4UTW | Genus

Total Genus 84

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	84
sequence length	229
structure length	229
Chain Sequence	GSSHHHHHHMLDVVKGNLIVSCQALSDEPLHSSFIMGRMAIAAKQGGAAAIRAQGVNDINEIKEVTKLPIIGIIKRNYDDSEIYITPTMKEVDELLKTDCEMIALDATKRKRPNGENVKDLVDAIHAKGRLAMADISTLEEGIEAEKLGFDCVSTTLSGYTPYSKQSNSVDFELLEELVKTVKIPVICEGRINTPEELKKALDLGAYSAVVGGAITRPQQITKRFTDIL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural and Functional Characterization of the Clostridium Perfringens N-Acetylmannosamine-6-Phosphate 2-Epimerase Essential for the Sialic Acid Salvage Pathway pubmed doi rcsb
molecule keywords	PUTATIVE N-ACETYLMANNOSAMINE-6-PHOSPHATE 2-EPIMERASE
molecule tags	Isomerase
source organism	Clostridium perfringens str. 13
total genus	84
structure length	229
sequence length	229
chains with identical sequence	D
ec nomenclature	ec 5.1.3.9: N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase.
pdb deposition date	2014-07-23

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4utwC00

2ZBTA 4WXYA 4LRTA 4NJJA 1Q6QA 2QKFA 3LCGA 2TRSA 2ZTJA 3O15A 2GPTA 1GVRA 1JCMP 4KWWA 5H91A 4BR1A 1K8ZA 4YXGA 3U6WA 1L6WA 4RK8A 2Y7DA 2QUTA 2V8ZA 4WXZA 3C56A 1DHPA 2A7PA 3W7OA 1OABA 3S8HA 3CIWA 4NX0A 3ABSA 1W3TA 2CU0A 3GDMA 4I9AA 4PA8A 4JX5A 1OFPA 3WK1A 4OHQA 4GNJA 2V81A 5FF3A 2VFFA 3UWVA 2ZZ7A 2JGQA 1H7WA 3EWBX 5AC7A 4Z1CA 1XL9A 3F4WA 3P80A 4LY8A 2EHHA 1W1ZA 3HGJA 2V30A 3RU6A 2XN0A 3W7KA 3UXAA 3KRZA 2PCQA 1LRQA 2DJXA 1P0KA 1DJQA 5G1TA 4JTHA 4EVZA 3BW4A 1LYXA 3E0IA 4EF8A 1H1YA 1KFLA 1VHCA 2OCZA 2ZZ4A 1W3IA 5LSMA 3W70A 4OQVA 3PVFA 2QF7A 3KAOA 3DENA 5BMXA 4IXHA 3LCXA 5FEPA 4FX6M 1KBJA 4NXKA 1VYSX 3QSTA 4OV4A 1OK4A 3TJXA 2FJKA 2QCDB 1PIIA 3QMRA 1B3OA 2A6LA 3W7EA 1H63A 4AXKA 4RR4A 5LNWA 1HG3A 3CIXA 1ME9A 3W2MA 5DY3A 5AOUA 4NJIA 3R89A 3U2OA 3TROA 4O54A 1BWKA 4O19A 4H3DA 3SIZA 3DH7A 4BWLC 3DZ1A 2JK2A 2Y6ZA 4CCEA 