4W89 | Genus

Total Genus 143

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	143
sequence length	339
structure length	339
Chain Sequence	DRSRVFDILSNINIGWNLGNTLDATGGGNSVNAETSWGNPKTTQEIVDTVNDRGFNAIRIPVTFANHLGPAPEYTISADWLARVKEVVDYAVNDGMYIILDTHHETNYWLKTDPNNEAALCEELAAIWKQLAEAFKDYDEKLMFEGMNEPRMAGSAKEWSGGTPAERKLINAMNKAFIDAVRATGGNNADRVLIICTYGHNSDEPTLKDLEIPSDPNIAVALHTYTPYFFTYVADGSYSVWNGSKKNDITWQYNNIKKYLIDKGIPVVITETGAQFKENTEDIVRWIGDYVGTLDQDGVKCFIWDNNIYHGNGEKFGLLNRSLLKWYNDDIVDAYVNHA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-d-Xylp(1 6)-d-Glcp Recognition at the -1 Subsite within the GH5 Family. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase
molecule tags	Hydrolase
source organism	Uncultured bacterium
total genus	143
structure length	339
sequence length	339
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.151: Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase.
pdb deposition date	2014-08-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4w89A00

1G94A 3FAXA 4OOUA 3A4WA 3GNOA 2OSWA 1E9LA 1UR2A 3RM8A 5HNNA 4JFVA 5CQ1A 4H8UA 4XX6A 5FOOA 3K1DA 2DH3A 3KWXA 3RMEA 4JAWA 4W8BA 3VM7A 3FXYA 4AD3A 3PZ9A 2J75A 2GK1A 3WQ5A 3II1A 3WBEA 2VZVA 2J4GA 2J74A 4JL2A 1DWHM 3VUPA 3DYOA 2TAAA 3AOFA 1XGZA 1AQMA 1GQKA 4PCSA 2EJ1A 3UEQA 3VKKA 5KEZA 2ZUNA 4QP0A 4YN5A 1MWOA 1MFVA 2YA1A 2C0HA 1L8NA 2YDQA 2J79A 1C7SA 3NDZA 5C8BB 2JE8A 5FL1A 1OBAA 4H04A 1UZ4A 4GXPA 1LWJA 1ODZA 1V0MA 1V3KA 3KE0A 2XUCA 3S2CA 7CGTA 1R86A 4QLJA 2D2OA 4HA3A 4P8WA 3VNYA 2CNCA 1HKMA 2XYLA 1UZ1A 4PMVA 1O6IA 3WKZA 2DSUA 2YL9A 3MUZ1 5JIWA 2IUZA 1HNYA 1NH6A 2ZX6A 4UFLA 1HKIA 1TA3A 1LG1A 3WH7A 2DH2A 1JZ7A 2VL4A 2PWFA 1SFSA 1HT6A 3MV01 3J7HA 1JAKA 2EXOA 3WQWA 2W91A 3GDBA 5JUVA 2W4XA 1DTUA 4WKAA 1QW8A 1JZ8A 1FA2A 1AVAA 1J0IA 4HP5A 6CGTA 2QHAA 1DWJM 2WC3A 4NI3A 5EFFA 1UKQA 2WLZA 4JKKA 1HVXA 3W29A 1E43A 2FH8A 3GH5A 1FFQA 4XZWA 3TA9A 1MXGA 3RIKA 4AWEA 3BAKA 2VNCA 5A6MA 4MNKA 3NJ3A 3WH6A 5M5DA 3NYDA 5GPRA 4J3TA 2V3GA 1Y7VA 1C90A 3VIIA 5JBFA 2PWHA 2VQUA 4Q7NA 3RDKA 2VUYA 2F2HA 1QNOA 