4TMCA

Crystal structure of old yellow enzyme from candida macedoniensis aku4588 complexed with p-hydroxybenzaldehyde
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MSYMNFDPKPLGDTNIFKPIKIGNNELKHRVVMPALTRMRAIAPGNIPNTEWAEEYYRQRSQYPGTLIITEGTFPSAQSGGYPNVPGIWSKEQLAEWKKIFNAIHENKSFVWVQLWVLGRQAWPEVLKKEGLRYDSATDDLYMGEEEKERALKANNPQHGITKEEIKQYIKEYVDAAKKAIDAGADGVQIHSANGYLLNQFLDPISNNRTDEYGGSIENRARFTLEVVDAVVDAVGAERTSIRFSPYGTFGTMSGGENPGIVAQYAYVIGELEKRARAGKRLAFIDLVEPRVTDPFLPEFEKWFKEGTNEFIYSIWKGPVLRVGNYALDPDQATLDSKKPNTLIGYGRSFIANPDLVYRLEKGLPLNKYDRNTFYTFTKEGYTDYPSYEESVAKGYKKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Engineered Old Yellow Enzyme that Enables Efficient Synthesis of (4R,6R)-Actinol in a One-Pot Reduction System
pubmed doi rcsb
molecule keywords Old yellow enzyme
molecule tags Flavoprotein
source organism Kluyveromyces marxianus
total genus 152
structure length 399
sequence length 399
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4tmcA00
1SPQA 1YXYA 3DI1A 1LCOA 5G2HA 3TQKA 5D38A 2QCDB 5C55A 3STCA 1UUMA 2O7SA 3PBWA 1WYIA 4LV9A 5DCBA 5KTLA 1A5AA 4IMFA 1SO6A 1AW1A 4M19A 1AMKA 1EUAA 3IVUA 1YTEA 3UWUA 3S0CA 2A2IA 3GIYA 4TO8A 2ATMA 2LLEA 1OABA 3FYPA 2ZZ6A 3NPVA 3EWYA 3NZ1A 3MMTA 1ME8A 3NL6A 2ZQ0A 3Q2DA 3KRSA 2Y88A 4Z0JA 4MY9A 4N6FA 2DZTA 4UTTC 1IXPA 1KM6A 1ZJIA 4LS0A 1EX5A 4QAIA 1TJRA 3ZFHA 1RV8A 1W5NA 4AHOA 4UCGA 1UBSA 3QEZA 4PCFA 2V30A 2WSQA 4POCA 5E93A 4MOZA 1EP3A 3USBA 2BX7A 1RZMA 4ICNA 1KLYA 1QWGA 5AYXA 4U28A 4WOZA 3GAYA 4UTWC 1QOPA 1H7NA 3T55A 4DF0A 1YPIA 3L0GA 3GKAA 2VOMA 3O15A 3EX3A 4B5NA 4WY0B 1PHWA 3I7SA 1W56A 5DBUA 1WXJA 1F73A 2A4AA 2CLOA 3MJYA 1TTJA 2QUTA 3DI0A 3MI2A 1K02A 1UCWA 1EEPA 3HMJG 4XUGA 4CQAA 2DZUA 1UJPA 5LKYA 3UWWA 1IIHA 1OFBA 4RV8A 3HPZA 4JR5A 2HTMA 3DZ1A 3RLUA 3G1SA 1F2JA 3HG2A 3ATZA 4O19A 4EIVA 3CC1A 1KBJA 1SW7A 4JTGA 1EP1A 4QQ3A 2QCNA 3NNTA 2ABAA 1WBJA 