4UTJ | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	360
structure length	360
Chain Sequence	SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGFLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLER

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas putida
publication title	Redox-dependent substrate-cofactor interactions in the Michaelis-complex of a flavin-dependent oxidoreductase doi rcsb
molecule keywords	NADH:flavin oxidoreductase
total genus	126
structure length	360
sequence length	360
ec nomenclature
pdb deposition date	2014-07-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4utjA00

1LRQA 3W7CA 3PUDA 2ZZ5A 3FIGA 4JTGA 1RD5A 3STGA 4AHQA 3EX1A 1RR2A 2ZA1A 1M6JA 3UYCA 4AF0A 4UNLA 5L6UA 4PC8A 4M6QA 4XTDA 2QCHA 2J9YA 2DZVA 3NNTA 3S6DA 4A2SA 3DHDA 4WOQA 5HUOA 1YPIA 3C0JA 4CNNA 4UTWA 3IV3A 3EX4A 1W0MA 3GDTA 3RFAA 1DBTA 2IQTA 3S5YA 2X30A 3PB2A 3SW6A 1KM1A 3M1ZA 1H1ZA 4BR1A 4L4LA 1DKWA 1W8SA 4LC6A 2A5HA 4B5NA 5CKSA 5D38A 5DY3A 4O1DA 4UTMA 2J6XA 1OYBA 3D0CA 3L0NA 4JIPA 1EUAA 2FIQA 2TYSA 4WQ6A 4AAJA 4AWUA 5AC6A 4JY9A 1FDZA 4HNNA 2YW4A 4MFDA 3Q94A 1ICSA 2C16A 2G97A 4JTSA 3B0PA 2PCQA 3L68A 3EX3A 3UWQA 5F1UA 3EKZA 4XUGA 3GXPA 3TXVA 5D03A 5LHEA 3W72A 2DJLA 3UXAA 1KFBA 1YXCA 4UC5A 1TO3A 3G1DA 1YDNA 4K7YA 3GKAA 5D2YA 2GQAA 3TQVA 1R30A 1LOSA 3G1FA 4YCOA 1SZEA 4BFAA 4I9AA 5D37A 4RR4A 3GAKA 1E51A 4NXSA 3FLUA 2O7SA 3LTSA 3L9CA 3BW4A 4GE8A 3M47A 2QCMA 3LRLA 3N9SA 4K6AA 3HG3A 5G4EA 3W2NA 4JTKA 1O4UA 4UMAA 3OBKA 4Z1CA 2CZFA 2RHGA 1OABA 1JCYA 2CLEA 2WKJA 3L2IA 3M41A 4TX9A 1VRDA 1F05A 4Y8FA 3IIVA 3UD6A 2NWSA 3HPZA 1XFBA 4RXGA 4RJEA 4E2BA 3NPXA 4HKPA 3IGXA 1YTKA 3M5ZA 4M5PA 4LY8A 3VKJA 1TCDA 2X1UA 3HB9A 1V5XA 1BEUA 2TPSA 4ADSA 2TMDA 1H7PA 3DFPA 3W1XA 1B3OA 3MBDA 5FF3A 3OHIA 4NU7A 3LHZA 3W9ZA 3NL5A 5LNUA 1IIGA 3TMLA 