4RR4A

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with dh03a367
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with DH03A367
rcsb
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
total genus 137
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2014-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4rr4A00
3PC0A 4A22A 3UZ5A 3GKAA 1ZCOA 2YYTA 2Y7DA 5CZTA 5HMSA 1VH7A 1R2SA 4E0CA 1LZOA 3P80A 3HG3A 3W75A 1T96A 2OZ0A 4RLIA 3LCLA 4UIOA 5AOUA 2ATSA 3ZWTA 4S1FA 5E93A 4IMFA 3OBKA 3P67A 2QCDB 4MY1A 2CZEA 3EWWA 5BW6A 2J88A 4JTJA 1X7FA 5C54A 4OV4A 4M6QA 4UXDA 1LCOA 1SPQA 2C18A 2GJNA 3DFSA 2AAMA 2ZRXA 5KZEA 3LI1A 3TX9A 4RR4A 2V8ZA 2KZHA 1H7XA 2QJGA 4WY0A 3W71A 1W0MA 3MI2A 3NM1A 2Y7GA 2YW3A 2OX1A 3G3MA 4UTTC 1K03A 3DU0A 3SGZA 2X1SA 4MJMA 3I65A 1F5ZA 4ZQPA 5HR7A 2PC4A 3NQ6A 2Q8ZA 4MVAA 1G7VA 3C2OA 3RLUA 3JS3A 1KM6A 2W6RA 4FIQA 4IMGA 3LBCA 3LTYA 3MBDA 3A22A 2PCQA 2QJHA 1K02A 3HMJG 4CNPA 3UWVA 1LRTA 2GVGA 5D09A 3O06A 2ZZ5A 3LERA 1QNVA 1X1OA 4O50A 4O1DA 2GVJA 1UJPA 3BGGA 1OK4A 4O18A 2JKPA 1JCJA 2NV2A 5K9XA 1XDLA 3UWQA 2VFHA 1F2JA 4ZMGA 1YYAA 3G18A 1GVOA 4OWGA 3HGSA 4O1BA 3W7PA 1DOSA 4Y90A 2YXGA 2WOQA 1BTMA 1SUXA 1N8FA 4A29A 4EVZA 4HPXA 4LVDA 4ZQNA 4IWWA 3G1FA 3DFPA 1IXPA 4TMBA 3I7QA 1MEWA 3NL5A 4WQ6A 3T55A 4LUJA 3GIYA 2NZLA 1Z41A 4Z1AA 3DZ1A 1CX9A 2FB3A 4TR9A 1W3TA 3M5XA 1UUMA 3FIGA 2VFEA 3SSJA 3G1DA 1OG0A 3CM4A 2A5HA 3DH7A 4GUFA 3R13A 1PCKA 2QCHA 1LM1A 1KW1A 1PS9A 2I1OA 4UTUA 4PFMA 4JGDA 4DO6A 2CLIA 3PUEA 3VE9A 3W1XA 3S8HA 4AF0B 2G95A 4Q32A 4W9TA 4UFKA 2NX9A 3M5ZA 1OYBA 1A5CA 5AC8A 1YXDA 3C4UA 1R2RA 1KV5A 1KFBA 4PCFA 2A2IA 3W87A 2BSLA 4UNKA 1NF0A 4ADUA 2TSYA 1PHWA 1ICSA 2Y89A 2Z6JA 3NYZA 5D30A 2DZWA 1I2QA 4A21A 2NWSA 1SZNA 1G4EA 3W70A 2X1TA 2A7RA 4UFHA 4KFNA 5L9FA 5MHBA 3A9IA 2ZZ6A 4AB4A 1WAUA 3UY7A 3QMSA 4UTHA 4S2CA 3SFKA 3TDFA 4DPQA 3MYOA 4BF9A 1FWSA 1H7WA 5I3FA 3W3OA 1TREA 4RXGA 1RQBA 4ZQRA 3TW6A 2GPTA 3NQVA 4JICA 4GUHA 2CFFA 3LCWA 3QW4B 