4W7UA

Crystal structure of xaccel5a in the native form
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
HMLKYVGVNLSGAEFNSRKKPGTLFKDYTYPAASDFSYFAGKGMNTIRLPFLWERVQPELNGPLDQAQLGLIKKSLEAAKANKQYLILDLHNYATYSGKRIGTSDVPAGALADLWRRLALEFKDDKAVIFGLMNEPNGISAPDWANAAQGTITAIRKTGAKNLILVPGTAYTGAHSWRSTSYGVSNAKALEILKDPGNNLAFEAHQYLDKDYSGTKPVCTSDSVGQEKLQGFTSWLRENKQKGFLGEFATANNPVCDKALEGMLTYMEKNSDVWLGWTWWAAGAWWKPDYPFTVQPGKDGSDKPQMAILSKYA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of XacCel5A in the native form
rcsb
molecule keywords Cellulase
molecule tags Hydrolase
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
total genus 122
structure length 313
sequence length 313
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w7uA00
4NF7A 1LL7A 4LYQA 4UQCA 3N17A 3ARWA 4M82A 4H8VA 1HKIA 4MAZA 5FL1A 5D9NA 4X9YA 1B3WA 1HF6A 5JIPA 1G94A 4PMXA 5A2BA 1E55A 2CHOA 2YL8A 1H0IA 3KZSA 5BCAA 1S46A 2C8NA 3TP4A 1JZ7A 4RL3A 5C71A 2XIIA 3VIPA 3WDJA 1B3ZA 4HA1A 1TMQA 2WNWA 3SURA 3WEMA 1ITXA 4XZBA 4XZWA 1J9YA 3ALGA 3ARSA 3WH7A 3ARVA 2EJ1A 1RH9A 4PMNA 3RCNA 3ARUA 1FHLA 2WC4A 1BYAA 1NWUA 4UFJA 2CBVA 3EBVA 3WKZA 3N11A 3UG5A 4XUYA 3WQ4A 4C7GA 3NYDA 3N9KA 1E71M 2WVVB 4C7FA 3E1F1 3CLWA 3CO4A 1IV8A 1E70M 2Y2WA 1G01A 4UQEA 3SCNA 3T0DA 4XB3A 3ARRA 1V3MA 1OT2A 1QBBA 3I3EA 1WDQA 4W7VA 1OT1A 5CPTA 2WMFA 3RMEA 1XCXA 1BYBA 4CN1A 1US2A 4NSBA 4B3KA 2GJXA 1IZJA 1GQIA 2XFRA 2VZSA 1M04A 3SUVA 4OOUA 5BXTA 4KWUA 1J01A 2WVSA 5FL0A 4AW7A 2PWHA 2IXUA 5A2CA 4MDOA 2W91A 4MADA 3N12A 2JIEA 5A6MA 1A3HA 1XC6A 3I3BA 1ISVA 1I75A 1QNOA 1UWTA 5AC4A 3AROA 2VRKA 3VILA 3OA5A 3WUBA 1CXIA 3VKKA 3K4AA 4WKFA 2NSXA 4JFWA 4D6HA 3RM8A 1KCLA 2GUYA 4PTMA 3UG4A 3B8SA 2A3BA 4TTGA 3VDCA 1VBRA 3BGAA 1L8NA 1PZ3A 3L2MA 4GO8A 1NARA 4EAMA 4LQ1A 4B3LA 4W8AA 1OWQA 3ZJKA 1NP2A 4D6GA 2JFEX 2A3EA 2E3ZA 3ZSTA 2OSXA 4J3SA 5EBAA 