4W7UA

Crystal structure of xaccel5a in the native form
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
HMLKYVGVNLSGAEFNSRKKPGTLFKDYTYPAASDFSYFAGKGMNTIRLPFLWERVQPELNGPLDQAQLGLIKKSLEAAKANKQYLILDLHNYATYSGKRIGTSDVPAGALADLWRRLALEFKDDKAVIFGLMNEPNGISAPDWANAAQGTITAIRKTGAKNLILVPGTAYTGAHSWRSTSYGVSNAKALEILKDPGNNLAFEAHQYLDKDYSGTKPVCTSDSVGQEKLQGFTSWLRENKQKGFLGEFATANNPVCDKALEGMLTYMEKNSDVWLGWTWWAAGAWWKPDYPFTVQPGKDGSDKPQMAILSKYA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of XacCel5A in the native form
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
molecule keywords Cellulase
total genus 122
structure length 313
sequence length 313
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w7uA00
1CECA 3DC0A 3AI0A 2DT0A 3VO0A 5AYBA 5DFAA 2O9PA 1IZKA 4JFVA 1SFSA 1GCYA 4UOJA 1JNDA 1KR0A 4UOQA 2OYKA 2FHFA 4FLQA 1V3LA 3PZMA 2C8NA 4OJYA 1UQYA 1UZ4A 2YDSA 2WYSA 1JZ7A 2EPOA 3MU7A 1S46A 2E8YA 1J18A 1DWHM 5BROA 4AIEA 4CD7A 1AMYA 1OD8A 1CXLA 1JGIA 1MFVA 3CHEA 3BSGA 4MDOA 1QNSA 2QPSA 3GM8A 4NSBA 1B30A 3WDQA 1YQ2A 3A4WA 2J74A 2J7DA 3VPLA 2W66A 2XFFA 4W88A 4A3HA 1US2A 1JZ5A 4DUWA 3OB8A 3POHA 1ESWA 5HOSA 1B3VA 1EQPA 2GJPA 3U5YA 5CPQA 4FLSA 1PEZA 4ZXOA 3ARSA 1LL7A 4MDPA 3EBVA 1BGGA 3ARZA 3ARUA 2XSAA 3SUUA 1C3FA 1BLIA 1NP2A 1OCQA 4JHZA 2D0GA 3VILA 1WE5A 4J3SA 1UG6A 4IPLA 1RH9A 4GZJA 1G1YA 3BAKA 2BS9A 4PBGA 4GXPA 2CEQA 2WBGA 3KL5A 3W27A 1W1VA 5JBEA 1VIWA 1U2YA 5I24A 3VM7A 1G94A 3IJ7A 2CKSA 1E0VA 1HKIA 4MAZA 2YDQA 4IPNB 5CPTA 3WQWA 1CBGA 2O9RA 1KGUA 3FAWA 4H04A 4LPCA 2J4GA 1W9PA 2WMGA 3ZT5A 1VFOA 3UG4A 1HJXA 3BCFA 3DYMA 4M29A 2VVSA 2GVYA 1UYQA 3F5JA 2PB1A 3M6DA 1OINA 5HPCA 4Q22A 1E40A 1UKOA 4K68A 5A3HA 4YN5A 2WC7A 1BHGA 4GKLA 4WLCA 4CN4A 3WFZA 3MKKA 3VIGA 3W82A 1LWJA 3W0KA 1UR9A 2EPLX 5EFFA 3U57A 1VBRA 1VBUA 1VJZA 4D6JA 3ZJ6A 3WN6A 1KXQA 2A3EA 4U31A 1TA3A 