4UTHA

Xena - oxidized - y183f variant
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
359
structure length
357
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIASAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGFLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREALPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
publication title Redox-dependent substrate-cofactor interactions in the Michaelis-complex of a flavin-dependent oxidoreductase
doi rcsb
molecule keywords NADH:flavin oxidoreductase
total genus 125
structure length 357
sequence length 359
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4uthA00
3EKLA 4H3DA 1XDLA 1DV7A 3DKJA 1PVNA 3PSVA 3L66A 2YXGA 1G4SA 3RK8A 2QJHA 5CGQA 1PIIA 2GUUA 4MPQA 1L6SA 1QO2A 3FYPA 5TQLA 4UMBA 4JIPA 3FKRA 3GKAA 2ZA3A 4JYEA 3GXPA 5F2LA 4AEOA 5CPOA 1WOAA 4RXGA 4O8RA 2FDSA 5IBXA 4MUZA 3B04A 3TA6A 1KV8A 2LLEA 1L6YA 1KTNA 2CLKA 3IIPA 5T26A 4R7JA 5A5WA 3PUEA 3P82A 3HB9A 3KRUA 3EWZA 8TIMA 4BI6A 1RQEA 4CQ8A 2CLIA 2X1TA 1SQ7A 3C4UA 3E02A 4E2BA 4YLWA 4EOUA 5CSSA 1G7UA 4UMCA 3HF3A 1IXPA 3G1SA 4Y90A 3SZ8A 1JRBA 1TYGA 2VELA 1KM1A 2EPHA 2Z6IA 5F2MA 4IMDA 4KFPA 3BARA 3NG3A 5L6UA 2ATMA 4UUIA 3PBWA 1RVGA 2XN2A 4MYXA 1D3HA 1GYNA 1TJPA 2JGQA 3L2IA 3CEPA 3W1AA 4BF9A 3LHUA 1SU5A 3LOTA 5K2ZA 4RXFA 1XFBA 1EUNA 1ZCOA 3OIXA 3TKFA 3GDKA 2BLEA 4FF7A 1IXQA 2ZYFA 1TPVA 3DKLA 4E0CA 1TO3A 1HG3A 2CLEA 3NZ1A 3UXDA 2F7FA 1G4PA 4JS3A 3BK0A 2NZLA 1H61A 1MXSA 4HNNA 2QUVA 3SGZA 4NJHA 4N9DA 4E2DA 2J24A 3NQ2A 2EGZA 4A2SA 2HS8A 4DBEA 3W1LA 2V81A 5LSMA 5A8GA 1RD5A 1O60A 3NDOA 3LCGA 4KFNA 5HJLA 3VCRA 2CZDA 3OEXA 1T96A 3M0ZA 3B0UX 5G4WA 1SFJA 2OT0A 5U7SA 3W2NA 1TPH1 3LLDA 1HTIA 3CIWA 3JR2A 3C6CA 3O05A 3ZFHA 1LZOA 4JTFA 1WYIA 3S1UA 5ABTA 1B4KA 3BVJA 1TPEA 1YPFA 3QSTA 4ONVA 1EX5A 3ELFA 