4RK8A

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with dh03a356
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with DH03A356
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 139
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2014-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4rk8A00
2PRMA 2CLIA 5FF7A 1LBMA 3V75A 1GVOA 2E6FA 1Q6RA 3CWOX 2ABBA 3B05A 3FYOA 5D33A 4LNYA 1GYLA 5DN1A 1WOBA 5SWUA 1JCXA 4KWWA 2J24A 3P5YA 2Q3RA 5D09A 1UUOA 4IOTA 4DQWA 4EVZA 1A53A 3KVMA 3TR2A 3P60A 4H6KA 3RFAA 1AW1A 3K30A 3B03A 1ZAIA 5CPNA 1VGAA 2Y89A 3ATYA 3WK1A 1LOSA 1ML1A 1Q6QA 1JRCA 1KTNA 4GUJA 5D05A 3FYPA 4MFEA 3PSWA 2CWNA 3GDTA 5FF2A 3T44A 4LRSA 4K8EA 3G8RA 3L65A 4ZQCA 3WJWA 3HG3A 1FWTA 4DBDA 1GTEA 1MEIA 4JN6A 2CZFA 3LLFA 3LERA 1GQNA 3GR8A 3UYCA 5A8GA 1YXDA 4IX0A 3CQ0A 7TIMA 3T55A 5F1VA 1OFOA 2ZTJA 1W8SA 4POCA 3DFSA 2PRHA 4ADUA 1QO2A 3QH2A 1K8XA 4MJZA 1RQHA 2CLOA 3NL3A 3M5VA 3FIGA 3W88A 1JUBA 3CLMA 1MXSA 3EWUA 4Q32A 2YYTA 2YDAA 1Z44A 4MJMA 2ZZ1A 3GAYA 4WD0A 1G4TA 1KM1A 1KBIA 3HB9A 3SI9A 1X7FA 5HMSA 1BWKA 2W0UA 1UCWA 4LS2A 3OIXA 3TXVA 3W2LA 2QUUA 3G1FA 3PAJA 1K02A 1OK6A 3C61A 4N9DA 4Z0SA 3DKJA 5BMWA 3B8DA 3S1VA 2ZZ3A 3R8RA 1Q6LA 1EUNA 2H3DA 3A5FA 4RV8A 3EWYA 3SGZA 1HTIA 1GVQA 5DY2A 1B4KA 1W1ZA 1WQ5A 3CEPA 2KZHA 4TO8A 2CFFA 4QSHA 2BXVA 4XKYA 4UTJA 3QMSA 5TQLA 3DENA 1S5TA 1EP2A 3TKFA 3TROA 1ZJIA 4AAJA 1XDLA 2X30A 2Y7GA 5HWMA 1VLWA 3ABSA 1ME8A 2J9XA 3INPA 4MKNA 3WJZA 5KZDA 4AF0A 3G1VA 3FKRA 1G6CA 2YGYA 3ANYA 3A24A 3BK0A 3PG9A 5CPOA 4EIVA 4JYFA 1VPXA 3KRZA 1J4EA 1GTHA 3T78A 1FUYA 1B57A 3EWWA 1SSGA 1FWWA 2XN2A 1WX0A 3L2IA 2DZTA 2H90A 1S5WA 1J5TA 1QPRA 2C1HA 4O19A 1H7RA 1TMHA 1SW0A 2CLKA 3S8HA 1KV5A 2CZDA 1P0KA 3SZ8A 1Q6OA 1XXXA 3CU2A 2AQWA 2YSWA 4EWND 2H3BA 1RPXA 1A5AA 2QDHA 1BEUA 3N2MA 1MEHA 1OJXA 2XN1A 4LUJA 5D2WA 4CQ8A 1A5BA 4Q33A 4LY8A 3LCGA 3NPWA 1H61A 3DFQA 4MZYA 3M1ZA 3RNDA 5D32A 4O16A 4MLJA 4BI7A 1FY6A 