4WUIA

Crystal structure of trpf from jonesia denitrificans
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
205
structure length
205
Chain Sequence
AMYIKVCGLTDPHAIDAAQAAHVDAIGFVHAPTSPRHLTPPHISTLTATVDCTIDTVLVVATTPIADALALAESTGVSVLQLHGQYSDDDVAYAAARFPRVWRATSLSASPNLTVGAYGEELLLLDAPQAGSGHTWDFAALAHRRPTGRWLLAGGLTPDNVADAITTTSPWGVDVSSGVESAPGVKDPAKIAAFVQAARGVSCPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Co-occurrence of analogous enzymes determines evolution of a novel ( beta alpha )8-isomerase sub-family after non-conserved mutations in flexible loop.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Jonesia denitrificans
total genus 66
structure length 205
sequence length 205
ec nomenclature ec 5.3.1.24: Phosphoribosylanthranilate isomerase.
pdb deposition date 2014-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00697 PRAI N-(5'phosphoribosyl)anthranilate (PRA) isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4wuiA00
2TPSA 3HG3A 2NLIA 3STGA 3S1WA 5G5IA 3WK3A 3MBFA 3TK7A 4K6AA 3NO5A 2VFEA 3A9IA 1XXXA 4JDBA 2A7RA 3GLCA 4FB7A 3GAKA 2NV2A 5LNRA 4HNVA 3LHVA 3S1XA 5DCDA 3W7QA 4NQ1A 4NX5A 1H7PA 2FPYA 1I8JA 4JXCA 3QQ1A 4JYFA 5L9FA 1KFLA 3FA5A 2X1SA 3ZWSA 1TB3A 2IQTA 4YLWA 2NUXA 2E1DA 2NX1A 2Y6ZA 2R94A 3W88A 2ZQ0A 3T4CA 3L67A 1Z44A 3LERA 1JCMP 2GJNA 3N2MA 3BO9A 1I2OA 1B3OA 4O1AA 1DKWA 3NQDA 1EB3A 2YFOA 3DENA 2VKZG 1GYLA 1KFJA 3LX9A 4UTHA 4TIMA 4JTLA 3M9YA 3CQ0A 2C3ZA 3QH2A 2ZBTA 4TX9A 5BMXA 3ATYA 1XFBA 4O4VA 1AK5A 3DFTA 4XTDA 3HB9A 1OFPA 4O19A 1SU5A 1LBLA 8TIMA 3CWNA 4AAJA 4P2VA 1PL9A 1B4EA 3AO0A 2ZRYA 4FNTA 1YYAA 3UY7A 3I65A 4CCDA 2RH9A 1H50A 2ZDRA 3L5MA 3BG9A 4WXZA 3WK2A 2E5DA 1U5JA 3T7VA 3TSBA 3WK0A 3DHDA 5K3VA 4JTGA 3LOTA 1OJXA 3PUDA 1SZFA 4O1BA 1KFKA 3W1UA 1JULA 3A5FA 3T44A 3S5YA 1GTEA 1O60A 1DJQA 2OT0A 3LCXA 3NZ1A 3UY8A 2NX9A 3PULA 2GQAA 3KVJA 4IXHA 4JICA 3LI0A 4ZQRA 1KFCA 2VFDA 3LHYA 3P61A 1LOSA 1BWLA 3QF0A 1Q3NA 2W0UA 1D3HA 4UR7A 1GVSA 3USBA 1K8ZA 2WO5A 3CTLA 5EY5A 4CNNA 3TFCA 3WJWA 2VEKA 2V5BA 4M6VA 2GVJA 3TKFA 3NR0A 4GFSA 2J9ZA 3OA3A 5A8GA 3TH6A 1B4KA 