4W85A

Crystal structure of xeg5a, a gh5 xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase from ruminal metagenomic library, in complex with glucose
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
339
structure length
339
Chain Sequence
DRSRVFDILSNINIGWNLGNTLDATGGGNSVNAETSWGNPKTTQEIVDTVNDRGFNAIRIPVTFANHLGPAPEYTISADWLARVKEVVDYAVNDGMYIILDTHHETNYWLKTDPNNEAALCEELAAIWKQLAEAFKDYDEKLMFEGMNEPRMAGSAKEWSGGTPAERKLINAMNKAFIDAVRATGGNNADRVLIICTYGHNSDEPTLKDLEIPSDPNIAVALHTYTPYFFTYVADGSYSVWNGSKKNDITWQYNNIKKYLIDKGIPVVITETGAQFKENTEDIVRWIGDYVGTLDQDGVKCFIWDNNIYHGNGEKFGLLNRSLLKWYNDDIVDAYVNHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-d-Xylp(1 6)-d-Glcp Recognition at the -1 Subsite within the GH5 Family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Uncultured bacterium
total genus 151
structure length 339
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.151: Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase.
pdb deposition date 2014-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w85A00
4UR9A 1BYBA 4JFTA 1G0CA 4XZBA 3OIHA 1JZ5A 3N13A 5DT7A 4ZE4A 3VMNA 1UR0A 3AMCA 3K8KA 2W66A 1GPFA 4K68A 1AVAA 1UZ1A 2E8ZA 4MDOA 1HJXA 2WVVA 2ZX5A 1E15A 3VUPA 3OZOA 1CBGA 1PPIA 3PZOA 2XVNA 2EPKX 3BAIA 1OGBA 3CLWA 2CBUA 3A4XA 3AHXA 4NF7A 2XWDA 2Z1SA 4W8AA 2CETA 4V27A 4GZEA 1IV8A 4RE2A 4AZCA 3I3BA 3VD7A 3ARUA 2E8YA 2J7FA 4RE4A 1E6PA 1KXQA 4ACZB 1SMAA 3W37A 4UQCA 2BY1A 4GIAA 2XVGA 1KR1A 3SCTA 2Y24A 4B16A 3PZQA 2YDQA 3WDPP 3AIVA 4PCTA 4MDPA 3CTTA 2FDMA 4ML4A 3FAWA 4JKMA 3CZ8A 3N11A 2J7HA 1GVYA 1UKTA 4FMVA 4AD3A 1H2JA 4Z2IA 4EAMA 4H2CA 3DYOA 3ZR6A 1LL4A 2A3CA 2O9TA 1CGVA 3VDBA 2WLYA 3AMKA 1DWIM 4PTXA 1UYQA 1RP8A 4F9JA 4CD7A 1NOWA 3RDKA 1UQYA 5BXPA 2WPGA 2VURA 2JFEX 4U3AA 3MS8A 3AXHA 1ZBWA 2FH6A 2VZVA 4AISA 4UZUA 4NSBA 1X6LA 2JALA 3VIJA 2J8GA 5E0FA 2EO7A 2QMKA 2NT1A 2VR4A 3NCOA 3QR3A 1HL8A 3DHPA 4YPJA 