4X9SA

Crystal structure of hisap from streptomyces sp. mg1
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
VNKLELLPAVDVRDGQAVRLVHGVSGSETSYGSPLEAALAWQASGAEWLHLVDLDAAFGTGDNRALVAEITGAMDIKVELSGGIRDDASLAAALATGCTRVNLGTAALETPEWAAKAIAEHGDRIAVGLDVRGTTLKGRGWTSEGGDLYETLARLDSEGCARYVVTDIGKDGTLTGPNLELLKNVCAATDRPVVASGGISSLEDLRALAALVPQGVEGAIVGKALYAKAFTLEEALKVVSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Co-occurrence of analogous enzymes determines evolution of a novel ( beta alpha )8-isomerase sub-family after non-conserved mutations in flexible loop.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phosphoribosyl isomerase A
molecule tags Isomerase
source organism Streptomyces sp. mg1
total genus 90
structure length 241
sequence length 241
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4x9sA00
2NZLA 5HWJA 1MEIA 2HS8A 3W23A 2WQPA 1TRDA 1TPEA 4JEQA 3THQA 3E49A 4N9EA 4NXSA 3PR2A 3IEBA 3TU9A 3RK8A 3W7EA 4WJEA 3LOTA 4JYFA 3C56A 4XKYA 2Y85A 3LM7A 2DJLA 3QZEA 2A4AA 4UNLA 4O4WA 3HF3A 2Y88A 1F5ZA 2JKPA 1VQTA 1ZFJA 4O12A 4MUZA 4GUFA 2G5WA 3LXCA 3LHYA 4MVAA 1X6UA 2QAPA 1QMLA 1GOXA 3NQ8A 2WOQA 1KTCA 4O8RA 5F2GA 3KRUA 3M0ZA 2PRLA 3RNDA 2P1FA 2H8ZA 1KM6A 3OIXA 3ZFHA 3PB0A 4MZ1A 4KWWA 3DU0A 3HOJA 4YWIA 1I2QA 2V0TA 4DF2A 3UWZA 4KWVA 4CCDA 3FEMA 3M1ZA 1F74A 4M6QA 2YCEA 3W73A 3W2JA 4JD4A 3STEA 3DFNA 3NVTA 3NNTA 3I7RA 3IVSA 1QFEA 3TW6A 4NVTA 4ZQPA 3S5ZA 1H7WA 1T8XA 4O13A 1F05A 3B05A 3PUDA 1LM1A 3G3DA 2NXIA 1FUYA 3Q2DA 3W1PA 1KM4A 3W1UA 3INPA 2PRMA 3W83A 3KVKA 2VFIA 2HMCA 4G1KA 1SZNA 2VXNA 4A2RA 2A6NA 1OFBA 4O18A 4UTJA 2A6LA 1RPXA 4HSOA 2NV2A 2WNQA 3TCEA 1QO5A 2PRHA 1OABA 4QSHA 5HNRA 5DN1A 3TDFA 2JKEA 4KKXA 1BWKA 3TSMA 3TC7A 5HMSA 3KFTA 3DFOA 1P0KA 2V30A 3IIPA 1Z41A 5F4WA 1EP2A 4JICA 1TYGA 4HNTA 3DFTA 2ZRWA 3QMSA 2DU2A 2ZDRA 3W1QA 1LRTA 5K4XA 1D3GA 3USBA 2EKCA 1K7FA 4ZMGA 1OX4B 2QDGA 3B8DA 2OJPA 1M6JA 1EIXA 2RKXA 3VE9A 3W2KA 5CSRA 3GNNA 3NDOA 4YCPA 1GYNA 2ZRVA 1F73A 1VLWA 1A5BA 3C8FA 1H51A 4NNBA 3A22A 1WDWA 4JTJA 3NQCA 4YL2A 1JUBA 1ML1A 2ISSA 4IX2A 