5KINA 1KV8A 2VEIA 3R2GA 4HPJA 4NQ1A 5LNUA 3TK7A 4JIPA 4WX2A 1QMLA 3NQMA 3LXCA 2WSQA 1G4TA 2E5DA 4FB7A 3A23A 4P61A 3UWYA 2I14A 3LV5A 4IQLA 1RPXA 2H90A 2YW4A 4WUIA 4A22A 4UIOA 4UFIA 3BO9A 4XBKA 4K6AA 4N9EA 5D03A 2ZZ3A 4XTIA 3ZWSA 4FIRA 3V1PA 2VFGA 3PSVA 4IOTA 4OT7A 2QAPA 3PB0A 3RMJA 4TR9A 3FLUA 1RZMA 1OHLA 4XWUA 4O18A 5EY5A 3PBWA 3UYCA 2F84A 1QPQA 3PSWA 3GLCA 1BEUA 2V2HA 2H8XA 1CW2A 2V0TA 3ZR4A 3EWZA 3MI2A 3IEBA 4GC4A 3RK8A 5FI8A 4UR7A 4QITA 1W5PA 1H50A 3W7IA 2ZDRA 3W2JA 3F03K 3GX9A 4JTJA 3TCEA 2CZFA 1GTHA 1T0OA 1GJPA 2J24A 3NPVA 4MY8A 2QCHA 5L6UA 3RFAA 3O6YX 4FNUA 2NWRA 3C61A 2ZRXA 1SSDA 4EF9A 4S2CA 3W1MA 4O11A 1R2RA 3TXVA 2VELA 1LBFA 1VYRA 5CPOA 3N9RA 2J88A 5DELA 5CZSA 4ZMGA 4UFMA 4ZQMA 4K8HA 5G2IA 3W7NA 2Y89A 4UMBA 2ZQ0A 1YADA 3C2OA 1WOBA 5E0KA 2QCLA 1PVNA 2V2CA 5G4WA 1LRNA 4UTTC 4WY0A 4JEQA 1G4EA 5EYWA 3WJZA 1ICPA 3A24A 1Q3NA 4LUIA 3H55A 2QCFA 3LLFA 1QOQA 3TE9A 1GT8A 3DFNA 5HWMA 3F1QA 4MJZA 3VE7A 3VE9A 1OF6A 4E2DA 5U7SA 2DU2A 1DJNA 3CU2A 2DZUA 3GAYA 4MZ8A 2HS8A 3DU0A 2B0MA 2I1OA 1V5XA 3UD6A 3DFOA 3DXIA 3PWAA 1ML1A 5HQEA 1I2PA 1JULA 1OFDA 3STCA 4PTNA 3THQA 1OJXA 2E6FA 3M7WA 3L0GA 3LGEA 3EX4A 2ZA2A 3PAJA 3LXAA 2G97A 3FKRA 3G1XA 4TX9A 4IXXA 3SGUA 2FQIA 4A29A 1IIHA 3LCWA 3PB2A 4NNBA 4CNNA 3I7SA 3H53A 3L5AA 6TIMA 2J9YA 4CQAA 3LCIA 4ORIA 4MY9A 5IBXA 3CPRA 3NL3A 3NNTA 3LB0A 2ZA3A 3LHYA 2WSRA 4O28A 1YPFA 3W1QA 3O6DA 5AYXA 4WOZA 3QRHA 4X2RA 3HG5A 1C8VA 2Y63A 4K36A 4LUJA 1EX5A 4AH7A 3LRMA 3LLDA 5AYYA 3LHWA 1VRDA 4UFHA 4D2JA 4TIMA 4UFJA 2DZTA 4O10A 1XBVA 1FWNA 1N55A 3KFTA 3CLMA 2CZEA 3KX6A 4FNSA 4DO6A 4UTWC 4QSHA 4JXCA 1PCWA 1KFJA 2GVLA 3DBPA 5AHMA 1NSJA 3CEUA 4FX7A 1DORA 1NEYA 5LHEA 3FA5A 4ICNA 1VHNA 4O4WA 3L0NA 3WJWA 1TPH1 2YDAA 4IWWA 1GYNA 5D02A 2PC4A 4UCGA 1TPDA 5AHIA 3QSRA 1QDSA 3JS3A 1OFOA 4M6QA 1Q6RA 4C1LA 3W86A 1N7KA 3A22A 4DELA 4MZ1A 1W5OA 2FPVA 4AF0A 2Z0IA 2ZCGA 3NYZA 5G5IA 3TC6A 3W1NA 1VS1A 1FDZA 