4UMAA

Structural analysis of substrate-mimicking inhibitors in complex with neisseria meningitidis 3 deoxy d arabino heptulosonate 7 phosphate synthase the importance of accommodating the active site water
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
ELLPPIAHLYELPISKEASGLVHRTRQEISDLVHGRDKRLLVIIGPCSIHDPKAALEYAERLLKLRKQYENELLIVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPHLDGTFDINFGLRQARSLLLSLNNMGMPASTEFLDMITPQYYADLISWGAIGARTTESQVHRELASGLSCPVGFKNGTDGNLKIAIDAIGAASHSHHFLSVTKAGHSAIVHTGGNPDCHVILRGGKEPNYDAEHVSEAAEQLRAAGVTDKLMIDCSHANSRKDYTRQMEVAQDIAAQLEQDGGNIMGVMVESHLVEGRQDKPEVYGKSITDACIGWGATEELLALLAGANKKRMAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Neisseria meningitidis
publication title Structural Analysis of Substrate-Mimicking Inhibitors in Complex with Neisseria Meningitidis 3-Deoxy-D-Arabino-Heptulosonate 7-Phosphate Synthase - the Importance of Accommodating the Active Site Water.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHO-2-DEHYDRO-3-DEOXYHEPTONATE ALDOLASE
total genus 133
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4umaA00
3SSJA 4IPIA 3QQ0A 3N3MA 3QJAA 2A21A 1B57A 4MY8A 3HG4A 1TPB1 4S2CA 1EP2A 3HF3A 2H3BA 1I45A 3HIJA 3FIGA 3W2JA 1KTBA 3Q58A 4GXMA 7TIMA 3OIXA 3H53A 1EPXA 4I7WA 3STGA 1B4KA 2YX0A 3O07A 3OBKA 3N34A 1ZY9A 4K8EA 2B7PA 2GQ9A 4CLMA 3A9IA 4RXFA 3B04A 3O8AA 4LVBA 3C4UA 4Y6GA 3E49A 3BW2A 1SZFA 4FX6M 3W1MA 3UXAA 3WJYA 4IGHA 3W85A 3W74A 1BTMA 2E6AA 3WJZA 3BW4A 3W70A 3W1UA 3H55A 3JR2A 1YYAA 3LHZA 5G2IA 3R89A 4RR4A 3W6YA 3G3MA 3CWOX 5FEXA 1MEWA 1YTKA 2VXNA 4FNQA 5HINA 4UFIA 2ZZ4A 3W7JA 2OCZA 4NX5A 3OVQA 3DHDA 4LS0A 1GWJA 1PHWA 1FXQA 3KVLA 3ZWSA 2GVGA 3S5YA 3HO8A 4TIMA 3DENA 4CNPA 1KFLA 3IGXA 1HO1A 3G22A 4AWTA 3L0KA 1SW0A 3SI9A 1ZFJA 3P62A 3WK0A 2CWNA 2ZZ6A 5D32A 4JEQA 1WA3A 4IX2A 2C1HA 2E5BA 4QIUA 4UTIA 2WO5A 3LCFA 3W88A 1NAL1 2YPIA 1TV7A 