4UTI | Genus

Total Genus 128

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	128
sequence length	359
structure length	359
Chain Sequence	SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGFLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Redox-dependent substrate-cofactor interactions in the Michaelis-complex of a flavin-dependent oxidoreductase doi rcsb
molecule keywords	NADH:flavin oxidoreductase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas putida
total genus	128
structure length	359
sequence length	359
ec nomenclature
pdb deposition date	2014-07-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4utiA00

3B04A 2FPVA 5G1TA 3UY8A 2C3ZA 2FPYA 1R2SA 2ISWA 1ZY9A 3U2OA 4E2BA 4JTIA 3UY7A 1EP3A 2EPHA 4XTIA 4OQVA 1Y0EA 2QUTA 1KTNA 2RKXA 5C6MA 4WUIA 4FXSA 4QNWA 3W1QA 4HKPA 5TIMA 1OFBA 4M5PA 4Y8FA 2VFEA 3QW4B 3UWYA 2V0TA 1EP1A 1JCLA 2QUUA 3PF3A 1KFJA 3ZR4A 2WV8A 1ZNNA 4N4PA 5U7SA 3G1XA 2ZRZA 3P61A 3R2GA 4LOCA 3S1UA 3PY2A 3FKKA 3F1QA 2GVLA 3OEXA 1QNVA 4KKXA 3TAKA 4ZZ9A 4NJGA 3KVJA 4UTIA 3FKRA 4UFLA 4A22A 3NZRA 1S3HA 4ONVA 3JRKA 1RV8A 1G67A 2Y70A 2VEKA 3TCEA 5AHEA 3W2JA 5T26A 2CU0A 2E5BA 4JIPA 1XUZA 5F1UA 1TPVA 4O1BA 1TRIA 1LCOA 4JTFA 1OG0A 3PWAA 1A53A 3V75A 4DELA 4L4MA 4JTHA 3NNTA 3EWUA 4LVDA 4O50A 4ZL1A 1G4EA 1I2NA 3TC7A 4LNYA 1Q6OA 3C6CA 2Q3RA 2VEPA 4DO5A 3W7KA 1OFPA 1F6KA 2FJKA 4O1CA 5AFDA 5D2XA 1WA3A 4QIUA 2HS6A 2ZRWA 4JR5A 5C5YA 3IVSA 1VLWA 5HWNA 3SGZA 4WXYA 5C2XA 1RD5A 4FB7A 1MO0A 3GK0A 1W5QA 3QPZA 4KFPA 4XWUA 1QR7A 1VC4A 4CQ9A 1OFDA 2OT1A 1B57A 4JTLA 4WZHA 1ICPA 1HO1A 1TTPA 3OA3A 4JTEA 2R91A 5HINA 4NX0A 1WBHA 1L9WA 3EEGA 3NPUA 2JKPA 5E93A 3QMSA 3G0SA 1LBFA 4HNUA 2QCEA 3FJ6A 4LVAA 2DZXA 1HL2A 2X1TA 1VLIA 3VNDA 2PRLA 2H8XA 3EB2A 1JUKA 3NXFA 1R30A 1GQNA 1X6UA 2B0MA 5AYZA 5D04C 1QCWA 3W2UA 2A7RA 5D2WA 1VJIA 3EKZA 3W7IA 3Q58A 3R5EA 3P8IA 1LRQA 2CZDA 3EX6A 1ZFJA 1F74A 5EL1A 3DFQA 3NZ1A 2V2HA 1OYBA 3PUOA 3W1RA 5FF4A 3FYPA 2VXNA 1VR6A 1KFCA 4EIVA 2TRSA 4Q33A 3W87A 1TPB1 2JK2A 