4XV0A

Crystal structure of an endo-beta-1,4-xylanase (glycoside hydrolase family 10/gh10) enzyme from trichoderma reesei
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
EASQSIDQLIKRKGKLYFGTATDRGLLQREKNAAIIQADLGQVTPENSMKWQSLENNQGQLNWGDADYLVNFAQQNGKSIRGHTLIWHSQLPAWVNNINNADTLRQVIRTHVSTVVGRYKGKIRAWDVVNEIFNEDGTLRSSVFSRLLGEEFVSIAFRAARDADPSARLYINDYNLDRANYGKVNGLKTYVSKWISQGVPIDGIGSQSHLSGGGGSGTLGALQQLATVPVTELAITELDIQGAPTTDYTQVVQACLSVSKCVGITVWGISDKDSWRASTNPLLFDANFNPKPAYNSIVGILQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Hypocrea jecorina
publication title Crystal structure of an endo-beta-1,4-xylanase (glycoside hydrolase family 10/GH10) enzyme from Trichoderma reesei
rcsb
molecule keywords Beta-xylanase
total genus 128
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2015-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4xv0A00
1GOKA 4CVWA 2ZUVA 2ZX9A 4MDPA 4M56A 2VZOA 3ZR6A 2ZUMA 4DM2A 1H0IA 1IZKA 1W3HA 2V5CA 3N04A 4U3AA 5A8PA 3GDBA 2G3NA 3VIGA 1HIZA 1UQYA 3LPGA 1VIWA 2E9LA 1KWGA 3FHAA 3GXDA 3S2CA 3AZRA 1FP8A 5I24A 4CD6A 3IJ8A 1EHNA 2BHYA 1WDQA 1ISXA 4PUDA 4WK9A 3ZMRA 4BA0A 3THCA 4J3VA 2CBIA 3POHA 4Z2JA 1X6LA 3CLWA 4LQ1A 1B9ZA 1UH3A 4OIFA 5ABGA 2J77A 2UY2A 1CXFA 3QOKA 3MV11 3F5KA 2BY2A 2CESA 1QBAA 4CN6A 3A47A 4GXPA 1HX0A 1XRVA 4HZ6A 3KL3A 4EAMA 3WEMA 1E9LA 4C7DA 4AZ7A 5I78A 2W92A 4U33A 3VGBA 1DP0A 3GXIA 5IFPA 3WQ5A 3T0DA 4CVUA 3BCDA 1CENA 2OWWA 1LWJA 1HVXA 3WUFA 2EPKX 3T08A 3VD9A 2CITA 1UWSA 2VVSA 2VRJA 5DMYA 1G0CA 3AYRA 2ZUWA 4P7LA 2ZIDA 3UEQA 1U2YA 4OBSA 5A3HA 4YN5A 4S3JA 1TE1A 1D3CA 1MQQA 3WD4A 5LA1A 1WZMA 2FGLA 3LMYA 1UKQA 1VJSA 2O9RA 2VZSA 4H8VA 3POCA 4A3HA 2IXVA 4UTFA 5BYWA 3WNPA 3BAKA 1E6QM 2E9MA 1I75A 4PMRA 4PUEA 4MAVA 1OINA 1V3HA 3BH4A 3AXIA 5HXMA 2VQUA 2VT0A 5E70A 2WZEA 3VD4A 5A6AA 1CGWA 1E5NA 3UCQA 1HL9A 4W84A 1Q6EA 1TMQA 1HKIA 3BMWA 2GJXA 