1TB3A 2YX0A 3QSTA 3TV8A 2CZEA 2EHHA 1X1ZA 5F4XA 3TNOA 3SGUA 5AYYA 3GAKA 4IPJA 4AVFA 1VYRA 3VE7A 5BMWA 2EPHA 1OFQA 1OFRA 3A24A 5CZSA 2QUUA 4EF8A 3C2OA 4EF9A 1H60A 2IQTA 4O1DA 1MXSA 2ZBTA 3TA6A 5K7JA 4BI6A 2V5LA 4BFAA 1M5WA 2V2DA 4C1LA 5D2WA 2V8ZA 3HIJA 3NQFA 1A5CA 1M7OA 1T96A 1EA0A 3RLVA 4RZ4A 4UTMA 4GUFA 3HGRA 3C56A 5D03A 4FNTA 3QPZA 1XCFA 3KFTA 3PBYA 1R30A 4N2YA 3EXSA 4HNNA 4EVZA 1EWDA 1TPWA 1ALDA 2GJNA 2YYUA 4Z1AA 1F05A 4O53A 3JR2A 2E5DA 3FLUA 4Y8FA 2CZ5A 3M5YA 3LTSA 1QDSA 1SO4A 1NF7A 1NFBA 3M41A 1JUEA 2Y7FA 3MBDA 4TMBA 1OX4B 5K4ZA 1LROA 3LCFA 3NR0A 3HG5A 1RQHA 4UFJA 2VEMA 3W76A 3NM1A 1LRTA 2NWRA 3JS3A 2RFGA 3W85A 1MEHA 1QOQA 3LX9A 4MYXA 1VYPX 3S5OA 4CQ8A 3W23A 1V5XA 1AW5A 1CX9A 4UFMA 1K8YA 3G0UA 1W3IA 1O60A 2EF9A 1RQBA 3W1QA 3B0VC 2JKAA 2VENA 3CIXA 2BWGA 3IIXA 3HJZA 3VI2A 3QYQA 4LWWA 4IUOA 1ZAJA 1WDWA 2Y85A 1YADA 4IMCA 4GUJA 2DZSA 4LUJA 1FQ0A 1PS9A 2CLIA 2E09A 1KM3A 3SECA 1A50A 3CIWA 3FIGA 3T44A 5AC7A 3LRMA 2H6RA 2V2CA 3VKJA 3V1PA 1VGAA 2NLIA 2QCFA 1H7PA 1QPRA 3M5XA 2YXGA 4PEKA 4ZVJA 1L6YA 4MFDA 1J2WA 3EX1A 3ABOA 4IWWA 2CZDA 3LBCA 5F4WA 2BTMA 1G4EA 1LOLA 4Z1CA 1R2RA 1KTNA 3MI6A 4IMDA 3KXQA 3GR7A 4CNOA 4KWWA 2E1DA 1TTIA 3G3MA 2DZXA 3W88A 1OX5A 3L21A 5AFDA 5G4WA 1U5JA 1JCNA 3R89A 4IQLA 1I2NA 1IF2A 2NV1A 4XKYA 2C16A 1T99A 4YCOA 3VNDA 3G0SA 3DXIA 3G1VA 1P0KA 1OFEA 2C14A 2NXGA 4ZMGA 4UTLA 3W1NA 1H5YA 1TPDA 4BF9A 3W70A 4HPJA 3SR7A 2V0TA 1KM0A 1SFJA 1QAPA 2GJLA 1GVSA 2JBMA 1TPH1 3N3MA 1P1XA 5CZJA 1HG3A 3W7HA 3DFTA 1OJXA 3W7KA 5LHFA 5LNSA 3THAA 3DFQA 3DKLA 3WFAA 4TU1A 2R91A 2X1TA 4IMGA 1KFLA 3CWOX 3QW3A 5CPLA 3W84A 3LXAA 1QO2A 3GK0A 3TSBA 1OF6A 1I8JA 4NU7A 4M7SA 4ALDA 4UFKA 5LGZA 3Q58A 3SJ3A 3MHUA 4IX0A 1FCBA 3ABRA 1YXDA 3L68A 1BWKA 5D2XA 4Q32A 3V75A 3G0XA 3C2EA 3QQ1A 3HG3A 1TPEA 4KWVA 4G1KA 2GVGA 2VFFA 1F5ZA 1XUUA 3NPXA 1SO3A 2WSRA 2CWNA 1KTCA 1I2RA 2XFWA 3PUEA 3L5AA 3N2MA 2NWSA 4DPQA 4TX9A 