4UTMA

Xena - reduced - y183f variant in complex with 8-hydroxycoumarin
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
360
structure length
360
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGFLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLER
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
publication title Redox-dependent substrate-cofactor interactions in the Michaelis-complex of a flavin-dependent oxidoreductase
doi rcsb
molecule keywords XENOBIOTIC REDUCTASE
total genus 128
structure length 360
sequence length 360
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2014-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4utmA00
2A7RA 2QUTA 1LBFA 1IXPA 4ADTA 3WJXA 4IPJA 2VFDA 2Z2UA 1IXQA 1FWWA 2VFHA 1IXOA 1T8XA 1W37A 4I7WA 5HUOA 1PVNA 4AWUA 2YPIA 2EF9A 1LTDA 3NGJA 4UR8A 2WNQA 1VGAA 3EEGA 1OYBA 4QITA 3UY8A 5CG7A 2CLIA 1R30A 1YTEA 2PRLA 1H7OA 2QCGA 2DJLA 3S42A 5EMUA 1KBJA 4L4LA 4O1CA 2HS6A 3JS3A 5D32A 1WBJA 1NEYA 1XBYA 2F7FA 6TIMA 4JTSA 3TSDA 3C2FA 1OFRA 2WJZA 4O54A 3W7GA 2YYTA 4N6FA 1VHCA 3PB2A 1ZAIA 1SZNA 1J5TA 4MYAA 3E9AA 4AMAA 3VNDA 1DOSA 4JY9A 1V7YA 4O1DA 3W1TA 4MLJA 4TO8A 5F2IA 1TV7A 3UWVA 3NA8A 3W2JA 2ZRYA 4JTLA 3B05A 4UR7A 1VYPX 4MZ8A 1TCDA 2EHHA 1WBHA 2NWSA 1K8ZA 5BMWA 4Q33A 4OV4A 1KM3A 4WY0B 2QCHA 1M7PA 1K02A 2HMCA 4CLMA 3W7IA 5C6MA 4M6QA 3KHJA 3NQAA 3W7QA 3M6YA 2ZA2A 2UV8G 3HG3A 3TH6A 1H7RA 1PHQA 4JY8A 3V75A 3INPA 1DBTA 3G8EA 5BMXA 1QDSA 1QFEA 1VZWA 3UQNA 1NF0A 2QCCA 3KFTA 3EX3A 3T7VA 4MVAA 1TTJA 3N14A 2ZRXA 2ZZ2A 4NXSA 5I3IA 1GT8A 1W1ZA 2C13A 3CTLA 4AB4A 4DO4A 3PY2A 1YPFA 3G3DA 1ZHAA 3NQ7A 2R91A 1LRQA 3PG9A 3DENA 2GUUA 3M47A 1EB3A 3R12A 3FJ6A 1G4TA 1ONRA 4AXKA 4XWUA 4N9BA 3B0UX 1B3OA 2QCMA 3M1ZA 4HN4A 4AHPA 2H6RA 3QRHA 2VOMA 1HTIA 4LS0A 5H2ZA 1H1ZA 2VFEA 1NF7A 4YLWA 4E38A 1L2UA 2G5WA 3QF0A 1FWRA 3O07A 1EWDA 4DPQA 5DBUA 3WK2A 4RR4A 1UUOA 2FPVA 2X16A 3IIPA 4HPJA 1P0NA 1W5NA 3IEBA 1DL3A 4IXHA 2OX1A 1AG1O 2YR1A 2VFGA 3S8HA 4ADUA 3OVQA 4LVGA 2Q8LA 4MUZA 2DJXA 5C5YA 2DZSA 