1YLVA 2JGQA 3VE7A 4UC5A 5I3KA 4CCCA 4UUIA 4OBTA 1E51A 5BMWA 2Y85A 3P61A 3B0UX 3GAYA 1YDOA 2WJZA 3MYOA 2F84A 3M5XA 1W3TA 3PSWA 4JNMA 5CSRA 4RK8A 5AOUA 4GUGA 4GE8A 3O05A 3ATZA 1OX4A 1TTQA 3B0PA 4XUGA 1FWWA 2DJXA 5G4WA 4QAIA 4Z1AA 2ZZ5A 1QR7A 1QO5A 1QMLA 4YCPA 1F73A 5G1TA 3N9SA 5F2GA 1IIHA 3E96A 1ME7A 3P60A 3QSTA 3CQ0A 3NL5A 1RVGA 2P1FA 3LTPA 5LNVA 4N02A 4O4VA 1WV2A 2WKJA 3TSDA 4XTDA 1OFBA 1FY6A 1O94A 1AW1A 2Q3RA 3M9YA 5L6UA 3T4CA 3W3OA 1OFRA 2HMCA 5GVJA 2BXVA 2QJIA 1U5JA 1EUNA 4LUIA 3LI0A 5EPDA 2PRHA 4JYEA 4ADUA 1O5XA 3DKJA 5LGZA 2W0UA 3P74A 4BK9A 1KM4A 1F76A 2YYUA 1QOQA 4ZMGA 4JDBA 4MJMA 3GNDA 2VFEA 4ZQRA 5EL1A 4N9EA 1ADOA 5D2XA 3S0CA 5KINA 3LHWA 4LV4A 2X16A 4JXCA 4HPJA 1VHNA 4PL2A 4HNTA 4FNPA 3U2OA 1PIIA 3DGRA 2YDAA 4S1FA 3SGUA 2FB2A 4WOZA 4MPQA 5DBTA 4JTUA 3C56A 3BGJA 5HR7A 1AL8A 3W1XA 5L9FA 2V81A 3EWWA 5D33A 4BF9A 3GYEA 3QC3A 2ZRYA 1XBZA 4ZQPA 5E0KA 1J5TA 3GX9A 3LHUA 2JK2A 1JRCA 4O11A 2QCDA 3M1ZA 4WXYA 4FNRA 1JUEA 1TV5A 2BX7A 1VYRA 4HNUA 4PA8A 3N2XA 3W7NA 3M44A 5F2IA 1XUUA 1VLWA 3LTYA 1PHQA 3IIVA 2CLFA 2J9ZA 3PG9A 4UTJA 3L65A 5FEZA 1M7PA 3DFTA 1TRIA 1UUOA 5F4WA 3DFSA 1ZJIA 2QCMA 3NL3A 1ZHAA 4UFMA 1JCJA 1EP1A 4I7UA 2YCEA 3BLFA 2CFFA 1I2PA 1VS1A 5G2WA 5KSWA 3NQ7A 2QKFA 3LXCA 3RMJA 5AN7A 3W7HA 4TU1A 2UV8G 4B5NA 2WQPA 5HMSA 3NQ2A 4YCOA 4UFKA 2GJNA 1QCWA 2CW6A 4AB4A 3CPRA 1H7XA 3HPXA 4RXGA 2V30A 1HUVA 4HNNA 1V5XA 2EHHA 4KWWA 3W86A 3W1PA 2VEKA 3MP5A 4IPJA 4K38A 3HPZA 3YPIA 3NO5A 4DEFA 2AAMA 3NQAA 2W79A 4O16A 4LWWA 4CCEA 2ATSA 4LS1A 3EXRA 4KKXA 1LRQA 4WX2A 3U6WA 4FNSA 2X1UA 1ALDA 1Z44A 3M43A 1Z42A 4RX0A 1WBHA 6TIMA 3NQ6A 1A50A 1Z41A 1ME9A 2YW4A 4N4QA 1H7OA 3MW7A 3PC0A 4IMDA 5IM51 1GJPA 3QPZA 4QITA 3M6YA 2FIQA 1SZNA 1QPOA 4HN4A 4NU7A 3EX2A 1AW5A 1K03A 3BLIA 1HG3A 2Y63A 5K9CA 4O12A 5K7JA 1I4NA 3QH2A 4TO8A 4Z1BA 1LTDA 1OYAA 2DZSA 5EYWA 3HG2A 1KFEA 3ABRA 1M5WA 1S3HA 5AHNA 5D2VA 4GWEA 1DBTA 2ABAA 4UTKA 