4UTJ | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	360
structure length	360
Chain Sequence	SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGFLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLER

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Redox-dependent substrate-cofactor interactions in the Michaelis-complex of a flavin-dependent oxidoreductase doi rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas putida
molecule keywords	NADH:flavin oxidoreductase
total genus	126
structure length	360
sequence length	360
ec nomenclature
pdb deposition date	2014-07-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4utjA00

5LNRA 4O1DA 1SW3A 1UUOA 3MO7A 1JCJA 2TRSA 5CGQA 5AHEA 4OWGA 4TIMA 4AAJA 1KV5A 3LLDA 2Y62A 1YXDA 1VHNA 1K02A 3EXSA 1Z42A 2Y61A 3LHWA 2YCEA 1JCNA 3DKJA 1KTCA 2CLLA 1SZNA 1GZGA 1LOLA 3ABOA 1EUNA 3CEPA 1U83A 5CPOA 3W7OA 1XCFA 2W79A 3E12A 3IIXA 5K9XA 2A21A 3EX1A 3W22A 3HG3A 1JR1A 2H6RA 3NL3A 4O1AA 1QR7A 3NM1A 5AHFA 4O1CA 2P10A 4K7YA 3VNDA 3NEVA 4ALDA 1XBVA 3R13A 4Z1AA 2PRMA 3C2FA 2H3DA 3WK2A 1QPNA 5D38A 4JTSA 3WK0A 3GDRA 2NUXA 5AFDA 1C8VA 3IIZA 4BWLA 2JGQA 1SSGA 4CLMA 1Q45A 3L67A 5HWMA 1TRDA 1ZAHA 1MO0A 5AYYA 2ZYFA 4JS3A 3TW7A 4EF8A 2F7FA 2I9EA 1N7KA 4O19A 1TMHA 1MEIA 4L4MA 5CKSA 1OFDA 3ZS4A 5J5DA 1TIMA 3W75A 1LLZA 4RJEA 5F2MA 1YDNA 3QEZA 4GFSA 3FA5A 1JJKA 3ZWSA 3P67A 3P81A 3BARA 4K8EA 3C4UA 3O6DA 3HIJA 3SIZA 4WY0A 2HS8A 3P61A 3UWQA 4N4PA 5FEXA 4DPPA 3KFTA 1K03A 4OU1A 2HMCA 3B0PA 1FX6A 4MPQA 1GTHA 3DFTA 1M6JA 3TAKA 2ZA2A 3SR7A 1JCYA 5D2TA 2JBMA 2Y63A 4HNTA 1UASA 4UR7A 2Z2UA 2PE4A 4HSNA 3ZWTA 4RV8A 1QOPA 1RPXA 1HG3A 5CPLA 5CPNA 1EIXA 2GQ8A 3QQ0A 2QDGA 6TIMA 2DZWA 5CZ0A 5AYZA 2QJIA 4N9BA 1TTJA 1VCGA 3SJ3A 2NXGA 3PAJA 5CG7A 3G1VA 2FLIA 1YTEA 1EA0A 1IIHA 4IJBA 1KTBA 2ZZ7A 2YYTA 4AF0A 1I2RA 1TJRA 3TX9A 2ZRWA 1PCWA 4R7JA 1DBTA 4UTTC 1VCVA 3W7QA 2YR1A 1PS9A 3HO8A 3MHGA 1W3NA 2EPHA 3NM3A 4MLJA 1LROA 4KFNA 2OT1A 1NF0A 2GQAA 1G4PA 4NNAA 1L6WA 4UMCA 1NSJA 3W2JA 1Y0EA 3RF9A 