4XWUA

Structure of the imp dehydrogenase from ashbya gossypii
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
389
structure length
314
Chain Sequence
TYRDAATALEHLATYAEKDGLSVEQLMDSKTRGGLTYNDFLVLPGKIDFPSSEVVLSSRLTKKITLNAPFVSSPMDTVTEADMAIHMALLGGIGIIHHNCTAEEQAEMVRRVKKYEPLASKSTKQLLCGAAIGTIDADRQRLAMLVEAGLDVVVLDSSQGNSVFQINMIKWIKETFPDLQVIAGNVVTREQAASLIHAGADGLRIGMACGRPQGTAVYNVTQFANQFGVPCIADGGVQNIGHITKAIALGASTVMMGGMLAGTTESPDKGSIKKYIPYLYNGLQHSCQDIGVRSLVEFREKVDSGSVRFEFRTP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Increased riboflavin production by manipulation of inosine 5'-monophosphate dehydrogenase in Ashbya gossypii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase,Inosine-5'-monophosph
molecule tags Oxidoreductase
source organism Ashbya gossypii (strain atcc 10895 / cbs 109.51 / fgsc 9923 / nrrl y-1056)
total genus 107
structure length 314
sequence length 389
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2015-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4xwuA00
1OFBA 3WJYA 3HQ1A 3GXPA 3TSDA 2CLLA 4EIVA 2WSQA 3HJZA 3CWOX 2ZDRA 1KM1A 5G1TA 1UCWA 3O1NA 3A23A 7TIMA 2TYSA 3LV5A 4LU0A 2Z6JA 2A0NA 3DHDA 4ZQRA 4LOCA 3LXCA 5DCDA 2C0AA 4JTHA 3W7KA 1G4EA 5K7JA 3P84A 4FX6M 3MYPA 2QDGA 3NL6A 3G1XA 3BGGA 1A5AA 2BLEA 4LRSA 1DJNA 3IVSA 3FJ6A 1PHQA 1H1YA 1F7BA 3MHFA 4WUIA 3QW4B 3WK0A 1FWTA 3G3DA 1KM0A 2HS6A 3L67A 1KTCA 4NJKA 1GOXA 4JTSA 3M9YA 1JUBA 4IJBA 2FIQA 3QF0A 3NVTA 4I9AA 3S1VA 1ZNNA 4YXGA 1FCVA 1B57A 3TX9A 3BK0A 4OQVA 4MKNA 3NL5A 3GR8A 5H2ZA 3HGSA 3EKLA 4WXYA 4LS0A 5F2MA 2YFNA 4O0KA 1AK5A 5KZEA 1AL8A 3RLVA 1G69A 5BMWA 4POCA 1W5OA 1VYSX 4G1KA 4S2CA 1X7FA 2TPSA 4GUIA 3FFSA 1DBTA 4AHQA 4WY0A 2CZDA 4L4MA 3HOJA 1VQTA 3LXBA 1BWLA 5D09A 1FY6A 2WNQA 2YYUA 5CZSA 4FNPA 3RLUA 2UV8G 1VHNA 1DHPA 1W8SA 5D2YA 3MHGA 3M5XA 4NT0A 4KFNA 5HQEA 2CU0A 4ADUA 3W07A 1P4CA 1W56A 2QCNA 3L5MA 4AH7A 1U83A 5BOOA 1H51A 3G1VA 2Q8ZA 4RCXA 5CSSA 2Y85A 1JRCA 3NQDA 3V1PA 1D3HA 3M16A 4TU1A 3QMSA 3JR2A 3T78A 1DVJA 2EPHA 4IQLA 1HO4A 4JYEA 5AHLA 1JJKA 2JKPA 3G0UA 1SW7A 3F4NA 3DGRA 2V8ZA 1H61A 3CTLA 1GT8A 