1PIIA 2NX1A 2VEIA 2HSAA 1TQJA 5K9DA 3S5NA 1R2TA 3JS3A 1OFEA 4PA8A 4Y6GA 5CZTA 1F7BA 3VKJA 4OV4A 3NPVA 3GNDA 3KFTA 1O4UA 1H1ZA 2E6AA 4XWUA 1XBZA 1NAL1 3PB0A 2QEZA 3L5AA 3T4CA 3ABOA 3G24A 1DHPA 1I2OA 2QUTA 4CQAA 4FNSA 1N8FA 2Y7DA 4UTTC 4IXXA 1AL7A 3IVUA 3C52A 3TJLA 3QQ1A 4A2RA 3FJ6A 3BG3A 5LHFA 3MMTA 1IXOA 2OT0A 4RZ6A 3W2MA 3M41A 1TCDA 5AB3A 3ZFHA 3EXTA 1XL9A 4O18A 3HJZA 1A50A 1QCWA 3W7OA 1LZOA 1X6UA 3MYPA 5BNKA 4MZ1A 4R7JA 3CT7A 3USBA 3A21A 1EWEA 3W1XA 1QOPA 2WV8A 3W6YA 3YPIA 8TIMA 2WSYA 3S0CA 1X1ZA 5CG7A 4Z0JA 3EWZA 2A7RA 3O16A 3GYEA 4UTIA 4DO4A 3O05A 3LM7A 2O7SA 3NZ1A 1Q45A 1KW1A 1EP3A 2ZDRA 1TPUA 1W56A 3LLDA 4RZ5A 1OYCA 3G3MA 1TJRA 4LWWA 1AK5A 1TV8A 5E0KA 4WJEA 3PS7A 3MBFA 4PTNA 4HNUA 1SSDA 2DJXA 4JX6A 4LC6A 5FF4A 3AO0A 3LTSA 4ADSA 1QPQA 3W73A 1GJPA 1O5XA 4NXSA 5DBTA 3C0JA 6TIMA 4JEQA 1H7XA 4U4MA 2GQ8A 1TRDA 2A2IA 2WSQA 3GXPA 3NQ7A 3S42A 1OVDA 2CZEA 5BMXA 3H54A 3QMTA 4EOUA 5D30A 1UBSA 3G1YA 1UASA 1KTBA 1YDVA 3KOFA 4UNLA 4I7WA 4M6PA 4JTJA 3SECA 3HBLA 3UZJA 4IMCA 1LBFA 3VFLA 2WQPA 3PSVA 3QPZA 4TX9A 1TTJA 3LRMA 3TK7A 4OWGA 3TAKA 3WJXA 4PODA 3ATZA 2VXNA 3LTYA 3AJXA 4GUFA 1VH7A 4B5NA 5BW6A 4C1KA 4ZL1A 2CU0A 3ZR4A 5I3JA 2C13A 1R46A 5HWJA 3C2EA 1LCOA 5EPDA 3B06A 3WJSA 4KKXA 1TPH1 4N2YA 3C2RA 2H8XA 2QCHA 3HG2A 3OVPA 1PHWA 2A85A 4UMAA 4JIQA 1CX9A 3SR7A 3QJAA 5D2VA 1EB3A 4NX0A 3C2VA 1XKYA 4K39A 4O1BA 4WOZA 4X3ZA 3P67A 4FO4A 5KTLA 5J5RA 3W07A 1ICQA 1G4EA 4RX0A 4AXKA 4UTKA 2TPSA 2Y88A 4G1KA 1TPWA 3QRHA 3C4UA 3UWWA 3JRKA 4OU1A 3M43A 4I9AA 4AHPA 2V9DA 4JYDA 3NQFA 4ZQNA 1H51A 3P84A 5HQEA 1KFBA 1N7KA 3MI3A 4Z1CA 2A5HA 4RLIA 4FB7A 5AHLA 2ATMA 1ZAJA 3QMRA 4NJHA 4NUWA 4ZZ9A 3NA8A 4FNTA 2P1FA 4JXCA 5TBOA 3TSDA 1OFQA 1YDOA 3KVJA 1OFPA 2Z2UA 5AYYA 2ZZ4A 5C5YA 3I6RA 1JCMP 1JR1A 3W7NA 3HG4A 2C3ZA 3ABQA 4MZ8A 1UUMA 3RF9A 3UPBA 1Z42A 4GRSA 4U28A 2GVJA 2HS8A 2QJHA 1I4NA 1TSIA 4O1AA 2BSLA 4FXRA 3W7RA 3LHUA 4CNOA 1SO3A 5AYXA 2QDGA 1F6PA 4M6VA 