4XTDA

Structure of the covalent intermediate e-xmp* of the imp dehydrogenase of ashbya gossypii
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
408
structure length
377
Chain Sequence
TYRDAATALEHLATYAEKDGLSVEQLMGGLTYNDFLVLPGKIDFPSSEVVLSSRLTKKITLNAPFVSSPMDTVTEADMAIHMALLGGIGIIHHNCTAEEQAEMVRRVKKYENPLASKSADTKQLLCGAAIGTIDADRQRLAMLVEAGLDVVVLDSSQGNSVFQINMIKWIKETFPDLQVIAGNVVTREQAASLIHAGADGLRIGMGSGSICITQEVMACGRPQGTAVYNVTQFANQFGVPCIADGGVQNIGHITKAIALGASTVMMGGMLAGTTESPGEYFFRGKRLKTYRGMGSIDAMQKLVAQGVTGSVIDKGSIKKYIPYLYNGLQHSCQDIGVRSLVEFREKVDSGSVRFEFRTPSAQLEGGVHNLHSYERLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Ashbya gossypii (strain atcc 10895 / cbs 109.51 / fgsc 9923 / nrrl y-1056)
publication title Increased riboflavin production by manipulation of inosine 5'-monophosphate dehydrogenase in Ashbya gossypii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase,Inosine-5'-monophosph
total genus 122
structure length 377
sequence length 408
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2015-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4xtdA00
4HNNA 2A2IA 3BG9A 5A5WA 4BI5A 1TPVA 3UWVA 4UR8A 3GAYA 3NQVA 3O15A 4GUHA 2ABAA 1TTJA 4UTUA 1GT8A 3PSVA 3W7IA 3W76A 3W84A 4YCPA 1VHNA 2QJIA 3RLVA 5E93A 3VE7A 1D9EA 4NVTA 1XBVA 2GPTA 2Y89A 4MKNA 4HT3A 1H62A 2QAFA 2X1UA 3W7CA 1UCWA 3VCRA 5H2ZA 3ATZA 3R8RA 3W6YA 2OMAA 4O16A 1QCWA 5EBUA 1TV7A 1IIGA 1G7VA 1JRBA 3M6YA 1CX9A 1XBXA 1TRDA 2VOMA 2NUYA 5D2WA 2ZRZA 3W7DA 2E6DA 2A7RA 3FKRA 2C6QA 1VYSX 3W87A 1M7OA 4RZ6A 3PVFA 5I3IA 1SSDA 4EVZA 4UTLA 3NG3A 1VR6A 1G4PA 5LZLA 4MZ1A 4GUFA 4PTNA 3UXAA 3BK0A 3NDOA 5G1YA 4DBEA 1N55A 3TSDA 3TFCA 4OV4A 1ZCOA 2OZ0A 4JTLA 1JVNA 2G96A 1W3TA 3DFPA 3F4WA 2VEMA 4M6PA 3SW6A 5AOUA 5F2GA 3IVUA 3S5YA 3MO7A 4MZ8A 5FI8A 3W73A 2ZRXA 2ZYFA 4H3DA 3C2EA 4NNAA 1L9WA 5AHNA 3NZ1A 3MHGA 1XBZA 4LUIA 1W5PA 2ZRYA 2Y7DA 4IPIA 4Q4KA 3ABQA 2C14A 4NUWA 1RZMA 1B4KA 1WA3A 3NL5A 1S5VA 3DH7A 3MW7A 5T26A 3G8EA 3DZ1A 2AAMA 3C2VA 4YMZA 1LROA 3HG4A 2ISVA 5FF4A 4LS1A 2Y7FA 5F4SA 1QOQA 2I14A 3TQ0A 3I7RA 4KFNA 4A21A 2Z0IA 2ZRUA 4TMBA 3S5OA 4RX0A 3KX6A 3EX6A 