4XZB | Genus

Total Genus 128

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	128
sequence length	312
structure length	312
Chain Sequence	ERTPVEENGRLQVVGTALLNQHNKPFQLRGISTHGLQWFGQFANKDAFQTLRDDWKANVVRLAMYTDPNANGYIAQPEWLKAKVKEGVQAALDLGMYVIIDWHILNDNDPNLYKEQAKRFFAEMAREYGKYPNVIYEIANEPNGNDVTWEEKIRPYADEVIRTIRSIDRDNLIIVGTGTWSQDVDDVASDPLPYKNIMYAVHFYSGTHTQWLRDRVDAALQAGTPVFVSEWGTSDASGDGGPYLEEAEKWIEFLNERGISWVNWSLCDKNEASAALRPGADPHGGWGDDHLSDSGRFIKAKLIEALEHHHHH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of endo-glucanase GsCelA P1 at 1.62 Angstroms rcsb
molecule keywords	CelA
molecule tags	Hydrolase
source organism	Geobacillus sp. 70pc53
total genus	128
structure length	312
sequence length	312
ec nomenclature	ec 3.1.2.4: 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase.
pdb deposition date	2015-02-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4xzbA00

3TA9A 3AI0A 1S46A 1BG4A 1GQKA 2GSJA 1QW8A 5KEZA 4L4OA 2O92A 1ODZA 2C8NA 1DP0A 2ZICA 3F5KA 2XIBA 1JGIA 1HP4A 3MUZ1 3VGEA 3EMQA 4W87A 3WMSA 2DSZA 2WC7A 4Y7EA 4J3XA 2DT3A 1FHDA 4CN1A 3K8LA 1WDQA 5JUVA 2AMGA 4PSRA 3E1F1 4BS0A 3O2LA 5A8QA 4P7RA 1KXVA 5E6ZA 4DUVA 1V3IA 4RE2A 1E0VA 1UWRA 4AD1A 1Q6GA 1Q6DA 4B3KA 4NF7A 1HJVA 3SURA 2CPUA 4W84A 2XTKA 3AIQA 4CKQA 5ABHA 3SCUA 2CKSA 4ACYA 5A6JA 3MKKA 5EBAA 4U3CA 1UD3A 3QOKA 3OZOA 3QGVA 1JDAA 1EIBA 4TVCA 1QBBA 3NDZA 2XUCA 5I77A 5AC4A 2J25A 1V02E 2D3NA 1JZ5A 2XFRA 1EDGA 4JL2A 2WPGA 1V0KA 4CD4A 1EHAA 5LA1A 4D71A 4DM2A 3WQVA 1E5JA 2WHMA 4IUGA 1E6QM 3WEOA 4H2CA 1CLVA 1KGUA 4URIA 2GJXB 3WNOA 1JZ2A 3CHEA 3OLEA 1GHRA 2V5DA 1K9FA 5GNZA 1GJWA 2J7GA 4PMDA 1MXDA 2EPLX 2O9TA 1GOOA 4GPNA 1UYQA 1BVNP 1V3MA 3GXDA 1BPLB 2VRJA 3VD3A 4GZIA 3AIBA 4HOWA 2DGAA 