4CCEA 3OZPA 1HVXA 2WB5A 3VM7A 2UY5A 4D6IA 4J3TA 2WWDA 4MADA 1ZU8A 1KCKA 3FN9A 4PCSA 5A2CA 3WNOA 2CYGA 1QNSA 1MW0A 1EXPA 1KXHA 1LWJA 5F7UA 1CLVA 3ZOAA 2D1ZA 4LYRA 3WENA 1W2VA 4PSRA 1QHZA 2GFTA 2PF0A 2D0FA 5BXTA 1JNEA 4WF7A 4TVUA 3RCNA 1Q6EA 3ZT6A 1E6QM 2CKRA 4OBSA 1PZ3A 1DP0A 3T2PA 2J7BA 3AMLA 1BF2A 3GXDA 4M82A 1H5VA 3ZO9A 2BY2A 3A6OA 2CHOA 4GZJA 3O9NA 3AS3A 1CGXA 1HKIA 1HKMA 3WF4A 4LYPA 3ARVA 1L8NA 1M7XA 1C92A 3ZR5A 3FHQA 2Y8KA 4PBGA 4DWSC 3AIEA 5CGMA 4JKKA 1UWSA 3MUZ1 1E0WA 1GOOA 1XYZA 2YLAA 3PZTA 3K4DA 5JBEA 3RIKA 1E4LA 4BQ5A 3AIUA 2DT2A 4NZCA 1OINA 3HJEA 4J3WA 2DIJA 4WKAA 1BQCA 4HU0A 2QPSA 2ZWYA 1WKYA 1BYAA 1ZJAA 2DSWA 4WKFA 4C7DA 3CHEA 3SCSA 3WDRA 1HIZA 2ZXAA 2DSVA 4PN2A 5EFFA 5DO8A 4A4AA 3ZJ7A 3G6LA 1UA3A 1L0PA 2VCCA 1V3MA 4UFMA 5IXEA 5CGTA 3WKZA 1HF6A 2V3EA 2RGLA 1PX8A 4E8DA 3WH8A 3AHYA 1VEOA 2BHYA 1UZ4A 3WMBA 4E8CA 4DUVA 1HKKA 3RM9A 2JEQA 3F5JA 2WSPA 1I1WA 2WC3A 3DYPA 2YL9A 1SR0A 1A3HA 4D6GA 4PRWA 1Y7VA 2YBTA 1DHKA 4MB3A 4ACYA 1NP0A 3RJXA 1I75A 4M1RA 3J7HA 5A94A 4FLQA 2J8FA 4W86A 2E9MA 3M6DA 4P8XA 4X0VA 2ZIDA 1UD4A 3HU7A 1V6VA 2WHLA 4UFIA 4DWSA 1E4NA 1CXHA 4HA1A 1KXTA 3FHAA 2PWGA 1QNRA 2W92A 1EDGA 4BS0A 1B9ZA 1JD9A 1GHSA 1OM0A 4LYQA 4QLJA 1E71M 2YL5A 1UWRA 2DGAA 3AS0A 3L4TA 3GNRA 1GONA 3AYRA 2YIHA 4CD5A 5FCZA 4TTUA 2WXDM 4AMCA 1UQZA 4JHOA 5E9AA 4TXEA 1AQHA 3ZT7A 1V02E 2V3DA 5JBFA 2CERA 1PZ2A 4MNJA 1M01A 3UG4A 1J12A 4BQ2A 3ARRA 2WHJA 1W9XA 1J0YA 1XYFA 1W32A 3CZGA 4QP0A 1TE1A 2WVUA 3JUGA 4ATLA 4B3KA 5C8BB 4H7VA 1JF6A 2D20A 3VU2A 5D8ZA 3VILA 4BCEA 4C7GA 1KCLA 3HN3A 4J3XA 1MVYA 4DWSB 3NUKA 1BVZA 3VD5A 1XH2A 3WY1A 2CXGA 5M3WA 1K6AA 4QLLA 4AZIA 2JIWA 4PMUA 1QI2A 2X05A 3BH4A 4UNIA 1UKSA 3VVGA 3QOMA 2XGIA 1GOQA 4DM1A 2ZX8A 1V0LA 1E43A 2E9LA 1J0HA 1CIUA 3GH5A 1UR8A 1JI2A 1N82A 2PB1A 2VX4A 2F61A 4AD1A 2QLYA 5CJ5A 2VZSA 3U7BA 3BAJA 3BAXA 4MJ2A 2EJ1A 1RP9A 4B3LA 1HKJA 4JL1A 2XM2A 1GQKA 1VF8A 1CNVA 5HOSA 3VD4A 