1WBHA 3VE9A 4HNUA 3IGSA 1JCNA 4EVZA 5C5YA 3NPUA 1FXQA 3W88A 1YTEA 1Q6LA 1PCWA 3P67A 2ZZ2A 2H6RA 3TK7A 3GIYA 1RQHA 4UNKA 5IM51 4X9SA 2X1SA 3A5VA 3PUOA 3GDLA 4GXMA 1H51A 4WD0A 2YYTA 2WNZA 1NFBA 5AC6A 4O4WA 3ATYA 1AW1A 5FF4A 4GNJA 4JEQA 1TTJA 3LHTA 3FEMA 3KFTA 2E6FA 2GPTA 1VYRA 4AHPA 4LVFA 4O1AA 4HPXA 1W3IA 5CZTA 5E93A 3LI0A 2FLIA 3LRMA 1YPIA 2JGYA 3EEGA 1JCYA 3PBYA 3W86A 3T4CA 1LOQA 2QKFA 4Z0JA 1H7RA 1UUOA 3TFXA 4FNPA 1F6KA 3PBVA 4ZQMA 3DI0A 1LRTA 5D02A 2NWSA 3QW3A 4PC8A 1AK5A 1KFJA 4N4PA 2ZRVA 5LNRA 4KKXA 1IGSA 3GK0A 2ATSA 2Y89A 3LLFA 4LVAA 4ORMA 3O15A 1A53A 4DF0A 3W1MA 2DZUA 2FB3A 3WK2A 1IIHA 1H7NA 1WXJA 3K30A 2PRHA 4LRTA 5J5RA 2V0TA 2VOMA 3NL2A 3W7NA 1KA9F 3CU2A 3GDMA 4NNAA 1BWLA 3NOEA 4Y96A 1LRQA 3W1XA 3IEBA 3NYZA 4ADUA 3EXSA 3W2JA 4GUGA 2QCDA 4PEKA 4JY9A 5D38A 1TB3A 3EX6A 2DZVA 3DFPA 3IVSA 1XI3A 1F74A 1X7FA 2BTMA 4O1CA 4KFOA 1GVQA 4GC4A 2FB2A 3DI1A 4YL2A 3W2KA 4Q33A 1VCGA 3VE7A 5EYWA 3UYCA 3NVTA 1OX5A 4AMAA 1H7PA 3MP3A 3FJLA 5H2ZA 3TSMA 3PVFA 5AYXA 4CCDA 1N8FA 2GJLA 3LERA 3TQKA 1PV8A 3FS2A 5AHFA 3NGJA 5G1TA 3QM3A 1VRDA 3SW6A 1H7XA 2P1FA 4JYFA 2KZHA 3W1PA 3GLCA 3PS7A 3BG3A 5C6MA 1LCOA 4AWSA 4LRSA 1I2OA 3RFAA 2HMCA 1I2NA 1EP2A 1ZHAA 4RCXA 2A7PA 4S2BA 1TQJA 3EKZA 4N9EA 1RZMA 1A5BA 2QDGA 1ZY9A 2YYUA 4WZHA 5BRBA 4OBTA 4M6QA 3EWYA 1YADA 3M47A 2DZXA 5EL1A 3TROA 5KZDA 1FDZA 2AAMA 1MZHA 1IF2A 4I7VA 4O13A 3NL3A 3TMQA 4EF8A 5AHMA 3HG5A 1GT8A 3UY7A 1LDCA 3TAOA 3W7HA 3BW2A 3B03A 4K8EA 1KM5A 3C3NA 3S9YA 2XN1A 1FUYA 2ZQ0A 1Q45A 3KAOA 3NQEA 5HQEA 2ISSA 4LVBA 1IXNA 1R46A 4WXYA 2E77A 1TV5A 3UPWA 4FNUA 3LHYA 5G5IA 1FWRA 3LCIA 4UTLA 3TE9A 1GEQA 1UUMA 3FLUA 2H3DA 3THAA 2C15A 3GDTA 4LT9A 3TNOA 3H54A 4XKYB 5I3KA 1E51A 2R14A 1QNVA 3CEUA 4NU7A 3CPRA 4RR4A 3EWXA 3RMJA 4A3UA 3DHFA 3TFCA 4GRSA 3UWVA 1GYLA 4TMBA 2X30A 3EXRA 