5K9XA 3DFTA 4FHAA 5K2ZA 3GDMA 4GUJA 3P67A 4A2RA 1P5BA 1YLVA 2Y63A 1OK6A 1HO1A 2ZTKA 2NUWA 5F2LA 4GFSA 1AK5A 3O63A 4R7JA 4O8RA 3C61A 3M9YA 1SPQA 1TQXA 2OX1A 4UTHA 2VFHA 3NZ1A 3L0GA 3DAQA 1PHWA 4ALDA 1H7NA 2XN2A 4KKXA 4NJIA 1MEHA 4LNYA 5F2GA 1GEQA 4FXRA 2ISSA 4O12A 4LT9A 4O17A 4UFIA 3FOKA 2DZUA 2QAFA 2FPYA 4R34A 2E6DA 3VI2A 3O6YX 2V2CA 3M5XA 4TR9A 3E9AA 1Q6RA 4LUIA 3GLCA 3NA8A 1RZMA 3G1VA 5TQLA 3RMJA 4I7VA 1KTBA 1TPWA 1VJIA 5D02A 7TIMA 4QSHA 3NQAA 1G4PA 1TYGA 1CW2A 4AHPA 3M6YA 2ATSA 2ZRVA 1J5TA 1T96A 3ZS4A 1QOPA 2CZDA 1OF8A 2QUUA 3TAKA 1I2OA 3W7RA 1R2SA 2WV8A 1YXYA 2BX7A 2CZEA 1U83A 4MY9A 5KZEA 3W7KA 2V30A 4RCXA 3THQA 4AWTA 3NXFA 2YX0A 2E1DA 4JTLA 3G0SA 1LOLA 2ZA3A 1XBYA 4NNBA 1B4EA 2P0OA 1F6KA 3GR7A 1JUEA 2FPTA 4NX5A 2ZRWA 3BVJA 2C15A 3EXSA 4HNTA 2NV1A 3GDKA 3W7EA 3LCFA 4DBEA 3TQ0A 4CQ8A 1Z41A 3DI1A 2NX3A 3R5EA 4UTUA 5CSRA 2FTPA 5HULA 4UTIA 3I7RA 1FWNA 3O15A 3CEPA 3BARA 3LHTA 4YMZA 1WOBA 1VH7A 2YFOA 3G3MA 3QSTA 5AB3A 1OYCA 4RZ4A 1WBHA 4TU1A 2YR1A 1LBLA 2C1HA 2VEPA 3QPYA 1MEWA 4OWGA 3NAVA 4NUWA 3PF3A 1P1XA 1KFEA 6TIMA 5CZJA 4JTFA 4N9BA 3G1XA 1WV2A 4O16A 1AMKA 3PUEA 1NSJA 1C9DA 1A50A 5G1YA 2QCDB 4BWLC 1GYLA 2H3DA 1JJKA 3PBUA 2Y61A 2ZZ6A 1EP1A 4GJ1A 4FIQA 3T78A 1X6UA 4IJBA 1A5AA 4Y90A 3S1VA 1T8XA 1WA3A 4WUIA 3WK1A 5HR6A 5DBTA 1XC4A 1VR6A 2YFNA 2X16A 2R14A 3DZ1A 3G1SA 3NEVA 4MZ1A 4GUFA 3WK3A 3P74A 3QW3A 3P8IA 4A22A 2BTMA 5BNKA 2NX1A 3OA3A 5KINA 2NX9A 5U4NA 4MY1A 3R89A 3G1HA 1PL9A 2E6FA 2E5CA 5K4ZA 3W85A 1XBVA 4A29A 3KOFA 4WD0A 3MP3A 3P84A 3ATYA 3SECA 3NDOA 3MHUA 2E6YA 2J88A 3CWOX 3LB0A 2Q3OA 4XBKA 1JUBA 1PCKA 2DJXA 5FEXA 4PCFA 1ZFJA 1F7BA 2Y7DA 2PURA 3LHYA 3R13A 1L6YA 4Q33A 1MZHA 1V7YA 2CZ5A 1I2RA 1H61A 3WJWA 4S2CA 4NQ1A 1NEYA 5F2IA 3V1PA 2VELA 2ZRYA 4UMBA 1T0OA 5KSWA 3QW4B 1HG3A 4O4VA 3LOTA 1VGAA 1JUKA 4GNJA 3W1UA 3W86A 2VFDA 