2QAPA 3WJWA 3G24A 1MEHA 4BI6A 4WY0A 4UXDA 2NWRA 4QISA 1GVRA 1KA9F 3W88A 1OFEA 4ZVJA 5FEPA 2VEIA 2NWSA 3UWQA 1MZHA 2AQWA 1X7FA 2RDTA 5AHFA 1SW7A 2PE4A 5AC7A 2ZBTA 5FF3A 3NM1A 4AB4A 3QC3A 1KM5A 3TAKA 2DJXA 3MI3A 3C6CA 2FQIA 3HPXA 1XCFA 2ZDRA 1QO2A 1Z41A 4MFEA 4QQ3A 4LS2A 3PR2A 5BRBA 1WXJA 1TJPA 3W1PA 5AHLA 3RF9A 4MLJA 4K38A 3P5ZA 3SSJA 4O53A 4JEQA 3CEPA 5CZTA 2OT1A 2YR1A 1G4SA 2HSAA 3I7SA 4N2YA 3HB9A 3BW3A 3E49A 2X2GA 2R8WA 3BO9A 3WFAA 1YTEA 1GJPA 4O54A 4FEZA 2Y6ZA 3PSWA 3W3OA 1K02A 4FO4A 4N9DA 5EY5A 3I65A 2CU0A 3LRKA 1O95A 4Z0SA 5K7JA 1I2QA 2YW3A 3LRMA 4JNMA 2NZLA 1JR1A 5KINA 2KZHA 2DP3A 1EP1A 2FLIA 2DU2A 2GJNA 3ELFA 3L65A 1BEUA 1TPWA 1ZJIA 5DN1A 2TMDA 4NJKA 1SZGA 5F1VA 3W2LA 5D02A 2A1YA 1YTKA 3G1DA 4QIUA 1CI1A 4TIMA 1ZAHA 1SZFA 1SW0A 4XKYA 1JCYA 4H4IA 3PS7A 3HF3A 3CB8A 3P5YA 4DPPA 5HJLA 2ZA1A 4CNPA 1B57A 3P61A 5AHMA 4YWIA 4TU1A 2FPTA 3LTYA 2C13A 3FKKA 3GB6A 2E6FA 1OX4A 4MLRA 5FF0A 3DENA 1KLYA 4W9TA 2DJLA 3GXTA 3PUDA 1Z42A 2DORA 4LVBA 4WD0A 4UMAA 1FWNA 5KSWA 3C52A 1T96A 3S6DA 4UMCA 3BG5A 3UQNA 1W3NA 4ONVA 3EX2A 4RV8A 1OYBA 2H8ZA 5BNKA 1YPIA 1EP2A 3HOJA 4IOTA 3HQ1A 1KM4A 3H55A 4Z1CA 3L5LA 1JJKA 1PE1A 3BGGA 2C16A 4JIQA 3ZFHA 1YLVA 1LOSA 1P0NA 5HMSA 1EWDA 4NNCA 1O5XA 1KV5A 4O0ZA 2E1DA 2Y63A 4OT7A 3FYPA 1OFBA 2NV1A 3M43A 1F74A 4S2BA 3W1LA 4E2BA 5AB3A 1R46A 5U7SA 3K30A 3UY7A 3WJXA 2IQTA 4RR4A 2X1RA 3QMRA 1I2PA 3L9CA 3UWZA 2NXGA 3NL6A 4AWUA 3NA8A 4RJEA 2P1FA 1DOSA 1QNVA 4NJHA 3NPVA 4JR5A 4ZQPA 3S5ZA 4CCDA 1FDZA 3GR8A 3LV6A 1DQXA 2Y70A 3M44A 4ORIA 3FJ6A 2BXVA 4CLMA 4NJJA 2EHHA 3WJYA 4LVGA 4BI7A 3GDMA 3RMJA 1GZGA 2YZRA 2CZ5A 1B9BA 4Y8FA 4KFOA 3TA6A 5G2HA 4JY9A 4WQ6A 3W07A 1X6UA 2VFDA 2DZTA 3GXNA 1MSSA 3B0PA 5HR7A 3NQ8A 3W7HA 4NU7A 5F1UA 1R2SA 5LNVA 3O06A 4FIRA 1WDWA 4UFJA 5I3FA 5KZEA 3TIMA 3BARA 3PM6A 4IWWA 4PH6A 3N34A 3RK8A 3A23A 4HSOA 1H7RA 4GC4A 1PIIA 3T40A 5F2LA 1P0KA 2ZA3A 4ICNA 1SU5A 3L0KA 3LXAA 2XFWA 3F1QA 5DCDA 1I2RA 2H3DA 3GVGA 4M6QA 3DFTA 3DKJA 1O60A 5FESA 1JQXA 1S3HA 2QCDB 1CW2A 3BPWA 2XN1A 3W7KA 2V82A 2QUTA 3I6RA 2J24A 4WXZA 5HR6A 5G2WA 1XFBA 1Z44A 1W54A 4EF9A 3B8DA 4O57A 3STFA 1U83A 4KKXA 4IGHA 3O1NA 