4W89A

Crystal structure of xeg5a, a gh5 xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase from metagenomic library, in complex with cellotriose
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
339
structure length
339
Chain Sequence
DRSRVFDILSNINIGWNLGNTLDATGGGNSVNAETSWGNPKTTQEIVDTVNDRGFNAIRIPVTFANHLGPAPEYTISADWLARVKEVVDYAVNDGMYIILDTHHETNYWLKTDPNNEAALCEELAAIWKQLAEAFKDYDEKLMFEGMNEPRMAGSAKEWSGGTPAERKLINAMNKAFIDAVRATGGNNADRVLIICTYGHNSDEPTLKDLEIPSDPNIAVALHTYTPYFFTYVADGSYSVWNGSKKNDITWQYNNIKKYLIDKGIPVVITETGAQFKENTEDIVRWIGDYVGTLDQDGVKCFIWDNNIYHGNGEKFGLLNRSLLKWYNDDIVDAYVNHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-d-Xylp(1 6)-d-Glcp Recognition at the -1 Subsite within the GH5 Family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Uncultured bacterium
total genus 143
structure length 339
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.151: Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase.
pdb deposition date 2014-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w89A00
4NZCA 2EQDA 4JFWA 4BZYA 1LL4A 1JZ2A 1H41A 1Q6EA 3SIMA 3VO0A 2DSVA 5CJ5A 3M46A 2XPKA 3ARWA 2W66A 1MXGA 2EO7A 3ARYA 1MW0A 2WCGA 1XH1A 2CNCA 1B30A 2WCAA 1KWKA 4LYRA 4V27A 2G8ZA 4UR9A 3ZQ9A 5E0CA 3OGSA 2VURA 1W1PA 3N17A 1JZ3A 3ARZA 3ZR5A 1ZBCA 3AIRA 3WL1A 4A3HA 2VZTA 4UFLA 3TTYA 4B3LA 4UFJA 3MSDA 4HZ7A 4GKLA 3ZMRA 5ECUA 1JIBA 3WQ8A 2BY1A 1UZ1A 2RGMA 3OLDA 1CXIA 1E73M 2NT1A 3AYSA 2WC7A 3POHA 3RPMA 2W61A 3WUGA 2WK2A 5A6LA 2J62A 4F8XA 2XFYA 3HMCA 4AY1A 1GOKA 3AICA 1UKSA 2G3MA 3WDPP 4JFTA 1HN1A 3ZJ6A 4P7RA 1JF5A 5C8BB 3WDIA 4W86A 1FP9A 1KR0A 1BGGA 5E70A 3WEOA 3VILA 2BVDA 5AYBA 1GQLA 3CZGA 1HVXA 1VFOA 1C3FA 2J7FA 2D2OA 1M04A 3WH7A 4B15A 1SFSA 2DIEA 4W8AA 2WAGA 4UOZA 4CD4A 2ZXBA 2ZWZA 2WB5A 1KWGA 1JAKA 1A3HA 3PZMA 2DT1A 2JIEA 2JF7A 4U2YA 4WSJA 3EDDA 1XRVA 2GJPA 2CITA 3DYMA 3VNZA 2ZXAA 4GI8A 1G01A 2WKLA 1JXJA 