1SZGA 4I9AA 3AJXA 3W07A 3BGGA 1I2PA 3OBKA 1QOQA 1OX4B 4IPJA 4CLMA 2DU2A 3S0CA 1K7XA 5D33A 3W71A 1GQNA 5KZEA 1OFPA 3T55A 2WPBA 3OG3A 1VYPX 1QDSA 4S2CA 3I7SA 1SW0A 2Y62A 3G22A 4QISA 1LOSA 2FIQA 4O0KA 4UTWA 4GE8A 5HWNA 3ZR4A 3A5FA 2PCQA 2QJIA 1QR7A 3NZRA 4WY0F 1ADOA 4CNNA 1JCXA 4K38A 5I3IA 2WQPA 2WNNA 4NUWA 1G6CA 1OFAA 3IIXA 1J5TA 1WDWA 3TX9A 4UTKA 2FQIA 3UNDA 4FXSA 5G2WA 3PM6A 5H91A 3PSWA 4LW7A 1MEWA 5MHBA 4LS1A 3VKJA 1FCQA 3BG9A 1GTHA 1KTCA 5I3HA 4M7SA 1GJPA 2R8WA 3A23A 4HSNA 1UASA 1ZALA 3QQ1A 2FJKA 3NPWA 4YXGA 2CLLA 1ICQA 3BW3A 3LCFA 3T78A 3S1XA 3T44A 3G1VA 2QCGA 5CSRA 3P5YA 4CNPA 1AMKA 1I2QA 2JK2A 1KFBA 3QRHA 2NUYA 3LCXA 1FXPA 3GB6A 3QQ0A 4ZZ9A 1KFKA 4N02A 4LC8A 4JTUA 3INPA 3EWWA 3SIZA 3DFNA 4O57A 3M16A 3I68A 3WK1A 5DCDA 3DFTA 4OV4A 1FWSA 3G18A 1XCFA 5HINA 7TIMA 4JTGA 1LBFA 3TSDA 4U28A 3P8IA 3DGRA 2E1DA 1JQVA 2RDTA 3HPSA 4H4IA 3R12A 4HSOA 1OJXA 4DO5A 4IQLA 1ML1A 5LHEA 2H3BA 3HPZA 4JTSA 1THFD 3KVLA 5CKSA 3B0VC 1IXOA 2GJNA 3NO5A 1ME7A 1YDOA 3QMRA 1KM3A 4POCA 3QYQA 4O53A 4N2YA 2FPVA 3S1WA 3N2XA 4FHAA 5E1QA 1TRIA 2FTPA 1F05A 1YYAA 3BG5A 1TPUA 4LUIA 3OVRA 1XBXA 1RPXA 2VENA 4CCEA 3RLUA 4UTTA 4IXHA 1VHCA 1VYSX 2Q8LA 5DLCA 3W7DA 3G1AA 3H55A 5G2IA 4HT3A 2H90A 1SR9A 3NA8A 4JTTA 3CTLA 4RV8A 2RDWA 1SW7A 2QJGA 1IIGA 4GUJA 3JRKA 4CQ9A 1TPFA 2Y85A 1VCFA 4QNWA 1LLWA 2YGYA 4Z0SA 4ZVJA 4C1LA 1TSIA 1JCJA 4ZMGA 2Z6JA 4MIMA 1XUUA 3G3DA 3N14A 1VJIA 3L65A 2Z2UA 4O54A 3ABRA 2G96A 2W6RA 2C1HA 3M41A 3TJLA 4IXXA 4MJMA 3L9CA 2I9EA 3FFSA 4IWWA 5F4XA 4YMZA 4AAJA 1QMLA 4XKYA 1T0OA 1XM3A 1FWTA 3Q2DA 3LDVA 3A24A 3B05A 2QAPA 4NX0A 5DBUA 5LNSA 1SSGA 2RFGA 3HIJA 4JDBA 1WV2A 1BKSA 1HFBA 1G69A 3PG9A 4X2RA 3LCHA 1B9BA 3MW7A 4WQ6A 1GOXA 4NJJA 2QUTA 3CC1A 3IGUA 2HTMA 1OX4A 3HGOA 3O07A 3STCA 4MZ1A 5CZJA 3C2EA 3IRDA 2CFFA 5F1UA 3TIMA 1GWJA 3N73A 