4DF1A 4UTMA 4DO6A 3E9AA 3N2XA 3HGOA 4AH7A 4EF9A 1XBZA 3L0GA 3QRHA 2YFOA 3OBKA 2YXGA 4UTWA 3PG8A 4O16A 4JTEA 2BWGA 1GYNA 4WJEA 2KZHA 3V75A 3FLUA 1TPWA 2E6AA 2CZEA 4GNJA 4PFMA 1SW7A 4AHOA 4ZZ9A 3M7WA 3TQ0A 3E96A 2HS6A 2QCGA 4U4MA 3EX3A 4ZVJA 3HPSA 3W6YA 3QQ1A 1BTMA 3TA6A 3BG3A 2H8ZA 2OJPA 4CCCA 3O1NA 3B04A 1PL9A 5FI8A 2H3BA 3S1VA 4FX8A 4XTDA 4GBUA 4NZJA 3W1XA 3UZ5A 2DZXA 3S5ZA 4WY0B 3KAOA 4LWWA 4MVAA 3GDTA 4TR9A 3VKJA 1R2SA 3W7GA 3L2IA 4H4IA 5DXYA 1THFD 1TPB1 1KM4A 3P74A 4AWUA 2QF7A 5I3FA 3M5VA 4DO4A 4I7UA 3PB0A 3D0CA 4HPXA 5AYXA 4ZL1A 3QFEA 1VYSX 3PWAA 2ISVA 3NPXA 4LS2A 3MBDA 4TMBA 3FEMA 1QPQA 4LVGA 3S9YA 1XUZA 2YW3A 3TXVA 3BGGA 3W23A 1JUKA 1N55A 1ZJIA 2VKZG 4Y90A 3WK1A 1DL3A 1QOQA 3USBA 1B4EA 4UXDA 2X1UA 3LX9A 4ADSA 1EP3A 5G1YA 3Q2DA 2A85A 1VC4A 3LRLA 3THQA 3N34A 3W7EA 1LTDA 3L68A 3PSVA 3TU9A 4AF0B 1TV7A 2WO5A 2Q3OA 5K7JA 4MZ8A 2WKJA 3BW3A 3L9CA 3OVPA 2NWRA 5K2ZA 4OBTA 4NJIA 4S2BA 4MFDA 1S5VA 1P0NA 3TMQA 3TSBA 1QWGA 5HUPA 2Z6JA 5LZLA 4Y6GA 1A5AA 4LC8A 2VFIA 2QJHA 3OG3A 3W07A 3SI9A 1HL2A 3UYCA 1VQTA 2TSYA 2DP3A 3W2MA 4HT3A 1AW5A 4JIPA 1O4UA 4QNWA 3EWZA 1H7XA 1L9WA 1VR6A 2QCHA 2TPSA 3FJ6A 1A5SA 1YTKA 3PB2A 5D2YA 2QJGA 3GDMA 1FDZA 4I7VA 2E6YA 2VEIA 1OG0A 5DLCA 2R8WA 3C56A 5FF7A 1PE1A 2V81A 3GXPA 3P8JA 4I9AA 4A21A 4WY0F 5D33A 3G1FA 3UQNA 4QJ1A 3U8GA 4BK9A 4LVDA 1ZNNA 2FB3A 3EEGA 5AHMA 3W1PA 2D73A 2QCMA 3LV6A 5G2IA 3O06A 3G22A 4IMDA 1HO1A 3FKKA 3TSMA 1LYXA 2C6QA 4PTNA 3PUOA 2QAPA 3KVMA 5D2XA 1GJPA 1W3TA 1F73A 2DZSA 3TSDA 4JIQA 3LBMA 5MHBA 1VGAA 1RQBA 1IXQA 3DI1A 2A0NA 3QMTA 2A7NA 2ZRYA 1KLZA 2RFGA 3IIOA 3NQ6A 4M7SA 2QUUA 1SZEA 1VCFA 4M7TA 4XBSA 3V1PA 4AWSA 3W1LA 4ZQCA 5EKYA 2QCEA 4WXZA 2WSQA 4DBDA 4LVAA 4UTLA 2E68A 1KW1A 2C3ZA 4E0CA 3A24A 4H3DA 1MEWA 1LM1A 3OA3A 1EP2A 1UBSA 3LCGA 3UPWA 3G0UA 5D03A 2QR6A 1PHWA 1SW0A 4JXCA 3M47A 4IQLA 3NGJA 4FHAA 3CQ0A 1YTDA 4N2YA 5DY3A 5EYWA 1LBLA 2CLMA 1OYBA 3PBVA 5LGZA 4FNQA 3M5XA 4JTUA 1A5BA 3W1MA 4GRSA 4M19A 2Z1BA 4CQ9A 1XL9A 2A5HA 4N4QA 3N2MA 2EKCA 3GR7A 4WXYA 3SFKA 3G8EA 