4UTTC

Structural characterisation of nane, mannac6p c2 epimerase, from clostridium perfingens
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
GSSHHHHHHMLDVVKGNLIVSCQALSDEPLHSSFIMGRMAIAAKQGGAAAIRAQGVNDINEIKEVTKLPIIGIIKRNYDDSEIYITPTMKEVDELLKTDCEMIALDATKRKRPNGENVKDLVDAIHAKGRLAMADISTLEEGIEAEKLGFDCVSTTLSGYTPYSKQSNSVDFELLEELVKTVKIPVICEGRINTPEELKKALDLGAYSAVVGGAITRPQQITKRFTDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Functional Characterization of the Clostridium Perfringens N-Acetylmannosamine-6-Phosphate 2-Epimerase Essential for the Sialic Acid Salvage Pathway.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PUTATIVE N-ACETYLMANNOSAMINE-6-PHOSPHATE 2-EPIMERASE
molecule tags Isomerase
source organism Clostridium perfringens str. 13
total genus 88
structure length 229
sequence length 229
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 5.1.3.9: N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase.
pdb deposition date 2014-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4uttC00
1OYAA 5D33A 3AO0A 1L6WA 1I45A 4LVGA 3LCXA 2QCNA 2C19A 4DO5A 1ZNNA 3SFKA 4FX6M 4WXYA 4RZ6A 2QAFA 4ORMA 3MI6A 4JXCA 2YXGA 1TPB1 2TYSA 3ANYA 3ZS4A 4A2SA 2ALDA 4ORIA 1H7RA 1GG1A 3NQFA 5TQLA 1TQXA 3OVQA 4MY8A 1AL8A 3Q37A 4XUGA 2J27A 1HO1A 3PBYA 2RDUA 2EF9A 2YX0A 1F76A 5KZEA 4DPQA 3GNNA 1QOPA 3DHDA 4NZJA 4JTKA 1SO6A 3NZ1A 3C2FA 3OBKA 1NF7A 5IBXA 5G5IA 3PBWA 3A21A 3IRDA 4OHQA 3QZEA 4S2BA 1R2RA 2R91A 4BFAA 5HINA 1LORA 4N9BA 1FQ0A 4WX2A 5BOOA 4OT7A 4UR8A 4QSHA 4JX4A 2BWGA 1B4EA 1LCOA 3DKJA 1FWNA 1W0MA 3KVJA 2HS6A 5FF4A 3L65A 1G69A 3KOFA 3SJ3A 3TSBA 3MP3A 4Y6GA 5D05A 1W31A 1HG3A 1FCVA 3FLUA 3WK0A 2Z2UA 3CT7A 3DFQA 4PL1A 2V2CA 3DHFA 4IX0A 4JYDA 1JUEA 4NUWA 3DKLA 3CHVA 3EX4A 3GAKA 1GTEA 3JS3A 2QCCA 4YXGA 5D30A 3W1XA 4O54A 1WDWA 2ZA1A 1OG0A 2GQAA 2FPTA 4TIMA 3GDRA 1KTNA 3WFAA 3BLEA 1KFLA 1O60A 3NL2A 3TCEA 2FFCA 4NJKA 1FCUA 3Q94A 3FIGA 3UWUA 1QPOA 1WX0A 2YYUA 4XTIA 5L6UA 2ZRZA 4KWWA 4MUZA 5KSWA 4CCDA 1G67A 1JVNA 2NWSA 2IQTA 1T0OA 2NX1A 4ZVJA 2C14A 1MZHA 4TR9A 4O1DA 4YL2A 3QM3A 1XCFA 2TSYA 3GR8A 4FF7A 