4XZB | Genus

Total Genus 128

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	128
sequence length	312
structure length	312
Chain Sequence	ERTPVEENGRLQVVGTALLNQHNKPFQLRGISTHGLQWFGQFANKDAFQTLRDDWKANVVRLAMYTDPNANGYIAQPEWLKAKVKEGVQAALDLGMYVIIDWHILNDNDPNLYKEQAKRFFAEMAREYGKYPNVIYEIANEPNGNDVTWEEKIRPYADEVIRTIRSIDRDNLIIVGTGTWSQDVDDVASDPLPYKNIMYAVHFYSGTHTQWLRDRVDAALQAGTPVFVSEWGTSDASGDGGPYLEEAEKWIEFLNERGISWVNWSLCDKNEASAALRPGADPHGGWGDDHLSDSGRFIKAKLIEALEHHHHH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of endo-glucanase GsCelA P1 at 1.62 Angstroms rcsb
molecule keywords	CelA
molecule tags	Hydrolase
source organism	Geobacillus sp. 70pc53
total genus	128
structure length	312
sequence length	312
ec nomenclature	ec 3.1.2.4: 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase.
pdb deposition date	2015-02-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4xzbA00

1EQPA 3VDAA 3EMZA 3OIHA 1BPLB 4TX8A 1EO5A 3AISA 4JFWA 2DT0A 4BQ4A 3W6MA 3CZJA 1WZLA 1JL8A 2VC9A 4IUGA 1R7OA 2B31A 4QDMA 4A3HA 4JIEA 3TTYA 1E55A 2XIBA 4GXPA 3FAXA 6CGTA 1XC6A 2X0HA 2X1IA 3CHDA 3TONA 3PZNA 4TOQA 3BAWA 4QLJA 4NF7A 4W7VA 3VIPA 1VBUA 1M04A 1VBRA 1KFWA 1ZJBA 2WVVA 4M56A 1QBBA 3UR7A 4J3UA 2J8FA 1WE5A 5A6LA 1V3HA 2VX5A 3WBAA 4GO9A 5A6KA 3BC9A 2NSXA 1H0GA 2C0HA 2C8NA 2E9MA 4H41A 2J47A 1C8YA 4D6HA 3WMSA 4HZ6A 4J3SA 5ECUA 4CGTA 3W82A 2CIPA 5D9OA 2E9BA 4L4PA 4JCLA 1W3KA 3SCWA 2GVYA 3VIFA 5JBFA 2XG9A 3AHXA 4J3WA 3I3DA 2O9RA 2WZEA 1WZKA 1GVIA 1OSEA 3NYDA 4MNMA 4JZ5A 3RM4A 2PWDA 1V0LA 1BG9A 1E56A 4QAWA 3VIIA 1HL9A 1HKKA 4WLCA 1MXDA 2WYSA 4PMZA 1WDSA 3AXXA 3NDYA 4S3JA 1V08A 1V6WA 3O2LA 4RL3A 2ZOXA 3AS0A 3RJYA 3VIMA 3ZOAA 3K46A 3VD4A 4UCFA 3S6TA 1EDQA 4JFSA 1PAMA 5FD0A 2GFTA 1JF5A 4BZYA 2YDSA 3AI0A 3EMCA 2J7DA 2Q8XA 1WDRA 3DHUA 3L4UA 4HOWA 1OBAA 3BSGA 2XGIA 3ARQA 