4U4MA 2A5HA 3CWOX 5HMSA 3QPYA 1TO3A 1PCWA 3NL2A 1V5XA 1TPUA 4DPPA 3HQ1A 1W5OA 2CZEA 3LRLA 4A2RA 3GDKA 3IIXA 2W79A 4OV9A 2QCMA 2ZTJA 3NM1A 3W1AA 4LVBA 4I7UA 1TV7A 5I3JA 2EF9A 1M5WA 3OHIA 3O6CA 2E77A 1SQ7A 5AB3A 4O28A 4DXVA 1JCJA 1RVGA 4UXDA 2ZZ7A 4YCOA 4JN6A 3TV8A 2V81A 2ATMA 3TFXA 1FXQA 2PCQA 3O1NA 1EPXA 3TK7A 3Q37A 3L2IA 1VPXA 3PAJA 3P67A 4QM1A 2ZA2A 1O5KA 3FIGA 4EWND 5AHNA 3GAYA 2CLOA 1KBJA 3QZEA 4LS2A 3G22A 4IX2A 4CNNA 5CZ0A 3PS7A 4YXGA 2P0OA 5LNSA 3DGRA 1IXOA 3GNDA 5CPOA 4DPQA 4WX2A 3W75A 4AB4A 3WJSA 1OYAA 1ICSA 1YDNA 3WJXA 1XM3A 4NUWA 1VCFA 1MSSA 5D33A 2DP3A 3O07A 4PL1A 3N9RA 3BG9A 4MZ1A 3TDFA 3NM3A 3EXRA 3H55A 4OE7A 2J9YA 1AW1A 2Q8ZA 3BLFA 5G2HA 1W56A 3TQ0A 4OGZA 1QAPA 2WNQA 5EYWA 4O11A 4WD0A 1TJRA 3P62A 3BPWA 2FTPA 1LRNA 3LOTA 1P0KA 2PRMA 3NQVA 3WK2A 1NF0A 3PG8A 4JTGA 1F5ZA 3W7EA 5EBUA 3RFAA 5I3FA 1SSDA 2GOUA 4AAJA 4R7JA 3LCWA 1T96A 1H60A 1CW2A 4K39A 2QCDA 4ML9A 3L21A 3G1AA 3T78A 4Z1AA 4YL2A 2RDTA 3EX3A 4JYEA 2V5LA 4O8RA 3PULA 2E1DA 5AC7A 3HG2A 5D38A 4MLRA 1IF2A 1LBMA 2R14A 4FO4A 4AH7A 2ZA3A 3P7YA 2J27A 1KFBA 2WNNA 3IV3A 2NX3A 5DXXA 4JS3A 3W1NA 3I68A 3TQKA 1KFEA 2X2GA 4A2SA 4YCPA 3R89A 4O0KA 3BW2A 1H7XA 4HHPA 4O16A 5G4EA 5H91A 1C29A 1HG3A 3W7CA 2FLIA 2P10A 3G1VA 4NJIA 1SU5A 3DXIA 4NXKA 3BGGA 4S1FA 2F7FA 3C52A 3CWNA 4HNTA 1XFBA 3S9YA 4QSHA 2JGQA 4GNJA 3UXDA 5FF7A 2HMCA 4GXMA 2H6RA 3S42A 1JCYA 1R46A 1G4SA 2Y7GA 5I3IA 5D32A 1SZGA 4IMFA 1J5TA 3LCLA 1GZGA 3QSRA 3G1FA 5K9XA 3QSTA 1KM6A 4DO6A 3W70A 3ZWSA 2X1SA 1FCBA 4NZFA 1A50A 2EGZA 3CC1A 1FCUA 4R33A 3BGJA 4R34A 3STCA 1UBSA 3G0UA 1MEIA 2A6LA 1QPQA 1DJNA 5LSMA 2ATSA 3NQCA 1FY6A 3NPXA 4ORIA 3LB0A 1QO2A 1A5AA 1WXJA 2Y89A 5CPNA 2GUUA 4AWUA 3UNDA 1IXPA 4N6EA 5BOOA 1N8FA 5C54A 3G8RA 4YMZA 1I2QA 4FF7A 2YDAA 4N4QA 3G8EA 2ZFAA 3DFTA 3P5ZA 1TPEA 1JCMP 2JKAA 3SSJA 3PUEA 4C1KA 3U8GA 5HWJA 2QJGA 4IMGA 4AMAA 3B4UA 1PL9A 4UR8A 2V30A 3O06A 4IUOA 1C8VA 3PB0A 1EX5A 3USBA 3CPRA 4LS0A 1LOLA 4N9BA 4XUGA 4A21A 1OX5A 2O7QA 3NL6A 4JIQA 3LRKA 1D3GA 3LHZA 3GXTA 1EWEA 3C4UA 