4U3AA

Crystal structure of ctcel5e
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
304
structure length
292
Chain Sequence
AVDPFEMVRKMGMGTNLGNTLEAPYEGSWSKSAMEYYFDDFKAAGYKNVRIPVRWDNHTMRTYPYTIDKAFLDRVEQVVDWSLSRGFVTIINSHHDDWIKEDYNGNIERFEKIWEQIAERFKNKSENLLFEIMNEPFGNITDEQIDDMNSRILKIIRKTNPTRIVIIGGGYWNSYNTLVNIKIPDDPYLIGTFHYYDPYETWGTQEDMDTVVRVFDFVKSWSDRNNIPVYFGEFAVMAYADRTSRVKWYDFISDAALERGFACSVWDNGVFDMAIYNRDTRTFDTEILNALF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium thermocellum atcc 27405
publication title Biochemical Characterization and Structural Analysis of a Bifunctional Cellulase/Xylanase from Clostridium thermocellum
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase H
total genus 119
structure length 292
sequence length 304
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2014-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4u3aA00
4J3XA 4UZSA 1X6LA 3CZEA 1D3CA 5HPCA 3UERA 2XVKA 2X0HA 2HISA 4M8UA 2X05A 1FP8A 4MNJA 1KR0A 1V6UA 2G41A 3RO8A 2GSJA 4Z2GA 1WZLA 3ZT7A 4EE9A 4WKFA 4UOJA 2WCGA 3KL3A 1TMQA 2WXDM 5I6SA 4MJ2A 4AY1A 3CUJA 2O9RA 4W89A 4PMQA 4NI3A 4D6JA 1NQ6A 1V08A 2C7FA 1IT0A 1KGUA 1MQPA 1PEZA 3MSDA 5EFFA 1XRVA 2JEPA 2MANA 1WZAA 1CGXA 1E5JA 2XSAA 2BNJA 4PTWA 1U2YA 4CD6A 1CPUA 1E72M 4WJXA 1RPKA 4ATDA 2CBIA 3KL0A 5A2AA 2E8YA 5FOOA 1J0ZA 3RILA 7CGTA 5BCAA 3GBDA 1IV8A 5E0FA 3WH8A 3OB8A 4PMRA 2WVVB 3SCTA 2BXYA 1HL8A 1PIFA 4J3TA 4U5IA 2WAGA 1JI1A 1PX4A 1JG9A 4TUFA 4NF7A 4PTMA 4D6HA 1XH2A 1NARA 2W4XA 2QLYA 1MW2A 4E2OA 4D72A 1LWHA 1A47A 4S3KA 3OLDA 4J3WA 5ABFA 5HDRA 3L2MA 3THCA 5DEZA 2PC8A 3AS3A 3T08A 2G3JA 5I79A 4QCEA 3VDBA 3CHCA 2F8QA 1C7TA 2AMGA 1UKSA 3GNPA 1J10A 2VCCA 4IUGA 2JALA 1JZ5A 1GVIA 4GI9A 3WQWA 3ZM8A 3AS2A 1EQCA 1UQYA 2WSPA 2XWEA 2E9BA 5GPRA 1FP9A 1BFNA 2FH8A 3SCWA 2ZUMA 3MUZ1 5KEZA 1PIGA 3MMWA 1GQIA 1E70M 3ZR6A 2EEXA 4UZUA 3VGEA 