4JN6A 2R91A 2FLIA 4GC4A 1GWJA 2JK2A 4PC8A 3CLMA 1R47A 2DZTA 1LOQA 1H50A 2Y6ZA 4FXSA 4LUIA 5DBTA 3N9RA 5D32A 3TSDA 5FESA 1W8SA 4XZ9A 1W31A 3EWXA 8TIMA 3TC7A 4JTSA 1TCDA 4MZ8A 1NAL1 5AHFA 1UASA 4K8HA 1FDJA 3P81A 2WO5A 1IGSA 2NUWA 2E5DA 1AMKA 4LV4A 3DFQA 4OU1A 4WOZA 2VFIA 1OHLA 4UFLA 5D03A 5LKYA 3HPSA 4UTMA 3G22A 1X6UA 4YL2A 3UPBA 1DHPA 1TV8A 1P1XA 3LXCA 3N73A 3NG3A 5FF0A 3AJXA 1K3UA 5AN7A 1RQEA 3TQ0A 1QPRA 5FF4A 3THAA 2TMDA 2CZ5A 2WNZA 4UFJA 1JUBA 3STFA 4IGHA 3O63A 3QPZA 2YDAA 4O16A 2ATMA 5F2IA 2EPHA 2ABBA 3UY8A 3OG3A 3PUDA 3W83A 1EP1A 1VCGA 3R89A 1JUEA 3RNDA 4JTEA 2FPVA 1H1ZA 1K7EA 1XM3A 3QSTA 4IMCA 3STGA 3T78A 3HIJA 1O95A 4NUWA 5LNVA 2VFFA 1QCWA 3W2MA 3W7RA 1VYPX 3W23A 3B0VC 5HR6A 1QMLA 3MHUA 4HNVA 2CZFA 1F73A 1I2RA 1W5MA 2J27A 2TPSA 5FEXA 3W7MA 5DBUA 1HFBA 1FWNA 4JYEA 3CPRA 3N14A 1SZGA 3HPZA 3NGJA 4Y9AA 4QNWA 2NUYA 4PL1A 3S5YA 4AWUA 1OFPA 3P5YA 4QQ3A 3LHYA 4R53A 3P60A 4O13A 5BRBA 2D73A 5D2TA 1DJNA 3NL2A 1FCVA 3C52A 3F03K 4Q4KA 1LRNA 3TCEA 1FCBA 4NVTA 4CQAA 3CEUA 3NO5A 2BXVA 3L2IA 5G4EA 5H91A 1TPH1 2Z2UA 4LS0A 4O0ZA 3FA5A 2WSRA 1N55A 4FNPA 5HUPA 1YXCA 3W1LA 1R30A 4HNTA 3O16A 3HB9A 1XBVA 3W84A 3PBUA 5IBXA 1B57A 3DFTA 4UFMA 1H7OA 2E5CA 1YTDA 3SJ3A 4I9AA 1PE1A 4IMEA 1RPXA 2GVLA 2ISWA 3UWYA 5AC6A 2ZRZA 3EX4A 2NLIA 4IJBA 1VGAA 1XL9A 4UTJA 2O7QA 1EEPA 4QSHA 1U5JA 1VCFA 2P1FA 4K38A 1G4SA 1O4UA 3V1PA 2YFNA 3UYCA 2CLEA 2HMCA 4XBKA 3W7QA 1ZFJA 1CI1A 3DKLA 4NZJA 3LCGA 4BI5A 1XCFA 1WOAA 3LV5A 4X9SA 1S5WA 3F4WA 2ZZ7A 1ML1A 1DJQA 5I3JA 4XWUA 4CNOA 3G1AA 4M7SA 3NQGA 2Y63A 5LGZA 1OFAA 3UPWA 1A53A 4XTIA 4NJIA 2Y62A 3ELFA 3NQDA 1WYIA 4JX4A 1YPFA 4QM1A 4LVAA 1BKSA 1J4EA 4UTWA 3HBLA 3DHDA 3NXFA 3BVJA 5F1UA 1TPUA 5HWMA 3W1MA 2V5LA 3L9CA 2WKJA 1ADOA 2VFDA 3HGOA 1DKWA 2R14A 1YPIA 4PEKA 2V5BA 4JYFA 1P0KA 4G1KA 3MI3A 1Z48A 5GVJA 1LDCA 4RK8A 2Q8LA 3BLFA 4DF2A 2B7QA 1IIGA 1WX0A 3TAKA 1KFKA 2A4AA 2WQPA 5CPOA 2E6FA 3VI2A 1XI3A 2WNQA 1WXJA 2WV8A 3CIXA 1NFBA 4NNAA 1W54A 4RZ4A 1SFLA 