5CG0A 5A8PA 1ZBWA 1QNRA 3M7SA 1E6PA 3POCA 3WENA 4U2YA 1E4LA 4CVWA 5E6YA 3WNOA 3SCTA 3MV01 2QF8A 4KRTA 1C3FA 1RPKA 3PTKA 3WFLA 1C93A 2Y5EA 3GBEA 4J3UA 1VIWA 5A2AA 1NWSA 2D22A 2UWFA 1V6VA 2D1ZA 3ZQ9A 1EH9A 2W62A 6CGTA 3VIOA 2ZUSA 3CUIA 1QNQA 2J7GA 3AHZA 3MUAA 5AY7A 3CTTA 2HVMA 1E3XA 2EPLX 1W3HA 1HJXA 2B31A 3WQWA 4A3HA 1D2KA 4P7NA 1RP9A 3VTRA 1WKYA 2FH8A 2CBJA 2DH3A 4PUEA 2TAAA 4PCSA 4PUDA 3MUZ1 4IPLA 4FMVA 1UH2A 1XYZA 2X0YA 4CUCA 2XM2A 1WCGA 2WMHA 1HP5A 3CHCA 1HKKA 1TUXA 2ZX9A 1MYRA 2J7BA 2RGLA 1KCKA 3BAIA 1Q4NX 3BAYA 3AIQA 2CETA 2VX5A 1J0KA 4DUXA 1GOMA 2J4GA 1JF6A 3EDJA 2V3GA 3WD1A 4JCLA 1KGXA 1BHGA 4H8UA 1BG4A 5LA2A 1UYQA 2YA1A 3BAWA 1PZ2A 3UEQA 2VX4A 3G6LA 1V02E 3SCQA 3VD7A 1TZ7A 2YLAA 1OM0A 2XPKA 2UY5A 3BCFA 3LPGA 4ATLA 2VL4A 4PMQA 3EDFA 1GORA 2VO5A 1XD0A 3AMCA 2BHZA 3WQ5A 3AHVA 3CMJA 4AIEA 1JZ2A 1E4MM 3AMDA 3QOMA 4AIUA 2BFGA 4W85A 4OBSA 2J8FA 5CSYA 3DC0A 4IPNB 2XTKA 2ZICA 3M6DA 1E6SM 1QBAA 2VJXA 3CPUA 2WLZA 2J74A 3TTSA 1KQZA 1UH3A 3FW6A 1W9PA 1OB0A 2DT0A 4HTYA 3PZUA 1Q6GA 4U3CA 4GI6A 3EMQA 1HXJA 5BYWA 2J7HA 1G9HA 1B90A 4HP5A 3NSMA 4L4OA 4DWSA 1W1PA 4U3AA 4UCFA 3ARTA 5BWFA 1BFNA 3NDZA 1GQKA 4AY1A 2W61A 4LPCA 1W2PA 1JFHA 1YQ2A 5I5RA 3WBAA 5HOSA 2GJXB 4GI8A 1QHOA 5EB8A 5I23A 5ECUA 4J27A 5FIPA 5GPRA 1QW9A 1WE5A 2UY4A 4J3XA 3OZOA 3N13A 1UUQA 2VOTA 4PMVA 3WL0A 3WNMA 1C91A 1HKJA 1WZLA 4H2CA 3VM7A 3GM8A 3OLIA 1V3LA 1WDSA 3WH8A 5A8QA 3BXWA 3W24A 3I3DA 5IFPA 1QNSA 1EOKA 4UR9A 3W29A 4W93A 2EBNA 1JL8A 1MFVA 1C8YA 3AMLA 5A6SA 1OD8A 5I79A 5HNNA 1R7AA 1KFWA 2W4XA 3B9DA 2ZXDA 5JBFA 3VIMA 1P6WA 1JZ4A 3OG2A 2BVTA 4QFUA 4BQ3A 2XG9A 1EHNA 1TVNA 2WB5A 4HZ6A 3L4XA 3FXYA 2FHBA 1HJSA 2D3LA 1QI4A 1VBUA 3AMKA 1GOQA 4P7RA 2VCAA 2OSYA 3U5UA 2PBOA 1GVYA 3EDEA 1MW3A 2VZUA 3U7VA 1XH1A 1W9VA 2EEXA 5CSUA 1HJVA 3MSDA 2ZX7A 3WEOA 4J3WA 5I3DA 2VVNA 1UOKA 4PEEA 1WZAA 2WVVA 2VC9A 