2IXUA 4BQ3A 2GUYA 1J0ZA 2YDRA 1ISXA 2O9RA 5ECUA 5LA2A 4GI6A 2VRQA 1MW1A 1DWAM 2O9OA 4PMRA 2DSZA 4W88A 4GQQA 1OSEA 3MANA 3MV11 5D4YA 1EHAA 3AHTA 3IJ7A 1VRXA 2GSJA 3GTNA 2OWXA 4XV0A 2OLHA 4ZE5A 1TCMA 4D72A 1C7TA 2WLZA 1W1PA 2ZUWA 4L4OA 2YKKA 2ZUTA 3UEQA 2ZXBA 2YL6A 2RGMA 1XV8A 2FHFA 4P7RA 3PZGA 4OZOA 4U5KA 4UFJA 5EMYA 3SEPA 3WNPA 3CZEA 4J7RA 1EOKA 3VGHA 4PUEA 3RILA 1W91A 5A6KA 1VBRA 1HJQA 4OBRA 1LWHA 2WSKA 5I2UA 3HMCA 4MNKA 3TA9A 1R7OA 3K46A 1PX3A 4TOQA 3MSGA 1CGWA 4HZ6A 4JCMA 4UTFA 5KEZA 5A69A 3O6AA 1CWYA 1TVPA 3F4VA 3L4YA 3AHZA 3M07A 4ZFMA 1GHRA 2DH2A 5CLWA 3PTKA 5A6LA 4QCEA 3CGTA 1DWJM 3AQUA 2Y2WA 2VR5A 4S3JA 3SCWA 1J0IA 3WUEA 1VEMA 1FP9A 3K8MA 4B9ZA 3CMJA 2XG9A 1KGUA 2D22A 1NM9A 1QNQA 4AZBA 2ZUMA 3WIJA 2CBVA 4EE9A 3U57A 2J7CA 1VFFA 3WNNA 3U5YA 3D5HA 3BSGA 5CZKA 3CUHA 3VGBA 1W1VA 3K8LA 4OOZA 1TA3B 4UQBA 3W82A 1UD6A 4E2OA 2X0YA 1E9LA 3NDYA 2BVYA 2VT0A 4CN6A 2D0GA 2W67A 2CNCA 3A47A 1LG2A 1FA2A 2D23A 1JDCA 1EIBA 3SURA 1CGUA 1GJWA 3WF0A 2XUCA 1KGWA 4DUWA 1H3GA 1UH3A 1YQ2A 2UY2A 3WF1A 1XRVA 3IAPA 2XPKA 1HX0A 1UD3A 4U31A 5ABGA 4LPCA 4MJ4A 2VNCA 4PMDA 3OGRA 3ARXA 3UG3A 5A6BA 3SUTA 1R7AA 2F8QA 1CXFA 4FLRA 2ESCA 1Q6DA 4KGLA 4AY1A 1VFOA 4Q7NA 3WUGA 5BWFA 5CXPA 3AS1A 3RMEA 1JGIA 4UFKA 4LGXA 3KL5A 4DWSD 4ZEPA 4UOQA 3T09A 3OLIA 1C8QA 4GZIA 1V0NA 1LJYA 2EPMX 1ZBCA 4YN5A 3AXXA 4GI8A 5AY7A 3CIVA 3NJ3A 1W3JA 3EMZA 3CHDA 5DFAA 4HZ7A 4CU6A 2WVSA 3WD1A 4QCFA 3GZAA 1GZJA 2F2HA 3WD0A 3WD4A 3WDJA 3VGGA 3W27A 2WCSA 3UESA 4AZ6A 2XTKA 4W7WA 3MKKA 3MUY1 4H04A 2FGZA 1H41A 5LA0A 3MMWA 5GQBA 1H0IA 1KBKA 1E40A 2DEPA 4WKHA 4UQ9A 3WMCA 1HJVA 3U7VA 4HMEA 4N42A 3VDHA 1UH4A 4U33A 1F4HA 2AMGA 2D3NA 1JZ8A 1JNDA 3VKKA 3AIWA 3T0BA 4MPKA 1H09A 5AC5A 2OYKA 1KGXA 1TZ7A 7CGTA 4X0NA 3AYSA 3VIHA 2WMIA 4KGJA 1X1NA 4W5UA 4FF5A 4CD4A 1QNPA 3W26A 1ZB5A 2WANA 3M46A 3NYDA 1ISZA 2WVVB 5D9MA 3WDIA 1JI1A 5A8OA 3N17A 5FL0A 6CGTA 3WD2A 1MQQA 3VNZA 3WMSA 