1B3XA 4FLOA 2CITA 3UR7A 2XVPA 4C7GA 1JD7A 1BGAA 5D9NA 1E3XA 1JD9A 2CIPA 1V6WA 3SCUA 3TTQA 4BQ3A 4PUEA 3GH4A 2DSZA 2CNCA 3ZJ8A 5JUVA 3WNNA 5CLTA 3VMOA 3ZJKA 5IXEA 1KCKA 1C93A 1TVPA 1C8QA 1B2YA 2V5DA 4U33A 4TTUA 2ZX6A 1VB9A 1GUVA 1JAEA 1BG9A 1OT2A 1U30A 3VTRA 1UR4A 5DO8A 4ZENA 1MYRA 5M17A 1EH9A 3BXWA 3W38A 4C7FA 2A3HA 2OWCA 1C7TA 2W62A 4HZ8A 3NJ3A 3ARXA 3VDBA 2VX7A 5GQBA 3UEQA 3RDKA 2WSKA 2BHZA 3IK2A 1J12A 3AHZA 1E6ZA 4IISA 1EO7A 4PN2A 5ABFA 4P8UA 5A8NA 4DM1A 3SCRA 2BFGA 2J77A 1XSIA 3VNZA 2FHBA 4OKDA 3D3AA 1CXFA 1KXHA 1K6AA 3ZQ9A 1BSIA 1ZL1A 3J7HA 4Y7EA 2XM2A 4HPHA 5HPOA 2J8FA 4UCFA 3S6TA 3AJ7A 1TR1A 3IJ9A 1JXKA 4CU6A 4BQ4A 7A3HA 3K8KA 1VAHA 4MPKA 3W4RA 5A6JA 1BPLB 1QHOA 2VJXA 5ABGA 1CGVA 2XPKA 3ARVA 1JXJA 4CN1A 3QOKA 1E6SM 2RGMA 4UFKA 5A2CA 2E8ZA 1UD4A 3WQVA 1MW1A 3BLPX 3WH6A 2GJXA 5FIPA 1XGZA 4W85A 1D2KA 1OSEA 1WZKA 4AD3A 3LMYA 3WF0A 3WUGA 1JYWA 1V0MA 1YHTA 3GBDA 1K9FA 1FFQA 3AYSA 4DUXA 2Q8XA 1PX4A 2ZXAA 5KZ6A 1I1WA 3WMSA 4UQCA 3BAYA 3I3BA 3LPGA 5A2BA 2J7HA 3G6LA 3EMQA 2WANA 3NSMA 2G3MA 5EB8A 2VNCA 1WB0A 1VF8A 4M8UA 3E1F1 4AISA 3BAWA 2CBIA 4JL1A 3GNRA 2VT0A 4A4AA 1EXPA 1QI3A 1DWFM 4QP0A 2QPUA 3QOMA 3CUJA 1PBGA 2BY1A 4W8AA 3K8LA 1E4IA 4F9DA 3BAJA 3RPMA 1BQCA 1GORA 4PUDA 5A2AA 4QLKA 4D6CA 2A3AA 5FL0A 1CGXA 3AIBA 3MS8A 4AZ7A 1JI2A 1JZ6A 2X8RA 1M7XA 3IJ8A 3BGAA 3CTTA 1JZ4A 3EDFA 1JYXA 4TTGA 3NSXA 5A8QA 1GZJA 4PMNA 3VGFA 1CLXA 3THCA 3KWXA 2ESCA 3ARWA 3PTQA 1GJWA 2WWDA 5C70A 1HX0A 1UA3A 1E72M 4AZGA 7TAAA 1FOBA 3VINA 1ZJAA 2A3BA 4Q7NA 2WMHA 5D9OA 3MUY1 3SEPA 1ISWA 1QNPA 1V3KA 1AVAA 3SUVA 4W5ZA 1E6PA 3CZGA 3AMLA 1UWSA 2AAAA 2EPMX 4M80A 1KWKA 3FHQA 3W28A 4MJ4A 4WKAA 1W3KA 2G8ZA 3GNPA 3GXIA 5A6SA 4GI6A 2WVUA 2WCGA 4IUGA 3GXMA 4LQ1A 2J8GA 1Q4NX 1C90A 4TX8A 3VDAA 3OLEA 3W6LA 4GI9A 5BXSA 1Z32X 5HNNA 1CDGA 2A3CA 3WNOA 4BA0A 1FP8A 1F4AA 4AD0A 4P8XA 1O7AA 