1OIFA 4AYSA 3WUGA 1F4AA 2WZHA 4M8UA 2WC4A 1I1WA 3FAXA 3KE0A 2BVDA 1NH6A 2J62A 3NDYA 1PX3A 4FMVA 1JFHA 1WDRA 4AEEA 1GHRA 1W2PA 4HA3A 3VIPA 1KCKA 4OJYA 4P7NA 4XZWA 1B31A 4W88A 2XM2A 3SUTA 1TZ7A 1LWHA 5I5RA 1JAEA 2DT1A 4FK9A 1NM9A 3BAYA 3HMCA 5IXEA 1UKSA 2E9BA 3PZVA 5JBEA 2VCAA 4AD0A 1I1XA 1FH8A 2DH3A 2VZTA 4D1IA 1UKPA 3VVGA 1MFVA 1NQ6A 3L4WA 5DEZA 1QW8A 4HOXA 3CUGA 1RPKA 1V6UA 4TX8A 4LYQA 3IJ7A 3OGVA 3M46A 2WCGA 2WSPA 4CCCA 2UY4A 1W1VA 1QHPA 3MU7A 2FH8A 1KXVA 2G8ZA 2PWFA 2WMHA 1OM0A 2VCCA 1L8NA 3FNDA 4AIEA 3A4XA 2DIJA 5I2UA 5DFAA 2ZOXA 3ZJ8A 2J74A 4PMZA 4AWEA 4DM1A 1KGXA 1V0KA 1GOWA 5A2AA 3A4WA 1ZBVA 3WDRA 1HF6A 1D2KA 4CD8A 2XYLA 4QP0A 2YIHA 2CBVA 3SCTA 3MSDA 4UQ9A 3WH7A 4QCFA 1D7FA 5BWFA 1JZ6A 4EANA 1KXTA 1NARA 1DWHM 2OSXA 2WVUA 2G3JA 1ISWA 1FH7A 3WQVA 1ECEA 5I6SA 4Z2KA 5EMYA 2J78A 2Z1KA 4PMYA 4AMCA 1J0HA 2VTFA 5A8QA 5IHRA 1WO2A 3W37A 3UR7A 3ZO9A 1DWFM 4QDMA 4HPGA 4CU7A 2JALA 1CLXA 4U2ZA 5FD0A 3PN8A 2PWGA 5HPOA 3ZJ6A 3A3HA 2CBUA 3W6LA 5CZKA 1OGBA 4UFLA 3ARPA 5CPQA 2XIBA 1H41A 4W86A 4HZ8A 2PBGA 4QLJA 2FGZA 3AS0A 2PBOA 5EBAA 4P7RA 5I3DA 4PEEA 3EDDA 1B2YA 5A94A 2WM0A 3KEHA 4MB1A 4AW7A 3L4ZA 4C7FA 5HNNA 5ABHA 3VGDA 4GQQA 2YA1A 3WELA 2YJQA 4JFUA 1CIUA 4PTWA 4TVCA 3AS2A 4C7GA 3MUIA 2BS9A 4MADA 2DSVA 4MB5A 1Y7VA 4GIAA 2XGIA 2X0YA 2WMIB 1FA2A 3QHOA 2BHUA 2CXGA 2UY5A 4OUEA 1JF5A 2D3NA 1E3ZA 4JFWA 3JUGA 3UG5A 1GPFA 5CQ1A 2XVGA 4B16A 1V3JA 3VTRA 1JI2A 2NT0A 3U5YA 2CPUA 4UOJA 3EDEA 1BG4A 1GOMA 4AZ5A 2GJXB 1E1FA 1RH9A 5FL1A 1WKYA 2E8ZA 5A6MA 1GVIA 1Q6GA 2XFRA 3IJ9A 1OSEA 3VO0A 1Z32X 1E6SM 2WB5A 3CZGA 3EMZA 1UZ4A 4URIA 4MNKA 1B3VA 2VUYA 2PC8A 5FKYA 8A3HA 4J3XA 2VL4A 3T2QA 1JZ3A 3WNNA 4PTMA 2WC3A 2DSWA 2EBNA 5E6YA 3DHUA 4M80A 1PIFA 3L4XA 2E8YA 3KL0A 4GO9A 4D6EA 2D0HA 3BCFA 4JKLA 3W82A 2B31A 4AZGA 3VMPA 4E8CA 3WDPP 1JFXA 3TTYA 1GQJA 4KH2A 5HDRA 4BQ3A 3NDZA 2Y2WA 1EHAA 2GSJA 3ZIZA 4EKJA 