3W53A 1L0PA 1E0WA 4UTFA 5D8WA 5I3DA 4PMYA 2VQUA 5BXSA 1GNXA 3MV01 4HMEA 3VD4A 2CYGA 1Y7VA 1NOWA 2VT0A 1VBRA 2PBGA 2A3AA 1BFNA 3DYPA 5DO8A 2ZICA 4X9YA 4F66A 3BXWA 3WH9A 2YDSA 1V0MA 4AZ6A 4CU7A 1E1FA 1XSJA 3HN3A 4PMZA 1J0ZA 4AZBA 1C92A 3BAXA 4CCCA 4GINA 4LQ1A 1E0XA 2PWEA 4D6HA 4Z2LA 3FAWA 1C7TA 1Q6GA 2AMGA 2ZX5A 1CLVA 1Q6CA 3SUUA 1JI1A 3VTRA 2J8GA 4ACYA 1H1NA 3EDKA 4UCFA 2E9LA 1JZ7A 2V3FA 1GVIA 5IXEA 3RIKA 2D0HA 3VD5A 1MQPA 1NP2A 4NI3A 2EPOA 2V5CA 4UQDA 1NP0A 1LL7A 4KGJA 1B3YA 4J3UA 3D3AA 4FLRA 1TZ7A 2FGLA 4ATDA 1EH9A 4JFVA 2EPNA 5GNYA 1MW2A 2BXZA 3VGDA 1QHPA 5CPQA 3QOKA 1V0NA 5FD0A 1PX3A 2CKRA 1GHRA 3AXIA 3WD3A 1UA3A 2ZX9A 1VENA 4JHZA 1K9DA 3WDJA 1JFHA 4URIA 2Z1SA 1V3MA 4JL1A 1H0GA 2WMKA 6A3HA 3AIEA 3N18A 4X0VA 1LF1A 4HU8A 4JHOA 3AS3A 4LYPA 4CD6A 1KR1A 1BHGA 4CGTA 4YN5A 1V3KA 2DEPA 3WF3A 3DECA 5A95A 3RM4A 2DH2A 3J7HA 1EHNA 5EFDA 4AW7A 1WNOA 4TXEA 4D6EA 3KZSA 4QLJA 1K9FA 2G3IA 3W0KA 1UR1A 1GQIA 4OJYA 1V6XA 5CLTA 1QHOA 3ARXA 1GOQA 3WDQA 4AIUA 1W1VA 1TVNA 4OUEA 2IXVA 4W5ZA 4Z2GA 2O92A 1XGZA 5A8NA 3FHQA 1IV8A 3IJ8A 1AMYA 4TTUA 5JUVA 3MV11 1DWGM 4PSRA 4MPKA 4W7UA 4DWSC 2PWFA 3CZKA 1HJXA 1KBBA 1UZ4A 5CSUA 1CNVA 2QF8A 3VIFA 2A3CA 5FL0A 3S2CA 3I3DA 4W89A 3L4UA 4RL3A 3I3EA 1BYCA 2BFGA 3UR7A 5M03A 3ARPA 3SCPA 5FIPA 1HF6A 3U5UA 3AFBA 3K4DA 4QCFA 2VR4A 1N82A 1R87A 3NYDA 1O6IA 2UY4A 1DHKA 2J78A 3EDJA 1JDCA 4EAMA 1BTCA 4PRWA 4CN4A 1UUQA 3CUIA 3FN9A 3OZPA 3L4ZA 3VIIA 3WF0A 3MO4A 3N13A 3OZOA 1V02A 1HX0A 4QFUA 3AIWA 4HP5A 3WUFA 1XYZA 3UEQA 3I3BA 1U30A 2C8NA 2WC3A 4JZ5A 2VX6A 3AROA 2JIWA 1J0HA 1I75A 4MTVA 5IFPA 4M80A 2VCCA 2WSKA 4TVCA 3N11A 3W29A 3CHEA 1NWSA 8A3HA 2J7DA 3VIGA 5LA0A 5A3HA 3AHYA 1MXDA 4XX6A 3WENA 1MYRA 1FHLA 1PIGA 3VM7A 5A69A 1BPLB 3CHDA 4BS0A 2Z1KA 4HOXA 3THCA 1E6QM 3AHTA 4AZCB 2YJQA 4AEFA 1AQHA 2E8ZA 1EO5A 3SCRA 1TCMA 1UWIA 4ML4A 4AD3A 2D3LA 3ARRA 4AD5A 3KL3A 1V3IA 3VGFA 2GJXA 3IJ9A 3QHMA 2Y2WA 2GVYA 