4TMCA

Crystal structure of old yellow enzyme from candida macedoniensis aku4588 complexed with p-hydroxybenzaldehyde
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MSYMNFDPKPLGDTNIFKPIKIGNNELKHRVVMPALTRMRAIAPGNIPNTEWAEEYYRQRSQYPGTLIITEGTFPSAQSGGYPNVPGIWSKEQLAEWKKIFNAIHENKSFVWVQLWVLGRQAWPEVLKKEGLRYDSATDDLYMGEEEKERALKANNPQHGITKEEIKQYIKEYVDAAKKAIDAGADGVQIHSANGYLLNQFLDPISNNRTDEYGGSIENRARFTLEVVDAVVDAVGAERTSIRFSPYGTFGTMSGGENPGIVAQYAYVIGELEKRARAGKRLAFIDLVEPRVTDPFLPEFEKWFKEGTNEFIYSIWKGPVLRVGNYALDPDQATLDSKKPNTLIGYGRSFIANPDLVYRLEKGLPLNKYDRNTFYTFTKEGYTDYPSYEESVAKGYKKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Engineered Old Yellow Enzyme that Enables Efficient Synthesis of (4R,6R)-Actinol in a One-Pot Reduction System
pubmed doi rcsb
molecule keywords Old yellow enzyme
molecule tags Flavoprotein
source organism Kluyveromyces marxianus
total genus 152
structure length 399
sequence length 399
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4tmcA00
4K39A 3C61A 4TO8A 2CLHA 4WUIA 3OBKA 2R14A 2GQ9A 2CU0A 3GDTA 4GRSA 2JK2A 1TPUA 2ALDA 2GJLA 2QKFA 3STGA 4IXHA 5AHLA 4MVAA 3M16A 3NQ7A 4Y9AA 2VFDA 3N9RA 4HHPA 1P5BA 5G2WA 4JD4A 1ZJIA 2CLMA 5LGZA 3PAJA 4NT0A 2QJIA 3QC3A 3W7EA 4HPXA 2W6RA 1LRNA 2G97A 1KA9F 2H3BA 4K8HA 1KFCA 1O94A 3W7NA 3T4CA 5CSRA 2GPTA 1KFLA 2VEIA 3W1TA 5DY2A 1WYIA 1XDMA 2V2DA 3UYCA 1OX5A 4RX0A 2EKCA 2O7QA 1N7KA 2JKPA 4LS1A 5EA9A 4D2JA 3Q37A 1WBHA 3N73A 1EWEA 3P81A 1H1ZA 4TMCA 1XDLA 3PR2A 1VH7A 3S1WA 1WXJA 3PBYA 3T78A 3P62A 3G1AA 3GYEA 4UMCA 1VYSX 2Z2UA 3N2XA 1GEQA 4MFDA 3W9ZA 2HSAA 1VRDA 4NNAA 4H6KA 1QCWA 1G67A 1W3TA 1O60A 4FIRA 5HUOA 4PC8A 4PCFA 1ZAIA 3FS2A 5DCBA 2JKAA 3HG4A 1L6YA 3THAA 4HNVA 3NYZA 2Y7DA 1GYNA 1GVFA 2V5LA 5E1QA 4UFJA 3E02A 1QNVA 2Y7GA 2H6RA 5AHEA 2A7RA 3BW2A 2YGYA 4IX0A 3DFOA 1GZGA 3LRKA 4LW7A 3E96A 1GQNA 5BMXA 2ZRVA 3S5OA 3RK8A 3NQVA 3NQGA 2RKXA 3KX6A 4AWUA 