4B16A 1UWTA 1JZ7A 2J4GA 3GXDA 4AD5A 2WWCA 3WD1A 2CEQA 1XD0A 3WNLA 4UOZA 4XZBA 1ISZA 4HMEA 1K6AA 4W7UA 3SCSA 4CCDA 4RE3A 4ACYA 4BZYA 2VR4A 4F9JA 3EYPA 1VEMA 1DTUA 2UY2A 3N04A 5JUVA 1HXJA 1RP9A 3BAXA 2W91A 3EBVA 1V0MA 4PCTA 2VZVA 2XIIA 3AIWA 1HX0A 3AIQA 1HVQA 2GJXB 2VQUA 1W1TA 5A6SA 3E1F1 4OUEA 5BYWA 2Z1SA 3PZ9A 4UR9A 2DGAA 3SCVA 1QI0A 1UD4A 4FF5A 4AC1X 1GW1A 1OD8A 1WDSA 1V3JA 1VJSA 3GBEA 2EPNA 1G94A 4MB5A 1OGGA 3L2LA 3ZQ9A 3MUAA 1KXTA 2CHNA 5CLTA 4D6GA 2PWEA 2CIPA 1NWRA 2YBTA 3SCOA 1ECEA 2ZUTA 3CTTA 3K46A 1R7OA 4J3VA 1WPCA 2WVVA 1VFOA 4UFLA 4OBRA 1J18A 4J27A 2J77A 2GJRA 2X0YA 1KCLA 1W1VA 4JFTA 2BVTA 4EANA 2WKLA 4H41A 2QV4A 2YBUA 4J3UA 4F9DA 3ZSTA 1HKJA 3AOFA 1DP0A 3VOCA 4GZIA 2WMFA 1HKKA 3W25A 4JKKA 2JE8A 1FA2A 3WSUA 1V03A 4HA3A 3FHQA 4MADA 1JZ4A 1OGBA 2WHJA 4AXNA 1EOKA 1EHAA 1BGAA 2YIHA 4M80A 1LJYA 4XUYA 2D24A 1K9EA 2BY3A 5M17A 1W32A 2ZX8A 2VVSA 3BAIA 1CGUA 5FD0A 1UKPA 3K8MA 1JZ8A 2ZE0A 3W37A 2OWWA 1AVAA 4M56A 1O7AA 3FHAA 4AD1A 4AWEA 4M81A 2PBOA 1BVNP 1W3LA 3B8SA 3WH7A 2WNWA 2XIBA 2XVPA 3CUHA 4JL2A 1D2KA 3IJ7A 2A3HA 3OG2A 4LXFA 1CLXA 1UD2A 4QLKA 4HOZA 1JYNA 3WENA 5CJ5A 2D3NA 1ITCA 4HMCA 3IANA 5EBAA 2PWFA 2PB1A 4P8XA 1SMAA 1LG1A 1ZJBA 4D6FA 1S46A 2WCAA 1EHNA 1ZBKA 3AFBA 1F4AA 5A94A 1W2VA 5AYIA 5TD4A 4PBGA 3TOPA 2J7EA 1E6PA 4GQRA 2D20A 4QAWA 1BF2A 2G3NA 3LPGA 2ESCA 4CCEA 1UD5A 2JIEA 4M1RA 1JZ6A 1DWAM 3SURA 3WD2A 1EH9A 4AZGA 3FY1A 5BXPA 3L4ZA 1R86A 2D3LA 4DUVA 5D9PA 3CHEA 2ZIDA 2UY5A 3VIOA 4NZCA 1QI4A 4UFMA 1H1NA 2EO7A 4MNLA 3QHOA 4W87A 1DWHM 4P7QA 3SEPA 3WDRA 2D2OA 7A3HA 3PZMA 5BXSA 1BGGA 3SCQA 2VJXA 3AXIA 1P6WA 4N42A 4R27A 1XCXA 3OBAA 1CXEA 3CHDA 1E0WA 4JIEA 4JFWA 2BY1A 4HU8A 3T0AA 1V3LA 1E73M 2C0HA 4FLSA 4BQ4A 1W9BM 4DM1A 5HPOA 5IFTA 3ZR5A 5CPSA 1XV8A 2NT1A 4LX4A 1UZ4A 1RD6A 1CXIA 1NWUA 1KGWA 3BCFA 4CN4A 1Q6FA 4JFUA 1QW9A 2OLHA 4S3JA 1B2YA 1ISYA 4UQ9A 1E0VA 1HIZA 2J74A 4BS0A 