1E6XM 2F8QA 3DHUA 3TOPA 4QAWA 4Z2HA 2YOCA 3PZGA 2Z1KA 2DDXA 2JALA 2VRJA 2OSWA 3MV11 2GVYA 4CN6A 4DUWA 1FA2A 4W89A 1VRXA 4BZYA 3OGSA 1CXFA 1B30A 4W86A 5GNYA 5M17A 3GBDA 1WO2A 4B9YA 4MNLA 1GQJA 4OOZA 1FP9A 3AICA 2HISA 2OLHA 1CGTA 4E2OA 4RE2A 1UH4A 4D1IA 3AHXA 3EDKA 1NWRA 5E9AA 5BRQA 2ZXQA 1SYTA 2E4TA 1OINA 4ZE4A 4UQAA 5TD4A 5D9MA 1E1FA 2VQTA 1VJSA 5A6BA 3DYOA 1VFUA 1DEDA 2J78A 4TVDA 4N0RA 4H04A 4NZCA 3WH9A 3HMCA 1PAMA 2WVTA 1CWYA 3WNKA 1NM9A 1V6UA 3MMWA 4RE3A 3BAJA 1W9XA 1C8QA 2YA2A 1QNPA 4CKQA 3S2CA 2Y8VA 5ABHA 1Z32X 3OB8A 2VT0A 4BQ2A 1XCWA 4TVUA 3VIJA 1JAEA 2G41A 3VDBA 1CLXA 1QVBA 1UR1A 1V6XA 2G4FA 4PBGA 4KRUA 1KQYA 3GDBA 4GQRA 4D1JA 1CGUA 1KB3A 3U5YA 5E0CA 2ZX5A 4GZIA 2G3NA 1FHDA 2G3MA 3F5KA 5A1AA 5D4YA 1PIGA 1B1YA 3AS3A 1LG1A 4JFVA 1ECEA 3SUSA 3UR7A 3WF1A 4CU6A 1TR1A 2V3EA 4HMCA 4AC1X 1KXVA 3GNRA 3CZEA 1HNYA 4DUVA 1ZS2A 1V0LA 2CBUA 4UOZA 3CUFA 4DWSB 1BGGA 1E56A 5A6LA 1OGBA 3WFZA 1M01A 1UA7A 1NP0A 5IHSA 1HJQA 1ZJAA 1U30A 6TAAA 1PIFA 2WMJA 2WCSA 1UD4A 4GKLA 4UQBA 1E15A 1FH9A 3W27A 2XVLA 2JIWA 3VU2A 4V28A 1TE1A 5HPOA 1RP8A 3L4WA 2F61A 1SMAA 2O9TA 4AWEA 2BHUA 1B2YA 4HMDA 3VIHA 5CPQA 1V3HA 3WF0A 1E5NA 3D3AA 2YBUA 1LF1A 1J0HA 3FY1A 3AS2A 2X1IA 2W66A 2Y4SA 4D6JA 5I24A 2VX6A 2YDRA 4PRWA 4ZEPA 2YL9A 4FLRA 1V3JA 1GONA 2VVSA 3O6AA 4FF5A 3IJ9A 2WYSA 1EGZA 3UERA 4J28A 2OWCA 5LYRA 4Z2GA 2D23A 1OIFA 5KZ6A 1IZKA 4DM1A 1I1WA 1F4HA 2V5DA 2CESA 3VNZA 1HVQA 3AFBA 3WDRA 2ZXAA 4TX8A 5A95A 4AD2A 4CU7A 1MQQA 3CHDA 3L4ZA 5BROA 2FDMA 4Y7EA 1K9FA 3WY1A 3ARQA 1EOMA 4D6CA 4MPKA 5FCZA 1W1YA 2WHMA 3AIEA 4AEEA 3U7BA 5C70A 4CVUA 3ZJ7A 2VX7A 1DP0A 1CXKA 1X6NA 4MNKA 4A4AA 4CCCA 3VIKA 1U33A 3FAXA 3AS0A 1EXPA 5CLTA 7TAAA 5I0DA 5AC5A 5CPSA 2VCCA 3AIVA 4R5EA 4UTFA 4IM4A 2CXGA 4ACYA 3POHA 3IAQA 2ZX6A 1UD5A 3WQ6A 3AMGA 2WM0A 3PTMA 1ESWA 1JDDA 1VENA 4F79A 3AI0A 3II1A 3WMSA 4QDMA 