4DWSA 3OZOA 3QR3A 3FAWA 3GZAA 2GFTA 2WXDM 1CXEA 3GBDA 5DT5A 5M03A 1LL7A 3ARYA 2RGMA 1LL4A 2E4TA 1AQHA 2F2HA 1BSIA 1E0WA 5ECUA 1UA3A 2CKRA 3K46A 1E4MM 3CZEA 1E4NA 5D8ZA 3ARRA 3VIHA 1UWIA 1V3KA 4DWSD 3RJXA 5I79A 2WVTA 3VIKA 4AD1A 1O7AA 4AZIA 2CBJA 2WMGA 1GNXA 4AISA 2OYMA 3CZJA 2YL9A 3K1DA 3CUFA 3MO4A 1KWKA 3CUHA 2GDVA 4PMOA 1H1NA 4UQDA 4NF7A 1WZAA 1Q4NX 3M7SA 2RGLA 4FLSA 2BXYA 3ARZA 4GINA 1UA7A 4XV0A 4UQBA 4JFSA 3ARSA 1UWTA 3OLDA 4J3TA 1LG1A 3BSGA 4LPCA 3AZSA 2ZX6A 3AFBA 4MJ4A 1YQ2A 5A6BA 1GZJA 3GH4A 1OT2A 5A95A 1JL8A 1FFQA 3BGAA 4Z2GA 2OSYA 2JE8A 1H49A 1E15A 3AROA 3SURA 2GDUA 3PZ9A 4TTUA 3NSNA 1VFOA 3N9KA 1ODUA 1BG9A 2ZXAA 1EOMA 2BNJA 1W3JA 5JUVA 2EPOA 3VD3A 3WMSA 1E4LA 1UR4A 3MUAA 4ML4A 4P8WA 2XUCA 3DECA 3N1AA 5A8OA 1OBAA 1C8YA 4E8DA 1GCYA 1HKJA 3WD2A 2VRQA 3SUSA 3TP4A 2VO5A 4N42A 4CCDA 4MTVA 4UOZA 2WCAA 3AS1A 3VUPA 1BLIA 5I0DA 1NOWA 4UNIA 3AYSA 3CPUA 2QHAA 4Q22A 3U5UA 4HA4A 3N13A 3PZUA 1UD4A 1JYXA 2DIEA 5EFDA 2W66A 5E0CA 3OIHA 4GZJA 2XHYA 3QHMA 3MMDA 1MYRA 1JDDA 5BXTA 4PMXA 5GNXA 5IFTA 1V6VA 3MMUA 4ZXLA 1E40A 1GORA 1NWSA 3K8KA 3SCUA 1R7OA 2O92A 4OOZA 1R7AA 3PTKA 4LX4A 4UQAA 3AIVA 3FN9A 1BHGA 3SUVA 3PBGA 2Y5EA 4V2XA 1PZ2A 3FHQA 1HT6A 1UD5A 1E4IA 4FLRA 3K4AA 2YL6A 3VIMA 1J9YA 1HVQA 3PHAA 3OB8A 5I23A 1BQCA 2BXZA 3PZNA 4W5UA 3BMVA 4NRSA 3CUIA 2ZE0A 3ARXA 2C0HA 1UKOA 4XZBA 5A8NA 3ZT7A 5CXPA 3OGSA 3HJEA 4KGLA 4HOZA 3AISA 3W24A 1JYVA 5AYIA 1CGXA 1EO5A 1OWQA 1BYAA 4DWSB 4RL3A 2YBUA 2CETA 4AD2A 4OZOA 4XX6A 3AIRA 1E3XA 1QOXA 3N18A 2O9PA 2CYGA 2XWDA 3ALGA 3WUBA 2FH6A 3BC9A 1BF2A 3OLGA 2E40A 1HJUA 4YHGA 3WDJA 3WSUA 4X0VA 5DF0A 3AHVA 1W32A 3AMDA 2UWFA 1JG9A 1CXIA 2J7BA 5IHSA 2FHFA 2EPNA 3OA5A 1J0IA 1XSJA 3WF4A 1UWRA 4PYSA 3AMLA 1EGZA 2CIPA 2QLYA 5JIPA 1QI3A 2OWXA 1XYFA 1VENA 1CECA 1JXJA 2J7CA 3VMNA 1C92A 4NRRA 1KXQA 4Z2HA 4M24A 3O9NA 2CEQA 2XWEA 2ZX5A 4BF7A 1QI4A 1CZ1A 2ZXBA 