4W5ZA

High resolution crystal structure of catalytic domain of chitinase 60 from psychrophilic bacteria moritella marina.
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
323
structure length
323
Chain Sequence
GTITSQDDNVVVGYWHNWCDGRGYQGGNAPCVELKTVNPQYNVVNISFMKVYDIAEGRIPTFKLDPTIALSEAEFIAQIDTLNSQGRSVLIALGGADAHIELTRGDEDALAAEIIRLTDLYGFDGLDIDLEQAAITAKDNQFVIPAALKMVKEHYRKTGDNFMITMAPEFPYLTANGAYTPYLTELDGYYDFINPQFYNQGGDGLWIEGVGWIAQNNDALKEEFIYYIADSLINGTRNYHKIPHDKLVFGLPSNIDAAATGYIQDPQDLYKAFDRLKAQGQPLRGVMTWSVNWDMGTDAANNSYNQQFIKDYGNFIHNQLPPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High resolution crystal structure of catalytic domain of Chitinase 60 from psychrophilic bacteria Moritella marina.
rcsb
molecule keywords Chitinase 60
molecule tags Hydrolase
source organism Vibrio marinus
total genus 126
structure length 323
sequence length 323
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w5zA00
1UR4A 1L8NA 2JF7A 1EQCA 4FLOA 4Z2GA 4TTUA 2ZUVA 2E8YA 2Y24A 5BRQA 2Q8XA 1HT6A 4CN4A 4UOQA 4W8LA 1E0WA 1KQZA 1W2VA 1KXTA 5D8WA 1EDGA 2J62A 5C70A 4UZSA 1E9LA 4QFUA 1EO5A 5ABHA 4KH2A 4FLRA 2D3NA 4UQAA 1B3WA 3GNPA 7A3HA 1GQIA 2WM0A 3KWXA 1PZ2A 2ZOXA 1BFNA 1TA3B 3KZSA 1C8XA 1E40A 1M04A 4OZOA 3BSHA 3CHCA 1ITCA 2FGLA 3WUFA 1A47A 2YDQA 1SFSA 3VGDA 4CD7A 2PBGA 1W9DM 1LG2A 4R27A 2ZWYA 1QPKA 4JCLA 4U3CA 2DDXA 2YBTA 4W8AA 2G41A 2G3JA 3UESA 3WUBA 4Z2KA 2A3CA 2A3HA 4H8VA 2GDVA 4JAWA 4W88A 3EMZA 2WWCA 4MDOA 1RH9A 3K8KA 5FD0A 2O9OA 1WCGA 3POCA 4OKDA 3ZSSA 3RO8A 3KEHA 2YA2A 4ZXOA 1V6XA 1LL7A 3APGA 3AI0A 2CKRA 4J3TA 3MV01 5FIPA 1UD8A 3EMCA 1MQPA 3UERA 1B3ZA 4JL2A 4H8UA 2WCSA 1DTUA 4PMZA 3W81A 3VX0A 5A8OA 2YLLA 5A95A 1ZJBA 2WHJA 2WHKA 3EDEA 4CVUA 3SUUA 2VCCA 2WMFA 3CGTA 2VZSA 1XYFA 1CPUA 2OSXA 1M53A 4OUEA 5JUVA 2G3MA 5A2CA 3MMUA 3TP4A 1W1TA 2ZICA 3WNOA 1JZ5A 1GVIA 2BY2A 5A8MA 5FL0A 3RPMA 1TVNA 2V38A 