3PG8A 1TJRA 3K30A 1WQ5A 1VH7A 4AVFA 3TUUA 3F03K 5A8GA 5F4WA 1ZJIA 1XFBA 3UWYA 3QMTA 1GVQA 4Z0JA 3OG3A 2I1OA 3P8JA 1N55A 3I6RA 1U5JA 3KVJA 3W6YA 2GQ8A 2J27A 1WX0A 1VCFA 3MO7A 2V9DA 4HNNA 1TPC1 3KVLA 2WKJA 2E6FA 4CQ9A 2XFWA 2BTMA 1ICPA 4DO5A 4O16A 1OX4B 4XUGA 4UTKA 3DXIA 5F4SA 3WK3A 2V0TA 1IXNA 3H54A 5EKYA 3G18A 3GIYA 2A1YA 4O17A 4IOTA 1NAL1 3W2NA 5TBOA 1SFJA 1H5YA 3QPYA 3S1UA 5HMSA 1TPUA 1OG0A 2DZPA 1XBXA 5L9FA 2DZXA 2VELA 3S1WA 4OE7A 2V2DA 1A53A 3GXTA 3V1PA 2Y85A 1FCQA 1H7NA 4NJJA 2QEZA 3HIJA 3VKJA 5HWJA 3DFNA 4Z08A 1Q6RA 2ISVA 2ZYFA 3TC7A 7TIMA 3O6DA 4N9DA 2V81A 4EWND 3LLFA 4RX0A 4N02A 4MYXA 3QC3A 5CZJA 2C19A 3H53A 4R33A 1GVSA 2Y6ZA 1K3UA 3SFKA 2QJGA 5D03A 3BLEA 2CLHA 1FUYA 4FX8A 1AK5A 4JXCA 3WK0A 4UTTA 1OX5A 1G67A 1LYXA 2ZRUA 2VENA 4Z0SA 3O05A 1EP2A 1WAUA 4UTHA 3FYOA 1P0KA 4NX0A 5AHNA 3GK0A 4CQAA 2A2IA 5AFDA 3TMQA 1TV5A 3W1AA 1EUNA 5K9CA 2Y88A 3G0XA 4HPXA 3MP3A 4ZQNA 4PL2A 2A21A 1G6CA 1R2TA 2QKFA 3NQFA 3FJLA 3LI1A 4MFEA 1DJNA 4UFIA 2E5BA 3W73A 4RCXA 3PUDA 2JKPA 4DEFA 3EXRA 3DKLA 5KZDA 4JDBA 4C1LA 2X30A 1G69A 1A50A 2RH9A 2ZTJA 1VYRA 4GJ1A 3VI2A 3LHUA 3G1VA 3NAVA 4GNJA 5K9DA 3QYQA 2Y7FA 2V5LA 1GTEA 5FF3A 5CZTA 3BG3A 3NL6A 3TIMA 3W7CA 5FF4A 3W1UA 4NNBA 3CB8A 4KFPA 1R2RA 4O15A 3A5FA 2X1SA 1KA9F 2BWGA 3BV4A 3DBPA 4IGHA 2A6NA 3C0JA 3Q94A 4ML9A 3W2LA 1KV5A 4O18A 2NUYA 5LNRA 3NXFA 4UMBA 4WD0A 4HIBA 4CNPA 4QNEA 2QR6A 3EXTA 1YADA 5LNVA 4IMCA 5TQLA 3NNTA 1RQBA 4DELA 2DZVA 1BEUA 2YGYA 3W1QA 3TC6A 3CHVA 3E12A 3QPZA 3LRLA 3L21A 4UTWA 3L5LA 2NLIA 3QM3A 1THFD 3LBMA 1O94A 2CWNA 2CZFA 4JD4A 3UPWA 4QISA 3P82A 1JUKA 4HNUA 3W7LA 1ZENA 2ABAA 3SI9A 5F2MA 4K6AA 3UPBA 2C18A 1RV8A 4NUWA 4E2BA 2EAWA 3L68A 4UXDA 4JX4A 1UBSA 3S1VA 3LB0A 3EKLA 2E68A 5K3VA 1F5ZA 3MI3A 4MZ1A 2JK2A 1CW2A 4JEQA 4RZ6A 3W7OA 1QR7A 1PV8A 3PBYA 3TMLA 3A23A 5E93A 5T26A 4JIQA 3FOKA 1RD5A 3MYOA 3PBUA 4WY0A 1IGSA 1F6KA 1L9WA 2FB3A 1PHWA 3RLVA 1PE1A 3VFLA 1FXQA 1LP6A 4O52A 3KRZA 2CLEA 1IIHA 2TPSA 3MWAA 2WPBA 1GJPA 3P67A 3TCEA 1EP3A 3W07A 3S5OA 2QCEA 4IJBA 5CPLA 