1CIUA 2YBTA 3WDJA 3MO4A 1UOKA 1GQJA 1MXGA 4MDOA 1BF2A 1B3YA 3PBGA 3OGSA 5I78A 1DWAM 3WY1A 1YQ2A 3DYMA 3AMKA 3AMLA 2XVPA 2OWCA 3B9DA 1J9YA 5FL1A 4Z2GA 3UERA 1XD1A 1CXKA 5BXTA 3QOMA 3WH9A 1DWFM 3AZTA 1K9EA 1CGTA 5ABEA 3BSGA 4BZYA 1WPCA 3AHXA 4W88A 4P8WA 3RJYA 4PMXA 4M1RA 1FFQA 3BAWA 4HA1A 3NJ3A 4S3KA 1C92A 2ESCA 2Y5EA 1TA3B 4LYQA 2J47A 4F9JA 3MUY1 4WKAA 4UNIA 1JYWA 4NSBA 5EMYA 1BSIA 1ECEA 1JDDA 1OIMA 4BQ5A 7A3HA 2EPNA 1E4LA 3AIUA 4R27A 3W6MA 3WF4A 1WDSA 3CZKA 2DT2A 3VIGA 2WKGA 1CXIA 4EE9A 2ZUTA 2XFFA 4RE4A 3RM4A 1G94A 1H5VA 4UTFA 4EAMA 2UY5A 1WZLA 2WHLA 2XIIA 5D9OA 5D9MA 2GDVA 1NWTA 1H0GA 2DPEA 4QDMA 2VX5A 4P8VA 4D6FA 3AISA 4QLLA 3ZIZA 5CPTA 2QMJA 2FDMA 1KXHA 1PIFA 2JALA 4LYPA 3J7HA 2BY0A 1V02A 3T0BA 3CHCA 2GVYA 2F8QA 1MW0A 1V6WA 3FAXA 4UQCA 1L8NA 3AZSA 2ZUMA 5A1AA 2WCSA 1VBRA 1C91A 2BY3A 1G0CA 1XYZA 3VIPA 3QHNA 4PMYA 4Z2IA 1V6YA 1H0IA 3I3DA 2J4GA 5A8MA 2BFGA 3UESA 3UCQA 4UFKA 3THCA 4BF7A 1R85A 2YIHA 3OG2A 3N1AA 4LXFA 3WF0A 1LF1A 1X1NA 3WD2A 1CWYA 2VZUA 4PMOA 4LQ1A 1V6XA 2WAGA 1X6NA 2CHOA 5D9NA 3RO8A 2XVGA 3ZJ8A 5HPOA 1JFHA 4AZCB 1GQIA 1DWGM 2WYSA 5CSUA 4JCMA 5GPRA 5A2CA 4GO9A 3KL5A 2ZX5A 3WFLA 1LG2A 4OIFA 1W1VA 4KMQA 4CCEA 3S2CA 2E4TA 1C7SA 1B90A 3ARVA 3AXHA 4JKLA 2HISA 3WDHA 5HPCA 2DT1A 2HVMA 3ARXA 3IAQA 3ARWA 5EFDA 4UQAA 3VMPA 1HL8A 1MW1A 4MNMA 1ITXA 3PZUA 3W38A 1EDQA 2PWHA 3POHA 1B30A 3L4VA 5IFTA 3AHZA 1F4AA 1VEMA 2Y8KA 3CPUA 3HJEA 5C8BB 2VQUA 2BY1A 1EHNA 4HMDA 3FW6A 4ZXOA 3PTMA 4M82A 1E73M 4NRSA 4YHEA 3SCOA 3N13A 3WEMA 3K8KA 1XCWA 1PIGA 3W29A 1HJSA 1JXJA 3TTYA 2JEPA 2VX6A 2YA1A 3VPLA 5HDRA 3VIKA 2PWDA 1M01A 1PBGA 1QHOA 2BVYA 2ZXQA 3ARSA 2JF6A 1H4PA 2WVSA 5E0CA 2VC9A 5BWFA 4JCLA 3UG3A 1EOMA 1LQ0A 1ISWA 1XHGA 2YLAA 1G1YA 1E56A 4GZEA 1CZ1A 