1EP3A 1G67A 3LHUA 3W1AA 1QMLA 1UASA 2TRSA 5DCBA 5KITA 5KZMA 3L21A 5G5IA 1G4SA 3W7GA 1A5BA 2C3ZA 1GTHA 2Z6JA 2Q8ZA 3CEUA 1VLWA 1IIHA 1TPEA 2H8ZA 2VFFA 3WK2A 3HBLA 3LCXA 1Y0EA 3LCHA 3UXDA 3LHWA 4EIVA 4UUIA 1CX9A 1F6PA 5K9DA 1VLIA 3MI2A 1TPFA 3R8RA 4Z1BA 3W7DA 3NL3A 2VFGA 1OG0A 2AQWA 2B7NA 3L5MA 3W76A 4S2BA 5AYXA 3HGRA 4O1CA 3P62A 3IIZA 4DO6A 3G24A 1AL8A 3CM4A 3TW6A 5EY5A 4MOZA 2ZBTA 1FXQA 3NM1A 5AHMA 4MYAA 5GVJA 1WAUA 4FB7A 2O7QA 4WOZA 3WJXA 1LLZA 4YL2A 2QF7A 2VC6A 2GPTA 1ZJIA 1K8YA 3N2XA 4BI7A 1QPOA 3EXTA 1L6WA 2B7PA 4IXXA 4CNPA 3NPWA 3IEBA 3DKJA 3KVKA 2OMAA 4OT7A 2A7PA 3LXAA 2FJKA 3QF0A 4CCDA 2ZZ1A 3N73A 2E5DA 2G5WA 2VENA 4HN4A 1G69A 2DZWA 4LW7A 1X1OA 1ZAIA 2EF9A 4H4IA 1ZAJA 4YLWA 1DHPA 1PHQA 2R8WA 3GR8A 1WX0A 5F1VA 1IXNA 3BLEA 1DORA 1D3GA 1TSIA 2ZZ7A 1THFD 5AN7A 3GK0A 3TX9A 4MLRA 3YPIA 3LX9A 1SQ7A 3LM7A 3NQVA 2XFWA 2JBMA 1FCQA 3T7VA 3OVQA 3LXBA 2E5BA 2PE4A 1OFOA 3A22A 1VPXA 1GZGA 3W83A 3IIXA 5I3JA 2EHHA 3FA5A 5HWJA 3SSJA 3TXZA 5KTLA 4LC8A 3EB2A 4Z0JA 4IWWA 5K3VA 2NZLA 1ALDA 3Q2DA 4MZ8A 3LTYA 3C3NA 4JYFA 2NXIA 4NXKA 2V0TA 5EBUA 5LNSA 1BWKA 3CPRA 4HNVA 2DZXA 2R91A 4OE7A 3W22A 3NQCA 4MIMA 3MHFA 2Y88A 3M43A 4JY8A 3O07A 3WJYA 1RV8A 1H1YA 2NV2A 3A9IA 2C13A 5G2IA 1J2WA 2Z1BA 3CQ0A 3E96A 2G95A 5CGQA 1VHCA 3W7MA 4ADTA 2CLFA 2GUUA 3LBCA 2JKPA 1KFLA 4A3UA 1FBAA 2QJHA 3UY8A 3UZ5A 1RQHA 4I7UA 4NT0A 4R33A 1JCXA 3KAOA 3RNDA 3FYOA 3QYQA 1UUMA 3NR0A 3ELFA 3HMJG 1KTCA 5E93A 1H60A 3CTLA 1GWJA 1L6SA 1XM3A 3OVRA 4Q4KA 1S5VA 1Q6QA 4K37A 4JN6A 2V8ZA 3A5VA 1EEPA 4WX2A 4O15A 3B0VC 4LVFA 2BWGA 1FDYA 2GQ9A 4RK8A 3NQFA 3LCLA 4AB4A 3IIOA 3LTPA 3I7SA 3NZRA 1VCVA 1QO5A 3NQ8A 3HO8A 4NJHA 3UWUA 2Z2UA 3O05A 4DELA 3G18A 2A7RA 1P0KA 1PE1A 3DU0A 3EWZA 4EVZA 4N6FA 2HMCA 2ABAA 4AMAA 4O13A 3KHJA 2GOUA 3MI6A 3M7WA 4K8HA 5LNRA 1PV8A 3C8FA 2YPIA 1SO3A 3F03K 3GNDA 