4PODA 4OV4A 2VFIA 2GPTA 4JTSA 5ABTA 1OX4B 3LRKA 4JTEA 2QDGA 1XBXA 3W7RA 3TROA 1UUMA 4QM1A 3PSVA 1VQTA 1TO3A 3DU0A 4FNTA 4EWND 3DFNA 2LLEA 4LUJA 1NSJA 1TPDA 3LV5A 1PV8A 1XBYA 1C8VA 4OGZA 3I7RA 3AO0A 1YADA 4MYXA 1ZCOA 3W1LA 2G96A 4MJZA 1EX5A 4BI5A 4UMCA 1KV5A 3QW4B 2GVLA 5EBUA 1TQJA 1UASA 5FF0A 1NVMA 4YWIA 3A21A 4K7VA 4ZVJA 2QCNA 5AC7A 4DXVA 4IQLA 1DKWA 4QJ1A 3LXAA 1ZAIA 1LP6A 4UNKA 5LZLA 2QJGA 5D03A 2FDSA 3TMQA 2VEPA 2QAPA 3B8DA 2Y61A 4KFPA 3OVPA 2YGYA 4X2RA 1DL3A 1X1ZA 5IBXC 3BARA 1R2RA 1FQ0A 5AC8A 1WYIA 2YZRA 5A8GA 5U7SA 4AWSA 2C6QA 3KFTA 1OABA 2E6DA 2QCHA 3KRUA 2ZCGA 1SR9A 4PTNA 1TPUA 2A6LA 1HFBA 2ZZ1A 2O7SA 1JCNA 3N2MA 3EX3A 4ORIA 2BSLA 3GB6A 5FESA 1OF8A 4UNLA 1XC4A 4POCA 1UBSA 1F6KA 5F1UA 3G1YA 1XL9A 3NQCA 1UB3A 5HNRA 2QCDB 3LXBA 4LVAA 2V82A 3N14A 1WOAA 2NXIA 2OT1A 1FBAA 1I2NA 4MKNA 5E1QA 3CM4A 5EMUA 4DPQA 1G4PA 3W76A 1KM2A 5AHEA 1QNVA 1SW3A 4A2SA 2AGKA 5DLCA 1TPH1 1PL9A 3GR7A 2G97A 4PH6A 5HQEA 1VYSX 5U4NA 1RZMA 3W2UA 4O10A 4UFJA 4K7YA 1NF0A 2X1SA 3NA8A 5HUPA 4WD0A 3P67A 1H1ZA 3GIYA 3M7WA 3ZR4A 1QPQA 2BZNA 3E0IA 3W7EA 2BLEA 4AMAA 8TIMA 2FPTA 2ALDA 4X22A 1KBIA 1SW7A 3O63A 3TJXA 4X9SA 5TBOA 1HTIA 1GG1A 4LVDA 4C1LA 3IGUA 3TIMA 1LM1A 1TPC1 1K7XA 4MZ1A 1XBVA 3USBA 2B0MA 4PCFA 4IMEA 1P1XA 4FB7A 3P5YA 1H1YA 4JDYA 5BRBA 1ONRA 4QQ3A 3STCA 5K9DA 4N2YA 1P5BA 2QCLA 1Q6OA 4Y96A 4Y9AA 3O15A 5CKSA 4O53A 2H3DA 2YFOA 3G1DA 4XZ9A 4DF0A 1JCXA 4RZ6A 4E2DA 5DCDA 5H91A 4GUJA 1WX0A 3FJ6A 1ICSA 2GQAA 5D38A 4ICNA 2ZFAA 4NX0A 3IIOA 5HUOA 2NV1A 1ICPA 1QWGA 2PURA 1FWSA 4HHPA 2XN2A 4RV8A 2X30A 1JJKA 1Y0EA 4RKAA 4RLIA 3L5LA 3SGZA 1I2RA 2ZRZA 3L0GA 1YXDA 5LHEA 1FX6A 5J5RA 2QUTA 5AYZA 2NX9A 4N9BA 1Q3NA 2Y70A 4Z1DA 3DH7A 2Z6JA 4MZYA 4ZL1A 4O13A 2ZQ0A 3DHFA 5G4EA 1D3HA 4OT7A 2CLEA 1IGSA 3M5VA 1JUBA 1JCYA 3UYCA 3W7QA 3BVJA 4LVGA 3LRMA 3NYZA 3V75A 4TMCA 4ZZ9A 4UTUA 1O5KA 4NZFA 1SSDA 1H50A 3FS2A 4J9JA 3S1UA 3T7VA 3L2IA 