1OB0A 2Y24A 3DYPA 1HIZA 1HKIA 1D7FA 4YHGA 4C7FA 1QW9A 2G3IA 3VX0A 1NH6A 4KH2A 1XC6A 8CGTA 3WKZA 4M8UA 5BXPA 2FHCA 4W7WA 3CHDA 3BGAA 3AJ7A 3GXFA 1RD6A 3AIVA 2YOCA 4EK7A 4XB3A 3N11A 2VMFA 3A47A 4AIOA 4AZBA 3CZEA 2X0HA 4KGJA 5FKYA 3MANA 4GQQA 2J7HA 2G41A 4UFIA 1VAHA 1ZBVA 1WDPA 1WKYA 3NSMA 1XRVA 3OGVA 3OLIA 5DT7A 2Z1SA 4D1JA 4CUCA 1W3LA 3VGBA 1EH9A 3WBEA 3MUIA 3RMEA 3AS3A 4D6IA 1LWHA 1E0WA 4JHOA 2YDRA 3EDJA 5BYWA 3AICA 1FP8A 2CNCA 1P6WA 2YL5A 4ZFMA 1E6PA 4N42A 3VD9A 3W81A 5IDIA 3AHYA 1V08A 1W9VA 1CNVA 4W8BA 2VO5A 1W1PA 4HPGA 3VMOA 4QFUA 3OBAA 3PZ9A 1C7TA 1VEOA 4DUWA 5HXMA 1Q6CA 1VIWA 3K8MA 1OD0A 2Y2WA 2VCAA 2OYKA 4J27A 5DF0A 2DSWA 2UY2A 1ISVA 1R87A 2QHAA 3TTOA 3AOFA 3WSUA 5CGMA 4AZ7A 1V3HA 3HU7A 3AS0A 1XSJA 4HMEA 3U5UA 5CJ5A 2VI0A 1JNEA 3WDPP 2BXYA 4PRWA 5IHRA 1BAGA 2XM2A 5BXSA 1GOKA 1UWTA 2W66A 1HL9A 4MADA 3PZVA 3NSXA 3I3BA 3ARUA 3BCDA 4W85A 1CEOA 4MDPA 1HVXA 1OT2A 2O9OA 2IXVA 2XGIA 2E9LA 3A4WA 3AMCA 3G6LA 1E6XM 1IZJA 1E6ZA 2PF0A 1CXHA 3OLGA 3PTQA 2J79A 1KXTA 4QP0A 2PWEA 1UR8A 2VJXA 4AMCA 3JUGA 2CETA 3L4XA 2E8ZA 3ZSSA 3W28A 1K9DA 2ZE0A 4BQ4A 3VDAA 4OOUA 4E8CA 1IT0A 2WHKA 2WZEA 1R86A 1MQPA 1UWUA 3ZT5A 1QI0A 1CLXA 3O9NA 3A3HA 4AD2A 3RM8A 1FOBA 4WK9A 1CBGA 4PTXA 1V0NA 1SR0A 3WDRA 3WH6A 1UH3A 1QNPA 2A3HA 2WMIB 4DUXA 5A2BA 1JG9A 4B16A 4Z2JA 3SCVA 2X09A 3EBVA 3AROA 4CCDA 3GBEA 4J3WA 1TE1A 2WLYA 5M03A 1B3ZA 3OGRA 1UG6A 1KBBA 1QHZA 4D6JA 2WANA 2FH6A 2OWXA 1TCMA 2YJQA 5GQBA 2J62A 5CG0A 3VD4A 2C7FA 4QAWA 2EPOA 4P8UA 2W62A 4P7QA 3L4TA 3N04A 3AIEA 4WSJA 3T08A 4AC1X 4AZ5A 2GJPA 3QR3A 1XH1A 3F4VA 4D6HA 1W32A 1QI4A 1KWKA 4PTWA 1GCYA 5FOOA 4AY1A 1VJZA 3SUSA 1CGVA 2G4FA 3GNRA 4WJXA 3DC0A 3WFZA 1QBAA 4NI3A 2ZX6A 1GZJA 4CD5A 3N15A 2A3AA 1L0PA 1AQHA 1LWJA 3GH7A 