3CHFA 2YOCA 3SCRA 1JNDA 1HP4A 3AXHA 3DYMA 1W1TA 1V0NA 4RE3A 3B8SA 1JXKA 1V0LA 3SCSA 2EEXA 2DT2A 1C8XA 3L2MA 3PZOA 4P8UA 2YLAA 3RJYA 4JIEA 2WHJA 4UCFA 1ZL1A 3ARQA 2YBTA 4PMVA 4PMDA 3VM5A 1E6PA 3WF1A 1V6YA 1MVYA 3AIEA 5BXRA 4D71A 3ARUA 4CN4A 2J7HA 4HZ7A 1B1YA 1OGGA 4GI9A 1VF8A 1KBBA 1W1PA 3U7VA 1UUQA 4B9ZA 2V5DA 4A4AA 3RMEA 2X1IA 3F4VA 4UQEA 1BGGA 1J0YA 1PIGA 3CZLA 4AC1X 3PZMA 3WF3A 2WKGA 4JAWA 1WAWA 1V6WA 4PN2A 1MW2A 1EDTA 4NI3A 1GHSA 2WMKA 3WH8A 2WYSA 2ZUNA 1HXJA 2WWDA 1NP0A 4RE4A 3ZJKA 1CWYA 4ATDA 2VMFA 4LYRA 1M53A 1XD0A 2D3LA 3T2PA 4FLOA 1KBKA 3UG3A 5CG0A 4UFHA 4AIOA 1JZ8A 2WW5A 4MDOA 3CH9A 5JBFA 2VRKA 4HU0A 2YL5A 1UHVA 5D9MA 4PMNA 1WP6A 4W5ZA 3AMGA 1HJQA 1WNOA 2EXOA 3WFZA 1CGTA 1Q6DA 1FOBA 1K9FA 2VURA 4UFJA 3BAJA 3AS3A 5BXPA 3VD5A 1ISZA 3RM9A 2F8QA 2DDXA 1KQZA 1B90A 3GM8A 1K9TA 4D1JA 1UWUA 8CGTA 1W9PA 2WANA 3T0BA 3EDJA 4WSJA 1OCQA 4B3LA 1XSIA 3NYDA 1C7TA 5BRPA 4MPKA 5AYBA 1BAGA 3GNOA 2V3DA 1CXKA 1RP9A 2VQTA 3MS8A 1J12A 1TUXA 2V3FA 4A3YA 3AICA 1DWGM 5D9PA 5FOOA 4IISA 4EK7A 1V0MA 4M29A 6A3HA 1G94A 3U57A 3WH6A 3BLPX 4UFKA 2AAAA 1DHKA 3OZPA 2GVYA 3FY1A 3KWXA 3WN6A 4LYPA 5A6SA 1V02E 2V38A 1V3IA 2J79A 1W91A 1M03A 1OB0A 3RILA 3ZSSA 1GJUA 3AHTA 3G6LA 1B3XA 1E5JA 1K9EA 3W81A 3BAXA 5BCAA 3VDHA 3UR8A 4H8UA 1ZB5A 2PI6A 3J7HA 3RO8A 1CGVA 3AXXA 2X05A 3WIJA 4QFUA 3AHZA 1UKTA 1KFWA 4HMCA 1U30A 2VX5A 2BY3A 5ABFA 5CJ5A 3VINA 4JHZA 1JF6A 2J7FA 1JGIA 3WH5A 3SCPA 2BHZA 2PWDA 2JIWA 4W85A 1DEDA 3UETA 1PX4A 3WD1A 1OD0A 1WB0A 5GNZA 1E72M 4ATLA 4DUXA 4WIWA 4V28A 3WQ6A 2NT1A 3ZOAA 4MB4A 2DSZA 3VPLA 2X0HA 4WSKA 1QI2A 3TOPA 1LQ0A 1CXHA 1Q6FA 3GYCA 3IK2A 5C70A 1G1YA 4TX6A 4MNLA 1EH9A 1GQKA 2G4FA 4W7UA 4CUCA 4JCMA 5LYRA 3D3AA 2X09A 3PTQA 3T2OA 1UR8A 2JF6A 3WQWA 3ZR5A 4GQRA 1JAKA 1QVBA 3MANA 4PMQA 1O6IA 3WKZA 2FDMA 3MUZ1 4LXFA 1BGAA 3HN3A 1EDQA 1E71M 3I3DA 1BVNP 3CMGA 2D1ZA 2VC9A 2WHMA 3CHEA 3L4TA 