1VYSX 4FNQA 1H50A 2I1OA 4IPIA 2NWRA 4WXZA 1TPUA 2AGKA 4X9SA 3ZWTA 3GIYA 4AHOA 3UY7A 4HNUA 4BI6A 2NXGA 3TV8A 4UTTA 2J9ZA 4YCPA 5D32A 1SO5A 3L5AA 4XQ6A 1XL9A 3ABOA 3R12A 1ML1A 2B0MA 1Z42A 2OZ0A 3RLVA 3W87A 2WNQA 2CLOA 2QKFA 4ML9A 4ORIA 3IRDA 2DORA 1ZENA 2A21A 3QMSA 1JRCA 3C2FA 4OBTA 2Z6IA 5EL1A 3PBVA 1DOSA 4O0KA 2C6QA 4MY8A 2JK2A 5MHBA 1R2TA 2V82A 3LI1A 1N7KA 3BPWA 5IBXA 3DFSA 1DQXA 3INPA 3EX2A 1A53A 5C2XA 2PRLA 2CU0A 3HGJA 3LCGA 1D3HA 4CCEA 3FS2A 5AHNA 3EEGA 1OJXA 5KMYA 3CWNA 3GVGA 3VE9A 3EWBX 4UCGA 1YYAA 3F4NA 3LERA 3C52A 4ZL1A 2E09A 1OFDA 1XBXA 5FEWA 4ZQCA 4ZQMA 4JX4A 4WZHA 3VCRA 4AF0B 4DO5A 2VEIA 5AYZA 3FFSA 5I3FA 3PULA 4HSNA 2BZNA 1AW5A 5AHIA 3LRMA 3RU6A 3MWAA 3G0XA 4K36A 1CI1A 1GQNA 3G22A 3C2EA 3PC0A 2V2HA 3W7NA 1O95A 4UR8A 2HS6A 4K39A 4RKAA 1M7OA 1TJPA 2QUVA 3W1RA 4QNWA 1KV5A 3THAA 3KXQA 4QAIA 2QJGA 3TR2A 1G4TA 1WDWA 2X1SA 2HS8A 3KVLA 2Q8LA 3TDFA 1LOQA 2YCEA 1OX5A 5D04C 2VEKA 5FEZA 2QJIA 2ZQ0A 2RDTA 4N4PA 1VYRA 2B4GA 4MJZA 4IX2A 2H90A 3LI0A 1UCWA 3DI0A 1JQXA 1TB3A 2PC4A 4N9EA 3V75A 4O50A 2YXGA 4DQWA 1MO0A 2ISVA 3TE9A 4RLIA 5LGXA 5CPOA 1BTMA 3TU9A 3S0CA 1SW7A 3SGZA 3ZWSA 3PVFA 4UIOA 4UFHA 2C18A 1HL2A 4JD4A 1K03A 1KBJA 1KLZA 4DF2A 4DF1A 2Y7EA 1X7FA 4TO8A 3JS3A 3B05A 4CQAA 1O94A 4LTSA 3MYPA 1TMHA 3GKFA 3FKRA 4O11A 1SUXA 1ONRA 1QPRA 2V2DA 2ATMA 1GJPA 2WNNA 4O52A 4K7VA 1GG1A 1SO6A 2Y7FA 3KVMA 5F4XA 2P1FA 1W5QA 3LDVA 1OX6A 4QISA 2C14A 2FQIA 3Q37A 3S42A 5D2VA 4MJMA 3QRHA 3L5LA 4N9DA 2UV8G 5K4XA 1Q6OA 1LBFA 1F5ZA 5TIMA 1O5XA 4JTUA 4E2DA 3TCEA 5K9CA 1EX5A 1F74A 3BW3A 3LGEA 5HJLA 3QQ1A 3QFEA 4YWIA 3H53A 1H7OA 3BGJA 3RF9A 3M5VA 2NXHA 2E6AA 4UR7A 3QEZA 3QQ0A 4LWWA 2WO5A 4LRTA 1VYPX 2Y89A 1DVJA 1K8XA 1OFQA 3ATZA 5I3HA 1VQTA 4O1BA 1OFBA 2FB2A 1GOXA 4TMCA 1H5YA 1IXQA 3MYOA 1KV8A 3ABRA 3ZR4A 3NQ6A 4OQVA 5G2HA 1WXJA 4RXFA 1KBIA 