1AW2A 4U28A 3RF9A 1QMLA 3ANYA 1R47A 1VHNA 3DI1A 4BWLA 3QEZA 4UTJA 1AMKA 1MZHA 5D09A 3C61A 3HO8A 1OYAA 2V82A 4KFPA 3VNDA 1W0MA 2C13A 4YMZA 4QNEA 3P80A 3I7SA 2GVLA 1QPNA 2DJLA 5A5WA 4XBKA 5G1TA 1YPFA 1TTJA 5J5RA 2XFWA 2JKEA 3GXTA 1BEUA 2PC4A 5G4WA 1K8XA 4MLJA 1ZAJA 4O11A 1GTHA 1GVRA 1RQHA 2YGYA 4RKAA 1GT8A 3PC0A 4LY8A 3T40A 4JIPA 1M7OA 4LTSA 4QM1A 3UNDA 4JTHA 1WAUA 1L6SA 2BWGA 1FWNA 2QJGA 3LI1A 2JKAA 4PA8A 2GQ9A 1IXOA 1KM4A 4DBDA 3NQAA 3L9CA 4JYDA 1EIXA 1FCBA 3S1VA 2DU2A 1TJPA 5F4SA 3WFAA 5CPOA 2QDHA 5DN1A 4UR8A 5EYWA 3TSMA 3NVTA 2ABAA 3PB2A 4NX0A 2J6XA 1QFEA 1KW1A 4PC8A 1NVMA 1H51A 3THQA 4OHQA 2PRLA 2Q8ZA 5U4NA 5FESA 1G4EA 3DBPA 4N9CA 3KOFA 1GYNA 5EMUA 2P1FA 3LCWA 3DGRA 5DXYA 1W8SA 2E6AA 4OBTA 1KM0A 3B0VC 1TMHA 3FIGA 1OX4B 4NJGA 3SJ3A 5AFDA 4KFOA 1X1OA 2Y89A 3BK0A 3MHFA 3QPZA 1XBXA 3CLMA 1NAL1 1EP2A 3UWQA 5BOOA 1HUVA 1OYCA 1I2QA 4AEOA 2YZRA 4UTTA 2QJIA 3STFA 2C0AA 1KBIA 2HMCA 3EWWA 3NPXA 3KVMA 4UUIA 3ZR4A 4MLRA 4HSNA 5CSSA 1R2RA 4JR5A 2YSWA 3BGGA 2WOQA 3G8EA 4IQLA 4LRTA 4E2BA 3MP5A 1EEPA 2RDWA 1G67A 3NQ2A 2CZDA 4L4LA 5IBXA 3W7HA 3M43A 2NUYA 4Z1DA 1LOQA 5TQLA 2FFCA 1M6JA 1SFLA 1PIIA 1WXJA 3KRSA 3DFPA 1L2UA 3P81A 3CEUA 1KFEA 4BK9A 1ICPA 1LLWA 5FF3A 4DQWA 4NVTA 1H5YA 5CGQA 4Z1BA 2X30A 1H7RA 1OK6A 4DO5A 3S9YA 4NJKA 3EX2A 1FCUA 2RHGA 1QOQA 4S1FA 3QSTA 3LCFA 2ZZ1A 4RK8A 1DORA 2X1RA 3PUEA 2XN2A 3I6RA 3MP4A 1H7XA 5AHMA 3IGUA 1VCFA 1KA9F 5CKSA 3O1NA 4NJHA 3IGSA 4JD4A 5HR6A 1FCVA 3MUXA 4KKXA 3W7RA 2V81A 4K36A 2Y7GA 4C1KA 4DBEA 2W79A 4JTSA 1KBJA 2G96A 3I7QA 3PAJA 2B7PA 1LRTA 4I7VA 3W9ZA 5AHEA 1KV5A 3FYOA 4EF9A 4ZVJA 5I3IA 3FOKA 4TO8A 2X2GA 2RDTA 3UZJA 3S42A 4M5PA 2H6RA 1W3NA 1FUYA 1QDSA 3O15A 2ZRWA 4HNTA 3GK0A 3LBCA 3VI2A 5MHBA 3UXAA 1UCWA 1FQ0A 1THFD 4CLMA 3IV3A 2Z1BA 2CZEA 1XDLA 1JUBA 4OGZA 1PHWA 4Q32A 3W2NA 4H6KA 1FXQA 1SW7A 4NJJA 1I2PA 1TRDA 3VE7A 1OFBA 3NQ7A 3TQ0A 1V5XA 3WJXA 2DZPA 3LHZA 4ZQOA 1R2SA 1FCQA 3MI6A 3MYOA 5KZMA 2YYUA 3P5ZA 1QCWA 3W7OA 3O05A 1DBTA 3OEXA 4WY0F 1FWRA 4WY0A 1SQ7A 1IGSA 5TBOA 2Z6JA 1O5XA 3B8DA 3W7GA 5HWJA 1XUZA 4KWWA 5FI8A 4GRSA 3BW2A 1ZCOA 1TREA 1K02A 