1SW7A 3P67A 3ATYA 4O12A 5E0KA 1VJIA 3DBPA 4MUZA 1PL9A 4O13A 1KV8A 2DORA 3LBCA 4RXGA 3LV6A 3QEZA 3ABSA 3CU2A 4LV9A 2A5HA 4PFMA 4IWWA 4WOQA 1TRIA 3USBA 5G1YA 1MEIA 5G1TA 3JR2A 4WD0A 1AW2A 4RK8A 1P4CA 2QAFA 1WAUA 3QJAA 3L0GA 1KM6A 3S5ZA 2ZZ2A 2VFEA 2VOMA 4O54A 3W7PA 5LNUA 3IIOA 4UNKA 1LDCA 2CZ5A 3MI2A 2X1TA 3VFLA 4FNSA 5TQLA 5MHBA 3P80A 3HPZA 1PVNA 3NQ8A 4WJEA 3F03K 2CZDA 5CPMA 3O6YX 3GR7A 5AHIA 1OYBA 3OEXA 3QQ0A 1GT8A 1TCDA 4PA8A 3NQMA 2VEKA 4WQ6A 3G0SA 5G4EA 1SU5A 2ZZ7A 1KFKA 2DZUA 1GPWA 3NAVA 4ZZ9A 3S9YA 3EX6A 4AEOA 2EGZA 4H3DA 3U2OA 1P0NA 2V2CA 2J6XA 4FNRA 3FJLA 3TNOA 5K9XA 3TC7A 3TMLA 3QFEA 1QFEA 3C52A 4JN6A 1FCUA 4LRSA 1ICSA 1JCYA 3HIJA 4R34A 3TAKA 3SI9A 1X1OA 2FLIA 1LRQA 4JS3A 1FXPA 4UFLA 3W2KA 3TW7A 3MI6A 4OHQA 1W1ZA 5TIMA 1XFBA 1I4NA 1SFJA 4JY9A 3NM3A 4LVBA 1YXCA 1D9EA 3HJZA 3KAOA 5IBXC 3I7RA 1FY6A 4YXGA 1FCBA 2W79A 5HR7A 3TAOA 3M5ZA 2DU2A 1HUVA 4LC8A 4P61A 1WOAA 3WJZA 1EB3A 4JTGA 2D73A 2Q8ZA 1GJPA 4XKYB 1YXYA 3B0PA 2P1FA 2C1HA 2NZLA 2YXGA 4JTUA 4MJZA 1TPDA 1W3NA 5I3IA 5CSSA 4UTMA 2Y88A 3NOEA 4JNMA 4E38A 4GUJA 1J4EA 4AHOA 4UUIA 3A23A 1Q6QA 2J9XA 1DKWA 3MWAA 3LX9A 1YTDA 2CLFA 1AL7A 3R2GA 4LWWA 3W7OA 5EYWA 3G3MA 3CQ0A 1VS1A 1UJPA 1FWWA 3SJ3A 4FIQA 3M7WA 1JJKA 5D33A 2BLEA 3RLVA 3CTLA 1KBIA 4IX2A 4QJ1A 2RHGA 4HPJA 2CWNA 3KXQA 2C3ZA 4ZQMA 3M5YA 1EP2A 4EOUA 4LUIA 4FX6M 3G1HA 2ZRZA 3LHYA 4JX5A 4UMAA 5LNWA 4CCDA 3CPRA 3LB0A 4JTEA 2CFFA 1KM0A 2FIQA 1ZNNA 2NXHA 3U8GA 2R91A 3MBDA 1N8FA 2V82A 3O16A 4XBSA 4I7WA 4IMGA 2JGQA 3BLEA 4C1LA 2E1DA 3B0UX 2DZTA 3BGGA 1JVNA 4NQ1A 3W7IA 2YZRA 2J9ZA 1VYRA 4UFHA 4X22A 2YW3A 4JTTA 4BI6A 1ICPA 1LORA 4Y96A 3HB9A 3ZWSA 3A5VA 2QCMA 4LS2A 3PB2A 2G95A 3C2EA 3HOJA 1E51A 1R2SA 3TROA 3W86A 4QISA 1H5YA 2NX1A 4JYDA 3SGZA 1KLYA 4JTKA 2A1YA 3O63A 4WY0F 4O50A 4O17A 4DF0A 5FI8A 3NM1A 3W1AA 3E9AA 3ELFA 3QZEA 2FTPA 5KZDA 4HIBA 5CKSA 5LKYA 4OQVA 4MJMA 2NV1A 4JTFA 3UXAA 1JRBA 