2G3IA 3EMCA 4HOWA 3PBGA 3F4VA 2GDUA 4Z2JA 4HOXA 1VIWA 3SCPA 3THDA 5A8OA 3WNKA 2W63A 3WEZA 3O2LA 5ABGA 3FN9A 4HTYA 2PF0A 1B3ZA 3QHMA 4CCCA 4MNMA 3CGTA 1UYQA 2J7HA 3BMVA 3PZQA 1WE5A 1QI2A 1SYTA 2VRQA 4E8DA 1GOIA 1XD1A 4MB1A 4J28A 1CXHA 2J25A 2BVDA 5DF0A 1CXKA 4UFJA 3MUY1 2JFEX 2ZOXA 2DT3A 3K4AA 5FIPA 3WBAA 1HN1A 3BAKA 3WD3A 3NIYA 3EDEA 1UKQA 2QMJA 3DHUA 4JZ5A 3SUUA 1H3GA 5FCZA 2XG9A 3RM8A 1V6XA 2VURA 9CGTA 1FH9A 3NYDA 3WH9A 4PSRA 3SCNA 3AZTA 3WF1A 1TE1A 3KWXA 1CNVA 2FHCA 4DUXA 5IFPA 1KBKA 1XH1A 1E4LA 4LYPA 4FK9A 4JHOA 2E40A 1OBAA 1A3HA 1HJQA 4DWSB 1PX8A 1JL8A 4CVWA 4H8UA 3VILA 1ITXA 1OIFA 3A47A 5CLWA 4B9ZA 5IHSA 1NP0A 3N9KA 1PAMA 2CBUA 3VGDA 1UR8A 3ALFA 3AMGA 1E1FA 3PN8A 3OGVA 7TAAA 2OWXA 4H2CA 4MJ4A 1J12A 3GXMA 4IISA 2D0GA 2VZOA 3N15A 5A6KA 2DQXA 3VMOA 3D3AA 2WKGA 3CO4A 3VPLA 5D4YA 3VX1A 2J8GA 4NRSA 2ZXQA 1E43A 1W1YA 4HA4A 3W28A 2O9OA 1ZBVA 2VRKA 3CZKA 4GO9A 4U5KA 3WMSA 5D8ZA 4ZXOA 1E3ZA 1EO7A 3OZPA 3VD3A 1CGYA 3W82A 4IM4A 1GJWA 2GFTA 2Y24A 2E0PA 3LPPA 3AIUA 3WMCA 3IK2A 4RE4A 4D71A 2QF8A 2F2HA 4LYRA 1KXVA 1MQRA 4PMOA 2XWDA 4UFKA 4YHGA 5AC4A 3GH7A 2WM0A 2CESA 4K68A 1C90A 6CGTA 3I3EA 3VU2A 5AC5A 1BSIA 3M7SA 2XVLA 1UH3A 3CIVA 3ZJ8A 2GVYA 1V6YA 3VVGA 1MFUA 2O9PA 2FGZA 4CN1A 4AEFA 1RH9A 3WF4A 2VZSA 3AYRA 3AMLA 4TVUA 5E6ZA 5BRPA 2W66A 1E6SM 1D7FA 4N0RA 4Z2IA 3AZSA 4WIWA 4GQQA 4V2XA 4HZ8A 2VTFA 3W6MA 3WBEA 1GONA 1GCYA 5A1AA 3ZJKA 4MDPA 4XB3A 2PI6A 1W2PA 1LF1A 3II1A 1FHDA 5E09A 2PWGA 2VC9A 4ZXLA 3WNPA 1WKYA 3ZJ6A 1VB9A 1H09A 1JXKA 1XSJA 1JNDA 4OIFA 2XFYA 4QDMA 1W91A 4W7VA 2O9TA 3MMDA 1E56A 1EDTA 5M03A 4YN5A 1C91A 2XTKA 4D6IA 1QNRA 1H0IA 2VL4A 3CZLA 3VGGA 1ISXA 4JKMA 2WMIB 2PWDA 4LPCA 3VIHA 4DWSA 1E6NA 2CERA 5E6YA 2XGIA 4PTXA 3SCUA 3AHTA 1VAHA 4LQ1A 3T2QA 4PCSA 3AHYA 3PZNA 2DSKA 2EJ1A 1JZ2A 1AQ0A 3AISA 1OT2A 3GXIA 2WB5A 2ZUUA 1V02E 4BA0A 1UD3A 1E5NA 1OCQA 3F5LA 4LGXA 1J01A 3U5UA 