4UCGA 4MZ8A 1IXPA 1P0NA 4E2DA 3PBYA 3Q37A 1ONRA 5D37A 4JN6A 3YPIA 2AAMA 4AWUA 4AWSA 1PE1A 3BG3A 5C2XA 3NPWA 2NX3A 1DQXA 5G2IA 3S5OA 4UFIA 3TMLA 1S5TA 2XN1A 3P82A 5LGZA 2FQIA 3DH7A 2FIQA 3QW3A 2C1HA 2EPHA 3PR2A 3QMSA 5I3KA 4DPPA 4DF2A 3A22A 1WQ5A 4NUWA 4DXVA 3O6DA 2I9EA 2NXIA 4L4MA 4O12A 5EPDA 2B7OA 3GNDA 3PBUA 3NGJA 5CPMA 2B7NA 3E12A 1ADOA 4UTIA 2J88A 3LLDA 3HBLA 2ZZ3A 4HSOA 4CQAA 5U7SA 4N9DA 3NYZA 3UXDA 1FWTA 4UMCA 4MY9A 4XQ6A 3HG4A 3EX3A 1I45A 2V9DA 2GJLA 2Y70A 4ZZ9A 5AHFA 4PFMA 4ORMA 2X16A 1VLWA 3P62A 2ISSA 2EHHA 1YTEA 3W2KA 2OZ0A 5CZJA 1WDWA 2WSQA 1GPWA 4HT3A 3TC7A 2JGQA 4Y8FA 3C52A 4UFMA 1RV8A 4OU1A 5AC6A 5AHLA 4GJ1A 3EX6A 1YDNA 3LCLA 3B0PA 1YXCA 4WX2A 1DQWA 1YPIA 3HGJA 1T96A 2OJPA 2EGZA 3IGXA 2V2CA 1Y0EA 4ICNA 4M19A 1DHPA 4FXRA 2A6NA 2NWSA 2QUUA 3C2FA 5F4XA 3SW6A 2B7QA 3G1HA 1CW2A 5KTLA 5BNKA 5G4EA 3PF3A 2JGYA 4N9EA 3C2EA 3Q94A 4UC5A 5DELA 1BTMA 3B04A 2GQ8A 2ALDA 2TSYA 1OF8A 3G3DA 4LNYA 2NUWA 1WA3A 1JCXA 2PURA 3W2UA 2RFGA 4JTEA 1N8FA 2CLOA 1GVQA 1GVOA 2QF7A 1Q45A 1O95A 3LV6A 4Y9AA 5DCBA 1JCJA 3EXSA 3JR2A 3T78A 1JR1A 1GJPA 4DO6A 1FXPA 1F05A 4UFJA 1JCLA 1OFEA 3ZFHA 1OFQA 4O1CA 3NM1A 2A0NA 1TPDA 4IUOA 3TUUA 2CLFA 3N73A 3C2RA 4I7WA 4X3ZA 2R8WA 4N02A 3MHGA 4HKPA 2WSRA 5LHEA 1M5WA 3TV8A 1JJKA 5DBUA 3UWWA 4M7SA 3PUOA 1VS1A 5KINA 4ZQNA 1GG0A 4I9AA 1VR6A 2E6DA 4OV4A 3W1XA 3B4UA 4IX0A 4O28A 4UFLA 3SR7A 4AXKA 3U2OA 1OG0A 3IVTA 1L9WA 1S3HA 2X1TA 2I14A 4IX2A 2ZRXA 2H8XA 4FIRA 4JTTA 4AF0B 1X7FA 3UWUA 3N2XA 1XBVA 5SWUA 3IVUA 1LOLA 2B4GA 5CG7A 1KV8A 3P60A 4R33A 1LBFA 1XBZA 2EAWA 3TA6A 3TXZA 2P0OA 3CHVA 1W37A 3A24A 4JX4A 6ALDA 5KMYA 1TV5A 4NNCA 5AC8A 2DZXA 3M5VA 1QO5A 1LTDA 1QPOA 1GZGA 1PV8A 1Q6LA 3PSWA 1G4TA 2YW3A 3N34A 2QCDB 4PCFA 4Y6GA 3PSVA 5TIMA 1T99A 2Z6IA 3QYQA 4YWIA 3SSJA 3DFOA 3MI3A 3DFNA 4Y96A 1WBHA 3BLIA 2R14A 3IIZA 2Z0IA 3NZRA 5K2ZA 4I7UA 3N14A 4HNNA 2VOMA 4BFAA 1AL7A 3BLFA 4MJZA 4JEQA 5HMSA 4E0CA 3NQEA 3C56A 3E02A 3EWZA 1IIHA 4O13A 1PVNA 1XKYA 3UWVA 1A5BA 3STEA 1P0KA 4KFNA 4WXYA 4XKYA 3M0ZA 1W3TA 2C14A 2G5WA 1RQBA 1SO5A 1JUEA 5AB3A 1MO0A 3NA8A 2X1UA 3GNNA 4HIBA 3W7NA 