3SUVA 4UOZA 3POCA 1UWIA 1MXGA 2VC9A 1PEZA 5TD4A 1UWQA 2EXOA 4AZCB 3T0AA 1VENA 3POHA 1E70M 2WZIA 1B3XA 1WAWA 2WZHA 3WNMA 1Q6GA 3MU7A 4JKLA 3FNDA 1O6IA 1XSJA 1HP5A 3LPFA 5E09A 1OIMA 2GJPA 4W8BA 3ARQA 4ZENA 3QGVA 4MB5A 1E5NA 1E0VA 4YHGA 2WMIB 4JIEA 4CUCA 3T0DA 2DT3A 2TAAA 4JCLA 4AD0A 2Y4SA 1VJZA 2PI6A 3VGFA 2O9PA 2J47A 5CSYA 3VO0A 1W1YA 5M5DA 4D6FA 4PUDA 4CD6A 5BXSA 3VIGA 4GI9A 3KEHA 1G94A 1WDQA 4V2XA 4DM2A 1VFUA 3CH9A 2VTFA 2DT1A 1W9UA 1LG1A 1S46A 4FLSA 2E0PA 3GXMA 3BCDA 4DUXA 1W9DM 1O7AA 1DWHM 4U2YA 4CD8A 2C0HA 1MXDA 2YDSA 3UERA 2CPUA 1ITCA 5I24A 1NWRA 1XD1A 3CZJA 4JFVA 3ZJ6A 2IUZA 5I5RA 4PYSA 1BG4A 3PZVA 4W5ZA 3L4UA 2UWFA 2ZXQA 3W4RA 3ZJKA 3LMYA 3N1AA 4HMDA 4GQRA 1HT6A 4J3VA 1HNYA 4C7FA 4Y7EA 1CGYA 1EDQA 1WDSA 3GXIA 3L2LA 1M04A 2HVMA 4UQEA 5HBFA 3WQ6A 2BV9A 1LLOA 3TONA 4JAWA 1B90A 2ZE0A 3MSDA 1CEOA 1GQIA 4AZGA 3E1F1 1QI4A 3GBDA 2W63A 1WZKA 1KQYA 2XHYA 3TTYA 1JF5A 1FH7A 1KR0A 2BY3A 1XC6A 4AZHA 2VJXA 1QHPA 1RD6A 1OD8A 3OGSA 1FH9A 3AJ7A 3CUGA 1V3JA 1ESWA 1JL8A 1HP4A 2VCBA 2A3BA 1JDDA 3GBEA 3GNPA 3CUFA 1W2PA 4M29A 3WNKA 1GNXA 3VIMA 3QOKA 1JIBA 3CHFA 1JD7A 3OG2A 2J7GA 3GH7A 3WUBA 5A8QA 2BHZA 1GOIA 2VCAA 5A8PA 1BHGA 3UCQA 2E9BA 1G01A 2NW0A 3IK2A 5CPQA 1G5AA 1VAHA 1C7SA 1GOKA 3BC9A 4P7LA 3ZSTA 4GO9A 4HMCA 4R27A 4HPGA 5DF0A 1D3CA 8CGTA 2ZUNA 5A2BA 5A6BD 3WF2A 3PZ9A 2E40A 1H11A 1B3WA 1HJSA 2YL8A 3T08A 3SCUA 6A3HA 1MQPA 4W85A 3N04A 4GKLA 1MW2A 3MV01 4W7UA 3WDQA 1US2A 4Z2HA 3IANA 3F5KA 3NIYA 4V28A 4QLKA 1UUQA 1CXIA 3BXWA 5M17A 4UFLA 2JF6A 2WMHA 1J18A 4RE3A 1NOUA 1XGZA 1UOKA 4KWUA 5BXRA 5IHRA 2XIBA 4AEEA 1EOMA 3SCQA 1CECA 4PSPA 2YLLA 1H49A 1E55A 1AQMA 1GJUA 1UR9A 2CITA 1JZ4A 2GK1A 4PMQA 4AZ7A 5CQ1A 1U2YA 2XM1A 4ATDA 5E70A 1JFHA 3DHUA 4WK9A 1C8XA 2GJXA 3CZLA 3B9EA 4BA0A 1OBAA 4WSJA 1SYTA 2QV4A 1ZJBA 2CBIA 1IT0A 1V6YA 2ZUVA 3CPUA 5HXMA 1WPCA 4R5EA 3O2LA 1MW3A 1UA7A 2VOTA 5C70A 1OWQA 7TAAA 1RH9A 4XUYA 1GUVA 1Z32X 