1QFEA 3LI0A 1YDNA 5A5WA 1IXOA 2ZZ1A 4NNBA 4C1LA 5HNRA 4WY0B 2E68A 1PV8A 3DGRA 2NWRA 4CCCA 3KVKA 1TSIA 3HG4A 4BI6A 3LTSA 1TPVA 4AHOA 1JVNA 1KBIA 3TR2A 1G4TA 3G3DA 3H53A 3L68A 1MO0A 3NVTA 4L4MA 4HSNA 4AHQA 3M44A 3W22A 1XFBA 4PTNA 4LW7A 3FLUA 4MZYA 4WJEA 1V7YA 4O1AA 4O57A 1LBFA 4M6PA 4D2JA 4LC6A 3S5NA 1WV2A 3TE9A 5EL1A 5L6UA 1VC4A 4K6AA 3P62A 4RKAA 2FDSA 3HF3A 1SSGA 3RU6A 3BG5A 3HGRA 3C0JA 3MO7A 1EPXA 4GWEA 4NJHA 1V5XA 4FXRA 2CW6A 3G0UA 4H4IA 4ADSA 3ZWSA 4NXKA 3G1YA 4HPJA 1THFD 3NA8A 4OE7A 3IIZA 3PSWA 5AHNA 3WK0A 4YCPA 1LYXA 2YCEA 3ZFHA 3NQEA 1JRCA 3FYOA 4TIMA 5K9CA 3TXVA 1N7KA 4EOUA 4H6KA 1LTDA 4YLWA 4BK9A 4OT7A 1KFJA 1NF7A 1CW2A 3H54A 1BWKA 3N19B 1VPXA 2J6XA 1HO4A 2QCGA 5FF3A 3MYPA 2V82A 2DZUA 3QH2A 3QZEA 3LB0A 3EX2A 2ZQ0A 3G0XA 5AHMA 3TV8A 3IGSA 3Q58A 5AHLA 1XBZA 3DENA 2FFCA 1TPB1 1XUUA 3N3MA 2V81A 5DY2A 3C3NA 4IXXA 3G8RA 1FBAA 1TPC1 4K7YA 1U83A 3TIMA 5ABTA 3PF3A 1D3HA 1H7RA 3BG3A 2X1UA 1WQ5A 1OFOA 2GOUA 3G1XA 3STEA 3W7HA 3PY2A 4E2BA 1LOSA 2AQWA 2ZTKA 3G0SA 5I3HA 3L0GA 4RZ6A 3W2LA 1G69A 3ABSA 2QF7A 1JULA 5F1VA 4ALDA 3PUOA 5G5IA 3DHFA 4JTGA 1AK5A 1QPQA 1VHCA 2P10A 3LX9A 1F74A 1VLIA 4OQVA 4Y96A 4TX9A 3NQ7A 4LVFA 4GE8A 3QMRA 3HO8A 1H63A 3EKZA 1EA0A 4BR1A 1Z44A 3AO0A 4POCA 3P61A 1SO6A 4UR8A 2VKZG 1I4NA 2A0NA 1KLYA 2Y61A 3PAJA 4DELA 3S6DA 5EMUA 1MXSA 3N9SA 1FXQA 3NQMA 3M7WA 2ISVA 3GXPA 4P2VA 3M47A 2CLMA 1L6YA 3L21A 3R8RA 1HO1A 1ZJIA 2UV8G 4HN4A 4K8EA 2B7PA 5HJLA 4A2SA 3R12A 2QEZA 1VYRA 5LNUA 5CPMA 1JR1A 3MJYA 1E51A 3M41A 4KFPA 2QDHA 3N2XA 3DFNA 4MUZA 4IXHA 3T40A 3WJYA 3LOTA 1RQHA 1UBSA 1TTIA 4U28A 4K39A 4P61A 1FY6A 4O0KA 4BI7A 2B0MA 4DO5A 3W7NA 2CLFA 5TBOA 3GNNA 4QITA 2C16A 2Y70A 4N02A 2C19A 1F76A 3PSVA 1OABA 4ORMA 2Y88A 1I2PA 2IQTA 1OF8A 4GUGA 1F05A 2A7NA 4QNEA 3KRUA 2G5WA 1YDOA 4HT3A 2VC6A 4R33A 4IPIA 3HGJA 5U4NA 3VKJA 1TPEA 1OX4A 3LLFA 4Z08A 3DKJA 1O5KA 5G1YA 1B3OA 1B4KA 4NX5A 1WBHA 2RDUA 2GUUA 2CLLA 3EX3A 5BOOA 3O15A 3LXBA 3EWUA 1GVSA 2ZYFA 3FKKA 