4WY0F 3LXCA 1PHQA 1YXCA 1VHNA 2A21A 3EKLA 1FY6A 1FDZA 4KFOA 5G4EA 3A9IA 2Y61A 4XWUA 3KVKA 1M7OA 2VKZG 3UWVA 4O12A 3IEBA 3HGSA 1LBLA 1OFOA 3TSMA 4LC6A 4NU7A 4A29A 4JIPA 2WNQA 1DJQA 5I3GA 3ZWSA 1O5XA 1TJRA 3PM6A 4N9CA 4EIVA 3ABOA 2NWRA 3MBFA 1ONRA 1AW5A 4UCGA 4UFLA 5IBXC 3WJXA 5BRBA 3I7RA 3TR2A 2FPVA 2G95A 5CG7A 3W72A 3WJSA 3QC3A 1GOXA 3CQ0A 5LHEA 1C29A 1K3UA 1WOBA 3MBDA 1NFBA 3KHJA 2G97A 3SW6A 2C13A 4GBUA 2X30A 2E09A 3LXBA 1QPNA 3P81A 3EKZA 3W1QA 1KM3A 3MHUA 1GYNA 3LTSA 3W7OA 1XI3A 2X1TA 1B57A 3T4CA 4UMAA 3F1QA 1IXQA 4PA8A 3LLDA 2ABAA 1ZALA 1GVOA 4BF9A 5F2MA 1Y0EA 3OHIA 1GVRA 4U28A 1M6JA 1W3IA 4N4QA 3A5FA 4XTDA 1VC4A 2QUVA 3L5LA 3SGZA 2CU0A 3W7PA 2KZHA 1AG1O 3WK3A 4MJZA 4JY9A 1XXXA 2A7NA 4QAIA 3SSJA 2Z6IA 5AYZA 3DAQA 2NUWA 3W84A 5EPDA 2WKJA 3GIYA 3LCIA 4AEOA 1LP6A 1LRNA 2OX1A 1QCWA 4MZ1A 2E6DA 1HUVA 3W1LA 1OF6A 2EPHA 2I9EA 3GDLA 5I3FA 3TQ0A 3CTLA 4UMCA 5D02A 1VYPX 5A8GA 3NA8A 2YZRA 5D03A 5AC7A 2B4GA 4Z1DA 3B03A 4IJBA 3GK0A 4WJEA 3CB8A 3W70A 3NQ8A 2V9DA 2CLOA 1YLVA 3UNDA 2H3DA 4NT0A 4NVTA 4NXSA 2FB3A 2PRLA 1RZMA 4UFMA 1K8XA 3W7CA 2A6NA 5CGQA 4IMCA 3W71A 1RQBA 1G4PA 1OK4A 1EP3A 3PBUA 1JJKA 3N9SA 2BSLA 3PVFA 4AB4A 4KFPA 3KVLA 4Z1CA 1Q3NA 3IIOA 4H6KA 3MW7A 3R2GA 4N9EA 4M19A 3PR2A 3IGSA 2AGKA 2H6RA 4WQ6A 3G1FA 5LHFA 1Z44A 4JTTA 4N9DA 2FDSA 3LX9A 1WYIA 3TAKA 1OFRA 1FXQA 1ZENA 4MPQA 4EOUA 5J5RA 2E5BA 3GX9A 5SWUA 3RLVA 3UPWA 3NPUA 3N19B 1XUUA 1H7PA 4K8EA 4RKAA 1YPIA 4BI5A 4PC8A 7TIMA 4TMBA 3M41A 1I2PA 2FTPA 2A5HA 3L0NA 2CZFA 2H3BA 4IMGA 4JD4A 4JIQA 5I3KA 5FEWA 2BTMA 3TA6A 4GUGA 4MZ8A 1EUAA 1ZAIA 1F05A 3TH6A 1SZNA 4NJIA 3NPVA 3M0ZA 3DFPA 3INPA 5H91A 5EL1A 1VH7A 2VEMA 2E77A 3NEVA 4EF9A 5IM51 3CWOX 4RCXA 1TPUA 5C6MA 4LUIA 5I3IA 4KWVA 4GUFA 4JS3A 3B4UA 4JYEA 5KTLA 1G4EA 3W7KA 2Y62A 5AHMA 3LRKA 2J9XA 3Q2DA 1G6CA 2WSQA 3TXZA 2ZDRA 3NQEA 1THFD 4YMZA 3NAVA 3GYEA 3EWUA 5DY2A 1JQVA 2B7OA 1OYCA 5K4XA 1TIMA 2X2GA 1GWJA 3O1NA 1H63A 3LRLA 4M6QA 3NO5A 3HB9A 3L67A 5LNUA 2LLEA 4O50A 1G7VA 2V5BA 1QR7A 4MOZA 3LGEA 1SW0A 1RQEA 2F84A 1XKYA 5EA9A 3V75A 3SY5A 1KM2A 5H2ZA 1GVSA 1H1YA 4MY9A 3EEGA 3EX6A 5DXXA 3BG5A 4LWWA 3G8EA 