4PMQA 3M07A 4MB3A 4DM1A 5CZKA 3AYSA 1JZ3A 4CU6A 1U33A 1I75A 1JYNA 4HOXA 5A2AA 4MAVA 2BVTA 1GJUA 1VJSA 3CMGA 2D2OA 1HP5A 5E9AA 5I3DA 4CCCA 2DSVA 3PZOA 1F4HA 4GI6A 3B8SA 3BXWA 1K9TA 2E8YA 4M24A 2VX7A 3BLPX 3W0KA 1JXKA 2VZSA 2CESA 1UR1A 3RCNA 4MNKA 1HKMA 4DWSD 5BROA 4ATDA 1DTUA 3A4XA 1PX8A 5CSYA 4J3VA 5A6LA 2QV4A 3A4AA 2PBOA 1KFWA 4V27A 1O7AA 4U2YA 2J7EA 1UD8A 5A95A 1ZBWA 1OIFA 4JL1A 1UH2A 2GUYA 1WNOA 4W5UA 1NOFA 1LL7A 2W92A 1FA2A 4UZSA 2DSUA 6CGTA 3QHMA 2WNWA 4TXEA 1B9ZA 3RJXA 2EPKX 1GONA 3WNKA 2JE8A 3DECA 3ZJKA 1DWHM 2BY2A 1CGXA 1TZ7A 3W6LA 1HN1A 1V3LA 4DWSA 5FIPA 1GOIA 1V6UA 4OBRA 1WP6A 4UQBA 4GO8A 1UKSA 1E0XA 3KEHA 1WDRA 3ALFA 3AXXA 4AWEA 1VFMA 1MFUA 1CYGA 2CYGA 4GKLA 2NW0A 3BAXA 3D5HA 1X6LA 3RILA 4GXPA 4HTYA 2WK2A 4PTVA 3VIJA 1LLOA 1H09A 3WH8A 5LA0A 1C8QA 2CITA 1W1TA 2OLHA 1HF6A 3AHVA 5D4YA 4E4PA 5IFPA 3HN3A 1E9LA 4GI9A 4MNLA 1U2YA 1JD7A 4LPCA 4ZEPA 3DHPA 2WXDM 1EQCA 1UWIA 1XH2A 4H8UA 3OB8A 3SEPA 1J12A 3VD5A 4HU0A 2FGLA 4U5KA 1OCQA 2FHBA 1B0IA 1SYTA 4KGLA 3MMUA 2GFTA 2D20A 2DH2A 2E9BA 4TVUA 4XUYA 1HVQA 2W61A 1GHSA 5ABGA 2CBVA 2WM0A 5AC5A 2WMGA 1W2PA 2Z1KA 4AISA 5JBDA 2EO7A 4JFWA 4PMZA 2DIEA 1GVIA 3AZRA 2XPKA 2D23A 3A6OA 4JKKA 1Q6FA 3MMDA 2OSWA 2CERA 2XSBA 1V3JA 4PMNA 1BYBA 4JFSA 3WQWA 3WD4A 3SCQA 3GYCA 2WVVB 1ISXA 2Y8VA 4NRRA 2F61A 3K46A 5A8PA 1KR0A 1RPKA 1TMQA 3WD0A 4F9DA 3CZGA 3FN9A 3GH4A 4TTGA 1E72M 4B15A 1EXPA 4U31A 1MWOA 2E40A 4LYRA 2O9PA 4BA0A 3WN6A 3AFBA 5E6YA 1WCGA 4PUDA 4W89A 3M7SA 1J0HA 3VMNA 2WVVA 2EEXA 1C3FA 1VENA 3VDHA 3ZT6A 4HOZA 2XYLA 4GINA 3T0AA 4HP5A 1NP0A 3FY1A 1KWGA 1HNYA 1I1WA 3MS8A 3RPMA 4JFVA 4OKDA 4KRTA 4UOZA 2ZX9A 1NWSA 2WC4A 2Y4SA 3UG4A 4IPLA 2VZVA 3IK2A 4YN5A 2D0FA 3EDDA 1UD4A 3K4DA 2J7FA 2BHUA 3EMZA 1PX4A 3W82A 