1PZ3A 2WKGA 4QLLA 2ZXAA 1MFVA 4JIEA 4PSPA 2VO5A 1E6ZA 3AS1A 2BS9A 3AIRA 4V28A 4CN1A 3ARRA 1HL9A 2CHNA 5M03A 4NRSA 2EJ1A 1NWSA 3EDDA 1UYQA 2VMFA 1M7XA 1MW2A 1G0CA 2XUCA 1LL6A 4QAWA 3JUGA 1HJWA 3WF0A 5CGMA 2VNCA 5HBFA 4H8HA 1HVQA 1UOKA 2O9TA 4AD0A 1R8LA 3IK2A 1NWRA 1WDPA 3N11A 3WF1A 1JI1A 3MU7A 4BA0A 2J8FA 3W26A 3AFBA 3LMYA 3AIWA 3OGRA 4DM2A 3WQ6A 3ALFA 3KL5A 2E9BA 2PF0A 5DF0A 1JZ4A 1ESWA 1CGWA 2WMIB 4UQDA 2X1IA 1J0YA 4FLSA 3UETA 3EDJA 3RILA 4XUYA 1W3JA 2J7EA 3L4ZA 5ABFA 4BS0A 4OOZA 1G01A 3EDFA 4UZUA 5A8PA 2WPGA 3WF3A 2XFRA 1GJWA 4XZBA 5AYBA 2DT0A 2D2OA 2QHAA 4J3UA 2J8GA 4KGLA 1X1NA 2J7GA 3WQ8A 1VFMA 4W5ZA 5D9OA 6A3HA 1SMAA 4ATLA 4PMOA 2XVNA 3W4RA 1I75A 4MB1A 1E6SM 3NUKA 4GO9A 1FA2A 3AXXA 2XTKA 2V5CA 3GXMA 1DWHM 2VJXA 4P7OA 3TA9A 3ZJ8A 4U5IA 3T0BA 2XG9A 2Z1KA 5I3DA 1EOMA 5DMYA 1XH0A 5BWFA 1E0XA 4J3VA 4Z2LA 1MW1A 3FNDA 1PPIA 3VNZA 2WMGA 3LPOA 4BCEA 2D3LA 2EXOA 1Q6DA 2Y5EA 1PIGA 1WZMA 4HMDA 1JAKA 3WL1A 4MADA 4IUGA 5E0CA 5LYRA 3VGFA 3GZAA 3WQ4A 2YL8A 3WQWA 1W91A 3VD9A 1NARA 4UFMA 4MAVA 5AY7A 1W9PA 2GUYA 1XD0A 1VBUA 1HVXA 1UHVA 1UKOA 4PMDA 1E5NA 4DWSA 1VJSA 4CD6A 4U3AA 4GO8A 3PN8A 2J74A 4JKLA 4HA3A 2V3EA 4UOJA 5CSUA 1HP5A 3AHXA 3N17A 4Z2HA 1JGIA 3VM5A 1VB9A 3AISA 3PTMA 3AIBA 1C92A 3VPLA 2CBUA 1JYVA 4HU0A 3AS0A 1XSJA 1E55A 2VRQA 1CZ1A 1GOOA 1ISWA 2VOTA 3HJEA 3GBEA 4TVUA 1JF6A 5BXRA 4J28A 3VINA 3W53A 1BF2A 2GFTA 5A6JA 1E3XA 3AMCA 6TAAA 2CERA 1XH2A 1I1XA 1H3GA 1E6PA 2FH8A 4IPNB 1XSKA 4ML4A 3VDBA 2WMKA 4DUWA 1AQ0A 2WVUA 2MANA 4CGTA 6CGTA 2EO7A 3L2LA 3DYPA 1ZBVA 3HU7A 3K8MA 5AYIA 4FLQA 1C7SA 1OIFA 2VX6A 1D3CA 1H0IA 1GOQA 4MNMA 5A6BD 1UR1A 5DT7A 1JL8A 2CNCA 1BPLB 1XH1A 4QLJA 1W9XA 4KRTA 2UY5A 1JZ7A 1UUQA 2WCGA 1H0GA 3VGEA 3VM7A 2VR5A 4B9ZA 2WANA 4LYQA 2XPKA 3T0AA 3WELA 5CLTA 5ABFB 3AMDA 1B0IA 3VIOA 4MB5A 1PIFA 1XSIA 2BVTA 3BAWA 4P8XA 5KZ6A 1XHGA 1CNVA 3OLDA 1UZ1A 1Z32X 5GNZA 1VFOA 2YDRA 