1ICPA 5E0KA 2CLEA 1R47A 4XKYB 1Z48A 1ZJIA 1XL9A 1CW2A 2YGYA 2WO5A 1KFEA 3LB0A 3NGJA 4FX8A 4IOTA 3W1MA 4NXKA 5AHEA 1FDYA 3TROA 3PG8A 4HN4A 3DGRA 3A22A 5U7SA 1NSJA 2CZEA 3DFSA 4W9TA 1L6SA 4Y90A 3UZJA 4LRSA 1MXSA 2X1RA 1FWWA 3LM7A 3MP5A 4JTUA 3C52A 2ZTJA 4I9AA 1XC4A 2EGZA 1N55A 2Q3OA 2JK2A 4UMBA 2P0OA 3G22A 1EIXA 4FXRA 2Q8LA 4OV9A 5C54A 3SI9A 1X6UA 3UWQA 4D2JA 1VPXA 4FX7A 1W5MA 3BW4A 1QPRA 3LHUA 3QSTA 4O4VA 3P5YA 4HNTA 3CM4A 4IPIA 2GVLA 5CZ0A 2GJLA 4MZYA 3W76A 1VCFA 5K9DA 4U4MA 4JR5A 3UPBA 1XUZA 3PSVA 2C15A 4QITA 5C5YA 1TSIA 4R53A 3IIZA 2VXNA 1EWDA 4RK8A 3W85A 5D32A 4Z0SA 4R34A 4BI6A 1TB3A 2RHGA 1C8VA 4NQ1A 3RF9A 4JY8A 4AMAA 4WD0A 1S5WA 4B5NA 1YTKA 2P10A 1ME7A 5CPNA 1H51A 1SZGA 3EXSA 3G18A 1S3HA 1G7UA 3BARA 1OYBA 4IMFA 1SPQA 5AC6A 3W86A 4J9JA 3NG3A 3P61A 3LV5A 4WY0B 3B06A 4FNSA 4IXXA 4DPPA 1B9BA 3G0XA 1XBXA 4UNKA 2VEPA 2FIQA 1BEUA 1YDOA 2V81A 1G4SA 1VCVA 3NM3A 3IVUA 4O19A 2GJNA 3HGJA 3W7HA 4FNUA 1QAPA 2QEZA 3M5ZA 1XDLA 3MHFA 5G1TA 3C2OA 1H50A 1BTMA 4HNNA 5KITA 4M6PA 3ABRA 2NXIA 1KFCA 1W5OA 2ISVA 4C1LA 3TFCA 4WOQA 1AL7A 3HQ1A 2OT1A 1UCWA 1PCWA 2VFHA 3ATYA 3DFOA 3NL5A 1OFAA 1QWGA 5FESA 3LBCA 3NQAA 2ZA3A 3MI3A 2WSRA 1TRIA 2ZRWA 4QNEA 1SSGA 3QSRA 3NXFA 4ADSA 1DV7A 1H5YA 1PE1A 1W1ZA 1AK5A 4ZL1A 3NQVA 2DU2A 2VFFA 1VYRA 4AH7A 4N6EA 1F6PA 2QDHA 5F1UA 3KRSA 1GT8A 2HS8A 3USBA 5F4WA 5KMYA 1GG0A 5DCEA 3W7EA 1SO5A 4EVZA 1EEPA 1XBVA 3E12A 1H1ZA 3E02A 3PBVA 1OABA 3CU2A 3G1YA 3B0PA 3UWWA 1FDJA 5HWJA 4X9SA 1UUOA 2DZVA 2GPTA 2YDAA 2XN2A 3P8IA 4PFMA 3P67A 3BV4A 3M7WA 4NNAA 1RR2A 1FXPA 2A85A 1KLZA 3HPZA 5DXYA 3RNDA 3WJWA 4FNRA 4GUIA 2W0UA 4UFHA 5CKSA 3V1PA 3W87A 3A23A 3C8FA 3L5AA 4CLMA 5LGZA 3I65A 3R12A 2CLHA 2ZYFA 3M6YA 4LY8A 3QH2A 1DORA 1H7OA 2ZRYA 1EX5A 1F6KA 3VE7A 2QJIA 2OT0A 2E1DA 2PURA 3NL6A 4JYFA 4GC4A 1TRDA 2V2DA 5K7JA 4UFKA 1ME8A 3F03K 3HO8A 3S1WA 3P82A 4JNMA 1BKSA 5G1YA 3WJZA 3GXNA 3S42A 1SQ7A 3TX9A 4ZZ9A 2I14A 2J88A 1VRDA 2PRMA 5DN1A 5HR6A 1BWKA 4O0ZA 1KM6A 4I7WA 4O4WA 2E6AA 2YW3A 2Q8ZA 5EMUA 1LOQA 2X16A 4CCCA 1J4EA 3KRZA 3PS7A 3L2IA 2XN0A 3B04A 3L68A 4O10A 3QPZA 4GNJA 4NJGA 2V82A 3NZRA 1TV7A 5HR7A 