3B06A 4MKNA 3KVJA 4DEFA 4FX7A 4ZQPA 3LCIA 5FESA 5BMXA 4E38A 1KFJA 3STFA 3KRSA 3G0UA 5IM51 2FFCA 3NGJA 3R2GA 2WPBA 2NLIA 1GVFA 5FI8A 5EA9A 3PUOA 4NZJA 4FO4A 3BG3A 1K8ZA 3Q58A 1FDJA 2Y62A 4YXGA 3PM6A 1TQJA 4JTJA 2YGYA 3UWZA 1VCGA 2VFIA 4QNEA 4JTTA 4HSOA 1FQ0A 3S1XA 1W3TA 3QSRA 3HG4A 2W6RA 4Z1AA 3W7OA 5C6MA 1KM6A 3T55A 1FCVA 4RZ5A 3PB0A 3IVTA 5HUPA 2AAMA 1QFEA 1GG0A 3UPBA 2H8XA 4R53A 4UTJA 3FYPA 3FEMA 3LXCA 2P10A 1TTPA 4ICNA 3USBA 1LP6A 3NQMA 1QO2A 3OIXA 3IIPA 3S1WA 1GVOA 3GAYA 3S5NA 3TSBA 2Y85A 4HT3A 2EAWA 3O1NA 3O06A 4EF8A 4G1KA 3EXRA 1W56A 1VZWA 4JIQA 3G8RA 4JGDA 3I68A 2JGYA 1K02A 3P5ZA 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1S5WA 1TRDA 3GNNA 1QWGA 4Z1DA 3TA6A 4NX0A 3BLFA 3M5YA 4JYEA 3NG3A 3TKFA 3E12A 3TROA 5HR7A 3W1MA 4AWSA 2Y6ZA 1PVNA 5AHLA 1KM3A 1I4NA 4LS1A 1W3NA 3FKKA 1JR1A 4FEZA 5HWNA 1WOAA 3TK7A 3G1YA 1LRNA 4FNSA 3BV4A 4IPJA 3E0IA 5FF2A 3TC6A 4WXYA 3W74A 1JCLA 5CPMA 2QCLA 3GXNA 1EUNA 1JRBA 3IVUA 4O0ZA 4N9CA 5LHFA 3HIJA 4FNUA 3UQNA 5G4WA 3VE7A 4GUHA 1FX6A 1W3IA 1W37A 1HTIA 1TPDA 3P7YA 3TC7A 1A5CA 4FX8A 4JS3A 5BW6A 4O54A 3G1AA 1EWDA 3ABQA 1UB3A 4QM1A 3A23A 4JR5A 4O19A 4Y96A 3E49A 4HPJA 2H3BA 5DELA 3G3DA 1UBSA 5AFDA 3MI3A 2Y7GA 3A5FA 2ZTJA 2G96A 4RX0A 5AC7A 4MZYA 3TFXA 2VOMA 2FB3A 3W7HA 5FF0A 3W84A 5G2WA 4U4MA 5J5DA 2A0NA 2VEMA 5AHEA 1SR9A 1I45A 3SFKA 3T4CA 4O57A 1U5JA 3U6WA 4UTWC 1KA9F 2QAPA 4PFMA 4D2JA 4JX5A 3SJ3A 1YDVA 2DP3A 3UZJA 3GB6A 3P80A 2BSLA 3MP4A 2YYUA 4WJEA 3HQ1A 2FLIA 2ZDRA 1W54A 4P2VA 2H6RA 2CLKA 1R47A 3CIWA 3NQDA 1LYXA 1H63A 3RLUA 3DXIA 4M7TA 2C0AA 4GUGA 4IMFA 2TSYA 3I7QA 2X2GA 3CIXA 3QJAA 1YTDA 3VNDA 3NQEA 3SGUA 1IXOA 4UTTC 3HF3A 1VHNA 2CWNA 2HTMA 1JVNA 5HQEA 1SZNA 3UWYA 2QCFA 3TSMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4UTJA

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