4GUFA 1TMHA 4CCDA 3UXDA 3W2KA 1GVFA 2VFIA 3EB2A 1S3HA 1I4NA 1Y0EA 2C0AA 3I65A 5D2VA 3L5AA 2AQWA 4K36A 3HGOA 3NQVA 3STEA 2ABBA 1VQTA 3HMJG 4HKPA 1SFLA 3G1SA 2J9XA 1XUUA 3UXAA 3G1HA 5AHFA 2G96A 1JCNA 5EY5A 4M7TA 3I7SA 5J5DA 5AHLA 2XN1A 4YCPA 5LHEA 1EP1A 1JVNA 4NNCA 4N2YA 4O10A 5F2GA 5FF0A 4PODA 5BOOA 2JKEA 2I14A 3QH2A 2XN0A 3W1PA 5FF7A 1VC4A 1VCGA 1YTKA 1YTDA 3QQ1A 4ZMGA 1ZALA 3M41A 3M9YA 1TJPA 1SW3A 1PCKA 1Z41A 2RDUA 2B4GA 5DLCA 4LVAA 5F2LA 4WOQA 3BVJA 2NXGA 4UFKA 3EX4A 1TTQA 4OU1A 3W23A 2CFFA 3SSJA 4ORMA 1W5OA 2NX3A 4NJIA 3W84A 2CZ5A 4FEZA 1ICSA 1VS1A 2QUUA 3H55A 3NQMA 1FDYA 2ZRVA 3NZ1A 2PE4A 3QSTA 1G4PA 1OFAA 4O53A 4MY8A 3DAQA 4IMEA 2J9YA 2WNZA 4UMCA 1EWEA 2ATMA 4R7JA 3IIVA 1WYIA 4LV9A 4LRSA 1TQJA 3W3OA 2GVLA 5HINA 5HR7A 1WV2A 5I3KA 2ZZ4A 4TMCA 2JKAA 2ZRWA 3C6CA 3E96A 3FYPA 1I2OA 4Y96A 1OX4A 4WX2A 2WO5A 4O14A 1GWJA 3PVFA 5KINA 2ZA1A 1GQNA 2E6DA 1F74A 4BI7A 4O11A 3NQ2A 3S5NA 3GKFA 4PTNA 2NX9A 2G95A 2GQAA 1O4UA 3MW7A 2GOUA 4XZ9A 3FA5A 4KFNA 1FQ0A 1N7KA 1YDVA 4Z1CA 4FXSA 1UJPA 1FWTA 4BI5A 3W85A 3JR2A 4RZ5A 3DU0A 2YX0A 5CZSA 1M7OA 2GJLA 3MI2A 2DP3A 4OHQA 3S1XA 3STCA 1D3GA 1OHLA 3HBLA 4S1FA 4UFLA 4CCEA 2B0MA 3W74A 3QQ0A 4TR9A 2Y62A 4BI6A 3ANYA 3LCFA 5AHMA 2NUWA 3QFEA 3AO0A 3N9SA 2WNNA 5CGQA 1LORA 3G8RA 3DFTA 4DXVA 2CLLA 3GDMA 4Z1BA 1A5BA 3ELFA 3R13A 1Q3NA 4A29A 2Z0IA 3LCHA 3MYPA 3KVMA 4GBUA 2E77A 4RZ4A 4JS3A 1ZAHA 3CEUA 3EWUA 3OBKA 4FNUA 1ME8A 1JCXA 4IMFA 4KFOA 1SR9A 4QAIA 3WJSA 5KZMA 1LRTA 1NVMA 3TAKA 1X7FA 4DF2A 4BFAA 1GEQA 2FFCA 3A5VA 1MZHA 3KXQA 1OYAA 1SPQA 3LHVA 3DH7A 2JGYA 4XBKA 3BLIA 3EWWA 1C9DA 3PULA 3DHFA 3W71A 1C8VA 1LLZA 4H3DA 2C15A 3M7WA 3W76A 5I3GA 4DF1A 1C29A 2LLEA 3G1DA 2B7OA 3L67A 1UUMA 4X9SA 1KBIA 1WDWA 3OA3A 1YYAA 2RHGA 1SSDA 4M6VA 2TRSA 5LHFA 1W54A 4POCA 3TW6A 1KFEA 5A5WA 4BK9A 4K8EA 3QSRA 3DHDA 3W7MA 3I68A 5HWNA 2GJNA 2V30A 1KTBA 1XXXA 1MO0A 1H7WA 4P61A 3NPUA 4O4WA 1HO4A 4K8HA 3O1NA 3C8FA 3ABRA 4O57A 2NWRA 1AW1A 4PCFA 3W87A 2IQTA 4KWWA 1H50A 3TSBA 3KRUA 3R5EA 4CCCA 4GWEA 3NQCA 4GRSA 1W56A 