1HJXA 4CCEA 4K68A 2F61A 1PBGA 1IV8A 1TCMA 4OUEA 1TG7A 3W37A 1E5JA 2GJRA 3A6OA 5DMYA 4PMYA 2D24A 4MJ2A 5A1AA 2OYKA 3N9KA 5GQBA 2J78A 4U31A 4CCDA 3W6LA 1B3VA 1ZB5A 3RCNA 4FK9A 1V3HA 1UG6A 3WMBA 1JFXA 1W2VA 2WCGA 3NDYA 1K9TA 3WF2A 4TVDA 4Z2IA 2C8NA 4ZFMA 2BVYA 3TTSA 5KZ6A 5A6LA 1FOBA 5E9AA 2VT0A 2X2YA 3WNKA 3UG5A 1R85A 3IJ9A 3CUFA 3AISA 1QI0A 2FHCA 2HVMA 3WUFA 2A3EA 4QCFA 5I77A 1E56A 1UD2A 2QLYA 1S46A 1WE5A 1V3LA 1UD3A 4C7GA 5I0DA 1KXQA 4NRSA 1X1NA 1KGWA 3ALGA 2XSBA 3A4XA 1WDRA 3CZEA 1CGYA 3AIVA 5FD0A 5A8MA 4RE2A 1PZ3A 4E4PA 3SCPA 1HKJA 2XIIA 3SCQA 4CKQA 2CKSA 4WIWA 4WLCA 2XWDA 1ECEA 3HMCA 4EK7A 2VX6A 1W9DM 4WF7A 3GBDA 2E8YA 4E8CA 5ABFA 4WKFA 3VIPA 1WNOA 7TAAA 3T0BA 5BWFA 1WDSA 3LPFA 3AI0A 4B9ZA 5A6BA 3U5YA 1HKKA 2BHYA 1JG9A 4OBSA 4CGTA 3BSGA 4BQ2A 2X09A 4CU6A 3W24A 4P7OA 3AHYA 2VJXA 2VX4A 1B3YA 3T09A 3EMCA 1RD6A 3GXDA 1OB0A 4HZ7A 4AZCA 3VX0A 3NSXA 1BYCA 1BYBA 2VCCA 4PMDA 1ZBWA 4NZCA 4AIUA 4GO9A 1NP2A 5A8NA 2CIPA 1LG2A 1V6VA 4PUDA 2WZHA 2DIJA 2VQTA 2D0GA 1MFUA 2HISA 1C7TA 2WC7A 3ZJ8A 2V38A 1EGZA 1BGAA 1QOXA 1Z32X 2CKRA 2VX7A 4MB5A 2D22A 3OG2A 1E72M 2WVSA 1JI1A 3THDA 1H4PA 4U3CA 5AC4A 2EBNA 3L2MA 3T08A 4NF7A 2WMHA 4JHOA 1W1TA 5HXMA 1ZL1A 2J7HA 4ZE4A 5DFAA 1M01A 4TVCA 2A3HA 1A47A 4PSPA 4J3UA 1E0WA 4CD6A 1CGXA 1ISWA 3CZLA 5AYIA 4BA0A 2WCSA 1VEOA 4CD8A 3WD3A 2FGZA 1JYNA 5BYWA 3PBGA 1QNRA 4PRWA 3WQ6A 4M1RA 1QI5A 2V5CA 1I1WA 3CBWA 3VINA 3SUWA 5C71A 1OIFA 1JDCA 5I78A 3WMCA 2WWDA 4UZSA 3ZT7A 1MVYA 1E55A 2ZIDA 5CG0A 2V3DA 1C8YA 4P8XA 1BYAA 1EHAA 4UR9A 1IZJA 3W6MA 1QBBA 4UQBA 1K9DA 5FKYA 3VGHA 1VFOA 3FW6A 1A3HA 2UY5A 3FAWA 1GORA 2WVTA 1TA3B 1PEZA 2PWDA 3SCWA 2WSKA 1HL9A 3KEHA 4AY1A 4GIAA 1NWSA 3K8MA 3UR7A 2BNJA 3ZSTA 3NIYA 1CXKA 3ZR6A 4ML4A 3GTNA 4PMQA 3QHNA 4ZE5A 4HOXA 1H49A 2EO7A 1BFNA 2D1ZA 2FHFA 4V28A 3ZJKA 3MO4A 4OBRA 4LX4A 4GI9A 2D23A 1FHDA 2DT3A 1M04A 2Y24A 2JEPA 4LGXA 4UFMA 3A3HA 4QAWA 3L4ZA 1MW3A 2BY3A 3EDEA 4HOZA 2DSZA 1CXHA 3BC9A 2YOCA 2QMKA 4WK9A 3VDCA 4IM4A 3SCSA 4MNLA 4NSBA 1E6QM 3SUUA 1ZJBA 1LLOA 3IANA 3FHAA 3AIQA 3WN6A 5CGTA 3N11A 4AD1A 2BVDA 