1JAEA 3VO0A 2CHNA 3W25A 3FXYA 3W4RA 3CZJA 3WMBA 1VFUA 3VTRA 2WBGA 2VVSA 2W63A 1XGZA 1EA9C 2WBKA 2D0HA 2X1IA 1J0KA 1KB3A 1OM0A 1UKQA 3W53A 2PB1A 1J0IA 2W91A 4HZ6A 3ZT7A 4OZOA 5M5DA 3LPPA 3NSNA 3WNLA 3WH7A 3N18A 1B31A 4X0VA 4H41A 3LPFA 1NARA 1LL6A 1VFFA 3O6AA 3POCA 4UQ9A 2CXGA 2ZUNA 2NT0A 2XVLA 1ZBCA 1TVNA 2ZXAA 1UA7A 2BNJA 4ACZA 1AQ0A 1H3GA 2D3LA 3WL0A 1US3A 1V03A 3MV11 3THDA 1D2KA 2WVUA 4HA4A 1UR2A 2B31A 1YHTA 1MQQA 4F8XA 1XYFA 3ZR5A 2EJ1A 4FF5A 4R5EA 3SUWA 4IM4A 2G3JA 3UETA 1M04A 2XGBA 4ATWA 2RGLA 3SCNA 1ZBKA 1UR4A 2VCBA 2VZOA 1B2YA 2VCCA 1NQ6A 1E43A 4CGTA 1AVAA 3SIMA 1CGWA 1W9PA 1JFXA 1C8XA 1KXQA 4ZE4A 2YLLA 3ZO9A 2RGMA 4XZBA 2YL8A 3ZJ7A 3CHFA 4Z2HA 3WD1A 1PX3A 2FHFA 1BHGA 4TX8A 4IISA 3ARTA 1LJYA 1NP2A 2Q8XA 1B3XA 1UQYA 3QHOA 3CUJA 4U2ZA 4PMUA 4UOJA 3EYPA 4MPKA 3S6TA 4H04A 1PPIA 2J77A 4AZHA 1Q6EA 2J7DA 5CLWA 3WNNA 1G01A 3VIFA 4BQ2A 1CXEA 2A3EA 1NM9A 3UR8A 1UD2A 2WB5A 4AIUA 5C70A 2D24A 4AEEA 1WZAA 3VUPA 4HMCA 3NIYA 3WF2A 4CD7A 3RM9A 2V3GA 3CMJA 3WUFA 3GXMA 1ODUA 4AD0A 1DHKA 2WMKA 4CD8A 1H41A 4UCFA 2E0PA 3NDYA 1W1YA 4MB1A 2WSKA 1ISZA 4WLCA 2BVDA 1V0MA 3TOPA 1C93A 1E3ZA 3ZQ9A 3GDBA 2CEQA 5A6KA 1JYXA 3SCPA 3TTSA 4E2OA 3BMWA 4WKFA 2FH8A 4XX6A 2V5CA 4JFUA 1E4NA 3ZJ6A 4ML4A 3GNPA 3KZSA 4OJYA 2YL9A 1ZJBA 1E6NA 3VIHA 1M7XA 3PN8A 3CUGA 2X2YA 3WEZA 4UFJA 2WSPA 1UWSA 3IJ8A 1UUQA 4TUFA 4CVWA 1XSIA 5EFFA 1VRXA 4MAZA 3AS1A 3N12A 4C7GA 4NZCA 5D9PA 4B9ZA 3WD3A 2DQXA 5A6AA 2GK1A 1XSKA 2XM1A 3B9AA 3WQ8A 5HOSA 3SUUA 4D1IA 1MVYA 1G9HA 5A6BD 3ZM8A 3ALGA 2VOTA 2ZUUA 1JZ4A 7TAAA 3VILA 3CTTA 4M29A 4W93A 4MJ4A 3VGGA 1BYDA 3VDCA 1Q4NX 2JIEA 1Z32X 3MMWA 1UD6A 4JZ5A 3ZR6A 4A3HA 5BXRA 1WE5A 3CBWA 1PEZA 4E8DA 2E9MA 3W26A 4Z2LA 3CZ8A 1UHVA 1BG9A 4F79A 4OUEA 3T09A 4D6EA 