1OYAA 4AF0A 1YPFA 2J6XA 3HBLA 3W22A 1QO5A 1OFOA 1DBTA 3PC0A 4CCDA 3PVFA 2HMCA 3W1LA 3LDVA 4GBUA 3LTYA 1XDLA 3GR8A 3VE9A 1F6KA 3QF0A 1TRDA 1W37A 5FF4A 2DORA 1K7EA 3C2VA 4UR7A 1GJPA 4DO4A 5AOUA 5HULA 5D05A 1C9DA 1VPXA 2ZRUA 5I3JA 4O54A 3M0ZA 4FX6M 3KVJA 4Q33A 3DHDA 4KKXA 1CW2A 4Z1BA 1R47A 1H51A 1VLIA 2C19A 3M47A 3GVGA 3NG3A 1GVOA 1KFEA 3EKZA 2CLEA 1AG1O 2J27A 3R5EA 3O8AA 1LM1A 2OT0A 2J9ZA 4JTUA 4OE7A 4OHQA 3UWZA 4Z0SA 5LGXA 2W79A 4I7VA 3DHFA 2ZFAA 1SZNA 4JIPA 1K03A 3PR2A 1JCLA 1OG0A 3R13A 4X22A 4Y96A 4FNUA 2NXIA 5F2MA 3G1YA 4I9AA 3ZR4A 1WOBA 3DGRA 3UQNA 1O94A 1SZFA 1G4PA 3UNDA 1PE1A 1VS1A 3BLEA 2QJHA 4NZFA 3GNNA 3MP3A 4QNEA 3DENA 3UWVA 1I2QA 3C52A 2Y7DA 4N02A 3WJSA 4LVAA 1T0OA 3T40A 3DAQA 3LI1A 4O15A 3WK0A 2WO5A 3QQ0A 3E49A 3NL3A 4EWND 1LP6A 2VFEA 3MO7A 5D2YA 3NO5A 3S1VA 2FLIA 4LC8A 4XBSA 1GG1A 4L4LA 3W2JA 1BKSA 3RNDA 2V81A 2VEIA 3CQ0A 1GWJA 4WXYA 4A21A 1S3HA 1DV7A 3TU9A 3W7RA 1KM2A 3TC6A 3GB6A 2YFOA 2E6FA 2FPYA 4KFOA 5H2ZA 5D09A 1EIXA 4R53A 4PFMA 1B4KA 1BTMA 3LHVA 1TJPA 1KM4A 2Q3RA 3FS2A 4OBTA 1PHQA 3MW7A 3LCLA 3PF3A 1YDOA 4M6QA 1J5TA 5AB3A 3TH6A 4O4VA 3G1HA 4EOUA 3SW6A 1FWWA 4BWLC 1WBHA 5CSRA 2QR6A 5HMSA 3P8IA 1JRCA 5D30A 2NX9A 1XBZA 4O13A 2DJXA 4UTHA 3K30A 2X1UA 4AH7A 1HO1A 4UNKA 5DCEA 5EL1A 3PB2A 2QJIA 1MEWA 3L66A 3DFSA 4ZQOA 1XKYA 1KBIA 2QAFA 4UMCA 4MZ8A 4OU1A 1LLZA 1FWRA 3RFAA 3G8RA 5K9DA 3TUUA 4ADUA 1VCFA 2GQ9A 2WSYA 3I65A 1I4NA 2Z2UA 1B9BA 1FCVA 4E0CA 1RVGA 2OJPA 4LTSA 1QNVA 2C6QA 3GDMA 1TIMA 2XN0A 3W1MA 2DP3A 2FFCA 2FB3A 1Y0EA 3P61A 4E38A 5D2TA 1EWEA 1IGSA 3OA3A 3P5YA 2DJLA 1N8FA 2R94A 3BGJA 4IJBA 1A5SA 3WK1A 2QKFA 1G7VA 1ZFJA 3PM6A 3PS7A 5KSWA 4CQ9A 1OYBA 3HGSA 4E2BA 1LTDA 3B03A 3TR2A 1KFCA 7TIMA 1AL7A 4M6VA 5LZLA 1K7XA 3F03K 3W7GA 5HINA 5DLCA 3KVKA 5F1UA 1SU5A 3P82A 1O5KA 4GE8A 4JS3A 1JJKA 4GFSA 5E0KA 2JK2A 4JYEA 1SFLA 4MJMA 4UTJA 1HTIA 3LHZA 1QMLA 4NJJA 5G2IA 1EB3A 2JKPA 2QCDA 4XBKA 