4X9SA

Crystal structure of hisap from streptomyces sp. mg1
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
VNKLELLPAVDVRDGQAVRLVHGVSGSETSYGSPLEAALAWQASGAEWLHLVDLDAAFGTGDNRALVAEITGAMDIKVELSGGIRDDASLAAALATGCTRVNLGTAALETPEWAAKAIAEHGDRIAVGLDVRGTTLKGRGWTSEGGDLYETLARLDSEGCARYVVTDIGKDGTLTGPNLELLKNVCAATDRPVVASGGISSLEDLRALAALVPQGVEGAIVGKALYAKAFTLEEALKVVSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Co-occurrence of analogous enzymes determines evolution of a novel ( beta alpha )8-isomerase sub-family after non-conserved mutations in flexible loop.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phosphoribosyl isomerase A
molecule tags Isomerase
source organism Streptomyces sp. mg1
total genus 90
structure length 241
sequence length 241
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4x9sA00
2E6YA 2X1RA 1H7NA 4ZQPA 4LVGA 4O11A 3KFTA 1TRDA 1PHWA 2NV2A 4DELA 2W6RA 3WJXA 3NL2A 3O05A 3SI9A 2WO5A 3P84A 2C16A 3DI1A 4M5PA 4NJKA 3O07A 2ZCGA 2ZRZA 1K7XA 1SR9A 5C5YA 1EUNA 3N2XA 1QDSA 1OJXA 2YZRA 3EWXA 2HS8A 3NEVA 2QJGA 3P7YA 1X8FA 4AF0A 3N9SA 4YMZA 5D32A 2Q8LA 2VEMA 1FCQA 2QKFA 2ZQ0A 3Q58A 1W5NA 3Q2DA 1WAUA 3HB9A 3EKLA 4XZ9A 1H50A 1J5TA 5EY5A 3L2IA 3OA3A 1SZEA 3G8RA 2E5DA 3Q94A 5FF2A 3CC1A 1GJPA 1TRIA 4CCCA 2AAMA 1JCXA 3MJYA 4JDYA 1XM3A 3RNDA 4UCGA 4NX0A 3LTYA 2CLEA 3H54A 3UZJA 3L5AA 4POCA 5CSRA 4JYEA 3W7PA 4MJMA 1B3OA 1LCOA 5D2YA 3NQFA 4EF9A 5TQLA 4RV8A 4UFIA 4O8RA 2EKCA 3W7CA 1G7VA 3FEMA 3TV8A 1AK5A 3L67A 4LV9A 5K9DA 3M5ZA 4Z0JA 3DFOA 2NX3A 4IQLA 2ZZ3A 3LLFA 3SIZA 2H6RA 1OFEA 4R53A 3IVSA 1QOQA 4IMCA 1NF7A 1CX9A 4RJEA 1GPWA 3W1MA 4K8EA 3LCWA 4HKPA 1TTJA 2QCLA 3BG5A 3MO7A 3U2OA 2I14A 3LERA 3OIXA 2NWSA 2YPIA 3INPA 3GDLA 5CPNA 5DY2A 4R34A 4O15A 1MEHA 3FJLA 3SECA 5LZLA 1FBAA 1KM1A 3EEGA 3NL3A 2XN2A 5I3JA 2Y6ZA 5D03A 2X1SA 1JCLA 1C9DA 1Y0EA 1XL9A 4JTSA 1X1OA 6ALDA 5LKYA 1JULA 1OF8A 1SU5A 1MO0A 3BPWA 4FNRA 4N4PA 4WQ6A 4GUJA 5CSSA 1FWRA 2HTMA 4NZFA 4Z1CA 3P82A 3UNDA 1DHPA 2CLOA 2E5BA 5I3HA 2RKXA 1XDMA 4LS0A 2PE4A 4ADUA 4RZ5A 5KITA 1S3HA 5F1UA 1L6YA 1YXYA 