4UTK | Genus

Total Genus 125

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	125
sequence length	359
structure length	359
Chain Sequence	SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGFLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Redox-dependent substrate-cofactor interactions in the Michaelis-complex of a flavin-dependent oxidoreductase doi rcsb
molecule keywords	XENOBIOTIC REDUCTASE
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas putida
total genus	125
structure length	359
sequence length	359
ec nomenclature	ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date	2014-07-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4utkA00

3MHFA 5AC8A 4O53A 1WBHA 3B05A 3TE9A 3NXFA 3NA8A 1KFLA 1O94A 3W7DA 3GXPA 4JTLA 3M1ZA 4IX0A 1I2RA 4GUIA 2VEIA 2EGZA 4ZQPA 5BMWA 3STGA 3O6DA 2ALDA 2ZA3A 5EY5A 5AHFA 5CPLA 2A4AA 4Z1AA 4NJKA 1MZHA 1KFEA 4N2YA 3R13A 4K6AA 4QQ3A 3M5VA 1HFBA 3SGUA 3NQ6A 2V30A 1AL7A 2E09A 1K02A 1LYXA 2JGQA 4FIQA 4M5PA 4I7UA 3KRSA 3EXRA 4M19A 3W76A 3FYPA 3W7HA 4M6PA 3WJYA 1HG3A 2C6QA 1QAPA 4NJIA 2CLIA 5CPNA 4HSNA 4FIRA 5K4XA 4UTIA 1RD5A 2H3BA 1GVRA 1G4SA 4GE8A 1IGSA 3NYZA 2D73A 3UPBA 5LSMA 4WQ6A 2A2IA 1ZENA 5G1YA 4JX4A 2CW6A 4JTIA 3U2OA 4HNUA 1XC4A 5SWUA 4KFOA 3THQA 4K8HA 3LHZA 3NGJA 3BK0A 2VFFA 3PSWA 3S1UA 4FXRA 4O1DA 3LBCA 5KSWA 1G7UA 3IEBA 3IIVA 2QUUA 4RR4A 1RQBA 3LCFA 2NX9A 3OIXA 5G1TA 3DHDA 1OJXA 1HUVA 1RPXA 3ZFHA 1PV8A 2GVGA 3DENA 4UR8A 2B0MA 3N3MA 3QPYA 2NV2A 1PCKA 4DF2A 1TB3A 4I9AA 2FPTA 1N8FA 5K9XA 4E2DA 4RXFA 4O0KA 2E77A 2NX1A 4BI7A 1YXYA 4AWUA 4LRTA 4O57A 1MO0A 4HNNA 3C52A 3ABOA 1HL2A 4Q33A 1SW3A 1UASA 3MHGA 2B7OA 4Y6GA 4O18A 5LNUA 3MW7A 1I8JA 3C6CA 1OF8A 1XXXA 2HS8A 4E0CA 3EXSA 2YW3A 3O63A 3L5MA 3TC6A 1Q6QA 3NO5A 3P80A 3HBLA 2BX7A 2QAFA 3W7EA 1KFKA 2VENA 1D9EA 3M5ZA 4UNLA 4NJHA 5CPOA 8TIMA 3W83A 3N9RA 3TSBA 4JD4A 4DEFA 1VQTA 3DXIA 1LRQA 3HGSA 1P0KA 2YDAA 2Y7DA 4QJ1A 4JTHA 4FO4A 4MUZA 3DBPA 2XFWA 1TPC1 3QQ0A 1C29A 4EVZA 1WX0A 4MKNA 3O06A 1A50A 4Y8FA 3LHYA 