2BHYA 5F7UA 3ARZA 3D5HA 1NWUA 2FH6A 2WHMA 5I0DA 2O92A 2XGIA 3FHQA 5I24A 3F4VA 3VNYA 1FH7A 4B3LA 1CXHA 3ARYA 2CKSA 3K1DA 1E4NA 1HKJA 3VIIA 1E0VA 4TTGA 1HL8A 2VX5A 3B9DA 1GJUA 3VIHA 2E0PA 4UCFA 3QHNA 5CPTA 1CGXA 1M03A 2WLZA 1GOMA 3VGBA 5IDIA 1TG7A 3VDAA 1BQCA 1LWJA 3OLIA 3W0KA 4NZCA 4PCSA 4H7VA 2PI6A 1E70M 2ZUNA 4BF7A 1GQKA 4CU8A 3RDKA 3CTTA 5DEZA 4AD1A 4WSKA 2VI0A 4AD5A 1HJSA 4E8DA 3PZMA 1TMQA 2EPNA 3PZTA 4PYSA 4V2XA 1UH2A 1KBKA 1V02E 3WSUA 2PWFA 3WN6A 5A2BA 3SCUA 2BXZA 2A3AA 5I23A 4PMYA 1GHRA 3ARVA 2EPMX 5CQ1A 4DWSB 3VIPA 1JAEA 5A6SA 1I1WA 3WDJA 4ATWA 1WZKA 4PTWA 3A4XA 4U2YA 3FXYA 3POHA 2CCRA 4HZ7A 2E4TA 3BCDA 3BLPX 4F79A 2WZHA 4AISA 2ZUUA 4F66A 1KQYA 3RJXA 3VOCA 2X0YA 1Q4NX 3FAXA 1JXJA 3U57A 1JDCA 3VILA 1OGSA 1UWRA 4PMNA 3MO4A 1TFVA 2WLYA 1V3LA 3WMBA 1W3LA 4HPHA 3VTRA 3PZUA 1RP8A 2VL4A 1E1EA 2J75A 2DIEA 1IT0A 1RPKA 1RP9A 3WY1A 1J0ZA 1KGWA 4DUXA 1VAHA 1V3HA 4BQ4A 1G9HA 3VUPA 2XVLA 2ZX6A 4X0VA 3UR8A 2BVYA 2WC4A 3T2QA 2O9RA 4F9JA 3U5YA 1OGBA 2A3BA 1UD3A 4AMCA 2XM1A 2WBKA 3ZT5A 3IAQA 3WD0A 5D9PA 4XZWA 1R7OA 4WKHA 5A6KA 4M29A 3SCTA 3UG4A 1E72M 2GSJA 2WVVA 1EQPA 3PZIA 4EE9A 1QI4A 5C8BB 1M01A 1DWJM 1WO2A 4D1IA 3CIVA 4AC1X 1JZ6A 1EIBA 5A6AA 4ACYA 1R7AA 1PX8A 3WQ5A 1X6NA 1JIBA 4N42A 1EXPA 3WMSA 2ZIDA 4MDPA 2CITA 4HMCA 4W7WA 1J0JA 2V3FA 1UWQA 4UFHA 1UR9A 1UR0A 2D0GA 3SUWA 3WDRA 4D6CA 5I6SA 3AIUA 2J77A 1VIWA 2YJQA 3IAPA 1QHZA 3VVGA 1UD4A 3AHTA 3RM8A 3MUZ1 1MYRA 1MW3A 4JKKA 2DSUA 3ARTA 1X6LA 2YA0A 3WEOA 3ARQA 1VRXA 2BHUA 3MUAA 3ARSA 4FMVA 1NQ6A 3VD7A 3GDBA 4F8XA 2WZEA 4HZ6A 3CHDA 3ZJKA 3TTQA 2UWFA 2O9PA 1HF6A 1LQ0A 4H2CA 4JL1A 1FHLA 3K8LA 4GI8A 4LGXA 3SIMA 2VX7A 4OBSA 1C8YA 4YN5A 1KWKA 1NM9A 1QHOA 1NWTA 7CGTA 1GNXA 4GKLA 3ZJ6A 2XM2A 4PMUA 1O7AA 4AD2A 1NOUA 2QLYA 1OINA 4TX6A 4L4OA 2DT3A 4WSJA 2BFGA 3A4WA 2C8NA 3TTSA 2DPEA 1GUVA 2CESA 3AQUA 1EOKA 2X05A 4L4PA 4TOQA 4MPKA 3BCFA 3O2LA 2XFYA 4D6HA 