4W84A

Crystal structure of xeg5a, a gh5 xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase from ruminal metagenomic library, in the native form
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
340
structure length
340
Chain Sequence
DRSRVFDILSNINIGWNLGNTLDATGGGNSVNAETSWGNPKTTQEIVDTVNDRGFNAIRIPVTFANHLGPAPEYTISADWLARVKEVVDYAVNDGMYIILDTHHETNYWLKTDPNNEAALCEELAAIWKQLAEAFKDYDEKLMFEGMNEPRMAGSAKEWSGGTPAERKLINAMNKAFIDAVRATGGNNADRVLIICTYGHNSDEPTLKDLEIPSDPNIAVALHTYTPYFFTYVADGSYSVWNGSKKNDITWQYNNIKKYLIDKGIPVVITETGAQFKENTEDIVRWIGDYVGTLDQDGVKCFIWDNNIYHGNGEKFGLLNRSLLKWYNDDIVDAYVNHAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Uncultured bacterium
publication title Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-d-Xylp(1 6)-d-Glcp Recognition at the -1 Subsite within the GH5 Family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase
total genus 143
structure length 340
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.151: Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase.
pdb deposition date 2014-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w84A00
4CD8A 3VX1A 5A8NA 4A3YA 1JZ7A 1J0YA 2QHAA 3N04A 2CKRA 4NRRA 1OT2A 4LYQA 4CUCA 1XGZA 4XUYA 2YLAA 1W9DM 4JIEA 2UY2A 2YJQA 4CCCA 2PF0A 3K46A 1BQCA 2VX4A 4AZ6A 4DWSD 1LWJA 3WDIA 3TTQA 4AD5A 3WH9A 3AIWA 4E2OA 5A94A 4HU8A 1BLIA 1W3KA 4TX6A 2B31A 1JYVA 1PEZA 3L4WA 2WWDA 3WNKA 3RMEA 2E8ZA 3POHA 5FD0A 3MKKA 2WB5A 2WZHA 2YL5A 2BVYA 4MTVA 2D24A 4PMQA 2ZX9A 2RGMA 3W29A 3TTSA 4FLRA 4YN5A 2ZX6A 2JEPA 3SEPA 1BHGA 1E3XA 2MANA 3VM5A 3IAPA 4NSBA 2WC4A 3HJEA 1FP8A 3RM4A 4HA1A 3SCOA 3SURA 5DF0A 4JKKA 2ZIDA 3SUTA 4A3HA 1ZL1A 4U2ZA 3VIJA 1Q6FA 4UTFA 2VX6A 1V6XA 2QPSA 1O7AA 2XFRA 1WZMA 3AMCA 3VNZA 3PZIA 1JZ6A 2W92A 1AMYA 9CGTA 1NQ6A 3APGA 4OIFA 1BF2A 1KXVA 1XC6A 4FLQA 2ZUSA 1JG9A 4DWSA 3VM7A 4JHOA 2WHLA 4PMZA 4TTGA 1ECEA 2CBIA 4CVWA 3CPUA 3AYRA 2D0HA 5A8PA 4U5KA 