4TMCA

Crystal structure of old yellow enzyme from candida macedoniensis aku4588 complexed with p-hydroxybenzaldehyde
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MSYMNFDPKPLGDTNIFKPIKIGNNELKHRVVMPALTRMRAIAPGNIPNTEWAEEYYRQRSQYPGTLIITEGTFPSAQSGGYPNVPGIWSKEQLAEWKKIFNAIHENKSFVWVQLWVLGRQAWPEVLKKEGLRYDSATDDLYMGEEEKERALKANNPQHGITKEEIKQYIKEYVDAAKKAIDAGADGVQIHSANGYLLNQFLDPISNNRTDEYGGSIENRARFTLEVVDAVVDAVGAERTSIRFSPYGTFGTMSGGENPGIVAQYAYVIGELEKRARAGKRLAFIDLVEPRVTDPFLPEFEKWFKEGTNEFIYSIWKGPVLRVGNYALDPDQATLDSKKPNTLIGYGRSFIANPDLVYRLEKGLPLNKYDRNTFYTFTKEGYTDYPSYEESVAKGYKKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Engineered Old Yellow Enzyme that Enables Efficient Synthesis of (4R,6R)-Actinol in a One-Pot Reduction System
pubmed doi rcsb
molecule keywords Old yellow enzyme
molecule tags Flavoprotein
source organism Kluyveromyces marxianus
total genus 152
structure length 399
sequence length 399
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4tmcA00
4LVFA 3BK0A 2FB3A 3PC0A 3R13A 1I2QA 4S2BA 4LS2A 3EWYA 3M7WA 3HBLA 1Z42A 4GJ1A 4QISA 3UWVA 2QCMA 1Z44A 2VFIA 4HSNA 3DI0A 4UCGA 3W7CA 3ELFA 3ABRA 2R8WA 4I7WA 2NX9A 2I1OA 1YTDA 4HN4A 1OJXA 3T55A 4IWWA 3M47A 3BLIA 1B4KA 1VRDA 5I3KA 5FEZA 2G96A 2FJKA 3PUDA 4CQ8A 2QCLA 2WV8A 4DXVA 3G0XA 3IIPA 4LNYA 3L65A 3FKRA 5A5WA 2LLEA 3L66A 5DXXA 4GUJA 4JEQA 2NXHA 2X1SA 1P0KA 4ZQRA 3NPUA 4LWWA 1TIMA 4N2YA 1E51A 4TX9A 2CW6A 5E0KA 4NJIA 4RK8A 1I2OA 3O05A 1D9EA 2QCEA 1FWNA 3GLCA 3PR2A 1A5AA 2CWNA 3MYOA 4CQ9A 1YYAA 2F84A 4HHPA 3NQMA 1WBHA 1G4SA 4A22A 3W1TA 3ABSA 3DHDA 4GWEA 5AYYA 4WOQA 1X6UA 1YXCA 2ZTJA 4H4IA 4LY8A 2C18A 3GXTA 3NEVA 3TSBA 2Y7FA 3G3MA 2EGZA 2QCNA 2E6AA 3VKJA 3M5XA 1LYXA 4J9JA 4A21A 3O6DA 3W2KA 4LVAA 4GUFA 1KBJA 4KFOA 4OBTA 4JTTA 3EKLA 1QAPA 1G4PA 3PS7A 3P8IA 3UPWA 3AO0A 1TTPA 5DY3A 3F4NA 1OFRA 1V5XA 5I3GA 3TQ0A 2QUUA 1VC4A 4BWLC 4GXMA 4DBEA 4RCXA 2WKJA 4UTUA 4QNWA 3TNOA 4GFSA 1YDVA 1RVGA 1HFBA 4MFDA 2VKZG 1K7FA 1ADOA 5CZSA 3M44A 1C9DA 3FYPA 3Q2DA 3MI3A 3IRDA 3RF9A 4IPIA 2V2CA 4N02A 1W3NA 1XUUA 3W72A 4R34A 3KAOA 5H2ZA 5LNUA 