4W85 | Genus

Total Genus 151

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	151
sequence length	339
structure length	339
Chain Sequence	DRSRVFDILSNINIGWNLGNTLDATGGGNSVNAETSWGNPKTTQEIVDTVNDRGFNAIRIPVTFANHLGPAPEYTISADWLARVKEVVDYAVNDGMYIILDTHHETNYWLKTDPNNEAALCEELAAIWKQLAEAFKDYDEKLMFEGMNEPRMAGSAKEWSGGTPAERKLINAMNKAFIDAVRATGGNNADRVLIICTYGHNSDEPTLKDLEIPSDPNIAVALHTYTPYFFTYVADGSYSVWNGSKKNDITWQYNNIKKYLIDKGIPVVITETGAQFKENTEDIVRWIGDYVGTLDQDGVKCFIWDNNIYHGNGEKFGLLNRSLLKWYNDDIVDAYVNHA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Uncultured bacterium
publication title	Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-d-Xylp(1 6)-d-Glcp Recognition at the -1 Subsite within the GH5 Family. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase
total genus	151
structure length	339
sequence length	339
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.151: Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase.
pdb deposition date	2014-08-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4w85A00

2WC4A 2WZIA 3WMCA 2WMIA 4WK9A 5DMYA 1VBRA 4AYSA 2XFRA 5CXPA 4LXFA 4L4OA 5KEZA 3ZJ8A 1RP9A 2VTFA 2BXZA 1JZ6A 2DIEA 5I3DA 2EEXA 1HJWA 1J0JA 2FGZA 1W9DM 3VMOA 1M7XA 3QHMA 4RL3A 1TMQA 5A6SA 4ZXOA 3UG3A 4W87A 1UR4A 1VF8A 2ZIDA 1IZKA 3A6OA 4KGJA 2ZUSA 4PUEA 1FHLA 5A8NA 5A8MA 4GI8A 4W5ZA 3AHZA 4E2OA 6A3HA 2W91A 1JYVA 4UNIA 2WHMA 7CGTA 3W4RA 2ZX5A 3GNOA 4AIEA 4EAMA 4W8AA 1TE1A 4PCTA 4PMUA 2OSWA 3VX1A 4AZGA 2UY3A 2QPUA 1HJSA 1XH0A 4CU7A 5BXTA 5M5DA 3AYRA 3SUTA 3WQ4A 4BZYA 1KBBA 2YJQA 3BAYA 2BNJA 3BCFA 3IJ9A 2NT1A 2XVLA 5E6ZA 3TTSA 4E8CA 1R86A 2GUYA 1B0IA 3CPUA 3D5HA 1JZ2A 3NDZA 1E6PA 4JHZA 1ZB5A 4PTVA 1JZ5A 2GVYA 3W81A 1NWUA 3BAKA 3WBEA 3VMNA 2YA2A 2QF8A 3G6LA 5CPTA 2XVPA 4CCDA 2E9BA 5BWFA 3E1F1 4XX6A 4TTGA 4NRRA 1TVNA 5BXRA 1UR9A 2DEPA 3AMDA 4X0NA 5ECUA 