1V08A 1CBGA 4MNJA 4TUFA 3ARRA 4PBGA 3ARXA 1QVBA 1UYQA 5A69A 1UKTA 1OD8A 2VVSA 4JHZA 1V6WA 3FN9A 3ARWA 3WF3A 2OWXA 4P8UA 4D6GA 3L4XA 4UFHA 4AZIA 5I5RA 2JIWA 1HN1A 3HN3A 1ISYA 1FFRA 1VEMA 2XVNA 2VMFA 1FH8A 5AY7A 3TP4A 4PEEA 1PPIA 3LPPA 1L0PA 4YPJA 3CHFA 3VD4A 3O9NA 2G8ZA 3AQUA 1Q4NX 1OGBA 2JF6A 3RO8A 1D3CA 1JDAA 2DDXA 4HZ8A 4AD2A 1DEDA 1LL6A 3CUHA 1ZBCA 3BSHA 4D6CA 3BCDA 1NOUA 1NP0A 1VBRA 1VEPA 4Z2KA 2ZX7A 3ARTA 1B1YA 2WMGA 1UKOA 2WKGA 3M6DA 3LMYA 3AS1A 4DUVA 1B9ZA 2CERA 3WD2A 1KQYA 1K9FA 4W89A 3TTOA 4RE3A 5BRPA 2JALA 3AXIA 1MYRA 3M7SA 1H1NA 3CTTA 4UQAA 2VZOA 3IK2A 3K8KA 1J9YA 3WH8A 2WCAA 1V02A 1BG4A 2XVGA 1J11A 1VRXA 4HU0A 1DHKA 4UQ9A 3BMVA 3MANA 4AC1X 1QHPA 4GI6A 5D8ZA 5JBDA 5HOSA 3TOPA 4HMDA 1E4MM 1US3A 5D8WA 3ARQA 4AZCB 1D7FA 2W92A 4W84A 4X0VA 3IAPA 5IDIA 3OLIA 4E2OA 2Y8KA 1XCXA 3GH7A 3AS2A 1QHZA 3BCFA 1EH9A 4FLQA 2A3BA 4J3VA 2PI6A 4MB4A 1ZS2A 1MW1A 4B3LA 4QLKA 3F5LA 4FLSA 2ZX8A 2UY3A 1EDTA 3BXWA 4W8AA 1EO7A 3CIVA 4JIEA 4IUGA 1CZ1A 3ZQ9A 1J0YA 3VD7A 1OT2A 4AIOA 3VDAA 3BAJA 4HZ6A 4JFWA 1GPFA 4D6JA 1JD9A 3AHVA 5GNXA 4S3KA 3CUIA 2WWCA 1V0LA 4KMQA 3VD3A 1UD8A 4AD0A 4KRUA 3VNZA 1H41A 1CYGA 4X9YA 4AXNA 4F8XA 1FP9A 3IAQA 4DWSC 4S3JA 2BS9A 4PMNA 3WF4A 3K4AA 3OLEA 1U30A 1FH7A 3WMSA 4D1JA 2UY4A 4CD4A 4MPKA 1UQYA 4ZXLA 2J77A 5D9NA 2J7EA 1VFFA 1JGIA 1W9UA 4F66A 3CZ8A 3AHXA 2DGAA 2J7FA 2Y4SA 1NOWA 2OLHA 2PF0A 1E4IA 1K6AA 5I23A 1OINA 2J47A 4UQEA 1XYFA 4ACYA 4UOJA 4UFIA 2XWEA 3F5JA 4V2XA 4BCEA 1N82A 1AQHA 3SCOA 1WZKA 4HU8A 1JXKA 4J3XA 4M82A 1CGUA 3GBEA 4AIEA 5DO8A 2F8QA 1WZAA 1KXHA 3AICA 5D9PA 1BG9A 4B16A 4GPNA 3AMKA 2QPUA 4U5IA 3KZSA 2WVVB 4BQ4A 4B3KA 1NM9A 3G6LA 2Z1SA 4PCTA 1UUQA 1EQCA 4KH2A 4L4OA 5E6YA 4D6FA 4PN2A 3WNNA 2YL6A 1TMQA 2XIBA 2W63A 5JBEA 2JEQA 3UG3A 5LA1A 4IISA 4CD5A 2PWGA 5M3WA 1UR0A 1X6NA 2DQXA 3VMOA 3ZR5A 1K9EA 3ARVA 1UR9A 2BXZA 3WBAA 1CGVA 1EDQA 2CBVA 2VCBA 4UZUA 5BXTA 4H8VA 5D9MA 3VGFA 1KCKA 1MQPA 1OCQA 4BQ5A 4FMVA 1KCLA 3VGEA 2XG9A 5E6ZA 4M81A 1CLXA 1NQ6A 5CLTA 3ZJ6A 2D0HA 1Q6GA 3DYMA 4AZHA 3W27A 3WL0A 3ARPA 1V02E 4BF7A 3NUKA 1BTCA 3CUGA 