3HGRA 5HUOA 4QIUA 4N6FA 1SR9A 3S42A 4O12A 3O15A 1WV2A 4PODA 3TAKA 2VENA 2A7PA 1HG3A 2J9ZA 3KRSA 1GWJA 5FF3A 3C3NA 4BK9A 3GXTA 3NQAA 1FDYA 4PCFA 2ALDA 4FNTA 5AYYA 2C19A 5HINA 4GNJA 4UTTC 5U7SA 2E5CA 1M6JA 1DQWA 3NQ8A 4OV4A 2DZVA 5E1QA 4C1LA 1I8JA 1B4KA 3WJZA 5KSWA 3NPUA 5G2HA 1YADA 2ZRWA 1VH7A 4IPIA 4KFPA 1D9EA 4Z1BA 3N2XA 1Y0EA 1K3UA 3BW3A 3LCGA 4N9CA 3DU0A 3IIXA 4K7VA 3C4UA 1QOPA 4CQ9A 3DFSA 3IEBA 5G1YA 1G7UA 1ME9A 3LOTA 3BVJA 2ZYFA 2BX7A 3W1MA 4IPJA 3GYEA 3TFCA 3NQEA 1VR6A 4NJIA 3W1NA 1VCGA 3W72A 4R53A 1VHCA 1LOQA 1NAL1 3E96A 3FEMA 3VE9A 4HT3A 1FDZA 4K37A 1GVQA 3EXRA 3LTSA 1EA0A 1TRDA 3FKKA 3NQMA 3QYQA 4FEZA 3B0UX 5EYWA 5C54A 3ZS4A 3E9AA 5C2XA 3BW4A 2ZA3A 4ORMA 4GUJA 3MP4A 3IGUA 3W73A 4MY8A 3ZWSA 1EPXA 1QO2A 4RKAA 3NQVA 2JKEA 3CC1A 3PBYA 2XN1A 4Z1CA 3W88A 3QRHA 1DORA 1XXXA 3G0SA 3P5YA 3UD6A 2B7PA 2Z2UA 1OK4A 1XKYA 3C6CA 4JYFA 5HUPA 4N2YA 1TYGA 3B0VC 4O50A 1KA9F 1T96A 3FYOA 4E2DA 2X2GA 3C8FA 2OZ0A 2VFHA 4LVGA 3SGUA 2PURA 4PH6A 4QJ1A 3LCFA 5TBOA 1LTDA 1FDJA 1D3GA 3BGJA 2PRMA 2HTMA 4QNWA 1Q6OA 2C15A 2X1RA 3PSVA 5I3KA 1TPUA 2OMAA 3PAJA 3UY7A 2GVLA 1WX0A 4LT9A 4LVDA 1O95A 2E5DA 1X1ZA 1GVRA 4IGHA 4UUIA 3W22A 4AEOA 3HPSA 2NLIA 1GG0A 1QO5A 1FCQA 4UMBA 2CLIA 3DI1A 4CNNA 2BZNA 3QQ0A 4FNUA 3GNDA 1LRTA 2ZRVA 4IWWA 5D03A 5I3IA 1OK6A 5AHFA 5G2IA 3GX9A 4LC6A 5DCBA 3LBCA 3TMLA 4JN6A 1MXSA 3IIZA 3NQ2A 2BWGA 2NXGA 5AC7A 4O13A 2ZZ3A 2ZBTA 3ZWTA 1LP6A 5CG7A 4QM1A 1A5CA 2NX3A 2ABAA 4ORIA 2RDTA 4WOQA 1TPC1 2PRLA 1VLIA 2O7QA 1L6SA 3THAA 3DFTA 1X1OA 2EHHA 2H8ZA 4Q4KA 2HMCA 4XBSA 4X22A 4LVAA 3UWVA 2GQ9A 1WXJA 4YMZA 1ME8A 2ABBA 4BI7A 1J4EA 4JTFA 2ZCGA 3TU9A 3GB6A 1W5PA 1YPFA 1L9WA 1TV8A 2QJIA 2DZXA 2QCGA 4ICNA 3VFLA 1KFEA 1M5WA 1SZGA 1G4TA 4Z0SA 4XKYB 3OA3A 3W2UA 3W7DA 4MPQA 1EIXA 4U28A 1H1ZA 5LKYA 3S9YA 4MYXA 4LNYA 4FNSA 4LS2A 3DFOA 1K8XA 2YR1A 3G1YA 4L4LA 5IBXA 4AHOA 2GQAA 3NA8A 1W3IA 4JS3A 1OJXA 4AVFA 1YDOA 3BG3A 2VFIA 4R7JA 3K30A 3TUUA 5AHNA 3UWWA 2A4AA 2WPBA 5KTLA 4X2RA 5LNUA 4JY9A 4NNCA 3UWUA 2Y88A 4TO8A 5A8GA 3TSBA 3VI2A 1ZALA 1PIIA 4O11A 3VNDA 4BWLA 2Y62A 2QUVA 4Y96A 6ALDA 4UTJA 2JGYA 4OHQA 3TSMA 1NFBA 