4MY8A 5AOUA 1OX4B 3NOEA 5AFDA 2Y85A 1XUUA 1H7NA 1N55A 2UV8G 4KFOA 4K8HA 5CPLA 2P10A 5KINA 4IGHA 2NXHA 4RXFA 3UZ5A 4JTLA 1T0OA 1M7PA 5F4SA 2VFDA 2E6YA 1Q3NA 4H4IA 1EPXA 3MJYA 4NXKA 1UB3A 2I14A 2ABAA 1B4EA 3UWVA 4O57A 3RLVA 3NQ8A 2GVGA 4QJ1A 4O17A 3EKZA 3M44A 2QAPA 4AH7A 4LVDA 3IIXA 1NSJA 5K9CA 2FDSA 1B3OA 1XBVA 1SFLA 1LOLA 2ZRVA 2DJLA 3OG3A 1WBJA 5EY5A 3L5LA 3EX4A 5G4EA 4MYXA 5D03A 4IWWA 5K2ZA 2P0OA 1LLZA 2J27A 1W3NA 1WYIA 1PV8A 3L0NA 1RV8A 3CIXA 1DBTA 1JRBA 3LRKA 3W2NA 5BRBA 1SW3A 3NL2A 4MY1A 1HL2A 3HGJA 3NL5A 3B0VC 3LCHA 4RCXA 4ICNA 1YADA 5BOOA 1QOQA 3LI0A 3UWQA 1W5MA 4UMCA 4ADTA 1VLIA 3CB8A 1DL3A 3LB0A 3W1LA 3OBKA 4LT9A 1LOQA 1LDCA 4JTEA 3U6WA 4N9EA 4NVTA 1R2RA 3W23A 1KFCA 3W76A 1WXJA 1VYPX 5CPMA 3STCA 5FEXA 2ZCGA 3E96A 4JGDA 1SR9A 1FX6A 2OJPA 2E6DA 3EXSA 1B9BA 4NJGA 1EP1A 4PFMA 3LCIA 3NQMA 3I7SA 3NQGA 1JQXA 5LSMA 3GVGA 2LLEA 2W6RA 1R47A 4MIMA 3EWBX 4FNQA 2E09A 5CZ0A 1DQWA 2Y61A 3BG5A 4LW7A 2TYSA 4QIUA 4PH6A 3P7YA 4JTTA 5LNUA 3LHZA 2ZZ7A 4JNMA 2QF7A 4PCFA 5AHEA 4UTMA 2WKJA 2X2GA 3NAVA 3LX9A 4Y9AA 4E0CA 3GLCA 3DAQA 3L0GA 4H3DA 4M5PA 4DBEA 3KAOA 1M5WA 4FX8A 3TUUA 5CKSA 3CM4A 4CNPA 3KRSA 2VC6A 3FFSA 4O10A 2W79A 5D2TA 3NDOA 5I3GA 5HUOA 2OZ0A 3VE7A 1J2WA 1W0MA 1QO5A 3DGRA 1T96A 1DORA 3GXNA 3E9AA 4Z1DA 3N34A 5FEZA 4HHPA 1OF6A 1F5ZA 2NLIA 1ZFJA 3DI0A 2OX1A 2ZZ5A 3S9YA 2C14A 1L2UA 2EGZA 2Y7FA 4MYAA 1XBXA 4A3UA 4DF0A 5D37A 2YYUA 4IMDA 2V2CA 4QAIA 3A23A 4Y96A 3CEUA 3WJYA 2G5WA 1H63A 3W7GA 3L21A 1WV2A 5CZJA 3B4UA 2QCGA 3W22A 3DFPA 2OCZA 2QKFA 3M5YA 4WX2A 1XDMA 1KFLA 3ZWSA 4JIPA 1WOAA 2E68A 2Y63A 3NM3A 4O12A 3W85A 4DPQA 4ZMGA 1HO1A 3M7WA 1OX4A 3KRUA 3UXDA 2XN0A 4K38A 1BTMA 3QW3A 3S6DA 3STFA 5G1TA 2C0AA 3G1SA 3TIMA 2V81A 3IEBA 1EA0A 4GJ1A 2YFNA 4HSNA 1FWNA 3LI1A 2B0MA 4GNJA 2WPBA 3O63A 5FEPA 4X2RA 3CTLA 2QJIA 4S2BA 3E12A 2CLHA 4DXVA 3TNOA 4TIMA 4AWTA 1XFBA 4JR5A 3DKLA 3W7HA 1P4CA 3PUDA 3MYOA 3W9ZA 2QCLA 3O6DA 1VZWA 4UTLA 3SIZA 