4P7NA 3W81A 5A8PA 1TR1A 3WUEA 3DYPA 1XH0A 4W86A 1E3XA 4LQ1A 3SCNA 2X05A 2EEXA 3W28A 3ZO9A 3EYPA 3SCTA 4Z2LA 1BYDA 2CXGA 2WB5A 3AROA 1V03A 1GNXA 3LPOA 2EPKX 1V6YA 3AIUA 3CPUA 1X6LA 4P7QA 1R7AA 3GXMA 4GZEA 2XM2A 4URIA 1HP4A 3BAIA 1GOMA 3ECQA 1OIMA 2JIEA 1ODUA 3ARYA 3AHTA 3WDPP 1JI2A 1UD4A 4JKMA 1KGUA 2PBOA 3W26A 1JYWA 4YHEA 3EMQA 4W93A 1P6WA 5CJ5A 1GQIA 4Z2JA 5I24A 2GSJA 4W87A 4CD7A 3VIKA 3OIHA 3VOCA 1WZMA 2OYMA 1EXPA 2JFEX 1RP9A 4DWSA 3IJ8A 2BY0A 2YIHA 2Y8VA 5TD4A 1KGXA 1PX4A 4JFSA 3RJXA 1VJZA 1EHNA 3VIJA 4DM1A 3MUIA 1FP8A 1HF6A 2VURA 2VC9A 2G4FA 4F9DA 1UR8A 4AEEA 2WMIB 1CWYA 2ZWZA 1HIZA 5M03A 4EE9A 4BS0A 3WNLA 4MDOA 3VIFA 1ISXA 3MSGA 1UWTA 4QLLA 1NWUA 3RJYA 1G01A 3MS8A 1NWRA 3ZIZA 4KGLA 2YLAA 1JIBA 6TAAA 3SUVA 2W67A 3EDFA 2WHLA 3KL3A 3MSDA 1V3IA 1J0HA 3FY1A 1ZBKA 2GVYA 1OT1A 5E70A 1W3JA 1JZ3A 1J0KA 1DWGM 4PUEA 8CGTA 1KB3A 4FF5A 4F79A 3BAXA 3FHQA 1V0NA 1J01A 4ZEPA 4UCFA 4JL1A 2YDSA 2VR5A 2XFYA 3AZSA 3VMPA 2XVLA 4GQRA 1BHGA 1XSJA 1W1PA 3GM8A 3DECA 3VIGA 2DT1A 3WD4A 2E9MA 3QHOA 4W8LA 3W0KA 4WSJA 4PTXA 1BLIA 3VDBA 2G41A 3WD0A 1CGWA 1CXEA 2DIEA 1UQZA 4H8HA 1F4HA 3PZMA 5CSUA 1UH4A 5A2BA 3B9DA 1E73M 4XUYA 2AOSA 5IXEA 3NCOA 1E5NA 1UD6A 1UWSA 1XHGA 3CHDA 4Q22A 4LYRA 5DT7A 5I3DA 1XD0A 3PZGA 5HPOA 2WANA 3CH9A 1E6XM 2OSYA 3SCRA 5HPCA 4UFJA 3WSUA 3BLKA 1TVNA 2VOTA 2BHUA 5CLWA 4W85A 2W66A 3PHAA 4ZXOA 3QR3A 4KWUA 3WEZA 4P7LA 1LL7A 1GOKA 4D1IA 3ZT6A 1UR4A 1PZ2A 1JNDA 4M29A 1W1YA 3VD9A 3SIMA 1IZKA 4N42A 4DUXA 2XFRA 5BROA 4CVWA 1DWIM 1V3JA 1GZJA 3N1AA 4QDMA 1C8XA 2IXUA 4MDPA 4HA4A 3VILA 5ABGA 3PTKA 6A3HA 1XCWA 2YBUA 5M17A 1B31A 2WVVA 3CHEA 1WCGA 5ABHA 2G3IA 1GCYA 2E0PA 4CCCA 4JKLA 4L4PA 3VIMA 2EPNA 3ZM8A 1EIBA 1JZ4A 3AIRA 4YHGA 3BAYA 1VF8A 3ARUA 1CLVA 1XSKA 4EAMA 1VENA 1MW2A 4DUWA 2FHBA 3L4VA 2E3ZA 5A6AA 3L2LA 1JL8A 1DWFM 1G9HA 4MJ4A 3N13A 4IPLA 2MANA 4A4AA 4TVUA 1US2A 1F4AA 1YHTA 3QGVA 4AZBA 1E70M 2CHNA 5FL0A 2XGBA 1KFWA 1CNVA 3O6AA 4QFUA 2WSPA 5DEZA 1HJVA 2CCRA 1M03A 2D3LA 4AZ6A 2G3JA 3W25A 1C93A 5C70A 3AZTA 3MUY1 2DEPA 2J8FA 2X1IA 3OA5A 4UNIA 3T2QA 1J0ZA 2ZWYA 3PZNA 