4W5ZA

High resolution crystal structure of catalytic domain of chitinase 60 from psychrophilic bacteria moritella marina.
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
323
structure length
323
Chain Sequence
GTITSQDDNVVVGYWHNWCDGRGYQGGNAPCVELKTVNPQYNVVNISFMKVYDIAEGRIPTFKLDPTIALSEAEFIAQIDTLNSQGRSVLIALGGADAHIELTRGDEDALAAEIIRLTDLYGFDGLDIDLEQAAITAKDNQFVIPAALKMVKEHYRKTGDNFMITMAPEFPYLTANGAYTPYLTELDGYYDFINPQFYNQGGDGLWIEGVGWIAQNNDALKEEFIYYIADSLINGTRNYHKIPHDKLVFGLPSNIDAAATGYIQDPQDLYKAFDRLKAQGQPLRGVMTWSVNWDMGTDAANNSYNQQFIKDYGNFIHNQLPPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title High resolution crystal structure of catalytic domain of Chitinase 60 from psychrophilic bacteria Moritella marina.
rcsb
molecule keywords Chitinase 60
molecule tags Hydrolase
source organism Vibrio marinus
total genus 126
structure length 323
sequence length 323
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w5zA00
2XPKA 3A47A 3AIWA 2XHYA 3CIVA 3ARYA 3WF0A 3WENA 2QPUA 3SUWA 1JNDA 1ZBWA 5D9MA 5C70A 4UZUA 2E4TA 3AROA 1NOUA 1TUXA 1XH0A 4GI6A 3VD7A 3WMBA 4D6JA 5HDRA 3LPOA 4P8UA 3GXIA 3T2QA 3RJYA 2CXGA 3W82A 4QCFA 1QVBA 3GNPA 4YHEA 3ZQ9A 3EDJA 4P8WA 5E09A 6A3HA 1GONA 3TOPA 2UY3A 4ATLA 1K9TA 1KCLA 5FOOA 4AIOA 2VMFA 3RILA 1E3XA 4ZENA 2XIIA 1W2VA 2WCAA 4YPJA 3QR3A 1WPCA 1MQQA 4PSRA 3IAQA 4JFVA 3NDZA 3QHMA 4CVWA 1NOFA 1H09A 1MQRA 1PIGA 1QNOA 2WVVB 1C90A 1ISXA 3KE0A 2Y24A 3U7BA 5ABEA 1J0KA 1UR2A 5CJ5A 1H11A 1E6SM 2BXZA 1U33A 1EGZA 2VRQA 3MMDA 1WB0A 4W93A 5A2CA 3BAXA 4P7LA 3HU7A 1BLIA 2YDRA 1GOIA 1EHAA 3NYDA 3WFLA 4OIFA 4GZJA 2IXUA 1PZ2A 1B31A 4UQAA 1WDSA 2X09A 1LG1A 3VIIA 2X2YA 4MDPA 4P8XA 2O92A 2FDMA 2YOCA 1V3KA 3WF4A 4DWSA 1LG2A 3K4AA 1W3LA 1VBRA 4OKDA 1JFXA 3VDHA 3SUUA 3VD9A 4ATDA 4CVUA 1BYDA 3OZPA 4XB3A 2WNWA 1S46A 1QHOA 3PTQA 1UWRA 3I3EA 2FGLA 3HN3A 4CCCA 4JCMA 4J27A 3N1AA 1E4LA 1H0IA 4HPGA 