1GVSA 3W1RA 3L0KA 5AHIA 3W85A 3O1NA 4B5NA 1SW3A 1BEUA 1Z48A 3NQVA 4JD4A 4LVDA 2Q3RA 3EX1A 3KVJA 1VPXA 4R53A 5HWJA 4OE7A 4QNEA 1H50A 2DP3A 2XN0A 3W7MA 4MYAA 2PRLA 3GNDA 1FX6A 2QCDB 3LTYA 1GVOA 4JX5A 5KINA 4R34A 4IMCA 4N9BA 3NQMA 3M43A 1OFDA 4FNTA 3G1FA 4PA8A 1VHNA 3KVKA 2A6NA 3UY8A 1JJKA 4PL2A 1D3GA 4UFJA 3CT7A 1CI1A 4Z08A 3C2VA 1O4UA 5AC7A 5IBXC 5FF3A 3WK3A 1OVDA 3FKKA 1CX9A 1K03A 3HO8A 4LUJA 1P0KA 3D0CA 3G0SA 3DHDA 4DF2A 3QJAA 4K39A 2GQ9A 3DFQA 2PC4A 4O1DA 1R30A 3LHZA 1DQXA 3LCWA 4UMAA 5LGXA 3LXAA 4NXSA 2C19A 1YXYA 4E38A 4DEFA 1X6UA 3UD6A 2B7OA 3W7OA 2GOUA 3ZS4A 4JTJA 3O16A 1Q6RA 2Y70A 2ZRXA 3LCLA 4BI5A 1Z44A 3A9IA 1MSSA 3R13A 3RU6A 1EP3A 1O95A 4FNQA 4GUFA 1W31A 1ICPA 1C9DA 3ATZA 3MP4A 4FNRA 2J27A 1TPWA 1QFEA 3PB0A 4JTEA 3I6RA 1H63A 4OT7A 3G0XA 1FDYA 1VGAA 5DXXA 3DENA 3R2GA 4XBSA 1SZFA 3SSJA 4UNLA 1I45A 2B7QA 3PULA 4O1BA 3V1PA 4UFMA 1QOPA 4O28A 1K8YA 4M7TA 3Q94A 5KITA 4DBDA 4NNCA 1L6WA 1TTPA 3W7JA 1PL9A 2WOQA 1ZAJA 3IIVA 1N7KA 2TSYA 5CG7A 2YW4A 3KXQA 1TTIA 1KV5A 2V30A 3S8HA 2J6XA 4K6AA 2Z1BA 3N9RA 3GX9A 3N3MA 5KTLA 2NV1A 3GR8A 1H1ZA 3MUXA 3B8DA 4CCCA 1HO1A 3WJZA 1X1ZA 4NT0A 4AF0B 3NQ8A 1XUZA 1DKWA 5KZMA 3W84A 3GVGA 1A5AA 1JULA 3EXTA 3W7KA 5BOOA 3DU0A 2FPTA 3DAQA 4XWUA 4JTKA 3G3MA 2CW6A 1OF6A 3FYOA 1FCVA 3ABOA 1D9EA 3USBA 5HWMA 3IIOA 3KX6A 4YWIA 4A21A 5E0KA 4IJBA 5K4XA 1KLYA 2WNQA 5CZSA 1XXXA 4M6VA 1UB3A 3LM7A 3F1QA 3SR7A 3TC6A 4DO6A 1ZENA 4M5PA 1F5ZA 3GYEA 2E6DA 3P80A 3P62A 3C2FA 3QSRA 5D2TA 4L4LA 2Q3OA 3LTPA 4K7YA 4LC6A 3N19B 3QC3A 1YDNA 3O6DA 1SFLA 3U2OA 4ZQOA 1VLIA 3HG3A 4ZQPA 5EBUA 4IMFA 3O06A 1RQBA 4BFAA 2A85A 3EX4A 3IVUA 1W5OA 2C13A 5DXYA 2DZTA 5FF0A 5LNVA 4EIVA 3MI3A 3LTSA 1WX0A 1H60A 3NQ6A 2QCMA 3S42A 1DVJA 3HGRA 2Y88A 4LOCA 3VI2A 1MEIA 3LB0A 1R2TA 3C0JA 4R33A 4IGHA 4WOZA 1F76A 4IPIA 1PCKA 4MVAA 