1YTEA 1LORA 1YXDA 3FLUA 4KKXA 2F84A 5CGQA 3EWBX 3HJZA 1QO2A 4CQ9A 2QUTA 5LGZA 4MLJA 3L67A 1C8VA 1N7KA 3NQFA 3WK0A 3ELFA 3LRKA 1GZGA 3TJXA 1SSDA 3KVKA 3CWNA 3TA6A 3ABRA 5IBXA 1A53A 3UPWA 1VLIA 2Y7EA 4ZQNA 4U28A 4IGHA 3PBWA 4O50A 5F4SA 2CFFA 5I3HA 3B03A 2GQ8A 3R8RA 2ZQ0A 3UWVA 5LKYA 3S8HA 5AN7A 1OF6A 1OABA 1FDJA 4MFEA 1LRNA 3CIWA 1JQVA 3L0KA 3BGJA 3ATYA 1WAUA 1Q3NA 5AYYA 2YX0A 2NUXA 2EKCA 4UTTC 3I7RA 3BARA 4UTJA 4JDBA 2RKXA 4Z08A 2W6RA 3L68A 1R2TA 1L6YA 2P0OA 2H90A 3SW6A 1DQXA 1TPVA 3CIXA 4YMZA 1KM5A 4R7JA 4UIOA 2QCDB 2YSWA 2RDTA 4FF7A 1SR9A 4WXYA 3S1XA 3W6YA 3EX3A 2J88A 1K8XA 2RHGA 3TW6A 1D3HA 2YR1A 5AYXA 3KVJA 4FHAA 1TPH1 5F2LA 1ZAIA 2YXGA 4ADUA 2W79A 4L4MA 5K2ZA 1L6WA 1GT8A 3BVJA 1KA9F 1QR7A 5U7SA 1XUZA 1XI3A 4NJGA 3TIMA 3VI2A 3LHUA 4UTMA 4N9DA 3W23A 2X1RA 2CWNA 3H53A 3MJYA 4O4WA 3TJLA 3DHFA 3N9SA 1M7PA 2CU0A 3Q58A 3W73A 3LBMA 3LHTA 2B7NA 5G5IA 4EWND 4BFAA 4BI5A 4JEQA 4CQ8A 4ORIA 2C18A 2GQ9A 5H2ZA 3W7RA 3L2IA 2RDWA 3W7OA 4FX6M 5KZDA 2ZRUA 4IMGA 1PHWA 1ME9A 5HNRA 4X9SA 2PCQA 1O4UA 1YPFA 3LB0A 3WJSA 4XKYA 1QPNA 3WK1A 5AC7A 4OQVA 5J5RA 4N4QA 4UTKA 2V8ZA 1H7PA 4Z0JA 2DU2A 2X2GA 4KFNA 4ONVA 4UNKA 3NR0A 3QW4B 1UCWA 3P84A 4IWWA 1LRTA 3DI0A 4DXVA 2ISVA 4BF9A 2A5HA 4N6FA 1E51A 1LOSA 2TSYA 3RU6A 5DELA 1FWSA 3QC3A 3PBYA 4OHQA 5DLCA 3HOJA 3SFKA 4O11A 5HINA 1MEIA 3M43A 2ZZ4A 1M6JA 1PHQA 2NWRA 2PURA 4GUJA 3L0GA 2ZZ2A 2R91A 4NZJA 2B7QA 4NXKA 3G1DA 4AWSA 1KM6A 2DZTA 1NFBA 3M5XA 3F4WA 2AQWA 2E6YA 1XKYA 4BWLA 4O28A 1TQXA 4JNMA 3M16A 1CI1A 1YADA 3EX6A 1K7XA 2QCCA 1B4EA 1ZALA 1FY6A 1S5VA 4OV9A 1O5KA 4JXCA 2QR6A 3NL3A 1L2UA 1VRDA 3MBFA 3QW3A 3SIZA 4OU1A 1AW1A 5F1UA 1FBAA 4OBTA 5D2XA 1UB3A 1TPUA 3HPZA 3LX9A 2C13A 3VFLA 2GVJA 2Z0IA 1V5XA 4MY1A 3UWUA 1PL9A 1Z48A 2ZCGA 2FPVA 4M6VA 5AOUA 1PE1A 4UCGA 3C8FA 3TFXA 2JKPA 1F7BA 3QMTA 1KLYA 4PL2A 3VNDA 4K7VA 1ZAJA 1X8FA 1OVDA 2PE4A 1VCVA 1SFJA 1H60A 4LC8A 1JCLA 3DKJA 2TMDA 2QF7A 5HJLA 1KV8A 2I14A 1QFEA 2RDUA 3PB2A 2Y70A 1YTKA 5G2HA 4FX8A 5FI8A 4XUGA 3Q37A 4RJEA 2ATMA 3CEPA 1EWDA 4JYFA 