3SCVA 4Y7EA 2V3GA 2PWHA 1KGXA 3U5UA 1CWYA 4TTUA 4GIAA 2E9LA 3OLEA 1W9DM 4BQ2A 4AZ6A 1UZ4A 1V0LA 3GXFA 4HMCA 1JXKA 4Q22A 1HP5A 2DQXA 2VZSA 1A3HA 1Q4NX 5DF0A 1XD0A 4NZCA 2IUZA 3BAKA 4HA4A 4MADA 4E4PA 3CTTA 5IHSA 2XTKA 1W3HA 4KMQA 1LWHA 3VDBA 1LQ0A 1V3JA 7CGTA 3CBWA 1NM9A 1C93A 3WEMA 3AHXA 1G94A 2ZE0A 2WWCA 1E70M 4ZEPA 1BVZA 3WQ4A 4FLQA 3W29A 2BS9A 2YJQA 5EFDA 3ZJ7A 4MDOA 3WNKA 1DHKA 3WDIA 4A3HA 1J0YA 3WNLA 1K9DA 5A1AA 1Z32X 3GYCA 4X0NA 1OINA 1CLXA 3WNOA 1UZ1A 2W67A 3TTYA 4M24A 4RE4A 4BF7A 3NIYA 2WVUA 3VX1A 4A3YA 3OBAA 1QOXA 1TA3B 4PMOA 4B9ZA 5BXTA 5ABFB 2QMKA 1I1WA 3WD3A 3WELA 4K68A 1DP0A 5AY7A 1VEOA 3VM5A 2OYKA 2VUYA 5CPTA 8A3HA 5EFFA 4MNJA 1BG9A 2B31A 1QI4A 4AZGA 5C8BB 2CBUA 1GVIA 3PZQA 4CU8A 5LA0A 4AZCA 1V02E 4PMYA 3B8SA 1HX0A 3CO4A 2WLYA 4UFLA 3CPUA 3MV01 4HP5A 1H4PA 2ZUMA 4UFHA 2G8ZA 1GOMA 1UKSA 2VL4A 2ZX7A 1FH7A 3VINA 3SUTA 1QNRA 2WKLA 1DWJM 1N82A 4UQCA 3PZGA 2VX4A 3MANA 4U33A 3QHNA 2D1ZA 3QGVA 5EBAA 1UD4A 1UA7A 4HPHA 3D5HA 3VIOA 1EDTA 1EIBA 2W62A 1PIFA 5IXEA 1B3XA 1E6PA 1RD6A 4UTFA 1BF2A 4DUWA 3WH6A 2J4GA 5GPRA 1PPIA 4R27A 2ZX9A 3ZO9A 2V5DA 1AQHA 1GCYA 3KL0A 3VDAA 2HISA 4LGXA 2VCCA 2BVTA 4CN6A 1HNYA 3VNYA 1W9UA 3W25A 3U57A 2XG9A 2TAAA 2XFRA 3SIMA 5DEZA 4BCEA 4BQ4A 4WKFA 1HKMA 1E6ZA 3QOMA 3CUGA 4M8UA 3WY1A 3UR8A 1ISZA 3AJ7A 4UFIA 2J7EA 3BCFA 4H41A 1EOMA 1C7SA 2X8RA 2WBGA 1MW1A 3ZT7A 4QFUA 1EXPA 1WDQA 2BVDA 3WQVA 1B9ZA 5JBDA 1J11A 1X6NA 1ZJBA 4EAMA 3AIUA 4U3CA 3SEPA 3GTNA 1XHGA 1PX4A 1JDDA 3ALGA 1DWGM 1CZ1A 3J7HA 3IJ8A 4HMDA 4CD7A 3S6TA 3ALFA 1KR1A 5CZKA 2GUYA 1QNQA 2Y2WA 4ACYA 3UEQA 4LYPA 4AMCA 3AMDA 5BXPA 2Q8XA 2JEQA 4PMNA 1H2JA 1CENA 3GDBA 3U7VA 2PI6A 1HVXA 4AWEA 4IPNB 5HOSA 3F5JA 1M7XA 1JYVA 5E0FA 2DGAA 2A3AA 5BCAA 5JIWA 3TA9A 3VNZA 4P7RA 4X9YA 1SFSA 2D3LA 1ITXA 1WAWA 1H5VA 3OLDA 1GOOA 2W66A 1KBKA 3WKZA 2WHJA 5I77A 3VIFA 3FXYA 1VIWA 1JI2A 3VOCA 1WNOA 3GH7A 3VX0A 3ARPA 3CHFA 