5AHEA 3M5VA 2A7NA 3IVUA 2DZTA 3W7CA 3W84A 1LYXA 1TJRA 3LCIA 2TRSA 1FBAA 1JR1A 3MYOA 3PB2A 2A21A 2OX1A 1TSIA 1OX6A 1HUVA 3G0XA 1OFOA 2WSYA 3PULA 3MUXA 3L5LA 3LBMA 1VS1A 3O63A 3A9IA 2V5LA 4NQ1A 2YPIA 3QC3A 5A5WA 2B7NA 1GEQA 2QEZA 4M6VA 4H3DA 4S2BA 4NXSA 4HHPA 5FF4A 1F6KA 4M7SA 4NJGA 1YLVA 2FB2A 1TTIA 5AC6A 4ZZ9A 1ME7A 5LHEA 4LS1A 1JCMP 2PE4A 1TPWA 5L6UA 3NG3A 1I2QA 5EMUA 3UPWA 1K7FA 3ABOA 3QFEA 3MP5A 2BXVA 5CPOA 2QCLA 4CQAA 2ZZ4A 3LRKA 4JGDA 4A22A 4A2RA 3KFTA 4O57A 3O6DA 2DJXA 3UZJA 3LM7A 1NEYA 1QPQA 5TIMA 1I4NA 5D2WA 2NUXA 3LTPA 4AHPA 3MMTA 4O18A 2QCDA 1TTQA 2P0OA 3TNOA 3W85A 3FOKA 3T44A 2W79A 3UXAA 4N02A 2GQ8A 4JNMA 3L68A 3G22A 4ADTA 2QR6A 3U6WA 1QWGA 1PHWA 5LSMA 3EX3A 2A7RA 4NJJA 4YCPA 1CI1A 5AHIA 3L9CA 4IMEA 3LHYA 1RPXA 3W9ZA 2VELA 5TQLA 3RFAA 4TX9A 2H6RA 1P0KA 2VXNA 1FCBA 4OWGA 2VOMA 3H54A 5DXXA 1LRQA 1TREA 3W7HA 4UFMA 1ZJIA 4ZVJA 3IIVA 4QISA 5EL1A 2PCQA 1T8XA 1H7PA 4RXGA 2IQTA 8TIMA 2O7SA 1VGAA 1Q6QA 3PUDA 1C8VA 3C56A 1SO6A 4AWUA 4UFLA 1KV8A 4UTWA 1LOSA 3NZ1A 5DBTA 2WOQA 5G4EA 5K9XA 3ZFHA 2C3ZA 2ZRXA 1YDNA 1WA3A 3DKLA 4JR5A 3UXDA 3CEUA 4LVBA 3I6RA 4BR1A 3IIOA 1L6YA 4WZHA 4DQWA 4Y90A 2NX9A 4DPQA 2VKZG 4RZ6A 4UR7A 1U5JA 4JIQA 5CPMA 1Z41A 1SFJA 3GIYA 3DFPA 4GFSA 3LCWA 1GQNA 1N55A 2W0UA 3G8EA 1XBXA 1OX5A 3M41A 4W9TA 1YPIA 1TPVA 1F2JA 3G8RA 3TR2A 2Q3OA 2Y61A 2P1FA 3W76A 3ABQA 1HFBA 1QPOA 3PBVA 1ALDA 3BLEA 1B4EA 4HNNA 5DBUA 3W1TA 5DY3A 2GPTA 4JX5A 3RNDA 1OABA 3Q58A 4IOTA 3P80A 3DXIA 2FJKA 5F4SA 3W6YA 4A29A 4Y8FA 1FWRA 2H3BA 1AG1O 3TA6A 3C52A 4GJ1A 4O1AA 3IGXA 3CEPA 3UQNA 4RZ5A 2VEPA 1PV8A 4IMCA 3NNTA 4H6KA 4I7UA 1ICQA 1SSDA 1YTDA 1GG1A 3LGEA 4GRSA 4ML9A 4NX0A 5LZLA 4JX4A 3S1WA 3N2MA 5K2ZA 1XI3A 1H60A 3PUOA 2XFWA 3P8JA 4JYDA 3W75A 4M7TA 5D32A 3CU2A 4NX5A 4DF2A 2Y7FA 2NZLA 1KFCA 5KZDA 3A5FA 1S5TA 3DFQA 3WK3A 3EXSA 1R46A 2CZFA 5D33A 3LTYA 4R34A 3W1PA 4AMAA 1UBSA 2CLMA 1JRBA 4N9BA 2C16A 2OT1A 4R33A 3PUEA 5K4ZA 4KWVA 1F6PA 4QAIA 3N73A 2E6YA 3NPVA 1AW1A 3BARA 3BLIA 4AF0A 3TQ0A 1H62A 3KVKA 4UMAA 3OBKA 3E02A 3C2RA 3P81A 1IXPA 3UYCA 1TIMA 4O10A 4KFOA 1KFLA 3W83A 2QDHA 3USBA 2ZRYA 3NDOA 3A22A 3TC7A 