2J7CA 2VVNA 2J8FA 3GYCA 4GZJA 3WDPP 3BGAA 3EDFA 2DEPA 4W86A 4CU6A 4PMXA 4UQCA 3N18A 5HNNA 5HBFA 1MW0A 5CSYA 4B9YA 2Y4SA 4CD4A 1MW1A 4ZE4A 1M01A 3WNNA 3IJ9A 3WF3A 3SUSA 1BVZA 4JAWA 4QLLA 1WDRA 1O6IA 1G0CA 2WVTA 3TTOA 3O9NA 1UR9A 1MXGA 4PYSA 4F79A 2VCAA 2W92A 3K8KA 4CUCA 3BAYA 2DSVA 1BAGA 3AQUA 2BHYA 2D22A 4HPGA 4RE2A 4XZWA 1UR1A 3G6MA 1GOMA 5JBDA 4AZ7A 4JCMA 3AS0A 1WP6A 2NSXA 1H2JA 3GDBA 5I5RA 1HJUA 1IZJA 4MB3A 2VZUA 2ZXAA 3CZGA 1GOQA 2DSZA 1UQZA 3OA5A 1OM0A 4JFSA 4KGJA 3AZRA 2AAAA 1OGSA 1J0JA 1KWGA 2WMGA 4WSJA 1LLOA 3CPUA 1UHVA 5A6JA 1JD9A 2W61A 2W62A 4URIA 1UH2A 1H4PA 5I23A 1MW3A 1OWQA 2VOTA 4HU0A 3VM5A 1XSKA 3EDKA 4A4AA 1E40A 3VGFA 5DMYA 4PMVA 4FLRA 3CBWA 3RMEA 3VINA 3DYOA 3PTKA 2WK2A 5ABHA 2WC4A 3VO0A 1K9FA 4AZ6A 4ATWA 1EIBA 3A4XA 1ESWA 1KB3A 1J0KA 3AYSA 3BAWA 1W9DM 2V3GA 8CGTA 1TG7A 2XUCA 3W27A 1YHTA 2G8ZA 3A4WA 1US3A 4DWSD 1R8LA 2CETA 2AOSA 3GNOA 3W0KA 5E0CA 1PX3A 4PEEA 1C7SA 3ZJ7A 1HP4A 5ECUA 3JUGA 1UWRA 1BYCA 2VNCA 4AZBA 2WPGA 1QOXA 3GZAA 2JF6A 1V0NA 3AIRA 4M82A 4TVDA 3VKKA 3PZUA 1UWUA 2CKRA 1GNXA 2XYLA 5CPQA 5JIPA 3I3DA 2UWFA 2BFGA 3SUTA 5A6MA 3ECQA 3VIMA 3ARSA 1UR0A 1W9VA 1XH0A 3KEHA 3MANA 3WQ5A 1CYGA 1JDDA 4C7FA 4ACZB 3TTYA 2UY3A 5CG0A 1I1XA 3AHZA 4HZ6A 5E70A 3B9DA 3EDDA 2OSWA 4UNIA 4OZOA 1QNSA 2Y2WA 2XM1A 5BRQA 3F5JA 3CLWA 4PMZA 3BH4A 1R7AA 2DIEA 3LPOA 1SFSA 3PHAA 1PZ2A 5GNXA 1WCGA 4A3YA 3FW6A 4WK9A 5FL1A 1E55A 1C8YA 2J79A 2VO5A 2BY2A 5LA1A 1Q6EA 1Q6DA 4AW7A 1V02A 4MDOA 2VX7A 3N17A 5CGMA 2WZEA 1OINA 2BVYA 1B9ZA 4UCFA 4KRTA 3UCQA 3W6LA 1UD6A 2XVGA 8A3HA 1DWIM 4QCFA 2RGMA 2QPSA 1BQCA 1CLVA 3LPFA 2GJXA 3WQ8A 3O6AA 3T09A 1G5AA 5I24A 3NSNA 3DHPA 1E4MM 2J7GA 1HVXA 5M3WA 1UR4A 1TA3B 4KGLA 4D6EA 1V0LA 1XYFA 4U3CA 4BQ5A 1QVBA 1K9TA 3BAJA 1JXJA 4W84A 3WFLA 1WO2A 1JNEA 2YLAA 3WDIA 5A6BA 4D1IA 5BXRA 1W9UA 4NRRA 1PPIA 3ARZA 1ZJAA 1JIBA 1U30A 3PZTA 2C8NA 4AD0A 3NDZA 4IPLA 