3L65A 4K36A 1SW3A 5AYXA 1KM4A 2BZNA 2WSQA 2FPTA 2H3BA 4R7JA 5TQLA 3LHWA 1RVGA 3WJZA 2ZRVA 4MLJA 3B4UA 1C29A 5C55A 1ZNNA 4PH6A 5E1QA 3U6WA 4MLRA 1QOPA 4Q33A 3L5LA 5KINA 2VELA 3LRLA 1T0OA 2E77A 5CKSA 3TKFA 1YTKA 3YPIA 3O05A 5DY3A 5KTLA 1OFBA 1OFEA 3TROA 5DXXA 3MP3A 1ALDA 5FEWA 3W07A 1MEIA 1KBJA 3QFEA 3IEBA 4O11A 2Y7EA 1VZWA 1XKYA 2E6YA 3DAQA 2Q3RA 3E96A 1FWWA 2OT1A 4IX2A 4RJEA 2F7FA 3GB6A 5I3KA 1DVJA 2A6NA 3WK2A 1XBYA 1MZHA 3TA6A 4QAIA 3MBFA 1D3GA 1ME8A 3ZS4A 2V30A 3A5VA 2ZDRA 3LV6A 1YLVA 2OMAA 3EX1A 3PG9A 4S2BA 3C61A 3W7EA 3GR8A 2PE4A 2H90A 2YR1A 4UFIA 3S9YA 1DQWA 1RZMA 1FDZA 3NQAA 2E09A 2XN1A 4XBSA 3TU9A 5BMWA 3C8FA 3FKRA 4ICNA 3UWUA 5BMXA 2QDGA 3LM7A 1AW5A 1TPWA 2JKAA 1KFLA 4QISA 1SU5A 4BFAA 3W1RA 4EF9A 1F6PA 3O8AA 1KFCA 4O10A 5DXYA 1XUZA 2QCMA 1A50A 2B4GA 5KZMA 1DL3A 1OX6A 4UUIA 4JS3A 3GAYA 4I7VA 4J9JA 4X22A 4O19A 4GBUA 3IIOA 1GG1A 1K8ZA 3BO9A 3C56A 3UNDA 1T8XA 2JBMA 1G7UA 4JD4A 5G2WA 1TRIA 3NQ8A 1TQXA 5F4SA 1C8VA 5HQEA 1GOXA 1GYNA 4GUJA 1H62A 4AAJA 1I8JA 5K3VA 3TW7A 3EXSA 4HNUA 4GFSA 5AHIA 2ALDA 3GVGA 2G97A 1FQ0A 1ME9A 2NX3A 4OHQA 1GEQA 1EB3A 2GQ8A 5FEZA 1OJXA 4NNCA 4M7TA 4TU1A 3R2GA 2ZZ4A 3W1QA 1JUKA 1QWGA 4MOZA 2JKEA 1LLZA 1SO5A 3SECA 3UWZA 1TTQA 3IV3A 3QF0A 1VR6A 5EKYA 4LV9A 3S1VA 3W7KA 4TMCA 3NPWA 3GDLA 2QAFA 3QMTA 3UQNA 3W73A 4LVGA 3C2RA 4UCGA 3TUUA 4N2YA 2RKXA 4ADTA 2FIQA 3W2KA 3LDVA 3BV4A 1G4PA 3CQ0A 3ABOA 2BWGA 1KM5A 1TQJA 2PRHA 3I7SA 1EWDA 3NQ2A 3P7YA 1GT8A 5K4XA 4DXVA 3B0UX 1G6CA 3O6CA 2HS8A 4N9CA 5LNSA 3TH6A 3W86A 4DPPA 3GX9A 4MZ1A 5K7JA 3Q2DA 4LOCA 2WNNA 2QJIA 2FQIA 3CU2A 2TRSA 3M1ZA 3P84A 5DCBA 3TC6A 1B9BA 3KVJA 1DV7A 2F84A 4RV8A 3WJXA 1GJPA 2X30A 2VXNA 3BLEA 5TIMA 3BG9A 3BARA 5K2ZA 4O17A 1GQNA 3S1XA 4Z1BA 3S1WA 1Q45A 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 4FNS A;  2VEI A;  3SR7 A;  4AMA A;  1K8X A;  2NXH A;  1OYA A;  3B05 A;  1S5V A;  1AG1 O;  3GDT A;  3FFS A;  3KHJ A;  5DN1 A;  5F4X A;  2O7S A;  1TMH A;  2NXI A;  2QAP