4UCGA 2JKAA 2W6RA 1GZGA 1IXOA 3Q94A 3R12A 3UPBA 3INPA 3EX4A 1GQNA 5F1VA 2X1TA 2H90A 3MHUA 1F74A 2Z0IA 2DP3A 4S2BA 3S5OA 3QMSA 2QDHA 5IBXA 3VNDA 1YXCA 1AW2A 3AJXA 1D9EA 2Y7FA 1ME8A 1SSGA 1TPWA 4QNWA 4CQAA 3W2LA 2WNZA 2NWRA 1SFLA 4I9AA 1FDJA 3LHYA 1BWLA 1TSIA 2HS6A 3G1HA 2H8ZA 1O60A 3W87A 4ONVA 1X1OA 2PC4A 3QZEA 1TJPA 2VC6A 3HOJA 3BG9A 3GNNA 3TXVA 5H2ZA 1A53A 4IXXA 2YSWA 3KOFA 2Y7GA 1OFDA 2E5DA 2YFNA 3TK7A 1GEQA 1LOLA 2RFGA 1YPIA 3LCWA 1V7YA 3G1FA 3I7QA 2NUWA 3KVMA 3N9RA 2Y7DA 4NT0A 4GNJA 3TXZA 3RLUA 1A5BA 5TIMA 2VFFA 1JVNA 3G3DA 1TB3A 4AHQA 5C5YA 2B7OA 2I14A 4FX7A 2A5HA 3NEVA 1VH7A 2OX1A 4H4IA 1OJXA 2V8ZA 3TX9A 3O6YX 3PUDA 2DZWA 3EX1A 5BOOA 1FUYA 1GG0A 4TMBA 3C2RA 4HNVA 4PL1A 4RJEA 4RCXA 2FB3A 2G95A 1VCGA 3MJYA 2CLLA 3IV3A 2QCCA 5D09A 3QEZA 3HQ1A 3C2FA 3BPWA 4BWLA 1OFPA 1ICQA 3LGEA 3LCIA 2J27A 4M5PA 1UCWA 5CPOA 3W7DA 2PRMA 3W1TA 1DV7A 4WY0A 4Q32A 1L6YA 3QRHA 4MLRA 1FWRA 1XXXA 1SPQA 1T0OA 2FPYA 3O1NA 3TC7A 1ZENA 2WSQA 2HSAA 3GK0A 2J6XA 3GXPA 3R13A 3GVGA 2P10A 3PB2A 4ORMA 3TH6A 5HWJA 3GDLA 2A6NA 4Z08A 3G0SA 1DQXA 5LHFA 3B03A 1W1ZA 4PEKA 4LVFA 2A7PA 2ZA2A 3C2EA 3E02A 2Q8ZA 1Z48A 3W7IA 1VLIA 3KRZA 5CPNA 4JTLA 1U83A 2A2IA 2E68A 2TMDA 5CG7A 4UTTC 1SU5A 1CX9A 2J88A 4NQ1A 4YXGA 2ZRUA 1LYXA 3MI2A 2A1YA 1LLZA 5E93A 1OVDA 2Z1BA 1EA0A 3WJSA 4OU1A 1N8FA 2J9XA 2BWGA 3PM6A 2BTMA 1B3OA 4LNYA 2F7FA 4EF8A 3BO9A 1W56A 1P0KA 4AWUA 5K3VA 1NEYA 4PC8A 3DZ1A 3SJ3A 4IMFA 1PE1A 1TMHA 3W9ZA 2DORA 1FDZA 2CZ5A 2C18A 2C14A 4UMBA 3P8JA 1LBLA 1OYBA 2AQWA 3LM7A 4DQWA 1G7VA 1W37A 4IJBA 1FDYA 3DI0A 4QNEA 2DZPA 3A23A 3TMLA 3ABSA 1TYGA 4EF9A 2VFHA 4MZ8A 3R2GA 4AEOA 1BKSA 1TTPA 4FO4A 1I2OA 3NAVA 2FFCA 2ZZ7A 3W83A 3L68A 3LDVA 2WNQA 3EWZA 3G18A 3EKLA 1MZHA 1T99A 4M6VA 3Q2DA 4JICA 2XFWA 2JKPA 3B05A 3NL2A 2V2CA 3NM3A 3PUOA 3NQEA 3PBWA 3UPWA 3I65A 1W5QA 3KAOA 4HSNA 5I3GA 1ZAJA 4G1KA 1O95A 1GTHA 1I8JA 1R2SA 3NM1A 5T26A 3W1NA 2CLHA 4GBUA 