5A6LA 2WLZA 2JF7A 1A47A 2DSKA 1H4PA 2XGIA 2EPKX 2ZXQA 3CBWA 1B2YA 2UWFA 3CHCA 1NWTA 4ZE5A 4BZYA 1NWUA 3AOFA 3IAQA 3WH7A 2VJXA 4HZ8A 3SCVA 2WVVA 5EBAA 3T09A 2F61A 1N82A 1M53A 4U3CA 3POCA 1FP9A 3AI0A 2HVMA 4LYRA 4M29A 1E0WA 1UOKA 1B0IA 3UCQA 5LYRA 4MPKA 3W37A 2Y4SA 4UQDA 1E4MM 2J7HA 1H3GA 1Q6DA 2VC9A 1HVQA 3KL5A 1GCYA 3T0AA 2WBKA 3VMOA 2A3HA 3GNPA 1QNSA 1CXFA 3WMBA 4W85A 1LJYA 1C7TA 1BYBA 3MMWA 2PB1A 3AISA 3AYSA 3LPFA 3RJYA 2CNCA 3NDZA 1NARA 3L4YA 4JKLA 2XIIA 1E0XA 3THCA 4PSPA 1PIFA 2EEXA 1Y7VA 2VRKA 5IXEA 2NT0A 2ZXDA 1CGXA 4TTUA 5I77A 2W91A 3AIEA 4QCFA 5DEZA 1J01A 4PUDA 3MMDA 5EFDA 2XYLA 3UG4A 3NYDA 3ZR6A 1EH9A 4HMCA 1E56A 2J7GA 2WMHA 4MJ4A 2V3EA 1C3FA 1NOFA 5BRPA 2UY4A 3DHUA 1ISWA 4YHGA 1W3LA 2D23A 5HXMA 1ZBVA 2CBUA 1W9VA 3N11A 3VTRA 4DUWA 5DMYA 1HKJA 1UR2A 3PZUA 2ZICA 2XVLA 3CUHA 1V0MA 2WZEA 5CPTA 4PYSA 1DWGM 3ZO9A 1E6ZA 1RH9A 4MB5A 4PMOA 3WKZA 4RE4A 3BAYA 4DUVA 1CGYA 1HXJA 3ALGA 4WF7A 1W32A 3KL0A 1X6NA 2J7EA 3NSMA 4B3KA 2Y2WA 4M8UA 1FFRA 2D20A 3OA5A 4MAZA 3BAIA 3GYCA 1B9ZA 2DSZA 3PZNA 1GJUA 1U30A 3ZJ6A 4WSJA 2FH8A 3F4VA 1EOMA 4LXFA 2WCSA 1PBGA 3O6AA 1WP6A 3RPMA 4HZ7A 4DM2A 1QHOA 3WUBA 2XVNA 4CCDA 5HPOA 4ATLA 1XYFA 3MUAA 2XM1A 5GNYA 4D1JA 4KGJA 2BY1A 1KBBA 4UFLA 1FHLA 1KXQA 4HMDA 1VJZA 2O9TA 2XHYA 4W88A 1EOKA 2FHCA 1Q6EA 1UA7A 3RM8A 1QNPA 1JXJA 4P7QA 4V28A 2GJXB 2VZTA 3GXIA 1UQYA 2J79A 2XG9A 1XV8A 3D5HA 4P7LA 3AS3A 4GI6A 1VAHA 4KRTA 1XCWA 2ZXBA 4PSRA 1AQ0A 2CYGA 1UR4A 1V0NA 3MUIA 5I79A 3MV01 1VEPA 3BAXA 3VD9A 4AD0A 3TONA 4UOJA 1UWSA 1UKOA 1ZS2A 1SMDA 4MNMA 1B3WA 2DH2A 5HPCA 1NP0A 3B9DA 1BG4A 4X0VA 3VPLA 2VRQA 4UFKA 3RIKA 4K68A 4FK9A 4EANA 3FAWA 3K8MA 1LLOA 1JDDA 4E8DA 1LQ0A 4F9DA 1K6AA 4DM1A 1R8LA 4LYPA 1BSIA 1LL6A 4F79A 1HJVA 1F4HA 3VGEA 3VINA 3L4ZA 4H8HA 3SCRA 3W6MA 4C7GA 3AS1A 1HKMA 4XV0A 5FIPA 1K9FA 2CERA 4IISA 1UUQA 2WCAA 3OLIA 4OJYA 4FLSA 1H1NA 3QOKA 3AHYA 3FW6A 1O6IA 3ZT6A 4N0RA 2GSJA 2D0FA 4BS0A 1ISZA 2D22A 