1MEHA 5A5WA 1SW3A 1KTCA 2FDSA 3T4CA 2ZCGA 4FNSA 4DF1A 1Q45A 3VFLA 3B8DA 4AVFA 3M16A 3TKFA 6TIMA 1YDOA 3GKFA 2D73A 1VRDA 4MY1A 5F4SA 1UASA 1DQWA 1ICQA 1QPOA 3NQMA 1N55A 1WBJA 1X8FA 1EWDA 2BTMA 3ANYA 3ELFA 1AW2A 3HPZA 3UPWA 5FF0A 3A24A 4ALDA 2E5CA 4EVZA 3ABQA 1H63A 5CZJA 4KWVA 1U5JA 1QPRA 2BWGA 3HPXA 2VELA 4NJHA 1W37A 5H2ZA 3BW3A 1NAL1 3QMTA 3F4NA 3CM4A 1SO6A 1LRTA 2WQPA 2G5WA 1C9DA 4OU1A 2GQAA 3IGSA 1XDLA 2YPIA 5G5IA 2DZSA 4IOTA 3LCXA 3GLCA 4TR9A 3SZ8A 1JCNA 2ZYFA 1FUYA 3RK8A 4NNAA 2BXVA 1G7VA 3DI1A 4UIOA 1W1ZA 3W72A 4FNPA 3RLVA 1W54A 1L6YA 1H62A 3NO5A 4EOUA 1OYCA 4UFJA 3C61A 3MUXA 3MW7A 2DZTA 3HGJA 4PODA 3S5NA 3O8AA 2E6YA 1WV2A 1OFRA 3P82A 3GXNA 3GR7A 2B7QA 1OX6A 3MI2A 3TU9A 3S5YA 3MP5A 3C0JA 1G4PA 3TROA 5D09A 2TYSA 4FNQA 4RZ6A 1FWRA 5BRBA 1KLZA 4XQ6A 3NA8A 3GNNA 4PFMA 1O94A 4E2DA 4N02A 3N2MA 3BG5A 3C8FA 1GPWA 1WYIA 2J24A 2J9XA 3S1VA 3QEZA 5FI8A 4NXSA 3W7HA 2VFIA 3LV5A 3EWXA 4QISA 1H7OA 3NQAA 2RDWA 2YW4A 4NVTA 1K7XA 2VKZG 3NR0A 1SZEA 2NX9A 5AHFA 4QAIA 4HNVA 3PSWA 4A29A 3A22A 5G2IA 4ZQOA 4CQAA 3R8RA 2Z6JA 4I7VA 3O6YX 1LLWA 1VHCA 1VCVA 1OFOA 2I14A 3GIYA 1XUUA 5E1QA 4ADUA 1R47A 3QYQA 5CZSA 3FLUA 5F2LA 5LNRA 1CI1A 4UTMA 4X2RA 1ONRA 3TH6A 4X3ZA 3EWYA 1DVJA 3M1ZA 3W1PA 3G1DA 1AW5A 2OT0A 3NAVA 4UC5A 1OFAA 5D30A 2YXGA 3W85A 1OFQA 3HJZA 3LHTA 2YCEA 2Z1BA 3C2RA 3O16A 3OIXA 4MZ8A 1UCWA 5I3HA 2B7PA 3M7WA 3N3MA 1I2RA 5KZEA 3S5ZA 3ABRA 4ZVJA 3DKJA 5DLCA 4IGHA 4MVAA 2FB2A 5LHEA 5IBXC 1K8XA 3TJLA 2QCDB 3P80A 4PH6A 4FX8A 3LHYA 1F73A 4M7SA 3A5FA 4UFIA 4DBEA 5BNKA 5DBUA 4LRSA 1K8YA 5CZTA 4UTWA 2TMDA 1DJQA 3QW3A 3JR2A 3FA5A 2DORA 4ICNA 3HPSA 2PC4A 1VZWA 3PB2A 3T7VA 2YGYA 3SI9A 1Q6LA 4O19A 3ATZA 4AHOA 1TTQA 2OZ0A 5BW6A 2FIQA 3HBLA 3TXZA 2E09A 3LCGA 1Z41A 4W9TA 4R53A 3GKAA 5HUPA 3C56A 2WJZA 4Q32A 3F4WA 3PVFA 1GTEA 2QJIA 2YX0A 4JYDA 5KINA 5DCDA 1ZAIA 4CQ8A 5HWMA 2JBMA 2ZZ4A 3NL5A 2Z6IA 2A7PA 3KXQA 4JYFA 1EUAA 3GXPA 3LBMA 2O7SA 2E6FA 1JRBA 1H1YA 3HMJG 1A5SA 3L0NA 2GQ9A 1Z42A 4ZQNA 3E9AA 5CPMA 3T40A 1TPWA 3W84A 5F2IA 4FXRA 