3I7SA 3M5YA 5D2VA 1TPDA 2V2DA 2H8XA 1G67A 3NR0A 2NX1A 3IRDA 3I7RA 2Z6IA 4NJHA 5CZ0A 4UTTA 3GDKA 4MFDA 1MSSA 3N14A 4OV9A 3UPBA 2YDAA 3TXVA 2ZRZA 2H90A 3PBWA 1O5KA 3GZ3A 1PVNA 4OT7A 1C29A 4K6AA 2C14A 3S5YA 1FXPA 5I3FA 3LXAA 2VFDA 4Q32A 4CCEA 4IX0A 3T40A 3SIZA 3YPIA 3O6YX 3DH7A 3NPXA 3R13A 3C2FA 3W7MA 2QAFA 3QW3A 4XUGA 3TE9A 4IMGA 2OT0A 3DI0A 3F1QA 4QNEA 3W1UA 1NF7A 2YW4A 1R2TA 4MJMA 2JKAA 2PC4A 3UWZA 1YTEA 1XFBA 4PA8A 1LBLA 3BG5A 3EEGA 3G1DA 4ONVA 4XZ9A 3N34A 3S5ZA 4MVAA 2RFGA 3NEVA 1DKWA 4UNLA 4E0CA 2J9XA 2DZSA 1N8FA 1KM5A 5K4XA 1TRIA 4XBKA 2G5WA 2WO5A 3EWZA 1DL3A 1HL2A 1F73A 3GXNA 1JCXA 3MI6A 3TAOA 4DO5A 1BWKA 1ZAHA 1Q6RA 3WFAA 3FIGA 3FS2A 2QKFA 1SUXA 3STEA 1GTHA 3QEZA 1J2WA 3L0NA 5HJLA 3DENA 4EWND 4YL2A 3BV4A 1SO4A 3P61A 2A1YA 4N4PA 4DO6A 4C1KA 1HO1A 1S3HA 3KRZA 4IX2A 4D2JA 2QCFA 4WXZA 4DXVA 5I3JA 3GNNA 2E6DA 1QOQA 1W0MA 4QQ3A 4UNKA 3GKFA 3W7EA 5FEXA 1A5BA 1QMLA 2WV8A 3FJLA 1KV5A 5GVJA 1UASA 1K8YA 4MOZA 1LROA 5EY5A 1ZHAA 4DELA 3NQ6A 3GLCA 1IXNA 1F74A 1YYAA 4GWEA 2GUUA 1J5TA 1JUKA 3G18A 4JTTA 4MUZA 4HKPA 3EWUA 1ICPA 4K7YA 4JIPA 3UWYA 4O14A 1YTKA 2V81A 1IIGA 4A21A 3AJXA 3A24A 3DHFA 3TQKA 2WNZA 4O15A 3IIPA 3RMJA 3HG4A 1W5QA 2J9YA 1A53A 3ATZA 5KMYA 1LOLA 4FO4A 1N7KA 3JRKA 4DO4A 2ZA1A 2QJHA 1EP1A 4FNRA 2E68A 5AN7A 3EB2A 2CLKA 5E93A 2ATSA 3ELFA 1QR7A 3LRMA 3C0JA 2QCDB 2YYTA 3GVGA 1V7YA 3KVMA 1LZOA 5J5RA 3NYZA 5CKSA 2V2CA 3BW2A 4AAJA 3EKZA 4O52A 3ZR4A 3DFNA 1NSJA 1Q3NA 3PY2A 4GBUA 1TTJA 3N9SA 3QSTA 3W70A 2GJNA 4O4WA 3W1XA 1AW2A 3W7RA 3M43A 3LDVA 1KTNA 2C1HA 3CM4A 4GE8A 1FQ0A 4A2SA 5F2LA 3IV3A 4TMBA 1I45A 1JCLA 3PWAA 5EA9A 1ZAJA 1FWSA 3CT7A 3S6DA 4JTIA 4TR9A 4WX2A 3W3OA 1GYLA 2VFFA 3S5NA 2D73A 2A5HA 1KLYA 3GKAA 4RJEA 1RZMA 4O0ZA 3W2KA 2Y7DA 3SGZA 5HR6A 5C6MA 1E51A 5F2IA 2X1UA 3B05A 5CZTA 3TW7A 3QZEA 4CQ8A 1TV5A 3OHIA 4FXRA 4E2BA 3PS7A 3TKFA 1ZENA 4K38A 2RH9A 2QF7A 3LLFA 2FDSA 1BEUA 1DV7A 4O1CA 1OYBA 2BSLA 5D37A 1WOAA 3C2EA 4PFMA 3W7LA 1LBMA 3D0CA 2W6RA 3GR7A 3MO7A 3LCLA 4O1DA 2Z1BA 2YGYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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