4W9TA

Crystal structure of hisap from streptomyces sp. mg1
Total Genus 88

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
240
structure length
235
Chain Sequence
NKLELLPAVDVRDGQAVRLVHGVSGSETSYGSPLEAALAWQASGAEWLHLVDLDAAFGTGDNRALVAEITGAMDIKVELSGGIRDDASLAAALATGCTRVNLGTAALETPEWAAKAIAEHGDRIAVGLDVRGTTLKGRGGDLYETLARLDSEGCARYVVTDIGKDGTLTGPNLELLKNVCAATDRPVVASGGISSLEDLRALAALVPQGVEGAIVGKALYAKAFTLEEALKVVSA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
3H3 (214-216)EMPTYS1 (7-15)S11 (218-223)TIV1 (14-17)S2 (18-21)TIV2 (22-25)TII1 (26-29)AH2 (56-60)S3 (31-34)TI'2 (23-26)S9 (165-169)AH1 (36-46)AH3 (66-75)AH10 (225-229)S4 (50-55)TIV3 (83-86)3H1 (124-126)S6 (102-105)S7 (127-134)S8 (137-138)AH6 (113-123)TIV4 (133-136)TIV5 (139-147)AH7 (150-160)AH9 (204-212)3H2 (170-172)TII2 (172-175)AH8 (181-190)S10 (195-198)S5 (79-83)AH4 (89-98)AH11 (234-241)TIV6 (230-233)AH5 (107-111)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Isomerase
source organism Streptomyces sp. mg1
publication title Co-occurrence of analogous enzymes determines evolution of a novel ( beta alpha )8-isomerase sub-family after non-conserved mutations in flexible loop.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phosphoribosyl isomerase A
total genus 88
structure length 235
sequence length 240
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4w9tA00
2GJLA 4IXXA 1FDJA 3C6CA 4AF0B 1H51A 4HNNA 3OG3A 1JRBA 3BLFA 3O15A 4ALDA 3T55A 1EA0A 2QCNA 4RK8A 3R89A 1H7PA 5DY3A 2QAPA 1JVNA 1ONRA 3STEA 3TH6A 3C3NA 2C13A 5IM51 2J6XA 4A2SA 4OHQA 4IOTA 5DY2A 3NXFA 2ATMA 4H6KA 3NL6A 3Q37A 2J27A 2H3DA 5HINA 1DBTA 4NJJA 5LGXA 2NUXA 2QDGA 2CW6A 1SO4A 4IUOA 1QO2A 2RKXA 5D2TA 1P5BA 5DBUA 2IQTA 4Q32A 1FCBA 3BW2A 6TIMA 2Y7EA 1VHCA 4LTSA 3KVMA 4KWWA 4A29A 1KV5A 1XBVA 2EPHA 4FNRA 4L4LA 2QJGA 3STCA 1TV8A 4GRSA 4FF7A 4S2CA 3DZ1A 3M47A 4MJZA 3P62A 2ZZ1A 2V81A 3G1DA 3MWAA 3EKZA 4MY8A 5AHMA 1F5ZA 1VRDA 4UTMA 1X1OA 3TU9A 5CPLA 2NLIA 1KM6A 2Z6JA 1ZCOA 1IXOA 5TQLA 2JGYA 3C52A 4JTEA 3FOKA 3VKJA 3NQEA 3W2KA 4E2BA 3UQNA 3LLFA 4K38A 2J9XA 1VC4A 3ANYA 1H62A 4XUGA 3VNDA 3UWQA 5F2MA 5HWJA 2PURA 4JTFA 2ZCGA 3T40A 3BARA 