1MEWA 4NNBA 1PHQA 5AHIA 1OFBA 4MUZA 3LV6A 4LV9A 4AEOA 2A21A 1SO4A 2GJNA 2FJKA 4IMGA 3THAA 1GZGA 5LNVA 4FEZA 5D02A 1DKWA 2NUXA 3W2KA 1OFAA 4N02A 3DHDA 4TU1A 5HNRA 3BLIA 3R2GA 1QFEA 1ZALA 3LV5A 4O14A 1CW2A 3HPXA 2R14A 4M7TA 1SW7A 2BTMA 1KV8A 2WNZA 1SPQA 5KITA 4YCOA 3QQ0A 1FCUA 1LP6A 1W5OA 4MLRA 4LU0A 3EEGA 3L9CA 4ZQPA 1ZENA 4UCGA 1C29A 1W31A 1ALDA 1O60A 1VCFA 5EYWA 1FXQA 4W9TA 5LZLA 1GWJA 1ZAHA 2JKAA 1ZHAA 3LCFA 3S1UA 4DEFA 1IGSA 1F6KA 2AAMA 4DELA 5DY3A 2C16A 5DXYA 1YDNA 3RK8A 3EX2A 2CLMA 3LDVA 2OT1A 2ZQ0A 4UTHA 2E77A 3OHIA 5DLCA 3B04A 1KFEA 1G7UA 3N9RA 3TXZA 2GPTA 2EHHA 5MHBA 5K7JA 1KM6A 4OT7A 4EF9A 2OMAA 4N9BA 2FPTA 3TC7A 3O07A 4N4PA 3G1HA 3PULA 3UWUA 3V1PA 1KM2A 5AYZA 5J5DA 1OHLA 2RFGA 3NQCA 3IIOA 4OQVA 3PC0A 4KFNA 4TMCA 1DOSA 3W7JA 3DXIA 3N3MA 4RZ4A 3NL6A 3HQ1A 4IXHA 4GFSA 3GDRA 4WUIA 4LS0A 4JDYA 2HS6A 3NR0A 4YXGA 3IGSA 3GIYA 1LYXA 5CGQA 3CPRA 2ZTKA 1GVSA 4OBTA 2JGYA 1FBAA 2XFWA 5HJLA 5L9FA 3PF3A 1H1YA 4O53A 2ZRWA 3IVSA 2ZFAA 4LVGA 1FXPA 4GUIA 1P1XA 1KM0A 1JQVA 1TPB1 3STEA 1QAPA 5TIMA 4FX6M 2WO5A 1LRTA 1EX5A 1NVMA 3SJ3A 4N6FA 3IIVA 3P82A 4FIQA 3NG3A 1RD5A 3BVJA 1VHNA 2ZRUA 3GAKA 3R5EA 5DBUA 1TPDA 5EMUA 4PL1A 3B0PA 3GK0A 1F73A 4P2VA 1EUAA 3NQ2A 5FI8A 1OABA 5EBUA 3WK3A 1MZHA 4O0ZA 3PG8A 3CHVA 3UD6A 2GQAA 1ICSA 2I1OA 5K4XA 4DO6A 5C6MA 2GVLA 2H6RA 4HPJA 3IIPA 3N14A 1S3HA 1R30A 4IPIA 2DORA 1TTPA 3DFNA 4FX7A 1O5KA 2QCMA 1LRNA 1H7OA 3MWAA 1BKSA 3MHFA 1TRIA 3CWNA 2BLEA 4JYEA 3W71A 2I9EA 2NX9A 1GG0A 3KHJA 4HN4A 1YPIA 4C1LA 5F4WA 1NFBA 3PM6A 4NJJA 2Z6JA 4ORIA 5HUPA 5EA9A 3P81A 1KTCA 3R13A 1FCQA 1H50A 5IBXC 1GG1A 3NQ6A 1H62A 3S5ZA 3Q94A 4JY8A 5KSWA 1S5VA 2EPHA 5I3IA 3LBCA 1H7WA 3F4NA 4TR9A 1IXQA 2HMCA 3TW7A 3LCXA 2RDWA 3TH6A 2FPVA 1U83A 4Z08A 4OHQA 4PL2A 5L6UA 4JICA 3STGA 3GXTA 3TMLA 3DU0A 5I3HA 1SU5A 2V2HA 2ZBTA 1L6WA 3HO8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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