3G1FA 5SWUA 4H4IA 2EHHA 1AW5A 4I9AA 4N02A 3TH6A 3UWUA 1H50A 3EWXA 4KWVA 4LOCA 2NWSA 2TRSA 3W84A 4UMBA 1A5CA 4NUWA 4Z1AA 4ONVA 5K9DA 3CIWA 3TIMA 1XKYA 3NQDA 3PBUA 4HN4A 2B4GA 4DBDA 1SW3A 1W5OA 2CLKA 2NUXA 3W7MA 1GVQA 3BLFA 2V81A 2ISWA 1GG0A 3W7CA 4JYEA 1RVGA 1DOSA 1TSIA 4PTNA 3WJWA 4KFNA 2QDHA 4ZQNA 5D04C 1JUEA 1TB3A 4NZFA 1JQXA 5KINA 4JR5A 1MXSA 1V7YA 1AL8A 2NX9A 2WNQA 2Y6ZA 3IGSA 4ALDA 2GVGA 5H91A 4CNPA 4X9SA 1ZCOA 3TSDA 3GR8A 5HQEA 2DZPA 3R89A 2VFHA 4BK9A 3EX2A 4RXFA 2Y61A 3GAYA 1L6SA 5F4WA 3W7RA 3TW6A 1H51A 3K30A 3TFXA 2CLEA 4PL1A 5D09A 2R94A 2CZEA 1P1XA 3STEA 2FPTA 5CPNA 1EUAA 3STFA 1I2NA 1IXOA 1I45A 4DELA 4MLRA 4K7YA 1XBYA 5HJLA 3W22A 3GNDA 3W7DA 1KM3A 3L65A 4LVFA 2Y63A 3LRLA 3JRKA 1I2RA 1TTPA 3FFSA 1YLVA 3NL5A 3G8RA 1QO2A 3W7QA 1L9WA 2ZZ1A 3IVUA 2NXGA 3P8IA 1L6WA 1ME8A 2PE4A 3W07A 1FUYA 5HR6A 5LZLA 2NUYA 4LS0A 3UD6A 1L2UA 3HG2A 1GWJA 1W3IA 2RDTA 1G4PA 1B4EA 4OT7A 1EPXA 1LBLA 3FLUA 3L68A 1IF2A 2ZTKA 4TU1A 4YWIA 2WPBA 2X30A 1Z44A 1TTJA 1U83A 4NJGA 3SGUA 3S5NA 1DQXA 5L9FA 1IXQA 2HTMA 1QPOA 3HF3A 2A2IA 2Y7EA 1SO3A 1B4KA 4XTDA 1FBAA 3NR0A 4Y6GA 3GXTA 2A7NA 3QSRA 5F2MA 2J88A 2C0AA 3NEVA 1LBMA 2QEZA 1HTIA 1B3OA 1VC4A 1PIIA 1YYAA 1SFLA 1H1YA 8TIMA 5K7JA 3QPZA 5T26A 3RLUA 4JTIA 1DVJA 2FPVA 1TV8A 1KTNA 1KM5A 3IVTA 5KTLA 2PURA 4MY8A 5D2XA 4GUGA 4QNWA 1M7PA 1Q6LA 5I3HA 2HS6A 3W7LA 4OV4A 1F7BA 3BLIA 5KITA 2ZA1A 4RCXA 3NDOA 1ZAJA 3GDKA 5ABTA 2Z1BA 3IVSA 4FX8A 2QR6A 3SZ8A 2VEPA 1HO1A 4IGHA 3L0NA 3LXAA 1KM1A 3LCLA 3P74A 2J27A 4AVFA 3TMQA 2PC4A 3TJLA 3P61A 3NQ6A 2QF7A 2OJPA 1BEUA 1KM2A 5CPOA 1SPQA 4UTJA 3MUXA 1PV8A 1TQXA 4LNYA 2BSLA 3W1MA 2NLIA 1TQJA 1LM1A 4O15A 4GUHA 3FJ6A 1QO5A 2ZZ5A 1Q6OA 1GVRA 5A5WA 4OE7A 3E12A 4CNOA 2QJGA 2V9DA 2ABAA 1DHPA 5CG7A 5D38A 1VCGA 4BR1A 3G22A 4M6QA 4O1DA 4YL2A 1FWTA 5K9CA 2YCEA 2DZVA 5AHFA 2AGKA 3AO0A 3O07A 1J5TA 2OT1A 3I6RA 3W73A 1EEPA 3P5ZA 3QRHA 4QITA 1KV5A 1WBJA 