4JYEA 3LM7A 4NXKA 3OVRA 3N19B 3EB2A 5D2VA 1N7KA 5LNWA 5FEZA 3WJSA 2Y85A 1K7XA 1TPVA 3L65A 1ZNNA 4JNMA 4YCOA 1FDZA 4X22A 2Y88A 1WOAA 3NAVA 3M47A 1EPXA 3W71A 3PG9A 3W2MA 1TPWA 1JRBA 1OFAA 2WSYA 3A23A 1R30A 3EKLA 6TIMA 1OFRA 1SZEA 3G1FA 4GUHA 2ZZ2A 1VPXA 2BX7A 1ME8A 1ML1A 5K9XA 4G1KA 1WBJA 1SO3A 2H3BA 3LLFA 1ALDA 4OQVA 3M44A 2E09A 3HF3A 4JX5A 4TMCA 3UWZA 4UTMA 1EP1A 3LCHA 4WY0B 3P5YA 5HWNA 4UNLA 1TO3A 4LU0A 4PL2A 2NWRA 4JX6A 4MYAA 1JCNA 3DXIA 3P8JA 2DZVA 3HG2A 3W1NA 3TAOA 4AB4A 4A22A 2FJKA 2OT1A 1MEIA 4LWWA 5EBUA 4EF8A 3Q2DA 2F7FA 3CPRA 5LNUA 1W54A 4H4IA 1ZHAA 1EWEA 4O54A 4UTWC 5I3GA 1OYBA 1H62A 1VYPX 3T55A 2ZFAA 3LTSA 3NL5A 3C2OA 3MBDA 3ABSA 2DJXA 5D2XA 3FJLA 3TR2A 2WJZA 2NXGA 3QSRA 3BGJA 4ADTA 1RPXA 1SR9A 2ISWA 2A1YA 1W3IA 3W7DA 3W83A 2TRSA 1H61A 1PCWA 4O1DA 3UYCA 1H60A 1D3GA 2NXHA 3PM6A 3JRKA 5D03A 3DKJA 4WZHA 5LZLA 3HJZA 1FWSA 2DZUA 4LV4A 1IF2A 3PG8A 4QQ3A 4ML9A 4MZYA 4O14A 4MFEA 1O5KA 5D32A 4N9BA 5FEPA 5D2YA 5C5YA 4FNPA 3G18A 3FFSA 1SW3A 2I1OA 2GUUA 7TIMA 3CWOX 2C16A 2PE4A 5I3HA 2QKFA 5I3JA 3TMQA 1AL8A 1KLZA 2D73A 4LUJA 3E49A 1AG1O 1K7FA 1TJRA 1TPFA 2V5LA 3B0UX 3L5AA 1IXQA 1F73A 3L68A 4LC8A 4IJBA 1HTIA 5LNVA 3G22A 3V1PA 1JUKA 1QO2A 3MO7A 5HQEA 2A6LA 3L0GA 2A7NA 4RXGA 1SSGA 3D0CA 2E5CA 4FNSA 2Y7FA 3SZ8A 4IMDA 4MIMA 3TE9A 3L0KA 4A21A 1MSSA 5J5DA 3GVGA 3L21A 4O0ZA 2JBMA 4RZ6A 4MY1A 3MP3A 4BI5A 2FDSA 4LOCA 1XBYA 3M7WA 3EXRA 2VC6A 3W1MA 1HFBA 5HULA 4K8HA 3NG3A 4Y90A 4Q4KA 2J24A 2GVGA 2P10A 1LLZA 1W5OA 3C6CA 3O06A 4WQ6A 2YCEA 1ZAHA 4R53A 3NQCA 4RX0A 5T26A 4LS2A 1VJIA 1KM5A 3W1RA 4YL2A 3PBWA 4ZL1A 3TSDA 3W7LA 2A7PA 3W2JA 4JTIA 3FJ6A 4LVFA 4FX7A 3SI9A 3LHWA 1JVNA 2Z2UA 1VLIA 4NZJA 1ZALA 5FEWA 5DLCA 3UZ5A 4IOTA 5HJLA 2J27A 1TIMA 3S0CA 1Q6QA 3IIXA 4R34A 1H63A 3W7JA 1VYRA 4MJMA 4TR9A 4XBSA 4MUZA 5K4ZA 2GOUA 3MYPA 2ABBA 3MWAA 3W7CA 1QPRA 3UWYA 2DORA 5AHNA 4UMAA 3M5ZA 3TQVA 1Z42A 4JY9A 3W70A 4X9SA 4BF9A 2YYTA 5DXXA 3TJLA 3OIXA 4NT0A 4C1LA 2ZRUA 1W5PA 3MMTA 5EA9A 4W9TA 4JIQA 3GB6A 4AHPA 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 4RLI A;  4CQ9 A;  3B03 A;  3GYE A;  4EIV