3W25A 4H41A 1GW1A 4M1RA 4PRWA 4YHEA 1V0LA 4LX4A 4TXEA 3CZKA 3PZNA 3ZR5A 2WXDM 1B3VA 2XJ7A 2WCAA 4U2ZA 5KEZA 1WDSA 4C7GA 1CXEA 3AXHA 2C7FA 2XVGA 4IM4A 3PHAA 2Y4SA 5CXPA 3SUTA 2J7FA 3L4XA 1US2A 3VMPA 3GYCA 1CECA 3ZM8A 3ZT6A 1UWIA 1HJUA 3QR3A 3TONA 5JIWA 4MNKA 1WZAA 3AIEA 1B31A 1QHPA 3PTQA 1NP0A 1QI2A 2GDUA 5A6LA 2W5FA 2E40A 1ECEA 1CXLA 5BXPA 3AOFA 3WUGA 1UKTA 2C0HA 4M82A 5GNYA 3PZQA 2RGLA 3PZGA 4W8BA 1C93A 1BGGA 2VQUA 3RJYA 3WQVA 1OM0A 3SCPA 4KGJA 2D22A 3CUHA 3CLWA 1CYGA 2WVVB 3VMNA 1GOIA 1JDAA 1Y7VA 4PMQA 2YLAA 3NYDA 2DGAA 3VDHA 3CHFA 3WD3A 2D0HA 3ARXA 7TAAA 4ZE5A 2E8ZA 2BVDA 3AS2A 2QF8A 2OWWA 1CGVA 2EBNA 2ZUSA 1H49A 1V3KA 1UQZA 5HPCA 4MJ2A 2ESCA 5I5RA 1F4AA 5BROA 5I78A 3S2CA 1UA7A 3U5UA 2NSXA 1GVYA 1QBAA 3AROA 1GHSA 2OSWA 5E70A 2WBGA 1V6UA 4Q7NA 1V3MA 3QHMA 2VURA 2WC3A 2ZUMA 1UD2A 5EFDA 1KWGA 5A94A 4W7UA 4MB3A 3GM8A 1FH8A 4CD8A 1QBBA 1IV8A 3VIFA 1UD6A 3SCRA 2X0HA 2XHYA 5C71A 3E1F1 4JHZA 2DSKA 3L4TA 1GORA 1DEDA 3VMOA 3N15A 2G4FA 4CCCA 4FK9A 4RE4A 3CZGA 1B1YA 3AYRA 4LYPA 4W93A 2YBUA 1E6QM 1FP9A 2GJRA 4JFVA 2CIPA 1V0NA 4W7VA 2QPSA 3BMWA 4UQ9A 4E4PA 1AVAA 2VR4A 1W9BM 1XD1A 1MFUA 4JFSA 1JFHA 1E5JA 4M81A 4AYSA 1QI3A 3L2MA 4AW7A 1OB0A 2RGMA 3WD1A 4D1JA 4UFJA 4HU8A 2QPUA 4M80A 2VVNA 3L4WA 2EPOA 5CGTA 1W1PA 2JF6A 4ZEPA 2ZXBA 2CETA 4HTYA 4GZIA 3WDHA 1E15A 4YPJA 1A3HA 4QLKA 2WKLA 4ATDA 4F9DA 3BAYA 5IXEA 2F8QA 2XWEA 3CO4A 4XB3A 1IZKA 3ZIZA 1WP6A 4BQ3A 1XRVA 2G3NA 3NCOA 5AC4A 4TVCA 1BYDA 3QGVA 1UR8A 1CXIA 5E0FA 1VENA 3CMGA 2DEPA 2V5DA 3SUSA 1QNRA 1KCKA 1QI5A 4FF5A 3VU2A 2PWDA 2BY3A 5D8ZA 1JXKA 2V3GA 2W61A 2W91A 3KE0A 3CZLA 1TZ7A 2WAGA 5A1AA 1OT2A 3ZT7A 4RE3A 1TCMA 1WDQA 2CBIA 1VEOA 3BLKA 4ZE4A 2FHCA 3L4YA 4P8WA 2IXVA 2G8ZA 3VIMA 1PBGA 1MXGA 1E73M 3WEMA 4UNIA 3GXIA 1FHDA 2J7CA 3O9NA 1TVPA 1JFXA 4B16A 3T2OA 3WH6A 1HJVA 1V3JA 1WNOA 3BC9A 3G6MA 1XV8A 4P7QA 3CHEA 4AIOA 2OYLA 3I3BA 4PUDA 1VBRA 2WZIA 