2FPTA 1O5KA 3TDFA 5BOOA 5DLCA 1FWWA 4UMCA 3GK0A 1MEIA 4M19A 2WKJA 3T7VA 3MMTA 1P5BA 1W54A 2YXGA 4O12A 2WOQA 3EWWA 5HWMA 4MJZA 3TROA 4GWEA 4LC8A 2TMDA 3EB2A 1VLWA 2F84A 3GNNA 1BKSA 3GIYA 4HHPA 5G4WA 1P4CA 5L9FA 2OZ0A 3A24A 1W5OA 3F1QA 2LLEA 1TB3A 4IUOA 4FF7A 1JUEA 4IMEA 4CNPA 2C3ZA 5AOUA 4DF1A 3RU6A 4PA8A 1BWLA 1AG1O 2ZFAA 3W2NA 4Z08A 3BARA 5DXXA 5DY3A 3FA5A 4MYXA 3MUXA 2FPYA 2P10A 1Q6LA 1UCWA 4KKXA 4Y90A 5LNRA 3AO0A 3RMJA 3S5NA 5DBTA 2BXVA 3KVJA 1RV8A 2E5CA 1SSDA 4E0CA 4AHOA 4M6QA 4WD0A 4MFDA 3W7KA 2C13A 2TPSA 2ZA2A 4ZQNA 3LM7A 3IVTA 1TTQA 2EAWA 4CQ8A 3C2OA 1W3NA 3GNDA 3BGGA 4JTHA 3EX4A 4QITA 5DCBA 5EPDA 4H4IA 3TJLA 1LOSA 2GVLA 2Y7DA 3O8AA 5D37A 4UTWA 1WOBA 3UYCA 3LHUA 1VCGA 3ATYA 3LI0A 3W72A 3T55A 4ORIA 1XC4A 1KFKA 4FX7A 3R8RA 3W1UA 5CKSA 3MI2A 5LHFA 2QCMA 1AL7A 1W8SA 3BW4A 3PG9A 3OHIA 2ZZ2A 5AHFA 2QDHA 3P5YA 3TAOA 1X7FA 3KVLA 1RR2A 3WJYA 3E02A 3RK8A 1RPXA 5K4XA 3W86A 3OBKA 2DZXA 2V2DA 4CNOA 1JCNA 1XBZA 2E6DA 2A6LA 1YXDA 3K30A 4JDBA 1FY6A 3C8FA 1LORA 3LHTA 1ZENA 1CI1A 1SZFA 4HIBA 4NJIA 1T8XA 3W7MA 3G0XA 4YXGA 3G0UA 1WYIA 1LOQA 5KINA 2YCEA 3D0CA 1ALDA 4EVZA 4R33A 1R2RA 4BF9A 1LRTA 2NWRA 4PC8A 4LU0A 4JTFA 3BG9A 1WOAA 3FJ6A 3LHVA 2G96A 3C6CA 3QSRA 1KV5A 3QC3A 2JKAA 3HJZA 1AW1A 5AC8A 4U4MA 3QH2A 3HGJA 4UFJA 4W9TA 4ZQOA 4UTMA 3EKZA 1LOLA 3TFCA 1GQNA 3N3MA 4TU1A 5MHBA 2WNNA 1MXSA 1IIHA 2DZWA 3PM6A 3GAYA 1OHLA 3PBYA 2Z6IA 3G3DA 1F7BA 1GOXA 3HGOA 2FLIA 5L6UA 1AW2A 1HO1A 2FJKA 1RD5A 3WJZA 2X16A 3QMRA 1XUZA 4S2BA 1PIIA 4K38A 3G1YA 4O4WA 3LHYA 3KX6A 5D2TA 3TA6A 1FWTA 5D30A 4S1FA 2B7NA 1JQXA 4O1CA 4O50A 3ATZA 3C52A 4FIRA 4IPJA 1GG0A 1OK6A 1HFBA 4K7YA 5D2VA 5G1TA 3HOJA 3SGUA 1Q45A 3GDMA 3V75A 2NXIA 3TIMA 1ZHAA 3W1LA 1OFRA 1VS1A 1SO4A 4CNNA 2ZTJA 4JXCA 4K8HA 2V8ZA 3W7RA 2A4AA 4O1BA 1Q6QA 3VCRA 3NQ6A 4I7UA 5AFDA 4GUGA 2NUWA 2Q3RA 3STEA 3MYPA 3ABRA 3TH6A 4OT7A 3BVJA 4K37A 1FDYA 4DQWA 3PWAA 2V9DA 3MWAA 3S8HA 4OBTA 4DF2A 2PRHA 1KTNA 3IIOA 4UR7A 2OX1A 1ZALA 1I2OA 1L9WA 3DH7A 1XFBA 4I7VA 4TR9A 4JTKA 2ZZ7A 3NQ8A 2R94A 4FXSA 1R47A 3W1PA 3B03A 1GZGA 3W71A 1WDWA 1B57A 2GVGA 5G4EA 