3P62A 3M9YA 5KMYA 4CQ9A 2X1UA 4WD0A 1MEWA 2C16A 3TH6A 5FF4A 3C3NA 2VFFA 2QCCA 1K02A 4JX5A 4UNKA 2A7RA 4UCGA 3QQ0A 1H7PA 4JNMA 4L4LA 3OVRA 4O16A 3TX9A 3NQGA 3UQNA 5AC6A 5DXYA 4FX6M 2CZDA 3KRSA 5EA9A 4AWSA 2QCFA 3BG3A 1AL7A 3V1PA 2B7OA 3TSBA 4UIOA 3W7PA 3NM1A 3TFCA 3NGJA 2E68A 4HIBA 1QR7A 1HG3A 3STFA 2ZA1A 3LLDA 1GJPA 3PC0A 1DORA 3HB9A 4QM1A 4WXYA 4AAJA 3GXNA 3ABRA 3FKKA 1TB3A 2TRSA 1FXPA 3G1VA 3QPYA 3LHVA 2X2GA 5IM51 1ZAHA 3WJWA 1JCNA 5FF0A 2ZZ5A 4ZQCA 3W7RA 1EB3A 5CSSA 5CGQA 4Z1BA 1JUEA 1JCJA 1WBHA 4TIMA 1ZCOA 3G1AA 3W3OA 1GVOA 1S5TA 1DKWA 4NT0A 4EWND 3G0SA 2GVLA 1CI1A 5FI8A 1JR1A 2CZ5A 3H55A 2YDAA 4O1AA 8TIMA 3BO9A 2J27A 3NPWA 3PBUA 2R14A 1Z42A 1F2JA 2NXGA 3DFPA 5CG7A 3BGGA 1KA9F 3STCA 3P5YA 3LTYA 3W07A 1UUOA 3CLMA 3NL6A 2J9YA 4JY9A 3A24A 2BLEA 1ZAIA 3HG3A 4GJ1A 1SZFA 4IX0A 1W3IA 1I2RA 2QCGA 1WV2A 3C2VA 4WOZA 2ZZ4A 1XBXA 1DQWA 2H3BA 3DAQA 4JTUA 3G22A 4IXXA 4O4VA 3GDTA 2KZHA 3W2MA 5ABTA 4HN4A 1RQBA 1G7UA 4UXDA 2C15A 4BI6A 3SW6A 5BMWA 4N02A 3S6DA 3UWWA 2R8WA 4QJ1A 3G3MA 1HUVA 1LOQA 2NLIA 3BPWA 3W1NA 4E38A 4UTWC 1NEYA 1OK4A 4OE7A 3Q58A 4ZVJA 2G96A 5EY5A 3P82A 2JBMA 4N2YA 1RV8A 4LS2A 1G4PA 2Y62A 1SU5A 5CZSA 2J9ZA 3QMRA 5BW6A 3VKJA 3GKFA 2VELA 2QJIA 3FLUA 4ALDA 3QEZA 2QCMA 3G1FA 3TMLA 4PFMA 1LCOA 2QAFA 1QAPA 3UY7A 1DV7A 1PHQA 4FXSA 2BX7A 3F4WA 4RZ4A 4DBEA 5L9FA 5D38A 4UTHA 4NX5A 3MHGA 3TUUA 3EWUA 2FFCA 2ZRZA 4JTGA 1TQXA 4N9BA 3O07A 1OX5A 1WOBA 1H50A 5AC7A 4GUHA 4UUIA 5D03A 2RDWA 1BWLA 4IPIA 4FB7A 5HUOA 3Q94A 1JUKA 5F2MA 2NX9A 4YLWA 4IWWA 1LDCA 1H5YA 2ZRUA 2YR1A 1EP1A 1T99A 1W5NA 2AAMA 4UMCA 3F03K 1O5KA 3C52A 3MP4A 1N7KA 1W31A 3GKAA 3LHZA 3W87A 3I68A 3CT7A 5KTLA 3TQKA 2BWGA 4OBTA 2DZTA 4JS3A 4AF0B 5F4SA 3NYZA 1ZY9A 3ZR4A 3NPVA 3EX3A 5LKYA 2FPTA 1JJKA 2TSYA 4Q32A 1PCWA 5TQLA 2Y89A 3L65A 1FCBA 1JRCA 1SW0A 2QUTA 1FDJA 3W7KA 2W6RA 1QOPA 3BW4A 3ABSA 4DELA 4UTIA 4Z1CA 1ME9A 5L6UA 3VFLA 1IGSA 3SZ8A 4X9SA 4UMAA 3KOFA 3QRHA 4A2SA 4S2CA 3NR0A 1TIMA 1JCYA 4ZZ9A 1PV8A 2X30A 2CLFA 1GZGA 1YDNA 2ZA2A 2R94A 4QISA 2QJHA 3U8GA 1QPOA 3GAKA 2NXHA 3L9CA 4NU7A 3NOEA 