3AI0A 3AMKA 1UYQA 1JD7A 5A3HA 3VMPA 1CXHA 3AISA 2WZHA 1WDQA 4ZENA 3WNNA 4FLRA 1DHKA 1H09A 2WKLA 4UFMA 2BS9A 4D6EA 1A47A 2EPLX 4GZIA 3WSUA 1G5AA 4HOZA 4UCFA 5GQBA 5A2CA 1HN1A 1EH9A 2A3EA 4OOUA 2J4GA 4DWSA 1XV8A 3KWXA 3ZJKA 1V3JA 2D24A 1PIGA 4GXPA 2EPMX 4D72A 3U57A 2W61A 1DWFM 1OIFA 3VD5A 2VQTA 3OLDA 3VO0A 2ZXBA 3DC0A 4BA0A 1UD5A 4B15A 1R85A 1UKQA 1VFUA 3T2QA 3WQ5A 3NIYA 3N15A 4BQ4A 2VMFA 1HKMA 3F5LA 5BXSA 3ARRA 3WF4A 3AIRA 3WDQA 3A47A 3BLPX 2DSUA 3VIMA 1BYDA 4JL1A 4AZ5A 2CBUA 4IPLA 1GORA 1NP2A 1GPFA 4MB5A 5GNXA 3ZT6A 4J7RA 3WNKA 4AMCA 3EYPA 1ISWA 2XM1A 1E70M 2O9TA 5EFFA 1FP8A 3CTTA 4CD6A 1H49A 2DDXA 2EBNA 1OD8A 1CBGA 1LWHA 1UG6A 4H8VA 4WSKA 1VJSA 2GSJA 3O6AA 2J25A 2WBGA 1M03A 1J0ZA 1M04A 1LL6A 4AIUA 3AS0A 3ARWA 4J3XA 4PMOA 4E4PA 4W88A 3MKKA 1UQZA 4AC1X 2D0FA 4PMRA 1WZAA 1KB3A 3AIQA 1B90A 3VGEA 3SIMA 1MFUA 5AYIA 2D2OA 3S6TA 2WVVB 3U5UA 1JZ3A 2QMKA 4MTVA 3VD7A 1UWTA 3WNMA 1V02A 1CWYA 3IJ7A 5A8OA 2O9OA 2YA1A 3SUWA 5CPSA 3W6MA 3ZOAA 4JCLA 1FOBA 1V3IA 4UQ9A 4PEEA 5FCZA 2DH3A 1E40A 4HMDA 5IFPA 3VVGA 2DIJA 3QHOA 1RPKA 1BPLB 1TA3B 4GZJA 2NT0A 1V3MA 1KXQA 2VZTA 2C7FA 4CD7A 1KFWA 4Q7NA 1B3XA 4MNMA 1GJUA 3WNPA 3GH7A 5A8QA 1BVZA 1KCKA 2VURA 1VFFA 1ZL1A 2ZUMA 3AIVA 3WMBA 2D23A 1JZ7A 3CZKA 4JFTA 3NYDA 1MVYA 1VIWA 1W9XA 4PRWA 4MDPA 1E6SM 2XHYA 2WMHA 1MFVA 1Q6FA 1JDDA 1HVQA 3PZ9A 4GQQA 3UR8A 4MPKA 1SR0A 2WKGA 2ZUVA 3ARXA 4J3UA 3FXYA 2ZUTA 4CCEA 1VEOA 4AW7A 2XSBA 2OWCA 2YOCA 4UFJA 3SCQA 1N82A 2V5CA 4MNJA 5I78A 5KZ6A 4MJ4A 3MMDA 1G9HA 1JI1A 1OGGA 2YL9A 3AS2A 1GZJA 3BMWA 1U33A 2AOSA 3VIPA 1G0CA 4HU8A 3L4WA 1CGTA 1Y7VA 4OOZA 1MW3A 1TG7A 3AZRA 1VFOA 2ZXDA 1E4LA 3TA9A 2ZOXA 2ZUUA 3WEZA 1JG9A 3D3AA 3AYSA 3ZO9A 1UKOA 4X0VA 2WCAA 2PBOA 1M01A 4P7RA 1C8YA 2GFTA 4FLOA 1MWOA 4OKDA 2PWGA 3AIUA 1DTUA 3VDCA 3L4ZA 2JALA 1XRVA 4AZHA 4YHEA 1UOKA 4B16A 4TOQA 1E56A 3F5KA 3ZR5A 