1PZ3A 1UG6A 2WK2A 4B9YA 4GQRA 2WBKA 4QDMA 2VQUA 3VIJA 1E40A 1ISYA 3L4WA 5A2AA 1CXLA 2WMGA 2Z1SA 3WQ5A 4J3XA 3I3BA 1KB3A 3PBGA 3W6LA 3W0KA 4AY1A 5D4YA 4HOZA 4PCSA 3UETA 3ZT5A 3FW6A 4M82A 1WZMA 2ZUUA 4W7VA 3SCUA 2G3MA 2WCGA 4ZXOA 2WMFA 3ZJ6A 2GK1B 1VFFA 3OLGA 4PUDA 2XJ7A 4D71A 4DWSD 2YA2A 1VFOA 3WL0A 1UH3A 3PZMA 1NWRA 2CERA 1UR8A 3VPLA 3BAYA 3NSXA 4FLOA 1JYXA 3SUSA 1H49A 4TX8A 3AIQA 3AMGA 3UG3A 4D6DA 1F4HA 2JIEA 6TAAA 5A8NA 4EE9A 1C8QA 3MSGA 1L0PA 2VZUA 4ML4A 4Q7NA 1W1TA 3W6MA 5BROA 1R87A 1V08A 4AEFA 3N12A 1NP0A 1Q6GA 1KCKA 5A6JA 4HZ6A 1TVPA 4F79A 3W81A 4FLRA 1UKOA 3IJ7A 1LWJA 1TE1A 4XZBA 1J0HA 4D72A 5GNZA 2XVGA 3FY1A 2WM0A 3WF1A 3K1DA 5EB8A 2CETA 3GBDA 1QI0A 2WPGA 1NWUA 4FMVA 1HJXA 2QF8A 5A8QA 1YHTA 4XX6A 2CKSA 3WSUA 2Y8VA 5C71A 4X0VA 3AMKA 1I75A 3WNMA 1JF6A 3CMGA 2O9PA 1JI1A 1FHLA 2WMIB 4J28A 2GVYA 3AIBA 1CIUA 1W1YA 4N0RA 4AIEA 1KFWA 3IAPA 2E0PA 2ESCA 3CH9A 4PN2A 1HJUA 2IXVA 2BHZA 2G3NA 3ARQA 5D9OA 1W1VA 2CBVA 4CU6A 3VTRA 3ZR5A 2G3JA 1JZ5A 2XFYA 1SR0A 1VRXA 1PX3A 2BXYA 5HPOA 5BXRA 2XVKA 1E0VA 1XRVA 4JFWA 5A94A 2FH8A 3DECA 4RE3A 3PZUA 1LJYA 2DH2A 1ZB5A 5BRQA 2VTFA 3MO4A 4FLSA 1FP9A 3RM9A 1H0GA 3AISA 3ZMRA 3CZ8A 3M7SA 4AYSA 1GJWA 1ZBKA 1OGSA 1BYAA 1UWSA 2EXOA 1B90A 3II1A 5HBFA 5LYRA 4CN1A 4W8LA 1XCXA 3UCQA 2NW0A 4YHGA 4ZE5A 3SCNA 2VZOA 1NOWA 5JBEA 2OYMA 2XVPA 4AZIA 4JFTA 1QI5A 2WYSA 2G4FA 5A3HA 1TVNA 2J79A 2ZUWA 1UWIA 1OD8A 1B2YA 3TTQA 1GJUA 4M1RA 4S3JA 2YL6A 5HXMA 2CBIA 3A4AA 1D3CA 4J3VA 5KZ6A 2WHLA 2F2HA 2VRJA 2V3FA 1HN1A 1UUQA 1K6AA 1TR1A 3AFBA 4MTVA 1DTUA 4PMDA 2PBGA 1LL4A 4J3UA 3O9NA 2GJXA 4C7DA 3NSMA 4AZCB 5ABGA 1HVQA 2J7CA 4BQ3A 1WZLA 5CGMA 5E6ZA 1UWTA 1LF1A 5E70A 1GOWA 3M46A 2CNCA 1Y7VA 5FL1A 2D24A 5E0CA 1VFUA 4MJ2A 3GBEA 2ZXDA 3T0AA 2F61A 4PRWA 4AXNA 1BAGA 4Z2JA 4DWSC 1V0KA 1BG4A 3L4YA 5DT7A 5ECUA 4TVDA 1FH9A 2NSXA 4UOQA 3VM7A 2PWEA 2VCAA 1Q6EA 4AD3A 3TTOA 3MUY1 5CG0A 3CZKA 