2RFGA 1TRIA 2A4AA 5BW6A 3M6YA 3P67A 3E9AA 3G1FA 2HS6A 3G0UA 2WNZA 3P84A 1X1ZA 5DY2A 3SSJA 3OBKA 4UTUA 2YFOA 1KM0A 4YMZA 3USBA 4NJHA 1LP6A 1XC4A 2C15A 3S42A 5DXYA 3MUXA 4H6KA 1WAUA 4NZJA 5K3VA 3EWXA 1OYAA 3IRDA 3NM3A 4HNNA 4UMCA 3I7RA 3HBLA 3P5ZA 3G3DA 1OVDA 4A2SA 1WA3A 3W2KA 4UMAA 1GVQA 3S0CA 1K8XA 4TU1A 3FYPA 4IMFA 4RX0A 1JJKA 3CEPA 5KZMA 4FEZA 2WOQA 1X1OA 5CZTA 2QCGA 1OX5A 1KLZA 2ZRZA 4MKNA 2DP3A 1ZCOA 3L68A 2R91A 4A3UA 1HUVA 3W74A 1ZAJA 4JDYA 2TMDA 1Z48A 2NUWA 4H4IA 4IPJA 5G2HA 2NXGA 4K37A 4L4MA 4O14A 4O1DA 2JKAA 3GR7A 1VCGA 1F05A 1FWWA 1HO4A 1FQ0A 3QJAA 4M6PA 2FB3A 4RV8A 3TJLA 3EXSA 2GVJA 4Z0JA 5KSWA 2ALDA 1A5SA 4O8RA 1DQWA 1NVMA 4ZQCA 1VYPX 1H5YA 1W5QA 1H61A 3VKJA 3OA3A 2F7FA 1ADOA 1B57A 2H8ZA 2P10A 3BV4A 1EPXA 2VFIA 3INPA 3G3MA 4JGDA 3M5ZA 2KZHA 5FEZA 3NDOA 1G6CA 4BFAA 3QW3A 3PULA 3CTLA 3GKFA 2P0OA 4KFNA 3G0SA 1SO6A 4LC6A 1EWEA 3DI1A 1SW7A 4N6FA 1H62A 4UXDA 4UNKA 2I9EA 3W2NA 2X1SA 3G8RA 3W84A 4J9JA 3LRLA 4MJMA 2A21A 1FBAA 4DEFA 4FXRA 2XN1A 3Q58A 4XKYA 4WY0B 3TMLA 2NUXA 3MBFA 2DZWA 3NPWA 4NNAA 3VFLA 5AYZA 5K2ZA 1TCDA 4ADSA 5K9XA 2B7OA 4AEOA 1R47A 3GVGA 2J27A 3IGXA 4JD4A 4N4QA 1R2SA 3W23A 2YYUA 3W76A 4JY8A 4ZQOA 4MLJA 3N73A 3S5OA 2VOMA 4A21A 3N3MA 1K03A 1RVGA 3TR2A 3TFCA 3GNNA 1SR9A 1G67A 4GFSA 1FWSA 2Z1BA 1WYIA 3C2RA 3NM1A 1QNVA 3OEXA 3A5VA 4EWND 2QCCA 4IX0A 4TO8A 3DHDA 3LCLA 1GG0A 1SW3A 2GQAA 4LU0A 3TXZA 7TIMA 3PUOA 4FNTA 3LV6A 3KVJA 1FCQA 5AHNA 1S3HA 2CWNA 3NL6A 1A50A 5LKYA 2ZTKA 5J5RA 2OX1A 1KTCA 3P62A 1LBLA 1VQTA 3HGOA 2CLEA 1JUKA 1H60A 1LOSA 4NT0A 1GWJA 5HWNA 3W1UA 4YCOA 2E77A 3MI3A 1JQVA 1SQ7A 3ABRA 1Z42A 3GXNA 2V82A 5I3JA 4QJ1A 3RLVA 2FPYA 3KVLA 1PCKA 3DHFA 4RZ6A 3SZ8A 1QPNA 5F4XA 1B4EA 3DGRA 3QZEA 4Y6GA 2CZDA 1L6YA 4UTLA 3VCRA 1KW1A 1UCWA 4LVGA 4GUJA 1PHQA 1DOSA 3N34A 4NZFA 3UWZA 3CWOX 3GNDA 1OFQA 3LM7A 1OX6A 1EWDA 1ZJIA 3W7JA 4O50A 2A1YA 1THFD 4MFDA 4B5NA 3UWUA 4JIQA 3W2LA 4ZVJA 