5E0KA 5EBUA 1J2WA 4UCGA 2C19A 1F05A 4M6QA 1LOSA 3L5AA 3GK0A 4IXXA 4M6VA 1JULA 3I7RA 3LOTA 3W1RA 3ZFHA 4UFLA 4HNUA 4UMBA 4IGHA 1W0MA 2LLEA 4JDYA 5GVJA 4NJJA 4O14A 4U28A 4C1KA 1Q6QA 3RU6A 5CSRA 3VFLA 1YPFA 3NQCA 1VYPX 2B7NA 1I2NA 3LCWA 4E2BA 1F76A 1VHCA 2ATMA 1FUYA 2V5BA 3O6YX 5LHFA 4DF2A 3MP4A 3NQ8A 5CZJA 1OVDA 4NX5A 3LBCA 3YPIA 2C1HA 1OX5A 1OFPA 1C29A 1G7UA 3W1AA 3Q58A 5U4NA 3IEBA 5FF2A 1ZAIA 5IBXA 1PHQA 1FWSA 5U7SA 5EMUA 5HJLA 2A7PA 3IVUA 3G3MA 3M5ZA 1TB3A 3TW6A 4RXGA 1QNVA 4RXFA 4QIUA 1CW2A 2C16A 3RMJA 1F6KA 3G1YA 1LRTA 1W3IA 3A5VA 1DJQA 3UXDA 3TJLA 5HNRA 3M5YA 1G4EA 1KFEA 4PL1A 2ZQ0A 4O4WA 4NJHA 3TAOA 2NX1A 2OX1A 4O57A 5LSMA 1FXPA 2FPYA 5HWJA 1SR9A 1W5NA 1VZWA 3QW4B 2X1RA 2Y7EA 1KBJA 1I45A 2Y6ZA 5DCEA 1GVQA 3UD6A 3C2OA 2TYSA 1I2QA 1SO5A 1JRBA 1X6UA 3W71A 1OFQA 4HNVA 5C54A 3E49A 1KFJA 2R94A 3DFPA 3TCEA 2CW6A 3LHUA 2FJKA 1KM6A 3FYOA 3GR8A 2CZFA 2QCLA 1JUBA 4NNBA 5AHLA 4D2JA 4PODA 4UTWC 3BGJA 3DGRA 3G0XA 4LRTA 5CPMA 1G6CA 3A5FA 3NQGA 4FXSA 4OGZA 4MY9A 1TRIA 4Z1DA 4K8HA 4FNUA 4OT7A 2NXIA 1W31A 2C18A 3EWXA 3PG9A 4RZ6A 1V5XA 2Z6IA 1VPXA 3EB2A 5FEZA 3KRSA 2DORA 3PC0A 4YL2A 4RX0A 1WDWA 2QCNA 1OFAA 3UY7A 1SQ7A 4R34A 2GVGA 3WJXA 3P5YA 2GJNA 1RQEA 2ZRVA 1Q6RA 4JNMA 3M44A 1D3HA 1ICSA 1M7OA 3CWOX 3L5MA 1K7EA 1XDLA 1RVGA 4BI7A 2CZ5A 1UB3A 3HPZA 3NA8A 5L6UA 3W1QA 3TROA 2Y7DA 4O8RA 3T55A 4ORMA 1OF6A 3S0CA 5T26A 2FIQA 1G7VA 3NYZA 5H91A 1PVNA 1QO5A 3WFAA 1JCLA 1FCQA 3BLFA 3G8RA 3CB8A 3W7MA 3KVKA 4FX7A 4MY1A 3CIWA 3HF3A 4OV4A 1GWJA 4CQAA 5I3JA 1AG1O 3TIMA 2QDHA 3CLMA 4O54A 5AHNA 4NZFA 3INPA 4MZYA 3AJXA 2YX0A 4S2CA 4HNNA 4PH6A 2ATSA 1N8FA 3EKLA 3N9RA 2A6LA 3JRKA 4LS0A 1TPDA 3C2RA 1LORA 5K9CA 1JQXA 3DFNA 1FBAA 3TFXA 1O94A 4NJGA 1GG0A 4TMCA 3BW4A 2BLEA 5KMYA 4FIRA 2WSRA 3W88A 3C2EA 3LGEA 4Z0JA 3L66A 3PVFA 1SU5A 3KXQA 4LTSA 5BRBA 4AMAA 2R91A 5DCDA 4IMGA 4UIOA 2E09A 4NXSA 5I3HA 1L6SA 2ZTKA 4O0KA 3O6CA 1MZHA 4AHPA 4JD4A 4X2RA 1E51A 1I2PA 4M6PA 3I6RA 1WA3A 3S1UA 4ICNA 3C2VA 1YXCA 3BV4A 5F2IA 4GC4A 2O7SA 5D05A 4GUFA 2Y89A 