2GJRA 4HTYA 1P6WA 4OJYA 2G3IA 1BGGA 1TZ7A 5HNNA 4B15A 4PMQA 1XCWA 2FHBA 1CGTA 1FOBA 3SCQA 1X1NA 5CLTA 1BSIA 2WC7A 4FF5A 3L4ZA 4WJXA 1AMYA 4S3KA 1AVAA 2VNCA 1HJWA 1CXIA 1MVYA 4XV0A 1RPKA 2WC3A 2EO7A 4PTXA 4OOZA 2CBJA 4WK9A 3UESA 5BWFA 1HL8A 3B9DA 2W4XA 4NRRA 5A6MA 4M81A 1C92A 1E6XM 4NRSA 1W9XA 3UG5A 3PZNA 4UCFA 2XSAA 2E8YA 3AZTA 1E1EA 1V6WA 1WE5A 3CUFA 4ACZA 2PWGA 3PTMA 2BV9A 2UY2A 1OT2A 1G9HA 2XYLA 3GH5A 2J77A 1TCMA 4GINA 4U2YA 4UQBA 1OIMA 1E55A 1CDGA 1IV8A 2YBUA 3VGFA 4BZYA 3VUPA 2CEQA 2VT0A 3L2LA 3AZSA 3VMNA 4H7VA 3NSNA 4DM2A 4TOQA 3KL5A 3SUVA 4F9JA 1ZBCA 4JKMA 2AAAA 3MKKA 1OD0A 1SYTA 3N18A 3WDJA 3VDCA 4CD5A 3PHAA 3WUEA 1QHPA 2VX6A 4U5KA 4JIEA 2WKGA 5CSUA 2XIBA 2DT0A 3M07A 4TVUA 1UQYA 3WD1A 3IK2A 1JL8A 4UFJA 4QLLA 4W85A 4PTWA 1IT0A 2VVSA 2WC4A 5JUVA 5FKYA 3WQ6A 1U30A 1XH2A 2D23A 1O6IA 4PEEA 4WLCA 1QNPA 3VD3A 2BFGA 1V03A 4YN5A 2YDQA 5A6AA 4DUVA 1OB0A 1VEPA 1V02A 1OM0A 1MQPA 3GZAA 1E43A 3N11A 3AXXA 4D6CA 4CUCA 4QAWA 4PTMA 3CZEA 4PBGA 1B1YA 2WLZA 2YA0A 2X1IA 1R86A 1XD1A 4ZXLA 2GDUA 3RO8A 3ZM8A 3ZT6A 1QBAA 5GQBA 5BRPA 2J75A 8CGTA 4JKKA 2UY5A 2J8FA 3SCOA 3N17A 2WVVA 4NI3A 4XUYA 1MXDA 4M29A 2CKRA 2GDVA 3AMCA 1ECEA 3MU7A 2O9OA 1D7FA 4Z2HA 3ZJKA 1J10A 1K9EA 3AHZA 2ZUTA 3FNDA 3WN6A 3AQUA 1PBGA 4UQDA 1GOQA 1AQ0A 2WMKA 1E72M 1CLVA 1VBUA 2D22A 4W7WA 3CMJA 5I3DA 2CYGA 3WBEA 1RP9A 2ZX8A 1C91A 3AYSA 5M03A 4TTGA 3O6AA 4HZ7A 2D0GA 2CESA 3VGEA 3BAJA 1E5NA 3APGA 3EMZA 4V27A 1XV8A 3OA5A 1HKJA 3VGHA 3SCWA 3WF2A 2EEXA 1HKIA 4J3WA 2VZTA 3VU2A 2OSXA 3AI0A 1EO5A 3AOFA 4IM4A 3EDFA 4P7QA 2EPNA 1CGVA 5A6BA 4L4PA 1BYBA 1GOKA 4LYQA 1QW8A 5TD4A 4AZHA 1E6RA 3ZR6A 1UH2A 2NT0A 1BTCA 3ZSSA 2QMJA 1VB9A 3MMUA 2XWDA 4R5EA 4JL2A 4M80A 2UY4A 2WB5A 4QP0A 2ZX6A 1BVNP 3WMCA 3CHDA 3POHA 4V2XA 3RCNA 1W1PA 4RE2A 2BY1A 2FHCA 4J3TA 1C8XA 3I3DA 4HOXA 1XC6A 4FK9A 4RL3A 1DWIM 2DIJA 5E6YA 3B9AA 2RGMA 1UD2A 2CHNA 5DO8A 3VILA 1JIBA 