3AS1A 3VGGA 3HU7A 3WDHA 2JFEX 5FD0A 2FHFA 4WSJA 2JIWA 3UEQA 2QLYA 1XYZA 5D9MA 1JZ8A 3K8LA 1X1NA 1I75A 1BSIA 4W84A 1C3FA 5AYBA 3OGSA 2ZX8A 4AZCB 4AD4A 4U3AA 2Y24A 2TAAA 1E0WA 1HIZA 2J74A 1UUQA 4GINA 3ARPA 2BXYA 4EK7A 3QGVA 2UY2A 5E0CA 3N04A 4H2CA 2VCCA 1NQ6A 3CH9A 2WMFA 1ZU8A 5FKYA 4QCFA 3CHEA 1V3KA 3GDBA 3WUBA 1CDGA 3LMYA 3BLKA 1HL8A 1PX8A 3RMEA 1NH6A 1R8LA 4A3HA 3EDEA 4GQRA 2FGLA 5IHSA 2FHBA 1QHPA 2FH6A 4D6FA 4ATLA 3QOMA 2VZUA 1W2PA 4CKQA 3CZLA 1MQPA 1NARA 5EB8A 3WD2A 3PBGA 5D8ZA 2XG9A 1EO5A 1PPIA 2VR5A 1E71M 2BVYA 1B3WA 2ZWZA 3WNLA 2ZWYA 4NZCA 4LYQA 2WNWA 1ISVA 1X6LA 1V08A 2WVVA 2E9MA 3MSDA 2PI6A 3MMWA 1BYBA 2JEQA 2OSYA 1OINA 5CPQA 1Q6EA 2D1ZA 3APGA 3A4WA 4AZBA 2VCBA 2ZUNA 3IANA 3M7SA 2D20A 5I23A 1WAWA 1GONA 1C7SA 4B9ZA 2EPOA 4ZFMA 3VILA 2XGBA 2E9LA 3ARSA 3WFZA 3G6MA 1I1XA 3EMQA 4PMZA 2WK2A 3VGHA 1NM9A 4UOQA 4CU6A 4EE9A 2F8QA 4QCEA 1KGUA 5IFTA 1KQZA 3N9KA 2ZX6A 4W85A 4PSPA 1WZKA 1W3LA 2D3LA 4HTYA 4F66A 1W32A 5ABHA 3GM8A 4UQEA 3L4YA 1HX0A 3VDBA 1V6WA 1NOFA 2F61A 1H41A 2Z1KA 4NSBA 2VI0A 2J75A 3SCPA 1JYWA 1V02E 2VX5A 3VU2A 3W6LA 5DT5A 3WL1A 5D9NA 4MB4A 2VQUA 2WWCA 4UR9A 3K8MA 3SCWA 1GHRA 4HA1A 3W53A 3KL3A 4F9DA 2XTKA 3VTRA 1VEMA 2VCAA 1BF2A 1W3JA 2J7DA 3VIOA 2J77A 2XIBA 1QBAA 2X2YA 4DUWA 1JNDA 5M03A 1OT2A 1VENA 3M6DA 1XSKA 1OSEA 3WDJA 2VO5A 1XYFA 2WB5A 1EHAA 2BY0A 1C8QA 1W3HA 1OBAA 3CUGA 1EQCA 3PN8A 1BVNP 1PJ9A 2OWXA 1C90A 2XVKA 3LPFA 3VNZA 3PZNA 5HBFA 5CGMA 2OLHA 3MUAA 3OLEA 2AMGA 3CHFA 4W7VA 1B9ZA 5CSYA 2CBIA 5I6SA 2F2HA 2CKRA 2D0GA 4BQ2A 5LA2A 1HVXA 2XIIA 3GBEA 1QVBA 4W93A 3ARQA 3W29A 2OYLA 2DSVA 4AZCA 4GIAA 1SMDA 2XFYA 2YDQA 4A4AA 1CGUA 4M80A 2GK1B 3O2LA 4YHGA 2NSXA 2HISA 3AMGA 1RD6A 1E0XA 4BCEA 1JGIA 3AHVA 3AQUA 1G94A 5JUVA 5FOOA 1BGGA 1VFMA 1WCGA 3GNPA 3WEOA 2GDUA 5LYRA 1CXKA 3UETA 1OGSA 2BHYA 3AMCA 3CUHA 3ZM8A 2GJPA 1UQYA 3N12A 4AZ6A 5JIWA 