4XQ6A 3LX9A 4MOZA 5DBTA 4O52A 3M16A 2PC4A 1GWJA 3CHVA 4AWSA 2C1HA 3G24A 2E1DA 3N3MA 2QUVA 1W5MA 4FX8A 2H8ZA 1KLYA 4HPXA 3UWUA 2Z0IA 4RR4A 1VLWA 4O0KA 1JCMP 1SFJA 4AB4A 1ME7A 2R91A 3PM6A 1F73A 4X2RA 2VXNA 4TIMA 3TU9A 2X2GA 3CU2A 3PB0A 5HUPA 2E5BA 3TW7A 1YTEA 3LCLA 1LP6A 1DV7A 2QDGA 4U28A 4M7SA 4IMDA 3QH2A 3PULA 1UUOA 3G1HA 2ZZ7A 1XBXA 4UTHA 3DENA 4RXFA 3L5AA 4JTSA 1XCFA 2PE4A 2C15A 4N6FA 2QCFA 3LHWA 1SU5A 2HMCA 4OT7A 1TPEA 1EB3A 3W84A 3G1FA 5LZLA 3GDLA 4GBUA 3W7PA 7TIMA 1P5BA 5F4WA 3LXCA 3DI1A 5CZTA 1UB3A 6TIMA 3USBA 1KLZA 2ISVA 3PSWA 1PIIA 4UFLA 4O50A 2FFCA 1SW7A 1C29A 1TRIA 3G22A 2OCZA 2ZZ4A 3UPBA 1FWTA 2DZPA 3TR2A 1H7XA 3LGEA 2DJLA 3P61A 4KKXA 4LT9A 2DP3A 1X7FA 3G18A 3LCHA 1JULA 5DY2A 3UWYA 2YZRA 1F74A 1TO3A 4JX5A 4MKNA 5BMXA 3E49A 4XWUA 4POCA 1W31A 1S3HA 3EEGA 3IVTA 5HR6A 2HS8A 3IVSA 3LCXA 1SPQA 2ZRXA 3W1PA 3IIVA 1O5XA 3PG9A 3PBYA 1LROA 4MIMA 1ZNNA 5TQLA 5EKYA 2CU0A 4ZQCA 5BOOA 1QO2A 3DBPA 3NQFA 1MZHA 4QM1A 3QPZA 1QR7A 2HTMA 1SR9A 1GJPA 1H62A 2ABBA 1EX5A 1OVDA 3A21A 1DORA 3ZS4A 3IVUA 3PF3A 3ZWSA 1BKSA 5EYWA 3KRZA 4AAJA 1K7XA 3SZ8A 2DZVA 1SZNA 3KVLA 1QPRA 4IX2A 5DELA 1EUNA 3CB8A 4YLWA 1KM2A 1PV8A 5DLCA 3M9YA 2AQWA 1UCWA 4LOCA 1YXYA 4TU1A 1I2PA 1JUBA 3L0NA 5TIMA 4AVFA 3ZR4A 2QR6A 1ZALA 3E12A 4M19A 3PUOA 4S1FA 3E96A 3K30A 3NQ8A 4FIQA 3VNDA 1KV8A 3QYQA 4AHOA 3DFPA 5LSMA 3HQ1A 4O19A 1I8JA 4E2BA 4WUIA 4JNMA 4FX6M 3GXNA 2ZA1A 3UY8A 3NQ2A 2Q3OA 1KW1A 2GVGA 1JCLA 1YTKA 2ISWA 1OYBA 3H53A 1HG3A 3NQEA 3M5ZA 5D2VA 2YDAA 4OV9A 5K7JA 3W1QA 3GKAA 1EIXA 2J6XA 4NNAA 5C2XA 3TX9A 3W7DA 1VQTA 4WJEA 1OX6A 3HG2A 2QKFA 4QJ1A 4N4QA 3JR2A 1WOAA 1TJRA 3T4CA 3G8RA 4O16A 4OGZA 4B5NA 2P10A 4CLMA 4FXSA 4JTJA 2E09A 1JCYA 3GAYA 3MP5A 4LU0A 2WNQA 3LB0A 4XZ9A 4O28A 2ZRZA 3ANYA 3NQ6A 3DKLA 3P81A 2CLKA 4ZQPA 1N8FA 4GE8A 3GR8A 3B8DA 1FDJA 2FLIA 4AF0B 3QMRA 2G97A 3CLMA 4YCOA 4DO5A 3KXQA 3GAKA 4Z1AA 3MI2A 4OE7A 2TRSA 4NZJA 2XFWA 3R5EA 1ALDA 3TROA 4WOZA 4RZ6A 4HNNA 3QJAA 4O1BA 1OF8A 2J24A 2RH9A 2VEMA 5D30A 3C3NA 4JY8A 4GNJA 5E93A 1ME9A 3W1LA 4O12A 1XM3A 3MUXA 2X1RA 3B05A 1H5YA 4IQLA 2DZUA 4ALDA 1SUXA 