3VIGA 4E8CA 4OUEA 3KE0A 4HOZA 5HDRA 1BGAA 1HP4A 3WIJA 5BXSA 1CGXA 4Z2JA 1ZL1A 1MWOA 2WAGA 2WW5A 3KL5A 3KWXA 4UZSA 1WNOA 1GUVA 2GSJA 4PYSA 4BF7A 1PJ9A 4BA0A 4M24A 2QMKA 3WBEA 1EQCA 4ATDA 1KXTA 4PMYA 4UFKA 5LA0A 4FLQA 1XH2A 3CGTA 4Q7NA 1V08A 3D5HA 1J0IA 3IJ8A 4U5KA 2WLYA 1KWGA 1Y7VA 1C92A 5DMYA 3MS8A 3A4WA 2V38A 4AZBA 3ECQA 3VDAA 2WC7A 2X8RA 3PHAA 4HU8A 2A3HA 4M81A 3RJYA 3GXFA 4PSPA 2BV9A 1FP8A 1HT6A 2CITA 1GHRA 5EFFA 1V0KA 4OIFA 2WBGA 3NIYA 4AD3A 1YHTA 1M53A 2ZE0A 3FHQA 4QCEA 4U31A 2XVNA 1HJUA 4GPNA 1UHVA 1J0ZA 3WELA 1QI3A 2X09A 2J47A 4MDPA 1FFQA 1QI5A 3B9AA 4TVCA 1MXGA 4TUFA 1WP6A 1UZ4A 3NDYA 4MB4A 4BQ4A 3W81A 3T09A 3IAPA 2WHLA 3PZMA 3U57A 3EDDA 4U33A 3PZIA 3ARXA 1JI1A 1WDRA 2PB1A 3K46A 1UA3A 3AIRA 1LQ0A 3L4UA 1UKQA 1CEOA 3MMDA 3WF3A 1QW8A 3SCWA 1KXHA 1KR1A 1W9BM 3AXHA 4W5UA 3CZGA 1CGVA 2BXZA 1UR8A 2QPUA 1XRVA 3CH9A 2G3JA 1D3CA 2WMKA 3T08A 4WSJA 1K9TA 3MUY1 2WCGA 4KGLA 4X0NA 4P8WA 1GJWA 4WJXA 3RPMA 3VX1A 2CCRA 3ARZA 5M03A 3SUWA 4JKMA 3WN6A 1UWQA 3FHAA 4JFUA 1X1NA 3VD4A 1H5VA 4MAVA 2W92A 1XGZA 5GNXA 2WZHA 1MW0A 2VMFA 1GOOA 4XV0A 3F4VA 5FKYA 4D6DA 2WZIA 1RD6A 2VZVA 2VZOA 1OIMA 1JDCA 2WZEA 4EK7A 1WB0A 2GJRA 4M8UA 4F66A 2X0HA 3GTNA 1LG2A 1E40A 4Z2KA 5E6ZA 3VGHA 1UD2A 2O9PA 2VQUA 1UWRA 2WBKA 2OYKA 1EHAA 3TA9A 1IT0A 1BF2A 3M07A 2DT3A 1MQRA 1CECA 1J10A 2QV4A 4HZ8A 4WF7A 2UY2A 2XVPA 4S3KA 3SIMA 1HN1A 1A47A 1JNEA 1UQYA 1BSIA 1G1YA 1MW1A 3UETA 3W0KA 3AIWA 3CBWA 4AZ6A 1N82A 3AQUA 5HPCA 2ZOXA 4AZ7A 1EDTA 1ISXA 1UR4A 1C90A 1CLVA 3FN9A 2D3NA 4J3VA 8A3HA 1W1VA 1LWHA 4URIA 2BY2A 1UWUA 3SUUA 2DH2A 4F9DA 1EDQA 2XJ7A 3N15A 3FNDA 4L4PA 3HN3A 1NOWA 1ODZA 4M56A 2IUZA 5HXMA 4JFSA 1BYDA 5IFTA 3BSGA 3CUGA 1HL9A 1AMYA 1EO7A 4XX6A 1JZ3A 1QHPA 2E9MA 1CZ1A 2BXYA 3PBGA 4H7VA 2BY0A 3CHEA 4MJ4A 4MNJA 2EPMX 4UOQA 2W67A 4MNMA 4ZENA 2EPOA 3KL3A 3UESA 3VPLA 5A94A 5C8BB 4AZCA 1Q6EA 