1H7XA 3A9IA 3QM3A 3VFLA 4A21A 1VRDA 3GKAA 3VNDA 2OJPA 3FYOA 4JYFA 2WNZA 1JVNA 2WPBA 3S1WA 1IXQA 5BW6A 4XTDA 3PS7A 4DEFA 3STGA 3THAA 3TQVA 3W7GA 1JCJA 1T96A 1TQJA 3KXQA 4LVAA 3FIGA 3C56A 3CQ0A 3W73A 2YYTA 1FCBA 2GQAA 2J9XA 3M44A 4O52A 3QQ1A 2OT1A 4O0KA 4IXHA 4HT3A 1Q3NA 3W1AA 3L21A 4N6EA 4WX2A 5IBXA 3USBA 4X3ZA 3GR8A 5F4WA 3WJSA 2NUYA 1QPOA 3S6DA 3E49A 2QF7A 4GBUA 4FX8A 3KRZA 3HF3A 1W5PA 1ZAIA 2CFFA 2DORA 3IRDA 3TNOA 4O16A 4FX6M 4DBEA 4CCDA 1OF6A 3UWVA 3B0VC 1G4SA 2Y88A 4EOUA 4NZJA 3MI3A 1FXQA 5F4SA 3C2EA 2CZ5A 1SO6A 4NXSA 2Z1BA 2WV8A 3O6CA 4ALDA 3SGZA 4JEQA 3W2LA 4LS1A 4UXDA 3HBLA 1K8ZA 5D05A 3MW7A 5C2XA 1C8VA 1OFOA 3BW3A 4UTTA 4RKAA 5DN1A 4BFAA 4Z1AA 2JGQA 4ICNA 5D2WA 3IV3A 3ZWTA 5FF3A 1RVGA 4HPXA 4A29A 1DJNA 3UWZA 1W0MA 3NDOA 1BWKA 3A23A 1ZFJA 1JCMP 4YL2A 3CIXA 1O94A 5CPLA 3UWWA 1VQTA 4I7WA 5IM51 1TJPA 2I9EA 4LC6A 2CLLA 2ZA1A 1TYGA 4NX5A 3TFXA 3M41A 1KW1A 5E1QA 5LNWA 4NQ1A 4NNBA 2Y89A 4CCEA 3LBMA 4KWWA 4GUIA 2I1OA 1FWSA 4AHQA 1SSGA 3T4CA 3DGRA 1F05A 2Z0IA 4A2SA 2QCGA 1NSJA 3PR2A 2H8ZA 1HTIA 3FYPA 2YW3A 2NZLA 3A5VA 4JGDA 3MBFA 4C1LA 3W88A 3NPXA 1T99A 1MZHA 2H3DA 4BWLA 2A85A 3GAKA 3QRHA 1YDOA 3W7DA 3NOEA 1KFBA 2X2GA 1QMLA 5I3KA 3RLVA 4UUIA 1F76A 4A22A 1DL3A 1EWEA 2G5WA 1NAL1 4UFHA 4LT9A 2B7PA 1FCVA 4RZ6A 2ISVA 1ZAHA 3NQVA 4BR1A 4G1KA 2ZYFA 1OG0A 1WBHA 1KV8A 2ATSA 3DBPA 3HPSA 3PVFA 1F6PA 1GEQA 2C1HA 3VE9A 3UWUA 4B5NA 3W22A 3T40A 1EIXA 5KMYA 5KSWA 2ZTKA 3HPZA 1VHNA 2NX1A 4DO5A 3A5FA 3LGEA 4HSOA 3IGXA 1K03A 1W56A 3M5YA 2V5BA 3NQEA 5GVJA 2X30A 1S5WA 2QCHA 4P61A 1GT8A 1FCUA 2A7NA 3NQCA 1NVMA 4XKYB 1D3GA 2GJNA 5D02A 5G5IA 1QPRA 5LNVA 3EWUA 4O14A 1GVRA 5CPOA 4ADSA 4WOZA 3P61A 5CZ0A 4N2YA 1IIGA 3W2KA 3QMSA 3L0KA 2R8WA 4MOZA 5KZMA 2TSYA 4O28A 3KVMA 4UFMA 3UPWA 4DXVA 2ABBA 1TQXA 2XN0A 3M16A 5EYWA 3W7EA 1A5SA 4CQ9A 1TCDA 4HNVA 1P0KA 3PBWA 4LNYA 1UUOA 3S5ZA 1KFLA 1O5XA 4Q4KA 3S1XA 3ABOA 3A22A 3W70A 1F73A 2RDUA 3CEUA 5F4XA 5FF0A 2VXNA 2V0TA 3S42A 5H91A 5LHEA 1KM6A 2JKPA 3SSJA 3LHWA 4H3DA 2QJIA 4QM1A 4AWSA 3HG4A 1IXPA 2V81A 3BK0A 4N6FA 2B7OA 4RLIA 2HMCA 3TXVA 4Y9AA 