4MFEA 3HF3A 3KVJA 2J9ZA 4L4LA 1GG1A 1ZY9A 3C2FA 3HGJA 2VFGA 2C6QA 4BWLA 3UZJA 1EWDA 1YPIA 1QCWA 2A0NA 4AEOA 1WBJA 2E6YA 1BWKA 3A22A 3MMTA 2BX7A 4FB7A 1DL3A 4NXSA 1OFBA 5TBOA 3LRMA 1KTBA 3W7IA 2NX1A 1QPNA 4UFMA 3C52A 1H51A 2V82A 3SI9A 2GVJA 4LTSA 4N9DA 1RV8A 2EAWA 3G1SA 4A2SA 1R2TA 4OV4A 3W85A 4IMGA 3NQDA 4FX7A 3PVFA 1RPXA 5G1YA 1OK6A 3BGGA 3P62A 4K38A 1Q6LA 2FIQA 4XBKA 1EP3A 3I65A 2TSYA 1F6KA 2YYTA 3KOFA 4I9AA 3B0VC 2JKEA 2QF7A 4OWGA 4H6KA 3T40A 4IJBA 4UNKA 1W37A 3UQNA 4UMBA 3G1AA 2A7RA 3MP4A 4WX2A 3O8AA 4RZ5A 1W5PA 3I7SA 4JTGA 4AF0A 2FB2A 2OZ0A 3TAKA 3CEUA 3MJYA 4I7VA 1X8FA 1ZENA 3I68A 1DJNA 2OMAA 3WJWA 2ATSA 1M5WA 1QNVA 2HS6A 1ML1A 1FCQA 2Z6JA 1OHLA 4LS1A 4O4VA 5D33A 2RKXA 3NZRA 2YCEA 1DOSA 2YXGA 3TV8A 2X1TA 4UIOA 3OEXA 3FIGA 3PWAA 1AL8A 3PY2A 3MHFA 4UNLA 1BTMA 3B03A 2B0MA 4LVGA 4N6EA 4UTTC 3TXVA 4MVAA 5AHEA 4Q4KA 3UD6A 3W7LA 3WJSA 2BXVA 3NQCA 1IIHA 2YPIA 3LDVA 1OYAA 1I2RA 4X22A 2DZTA 5AC6A 4O11A 3WJXA 1GG0A 1W5OA 4O57A 1Z48A 2ZQ0A 2UV8G 3DFQA 2C13A 4JX4A 2TYSA 3HG4A 3NPWA 1PCWA 3QSTA 1TB3A 2OX1A 2FTPA 1X1ZA 2Y85A 1O94A 4FNPA 4BF9A 3TCEA 3WJYA 1MEWA 4JTLA 1GVSA 3BW3A 3UXDA 3GIYA 3WFAA 3W7MA 3S1XA 1LBFA 1KFJA 4QAIA 1ZAIA 1SQ7A 3DAQA 4FEZA 5LHFA 3EX4A 5ABTA 1TTJA 1DVJA 4QIUA 5K3VA 2I14A 4GC4A 2Z6IA 4WY0B 3NPVA 3NA8A 2CLOA 3N19B 4FF7A 4Z0JA 1FCUA 3BG3A 3FKKA 1FWSA 5HJLA 2QCHA 3W7JA 2WSQA 4PTNA 4DELA 1NFBA 5LNVA 1PHQA 3CPRA 1XFBA 1HL2A 5I3HA 3QQ1A 2ZBTA 4WXZA 3OVRA 4E2DA 4LW7A 4UTLA 4OQVA 4K6AA 5FESA 3THQA 4MYAA 3HMJG 2NWRA 4IX0A 4MZYA 3BVJA 3GR7A 3FOKA 3UY7A 1W1ZA 1KA9F 2QUTA 4NT0A 4JGDA 3O6YX 3OA3A 4X9SA 4RJEA 5EY5A 2AGKA 3PSVA 1EPXA 3HG5A 2C14A 4DF0A 4YL2A 3HGRA 5AOUA 3FYOA 4M6PA 4O4WA 3TC6A 4Y8FA 1SO6A 4N9CA 4LV9A 4ADSA 4DO6A 2TPSA 3MP3A 3O16A 5DBUA 2J88A 2JBMA 5FF0A 4ICNA 1ZAJA 4MLRA 1GVRA 3W7HA 5CPLA 1AMKA 5C5YA 2V30A 4PCFA 2O7SA 3HPXA 3C56A 4UR8A 1PE1A 1D3GA 2EPHA 2ZRYA 2TMDA 2ZYFA 3PBUA 1FDZA 5CKSA 3H54A 3W22A 4EIVA 4NQ1A 3C2EA 4NXKA 1TQJA 3FA5A 3DFTA 1GYLA 4UTWC 1I2NA 4JX6A 1FWWA 4DBDA 3THAA 3TH6A 2NX3A 4LVDA 4BFAA 4U4MA 1LRTA 4CQAA 1KTCA 4O15A 4K36A 3LI0A 