1NEYA 2VEKA 4NT0A 3KFTA 1TRDA 3MYPA 3P7YA 3W3OA 5BRBA 1DKWA 4UFJA 3O07A 4AH7A 4OT7A 4A3UA 3PUEA 1DQWA 5MHBA 2YYUA 3UY8A 3W7CA 5C54A 4UFLA 3JR2A 2QAPA 2VFHA 5DCEA 4TMCA 5L9FA 2ZRVA 1GVFA 3SSJA 3BW4A 2UV8G 1H7RA 3BO9A 3CWOX 1L6SA 3JRKA 4K7YA 4A21A 1A5AA 1OX6A 3FJ6A 5A5WA 1YDNA 5ABTA 3W2LA 3DKLA 4K39A 4PFMA 1FDYA 1L9WA 1G6CA 2E5DA 5CZJA 1TMHA 3E49A 5L6UA 2ZYFA 2GVLA 1FQ0A 3FEMA 1FCQA 3VE9A 5FEWA 3BLIA 4RCXA 1MEWA 3IRDA 1W0MA 5D38A 1BKSA 3W75A 3G1HA 3FYOA 4MIMA 3S5OA 3GKFA 3CM4A 4HPXA 5LHEA 3UD6A 4XWUA 1G4TA 3T55A 4WY0A 3EB2A 3N2MA 2WNNA 3E9AA 1VHCA 3IIZA 3KHJA 3L5LA 3W7PA 4UTHA 1ICPA 4X22A 4JY8A 3I7QA 3TCEA 2V2HA 1W3TA 4ZVJA 3LDVA 2V81A 5EA9A 2X1TA 4P2VA 1U83A 3E96A 4JN6A 4ZQRA 2JKAA 3QFEA 4PEKA 4Z1CA 4KFPA 1CX9A 3L66A 1W1ZA 4FNQA 1KW1A 2NX3A 3S6DA 3F1QA 3S0CA 1YDOA 3LERA 4Y96A 3SGZA 3KVMA 4UC5A 5FEPA 3V1PA 3W7QA 2GUUA 4WXZA 1OK4A 3EWWA 3QSRA 3L21A 1FUYA 2ISWA 5E0KA 3NQ2A 3LCLA 3KRZA 3E0IA 4AB4A 1TRIA 2CLMA 3TC7A 2YCEA 4WOZA 5LNRA 2E5BA 1DJQA 3NQVA 4O0ZA 1W5OA 3GKAA 3RLUA 1QO5A 3TROA 4AXKA 1DBTA 3M7WA 1DJNA 3W1XA 4IX2A 2XN1A 1GWJA 4GUGA 4EF8A 3W7NA 3GDLA 3MWAA 1YYAA 1VCGA 2E6DA 3KXQA 3G1VA 1Z44A 3NPXA 3PY2A 4DPPA 1VR6A 4KWWA 4GJ1A 5AHLA 5IBXC 2V5BA 4X3ZA 3DAQA 4RLIA 4LV9A 5CZ0A 2WNQA 3GR7A 4UTLA 3GR8A 5D2YA 3C3NA 4DF0A 3GNDA 5DCDA 5FF7A 3LCHA 1KV5A 1AMKA 1TPDA 5IM51 3ZR4A 2WQPA 4NNBA 3GXTA 5K9DA 5LNVA 1LP6A 1WDWA 2GJLA 2TYSA 1SPQA 1QWGA 4MZYA 4IXHA 4NX5A 1ME8A 2C0AA 4A22A 2H8XA 1JQXA 4DELA 4I7VA 1QPOA 3DFTA 1JCJA 1ICQA 3UNDA 1VYRA 4IQLA 4JICA 3M0ZA 2A0NA 3MMTA 5BOOA 1ZNNA 1A5CA 4LOCA 2J9YA 4NNCA 1SU5A 1J4EA 1JR1A 1IIHA 4HPJA 3SECA 3F4NA 2G5WA 2WO5A 4WD0A 3A9IA 3UWYA 1TTJA 2OT0A 2Z6JA 5D04C 1JUKA 1KTNA 3AO0A 5HR7A 3P8JA 5HUOA 2WOQA 2VEMA 4QITA 5CPMA 3T7VA 4O52A 4TX9A 3W7GA 2EHHA 2HS6A 4BK9A 1WYIA 3QPZA 3TK7A 3GLCA 1QCWA 1VJIA 3T4CA 4BR1A 1KM0A 2ZZ5A 3B0VC 2J9XA 4ZQOA 2Q3OA 4LS0A 1ZAHA 3T40A 3PUDA 4N9EA 4UFHA 1OFEA 3QQ1A 1R47A 3EWYA 3T44A 3BG5A 4JYDA 3WFAA 2NXGA 3QEZA 5EKYA 3WJXA 3WJZA 3DFOA 4DO5A 3QF0A 5F4WA 