1O7AA 1UWRA 2IXUA 4JCLA 4LYQA 5E6ZA 2YA2A 4QLKA 2GJXB 2YIHA 3LMYA 3WBEA 1J12A 3W81A 1C8XA 2WBKA 3GXFA 3T2OA 2G3NA 4TTGA 2WMJA 2XVLA 1CXLA 2FDMA 3WEMA 1XH2A 1MW1A 3KEHA 3PTKA 4E8DA 2WHMA 4D1IA 3SUVA 1OB0A 1UH3A 1E6NA 3UG4A 4H7VA 3VD3A 1UR9A 1E0VA 2A3BA 2OWWA 4PTWA 3AZTA 3N04A 3AS1A 3K1DA 2CETA 1F4AA 1QNOA 1W9BM 3WF4A 2ZUMA 2WHJA 3WNPA 1E70M 4GI9A 1ISVA 1CLXA 3K4AA 3ZT6A 2WSPA 4GZEA 3MUAA 3OB8A 1OD0A 1ITCA 2V3DA 3ZJKA 2J7HA 1G5AA 3T0BA 1E5JA 4KGLA 5E9AA 3U7VA 1RP8A 2YBTA 3W4RA 1AQMA 5CPSA 2GSJA 3AZRA 5JBEA 5AC5A 5TD4A 1JDDA 3CZLA 4J28A 2YLAA 2XWDA 1GONA 3WBAA 1UD5A 4DUXA 1OBAA 1OGBA 1BG4A 2CCRA 5IDIA 3WNKA 5BXRA 1EIBA 5A94A 3WELA 3M07A 3W26A 1UD3A 4A4AA 1QI4A 3U5YA 4D6IA 1HJSA 5A6KA 1EQCA 4B9YA 2WW5A 5A6JA 4U3AA 1ISYA 5D8ZA 1WKYA 4KH2A 5A6BD 1BG9A 4S3KA 5A8PA 1E4MM 2W5FA 3W25A 3WDRA 2BY0A 3WF1A 5EFFA 3A4AA 1W3JA 1B3WA 2WANA 1DWJM 3SUSA 1UQZA 2BXYA 3T2PA 5A1AA 2E40A 3QGVA 1WB0A 4J3VA 1U2YA 1QW9A 1BF2A 2JF6A 1LWJA 4HA3A 3CZ8A 1QNPA 1GHSA 3M7SA 4GPNA 1UG6A 3T09A 3RJYA 1B2YA 2YL9A 2YLLA 3PZOA 2UY5A 3DYOA 4JKKA 3WD0A 4CUCA 1EHAA 1CGXA 1UR4A 3PTQA 3BLPX 1HNYA 1WZKA 4LPCA 1JZ8A 3VGEA 4M29A 3VOCA 3QHOA 1G0CA 2XIBA 2CPUA 5A6BA 1V08A 5FOOA 2VUYA 4J3TA 2GFTA 4Z2JA 1B31A 4UQAA 2CKSA 1M7XA 2C0HA 1OT2A 3A4WA 1WDPA 4WLCA 4NRRA 3ZJ7A 1MVYA 2XG9A 3T0DA 4GXPA 3VDAA 1SMDA 1B3ZA 4UFKA 1UR2A 4MNJA 1GUVA 3N9KA 4HOWA 4AIOA 2OYLA 1CTNA 3ZSSA 4M81A 3O6AA 3MUZ1 1W3LA 1E56A 2NT0A 2VCAA 1XH0A 3LPGA 2HVMA 3TTOA 7CGTA 3VNYA 4PEEA 1OINA 4OIFA 3AISA 6CGTA 3AXXA 1QHZA 1QI2A 2F8QA 4PMDA 1CIUA 1C90A 5I2UA 1WE5A 2VNCA 1TFVA 2VRQA 3MS8A 1R85A 2WXDM 5JIWA 3WD4A 1DEDA 1FFRA 2CERA 1MFVA 1E40A 4C7GA 1CBGA 4RE4A 2X1IA 1QNQA 3W6LA 5ABGA 2WWCA 5HDRA 5BROA 4UQBA 5A6AA 1DWAM 4PMQA 1BSIA 4PMRA 4AWEA 1ZB5A 3WF2A 3BSGA 2XHYA 3B9AA 1NWTA 4JFSA 2HISA 2OYKA 1JZ4A 4R5EA 3AXHA 2VR5A 4WIWA 1HJQA 3AS2A 4MB5A 1FH9A 1ZJBA 4EKJA 3CO4A 4HPGA 3WN6A 1RD6A 1E4LA 