3MYOA 5D2XA 3W2UA 4OT7A 1YLVA 5DLCA 3W83A 3N19B 3DFSA 4R53A 3LCIA 4NNBA 4NVTA 3EX3A 2JKEA 4O8RA 2V2HA 4Z1DA 3A22A 4O17A 1YPFA 4GBUA 3W88A 4O4WA 5EMUA 4LWWA 3NQGA 1OFOA 3L0GA 2A1YA 1NSJA 1SSDA 4CQAA 3UPBA 4FX8A 3AO0A 3HPXA 1SW7A 4PFMA 2Y85A 3MP5A 1RQBA 1H50A 5FF7A 3UXDA 3V75A 1F2JA 3W7PA 1B4EA 3P81A 1TSIA 3UWYA 4K8EA 1S5VA 3NAVA 3O6YX 3PM6A 3EX4A 1YDVA 4EWND 3DAQA 2WNQA 3WJWA 3NPUA 4DF1A 2YR1A 1L2UA 1D3GA 4YLWA 1GVFA 2A2IA 3N34A 4PL2A 5SWUA 4MFDA 4NJGA 1SPQA 4O14A 4AWTA 3OVPA 3IVUA 5D03A 1A5SA 1Q6QA 2EGZA 2NV1A 4RLIA 2DZSA 1R47A 3NYZA 2GPTA 1ZAHA 3W7GA 5EKYA 3DI1A 4WXYA 3EWYA 2VFDA 3OIXA 4N9BA 1P1XA 4WUIA 1QDSA 4FXSA 3HGOA 2E6AA 1GG0A 3DXIA 1PS9A 4OBTA 1CW2A 1I2NA 2B7QA 2WSRA 4MFEA 1KFBA 4LS0A 1TPVA 1TB3A 5F4XA 3ZFHA 3CB8A 3L5MA 3N3MA 4ZQMA 1PHQA 2YW3A 4HNVA 2ZZ4A 4X2RA 4U28A 3PSVA 4LUJA 5G5IA 1K8XA 1S3HA 2VEMA 1OF8A 3M7WA 2CLKA 3PBVA 3G18A 1OX4A 3TA6A 4AVFA 1H7OA 3QMTA 5AYZA 4NZJA 5TBOA 3WJZA 3U8GA 2Z2UA 5I3IA 2NX3A 2GQ9A 1R2SA 5BW6A 1M5WA 3C2EA 2FDSA 1BTMA 1HG3A 4LVAA 3UYCA 3THQA 7TIMA 3QW4B 3PVFA 3G3DA 3RFAA 3IV3A 4YXGA 4LC8A 4DF0A 2P0OA 4CNPA 2QF7A 2VELA 4B5NA 4LRTA 3DKLA 1AW2A 1TQJA 1FQ0A 3LHZA 5G2WA 2VFGA 2V8ZA 2V2CA 3IGXA 3O05A 4UR7A 3SJ3A 4DO4A 3C4UA 4O12A 1V7YA 3IVTA 3MW7A 2VEPA 3N9RA 1JULA 1Y0EA 3B8DA 3GNDA 2X1TA 3EKLA 1JUEA 1UUMA 2VFIA 1H1YA 4HN4A 2QKFA 3FEMA 4LVBA 3FYOA 3TSMA 5BRBA 4K37A 5LNSA 1OG0A 3MJYA 2DZPA 5DELA 1XUZA 3WFAA 5AC6A 3B0VC 5KINA 1ZY9A 3NPVA 4LUIA 3QMRA 1JCYA 3KOFA 5LNVA 5KZMA 1OFPA 1K7FA 1S5TA 4XKYB 3LXCA 3EXSA 2TMDA 1SW0A 4M6QA 5HR6A 3IIVA 3STFA 1H7NA 6ALDA 1PV8A 1UB3A 4KKXA 4WY0B 3UWUA 3GKAA 2NXIA 2WO5A 4POCA 3LBCA 5G2IA 3CLMA 3N2XA 4BWLC 1X8FA 2WNNA 4JTIA 4FEZA 1I8JA 5FF0A 4UNKA 4UTJA 4IX0A 4NQ1A 4K7VA 1R30A 5K9CA 3QYQA 3WK1A 5EA9A 3LGEA 2QEZA 2QCHA 4WOQA 5AB3A 2WSYA 4HKPA 1OYAA 1WAUA 1TPEA 3I7RA 1H63A 1QWGA 1FDYA 4O19A 1ZAJA 3LI1A 5HR7A 1DVJA 3DI0A 3S6DA 1JRCA 2NWSA 2QUTA 2JKAA 4MKNA 1KBIA 3DGRA 1Q3NA 4CCEA 3G1YA 5A5WA 1MEHA 2CLOA 1MXSA 3HG2A 3NQ2A 4MUZA 1DORA 4AB4A 1G67A 1WV2A 1EP3A 3LERA 1GG1A 3PBWA 3PG8A 2VFFA 1Z48A 3QW3A 1BWKA 4Z1BA 4AHQA 3HIJA 2ZZ3A 4MIMA 3NQDA 3RLVA 3LI0A 2BZNA 3HG4A 4JY8A 1EWEA 5DBTA 1J4EA 