3E9AA 3IIPA 4LVDA 1PV8A 3DKLA 3PUEA 4FO4A 4NU7A 4HNTA 3LRKA 2D73A 3L68A 4JY9A 2ISSA 2DU2A 3C2RA 4O53A 1NF0A 4UTLA 2NV1A 4O4VA 4GRSA 4MYAA 4UTJA 4K6AA 3NM3A 2C15A 3UWQA 4ONVA 3G0SA 2DZPA 5CZTA 3IIZA 2W79A 1GWJA 1LRQA 3W74A 5CPMA 4ZMGA 1UASA 5I3GA 1C29A 1SQ7A 2V2HA 3P62A 5EA9A 3L65A 4WOQA 1FX6A 3BV4A 4HNNA 1EB3A 3W85A 3CTLA 3GDKA 1BEUA 1F74A 4K7VA 5AC6A 2CZDA 1LZOA 1ICPA 1I8JA 4O57A 1W37A 3W76A 1T0OA 3W07A 4E38A 2FDSA 3LTSA 2OMAA 3KRSA 3PB0A 2CW6A 3BG3A 4FIQA 2YGYA 4HNUA 3W9ZA 1E51A 3HO8A 5HR6A 1HUVA 3FFSA 2E6FA 3LCGA 5F2MA 5C54A 2X1UA 2FIQA 2E09A 1YYAA 3P67A 4S2CA 1KTBA 1KM5A 2CLHA 1YADA 2V30A 3EWBX 3NZ1A 3N9RA 4CLMA 1I2NA 1R46A 3PSVA 1QFEA 4UTHA 3G24A 3NL6A 3QPYA 3STFA 3LRLA 4GJ1A 1CW2A 4MKNA 1IGSA 4AB4A 1H5YA 3SFKA 4NUWA 2HSAA 2CLMA 3FS2A 5AC7A 1UJPA 4PFMA 3GXTA 4ML9A 3GVGA 1O4UA 1MEWA 4UIOA 3WFAA 1M7PA 2QUVA 4IXXA 1LYXA 3C4UA 3LXBA 3W2MA 4LUJA 1KM4A 3FOKA 4MLRA 2QCNA 3TSBA 4LWWA 3BGJA 3H53A 3G1DA 1GYLA 1SW7A 3NQDA 2GUUA 4M7TA 3SJ3A 3G1HA 2NXHA 3KHJA 2RH9A 5AYYA 4MVAA 3NQGA 4IMDA 2QDGA 3W1RA 3ANYA 1ICQA 3LCFA 1OX5A 3B05A 2PCQA 2ABAA 2QCDB 4JR5A 4WY0B 2VOMA 1Z48A 3I65A 1TPWA 3B04A 2CLFA 3L5MA 3DFNA 4FNSA 3EWYA 1EWDA 4UC5A 3TUUA 3L5LA 3QFEA 4N9BA 1D3HA 2QUUA 1H60A 2TYSA 2VEPA 3NYZA 1B9BA 1M6JA 3DHFA 1SZGA 3BLFA 3P60A 1ONRA 3P8JA 3S9YA 3NPVA 4N9CA 1AMKA 4PH6A 4WZHA 3U6WA 3O6DA 5C6MA 3LTPA 2AGKA 4EIVA 3M9YA 1FXPA 4X2RA 4QNEA 1V7YA 1K02A 4YCOA 2PURA 4N02A 4ZZ9A 2BWGA 5KZDA 2P0OA 3QW3A 5F2LA 4EWND 1TSIA 2IQTA 2Y7GA 4AF0B 4E2BA 4AAJA 4JYDA 5SWUA 3GYEA 3JS3A 4JTLA 2X1TA 3U8GA 2JK2A 1RQBA 2C6QA 4MY9A 2DZTA 4O17A 4AVFA 5D38A 4Z1BA 1R2TA 1Q6OA 4FNQA 1J4EA 4IMFA 5EBUA 3UY7A 2BSLA 3O15A 5FEPA 1GVOA 2H8XA 4UFLA 4DBDA 2FTPA 1OFQA 2G95A 1SFJA 1A5CA 2H3BA 2A7PA 3NQ7A 3TAKA 3CWOX 2FPVA 5I3IA 2UV8G 2B4GA 1EP1A 4C1KA 1H63A 3DFQA 1G4TA 1KFCA 3NQ2A 5K7JA 4UTIA 1NEYA 1EX5A 4OV9A 2WQPA 4XBSA 4A3UA 4PTNA 1UB3A 1PCKA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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 3UPB A;  3N73 A;  4RR4 A;  2P1F A;  1VGA A;  6TIM A;  1LBL