3WNOA 3FHAA 3ECQA 5C71A 1ZBCA 2E4TA 4PBGA 1C92A 2WLZA 4J3VA 3RIKA 4UFHA 1KXVA 3WF1A 3PZUA 1JI2A 1ODZA 4F8XA 3DYMA 1OIMA 2WSPA 2BHUA 1LL7A 3W26A 1V6VA 2Q8XA 5A8PA 1EDGA 4DUVA 1MQRA 3GBDA 3BAWA 4FK9A 1TR1A 5E9AA 3M46A 3EDJA 2ZXAA 4U31A 1C8XA 4PMNA 3AZTA 1AQMA 3GH4A 1L8NA 2V3EA 2WAGA 1K9TA 4W86A 5I79A 4TUFA 3ZQ9A 1VAHA 1ZBKA 1BAGA 1NWRA 4P8XA 1GQLA 3RJYA 1OM0A 3FAWA 3PZMA 4S3JA 8A3HA 4ACZB 2XWEA 4ATDA 3N11A 1E9LA 5D9PA 3MV01 4JL2A 3F4VA 2FHCA 2WW5A 4UFKA 4M82A 1R87A 1PX4A 5I24A 3WQ8A 3ARTA 4GI9A 2WSKA 2WYSA 2BY2A 1HJVA 2B31A 1ISXA 1LJYA 4JFWA 2A3BA 1VRXA 4KGLA 5TD4A 4R5EA 1DWIM 4BS0A 4P7NA 3RM8A 4PN2A 4GZEA 1WB0A 5CSUA 2XFFA 2JF6A 1J0IA 1B3ZA 3WH8A 3KE0A 1PX3A 1ZBWA 5EBAA 3L2LA 4WF7A 1CGXA 3VM5A 1ZBVA 3WH9A 4Z2JA 2J62A 2W5FA 2J7BA 5A6LA 3BXWA 4UOJA 1YQ2A 5A6MA 1XSJA 1EOKA 1KXHA 2G8ZA 5A6BD 1E5JA 4ACYA 1WO2A 2G3JA 4UOZA 1LL4A 4AY1A 4H7VA 3I3BA 2X09A 3EMZA 3GXDA 4XZBA 1PEZA 1HKIA 4GO9A 2W92A 1F4HA 1K9DA 4D6JA 2BVDA 1W1YA 1K9EA 4HZ8A 4JFUA 1WPCA 2D0HA 3BMVA 1QNSA 3VD3A 5HNNA 4AXNA 2XM2A 3AROA 5I5RA 3W0KA 4X9YA 3WD0A 1QI2A 2DT0A 1BG9A 2G3NA 4CU8A 3EBVA 1CXIA 2EJ1A 1J0KA 1CLVA 2CXGA 3CIVA 3W38A 5D4YA 4HZ6A 2EPNA 1FH8A 3SURA 2G3IA 3EDDA 1VJZA 3SCOA 2WPGA 3EDKA 1Z32X 4UZUA 4HA4A 3UCQA 2VOTA 2J7CA 4XV0A 3J7HA 1E72M 3II1A 3WH7A 2EXOA 1US3A 3SCSA 4ML4A 1J10A 4W5UA 1GOOA 3AHTA 2ESCA 4MB1A 3NDYA 3BGAA 1UKTA 1JAEA 4UQCA 4W7WA 4AD2A 1E6RA 4KH2A 1HXJA 3IJ8A 1PZ2A 3WUFA 1OCQA 4AEFA 3GXFA 2XPKA 1TVPA 1UH4A 4CD5A 2ZICA 2HVMA 3BCDA 4QFUA 4Z2KA 1JAKA 5IDIA 4RE4A 4M24A 2VUYA 5DT7A 3VUPA 4V2XA 5FIPA 3VNYA 1OWQA 2DT3A 3VIIA 1GVYA 1YHTA 1WP6A 4KWUA 4WIWA 2E8YA 1CECA 4J3TA 5JIPA 5EMYA 5I2UA 1FH9A 2YLAA 3DHPA 1V6YA 3CBWA 4V27A 3AXHA 4J27A 3T0BA 4HPGA 3OLIA 4U2YA 5FL0A 1UR0A 1QNRA 2JIEA 4Z2LA 2DSWA 1GNXA 2PWFA 3CUFA 6TAAA 4MDOA 2VVSA 2WMJA 2O92A 2VRJA 3K1DA 3VM7A 3AOFA 3SCRA 