2OYLA 4EKJA 2ZXBA 4CN1A 2GDVA 3VPLA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1NAR A;  3BGA A;  4BZY A;  3F4V A;  2PC8 A;  3QHM A;  1U33 A;  4CUC A;  2GFT A;  1SMD A;  3MMD A;  3AIE A;  2WZE A;  1HXJ A;  2D3N A;  1ISV A;  2E8Z A;  2YLL A;  3L4T A;  4Y7E A;  3EBV A;  2VI0 A;  2WBK A;  1NOF A;  3VVG A;  1B90 A;  3PZT A;  4D6E A;  2WVU A;  1Q6E A;  2ZUT A;  1H3G A;  3K4D A;  1MXD A;  3CLW A;  1AQ0 A;  2XJ7 A;  2ZIC A;  1E6R A;  1HJS A;  3AXH A;  3GH4 A;  3M46 A;  3VMN A;  1KXV A;  1UOK A;  2V3F A;  1WDP A;  2W61 A;  3AMD A;  3GXF A;  3U5U A;  2WAG A;  1CIU A;  4R5E A;  3AZR A;  1XD1 A;  4OIF A;  3UET A;  3VIH A;  2WM0 A;  1JNE A;  2YA2 A;  4RE4 A;  2XHY A;  4V27 A;  1B3Z A;  1UWU A;  1BGG A;  1C3F A;  2D20 A;  1W3H A;  3WNO A;  3POH A;  4F9J A;  2QV4 A;  4B9Y A;  1JFH A;  2WKL A;  4MB1 A;  4W7V A;  2CES A;  4UFK A;  3OLD A;  4EAN A;  3PTM A;  2J8G A;  1D2K A;  2XVP A;  1W9P A;  3WDR A;  4J7R A;  1B30 A;  3ALF A;  2Z1K A;  3ZMR A;  1E3Z A;  3CO4 A;  3MMW A;  4TX8 A;  4OZO A;  2PBG A;  4X0N A;  5CZK A;  1QI4 A;  3M07 A;  5CXP A;  2ZUU A;  3WY1 A;  4R27 A;  2NT0 A;  2WW5 A;  2UY2 A;  1ESW A;  2ZOX A;  4TXE A;  4BQ3 A;  4CU8 A;  1KR1 A;  3PZO A;  1PJ9 A;  4DWS D;  4ACZ A;  4ATD A;  3BMW A;  4GI8 A;  1R7O A;  5AYB A;  5CPQ A;  3AIW A;  4LYQ A;  3WDJ A;  2VTF A;  5I6S A;  1KBB A;  2J7B A;  5ABF B;  3AXX A;  4LPC A;  1V0K A;  1C8Q A;  1B2Y A;  5ECU A;  4TOQ A;  2VZS A;  2NSX A;  2QMJ A;  1JZ6 A;  3VGB A;  2WPG A;  2ZUS A;  3MKK A;  4FLO A;  2BXY A;  2BFG A;  5EFD A;  4PMO A;  2VRK A;  2EPL X;  3WDI A;  4N0R A;  1HJW A;  1E6Z A;  3AYR A;  2XFF A;  3OGR A;  4KRT A;  5EB8 A;  1EQP A;  1G1Y A;  1PX3 A;  3VD5 A;  2CEQ A;  3T0A A;  3ZOA A;  1EA9 C;  2VRJ A;  3SCU A;  4GO8 A;  1UWQ A;  3BH4 A;  3S6T A;  5BXS A;  1LJY A;  4AYS A;  3NSN A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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4W89A

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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