1DWGM 2VI0A 1C8YA 3WF4A 3L2MA 1HJWA 3RO8A 3NCOA 1GOMA 2BVYA 1H0IA 5TD4A 4ZEPA 1BVZA 2XFYA 3B9DA 4ACZA 2WLYA 1HKJA 2WMFA 4PCSA 4S3KA 5A95A 5GPRA 3FW6A 3PZVA 1EQCA 1H41A 1OD0A 4V2XA 1LJYA 1ZBCA 3N15A 1LF1A 1L8NA 2VZUA 3A4AA 3WEZA 2ZUWA 1JZ2A 4UQEA 1JDDA 4UZUA 5JBDA 4MNJA 5BRPA 3W29A 4L4PA 4BQ5A 4JIEA 1BYCA 3OG2A 3OLDA 5IFPA 1EDQA 1CZ1A 1KXVA 3OA5A 1BF2A 1M01A 3WDIA 3SCVA 1V3HA 4W8LA 3AHVA 2XGIA 1NWRA 3NIYA 1V6YA 3VOCA 4P7RA 1OGGA 4RE3A 1DWJM 4HMEA 4ZE4A 3N12A 5DT7A 4PMYA 2CKRA 2CYGA 1HVQA 3O2LA 5A6AA 3WFLA 2VC9A 1PZ2A 3K4AA 1GQJA 2ZWZA 1WDSA 4JCMA 4XX6A 1E4LA 3RILA 3OLGA 2XWEA 4CCCA 1HJVA 2OSXA 1KBKA 3GTNA 3L4WA 1W9VA 2E9BA 3WD4A 4PMUA 1UD3A 5IHRA 1FHDA 3QHNA 1EDTA 2WVSA 1TE1A 5DT5A 1LL4A 3VIJA 3WDPP 2YL6A 1KR1A 2EBNA 2WXDM 1NQ6A 8CGTA 2UY3A 3O9NA 1CLVA 1AQMA 1KGXA 4JFTA 3WMBA 3L4UA 4AW7A 1CWYA 2YA2A 4D6EA 2E9LA 4KGLA 2XUCA 1W32A 4D6DA 3CHDA 3AICA 4FMVA 2D2OA 4NZCA 4DWSA 3T0DA 4AIUA 2V38A 4RL3A 2WVVB 3ARRA 3CMJA 1H11A 3K4DA 3VIFA 1LG1A 4AEFA 1ODUA 1CEOA 1KB3A 9CGTA 2X1IA 1E6XM 1JF6A 2VX6A 2ZUNA 4UFJA 3AMGA 5CSUA 3PZ9A 4JAWA 1UA7A 4LXFA 1KBBA 2XVKA 4P7NA 4ZXLA 3W6MA 3WL1A 1QHZA 3T0BA 3FN9A 1GPFA 5I79A 4X9YA 2F61A 4X0VA 1XD1A 3BAXA 2Y4SA 2DQXA 3OLIA 2VRKA 4JL2A 1W9XA 4QAWA 1Q6GA 1G5AA 3SCTA 3EMZA 1KQYA 1C92A 3QGVA 1MQQA 3SURA 2JEPA 4DWSC 5AC5A 1BG4A 2ZXQA 4AYSA 1JDAA 1W1PA 1DWIM 4AMCA 4W86A 4B16A 1FFRA 1GOOA 4D6HA 2NT0A 1BVNP 4AIOA 1ZBWA 5A6BA 3RM9A 2ZUSA 2DPEA 4JKMA 4PMZA 4CCDA 2IXUA 3THDA 3A4XA 3A47A 2PC8A 2YDRA 3PZUA 2XJ7A 4U3AA 3WBEA 2D20A 1JYNA 1UQZA 4RE4A 2GJRA 3CBWA 3VD7A 4Z2LA 1L0PA 4CVUA 2RGLA 2Z1SA 2XSBA 1TZ7A 3VIMA 3S2CA 3IANA 1WDPA 2E4TA 1VFFA 2EQDA 1DP0A 3CHFA 3RIKA 3W26A 4GZIA 3UG3A 2XG9A 1NOWA 2VOTA 3AHTA 3WSUA 1W2VA 6CGTA 3N11A 2YIHA 1JNEA 3WMCA 1B3ZA 4R27A 3CIVA 4OBSA 1EIBA 4F8XA 1CXIA 4PTWA 1W3JA 1EOKA 2Y5EA 4MAVA 4CKQA 