5HQEA 5HJLA 4JX6A 3PUEA 3NQ7A 1K7XA 1EP1A 4HIBA 3BGGA 5D09A 4RV8A 5D37A 3PSWA 2RH9A 3M1ZA 4GFSA 4RLIA 1TTQA 2Y88A 5AHIA 5HULA 1TTPA 3O63A 1CX9A 4Z1AA 4AWUA 3S5YA 1F5ZA 5FF0A 2RDWA 4K7YA 4O16A 3TK7A 3M47A 4GXMA 4JTIA 1K7FA 1AW2A 2DP3A 5BNKA 1KTBA 2TPSA 4LVDA 1ML1A 1I8JA 1O94A 3O6CA 3QMSA 3W1NA 2Y7EA 2QCDA 3P80A 2QCFA 1KM5A 4QQ3A 5CSSA 4UTKA 1YPFA 1RD5A 2I1OA 1ICQA 3W2NA 3FJ6A 1SZFA 2DZUA 3RMJA 4K7VA 4JTFA 3EX3A 3MJYA 1PS9A 1Z41A 5D04C 3W7JA 3GXTA 5ABTA 4I7VA 2PRHA 3OVRA 1VQTA 4E2BA 5LNRA 2YSWA 3ELFA 5HUPA 4I7UA 3LLFA 4M5PA 1FX6A 4FEZA 2C3ZA 2VFEA 2WNZA 4JX5A 3TC7A 2RFGA 4NJJA 2C6QA 3VE9A 4AHPA 2QCGA 3NQGA 3DFTA 1LRTA 3HG4A 5F1VA 1F74A 3EXRA 1ZCOA 2DZXA 1KM4A 1X8FA 4LOCA 1W56A 2ZRUA 4CQAA 1TTJA 3RFAA 4TX9A 2GOUA 2JKEA 3O07A 1W3NA 3W2UA 1NVMA 1EPXA 1W8SA 4JTGA 1KV8A 1ME9A 3HJZA 4Q4KA 2DORA 2G96A 3ZR4A 3G0SA 3GZ3A 2Z1BA 4OQVA 1SO4A 2NZLA 1UASA 2RDTA 4HNUA 1TPH1 5EYWA 3VI2A 2X1UA 2OZ0A 4MYAA 3NPWA 3D0CA 5DY3A 5K4ZA 2ZCGA 1P4CA 3I6RA 2FQIA 4JTSA 1MEIA 4L4LA 2F7FA 3UXAA 1X1ZA 1ZY9A 3W7IA 2R14A 4CNPA 4H4IA 3VKJA 4FB7A 1LOSA 4DF2A 2B7PA 2BZNA 5CPLA 1GZGA 4AWSA 4CNNA 1QO5A 3JR2A 3E96A 2A7RA 2ABBA 4DF1A 5LKYA 1LDCA 1Z42A 1R2SA 2QJGA 4K37A 4NJHA 1TO3A 5D38A 3TNOA 3NQ2A 1OVDA 4DO6A 2PC4A 3L66A 3OVPA 4QIUA 3FS2A 1P1XA 5AB3A 3TU9A 5CZTA 1DJNA 2NUXA 4A22A 1SW3A 2QJHA 3LRMA 1VR6A 1IXPA 4DF0A 3UXDA 4LU0A 4LS2A 1WQ5A 3O6DA 4RZ4A 3OG3A 1JCLA 2H8ZA 3EWBX 2V8ZA 5DCBA 6TIMA 1NEYA 3O16A 2QCMA 4LV9A 3PB2A 1N7KA 3S6DA 2J6XA 3W7NA 1LROA 3LCLA 4AVFA 1EP2A 4O1AA 1DVJA 3NQCA 3W2KA 2Y70A 5LZLA 4HPJA 3S0CA 3BVJA 1ALDA 1QMLA 2B7QA 1HFBA 2NV2A 3R13A 4LUJA 4O18A 1FCQA 3QW3A 4HPXA 2VEIA 3TE9A 4OE7A 3PAJA 3K30A 2A2IA 4MKNA 1TREA 3GVGA 4AXKA 1IXOA 3QMRA 2DJLA 4PH6A 3NNTA 3MP4A 1SU5A 3NM1A 2A6LA 2C18A 1TPFA 1XM3A 4O28A 4O11A 2V0TA 1KW1A 1XFBA 3B05A 3P60A 3C2RA 5DLCA 1HO4A 1VJIA 4ONVA 8TIMA 3LHYA 4N2YA 1FBAA 4HT3A 4O8RA 1GQNA 1VS1A 2ZZ3A 1VLIA 2NUYA 5I3HA 4RR4A 4YCPA 5G4WA 1K7EA 5AFDA 5FEXA 5MHBA 4UTUA 1ZHAA 1JR1A 3KRUA 4Q32A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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