A;  1LOR A;  1S3H A;  3A24 A;  1JCM P;  2DZV A;  3OVP A;  4JTK A;  3O6Y X;  1WA3 A;  1Z42 A;  5HUO A;  3G8E A;  5D33 A;  1JQX A;  3EWY A;  2FJK A;  2YPI A;  3TJX A;  1EP2 A;  2RDW A;  3G1H A;  2J24 A;  1RV8 A;  2PRL A;  3SZ8 A;  3NZR A;  1WDW A;  2ABA A;  5D05 A;  4BWL A;  4M19 A;  3UWW A;  3LHZ A;  1PVN A;  4O12 A;  3W7C A;  3EEG A;  1LRO A;  5D2X A;  1OYC A;  2AGK A;  3GZ3 A;  4LC8 A;  5LNR A;  1O5X A;  4ZQM A;  1NSJ A;  4XKY B;  3TK7 A;  2A21 A;  2H8X A;  2RH9 A;  2EF9 A;  1KM3 A;  4RX0 A;  4YXG A;  3NOE A;  1VJI A;  1LOL A;  1L6W A;  1IXQ A;  3M16 A;  4N6F A;  3CTL A;  1YXY A;  6TIM A;  3WJW A;  4X2R A;  2CZD A;  3QQ1 A;  4HNN A;  1JCN A;  1KV8 A;  1XDM A;  2QCL A;  3FYP A;  4NT0 A;  4O54 A;  3WK1 A;  4B5N A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4A22 A;  3GKA A;  4HJW A;  4HU4 A;  2BVW A;  1VH7 A;  3L2L A;  3LPF A;  1EF2 A;  3LCL A;  1MQR A;  4F2U A;  4W88 A;  3E0W A;  5DEZ A;  3GH5 A;  2O9O A;  1RK5 A;  3GIP A;  4S1F A;  3OBK A;  3P67 A;  4MY1 A;  2ZXD A;  3APY A;  4UQD A;  1X7F A;  3TN5 A;  2X0Y A;  5LA1 A;  4UXD A;  2CXG A;  2HQA A;  2C18 A;  1NFP A;  4ZA0 A;  4DUW A;  2OZ3 A;  4HCD A;  2HRW A;  2G37 A;  4WY0 A;  3UW6 A;  3HQP A;  1QT1 A;  4PCT A;  2X1S A;  4MJM A;  3I65 A;  4ZQP A;  5FIP A;  1E6R A;  3SUR A;  4A8I A;  4LB4 A;  1SGJ A;  3OOD A;  5FOO A;  5E09 A;  1XQK A;  2YCL A;  1CLX A;  3LBC A;  1S5N A;  3SCS A;  2JAL A;  4CNP A;  4P7Q A;  1Q63 A;  2GVG A;  3VAB A;  4V2X A;  3AIE A;  3E74 A;  4O50 A;  1UJP A;  1A3X A;  3CB3 A;  4R9O A;  2VFH A;  1F2J A;  1B2Y A;  4ZMG A;  3LS9 A;  2J8G A;  4F2B A;  4AX7 A;  1KCZ A;  1S46 A;  4TOQ A;  2YXG A;  1BTM A;  3KM8 A;  3LEN A;  2FGB A;  3RYS A;  3MCN A;  4HPX A;  3G1F A;  4TMB A;  1EA9 C;  3POH A;  1NU5 A;  5FAG A;  1GOM A;  3IJ6 A;  1KFW A;  2NZL A;  3DZ1 A;  5A69 A;  3TW9 A;  4GI9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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