2PC8A 3AMKA 3PTMA 1QOXA 5A1AA 2VQTA 1UD8A 5I78A 2WWCA 3AIBA 2VO5A 1UR0A 4U2YA 4UQCA 1FH8A 4JL1A 4W87A 1HVXA 3WNOA 2F2HA 1JFXA 2FDMA 5DO8A 3W24A 5C71A 4AZBA 2VX7A 3RCNA 3LPPA 4GO8A 2D3LA 4AZCA 4UFIA 3OGRA 5KEZA 3EMCA 4FF5A 3NUKA 2ESCA 4CU6A 1IZKA 4GIAA 3EMQA 4JFVA 2W66A 1BVZA 5D4YA 1J0IA 2GFTA 1OGBA 5ABFA 1IV8A 3T0DA 3QR3A 2CHNA 1VRXA 1XCXA 2V38A 4J7RA 1X1NA 3DYPA 4GXPA 2E8YA 5CPSA 2O9PA 3GXMA 3RO8A 1BAGA 1JI2A 4W7VA 4NI3A 1KGUA 3VGGA 4QLKA 4W7UA 3NCOA 4U5IA 5D9OA 1IZJA 5CG0A 1QI3A 2CITA 3VDHA 1MQQA 1TZ7A 3CZLA 1PJ9A 3OG2A 4PTMA 1W1VA 2ZWYA 2CPUA 4M81A 1WDRA 3WUGA 3WQWA 1JYWA 1LL4A 3CUGA 4ACZA 4J3SA 1ODUA 1QNQA 2NSXA 1IT0A 3SCTA 4D6HA 5EMYA 4PCTA 3WIJA 3T2PA 2WANA 1OIFA 1E5JA 6CGTA 2BY2A 4DWSB 1HL8A 1MW3A 4MADA 2WMIA 4CCEA 1KCKA 5BWFA 5M3WA 4BCEA 4F9JA 2J77A 1HF6A 3WFZA 3EDDA 1UYQA 1V08A 3RDKA 3TOPA 4UQ9A 4M80A 4BF7A 3GNRA 1UA3A 1DHKA 1JF5A 3ARVA 3AHTA 3N17A 1C93A 1I75A 4PCSA 2ZX5A 1GPFA 1MW2A 4AC1X 4AEEA 3VIMA 4AISA 5D9PA 3WEZA 4EKJA 1E9LA 2BY3A 5E0CA 1FHDA 2WVVB 4FMVA 4D6EA 3E1F1 4P7NA 5IHRA 3WNLA 2J7FA 1W3JA 4MNKA 4Z2LA 3VIHA 3AIVA 2J25A 2YA2A 1EIBA 4TVDA 4AZIA 4AZHA 5AC4A 1JAKA 3WF4A 4D6DA 4GQRA 3NIYA 2YBUA 5CGTA 1JIBA 1EGZA 1RP9A 3AJ7A 2Z1SA 2X8RA 1V6YA 5DT7A 2IUZA 4D72A 2DQXA 4CD6A 2IXUA 1G94A 2OWCA 3OIHA 4S3KA 3WY1A 3J7HA 3FN9A 1MW0A 1UR8A 4PMNA 1KR0A 3DHPA 2Y8VA 1FA2A 3ARUA 3BCDA 2WC7A 2WK2A 1OGSA 4D6CA 4HZ6A 3VGBA 2W5FA 4W5UA 3K8LA 3QGVA 5I24A 3TTOA 3WF2A 2E3ZA 3AXIA 2XSBA 4AD1A 1UWUA 1R85A 2WHJA 1E6QM 3M07A 4JFTA 1VEOA 1CYGA 4CD4A 3WH8A 2PWGA 4WSKA 2OSXA 3FHAA 1HJSA 4AMCA 1UH4A 4DWSC 3OLGA 4UZUA 1MXGA 2J8FA 3UESA 1QI2A 1B1YA 2DH3A 4Z2JA 1HIZA 1D3CA 3WQ8A 2EXOA 1US3A 3UERA 4HMEA 5CJ5A 1SR0A 5A69A 4CN4A 1GUVA 4L4PA 5FL1A 3VIPA 2EO7A 4MB3A 3AXXA 4W93A 4IUGA 3F5LA 1CXKA 5E6YA 2Y8KA 1HNYA 1AVAA 2V3GA 2DPEA 2WM0A 3TA9A 2Q8XA 2XUCA 1B3ZA 3IJ9A 1Q6CA 2YKKA 2WLYA 3AZSA 4Z2IA 2WCGA 3N12A 3N18A 2XVPA 1WKYA 3VD7A 