2ZZ7A 3TR2A 4DQWA 3TMQA 3INPA 1DV7A 3IRDA 4LS0A 4M19A 5ABTA 1K8ZA 2XN0A 2WNQA 4JS3A 4JXCA 1YDVA 1DORA 1K8YA 1W5MA 2J88A 2ZCGA 2YPIA 3M7WA 1IF2A 3EX1A 3W70A 4JTHA 5F4WA 3NQ2A 2BLEA 3BLFA 3ZS4A 1FUYA 3TW6A 1M6JA 1VCGA 3O6YX 3NNTA 4GNJA 1JUBA 1WYIA 5C55A 2V30A 4JIPA 4L4LA 1NF0A 3LI1A 2D73A 1P5BA 1LRNA 3WK2A 1H7NA 1AL8A 5MHBA 1ONRA 4N6FA 3LHTA 3UYCA 4UTTC 4R34A 3VE9A 1WOAA 1QPNA 3S42A 3M5VA 5AN7A 4N4QA 4FF7A 4UNKA 3TQKA 3TQVA 3T7VA 4OV9A 3GR7A 2TRSA 2YSWA 2P0OA 3LCFA 3W23A 4TO8A 2H6RA 1F6PA 4R53A 4DO6A 1W56A 3HGOA 3PG8A 4NZJA 2R94A 2Z6IA 3Q94A 3B4UA 1H1ZA 1OF6A 2OJPA 3PB0A 4I9AA 1HUVA 3QZEA 1GVQA 3QF0A 4YCOA 1O94A 4AF0B 4FB7A 4PC8A 3JRKA 5EYWA 3T44A 4BR1A 1FDJA 4RXGA 4QNWA 3GNNA 4O1DA 1DJNA 4JTTA 5LSMA 3UWUA 3QRHA 5D04C 1JCNA 3TC6A 4I7WA 1JCXA 3PULA 3NQFA 1C9DA 4MUZA 4UTMA 3SECA 2XN2A 2RDWA 2OCZA 3CIWA 3EXRA 3GLCA 2V2DA 3MBFA 1H50A 5K9XA 3S8HA 1EX5A 4ZQNA 3R13A 4N6EA 4R33A 1KM6A 5AHIA 2QCHA 2YFNA 4OGZA 4NX0A 4MJMA 5EKYA 1F73A 2FIQA 4IMGA 4C1KA 2WKJA 1LP6A 4GUGA 3G0SA 3LCIA 2JGQA 4O28A 5I3JA 3W71A 3W9ZA 5K4XA 1LZOA 3S9YA 3CM4A 1WBJA 1IXOA 1H60A 4WOZA 1TRIA 4O4VA 4AWSA 3NVTA 1V7YA 3G0XA 1G4EA 3W7GA 5D2TA 2H90A 3GK0A 4MY8A 3O05A 4K36A 5DY3A 4NQ1A 4RKAA 2CLKA 4E0CA 3TJXA 5DBUA 5J5DA 3HG2A 5LHEA 3FJLA 3KHJA 2QEZA 4XQ6A 1G4TA 4EWND 4D2JA 2NUXA 2GVGA 2A4AA 1RD5A 3RU6A 3EKZA 3IIZA 4Z08A 4ADUA 2EKCA 2DZWA 1LBMA 3IGXA 5FEXA 2JKPA 4K37A 3LRLA 2TPSA 3LTPA 4LVFA 3PB2A 4HPXA 3ATYA 4MPQA 4X2RA 4O8RA 1OFOA 3VFLA 4CQAA 3LHZA 5BMXA 4XKYB 4OQVA 3LCWA 2A6LA 4LNYA 4FNSA 3PUEA 3A9IA 1DL3A 3KVLA 1LRQA 3W1XA 3GDLA 2ISWA 4TMCA 1GVFA 1ML1A 4JTSA 1FBAA 4Z1BA 3AO0A 3B06A 1OX4B 7TIMA 1R2RA 1ME7A 5CZJA 3ABSA 1X1ZA 3DHFA 4MY9A 2GVLA 4JDBA 4JX6A 5BW6A 4HPJA 4Y96A 4C1LA 3HIJA 3NR0A 4MIMA 3HMJG 1YADA 5L9FA 3MP5A 1SO6A 3UWWA 3P67A 1IXNA 4OE7A 2ABBA 4A2SA 1TYGA 2BX7A 5SWUA 3OVPA 4IMCA 3NAVA 4PODA 4O11A 1KFJA 3QW4B 5DY2A 2Y62A 4MYXA 1UBSA 2B7OA 2F84A 1SFJA 3W7RA 2QJHA 1UUMA 3DXIA 5H91A 3U2OA 2R91A 3C0JA 2PRHA 4DO4A 1F76A 4HNVA 3BW2A 4BWLA 2ALDA 1EA0A 2R14A 3W72A 2B7QA 5E1QA 3R89A 1OFRA 4QSHA 5D32A 4R7JA 1H61A 5I3HA 3L66A 3TFXA 2A21A 4IX0A 3A21A 