1Q3NA 5AHLA 3TSDA 4S1FA 2Y7EA 1Z41A 1FXPA 3WJXA 4DO6A 1ZENA 3W1AA 1TPB1 3G22A 3EXTA 2WNZA 3P5ZA 5GVJA 3LCXA 3E9AA 1H7RA 4O18A 4FNRA 5C54A 3NEVA 4GJ1A 3W7DA 4RXFA 1H7XA 4PA8A 4DBEA 1GTEA 1LRQA 1JUKA 5K4XA 4JTIA 3EWXA 1KM1A 3PWAA 5IBXA 3DH7A 1Z48A 2QUVA 3BW3A 1ZALA 4ZQCA 2A0NA 2XN1A 3UY7A 2TMDA 4JNMA 4UTKA 1KV5A 1TV5A 4PTNA 1VCGA 4MLRA 2CLKA 3LHUA 4O0KA 1ZY9A 2GQ8A 5CGQA 3TMLA 1GYLA 1TMHA 4L4MA 4H4IA 4HSNA 4QIUA 1ZAIA 1Q6RA 4QISA 3L2IA 1RPXA 3NQ7A 5HWJA 1LBLA 3BW4A 3BVJA 3UY8A 1O4UA 3YPIA 3DBPA 3LRLA 4W9TA 3UPBA 4MYAA 3R12A 3STFA 1X6UA 3GZ3A 1KLZA 2WPBA 3S9YA 2X1RA 2O7QA 3THQA 3HGJA 1O95A 3HQ1A 4NJHA 3BV4A 1XC4A 1FCUA 2QDGA 1BEUA 3TQVA 3QH2A 2X1SA 4MFEA 3IGSA 3W7MA 3EXRA 2Y6ZA 4XTIA 5BRBA 2B7NA 4WY0A 2ZZ1A 3EX2A 4AWTA 3MHGA 1DJNA 4JX4A 4JIQA 5HWMA 3QM3A 4DQWA 1ME7A 5G5IA 1VH7A 2BXVA 3TMQA 5F2GA 1OFDA 1GT8A 3GDTA 4NJKA 3P81A 2GVLA 3SIZA 4U4MA 2Z0IA 3PG9A 1YXCA 1SR9A 5FEZA 5J5RA 1W5OA 3E02A 3NYZA 3N34A 3GNDA 1JCYA 3NVTA 4BI7A 3A21A 5TIMA 1GYNA 1T8XA 2VFGA 3U8GA 3KVMA 2ZTJA 2RH9A 1WX0A 4UTUA 4ML9A 2C1HA 3RMJA 1OF8A 2ZZ7A 1Q45A 2OCZA 5FEWA 5I3IA 4YLWA 1OK4A 3P60A 2PRMA 2FPTA 3ABSA 2CLLA 3LERA 4UMAA 1DQWA 1X7FA 1F74A 1OFPA 1SW0A 1K8XA 3M16A 1B57A 2YGYA 4O57A 1OYCA 2G96A 3B06A 3HPSA 3OHIA 1RQEA 3RK8A 5CPMA 1YYAA 5FF2A 4LW7A 3H53A 2OZ0A 2NUYA 2PE4A 3W1PA 3G1AA 4GWEA 4PC8A 4UTTA 1W1ZA 5KITA 4NUWA 1OHLA 4WX2A 3NGJA 3ABQA 3U6WA 3W7OA 2B0MA 2Y61A 2V2HA 4BR1A 3NM3A 3LM7A 1V7YA 4AXKA 5F2LA 4LVBA 3MYOA 3TFCA 1TQXA 1TYGA 4LC6A 3W73A 2Y89A 5U4NA 2A6NA 4UTWA 3CTLA 2R8WA 1Z44A 3WK3A 4O14A 2YPIA 3L5LA 4TIMA 5G1TA 1OX4A 5AN7A 1A53A 2PRHA 3CWNA 1EUNA 3W83A 1JRBA 4QJ1A 1R2SA 4FIQA 4HN4A 5HR6A 4K36A 2B7PA 2Z1BA 2QEZA 2ZYFA 3LOTA 5H91A 1G69A 2RDUA 1DVJA 4D2JA 4QM1A 1VCVA 2GPTA 3NQAA 1C8VA 3CB8A 4JTEA 1DOSA 3FJLA 1P0NA 1QFEA 3O6DA 3A5VA 3Q94A 1KA9F 4UXDA 5DELA 4O1CA 4LOCA 4WZHA 3W3OA 2A7NA 2W6RA 2QF7A 1LOSA 3UWYA 