2VZSA 5AC4A 2UY2A 1E56A 2W4XA 2DIJA 1C8XA 1H0GA 3BH4A 5FL1A 5A8PA 2E40A 2VCAA 2ZWYA 3CUGA 1W1YA 2OWXA 2WHJA 4TXEA 1OIFA 4LX4A 4HOXA 2XVLA 2J7GA 1C91A 2VQUA 4P7QA 1HL8A 2BXYA 1B9ZA 1QHPA 5I23A 1UD8A 1LL6A 3EDDA 5IFTA 3L4VA 1V02E 5JIPA 1UR8A 2VQTA 4MNMA 3JUGA 2PI6A 1QI4A 3LPFA 1XYZA 4AZHA 1E73M 1QNRA 2XGBA 4WSKA 1WZMA 2Y2WA 3AYRA 4AY1A 2CERA 4ZFMA 3N9KA 4D6IA 2EPKX 3EDKA 3RCNA 1OGSA 1UOKA 4D6GA 1UWRA 2DT3A 1I1XA 2WKLA 4D1JA 5IHSA 1G9HA 4DWSD 3TP4A 4UQ9A 4RE2A 1WCGA 1E9LA 1XH2A 2BNJA 1JIBA 1V3JA 3MSGA 3W25A 3AMDA 3CO4A 3PBGA 3AS3A 3HJEA 2FGLA 3NSNA 1J0ZA 1E0XA 1CNVA 3WNKA 1R85A 5BYWA 1E4MM 1R8LA 1OBAA 4KGJA 2JALA 3O6AA 3RJYA 5CSYA 4PMDA 3EDEA 4XUYA 3WKZA 2JE8A 2YLAA 4QLJA 1EHAA 3DECA 3ARTA 3PZQA 3GXDA 3VM5A 4A3YA 2J7CA 2ZX5A 3BAIA 3UERA 2WBKA 4W8BA 3SCSA 4J3VA 4AEEA 1M04A 4N0RA 1O6IA 2JIEA 1J0YA 3BCDA 4V27A 1H09A 4AWEA 2OYLA 2OSYA 4AD4A 2DSUA 4Z2KA 3ZR5A 1JI1A 1DWAM 4UQBA 1GOKA 1D3CA 1WDRA 5M5DA 4PMVA 3AIEA 3UR8A 2D0HA 4FF5A 1CXHA 1I75A 3ZT6A 5A6BD 2VURA 1MVYA 1Q6CA 2DT1A 3VGBA 4AZ5A 1E70M 4NF7A 2CESA 3VD5A 3VU2A 4MB1A 4Z2JA 1V0LA 4GPNA 1NWTA 4PSPA 1NM9A 3CUHA 3QHMA 3WF3A 1A47A 4J3TA 1NP0A 4ACYA 1QI2A 3F4VA 1UH4A 1DHKA 1HVXA 2JEQA 1UH3A 4CGTA 3BSHA 3WUEA 3VGGA 1U33A 2JF7A 3D5HA 2WK2A 4AZIA 1H5VA 2QLYA 4JFUA 2FDMA 2VCCA 2C0HA 1V3IA 1HP5A 3ARQA 1HIZA 1UKPA 2ZUUA 2EPNA 3VDHA 2XYLA 3EYPA 1VFUA 1QVBA 5E09A 4P8WA 3UG5A 1ODZA 3OGRA 1J10A 4HPGA 1X1NA 1VEOA 3CPUA 2ZUMA 1B1YA 1E6RA 3M46A 3FY1A 5ECUA 1AQHA 2E9MA 3VD3A 1FH9A 4HA3A 1JAKA 4GI8A 3WL0A 3NYDA 1SMAA 2VZVA 3AHYA 4ML4A 1W3LA 4GZEA 2J78A 2XVNA 1MFUA 4JKKA 3TTSA 3BMVA 3WF2A 4U2ZA 5CGMA 3ALGA 3WD2A 3WH7A 4UFHA 2V5CA 1EA9C 4CCEA 5ABEA 4ZE5A 4XZBA 5BXTA 5DMYA 4NRSA 4P7LA 1JZ8A 1R7OA 2OYMA 2GSJA 2GJXB 3N13A 1V03A 3T09A 2FH8A 1GJUA 3ECQA 1W9UA 3MMDA 3PZTA 1CXKA 4UOZA 8A3HA 1CIUA 2PWDA 3MMWA 4BF7A 2Z1KA 