3Q58A 2GJNA 4DF2A 3G1XA 1F5ZA 2WSRA 3JRKA 3T78A 3HB9A 1T99A 2ZZ1A 3IIXA 3KVKA 1H7WA 5G2IA 3DFOA 4JTUA 3LHVA 4WY0A 1T96A 3CQ0A 5L9FA 1K8ZA 3TQKA 3LI1A 5G2WA 4TR9A 1GPWA 4E38A 3P74A 1B3OA 4JTEA 1TV8A 3O63A 1BEUA 1M6JA 1OABA 5F2IA 1JRBA 4DEFA 3PG8A 1WA3A 5H91A 4LRSA 5FEPA 1D3HA 2ZRWA 3LM7A 3NQ7A 3DFNA 3Q94A 4NUWA 3W2LA 5FF2A 3TJXA 1OK4A 3P5YA 4FIRA 5EA9A 3HOJA 3N2MA 4FNSA 2C3ZA 5D02A 4GUIA 2CLLA 5HWMA 1EP2A 1FCBA 4FXRA 1VHCA 5CG7A 2JKPA 4O53A 2XN1A 3GNDA 1MXSA 4IXXA 4UFHA 1L6YA 3UNDA 4O14A 3TSDA 5LNRA 3A24A 2E5DA 3TMLA 3NYZA 5C54A 4NX0A 5DCEA 3P67A 3A5VA 4Q33A 5KITA 3EWBX 2A1YA 5D38A 3PBWA 4K37A 3IGXA 4ADUA 3S8HA 1NVMA 2A6NA 2V81A 2BLEA 2H6RA 4MY1A 4NNBA 4A2RA 2YW4A 3SGZA 3NXFA 4RZ4A 1JCJA 3LV5A 2W79A 1G7VA 3EWZA 4AHPA 2CZEA 1EUAA 3LBMA 2WNNA 4KFPA 1OFOA 3MHGA 3W7NA 3AJXA 4NZFA 3W9ZA 2Z1BA 4E0CA 1AW1A 2QAFA 4RKAA 2A7PA 4HKPA 4IOTA 1DKWA 1LBLA 4HNTA 5SWUA 3L0KA 3LHTA 1VR6A 3KX6A 4AH7A 3FJ6A 1UBSA 3GNNA 3VE9A 3LTSA 4WQ6A 1VS1A 3P7YA 3FLUA 5CSRA 2R14A 1RQEA 3FS2A 4C1KA 2RDUA 1GVOA 2WO5A 1KV5A 3E9AA 2WNZA 2V2DA 4PL2A 1HTIA 1DJQA 2V2HA 1ZFJA 3SFKA 1KFCA 2NWSA 3G0SA 4JTFA 4D2JA 4EWND 4YXGA 3NDOA 2DU2A 2G95A 1RD5A 1LORA 2JK2A 4N4PA 1TYGA 1Y0EA 4UTTA 3SJ3A 1LCOA 5AYXA 1YDNA 2B4GA 4GRSA 5G4WA 1OFEA 4UTKA 3SW6A 3W86A 3INPA 1VGAA 4EF9A 5EMUA 1OFQA 1S5TA 1JCXA 1LOLA 5LHEA 3NO5A 2I9EA 1W0MA 4P2VA 1YPFA 4PC8A 1H1YA 1R2RA 4LRTA 1OX5A 1JVNA 3UWZA 3CC1A 2Y70A 4AWUA 5T26A 3IGUA 2CLHA 1MO0A 3E0IA 4RXGA 1TSIA 1KM5A 5D32A 4FO4A 4Z1BA 2QJGA 4EF8A 3L5MA 1QWGA 3UWWA 4UXDA 1QFEA 3W70A 5HR7A 1ICPA 1XC4A 4JY9A 1SZEA 3P60A 4MYXA 1FUYA 1NSJA 4ML9A 1ZJIA 1U5JA 3EX2A 1QOQA 2QAPA 1H61A 5AHIA 3GVGA 1OF6A 1Q6OA 2ZZ3A 2QDHA 3EXTA 2J27A 2YR1A 1P0NA 1R47A 3LXBA 4HSOA 5CPNA 1CX9A 1JRCA 3GX9A 4JICA 3L5LA 4ZQNA 4L4MA 3FFSA 5I3JA 3NVTA 5HNRA 3VI2A 4UMAA 3M1ZA 3TK7A 3L21A 3HPZA 1EWEA 4MY8A 5G1TA 2E5CA 3TMQA 5CSSA 2H90A 3C8FA 3F03K 4AWTA 2XN2A 5MHBA 2NLIA 4ONVA 1W3TA 2VC6A 1XBYA 1TPWA 1K7EA 3NQVA 3C2VA 4K7VA 1TPB1 3G1VA 1K8XA 2B7QA 3PAJA 1WAUA 3DZ1A 4HNVA 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 