1OHLA 3LCGA 3NL3A 2LLEA 4Z08A 4TO8A 5D04C 1K3UA 4UR7A 3LTPA 1UBSA 1GVQA 3I6RA 1ZJIA 1XUZA 3PUEA 1CX9A 1TMHA 1ZALA 3C0JA 1FXQA 3WK2A 1NFBA 2FLIA 1GPWA 3M6YA 2C19A 3SY5A 3BLFA 1OX4A 1XKYA 1OYBA 2QUUA 1W5QA 5AHLA 3QW4B 4FXRA 2C14A 3QSRA 2VEMA 1SFJA 4JYDA 4QIUA 1DOSA 1YXDA 4MYXA 4YMZA 3YPIA 3DH7A 1F6KA 1QOQA 4IMCA 1FWNA 2F7FA 3IGXA 1FX6A 4PA8A 4ORMA 3I65A 3N2MA 1AL8A 1W3TA 3LB0A 3HJZA 2FJKA 2YW3A 4NJJA 3WK0A 3GLCA 4FNRA 1ALDA 1VJIA 4LVDA 1Q3NA 3PAJA 4K8HA 4MZ8A 3NQDA 3NZRA 5AN7A 2ZRXA 1FDYA 3Q37A 4NX0A 4O53A 4Z0JA 3FYOA 3W86A 4IJBA 4JX6A 3TAKA 1U5JA 2VOMA 3C6CA 2ISVA 3L67A 2O7QA 3L5AA 4OV9A 1KFEA 4IMFA 3TKFA 5LGZA 4LC8A 1PCKA 1PVNA 4DO5A 2FQIA 1OYCA 4BFAA 4PTNA 3W85A 5I3KA 3W1AA 4C1KA 3A9IA 1F7BA 1SW3A 3LI1A 1XBYA 4O17A 2BXVA 3L68A 3SGZA 4GWEA 4FNSA 2PC4A 3I7SA 4BF9A 1ZHAA 3W7JA 2EAWA 4M7TA 4QITA 3M41A 3L21A 4CLMA 4D2JA 3NQ7A 3EB2A 2YPIA 5K9XA 3GR8A 5EPDA 1WOAA 1SFLA 1BKSA 4O0ZA 1G4EA 2E77A 3W7MA 2OT1A 2YZRA 5LNVA 4O52A 2AGKA 1KLZA 1OFEA 3UXAA 4PL2A 4Y8FA 4DBDA 4WY0B 1KV5A 2YFNA 4TU1A 2ZZ2A 3S5OA 2C18A 5F2IA 1OFAA 3P7YA 1DQXA 1K8ZA 5D37A 2GQAA 2BTMA 3GZ3A 2VEIA 2Z2UA 1HO1A 1LP6A 4A29A 3UPBA 3M16A 1LZOA 2EHHA 3NQVA 1Q6QA 2J24A 1OJXA 1R30A 1M7PA 1VCGA 2PE4A 3LCXA 3HPZA 4LOCA 1D9EA 5EBUA 4WOQA 3B0PA 5D2WA 5AYYA 3PG9A 3HQ1A 2XN1A 2TYSA 3N19B 4OWGA 3TROA 5LHFA 2QCDB 3E96A 3JS3A 3C2RA 5HQEA 5I3HA 1O94A 3M5ZA 1V7YA 4MY9A 1MZHA 5HWNA 2WSRA 2ZBTA 4DPQA 5I3FA 2DJXA 4IQLA 1PIIA 1SUXA 1O4UA 1VR6A 4N6EA 4E0CA 2X1SA 5F4XA 2G95A 3FIGA 3L66A 4BI5A 2DORA 5G1YA 2B7NA 2X16A 3O05A 3MP5A 3MUXA 5AYZA 5K4ZA 2JGYA 2BSLA 3OVQA 3WJXA 4XZ9A 3P80A 3IGSA 5U7SA 3TQ0A 1HTIA 1H7OA 4J9JA 1SR9A 4JTTA 5TBOA 3AO0A 1KTBA 3DZ1A 3PY2A 1A50A 1A5CA 3FJ6A 4NUWA 4U28A 3G1SA 4QQ3A 1EP3A 3HG2A 3MO7A 4XBKA 5CPNA 3PG8A 3C4UA 2NWSA 1KBJA 4UTUA 5CZTA 1KFJA 1TTQA 3F1QA 1YXCA 4JXCA 3T44A 3N3MA 1FQ0A 1MO0A 1GEQA 1ICQA 3LDVA 3TXZA 3DFQA 3EWXA 5D30A 2GVGA 3RLUA 3NQ2A 4IMGA 1TPWA 3GK0A 5LZLA 3ANYA 3W2UA 3OG3A 1B57A 1K7EA 3WFAA 1VCVA 4FNUA 1TPDA 3L5MA 1YPFA 1A53A 2E6DA 4HNVA 2J6XA 1J2WA 1W3NA 