5EMUA 4ZVJA 3EB2A 4ORMA 1TPH1 4Z0JA 2W0UA 1ADOA 3LCIA 1KLZA 1J2WA 3FA5A 3Q2DA 4JX4A 3MJYA 2E6AA 3BPWA 4C1KA 1YADA 1I8JA 3IIPA 3SW6A 5LGXA 3PUOA 1FXQA 2BXVA 1A5SA 2A7PA 3IIZA 1XC4A 3LXCA 4UTTA 2YYUA 4LVDA 2VELA 3NZRA 4UNLA 3NGJA 2Y62A 4Y90A 1YDVA 3DFTA 5AC8A 1SR9A 3HG3A 5KZEA 4KWWA 3N19B 3SFKA 1AMKA 1G4EA 1KFJA 1OFOA 4MLJA 3GIYA 4XQ6A 3LCXA 5AHNA 4NXSA 5D02A 1LOSA 1D3HA 3HGRA 3UXDA 2B7NA 3T7VA 1WV2A 2DJLA 5BOOA 4LUJA 1PE1A 4O53A 3UWVA 1V5XA 2A0NA 4R7JA 1BTMA 3EWUA 4AWTA 3CIXA 4BF9A 3HMJG 4NNBA 2E09A 3UWYA 3RFAA 3EKZA 3QQ1A 3HGSA 3MYPA 3TV8A 4A3UA 1TO3A 2YX0A 1PHQA 4JTJA 4PH6A 4IJBA 4NX5A 1G4TA 5FEXA 5E93A 1ZALA 2ZZ4A 3QYQA 4L4MA 5AN7A 2B7QA 2VEMA 2XN1A 2YW4A 2QUUA 4GNJA 2I9EA 4E0CA 1OFAA 3OVRA 1GTEA 3ZWTA 5DCDA 1H7NA 3TA6A 1LLWA 4MPQA 1G69A 5FF3A 1XBXA 5L6UA 3M1ZA 1TPC1 2QJHA 4ICNA 4E2BA 1WOBA 3HQ1A 1RQHA 2WSRA 4AXKA 4X3ZA 1VCVA 1ZENA 3UPWA 5DN1A 1HL2A 1B9BA 1TPFA 3G1SA 4JY8A 4MKNA 5C54A 3GDRA 4NU7A 3SR7A 4O1CA 3Q58A 4FX7A 4MY1A 3W1UA 2ZQ0A 4AH7A 3S0CA 4U28A 1KFBA 3UWZA 1CW2A 1ZFJA 4M7SA 3W2LA 3EX4A 3VNDA 3UY7A 1JCJA 1PCWA 1FCQA 1SSGA 4DPPA 1VQTA 3OHIA 2WKJA 3DHDA 3EX3A 3F4NA 4FEZA 2WO5A 3G8EA 2QDGA 5LNRA 2YR1A 1RQBA 4XZ9A 4IQLA 2PRLA 5F1VA 4JTHA 2JGYA 3W75A 2VC6A 3UY8A 3HBLA 3MYOA 2E6YA 5AYXA 1EA0A 3NZ1A 4O1AA 1LROA 2BX7A 3A21A 1RPXA 4DF1A 3NQFA 2FB3A 4UIOA 2BWGA 2AQWA 1LZOA 3C4UA 4HKPA 4Z1CA 5CZTA 1F76A 3L67A 1VZWA 1RD5A 3DAQA 3HGJA 1K7EA 4AHQA 1F2JA 1S5VA 3NXFA 4JEQA 3T40A 3WK2A 3N14A 3KFTA 3LERA 4N4QA 4YMZA 2AAMA 1JUKA 4JYFA 1ZAHA 2NXIA 2ZDRA 1H63A 3I7SA 4U4MA 2H8ZA 3IIXA 2IQTA 2A4AA 3EWBX 3NQEA 5EBUA 2FQIA 2NUWA 4ADTA 3G1VA 2NWRA 4GC4A 4IPIA 1JUBA 5HUPA 3TDFA 3EKLA 2QCGA 4BFAA 2KZHA 5AFDA 4NNCA 2XFWA 3G18A 2ZRXA 1T0OA 2C15A 3E49A 3N34A 1Z41A 1W5PA 3WK1A 5DBUA 4K7VA 2FPYA 2TMDA 3GDLA 4PODA 4OWGA 3U6WA 4A29A 3L5AA 1GVSA 1M7OA 2ATSA 4RJEA 4EVZA 3IRDA 3FKKA 3L5LA 2CZFA 1FDZA 4RZ4A 2B0MA 3LLDA 