3NL2 A;  1A53 A;  3BPW A;  4UFK A;  1SO4 A;  1G69 A;  1QPQ A;  4W9T A;  1JUK A;  5DCB A;  4IMC A;  3L67 A;  2B7N A;  1SSD A;  4BI5 A;  3NM1 A;  2CFF A;  3HO8 A;  3LCF A;  3C2O A;  3SSJ A;  1XBZ A;  3TUU A;  3DGR A;  1KFK A;  1PVN A;  2WJZ A;  4M7T A;  2EF9 A;  3C61 A;  3F1Q A;  1WOB A;  1IXN A;  5AHM A;  5E1Q A;  4O1D A;  3W7K A;  5BMW A;  3OG3 A;  2DJX A;  1H7R A;  4Z1D A;  3RLU A;  3MYP A;  2E77 A;  3STE A;  3TSM A;  1SFL A;  1CW2 A;  3B04 A;  3E02 A;  1VCF A;  3Q37 A;  1LZO A;  2NXI A;  3IV3 A;  3QQ0 A;  2W0U A;  1TPV A;  2Y7D A;  1L9W A;  5AC7 A;  3W23 A;  5A8G A;  1A5S A;  1ICS A;  1SSG A;  3G0U A;  3W87 A;  1M7O A;  3B0P A;  3SY5 A;  3YPI A;  1VCV A;  1C8V A;  5KTL A;  1ZHA A;  3LXA A;  1LTD A;  4JYF A;  3BAR A;  3TC7 A;  3W7R A;  3M5Y A;  5L6U A;  2FQI A;  1FDY A;  3M6Y A;  2C19 A;  1LOQ A;  2E6F A;  1AG1 O;  2Y6Z A;  2A85 A;  4UUI A;  1NAL 1;  2BWG A;  2VEN A;  3PBV A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IT0 A;  3CHF A;  1XII A;  4LVF A;  2FB3 A;  1YDY A;  4MDO A;  4LS2 A;  1WKY A;  3GC2 A;  2QGY A;  1QU4 A;  1URO A;  3CAQ A;  4DUV A;  3DI0 A;  3W7C A;  6A3H A;  1CGU A;  3BQ5 A;  4LAZ A;  3TYA A;  2OOF A;  4NHV A;  2DGA A;  4IWW A;  5BCA A;  2QDD A;  3MMU A;  3AMG A;  4CD6 A;  3GIQ A;  1B4K A;  1VRD A;  1VIW A;  5IDZ A;  5FEZ A;  2G96 A;  2W66 A;  1XP3 A;  1S2W A;  2A79 A;  3IIP A;  4WJ8 A;  1BD0 A;  4LUS A;  1NU5 A;  3ZZ1 A;  2LLE A;  5DXX A;  1VRX A;  4BQ2 A;  1V3L A;  1DYS A;  2YXX A;  1E51 A;  1RY8 A;  1PIF A;  3WLK X;  2JEP A;  4NJI A;  4DJF A;  2ZE0 A;  4AW7 A;  1J12 A;  1I2O A;  1XYA A;  3RDK A;  4MWA A;  3N2O A;  3UG8 A;  3MY9 A;  3MYO A;  1OCN A;  1EOM A;  4CQ9 A;  1YYA A;  2F84 A;  4XD4 A;  2WM1 A;  4C7G A;  1S2C A;  3NQM A;  1WBH A;  4L7Z A;  1SJB A;  3W1T A;  3DHD A;  2Z26 A;  4GWE A;  3WZ0 E;  1GZ1 A;  1YXC A;  3N6Q A;  2ZXB A;  3QTP A;  1QBA A;  3R4I A;  3GXT A;  4YHE A;  3IJL A;  3L4Z A;  2PDU A;  5BOF A;  3P3B A;  2XGI A;  3GG1 A;  4J9J A;  4GKT A;  3O6D A;  4ZR8 A;  3AMC A; 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