1QHZA 3ZJ6A 1E3ZA 1CIUA 1DTUA 1VB9A 1ZB5A 2XIBA 3DHPA 3CUJA 4KH2A 5JIWA 4K68A 4QLLA 1SFSA 3N18A 3BH4A 4OZOA 4P8UA 3CZ8A 4W7UA 2VR5A 3WD2A 4HMEA 4KGJA 3VDHA 4AZ5A 3MSGA 5A8NA 4J3TA 1PPIA 4JKKA 1KGUA 2CIPA 3VMOA 5A3HA 4P7QA 1UR9A 1E4IA 1HX0A 1OGSA 4B9ZA 1XHGA 1WZKA 4ACZA 3LPPA 3PZOA 1DWFM 3CZKA 3W26A 3VGGA 1J12A 2PWEA 2FHFA 4W7WA 1LL6A 1V3IA 5KEZA 1Q6DA 3AYSA 3L4TA 1PX4A 2FHCA 2C0HA 4GQQA 3ZT7A 1TVPA 3LMYA 4W8BA 1E43A 4HU0A 1VEPA 8CGTA 1FFRA 2BHYA 1JD9A 1JYVA 2CEQA 2PWFA 2YA0A 2CKRA 4HOXA 1DWIM 5ABFB 1TCMA 3ZOAA 2DQXA 2RGMA 3WUEA 3SCUA 1BLIA 1CDGA 1SR0A 2NT1A 4V27A 4AXNA 3WSUA 3TONA 3AS1A 3GXIA 1ZJBA 2XGIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4NF7 A;  1LL7 A;  4LYQ A;  4UQC A;  3N17 A;  3ARW A;  4M82 A;  4H8V A;  1HKI A;  4MAZ A;  5FL1 A;  5D9N A;  4X9Y A;  1B3W A;  1HF6 A;  5JIP A;  1G94 A;  4PMX A;  5A2B A;  1E55 A;  2CHO A;  2YL8 A;  1H0I A;  3KZS A;  5BCA A;  1S46 A;  2C8N A;  3TP4 A;  1JZ7 A;  4RL3 A;  5C71 A;  2XII A;  3VIP A;  3WDJ A;  1B3Z A;  4HA1 A;  1TMQ A;  2WNW A;  3SUR A;  3WEM A;  1ITX A;  4XZB A;  4XZW A;  1J9Y A;  3ALG A;  3ARS A;  3WH7 A;  3ARV A;  2EJ1 A;  1RH9 A;  4PMN A;  3RCN A;  3ARU A;  1FHL A;  2WC4 A;  1BYA A;  1NWU A;  4UFJ A;  2CBV A;  3EBV A;  3WKZ A;  3N11 A;  3UG5 A;  4XUY A;  3WQ4 A;  4C7G A;  3NYD A;  3N9K A;  1E71 M;  2WVV B;  4C7F A;  3E1F 1;  3CLW A;  3CO4 A;  1IV8 A;  1E70 M;  2Y2W A;  1G01 A;  4UQE A;  3SCN A;  3T0D A;  4XB3 A;  3ARR A;  1V3M A;  1OT2 A;  1QBB A;  3I3E A;  1WDQ A;  4W7V A;  1OT1 A;  5CPT A;  2WMF A;  3RME A;  1XCX A;  1BYB A;  4CN1 A;  1US2 A;  4NSB A;  4B3K A;  2GJX A;  1IZJ A;  1GQI A;  2XFR A;  2VZS A;  1M04 A;  3SUV A;  4OOU A;  5BXT A;  4KWU A;  1J01 A;  2WVS A;  5FL0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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