A;  4QJ1 A;  4DO4 A;  3DFQ A;  3O6Y X;  2CLE A;  2FLI A;  3KRU A;  2WQP A;  1Z48 A;  2OX1 A;  3CC1 A;  5G2W A;  3A5V A;  1DOS A;  1W1Z A;  1SZN A;  4UTW A;  5LKY A;  4RZ5 A;  3GAY A;  2YDA A;  4WOQ A;  2FB3 A;  4IMF A;  3NDO A;  4CQ8 A;  4HN4 A;  2RDU A;  1EP3 A;  1LRO A;  3SGZ A;  3I68 A;  1VH7 A;  1EA0 A;  3N9R A;  3O8A A;  5C54 A;  2A2I A;  1LBM A;  1W31 A;  5D38 A;  1J4E A;  1TYG A;  2HTM A;  1W5N A;  5C6M A;  3W73 A;  1LDC A;  5E1Q A;  2YW4 A;  1U83 A;  1ZJI A;  1HO1 A;  2QCL A;  1GG1 A;  4FIQ A;  3EKZ A;  1RD5 A;  2ZYF A;  1R2T A;  3NXF A;  3S8H A;  4UXD A;  4UTK A;  4Z1A A;  1EX5 A;  1R46 A;  1XM3 A;  3BG5 A;  3H53 A;  3W6Y A;  3NNT A;  3HIJ A;  2Y7D A;  1T0O A;  2Q3R A;  4QAI A;  1SFJ A;  5H2Z A;  1LRN A;  3LXB A;  3R13 A;  3JS3 A;  3NL3 A;  3TFX A;  3VKJ A;  2H8Z A;  1S5W A;  2VXN A;  4O16 A;  2KZH A;  1AW5 A;  1FX6 A;  4K37 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HG3 A;  1BYB A;  2FZ9 A;  3SJN A;  1U5H A;  3EDF A;  1CEO A;  3S1W A;  5G5I A;  3P2V A;  1XXX A;  4JDB A;  2A7R A;  4MG4 A;  3LPO A;  3VCC A;  2CHN A;  2NV2 A;  5LNR A;  3W7Q A;  4GQG A;  4RE2 A;  5C2C A;  1H7P A;  2JAL A;  4HTB A;  3FA5 A;  3R8G A;  3NOY A;  3ZWS A;  1TB3 A;  4DLM A;  2R94 A;  3VOJ A;  4LAZ A;  1RY0 A;  4MWA D;  2XIO A;  2NQL A;  3N2M A;  2QXW A;  3NVD A;  1I2O A;  4FXF A;  1FWI C;  1YDY A;  1C7T A;  3QOM A;  2CLP A;  2YFO A;  3DEN A;  1EYE A;  4UTH A;  3LX9 A;  4J2P A;  4PMO A;  3QH2 A;  1NWR A;  3TJ4 A;  4XTD A;  3F7J A;  2DQW A;  4O19 A;  1XQK A;  3K8M A;  3FDG A;  4ZB5 A;  4S38 A;  2YDR A;  5FA5 A;  2NVA A;  2XSX A;  1AA1 B;  3I65 A;  3GWQ A;  2XJ7 A;  3L5M A;  2E5D A;  3BOX A;  3SCV A;  1U5J A;  4PTX A;  3ES8 A;  2V38 A;  5K3V A;  3PPF A;  4O1B A;  1CNV A;  1PTD A;  1JUL A;  3MV1 1;  2YCL A;  3S5Y A;  4H8N A;  1GTE A;  3VCN A;  3AML A;  4IIC A;  1NQ6 A;  4IXH A;  4JIC A;  2ZXA A;  3QBU A;  1QVB A;  2PSN A;  3UR2 A;  1M01 A;  1BWL A;  3QF0 A;  4GME A;  4UCF A;  5EFD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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