4U31A 2WSPA 1KXHA 1NH6A 2C0HA 1WO2A 1CIUA 3NJ3A 4Z2KA 5C70A 5BXPA 5A8OA 2QMKA 3TTYA 1L0PA 5BXRA 4PMXA 2VX5A 2ZUWA 2YDRA 1J0ZA 2XVKA 2GK1B 4URIA 1PX8A 3G6LA 2DIJA 3W4RA 1FH7A 3CO4A 7TAAA 5CZKA 4Q22A 3IJ8A 5JBFA 3SCPA 5CLTA 2PWFA 1NP2A 3QHOA 5EB8A 1BTCA 3ARXA 3WUFA 1TA3A 1W9BM 3WMSA 2C8NA 3VVGA 1V3IA 2XTKA 4LX4A 1K9DA 4AW7A 1GORA 5ABEA 1C92A 2A3AA 2ZOXA 2ZX8A 5E70A 4CN1A 4QLJA 4J27A 4E8CA 1QI5A 3B8SA 2E40A 1JAEA 2WMFA 3WD0A 2GUYA 3ZSTA 1FH9A 2XFYA 3ECQA 3VO0A 1CNVA 2DIEA 4ZXLA 2JIEA 3FHQA 3IK2A 4Q7NA 1XRVA 1UKPA 1MYRA 1CXLA 4HTYA 2Z1KA 1QHPA 3AHXA 1B90A 5LA1A 1QHZA 1V3MA 2J4GA 3BSHA 5IFPA 1C7SA 1R87A 2PWEA 4CGTA 2ZUVA 1BGGA 5A8MA 3BMVA 4UOQA 1MXDA 1HT6A 1JXKA 4OOZA 2V5DA 1J11A 4IM4A 2VRJA 3UETA 4NRSA 3B9AA 3HU7A 1QW9A 2VVNA 3MANA 3T2OA 1Q4NX 2EPLX 4X0NA 2JF6A 4D71A 3AIRA 4N42A 3GM8A 3WDJA 3WL1A 1WNOA 4MB4A 3OZOA 1YQ2A 4QAWA 3ZM8A 4AZCB 4UCFA 5A2BA 3O9NA 1OT1A 2QMJA 1E6PA 4GZIA 2WMGA 3QOMA 1GQKA 1JDCA 3DC0A 4PMRA 5DT5A 3DYMA 1RPKA 2XWDA 3W28A 4M82A 3VGDA 1FOBA 3WH6A 3KE0A 3BAKA 2RGLA 4XB3A 3CZ8A 2UY3A 4HU0A 1TUXA 2W61A 3MMUA 5F7UA 1WZKA 4J3UA 3N9KA 1EDGA 1WB0A 4D6IA 1R7OA 2YL9A 1PZ3A 4MDOA 4J3XA 2XGBA 1S46A 4J3WA 2GJRA 3AIUA 3CZGA 1XH0A 2OLHA 4RE3A 2Y5EA 2XM2A 4PTWA 2OYKA 1ITCA 3WDRA 1VJSA 2J7DA 3GXFA 3SUVA 3ARQA 3QHMA 4KMQA 2VZUA 2PBOA 1AQMA 4HA4A 4C7FA 1JYXA 5JBEA 2DT1A 5A2AA 5A6BA 1WDPA 1MFUA 1MFVA 3WEMA 2J74A 1W1PA 1GOWA 3AXHA 2BNJA 4JCLA 5D8ZA 1PPIA 5GPRA 3WF3A 1E6XM 2XJ7A 1JD7A 3PZOA 2VI0A 5D8WA 3UR8A 3W53A 4W7WA 4AZ7A 2X0YA 1JF6A 3WQ4A 1PX3A 3MV11 2E9LA 1H41A 4P7RA 3GTNA 3ARTA 3SCNA 3CTTA 5HNNA 5AY7A 1W91A 2HISA 1GQLA 3RILA 5GNZA 1E71M 3PBGA 1E1EA 1JZ3A 1VIWA 1MWOA 2YL6A 2FHFA 3JUGA 3VNYA 1BGAA 2IXVA 3A3HA 1V6UA 4JZ5A 2CBJA 3VMPA 2E4TA 4ZE4A 2NT1A 3BMWA 2ZE0A 4JFUA 1CPUA 4PN2A 4W5ZA 4PMDA 3WH5A 3VGHA 3WNNA 1BVNP 1H0GA 1GOKA 1CECA 1V3JA 2CXGA 1JD9A 4GI8A 2OWXA 4PMUA 4P8VA 1KGWA 2E9BA 3BGAA 4PBGA 3A4AA 1HKKA 2GDUA 