1I2PA 3W7JA 4QITA 2I1OA 1ICQA 4FNSA 3GXTA 4LNYA 3TW7A 3TKFA 3N19B 4HKPA 3QSRA 3TAKA 5BNKA 3B4UA 4JGDA 1DQXA 4NZJA 1KFBA 3QJAA 5T26A 2ISWA 3HG4A 3L0KA 5K9CA 4X2RA 1H1ZA 4JTLA 3OBKA 2ATSA 3TW6A 1W5MA 5HNRA 1O5XA 3P7YA 3WJYA 2TSYA 5AHMA 1JUBA 1OVDA 3LCWA 1FCQA 2HS8A 1WA3A 1E51A 3NQCA 2VC6A 2FIQA 5HUOA 6ALDA 2A7RA 1NF0A 4MJZA 3W6YA 3S6DA 1KM5A 3STEA 4Y90A 1XBXA 3PSWA 3W7IA 3MP5A 4LVDA 1FY6A 5LNWA 1ZHAA 3BPWA 2VEKA 4FB7A 1FWTA 4FXRA 1LBMA 2E77A 5BOOA 4Y6GA 3I7QA 2YCEA 2ZRWA 2CZFA 1VZWA 3EX6A 3G18A 4JTKA 5A8GA 1LYXA 1H63A 3FKKA 3W7QA 1B3OA 2ZZ4A 4MVAA 4Z08A 4FHAA 1QPQA 4WQ6A 1K7FA 1FDJA 2E6YA 4ORMA 3A9IA 4N4PA 3TK7A 2NV2A 3S5ZA 4AB4A 1TPC1 3H55A 3NDOA 3W1RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4PMQ A;  4K2S A;  1YXY A;  4Q4P A;  2FH6 A;  4XZI A;  3IK2 A;  2E25 A;  3TQK A;  4ICC X;  1Q6D A;  2OTD A;  3GE7 A;  1UKO A;  3STC A;  1UUM A;  3V7P A;  4HOX A;  2O7S A;  4LV9 A;  1WYI A;  5DCB A;  2W63 A;  5KTL A;  4IMF A;  1EJS C;  1PX8 A;  4QG9 A;  3RLG A;  1AW1 A;  4FOK A;  4M19 A;  1AMK A;  1UR9 A;  4HCH A;  3S0C A;  3TLL A;  4AD4 A;  3C0L A;  1RP8 A;  4LB3 A;  1OAB A;  3FYP A;  3NPV A;  1E5J A;  3NZ1 A;  1C8Y A;  3P14 A;  3EKG A;  3NL6 A;  3VX0 A;  3GHS A;  2DT2 A;  3NZG A;  4CUC A;  4HHL A;  3KRS A;  1M68 A;  3GC5 A;  1RA5 A;  1ENU A;  2ADA A;  4UTT C;  1KM6 A;  3ONB A;  2VDI A;  3STP A;  1EJ7 L;  4QFU A;  4QAI A;  1TJR A;  4HA4 A;  3PFR A;  4JN7 A;  3UU0 A;  4BQ2 A;  1W5N A;  1UBS A;  1ITU A;  4JFW A;  2V30 A;  2I5I A;  3WZ0 E;  4ZXO A;  1RZM A;  1S2U A;  4WOZ A;  1VBH A;  1YNQ A;  5HPC A;  1H7N A;  4GK8 A;  3T1G A;  1JPI A;  3EX3 A;  1E4N A;  4DLM A;  3ARX A;  1F73 A;  2XSX A;  3KE0 A;  2EQD A;  5HAT A;  2QUT A;  3R58 A;  3DI0 A;  3MI2 A;  1K02 A;  4QX4 A;  1UCW A;  3HMJ G;  4XUG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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