2G8ZA 3HMCA 4WKHA 4M80A 4OBSA 1JF6A 1HKKA 1CGUA 4AZ6A 2YBUA 1H49A 1HX0A 2YDSA 2J7BA 5A6BA 3OIHA 3FHQA 2WCGA 4HA3A 5I23A 4JFTA 5D8ZA 3WUBA 1UH4A 5CGTA 3UG5A 5A8NA 2JFEX 3BH4A 2W5FA 2VUYA 1GQLA 3WIJA 2AOSA 2XWDA 1KCLA 4D6CA 4Q22A 4AD3A 2ZX8A 3PZMA 4XV0A 1W9DM 4MB5A 4L4PA 3WDQA 2CCRA 2VR5A 2BHZA 3OA5A 3L4YA 3VU2A 2TAAA 1QI5A 5CLTA 4K68A 5DFAA 3WQ6A 4J28A 1M53A 4MJ2A 1QNSA 2DSKA 3KL0A 1UA3A 2DT0A 1UKOA 4P7LA 2ZWZA 4EANA 5A6MA 2XVNA 1QOXA 1BLIA 3W24A 3LPGA 1ZB5A 3NCOA 1OBAA 1PZ3A 5AY7A 3AMGA 1V0LA 1IZKA 1JZ8A 4W86A 5D8WA 1QI3A 2BHYA 3WL1A 1D3CA 5I5RA 4D6DA 3VINA 4QLJA 1C90A 3WUGA 4GZJA 2WHJA 1JD9A 3CZLA 1E4IA 3K4AA 3WELA 5LA2A 1G5AA 5AYBA 4X0NA 3VGHA 3IAPA 3GTNA 1KR1A 4UQEA 1CGYA 2WMHA 1XCXA 5CPSA 4WF7A 5ABFA 2FGZA 4RL3A 4EKJA 4X9YA 4W7UA 4A3YA 3L4UA 1UKPA 1C8YA 5A94A 1CDGA 5KZ6A 3ARQA 1UR0A 2BXZA 4PMRA 5FCZA 4CVUA 4TX6A 1HXJA 2J8FA 5EB8A 1N82A 2A3CA 1MW3A 4BCEA 2XG9A 1MW2A 3ECQA 1NOWA 2YL6A 2WVTA 4PBGA 8A3HA 2IXUA 5JBFA 4DWSB 1A3HA 1WZKA 3PTKA 1KGWA 1UR9A 1UKTA 2PWGA 3IJ7A 4ZE5A 1J0JA 3T2QA 3NYDA 1B3WA 1OGGA 1J10A 2QLYA 3AQUA 3D3AA 5I24A 2WMJA 4UR9A 3CGTA 1QVBA 5HBFA 3CUHA 2OWWA 4BQ3A 3AYRA 2WZIA 1CPUA 3FAWA 4AZIA 1SFSA 2NT1A 2VRKA 3LPOA 2PWFA 3M46A 2J75A 2WZHA 3T0DA 1CXFA 4Q7NA 1J18A 1JIBA 2VURA 3N9KA 2YA0A 4QCFA 3WF1A 4GIAA 4M81A 2VR4A 3EMCA 2BS9A 4PTMA 1PJ9A 1W9UA 4CN4A 1GOMA 2CBUA 1IV8A 3BAKA 3WNPA 2VL4A 3AIRA 1FH9A 4F66A 2XHYA 4HPHA 1LG1A 1E40A 5CQ1A 4PCSA 3N17A 3TP4A 1J0ZA 1BFNA 3CUIA 4AD5A 1J11A 3TONA 1EOKA 2PC8A 4PCTA 3W27A 1CECA 4A4AA 1E70M 1OSEA 1ZL1A 5A3HA 2J8GA 1O6IA 5CXPA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4XZBA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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