2EAWA 2ZZ2A 1FXPA 5D03A 3QFEA 3F03K 5CKSA 2TSYA 1K02A 3IGXA 2XN1A 2GJLA 1M6JA 1GWJA 4OV4A 3A9IA 4IWWA 2DU2A 3CB8A 1YPIA 4BI6A 2BSLA 3BVJA 2ZTKA 4MYXA 3KOFA 5F4XA 4XBKA 3LHUA 3ATYA 3I7RA 4FEZA 1JUBA 1XBXA 3ZFHA 3LXAA 3CT7A 3IIPA 4XKYB 1W8SA 1SR9A 2A7NA 3R12A 3TIMA 3KRZA 3SECA 4AHPA 2CWNA 1O60A 1EIXA 3HB9A 5CSSA 4JTUA 3LHWA 4UTWC 5HR6A 1JQVA 3LCIA 3SR7A 3A21A 1RR2A 1KM1A 3I7SA 1OK6A 1GVRA 4NU7A 3MHFA 2CLHA 3NEVA 4RCXA 1YYAA 4BR1A 3W07A 2PE4A 1ME8A 1G69A 3BO9A 4Z08A 3DFPA 1TQJA 2RDUA 1WX0A 2E68A 1I4NA 3LV6A 3WJYA 2QAFA 3G18A 2G97A 4UTJA 1W3NA 1EEPA 3LBCA 3DH7A 2NUWA 4UUIA 2J88A 4NZJA 4LS1A 5C55A 2QF7A 4K8HA 3L66A 3MHGA 5DCBA 5E0KA 4CCEA 3W2LA 3C2EA 2CZFA 2CLLA 2X30A 4O1AA 5K4XA 2VEIA 4AWSA 1YXDA 2B7NA 4IXHA 2C15A 3LXCA 1JUEA 1D9EA 3M5XA 5EKYA 2WSRA 3RU6A 1H1ZA 2H3BA 1OK4A 4GRSA 4N9EA 1LOSA 4HPXA 4CCCA 3PC0A 1S5WA 4O53A 2DZWA 5TQLA 1PHQA 4K6AA 1PCKA 1B3OA 3DENA 1G7UA 4UNLA 3L68A 1SFLA 3TNOA 3PBVA 1QFEA 1TPC1 2E6DA 4Y6GA 1FWWA 4UMAA 1XC4A 4TO8A 1TV5A 4IMCA 2Y6ZA 3CTLA 1HO4A 1DHPA 3LHVA 2QCHA 4TU1A 3STEA 3HG3A 4LT9A 1B4KA 3W7DA 3S1WA 1FDJA 1Z48A 4UMBA 1WDWA 4RK8A 4FHAA 2NV2A 2X1UA 4O15A 4JX4A 3KVKA 4AXKA 4PEKA 4IXXA 1XDMA 2Y7FA 4MOZA 3QM3A 1SO5A 3IEBA 4IQLA 4E38A 3DHDA 4OWGA 4O0ZA 3L0KA 1KBIA 1OX4A 4LTSA 3BK0A 4UR7A 2NXHA 3B0PA 2BLEA 1FX6A 1YXCA 2C18A 3GDRA 1OFEA 4GUGA 4HN4A 3L0GA 4RJEA 3EX2A 1B9BA 3W76A 2Z0IA 3B06A 3NYZA 4O57A 1F2JA 3DI0A 1FDZA 4ZQPA 3MBDA 5LKYA 4LUIA 2G96A 2QCLA 3K30A 1OF8A 1G4TA 2J9ZA 2QDHA 3P5YA 3G1YA 4AEOA 1J2WA 2W0UA 2B4GA 3QJAA 4UTLA 2QKFA 5LZLA 5GVJA 4K7YA 3BLIA 1GYLA 2JKEA 3LDVA 3PR2A 3HG5A 4LUJA 3TMQA 1ZENA 3A23A 4M6QA 4O52A 3W2KA 2H90A 4NJJA 1XBVA 4FX7A 1NVMA 1GJPA 7TIMA 1TTIA 3LTYA 5AC8A 2OCZA 3GAKA 3I6RA 3FS2A 4MFDA 1SSGA 4UMCA 5AN7A 1G6CA 4NJKA 1THFD 1XCFA 3LTSA 1TPH1 4TMCA 4GUHA 3MYOA 1PHWA 4HIBA 1T8XA 3QQ0A 1JCXA 3NG3A 3EWBX 3PUDA 2AAMA 1M7PA 3N19B 2BZNA 2QEZA 4MFEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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