1QVBA 3WSUA 3DYMA 3WL0A 2PWHA 4PMOA 3BAWA 1TUXA 1DWGM 4NI3A 1JYNA 1V3IA 1K9EA 3VD9A 1UKQA 1J0KA 2OWWA 3AIBA 3AZRA 1ITXA 1B2YA 1E6XM 3AIRA 4QFUA 4WIWA 4JZ5A 4H8VA 4AYSA 2G4FA 3K4AA 4D6EA 3KL0A 5FKYA 2J78A 4U3CA 3AFBA 1HVQA 2B31A 2GJXB 2VZUA 1ISWA 1FFRA 3ARPA 2D24A 1BSIA 1BLIA 3AISA 1ECEA 4MAZA 2W4XA 4H41A 5A6JA 1GORA 1JDAA 2OSXA 2ZOXA 4IISA 3ARTA 1FH8A 3SCNA 1CENA 3CBWA 1CXKA 4IM4A 2WMGA 4Z2LA 2CESA 1E4MM 1UR1A 4HOZA 1CXEA 4B9YA 2XIIA 4PTMA 4WSKA 4OKDA 5HDRA 4CVWA 2WZEA 4IPLA 3OBAA 5A2AA 3VGDA 2VRJA 1GW1A 3ZMRA 4JFWA 3APGA 4UZSA 2E4TA 4LX4A 4D6JA 3UG5A 3WELA 1ZS2A 2X2YA 4CCDA 2WM0A 1VB9A 2XFYA 4W93A 7A3HA 1JZ7A 3CZKA 5IDIA 1UR2A 1EO7A 3LPOA 4EANA 4UOJA 4P8VA 4AWEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4UR9 A;  1BYB A;  4JFT A;  1G0C A;  4XZB A;  3OIH A;  1JZ5 A;  3N13 A;  5DT7 A;  4ZE4 A;  3VMN A;  1UR0 A;  3AMC A;  3K8K A;  2W66 A;  1GPF A;  4K68 A;  1AVA A;  1UZ1 A;  2E8Z A;  4MDO A;  1HJX A;  2WVV A;  2ZX5 A;  1E15 A;  3VUP A;  3OZO A;  1CBG A;  1PPI A;  3PZO A;  2XVN A;  2EPK X;  3BAI A;  1OGB A;  3CLW A;  2CBU A;  3A4X A;  3AHX A;  4NF7 A;  2XWD A;  2Z1S A;  4W8A A;  2CET A;  4V27 A;  4GZE A;  1IV8 A;  4RE2 A;  4AZC A;  3I3B A;  3VD7 A;  3ARU A;  2E8Y A;  2J7F A;  4RE4 A;  1E6P A;  1KXQ A;  4ACZ B;  1SMA A;  3W37 A;  4UQC A;  2BY1 A;  4GIA A;  2XVG A;  1KR1 A;  3SCT A;  2Y24 A;  4B16 A;  3PZQ A;  2YDQ A;  3WDP P;  3AIV A;  4PCT A;  4MDP A;  3CTT A;  2FDM A;  4ML4 A;  3FAW A;  4JKM A;  3CZ8 A;  3N11 A;  2J7H A;  1GVY A;  1UKT A;  4FMV A;  4AD3 A;  1H2J A;  4Z2I A;  4EAM A;  4H2C A;  3DYO A;  3ZR6 A;  1LL4 A;  2A3C A;  2O9T A;  1CGV A;  3VDB A;  2WLY A;  3AMK A;  1DWI M;  4PTX A;  1UYQ A;  1RP8 A;  4F9J A;  4CD7 A;  1NOW A;  3RDK A;  1UQY A;  5BXP A;  2WPG A;  2VUR A;  2JFE X;  4U3A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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