4QQ3A 5BMWA 3PF3A 4K37A 3W1QA 4FXRA 1RR2A 2E09A 1J4EA 5AC8A 4XBKA 4BI7A 3FIGA 3N34A 4A29A 3QMSA 4N6FA 1K3UA 2NXIA 4K36A 5HUPA 5AHNA 5DBTA 3TQVA 4O19A 2A1YA 4UFIA 4DF1A 2NX1A 4HIBA 1EIXA 3RLVA 1QWGA 2J88A 1V5XA 5G2HA 2XFWA 2ISVA 1OX6A 2V8ZA 4KWWA 3LGEA 5AOUA 3CWOX 1ALDA 4NZFA 5CZ0A 4JXCA 2VFHA 1AL8A 2QCHA 3GZ3A 3M6YA 2R94A 1GG0A 2QR6A 3IIZA 1B57A 1OK4A 1OFEA 3MI2A 5D2VA 4Y8FA 1Q6OA 1SSDA 1T99A 4IX2A 4AXKA 5D2XA 1VH7A 5BMXA 4LV4A 4PH6A 3S5OA 2YSWA 4UTJA 2TYSA 4XUGA 1YXDA 4LV9A 4M6PA 3W1TA 5L9FA 4JIQA 4GUIA 1SZNA 1YTDA 5LKYA 3NPXA 5AYZA 1FWWA 2ZA2A 1RV8A 3Q37A 1K7EA 5F1VA 5EKYA 3W7QA 1ME9A 4HKPA 4NX5A 1H7OA 2P10A 1DHPA 3KOFA 3MBDA 3BGJA 3HJZA 1W56A 1ZAIA 1Q3NA 2BSLA 3NXFA 2RH9A 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 3MHU A;  3S1V A;  1VZW A;  1XBZ A;  1B4E A;  1NF7 A;  1WBJ A;  4PL1 A;  4FEZ A;  3UWQ A;  2I14 A;  3RF9 A;  1OFQ A;  2VFF A;  1FCU A;  4XTI A;  1XC4 A;  2R91 A;  3H53 A;  4UTM A;  1FBA A;  1S3H A;  3B06 A;  1A50 A;  3CWN A;  1LRN A;  2V82 A;  6ALD A;  5DN1 A;  1P4C A;  1TV7 A;  2QAF A;  4FX7 A;  4NZJ A;  3BO9 A;  2ZZ6 A;  1PE1 A;  3ANY A;  4RX0 A;  4UCG A;  3L68 A;  3WJY A;  4BK9 A;  2JKP A;  3W2L A;  1F73 A;  3M9Y A;  2CU0 A;  5LHF A;  3DXI A;  5D37 A;  3W72 A;  2PUR A;  3E96 A;  4XTD A;  5AHE A;  1WAU A;  1X8F A;  1YTK A;  1JQX A;  5D2Y A;  2QCF A;  5F4S A;  2VC6 A;  3NM1 A;  3L5L A;  4FIR A;  5AFD A;  1JUE A;  2QUU A;  3NPV A;  2OX1 A;  2W79 A;  1AG1 O;  3SGU A;  3B4U A;  4HNV A;  3NQD A;  1OYC A;  1JVN A;  3MBF A;  3NQC A;  3QPY A;  3CHV A;  4LNY A;  3I7Q A;  4MKN A;  4OWG A;  5K9X A;  5FF7 A;  4DXV A;  5F2I A;  1AL7 A;  2EKC A;  2QCL A;  2J9X A;  3W74 A;  3CLM A;  2ZBT A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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