1R30A 4UCGA 3O05A 1PCKA 2CLIA 1LOQA 1TPWA 1KM4A 4M7TA 4JTSA 3W88A 4MZ8A 1SUXA 3GKFA 3BARA 4K37A 3FKRA 1OF8A 1T99A 1UB3A 1XBVA 1FCVA 2OMAA 4QQ3A 3MHGA 1WA3A 1LOLA 2FDSA 5D32A 2YDAA 5LHFA 4ADUA 1ICQA 3LM7A 1DJNA 5AOUA 3CWNA 4AF0A 4UTIA 4LU0A 2HS8A 5KMYA 4GUFA 1A53A 5TBOA 4J9JA 3SY5A 1EIXA 3CM4A 4ML9A 1W0MA 1YTKA 1OG0A 3D0CA 3CEUA 2WQPA 4WX2A 3PG8A 4E2DA 3TCEA 2R8WA 1YDOA 1OK4A 3TQVA 5G2HA 5KSWA 1C8VA 3MP5A 1MSSA 3VCRA 1A50A 2WJZA 1H62A 5D2TA 2Q3RA 5F2GA 2C14A 4RV8A 3OIXA 3LOTA 3CWOX 2E5BA 2J9YA 2EF9A 1R47A 4UC5A 3R8RA 3UZ5A 2ZRWA 1GOXA 3VE7A 4S2BA 2XN0A 3KHJA 4Q32A 5D05A 7TIMA 3KRZA 4N9BA 1EX5A 3A22A 3LBMA 1TJPA 3UNDA 2ZA3A 3ZFHA 1GVOA 3C2RA 1T8XA 3M9YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ISV A;  2WPG A;  2PGE A;  1PZ0 A;  2CLH A;  2R14 A;  2GQ9 A;  2Y8V A;  1I0D A;  5E0C A;  3RUB L;  1TPU A;  2ALD A;  4JEJ A;  3OLG A;  3ZIZ A;  2QGY A;  3M16 A;  3NQ7 A;  4Y9A A;  3N9R A;  1S2T A;  1ZJI A;  1ZLP A;  3W7E A;  5BZA A;  3LGD A;  2G97 A;  2D1Z A;  5CC6 A;  5C70 A;  2QJM A;  2V2D A;  4HK7 A;  4RX0 A;  3WQV A;  4C1N A;  1N7K A;  1JPI A;  3PUG A;  1EWE A;  4HZ6 A;  3Q4D A;  3EB4 A;  1H1Z A;  3PR2 A;  4KF1 A;  5EBA A;  4X61 A;  1WXJ A;  2VRQ A;  4JQ1 A;  1O1H A;  3UG4 A;  2HNH A;  3A13 A;  2Z2U A;  3N2X A;  1KWK A;  4BQ3 A;  3WLO A;  4NNA A;  1QCW A;  2O4Q A;  1G67 A;  1LF1 A;  4GQR A;  3VOC A;  1ZAI A;  2OEM A;  4AZH A;  3H26 A;  3FS2 A;  5A6M A;  2OLA A;  4H41 A;  2HBX A;  1WB0 A;  4N7Q A;  2FYM A;  4W85 A;  1RCO B;  4W4Q A;  3URA A;  1GVF A;  5E1Q A;  4P8X A;  5GJP A;  3E02 A;  2H6R A;  2A7R A;  4W87 A;  2OG9 A;  2OX4 A;  3F4C A;  4C6Q A;  2EXO A;  4IX0 A;  3DFO A;  4GD0 A;  4UZU A;  1NWT A;  3W25 A;  3RK8 A;  1QJW A;  3KX6 A;  3BZG A;  1JD9 A;  3P67 A;  3ATY A;  5E0K A;  3DBP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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