A 3PBVA 2GUUA 8TIMA 4LUIA 4L4MA 4IGHA 1OFAA 1GYNA 2VFHA 2Q8ZA 1XBXA 1ZNNA 4BF9A 4GE8A 3CC1A 1M5WA 4WY0B 3N2XA 1KM1A 4FNRA 3EX4A 4GRSA 2VFGA 2X1UA 3W1QA 4NZJA 1J2WA 3LCHA 4Z0JA 3AJXA 3HB9A 3NQDA 5FF3A 1K8XA 3SI9A 3BG3A 3KXQA 2DJLA 1HUVA 1W8SA 3LCWA 2R14A 3A21A 4A2RA 2ALDA 2E1DA 2DZSA 2NWRA 4G1KA 1WA3A 4N6FA 4LVAA 4X9SA 1ZY9A 1FX6A 3NL6A 1ZENA 3E49A 2QCHA 2ZFAA 3BG5A 3FYPA 3GVGA 2Y6ZA 2YR1A 2YDAA 3NPWA 1MEIA 4QSHA 3CIXA 4TR9A 1KBJA 5D2XA 4N2YA 3GAKA 3O8AA 4WY0A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4QQ3A

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