2WPGA 3SUSA 1UG6A 3PZMA 2V5CA 4H41A 6A3HA 1UWRA 2EJ1A 5E6ZA 3OB8A 3KWXA 1UD5A 2BXZA 3VD3A 1UH2A 4ZXOA 4M24A 1NWRA 2FGZA 4JFSA 3MU7A 2WHKA 3AMDA 4MB1A 4UQAA 4XZWA 5BXSA 4Y7EA 3CHDA 2FH6A 1G9HA 1Q6GA 1WCGA 3SUWA 1E43A 3VX0A 1NOUA 2Y24A 1JDAA 1ZBCA 4D6JA 1J0KA 2J78A 4CU7A 1EDTA 4P8XA 1UZ1A 3ZQ9A 1J10A 5HDRA 1CXHA 3ZMRA 4EE9A 3CLWA 3NSNA 3U5UA 4GPNA 4BQ2A 4BA0A 2QF8A 3WF0A 5A8QA 1G01A 3ZJKA 3CZJA 5I23A 2DSUA 3A4XA 2DEPA 2BVDA 1E1FA 1GHSA 2VVSA 2AOSA 2OYLA 1BPLB 1KCLA 3U57A 1BFNA 2XFFA 1GNXA 2VQUA 2VOTA 4NF7A 1PX4A 4AD3A 5A2CA 3BC9A 4AZGA 3I3DA 2J7CA 3MSGA 4CVUA 1J18A 4TOQA 3UEQA 1KBKA 1E5NA 1UKQA 2ZUNA 2OYMA 3BXWA 1GHRA 2JALA 1OINA 4V2XA 3T2QA 3ZJ7A 3O2LA 5BCAA 3DYOA 2VCBA 4XZBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4CD8 A;  3VX1 A;  5A8N A;  4A3Y A;  1JZ7 A;  1J0Y A;  2QHA A;  3N04 A;  2CKR A;  4NRR A;  1OT2 A;  4LYQ A;  4CUC A;  1XGZ A;  4XUY A;  2YLA A;  1W9D M;  4JIE A;  2UY2 A;  2YJQ A;  4CCC A;  2PF0 A;  3K46 A;  1BQC A;  2VX4 A;  4AZ6 A;  4DWS D;  1LWJ A;  3WDI A;  3TTQ A;  4AD5 A;  3WH9 A;  3AIW A;  4E2O A;  5A94 A;  4HU8 A;  1BLI A;  1W3K A;  4TX6 A;  2B31 A;  1JYV A;  1PEZ A;  3L4W A;  2WWD A;  3WNK A;  3RME A;  2E8Z A;  3POH A;  5FD0 A;  3MKK A;  2WB5 A;  2WZH A;  2YL5 A;  2BVY A;  4MTV A;  2D24 A;  4PMQ A;  2ZX9 A;  2RGM A;  3W29 A;  3TTS A;  4FLR A;  4YN5 A;  2ZX6 A;  2JEP A;  3SEP A;  1BHG A;  1E3X A;  2MAN A;  3VM5 A;  3IAP A;  4NSB A;  2WC4 A;  3HJE A;  1FP8 A;  3RM4 A;  4HA1 A;  3SCO A;  3SUR A;  5DF0 A;  4JKK A;  2ZID A;  3SUT A;  4A3H A;  1ZL1 A;  4U2Z A;  3VIJ A;  1Q6F A;  4UTF A;  2VX6 A;  1V6X A;  2QPS A;  1O7A A;  2XFR A;  1WZM A;  3AMC A;  3VNZ A;  3PZI A;  1JZ6 A;  2W92 A;  1AMY A;  9CGT A;  1NQ6 A;  3APG A;  4OIF A;  1BF2 A;  1KXV A;  1XC6 A;  4FLQ A;  2ZUS A;  1JG9 A;  4DWS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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