1XDLA 1DOSA 2GPTA 1SZNA 2ZA2A 3C61A 3N73A 1I45A 3STCA 4LY8A 4CNNA 1GEQA 4QM1A 1PCWA 1P4CA 3ZWTA 4HIBA 3I68A 4YXGA 4R53A 4JTSA 1OFAA 4JTTA 3W85A 5D2TA 3G1SA 1JUEA 1XUUA 1LBFA 3G22A 2WSQA 4QAIA 3W1MA 2OT1A 3R12A 5D02A 3JS3A 1F6KA 2VFDA 4JS3A 1X1OA 1OX4A 2DZUA 3TXVA 4MFDA 3NL2A 3EEGA 3NEVA 5HWJA 2VEPA 4XQ6A 3HPSA 2NLIA 3ABSA 2BTMA 3HG3A 2CLKA 4TMBA 4UMBA 1VC4A 3LLDA 3PG9A 1WBJA 3OBKA 5AYZA 2CLOA 5AHMA 1DHPA 3H55A 3A23A 3SR7A 3M47A 1VHNA 4K38A 4FNSA 2FDSA 1S5WA 1H62A 1M7OA 4QNEA 3MI2A 3C4UA 1AW2A 3GDRA 1B3OA 1TPFA 1GTEA 4WY0B 3IGSA 3C56A 1LROA 1W8SA 3D0CA 3W1QA 2WKJA 1FCUA 4GWEA 4BWLC 1Q6OA 1ZCOA 2CZDA 3UWQA 2WSYA 4D2JA 4FB7A 2O7QA 2CLLA 4QNWA 3LTSA 1EX5A 3FKRA 3NQEA 1FCVA 4NXSA 1SO5A 3BG9A 3PB0A 3W70A 3OHIA 1BTMA 1H7XA 5EPDA 1GG1A 3FA5A 3BW3A 2CZFA 3GYEA 4IMEA 3E12A 2YYTA 3GZ3A 5G4WA 5AB3A 2J6XA 1Y0EA 3CLMA 5CZSA 3DU0A 4DO4A 3P61A 1H1YA 1A5BA 3E02A 2ZRYA 3PBVA 4HKPA 4UTUA 4MY9A 4DPQA 3IGXA 2X1SA 1TV7A 1W5PA 4B5NA 4OWGA 3IVUA 4LW7A 3TDFA 3UWWA 3LLFA 3GVGA 3M9YA 2IQTA 2J9ZA 1O60A 1ZY9A 3PBUA 3INPA 3OVPA 3HGJA 1RQEA 3HO8A 4CCCA 1CW2A 3TQKA 3GAKA 3NNTA 2AGKA 1OFRA 4JX6A 3GK0A 1AG1O 1R2RA 3W2NA 4A2RA 3NG3A 3HQ1A 4R34A 3W86A 3NQDA 4UFKA 3P62A 4CCEA 4O14A 4PCFA 4UFIA 3GNNA 3HMJG 4AF0A 3P81A 2E5CA 1VLWA 4QSHA 1THFD 4LRSA 2WPBA 1VPXA 1XBYA 3H54A 3I7SA 4RX0A 1JCNA 2QJIA 3ABQA 4UTWA 5I3KA 2QKFA 2RH9A 3W07A 3B0UX 3TX9A 1NF7A 4POCA 1KTCA 3NL6A 2YZRA 1RZMA 4O8RA 3LTYA 1OYCA 3CU2A 1TYGA 1JRCA 1SO6A 3RFAA 3W71A 4YWIA 3KOFA 4ZZ9A 4PC8A 5AC6A 3G0XA 3QMRA 3NQCA 1W5QA 4Z1DA 1C9DA 4E2BA 3K30A 3IVSA 3PC0A 3B8DA 2A6LA 2YW4A 3EX1A 3W2JA 1R46A 1NF0A 5DXXA 3FIGA 1GJPA 1OX5A 5LHFA 2QCLA 3HG4A 3B04A 3MP5A 4OV4A 1MEHA 2NXIA 3UZ5A 2DZSA 2J27A 4S2CA 1WXJA 5K4ZA 2Y89A 1B9BA 3W1TA 1EB3A 3C2VA 3TKFA 1JUBA 1VS1A 1YXCA 1LBLA 5EMUA 4M7SA 4H6KA 4KWVA 4NJJA 4BI6A 4NX0A 2BSLA 1IXPA 4Y90A 3MP4A 3MBDA 4CNOA 2EAWA 3P82A 1TTQA 2O7SA 1ICSA 1EA0A 4A29A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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