5C55A 1PCWA 3ATYA 1VH7A 2E09A 4L4MA 1QPOA 1XDMA 4LT9A 2ZQ0A 2HMCA 4DXVA 4IJBA 4NZFA 2A6LA 4O13A 5K7JA 5K9XA 1NEYA 4JX5A 3L68A 3G8EA 3QQ0A 3W7EA 3V1PA 1B57A 2V2DA 3PB2A 1OYCA 2XN0A 2Y6ZA 4E2DA 3DKJA 2I1OA 2G96A 4UTTA 2A5HA 1O5XA 1G69A 1ALDA 3L9CA 4TX9A 4IPJA 3CT7A 5G1YA 4JEQA 4Y9AA 1W0MA 1EUNA 3BG5A 1H60A 3LCLA 2EAWA 3LBMA 4FNQA 5D04C 1H7XA 2DZWA 2GOUA 5G1TA 1PCKA 4QISA 2I9EA 3IIOA 1TTIA 4X3ZA 1GQNA 1KTBA 5K4XA 5ABTA 3DH7A 3NPWA 3NR0A 2C18A 1JCJA 1GWJA 2C3ZA 3G3MA 2FB3A 2A7RA 4FX6M 4NNCA 2X1UA 1TJRA 2P10A 3KHJA 1GYNA 3L5AA 4YCOA 1OK6A 3IEBA 1TMHA 1LDCA 3DBPA 5FF3A 3MYPA 3LRLA 1ZHAA 2YGYA 2BLEA 4FO4A 3USBA 3B0UX 1H5YA 1YXYA 2ISWA 3TSDA 1TV7A 3TR2A 2W79A 4JTGA 3FJ6A 1SO5A 4LV9A 1FCQA 3ABQA 4OQVA 4CQ9A 5K3VA 1HO1A 1KM4A 1JCXA 2JBMA 3LB0A 5LHFA 5F1UA 3TUUA 3P74A 1T0OA 1WBJA 2CLHA 3HBLA 2B0MA 4A21A 3BO9A 2J9YA 1XL9A 3LHWA 3L0KA 4U4MA 2RHGA 1VS1A 3G0XA 5AFDA 3C2VA 4N4QA 3TC6A 3EWUA 5D38A 2YCEA 1VCGA 3R8RA 2CWNA 1LLZA 2C6QA 2W0UA 1AMKA 3T44A 4EF9A 2GJNA 1VZWA 4KFOA 4XBKA 4K36A 3KX6A 3CEUA 4NUWA 1TREA 3WJXA 3SZ8A 2VFHA 3LOTA 1W5QA 3AJXA 1TPUA 1I2OA 5HULA 3NDOA 3TJLA 3KRUA 1SZEA 4MY1A 3W7DA 1GEQA 3CQ0A 1G4SA 3KXQA 3CC1A 2RDTA 3FFSA 1TRIA 4JTJA 5I3KA 1QCWA 2FQIA 4HPXA 2GQ8A 5AOUA 1MO0A 3S1WA 3GK0A 1SUXA 3VFLA 3W76A 4N9EA 1VQTA 1ZNNA 3LHTA 3BPWA 1FBAA 3QZEA 1WQ5A 3OEXA 5TIMA 3TKFA 3ZWTA 3NQ7A 3MMTA 4XZ9A 4UTIA 2DP3A 1GTEA 2HSAA 2R14A 4MLRA 3QMSA 4AHPA 3O6CA 5BOOA 1R2TA 1KM0A 3SI9A 1UCWA 1KLYA 3E9AA 4OE7A 5F1VA 5BNKA 5CZ0A 3IIZA 4AMAA 3SECA 3I65A 4CNNA 4JR5A 4IQLA 2GVGA 1ZAIA 1XFBA 2VFEA 4I9AA 5HNRA 3BW4A 5FF2A 3GDTA 1MZHA 4OV9A 1KM2A 4O57A 1XM3A 4FNPA 4FNUA 4UUIA 3I6RA 3FKRA 4GUGA 3G24A 5FEXA 4DQWA 2Q8ZA 3NM3A 1A53A 2QDHA 4NX5A 1I4NA 3QSRA 4K6AA 4D2JA 3HJZA 3EWWA 3PUOA 4NJKA 3P8IA 4MZ8A 2FLIA 3NA8A 1RD5A 3F4NA 3W7MA 3I68A 2ZZ6A 1VCVA 1AW5A 3W7JA 3U2OA 2HS6A 4BR1A 2FPYA 1QPRA 1DQWA 4JTHA 4HPJA 3TROA 3W87A 3GZ3A 1HO4A 1PE1A 2FB2A 2WV8A 4GC4A 3SY5A 1QAPA 1ADOA 4IMEA 5E0KA 1LRTA 2V82A 3HG5A 3ATZA 2ZRVA 1K3UA 1E51A 5BMWA 1FXPA 3TFXA 3GDKA 1LCOA 4ZQOA 3LTSA 3KRSA 3NEVA 2G95A 1GTHA 1YXCA 2ZBTA 1H61A 1F7BA 3KFTA 5K2ZA 3W86A 4AF0A 4AHOA 4J9JA 3FS2A 3CIXA 2G97A 4JIQA 4BWLA 