1OGBA 3VIKA 1HF6A 5BYWA 3K8KA 1EIBA 3WFLA 1CNVA 3N1AA 1V3LA 1TZ7A 2WBKA 2CHNA 3A3HA 1B31A 2CPUA 1JYNA 2WWDA 1E3ZA 1ITCA 1EGZA 2Y8KA 3KZSA 5JBEA 2VRQA 4Y7EA 1GJWA 1LG1A 2PC8A 1HNYA 1K6AA 4B3LA 4Z2GA 4ZXLA 1UWQA 3THCA 3ZJ7A 2AAAA 3VD4A 1E6ZA 3L2MA 4D71A 5A94A 1KBKA 4H8HA 3MV11 3I3DA 2CESA 1QI0A 3AIWA 3IAQA 2CHOA 2MANA 2WMIB 4D6HA 1V0KA 2J7HA 4JKMA 1J9YA 3DECA 3UG4A 1H0GA 4JCMA 4P7QA 5HXMA 2WANA 1KXTA 3A4AA 4D6CA 3PTKA 2BV9A 1H4PA 3W24A 1V03A 1E6QM 2PWHA 1CENA 1QPKA 2GJXB 4IM4A 1CXEA 4BF7A 2BY3A 1GW1A 4C7DA 1MW1A 3CMGA 1XD0A 2J78A 1UKPA 3AJ7A 1WZMA 3CLWA 3WY1A 4D6GA 1JIBA 3CZEA 2CNCA 3PTMA 1UD2A 1AQ0A 1GHSA 4UFLA 5JBDA 4UFIA 1UH2A 1E6XM 4U5IA 1PAMA 1A3HA 4J3SA 4PTWA 3RCNA 3DYOA 5M3WA 4W7UA 2PBGA 4OUEA 1TA3A 2EPKX 1WDPA 3MO4A 1ISZA 1UD8A 3LPOA 1XCWA 2DGAA 2JF7A 4MNKA 4AD5A 1RH9A 3AXXA 2WLYA 2A3CA 1GQKA 2XWDA 2DSKA 2XVNA 3K4DA 3UG5A 4U3CA 3GYCA 4QLJA 2YL8A 4R27A 3CUJA 3PZGA 5A1AA 2OWWA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4KRU A;  3RPM A;  6CGT A;  2CBV A;  1MXD A;  2D22 A;  4H8U A;  3WKZ A;  3SCV A;  4UQB A;  3M07 A;  3WUE A;  4XUY A;  1XCX A;  4QP0 A;  1VEP A;  3OZO A;  3POH A;  5CQ1 A;  3K46 A;  1CZ1 A;  1WDR A;  3CO4 A;  4EAN A;  4N0R A;  2QHA A;  2E8Z A;  2DT2 A;  1QI4 A;  1UD3 A;  3SCT A;  3B9E A;  3ARU A;  5C8B B;  3VDH A;  4PMV A;  3WEN A;  3KEH A;  4NRS A;  4QLK A;  1JD9 A;  1G1Y A;  1J12 A;  1E3X A;  3IK2 A;  3QHN A;  1US2 A;  5DEZ A;  5HPO A;  1XD1 A;  1XH2 A;  2O9R A;  3W25 A;  1LLO A;  2CET A;  3ZR6 A;  3UR7 A;  5GPR A;  1X6N A;  3RO8 A;  1B3V A;  1WZL A;  1EXP A;  5BRO A;  1CIU A;  2VT0 A;  4AZI A;  1UWS A;  1IT0 A;  3AFB A;  3PZO A;  3ZMR A;  3ZSS A;  2V5D A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4W85A

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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