2ESCA 4H8HA 2YL6A 4A3YA 1XSIA 3A6OA 3NCOA 1WP6A 1QVBA 4KRUA 4WKFA 3F4VA 2V3EA 4OOZA 5EB8A 4EANA 3VIPA 4QDMA 1J9YA 3AOFA 1VFFA 3L4TA 4JL2A 4B9ZA 1DP0A 4K68A 1KQZA 1GZJA 2ZIDA 1KCLA 1JD9A 3NDZA 4U2ZA 3ZM8A 5FCZA 1UYQA 4U5KA 4KMQA 4S3JA 3BLKA 4DM2A 1E71M 1NWUA 2PC8A 5GQBA 1OGGA 1ZS2A 3GM8A 4ZXOA 1FA2A 4UOQA 3OLGA 3T08A 5AC4A 4GIAA 4HOZA 3TP4A 3VMNA 4AZHA 5CGTA 2W92A 4EK7A 5I77A 4HU0A 4UQCA 1HJVA 2YKKA 3A3HA 3AIQA 2VX7A 1H5VA 1HT6A 1L8NA 1WDSA 3OG2A 1DWIM 1GPFA 4CD5A 3FY1A 3VPLA 4AD1A 1B9ZA 1G94A 3SCQA 3NIYA 4TVDA 2BS9A 5ABFA 2VRKA 2O9PA 4X0NA 3RCNA 5ABFB 1HKMA 1W91A 4AZ5A 1E3XA 3ARTA 4E2OA 2XSBA 2XUCA 3VIKA 1US3A 2CXGA 1SR0A 3A47A 5HBFA 2X05A 3AQUA 1UD2A 1JZ6A 4UNIA 4MDOA 4PUEA 4HZ6A 4IM4A 7A3HA 4H04A 4DM1A 3ZIZA 3TONA 2J79A 5HXMA 2VI0A 2CESA 5I6SA 4W88A 3AIBA 3WKZA 2VCBA 3WD1A 5CLWA 3PHAA 1GORA 1VRXA 3VX0A 2WHKA 4D6CA 1TMQA 4WKAA 3N1AA 4BQ3A 5GPRA 1PIFA 2AAAA 3UESA 2E9BA 3BAKA 5CQ1A 1X6NA 1B3XA 1ZBWA 4QP0A 1UOKA 5A6SA 5M5DA 1OT1A 2YOCA 1WDRA 4MB1A 2TAAA 3WNMA 3VIOA 3KL0A 1YQ2A 1CENA 2BY2A 3GXDA 2YDQA 2W91A 2EBNA 4AC1X 1Q6FA 3AMDA 2PF0A 5A8MA 1JXKA 3ARQA 1H49A 4P8VA 2Y8KA 3GTNA 2V3GA 5AY7A 4EE9A 5KZ6A 1OWQA 1UWUA 5CZKA 5HPOA 3OGRA 4WSKA 5D4YA 3SCVA 1K6AA 3CPUA 3ZO9A 1KXHA 1LG1A 3W82A 2ZUVA 3BAYA 1JI2A 3BCDA 1FP8A 3U57A 5A2BA 4PYSA 4D6JA 1QBAA 6TAAA 1UH4A 1VJZA 2VJXA 1HP4A 3NDYA 3D5HA 4W93A 3CUHA 1OM0A 2FHFA 2DIJA 1QI3A 3PZVA 2QPUA 1HKJA 1ODZA 3WL0A 1ZBVA 1LLOA 5IHRA 3WMSA 2G3JA 1MQRA 4Z2HA 1US2A 2AOSA 2OSYA 3ZR6A 1EGZA 1HXJA 1MWOA 4AISA 4BQ4A 3F5JA 3RILA 2WVSA 2WVUA 3OIHA 3MUY1 1EXPA 1JG9A 4MNKA 2ZX6A 1PX4A 2GDUA 3AHZA 1W3KA 2OYMA 3WUEA 1ZJAA 3VX1A 3WH8A 3W38A 3WD2A 3CMGA 4BF7A 3MMWA 1FHDA 2Y24A 3EMZA 4P8WA 5HNNA 4P8UA 2E8YA 4H2CA 3BAWA 3PZTA 1LG2A 1ZBKA 4D72A 4PCTA 2E3ZA 4Z2IA 3FHAA 1I1XA 3IK2A 1BAGA 4W8LA 1QBBA 4M56A 1HIZA 4FLQA 4W85A 3WUBA 1UR0A 3LPFA 4R27A 2OLHA 4OBSA 3VUPA 3L4XA 2BHUA 2XTKA 3RO8A 