3UY8A 2FIQA 4JTTA 3MBDA 1I45A 3CM4A 1B4KA 1YDNA 1IXNA 1Q6OA 3NL2A 2X1SA 5D30A 2CLIA 1RV8A 4R34A 1LOQA 3WK0A 4DEFA 2OJPA 1KA9F 4LOCA 3M1ZA 1N8FA 1U83A 2E5CA 4ADSA 1FWRA 3INPA 2E6FA 4UTHA 3PUDA 3TDFA 3NZRA 4IMGA 1SZFA 3NGJA 4UTTC 5D33A 3LCFA 1Q6RA 1F76A 5MHBA 4Z1AA 4RCXA 3LCWA 1LORA 3W23A 4FX7A 3L66A 3W3OA 2NXGA 5HWNA 4BK9A 2EHHA 4K7YA 5KMYA 4BI5A 2E6YA 1OABA 3C0JA 3O16A 1YTKA 2B4GA 3VI2A 1LOSA 2PRHA 2TSYA 2AGKA 4RX0A 3P61A 3QPYA 4BFAA 1A5AA 3EWXA 3PF3A 1LYXA 3LHUA 5DN1A 1QNVA 1FXQA 1WYIA 4ADUA 4AXKA 4ZMGA 3T78A 4EVZA 1OFQA 2CU0A 4HNUA 5LGZA 3UPWA 1SFLA 3QFEA 3KVKA 1KFCA 4JYDA 3L67A 3Q58A 1YXDA 1B9BA 5CPOA 4O0KA 3BVJA 1QR7A 4KFNA 5F4WA 3TSBA 5CZTA 3L0NA 1BEUA 2WSQA 3EWZA 3H55A 4WJEA 3RU6A 1LTDA 3HB9A 1FWSA 4NXSA 5CSRA 4LNYA 1BWLA 3W07A 3PG9A 3VCRA 3GAKA 3ZWSA 2Y70A 3Q2DA 2PCQA 3MUXA 1GJPA 1W31A 4WY0F 4Q4KA 2Q3RA 2ABBA 4AEOA 2E77A 4TMCA 3KVJA 1XBYA 3MHGA 3BW3A 1QO5A 3TQVA 2E68A 3A9IA 3LTYA 3G1XA 3TXZA 4UFHA 3MBFA 2ZRXA 1EP2A 1I2RA 5HQEA 3WJSA 3NZ1A 3DFQA 1LBMA 4UFMA 4NT0A 4O52A 5BMXA 1TJPA 1JUKA 4EIVA 2H8XA 4Z1CA 3PBUA 1TPH1 3M5ZA 1ML1A 1D9EA 1HFBA 3CHVA 3W1UA 2V0TA 3W1LA 5K4ZA 1GVRA 4M7SA 3W9ZA 4PC8A 2OCZA 4OGZA 2LLEA 1LZOA 2ZRWA 1A5BA 3UZ5A 1GZGA 3DFPA 5C5YA 1GOXA 1X6UA 3C2RA 1SQ7A 4JGDA 3W1QA 3W1AA 5LKYA 1PL9A 1JJKA 5LNWA 3L65A 1T96A 4M19A 4A3UA 2TPSA 1AK5A 3G1VA 3UWVA 2CFFA 3QF0A 4N6EA 4YMZA 3W7NA 2A7PA 1RZMA 1QPQA 3W71A 2V5LA 3C2OA 4O54A 4HT3A 1DJQA 5EPDA 3E49A 3O07A 4FNTA 3OHIA 2DJXA 2Y88A 3EX2A 4GJ1A 2EKCA 3STGA 4JXCA 4UFKA 3UWWA 1OHLA 1LRQA 4CNOA 4I7VA 1VCFA 1C29A 3OVRA 3TK7A 1XC4A 4RZ5A 3TFCA 3P67A 4WQ6A 4EOUA 4A22A 1P0NA 2BX7A 5G2HA 5J5DA 1RPXA 4MOZA 4RKAA 1WOAA 3W1RA 3PSWA 1FWTA 5AC7A 1FCVA 4MLJA 2PRLA 2NZLA 5DXYA 4AWUA 1SR9A 1ZJIA 3QJAA 1OFDA 4O53A 3W70A 1GT8A 1TYGA 4O1DA 1TTPA 4O4VA 3IGSA 5E1QA 1FDZA 3W7OA 1VLWA 2C19A 1NFBA 2JK2A 5AYXA 3I7SA 1R2RA 2X16A 3QC3A 1DOSA 1KV8A 2B7NA 2VC6A 5GVJA 1O4UA 4DELA 3S5OA 3BK0A 3TNOA 3S0CA 5F2GA 1XUUA 1Z44A 2JKPA 1IGSA 3CPRA 3G0SA 1KBJA 5D2VA 2DZXA 3DFNA 2R91A 2Z6IA 2ZA1A 2ZFAA 2QR6A 3NOEA 4JIPA 4Z08A 1F73A 1W56A 2GQAA 4NJHA 3A5VA 2NWRA 4BI7A 1SZNA 1Z41A 3NQAA 2J9ZA 3ELFA 3HOJA 3M6YA 