3GH4A 3ZO9A 4AD1A 3W81A 4TTGA 4WIWA 3RIKA 3A4WA 2OWWA 3WQ4A 4DM2A 1Z32X 1JFHA 3WUBA 3WIJA 2W92A 1B30A 4DM1A 3UG4A 1HJWA 4H2CA 4AZCA 2WK2A 1JZ4A 2G8ZA 3VO0A 1V6XA 2VUYA 2XM1A 1Q6EA 4PMQA 3A47A 1L0PA 3W26A 1MW1A 2RGMA 1CEOA 1C7SA 3VIJA 1H5VA 1EOMA 3SCOA 3WELA 1MFUA 3WMCA 1OGGA 1BTCA 3VGDA 1D2KA 4GZEA 3AS3A 2X0YA 1RP9A 1WZAA 2V3EA 3MO4A 5GNYA 1BSIA 3AQUA 1J0JA 4MDPA 2YLAA 5IHSA 3AFBA 2BV9A 2WMHA 2YL8A 1JI1A 2J74A 4PMUA 1GORA 2FHBA 1MQQA 3KZSA 4MAZA 4M81A 3L4WA 1QNOA 1WKYA 1E72M 3WL1A 4PN2A 1W9VA 4MB3A 4ACZB 1GOWA 5AC5A 2VCCA 1OGSA 2FHCA 3RM8A 2Y8KA 1BYBA 1E6ZA 2WVTA 4CU6A 2PWHA 1Q6CA 3IJ8A 1UG6A 3GH5A 1H41A 1O7AA 2DT1A 3VDCA 3VD5A 3VU2A 5CLTA 1UA3A 2UY2A 2WVUA 4AZ5A 2GK1A 3EYPA 3VDBA 1J12A 1I1XA 4KWUA 1TFVA 4UQCA 1XH2A 5JBDA 4X0VA 4EKJA 1CGTA 1I1WA 3II1A 1ESWA 5LA2A 1TA3A 3AIRA 1MQRA 5D9MA 4M29A 3UEQA 4HU8A 5A6BD 3ZT5A 2BXYA 4DUWA 2IUZA 2J8GA 2VCBA 2WHKA 4P7QA 4UFJA 2BVYA 1KGUA 1UD6A 1W2VA 2RGLA 3LPOA 5LA0A 4H8HA 2JE8A 4JKMA 1EHAA 3U5UA 1ZB5A 3L4XA 6A3HA 4OIFA 2ZUTA 2OWCA 1NM9A 3AZRA 2WMIB 3NDZA 1KGWA 1HKJA 1VF8A 2Y8VA 4ZFMA 3ZR6A 1Q6DA 4AZHA 1KBKA 1AQHA 4YPJA 1LL6A 1F4HA 2E40A 1WDQA 4WSKA 5CQ1A 4CD7A 1GVYA 1XCWA 5BRPA 2WXDM 5M5DA 1JFXA 3AYRA 1QBAA 1UKTA 1UWUA 4GZIA 2WHJA 3KEHA 1CXIA 1Q6FA 1WP6A 3WH6A 3ARTA 5DF0A 3ARZA 2X09A 3TOPA 4UQDA 4A4AA 1DWFM 4B9ZA 3WNPA 3VINA 4AIOA 4B3KA 2DDXA 1NOWA 4ZENA 5BXRA 4U5KA 5BROA 4Z2LA 4HMDA 1QI5A 4JHOA 1CLVA 1CIUA 3SEPA 1L8NA 3UR8A 2XVNA 5ABFA 4AY1A 3EMQA 3ZMRA 4JL2A 4AYSA 1XSIA 5FCZA 2YL9A 1JYWA 3ZJ7A 3ALFA 5LYRA 3MSDA 4U3AA 1JGIA 3K4AA 4PTVA 5E9AA 3AIQA 4FLQA 3GDBA 5A6SA 1WAWA 2XFRA 4AISA 3GBDA 4M82A 2QPSA 1UR2A 2XSBA 4CD5A 2YLLA 3PZVA 2A3HA 3OZOA 4XX6A 1UZ4A 3UCQA 3WNNA 2ZUWA 4W89A 1B9ZA 1E0WA 5HPOA 3WH5A 2WBGA 3M46A 1CECA 1VRXA 4GZJA 3T2PA 4HA1A 2J25A 4OOZA 4LQ1A 1JAKA 4W85A 1D7FA 4CVWA 4UOJA 