1CDGA 2VZVA 4D6DA 1DWIM 1XGZA 5D9NA 1UQYA 1AQHA 4GIAA 3N18A 2W63A 3I3EA 3AMLA 5A2AA 2V3DA 3RCNA 1H41A 3CH9A 1VEMA 2E3ZA 4UTFA 2ZUWA 5A3HA 1DWAM 1JI2A 2WMJA 2QV4A 1KFWA 1W9VA 3W82A 4DUVA 3CUGA 1E71M 4HPGA 1GPFA 1E1FA 4X0NA 2XWDA 4J27A 3OZOA 3T2PA 3SCQA 1AMYA 1OCQA 3MS8A 3QOMA 4WKFA 1ZB5A 1PX3A 1BYBA 4EAMA 3T0DA 4CU7A 4PTXA 1QOXA 2VT0A 1UG6A 4WF7A 1P6WA 4AY1A 3FW6A 3GH7A 3LPGA 5A8QA 4DWSD 3MSDA 1BYCA 4A3YA 4D6GA 3BXWA 1BGAA 3SCNA 1K6AA 2OYKA 2AOSA 1E43A 4S3JA 3VD4A 4LPCA 2UY3A 4AZBA 3ZOAA 3A47A 1UA3A 1SR0A 1WZLA 1BHGA 3GXFA 2XVPA 1WE5A 5HOSA 1LLOA 2IUZA 1ODUA 4W89A 4HA1A 2CBVA 2QMKA 1WPCA 3AS3A 3BAKA 1CIUA 1G1YA 3CPUA 3GNOA 5CJ5A 4PBGA 5LA0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UR4 A;  1L8N A;  2JF7 A;  1EQC A;  4FLO A;  4Z2G A;  4TTU A;  2ZUV A;  2E8Y A;  2Y24 A;  5BRQ A;  2Q8X A;  1HT6 A;  4CN4 A;  4UOQ A;  4W8L A;  1E0W A;  1KQZ A;  1W2V A;  1KXT A;  5D8W A;  1EDG A;  2J62 A;  5C70 A;  4UZS A;  1E9L A;  4QFU A;  1EO5 A;  5ABH A;  4KH2 A;  4FLR A;  2D3N A;  4UQA A;  1B3W A;  3GNP A;  7A3H A;  1GQI A;  2WM0 A;  3KWX A;  1PZ2 A;  2ZOX A;  1BFN A;  1TA3 B;  3KZS A;  1C8X A;  1E40 A;  1M04 A;  4OZO A;  3BSH A;  3CHC A;  1ITC A;  2FGL A;  3WUF A;  1A47 A;  2YDQ A;  1SFS A;  3VGD A;  4CD7 A;  2PBG A;  1W9D M;  1LG2 A;  4R27 A;  2ZWY A;  1QPK A;  4JCL A;  4U3C A;  2DDX A;  2YBT A;  4W8A A;  2G41 A;  2G3J A;  3UES A;  3WUB A;  4Z2K A;  2A3C A;  2A3H A;  4H8V A;  2GDV A;  4JAW A;  4W88 A;  3EMZ A;  2WWC A;  4MDO A;  1RH9 A;  3K8K A;  5FD0 A;  2O9O A;  1WCG A;  3POC A;  4OKD A;  3ZSS A;  3RO8 A;  3KEH A;  2YA2 A;  4ZXO A;  1V6X A;  1LL7 A;  3APG A;  3AI0 A;  2CKR A;  4J3T A;  3MV0 1;  5FIP A;  1UD8 A;  3EMC A;  1MQP A;  3UER A;  1B3Z A;  4JL2 A;  4H8U A;  2WCS A;  1DTU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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