5HUOA 4X9SA 4FXSA 1DKWA 1QO5A 4A29A 1YPFA 2RH9A 1VC4A 3HO8A 3TXVA 3O6DA 4NJIA 2E77A 5DCEA 1G6CA 1FCVA 1OFQA 3EWUA 1LOQA 3CIXA 2GQ8A 3DFNA 2EF9A 2J27A 2QF7A 1ME8A 3NO5A 1AMKA 4IMFA 2BZNA 2FFCA 2GVJA 4ADSA 1EUNA 3S0CA 1LCOA 1MO0A 4UTTA 1QFEA 4L4MA 5D03A 5DBTA 5J5RA 3QFEA 3CQ0A 5TIMA 1XL9A 4E38A 1TPEA 1TMHA 1A5AA 4POCA 2VEPA 1THFD 4GUIA 3LHUA 2QR6A 5HINA 3C3NA 3SY5A 1Q6LA 5AYXA 1OYCA 2ZZ5A 1H1YA 2PURA 4WJEA 3HGSA 2E5CA 1ICQA 3CT7A 1T99A 4M7TA 3E02A 3LHVA 1J5TA 2GJLA 1C29A 3KXQA 3GDTA 1ZAJA 3DGRA 3CTLA 2JKEA 3UWYA 3C2OA 4S1FA 1I2NA 4O1CA 1ZY9A 1NSJA 3L0NA 3PAJA 3H53A 2HTMA 3Q58A 5EL1A 2V81A 3OG3A 4UIOA 2BSLA 3TNOA 3LXCA 1GPWA 5C54A 3M1ZA 2ZRWA 1AW1A 3Q2DA 5KZMA 2CLMA 2Y7GA 3EX3A 3S1UA 4A3UA 4UTJA 1UB3A 5CGQA 1UASA 5F2IA 5KITA 2ATMA 1PHWA 3NPWA 2A7NA 2CZEA 3TX9A 1VH7A 5AC6A 8TIMA 1TQXA 2Q3RA 3TJLA 3U6WA 2VFGA 3HPSA 1A5CA 4XTDA 3RFAA 1Q6OA 2QUUA 4RLIA 5LNUA 4XWUA 1OYAA 3FOKA 4JX5A 3EEGA 2EGZA 1E51A 1OK6A 2C0AA 5D33A 1WV2A 2JKAA 2QCCA 2FJKA 1VZWA 4DELA 1TCDA 1VRDA 3RLUA 2PC4A 3LERA 4JTGA 3A24A 2ZFAA 2UV8G 3NXFA 4WUIA 2TSYA 2ZTKA 2E68A 1TQJA 1B4EA 5LHFA 1W5QA 3QMSA 4ZQMA 5FEZA 1BTMA 3DBPA 3O8AA 1DBTA 1LOLA 2ZZ4A 4O15A 4MZYA 1NAL1 3N3MA 4K39A 1NF7A 1T8XA 4AXKA 2O7SA 1WBHA 3W2NA 1TPDA 2X1SA 1K7XA 1FCUA 3FIGA 1ZAIA 3OVRA 3LHYA 2FDSA 1VGAA 4XZ9A 3KVJA 2VFHA 2EAWA 3W83A 3M41A 4FX7A 2CZDA 4CNOA 2DZXA 1SUXA 2F7FA 1LDCA 3GYEA 4LVAA 2VELA 1S5WA 4LUJA 4HNTA 1XKYA 1W5OA 1MEIA 4JYEA 3OHIA 2ZZ6A 1TREA 3V1PA 3N19B 1AW2A 2A0NA 3B04A 3IEBA 5D05A 3JS3A 4O1AA 4UTWC 4NT0A 3R5EA 2X30A 4MYAA 3M16A 1TTQA 5CPMA 5AFDA 1KFCA 3M9YA 3EKLA 5DLCA 3KRSA 5K2ZA 1XUZA 4JX4A 3LOTA 4I7UA 1F2JA 3KOFA 3FEMA 3O16A 2J9XA 4ORMA 3MWAA 1JULA 1GYLA 2DZPA 1SZNA 3EWWA 3QJAA 1V5XA 1KFLA 4UFMA 3A22A 3W1UA 1R2TA 5D37A 4HNUA 4X22A 1FY6A 1QWGA 3B0UX 3EB2A 4LWWA 2B7PA 1SPQA 4AH7A 3ZWTA 5KTLA 2WOQA 6ALDA 4YL2A 2DZVA 3CC1A 4IUOA 4RZ5A 1X1OA 3C2FA 4DXVA 5G2IA 5A8GA 3FFSA 4JTJA 3KRZA 2HMCA 3WK0A 2LLEA 2X16A 4LC6A 3KFTA 1GTHA 1SQ7A 4N02A 4Z0JA 4LV9A 1HFBA 1W0MA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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