1AK5A 4MYAA 1EP3A 4M7SA 3GDKA 1KM5A 1VPXA 1L9WA 5AFDA 1SZGA 3TQKA 2RDTA 1OG0A 3MBFA 3HMJG 1K3UA 4IMCA 4K6AA 1VCFA 2VENA 1IXPA 2ABBA 1JULA 1LLWA 1W8SA 1M6JA 4N9CA 4GC4A 1K02A 2R8WA 4JY9A 3C8FA 5BNKA 1GVQA 4XWUA 3LCGA 3HJZA 3RU6A 1OX6A 5D2YA 2ZYFA 3SW6A 4NZJA 1OX5A 4MOZA 5LSMA 1YPFA 3S6DA 3PS7A 5D02A 2V5BA 1PVNA 1A5AA 3MI3A 4JTHA 4A29A 4XQ6A 3BGGA 3QSRA 4WZHA 2CLIA 3BLEA 4O1AA 3S5ZA 5CZSA 3MWAA 1LDCA 2E5CA 2YXGA 4N6FA 4UTHA 1S5WA 3WK1A 3THAA 3SY5A 3DAQA 5D05A 1W31A 3KHJA 2EAWA 4XBKA 4W9TA 3ATYA 4ALDA 3L67A 3GKFA 5AHIA 1WOBA 3W22A 3IVSA 2C15A 4DBDA 4CCDA 5C2XA 3MP3A 1XUZA 3L5AA 3TQ0A 4JY8A 4XTIA 3FKKA 2A85A 3HB9A 1SO4A 5LGXA 2VELA 4NJGA 4XKYA 3NR0A 3B06A 1WDWA 3OEXA 3KRSA 1SQ7A 3NZRA 4MLJA 3STFA 1K8YA 3HBLA 2VFDA 1M7OA 5HWNA 4WY0B 1N55A 3EEGA 1J2WA 5J5DA 1W0MA 4GJ1A 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 5CZJ A;  1IF2 A;  4KWV A;  4L4M A;  4K8H A;  3PF3 A;  1F5Z A;  4OE7 A;  2V2H A;  3TV8 A;  3GZ3 A;  4HT3 A;  4JS3 A;  2CLM A;  3NQD A;  4O4W A;  3VE9 A;  1XFB A;  4UTW A;  4FIQ A;  2A0N A;  1EWD A;  3C3N A;  4IXH A;  4UXD A;  4CQ9 A;  4EVZ A;  5DXY A;  5FI8 A;  3FKR A;  5DY2 A;  2NUY A;  2NUX A;  4BWL C;  3C0J A;  4Z0J A;  1W3I A;  1KTC A;  3W7L A;  2QJH A;  1KM1 A;  3QM3 A;  1P0N A;  2A4A A;  3RND A;  3UWQ A;  4NNC A;  4TR9 A;  1TPV A;  5D37 A;  3A5V A;  1WAU A;  1GT8 A;  1WQ5 A;  2FJK A;  3OA3 A;  3C2V A;  1EB3 A;  5AYX A;  3F4N A;  1RR2 A;  1TPE A;  4NNA A;  4OV9 A;  2ZRX A;  2OMA A;  3TJL A;  3TUU A;  3ELF A;  3EXS A;  4O8R A;  3W23 A;  5KZE A;  1B9B A;  1F05 A;  4O18 A;  3QFE A;  3PVF A;  3T78 A;  3LRL A;  4E0C A;  3LOT A;  2Y88 A;  3DFP A;  1EUA A;  1LCO A;  3FYP A;  3MBD A;  3LI1 A;  4R34 A;  2X1R A;  4IMG A;  3OHI A;  5LNU A;  4LOC A;  1VZW A;  3DFQ A;  3QMR A;  5LNR A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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