1PPIA 1H2JA 4ATWA 3WY1A 3CUGA 4UZUA 2X0YA 1VBUA 3IAQA 1JNDA 2XIIA 4PTMA 1IT0A 2JALA 1PAMA 3AS0A 3KE0A 2WNWA 4ZE4A 1UKOA 2CBVA 4BCEA 2VC9A 4MNLA 5ABEA 2WMIA 2IUZA 1MQQA 1PJ9A 2DGAA 2WMIB 3GDBA 1CXKA 1JNEA 1J0IA 1CGVA 4N0RA 3ZOAA 7TAAA 3UR8A 1GOWA 4MJ4A 5I79A 4B3KA 2J8FA 5M3WA 4UQ9A 4CU8A 1KGXA 1HKIA 3MSGA 2XFRA 3L4VA 1TUXA 3PZGA 3K8KA 1JYXA 3BC9A 3W24A 2OSWA 4IUGA 4AMCA 4U31A 2ZUTA 1X1NA 2ZX7A 3WQWA 1ITXA 2WLZA 3SCNA 5CGMA 3CZEA 5LA1A 1WZLA 1PX8A 2ZUNA 2PWGA 2W4XA 3QOMA 1E4IA 4CU6A 2J7GA 2VZSA 2PB1A 3GBEA 1ISZA 2WMHA 3WMBA 3AMKA 1XV8A 3BGAA 2DSUA 3GXIA 1U33A 3E1F1 4AD4A 1JFXA 4F79A 2ZOXA 4J7RA 3W37A 3L2LA 3APGA 3BCFA 2PWHA 1JGIA 1V6YA 4FLOA 4P7NA 2JEPA 4E8CA 1E6ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4NZC A;  2EQD A;  4JFW A;  4BZY A;  1LL4 A;  1JZ2 A;  1H41 A;  1Q6E A;  3SIM A;  3VO0 A;  2DSV A;  5CJ5 A;  3M46 A;  2XPK A;  3ARW A;  2W66 A;  1MXG A;  2EO7 A;  3ARY A;  1MW0 A;  2WCG A;  1XH1 A;  2CNC A;  1B30 A;  2WCA A;  1KWK A;  4LYR A;  4V27 A;  2G8Z A;  4UR9 A;  3ZQ9 A;  5E0C A;  3OGS A;  2VUR A;  1W1P A;  3N17 A;  1JZ3 A;  3ARZ A;  3ZR5 A;  1ZBC A;  3AIR A;  3WL1 A;  4A3H A;  2VZT A;  4UFL A;  3TTY A;  4B3L A;  4UFJ A;  3MSD A;  4HZ7 A;  4GKL A;  3ZMR A;  5ECU A;  1JIB A;  3WQ8 A;  2BY1 A;  1UZ1 A;  2RGM A;  3OLD A;  1CXI A;  1E73 M;  2NT1 A;  3AYS A;  2WC7 A;  3POH A;  3RPM A;  2W61 A;  3WUG A;  2WK2 A;  5A6L A;  2J62 A;  4F8X A;  2XFY A;  3HMC A;  4AY1 A;  1GOK A;  3AIC A;  1UKS A;  2G3M A;  3WDP P;  4JFT A;  1HN1 A;  3ZJ6 A;  4P7R A;  1JF5 A;  5C8B B;  3WDI A;  4W86 A;  1FP9 A;  1KR0 A;  1BGG A;  5E70 A;  3WEO A;  3VIL A;  2BVD A;  5AYB A;  1GQL A;  3CZG A;  1HVX A;  1VFO A;  1C3F A;  2J7F A;  2D2O A;  1M04 A;  3WH7 A;  4B15 A;  1SFS A;  2DIE A;  4W8A A;  2WAG A;  4UOZ A;  4CD4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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