5AC8A 4O12A 4M19A 4BI5A 1EP2A 1TQXA 1PHWA 3HG2A 3HF3A 5K4XA 4MIMA 3WK3A 2Y61A 3DFQA 3LERA 4LS1A 2JBMA 4IMEA 1QAPA 1F6KA 4NUWA 3LHZA 1ZAHA 3HG3A 2X1TA 1OG0A 3W7CA 2YPIA 2ZYFA 3G8EA 4BWLA 1R46A 3LHUA 3ZWTA 2TSYA 1YTKA 1RQHA 1I8JA 3S1XA 1O95A 3BLIA 4AF0B 3M5YA 4BI6A 1KM4A 1FUYA 4I7WA 4HIBA 1HTIA 4MY1A 3NPXA 4JTSA 5TQLA 1IF2A 3G18A 4FHAA 4FNQA 1G7VA 1M7PA 2C14A 3C3NA 1T99A 4N9CA 4U28A 4ADTA 1LTDA 2OZ0A 5CKSA 3NG3A 3E12A 3NAVA 4OWGA 3G1SA 1FY6A 2CFFA 3LCHA 4OV9A 4Z0SA 4NJKA 4O52A 4ZQNA 3DFSA 5D37A 4M7SA 2EKCA 3CWNA 4WOQA 1RR2A 2DZPA 3HIJA 2C6QA 4RLIA 1YLVA 3P74A 4RZ5A 2VFHA 3TIMA 1ALDA 3DAQA 5K7JA 1AL8A 5LHFA 4M6VA 1WOAA 1ZAIA 3W7MA 3MW7A 4XTDA 2EF9A 1HO1A 3BG5A 3IIXA 3STGA 3T78A 4JTFA 5G1YA 4LVAA 1JCLA 4DPPA 4UTIA 5F4WA 3S1WA 1KM3A 3IV3A 2RDUA 1YDOA 4XZ9A 4JDBA 1O5XA 2UV8G 5I3IA 1UBSA 1LOLA 2TPSA 2EGZA 3O06A 1LLZA 5EA9A 1QO2A 1SO3A 3GDRA 3L5MA 1P5BA 1SZNA 2V9DA 2Y70A 4LRSA 1J2WA 1HL2A 4AVFA 1JQXA 1EUNA 1V7YA 2NXIA 3W1PA 3EXRA 3TV8A 1QR7A 3NQCA 1P1XA 1Y0EA 4GWEA 4FXSA 4ZQRA 2H3BA 2RDWA 4LVDA 4PL1A 3GYEA 3TAOA 3DKJA 2IQTA 5C2XA 4DBDA 3L21A 5DCEA 1TPUA 1K7EA 1EP1A 4UTTA 3ZFHA 3LOTA 3W1AA 3A9IA 3G1HA 3M47A 1P0NA 1QPRA 2NWSA 4Z08A 3M0ZA 3G1AA 1O60A 3OVQA 5DBUA 3O8AA 5D05A 3HGSA 3R5EA 1AK5A 1NF0A 2CLFA 4GUGA 3LBCA 2A7RA 1L9WA 1OFBA 4HPXA 1W31A 1DQXA 1BKSA 2Y88A 3L5LA 4Y8FA 3PC0A 3EX1A 4KFOA 1FCBA 4DO4A 1IIGA 3B05A 5D30A 5CG7A 3TAKA 3HO8A 2FPTA 3QPZA 4LV4A 3CB8A 1C29A 4RCXA 1F6PA 4DPQA 4E0CA 1G4PA 1X7FA 2NUYA 3P8JA 4WZHA 1LZOA 3ELFA 1XBXA 5TBOA 3KXQA 3FJLA 4N6EA 3GB6A 4UR8A 3W88A 4N4PA 2OMAA 3CM4A 4XKYB 4CLMA 5A5WA 3L2IA 1H7XA 4PH6A 2B7PA 3UY7A 2QDHA 1SZEA 5C54A 2A85A 4JYFA 4BK9A 2PRHA 3L9CA 1G69A 4UUIA 2W6RA 3B04A 3PF3A 4O1CA 4O57A 3IVUA 2DZSA 3K30A 3PBVA 3P60A 2C13A 3CT7A 3GXPA 3BPWA 2O7QA 3N9SA 5D38A 1F74A 1S5VA 2GOUA 4OBTA 3DI0A 1MXSA 2PRMA 3KRSA 3P7YA 1DL3A 3W7RA 1YXDA 1F7BA 2VC6A 5F2IA 2VEMA 2YW3A 3PUEA 