2J27A 4NX0A 5KTLA 2C15A 3QPZA 3EX2A 3M16A 4RLIA 3C61A 1PV8A 4PEKA 3F4WA 1YDOA 3STFA 3PR2A 2OZ0A 4NUWA 3W9ZA 5HR7A 4PCFA 4RKAA 4GE8A 3HMJG 1LBMA 2NLIA 4RR4A 1QPOA 4A22A 2H8XA 2E6DA 1BEUA 1W37A 2C13A 1TTIA 3RLUA 3MHUA 5DELA 4JTFA 3P80A 2I14A 1TYGA 2P1FA 2WPBA 5HR6A 3TMLA 2EGZA 4LT9A 3GX9A 5G4EA 3LHTA 1FY6A 4MZ1A 4IX2A 4YCPA 2E6FA 4XKYA 1TSIA 3W2NA 2V2DA 2Y85A 3GLCA 2Q8LA 4QISA 2WJZA 4BR1A 5AB3A 2W6RA 4JTTA 1ZCOA 1O95A 1K3UA 3WJYA 4O11A 1TTPA 2PCQA 3IGXA 3QF0A 3HG4A 3PM6A 4Z0SA 1ZHAA 1G69A 1U5JA 5F4XA 1KFLA 3LV5A 4AEOA 1R2RA 3TR2A 2Q8ZA 4O17A 3DI0A 4DXVA 3UNDA 1OFEA 1TREA 1S3HA 1XFBA 4JTJA 5D04C 4ZQRA 5DN1A 3LXBA 1YPIA 3R89A 4E38A 1GOXA 5HINA 3PBYA 1G4SA 3NQVA 2FPVA 4A29A 4GUIA 1FWWA 4MOZA 4MY8A 4UFKA 3N3MA 3HGRA 1P0KA 1H62A 1UUMA 4R53A 4O0ZA 3DFOA 1S5WA 3KX6A 3PS7A 5I3GA 3RLVA 4JX5A 4LVFA 3TQKA 2ZZ6A 4JDBA 4WX2A 3QPYA 3NNTA 2WSYA 5K9DA 1WBJA 3P82A 4PL2A 5G5IA 4TU1A 2WQPA 2BZNA 3FOKA 3G0SA 2ZZ2A 3MP5A 4O18A 1ICPA 4HSOA 3O07A 3C8FA 1F74A 1OK6A 4L4LA 4J9JA 1OX6A 3GDLA 2Y70A 2H90A 3IVTA 1B4KA 2VFEA 1R46A 3S5NA 2VELA 1D9EA 4EVZA 1GVFA 3DKLA 3LHYA 3UWYA 1NAL1 1AW1A 3ATZA 1FDJA 3HG5A 5LNSA 2C14A 2VOMA 3G1DA 2A6NA 2PRLA 1QCWA 1TPFA 2VEPA 1FQ0A 3P7YA 1B3OA 3THAA 3W7JA 2CLFA 3ANYA 4MYXA 3A9IA 1A5CA 3TV8A 1ME8A 1AW2A 1MXSA 3PSWA 3LI1A 4MYAA 3LB0A 1TPEA 2VEKA 3NXFA 4LNYA 4WOQA 1GQNA 3UWWA 3UXAA 2J88A 2CZDA 2V2HA 3GVGA 4IPJA 4EOUA 3B0UX 2E77A 1QFEA 1AL8A 5DBTA 4JX6A 3CHVA 4O1BA 4C1LA 5I3IA 1H51A 1A53A 1LP6A 3UZJA 3GB6A 1EB3A 1M5WA 5HQEA 4FF7A 5LHEA 3T44A 3ATYA 3EWWA 1H1ZA 4FNPA 4K7VA 4FNTA 4FB7A 3EWBX 2ZRUA 3C0JA 1XC4A 1T96A 1OX4A 4YLWA 1GVRA 2GQ9A 2VFGA 3LTPA 2YDAA 3QSTA 4UTJA 4JEQA 3TJXA 3ABSA 1CI1A 4IWWA 3T40A 3HBLA 2DU2A 3E02A 3PBWA 1Z44A 3GXTA 1RR2A 3HB9A 1EX5A 1LRNA 2X30A 3GIYA 4MLRA 1SUXA 1FXQA 1LBFA 2F84A 1Z48A 1GVSA 2FQIA 3N73A 3HOJA 2YPIA 3I65A 1KLYA 3RK8A 3K30A 1K7XA 4X22A 4UTTA 4LS1A 5TQLA 2ZRXA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4UTJA

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