1X7FA 3T78A 4LW7A 5D2XA 3HGRA 2Y70A 2JGQA 3UZJA 2E6YA 5G2IA 4UTTA 2AQWA 1J4EA 4R53A 3VE7A 2HSAA 2OMAA 4PL1A 2GPTA 4JTEA 3W7QA 3UWVA 2DZVA 4AB4A 5D2YA 3R2GA 4ZL1A 3W7GA 4K37A 5FEWA 1H7XA 3AJXA 3S1UA 1YPIA 3A23A 4BK9A 4I7UA 1BTMA 1ZAJA 3LHWA 4RKAA 2CLEA 4FEZA 5MHBA 1OFOA 1NF7A 4LRSA 1H1ZA 3PB2A 4Q4KA 3TR2A 1KM0A 3MI3A 2YYUA 3QF0A 5DCDA 4RK8A 4OV4A 5G5IA 1X1OA 2GQ8A 2C0AA 5C5YA 3DENA 4JIPA 1NSJA 2FPVA 4FO4A 5E0KA 3PULA 3QMTA 1K8XA 1P1XA 3G0XA 3PS7A 3KRZA 3W74A 1XDMA 4L4MA 3NL2A 4Y6GA 3WK3A 4OT7A 4LVBA 3B03A 5I3IA 2VFHA 4IGHA 2W0UA 1W56A 3EX2A 4CQ8A 3NO5A 4DPPA 1UCWA 3ZWTA 4OGZA 3BVJA 3HO8A 1L6SA 4AWUA 1VS1A 1B3OA 2DZSA 4LWWA 1NVMA 4GUGA 4RR4A 3B06A 3W7CA 2VEPA 3R13A 3U6WA 4LU0A 4K6AA 3WJSA 1KM2A 4KFOA 1GWJA 4MJZA 1VPXA 4BR1A 1E51A 5KZEA 3IIXA 2WSYA 4TR9A 2CWNA 1MSSA 3W1TA 4FIQA 4RZ5A 3T4CA 4MY1A 1I2NA 3W7DA 2QCNA 4EF8A 3U2OA 3PBWA 1ADOA 3QW3A 4XUGA 1QPRA 1T0OA 2QR6A 2FTPA 4GFSA 3P5ZA 4NJHA 5DCEA 2E5BA 2WNNA 2QUVA 1SW7A 3G0UA 4UTLA 1L2UA 4DO6A 4HT3A 3EXSA 5DY3A 2YW4A 4DEFA 4UC5A 3GB6A 3LXAA 1R2RA 1GYLA 3NQEA 2A21A 4NJIA 5BRBA 4IOTA 3EXRA 4AWTA 5K9DA 1TPB1 1KM1A 3CB8A 1SZEA 1PHWA 2Z6JA 5I3GA 5KITA 1C8VA 3PF3A 4NNAA 3F4NA 4NZJA 2WNZA 1WA3A 5H91A 3N14A 3NQFA 4M19A 3WJYA 3FYPA 2IQTA 3T40A 1IXNA 4JTKA 4I7VA 4Z1AA 1OG0A 4ZQOA 2I1OA 3TK7A 3IIOA 2E6AA 2GQ9A 3GDLA 3FOKA 5CZ0A 3M7WA 4O14A 2J88A 4MKNA 4RV8A 3W72A 2RDTA 2HS6A 4A3UA 1EA0A 1NF0A 2RH9A 2DZPA 4MYAA 1KFLA 4YCOA 1XBZA 1W54A 1QDSA 3GDMA 2H90A 3QQ1A 2QKFA 2H3DA 2Q3RA 2R91A 3ABOA 4X22A 2RFGA 2QEZA 2VC6A 4NXKA 1HFBA 2ZZ7A 3ZWSA 4XTIA 1M5WA 2CLOA 1GG0A 3W2NA 3TA6A 3UZ5A 1P4CA 1Q45A 3NQAA 3LV6A 1U83A 4WZHA 1OX6A 3MWAA 4WY0F 2NV1A 4MLRA 4ADUA 2VFEA 1TV8A 3BV4A 3KX6A 3W1LA 1DJQA 3DHDA 5DELA 3TSDA 1S3HA 5J5RA 2Y61A 1SZGA 1S5VA 3JRKA 1R2TA 4ZQNA 1JVNA 1OK6A 3RU6A 1OF6A 5DBUA 5FF3A 2V2DA 1RQEA 1FWRA 4JY8A 1N8FA 2QF7A 4UFIA 2P0OA 1SO4A 1UJPA 4O15A 2QCDA 4RCXA 4Z0SA 5K3VA 2CW6A 1SQ7A 1J5TA 4CCCA 1XFBA 2BZNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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