3V75A 3S5YA 4UTWA 2ABAA 4Q4KA 2VEKA 3KVMA 4AWSA 4AWTA 4LS0A 3WJYA 1LDCA 5AB3A 4FX8A 1LROA 3WJSA 2JKEA 1EUAA 3BW2A 1FCUA 5LNVA 4GBUA 5LZLA 3UWQA 2CLLA 3KHJA 4RKAA 4JTEA 3R8RA 1L6SA 2NXHA 3QFEA 1PE1A 2ATSA 4IUOA 3AJXA 4ADUA 3EX2A 1RV8A 2ZRVA 3THAA 2RKXA 2PURA 2ISVA 1VH7A 3TNOA 3NQVA 5DLCA 4LVFA 4K38A 1DVJA 1K7XA 1GVSA 2OT0A 2ZZ6A 2Q3OA 3PY2A 2NV1A 2E5CA 3KRUA 1K7FA 3PG9A 4NXSA 4X3ZA 4HHPA 1O4UA 1TYGA 1KLYA 1IXQA 1KFBA 2Q8ZA 5KZEA 5ABTA 4O0ZA 3LDVA 4UNLA 3SECA 2BTMA 3W9ZA 5A8GA 4WY0F 5EBUA 2CLIA 4MZYA 4LTSA 2C16A 4JY9A 5D2XA 4JTIA 1TPVA 3Q37A 1IXOA 3NVTA 1A5BA 2QJGA 4O16A 1SUXA 1R30A 4QNEA 3W7GA 3T40A 4YL2A 4W9TA 1QPOA 2GVGA 2FB2A 2Y7GA 3W71A 4ZL1A 3SY5A 1XUUA 2B7QA 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4FNPA 2Y7EA 1FXQA 3MWAA 3G1VA 1OF8A 3NO5A 3S5ZA 4O0KA 2C0AA 1BWLA 3OG3A 5BMWA 1ONRA 2NX9A 4EOUA 4TMBA 3IIZA 1TIMA 3W1XA 5HJLA 2O7SA 3Q2DA 5KTLA 2A5HA 2Y62A 4E38A 3HQ1A 1TQJA 1TPWA 2FLIA 1M6JA 3P82A 1H51A 4R33A 1XDMA 1YPIA 1YXYA 5I3KA 3NQDA 1KFEA 1K8YA 2X16A 4O53A 3BG3A 1AG1O 1W0MA 2E6YA 2H6RA 1ME7A 1EIXA 3LBMA 1UASA 1NF7A 2HSAA 5FF0A 1J4EA 3EX6A 3MBDA 1TRDA 1QWGA 1A53A 1TO3A 4ALDA 3NQ8A 4KKXA 5D04C 5BNKA 4UFKA 1I4NA 1LRTA 2XFWA 5D2YA 3C2VA 1R2TA 1YDVA 4X9SA 3QH2A 1DKWA 3O07A 3PBUA 3W7HA 3ABQA 1T96A 5LNSA 1JCYA 3IVSA 4GXMA 1C9DA 1OFEA 2WQPA 4I7VA 3UPBA 2Z6JA 5CSRA 3R12A 3O16A 5KITA 4LNYA 2YR1A 4MPQA 1VLWA 1KA9F 4GJ1A 1D3HA 4JTGA 4CNPA 2YCEA 1KM2A 2ZA1A 3A21A 3QPYA 3OHIA 4POCA 4DF1A 3EKZA 3W87A 1FX6A 1WX0A 2WSYA 4CNOA 1OFRA 2WNNA 3M5XA 1ZNNA 3TQVA 3EKLA 3QQ1A 2RHGA 4R34A 2AAMA 1K3UA 4AMAA 1CX9A 1VZWA 1GVFA 4IGHA 5FF2A 3UXDA 1Q6OA 3G22A 3D0CA 4JTTA 3A5FA 3NQ2A 3W22A 2Y7FA 3BG9A 3S5NA 2EPHA 3M44A 3LTSA 3S1UA 3TQKA 1GPWA 3C4UA 1VCFA 3GKAA 4IMCA 3I65A 3LXBA 4WD0A 3QF0A 4HSOA 2GJNA 1U5JA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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