1WOAA 3M0ZA 5AHIA 5C2XA 2YW3A 3KOFA 3TFCA 1JRBA 1LBMA 4LWWA 1JUEA 4X22A 3ZR4A 1U83A 2ISSA 1TRIA 5HQEA 2OMAA 1AL8A 1TREA 3BLFA 3KX6A 3UZJA 2QF7A 1TPFA 2FB2A 3GDRA 2WV8A 2H8ZA 4H6KA 3FS2A 3LDVA 4JTJA 1WOBA 4NU7A 3UD6A 3NL5A 1W3IA 4FIRA 5G2IA 3U6WA 1F76A 3R89A 2VFFA 4PA8A 2C6QA 1OFOA 3M5YA 1K03A 3CWNA 5IM51 4KKXA 5CSSA 5AYYA 1E51A 3NZRA 4GXMA 1YDOA 1B4EA 3CC1A 3IVSA 1OF6A 2CZEA 3F4NA 3IIOA 3RK8A 3MHUA 3P5ZA 1HL2A 3NPXA 2X2GA 1DQXA 1SUXA 3L0GA 4Q32A 4EOUA 4QNWA 1XCFA 1T96A 4DQWA 2GPTA 2E1DA 2V5BA 5LGZA 4UTLA 4R53A 1DKWA 3HGSA 1SU5A 4P2VA 4JN6A 3UYCA 4ONVA 4RXGA 2TMDA 4LT9A 3NOEA 3G1YA 1V5XA 2B7NA 2HTMA 3DFQA 2OT1A 5TIMA 3Q58A 2OJPA 2P10A 3W7RA 1VPXA 1X6UA 4R34A 5KZEA 3OVRA 4O13A 3BW3A 3GVGA 4MPQA 3HPSA 1PL9A 1TPEA 3B0PA 3VE9A 2FPYA 4LVDA 3NM1A 3PR2A 2CLMA 3NQ8A 1FWSA 2GVGA 1KLYA 1K7XA 3QEZA 5D37A 4IWWA 2VEPA 3CLMA 2H8XA 4NX5A 3PWAA 2EPHA 4FNRA 4RJEA 4LY8A 2HSAA 4DO6A 3GKAA 2FTPA 3MBFA 3LTPA 3P8IA 4ORIA 5CKSA 3C61A 1TPB1 3M43A 1VCVA 2VEMA 3W2MA 3UWQA 4JTKA 2PRHA 3WJYA 3LGEA 3DKJA 2A0NA 3B0VC 2QCDB 3N2MA 1VRDA 4B5NA 1FBAA 2DU2A 1LOSA 1TPVA 1P5BA 1YXCA 1X8FA 1QMLA 2H90A 3W72A 3N3MA 3GX9A 3B8DA 4DPPA 1OFBA 3O6YX 4LW7A 1I2QA 4ZVJA 1XDMA 3TV8A 5DCDA 1QO5A 1SZFA 1XUZA 5D09A 1F73A 4IUOA 3W1MA 3GZ3A 3PAJA 1GPWA 4H4IA 4IX2A 1NSJA 1JJKA 4WXYA 4PFMA 1QCWA 4U28A 4MZYA 4LUJA 5IBXA 3USBA 4E0CA 3E49A 3B04A 3W7KA 2VKZG 1QPRA 1ZY9A 3QW3A 3W7HA 3LBCA 3QZEA 4OBTA 5LNSA 1KFCA 3GAYA 1XC4A 3UY7A 3L9CA 4LRTA 1DQWA 2GVJA 3G0UA 5U4NA 4FB7A 2VC6A 1H61A 3PB0A 2NX1A 4UUIA 2H3BA 1FX6A 2NXIA 4K38A 2C14A 3LCLA 1JQVA 1WA3A 2ZQ0A 3O06A 3O15A 2PCQA 4FNTA 4JTTA 4MY1A 3IIXA 3G1AA 4JYDA 1B57A 3W9ZA 4UTTC 5K4ZA 1GOXA 3P80A 4GFSA 4QJ1A 2ALDA 3NO5A 4NVTA 3RU6A 1AMKA 1B9BA 1I2PA 3R2GA 1OFPA 3LV5A 5D2XA 2Q3OA 1PCWA 3P61A 4AF0B 3O63A 3LTYA 3W1XA 5ABTA 3PS7A 4OV9A 4CNNA 5BRBA 4FX6M 2TSYA 3NPVA 1MEWA 1LZOA 5CZ0A 4LNYA 3O8AA 5G2WA 4AAJA 3Q37A 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 4ZZ9 A;  3GXN A;  2WQP A;  2YSW A;  1DJQ A;  1KTN A;  5HNR A;  