3GXFA 4DUWA 2V3GA 5GPRA 1BYCA 2YA2A 1H09A 2XVNA 1V08A 4TTGA 2D24A 2J47A 1K9DA 4H04A 3FW6A 3OBAA 1BFNA 2Z1SA 5A69A 3IAPA 2W4XA 4TUFA 3WNOA 3WDIA 4D6IA 2VZVA 1UR1A 3PZIA 1E43A 4FLQA 4FF5A 4UFMA 4W8AA 2PB1A 1TVPA 3GH5A 2VX7A 4MB3A 2X8RA 4W8BA 3EYPA 1ZBKA 3MUY1 3EMQA 1B30A 1JZ7A 1LJYA 1ITXA 1HN1A 3M6DA 3SUWA 1ZU8A 4WF7A 3EDFA 4TOQA 1HJVA 3L4UA 1W9UA 2AMGA 4QAWA 5CPTA 4H2CA 4PBGA 1H11A 1QW9A 1TR1A 3BSHA 4W87A 1ZJBA 3NJ3A 5TD4A 1AMYA 3HU7A 4H41A 4E4PA 2G3IA 1W3LA 1TG7A 3T09A 4W93A 5A1AA 4XB3A 2D0FA 2WMFA 3VOCA 2HVMA 1DWIM 1W9XA 2PWEA 2TAAA 1HKMA 5FIPA 4UZSA 5M17A 1C90A 1NWUA 3RM4A 1XC6A 2NW0A 1HNYA 1VBUA 4WLCA 1HJXA 1FHDA 3AIUA 5D8WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GOK A;  4CVW A;  2ZUV A;  2ZX9 A;  4MDP A;  4M56 A;  2VZO A;  3ZR6 A;  2ZUM A;  4DM2 A;  1H0I A;  1IZK A;  1W3H A;  2V5C A;  3N04 A;  4U3A A;  5A8P A;  3GDB A;  2G3N A;  3VIG A;  1HIZ A;  1UQY A;  3LPG A;  1VIW A;  2E9L A;  1KWG A;  3FHA A;  3GXD A;  3S2C A;  3AZR A;  1FP8 A;  5I24 A;  4CD6 A;  3IJ8 A;  1EHN A;  2BHY A;  1WDQ A;  1ISX A;  4PUD A;  4WK9 A;  3ZMR A;  4BA0 A;  3THC A;  4J3V A;  2CBI A;  3POH A;  4Z2J A;  1X6L A;  3CLW A;  4LQ1 A;  1B9Z A;  1UH3 A;  4OIF A;  5ABG A;  2J77 A;  2UY2 A;  1CXF A;  3QOK A;  3MV1 1;  3F5K A;  2BY2 A;  2CES A;  1QBA A;  4CN6 A;  3A47 A;  4GXP A;  1HX0 A;  1XRV A;  4HZ6 A;  3KL3 A;  4EAM A;  3WEM A;  1E9L A;  4C7D A;  4AZ7 A;  5I78 A;  2W92 A;  4U33 A;  3VGB A;  1DP0 A;  3GXI A;  5IFP A;  3WQ5 A;  3T0D A;  4CVU A;  3BCD A;  1CEN A;  2OWW A;  1LWJ A;  1HVX A;  3WUF A;  2EPK X;  3T08 A;  3VD9 A;  2CIT A;  1UWS A;  2VVS A;  2VRJ A;  5DMY A;  1G0C A;  3AYR A;  2ZUW A;  4P7L A;  2ZID A;  3UEQ A;  1U2Y A;  4OBS A;  5A3H A;  4YN5 A;  4S3J A;  1TE1 A;  1D3C A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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