1UA3A 2WHMA 3CUFA 1GOKA 1NM9A 4M29A 3MKKA 2W5FA 3KL5A 3NSMA 4MAVA 4PN2A 4FLQA 1W3HA 1BHGA 4UQAA 2J47A 4P7RA 5CSUA 1ISWA 1QW8A 2DH3A 3ZT6A 4V27A 2CKSA 3UG3A 1V6VA 2WSKA 6TAAA 2F61A 2CYGA 3WN6A 4MPKA 2E9MA 1JDAA 5M5DA 1W9XA 4E8CA 3VD4A 1HF6A 1B0IA 3M46A 4UFHA 1HP5A 1GJUA 3L4YA 3WD4A 1C92A 3AHXA 4AMCA 4DM2A 4MNKA 4ACZA 2YL9A 2EXOA 3WH5A 3WF0A 3UEQA 5E9AA 1EDQA 2ZXBA 1FHLA 2VQTA 2D1ZA 4OJYA 1NWTA 1EOMA 1HKIA 3ARYA 4HA1A 1PJ9A 1WAWA 3BSGA 3ALGA 1GUVA 5EFDA 2G3MA 2ZWYA 2EQDA 3QOKA 1K9DA 4F8XA 3WKZA 1H5VA 3RDKA 4F66A 2PBGA 1TUXA 2ZX7A 3RPMA 2E4TA 2DT0A 3EMZA 1GVYA 3T0DA 3L4WA 3HU7A 4KH2A 1V3KA 4W8LA 5I77A 3M07A 3ZSSA 1QNOA 3W24A 4HZ7A 3WIJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4J3X A;  4UZS A;  1X6L A;  3CZE A;  1D3C A;  5HPC A;  3UER A;  2XVK A;  2X0H A;  2HIS A;  4M8U A;  2X05 A;  1FP8 A;  4MNJ A;  1KR0 A;  1V6U A;  2G41 A;  3RO8 A;  2GSJ A;  4Z2G A;  1WZL A;  3ZT7 A;  4EE9 A;  4WKF A;  4UOJ A;  2WCG A;  3KL3 A;  1TMQ A;  2WXD M;  5I6S A;  4MJ2 A;  4AY1 A;  3CUJ A;  2O9R A;  4W89 A;  4PMQ A;  4NI3 A;  4D6J A;  1NQ6 A;  1V08 A;  2C7F A;  1IT0 A;  1KGU A;  1MQP A;  1PEZ A;  3MSD A;  5EFF A;  1XRV A;  2JEP A;  2MAN A;  1WZA A;  1CGX A;  1E5J A;  2XSA A;  2BNJ A;  4PTW A;  1U2Y A;  4CD6 A;  1CPU A;  1E72 M;  4WJX A;  1RPK A;  4ATD A;  2CBI A;  3KL0 A;  5A2A A;  2E8Y A;  5FOO A;  1J0Z A;  3RIL A;  7CGT A;  5BCA A;  3GBD A;  1IV8 A;  5E0F A;  3WH8 A;  3OB8 A;  4PMR A;  2WVV B;  3SCT A;  2BXY A;  1HL8 A;  1PIF A;  4J3T A;  4U5I A;  2WAG A;  1JI1 A;  1PX4 A;  1JG9 A;  4TUF A;  4NF7 A;  4PTM A;  4D6H A;  1XH2 A;  1NAR A;  2W4X A;  2QLY A;  1MW2 A;  4E2O A;  4D72 A;  1LWH A;  1A47 A;  4S3K A;  3OLD A;  4J3W A;  5ABF A;  5HDR A;  3L2M A;  3THC A;  5DEZ A;  2PC8 A;  3AS3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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