3VX1A 3LPOA 1E6QM 2BY2A 2CHNA 3MSDA 1V02A 4ATLA 5BCAA 3WH8A 4CD8A 2G4FA 3BC9A 4LYRA 3AIRA 3AIQA 4PTVA 2WMIA 1V3MA 1K9DA 4GQRA 4H2CA 3AXHA 2VRJA 5E0FA 4HP5A 1XYFA 5CG0A 2XFRA 2G3NA 1GHRA 1BAGA 5E9AA 3MANA 4QCFA 1PX3A 2QF8A 3VDCA 2PF0A 4M81A 2BHUA 1JL8A 1MWOA 2JFEX 1V6VA 4JFWA 3SCOA 1JF5A 2EJ1A 1B0IA 3PZOA 4CVWA 1GW1A 4HA4A 3RMEA 1MW2A 2NSXA 1B90A 1BYBA 2UY4A 2IXVA 4URIA 3AXXA 3GBEA 3CZLA 2O9OA 2J7FA 4HZ7A 3VUPA 2XM1A 2DEPA 2YOCA 2V3DA 3F5KA 1UKQA 4WF7A 1PX8A 1H4PA 1ISYA 3CLWA 2CBVA 2DDXA 1CGTA 4KMQA 3OGSA 2F2HA 1FA2A 4W93A 4MJ2A 1UH2A 3AS1A 5A8OA 3AZRA 4EKJA 2YA0A 4GINA 4F66A 3OZOA 1TFVA 2JF6A 4M56A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CEC A;  3DC0 A;  3AI0 A;  2DT0 A;  3VO0 A;  5AYB A;  5DFA A;  2O9P A;  1IZK A;  4JFV A;  1SFS A;  1GCY A;  4UOJ A;  1JND A;  1KR0 A;  4UOQ A;  2OYK A;  2FHF A;  4FLQ A;  1V3L A;  3PZM A;  2C8N A;  4OJY A;  1UQY A;  1UZ4 A;  2YDS A;  2WYS A;  1JZ7 A;  2EPO A;  3MU7 A;  1S46 A;  2E8Y A;  1J18 A;  1DWH M;  5BRO A;  4AIE A;  4CD7 A;  1AMY A;  1OD8 A;  1CXL A;  1JGI A;  1MFV A;  3CHE A;  3BSG A;  4MDO A;  1QNS A;  2QPS A;  3GM8 A;  4NSB A;  1B30 A;  3WDQ A;  1YQ2 A;  3A4W A;  2J74 A;  2J7D A;  3VPL A;  2W66 A;  2XFF A;  4W88 A;  4A3H A;  1US2 A;  1JZ5 A;  4DUW A;  3OB8 A;  3POH A;  1ESW A;  5HOS A;  1B3V A;  1EQP A;  2GJP A;  3U5Y A;  5CPQ A;  4FLS A;  1PEZ A;  4ZXO A;  3ARS A;  1LL7 A;  4MDP A;  3EBV A;  1BGG A;  3ARZ A;  3ARU A;  2XSA A;  3SUU A;  1C3F A;  1BLI A;  1NP2 A;  1OCQ A;  4JHZ A;  2D0G A;  3VIL A;  1WE5 A;  4J3S A;  1UG6 A;  4IPL A;  1RH9 A;  4GZJ A;  1G1Y A;  3BAK A;  2BS9 A;  4PBG A;  4GXP A;  2CEQ A;  2WBG A;  3KL5 A;  3W27 A;  1W1V A;  5JBE A;  1VIW A;  1U2Y A;  5I24 A;  3VM7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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