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 4EF8 A;  3G1S A;  5AHL A;  1XBX A;  3CU2 A;  1W54 A;  3KAO A;  2DZT A;  3M16 A;  3ZR4 A;  2E6D A;  1BKS A;  2FFC A;  3ZS4 A;  2A85 A;  2ABA A;  1M7P A;  2Y89 A;  3JR2 A;  3LRM A;  2V30 A;  4I7W A;  4UCG A;  4IMC A;  3HPZ A;  2VKZ G;  3GR8 A;  5AHF A;  3BLE A;  4YL2 A;  1L6S A;  5U4N A;  3CIW A;  4X22 A;  4GUH A;  4RZ6 A;  1KW1 A;  4GWE A;  4GUI A;  1W8S A;  3EEG A;  2WNZ A;  2Z1B A;  3E12 A;  1WBH A;  1ME7 A;  3M0Z A;  1IXP A;  1LOL A;  4PEK A;  5EL1 A;  5I3J A;  4ZQP A;  3TV8 A;  2ZRY A;  1WDW A;  2C15 A;  2CZF A;  2QCE A;  5L6U A;  3LHV A;  2YZR A;  2FPV A;  4E0C A;  3C61 A;  3HQ1 A;  2G5W A;  1I2P A;  2NX1 A;  5HUP A;  1TPF A;  1A5C A;  5CZJ A;  4QNE A;  1QOP A;  3PS7 A;  4KWV A;  2ISV A;  1AG1 O;  3TML A;  1KLZ A;  2BWG A;  3S1U A;  4N9C A;  2V9D A;  4LU0 A;  8TIM A;  3FA5 A;  5H91 A;  3DEN A;  1LBF A;  3MHU A;  4JX6 A;  3W74 A;  3O6D A;  3QPZ A;  3FIG A;  1QOQ A;  3N9S A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VNI A;  2WC3 A;  3WFL A;  4ALD A;  1PIG A;  1QBA A;  3T55 A;  5FJR A;  2QCN A;  4H6Q A;  4G7E A;  2D0F A;  4IH3 A;  1XRV A;  1H7P A;  2QAP A;  3STE A;  1UZD A;  3C3N A;  5IM5 1;  1R3R A;  1AQF A;  4OHQ A;  5DY2 A;  1EGM A;  2PF0 A;  1U1H A;  2H3D A;  2NUX A;  1PYM A;  3WBY A;  2XZ9 A;  2RKX A;  3L4T A;  5D2T A;  3VM5 A;  1P5B A;  2V67 A;  3QV7 A;  3BW2 A;  4W5Z A;  4E5T A;  1S2T A;  4PMQ A;  4A29 A;  1B90 A;  1VB9 A;  3LEP A;  5JQ9 A;  1UQZ A;  2QJG A;  1FHL A;  2ACQ A;  1TV8 A;  3D3F A;  2PCE A;  4S2C A;  1A0D A;  1S2U A;  2QDD A;  4HHM A;  2EG6 A;  3P62 A;  3BIC A;  3EKZ A;  5E0C A;  3VIM A;  4XV0 A;  1NOF A;  1VPY A;  5AHM A;  3TU9 A;  2ZUS A;  1LG1 A;  3B8W A;  3B8T A;  2CZV A;  2IPF A;  1EJW C;  3O2L A;  3NQE A;  3VKJ A;  4WSK A;  3LLF A;  1H62 A;  4XUG A;  4MWA D;  4JTF A;  4ACZ B;  5DMM A;  3AWN A;  3LSC A;  4R53 A;  4B5T A;  4CU6 A;  2BVY A;  4ACY A;  4LYR A;  2OGY A;  5BXR A;  4DZH A;  3IJL A;  1YEY A;  4HPN A;  3BLO A;  5EMU A;  2PDX A;  1WXY A;  2DW6 A;  1PJ9 A;  1GON A;  3NQG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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