A;  1OX4 A;  1XCF A;  1FUY A;  3O16 A;  3HGS A;  3DZ1 A;  1PS9 A;  3T44 A;  4NNA A;  1KTC A;  3LCL A;  2VFF A;  1K8X A;  1H7P A;  2EHH A;  3TR2 A;  1TPH 1;  3G1A A;  3OVP A;  2FQI A;  1QR7 A;  1TPV A;  3P8I A;  3IIX A;  3OVR A;  4O54 A;  1DVJ A;  2H90 A;  3NQM A;  3HG5 A;  5EMU A;  1OK4 A;  4MUZ A;  4MY8 A;  4NVT A;  1XKY A;  4Q32 A;  4OE7 A;  3OG3 A;  3TML A;  1G7U A;  2YDA A;  3TJX A;  2E1D A;  3ABQ A;  1KM2 A;  4XTI A;  3FLU A;  5U4N A;  1EUA A;  1RZM A;  1GG1 A;  2ZRY A;  2ISW A;  4P2V A;  4IGH A;  5AYZ A;  3MI6 A;  5HNR A;  1JRB A;  2WJZ A;  2DZV A;  2VC6 A;  1K3U A;  2NUX A;  4AWU A;  1OX6 A;  4JTG A;  3W83 A;  1TPU A;  1I4N A;  2CZF A;  3LXA A;  4JIP A;  5K3V A;  4KFO A;  3KVK A;  4QIU A;  2J24 A;  3NPU A;  1DV7 A;  2PC4 A;  2GOU A;  1KLZ A;  1IF2 A;  3I6R A;  1ICS A;  1GYN A;  1AL8 A;  4WY0 A;  3LDV A;  3EX6 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2E6Y A;  2X1R A;  2PLC A;  1W9D M;  3O3R A;  1DJX A;  1PO9 A;  1PHW A;  3T4W A;  3C0Q A;  3ZJ8 A;  1UIO A;  3B97 A;  3RRX A;  3NL2 A;  4R7W A;  4X0V A;  2PDF A;  1J6O A;  2C16 A;  1SR9 A;  4RDV A;  1EDG A;  3V3W A;  1EUN A;  3N2X A;  1WE5 A;  4ZA0 A;  2YZR A;  1NP2 A;  2F6U A;  3A13 A;  2PB1 A;  2ALR A;  2QJG A;  3IUD A;  3O0K A;  1IYX A;  4YMZ A;  1H4P A;  5BXP A;  4E8D A;  2Y5J A;  1CWY A;  2VEM A;  4QTG A;  3Q58 A;  3OIH A;  3HB9 A;  4XZ9 A;  3WNN A;  4F2B A;  5EY5 A;  3TR9 A;  4RNI A;  3DDM A;  3CC1 A;  1TRI A;  2ONE A;  1UP3 A;  4JDY A;  4UCG A;  1FRB A;  3K8L A;  3L5A A;  2JQX A;  5C0Q A;  1TE6 A;  5CSR A;  4JYE A;  3W7P A;  4RE2 A;  1SR0 A;  4NF7 A;  2VQU A;  3QV8 A;  5D2Y A;  4EF9 A;  5TQL A;  3SM0 A;  4Q4M A;  3FEM A;  3TV8 A;  1JPM A;  3T05 A;  5K9D A;  2DT3 A;  4Z0J A;  3LA4 A;  3OZO A;  1A5M C;  5M1T A;  3HN3 A;  4R53 A;  1IR2 A;  1NOF A;  3TN3 A;  4ZTX A;  2Y0F A;  3RLH A;  3BG5 A;  3TYE A;  5GJM A;  2CLP A;  2CBI A;  1FH7 A;  1W9V A;  4HK7 A;  3CL8 A;  1O5Q A;  4R34 A;  1EOM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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