4LUI A;  1R46 A;  5DN1 A;  4EF8 A;  3ZS4 A;  3GLC A;  8TIM A;  3L0N A;  3W2U A;  3GAK A;  2GQ9 A;  1J2W A;  1B4K A;  1P1X A;  3C52 A;  3ABQ A;  3T4C A;  3SGU A;  3CPR A;  2ZZ5 A;  4Q4K A;  2P0O A;  5E1Q A;  2YDA A;  3P62 A;  3QW4 B;  1A5S A;  3TXZ A;  1SZE A;  5EL1 A;  5DXX A;  2ZZ6 A;  1RR2 A;  3HG5 A;  3SW6 A;  2ZZ3 A;  1JQX A;  3GYE A;  1KM1 A;  1WXJ A;  3EX6 A;  4LC8 A;  4A3U A;  1F7B A;  4M7S A;  4Y90 A;  5D38 A;  1LLW A;  1EEP A;  2QDG A;  3SGZ A;  4MOZ A;  4NJG A;  1ZNN A;  1ALD A;  5FEP A;  3PUO A;  5HJL A;  3S5Z A;  3LCW A;  4Y6G A;  5L6U A;  1XM3 A;  1EIX A;  2DZW A;  4RXF A;  4FX7 A;  1K7F A;  4FIQ A;  4LC6 A;  2R14 A;  4YWI A;  4TU1 A;  5G2H A;  3HJZ A;  2R94 A;  4O8R A;  3G3M A;  4IX0 A;  1H62 A;  1FY6 A;  3MJY A;  4QSH A;  1I2N A;  6ALD A;  3N34 A;  1Q6O A;  4GUI A;  5C54 A;  2V8Z A;  3C3N A;  3HGR A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1FFQ A;  2FGB A;  2CPU A;  1LBF A;  4Q8M A;  1IXP A;  4ADT A;  3CAW A;  1U1H A;  3WJX A;  2Z2U A;  1IXQ A;  3OOD A;  1XD0 A;  1IXO A;  1T8X A;  4DLM A;  4I7W A;  5HUO A;  2EF9 A;  4CNT A;  1QPK A;  2NT1 A;  1LTD A;  3CV2 A;  2X41 A;  1VGA A;  4ZFM A;  3GWQ A;  3EEG A;  2OYM A;  5A3H A;  4ML4 A;  3VIJ A;  3S9Z A;  1R30 A;  1NDY A;  5EMU A;  4L4L A;  3GIP A;  2WC7 A;  4OOZ A;  2AL2 A;  3ARS A;  1WBJ A;  1W3J A;  4EXQ A;  1R3Q A;  1J0I A;  4C90 A;  1BVN P;  3C2F A;  4B5S A;  1SYT A;  4JIH A;  3W7G A;  1SGJ A;  4GZJ A;  1VHC A;  4H00 A;  3OLD A;  3E9A A;  4AMA A;  1E6N A;  1OC5 A;  5LA0 A;  1GOR A;  3TR9 A;  1GQI A;  4HZ7 A;  1HJX A;  3VD9 A;  4O1D A;  4MLJ A;  3M0Y A;  3AZR A;  3M0X A;  2B31 A;  3B05 A;  5BMW A;  3W81 A;  3GM8 A;  4Q33 A;  2NSX A;  1OIM A;  4GIR A;  2X1I A;  1XYZ A;  1MZR A;  2RGL A;  1UPP A;  5C6M A;  4M6Q A;  2DZB A;  2NQ9 A;  4H2C A;  4RNH A;  1UA3 A;  2ZA2 A;  2GGE A;  2OWW A;  2YBV A;  3PK7 A;  3KFT A;  1PKN A;  4AYG A;  4EAN A;  1PO9 A;  2ZRX A;  2HQA A;  1AD1 A;  4DO4 A; 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