2WVSA 4AD0A 4EK7A 3A6OA 3EMQA 4CKQA 4W5ZA 3WDPP 5F7UA 4A4AA 3F5LA 1KXHA 4AZBA 2V3DA 4M56A 1E4MM 4BQ5A 1D2KA 4JFUA 4LXFA 1JYNA 1BGAA 3W26A 1WDRA 1G1YA 3AXHA 4D6HA 5GNXA 3WH8A 1V6XA 3WBAA 4B16A 1CPUA 4C7GA 2OWXA 4OBRA 2CITA 1UR4A 3AHVA 5IFTA 1CEOA 5M17A 3N15A 4AZ7A 1C3FA 2JFEX 2YA1A 1BQCA 3AHYA 4PCTA 5JIPA 3CGTA 5HPCA 4HA1A 4MNLA 4HA3A 2XM2A 4GPNA 1E73M 4MB4A 4PMRA 3AIRA 2XVNA 2W63A 1UWUA 4P8VA 3UERA 3CHCA 1ODZA 2E9BA 5M5DA 3EDDA 4C7FA 4U2ZA 3MV11 2Y4SA 3PN8A 3RM8A 4IPLA 1Q6FA 2WHMA 2EQDA 3A4WA 4TX6A 4PMUA 1G5AA 2Y8KA 1WDPA 4KGJA 4NF7A 1CNVA 4ZFMA 1TA3A 2WSKA 4UQEA 2VC9A 5ABFA 2XFFA 1OT1A 2VQTA 3WDQA 4AD5A 1E4NA 5D8ZA 2WSPA 5A2BA 3TP4A 1PAMA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XPK A;  3A47 A;  3AIW A;  2XHY A;  3CIV A;  3ARY A;  3WF0 A;  3WEN A;  2QPU A;  3SUW A;  1JND A;  1ZBW A;  5D9M A;  5C70 A;  4UZU A;  2E4T A;  3ARO A;  1NOU A;  1TUX A;  1XH0 A;  4GI6 A;  3VD7 A;  3WMB A;  4D6J A;  5HDR A;  3LPO A;  4P8U A;  3GXI A;  3T2Q A;  3RJY A;  2CXG A;  3W82 A;  4QCF A;  1QVB A;  3GNP A;  4YHE A;  3ZQ9 A;  3EDJ A;  4P8W A;  5E09 A;  6A3H A;  1GON A;  3TOP A;  2UY3 A;  4ATL A;  1K9T A;  1KCL A;  5FOO A;  4AIO A;  2VMF A;  3RIL A;  1E3X A;  4ZEN A;  2XII A;  1W2V A;  2WCA A;  4YPJ A;  3QR3 A;  1WPC A;  1MQQ A;  4PSR A;  3IAQ A;  4JFV A;  3NDZ A;  3QHM A;  4CVW A;  1NOF A;  1H09 A;  1MQR A;  1PIG A;  1QNO A;  2WVV B;  1C90 A;  1ISX A;  3KE0 A;  2Y24 A;  3U7B A;  5ABE A;  1J0K A;  1UR2 A;  5CJ5 A;  1H11 A;  1E6S M;  2BXZ A;  1U33 A;  1EGZ A;  2VRQ A;  3MMD A;  1WB0 A;  4W93 A;  5A2C A;  3BAX A;  4P7L A;  3HU7 A;  1BLI A;  2YDR A;  1GOI A;  1EHA A;  3NYD A;  3WFL A;  4OIF A;  4GZJ A;  2IXU A;  1PZ2 A;  1B31 A;  4UQA A;  1WDS A;  2X09 A;  1LG1 A;  3VII A;  2X2Y A;  4MDP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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