5AYIA 3N1AA 4GKLA 2E8ZA 3MMUA 3VDHA 5I0DA 1PZ3A 2D0HA 2J77A 5JIWA 1LLOA 4W93A 5A8PA 1NARA 4GPNA 5GNZA 2W62A 4CVUA 5I6SA 2QV4A 4UFLA 2WC7A 5FL0A 4PMVA 3UG3A 4AD4A 1U33A 3WF3A 1E5JA 1CGVA 5IXEA 5HDRA 3MUIA 3TTQA 1C7TA 3CGTA 4UFIA 4F66A 5A2CA 4FK9A 4OKDA 5IHRA 5A8NA 1W3HA 4KGJA 3PZTA 5A69A 4PMOA 2YIHA 3WNOA 2Z1SA 1MFVA 3WY1A 1HT6A 2VTFA 1H3GA 1SMAA 5A94A 7CGTA 4WK9A 1JG9A 4W8BA 1IZKA 3NSMA 2JFEX 4LGXA 4ZE5A 5F7UA 3WEZA 2V38A 2XTKA 3WH8A 2IXUA 2E8YA 1VJSA 4J27A 3AJ7A 2Y5EA 2NW0A 1OB0A 2OYMA 4LYRA 4LPCA 1JDCA 3QOMA 1DWHM 1HJUA 2XVLA 1W9BM 4M24A 4DWSB 1E5NA 2V3FA 4OOUA 2CPUA 1KXHA 1FHLA 2XWEA 3A6OA 4AW7A 4MB1A 1GOKA 2ZX9A 3N12A 3ZJ8A 1B31A 1JZ5A 4AZGA 1TCMA 1N82A 1GHSA 4UTFA 3AHZA 3HMCA 3DECA 3BAJA 4IPNB 1E6PA 3KL0A 4V2XA 1UQZA 5M3WA 3FXYA 1ZS2A 1OD8A 2PWEA 1UH3A 2EJ1A 1NP2A 5AC4A 1VAHA 1PJ9A 1E6XM 1D3CA 4WF7A 4NSBA 2BHZA 4AD2A 4AMCA 1LL7A 1H09A 1EIBA 1V0NA 1VIWA 2F2HA 1E9LA 4W5ZA 3VGGA 3GXMA 1V02A 3DHPA 1WO2A 5I24A 2EPLX 4JL1A 2YBUA 4FF5A 4CCCA 1NWUA 1H49A 3SCTA 2EXOA 2F8QA 1EH9A 2ZXQA 2OSYA 4BQ2A 1GOQA 4NRSA 1TVPA 2G3MA 2JEQA 3W29A 2HISA 1NWSA 1UH2A 5JUVA 1QNPA 3NJ3A 4HMCA 1VFUA 4UFMA 4ZXOA 3AIEA 2CBJA 3CZ8A 4UQEA 1BVZA 5I2UA 2ZWYA 1MW3A 1NQ6A 3WKZA 2CNCA 4JCMA 3W4RA 4RE4A 3A3HA 4NZCA 2BVTA 5DMYA 1QW8A 2QMJA 1J0YA 2VMFA 3T08A 4M80A 1K9FA 5E0CA 3BAKA 4B3LA 4AZ6A 1TR1A 1ZU8A 1TG7A 2EPKX 3SCRA 4XZBA 2J7GA 4EAMA 1X1NA 4PSRA 4E2OA 2FGZA 3AHYA 4XZWA 4MB4A 3U7VA 1XV8A 3VILA 3MUZ1 2XSAA 4AD5A 3T0AA 1CZ1A 1FH8A 3VIGA 1WB0A 3JUGA 2DSZA 1W91A 2CBIA 3K8MA 4HOZA 2YL5A 1W1PA 1JAEA 5I23A 1RPKA 1MXGA 5HNNA 3AS1A 4P7LA 5EBAA 2VT0A 2DH2A 2EPNA 1FH7A 2BHYA 4TTUA 1DWGM 1G01A 1CPUA 3WDHA 3VIKA 3IAPA 3WD0A 3WF0A 3MSGA 1W9XA 4Z2KA 1XYZA 1KCLA 4GI6A 3KL3A 5D9NA 2VVNA 1ZJAA 1PX3A 2D22A 3PZUA 1ODUA 5C8BB 4F79A 3EDDA 1UWTA 1GJUA 5ABEA 5FKYA 1E73M 3CHEA 4ZEPA 2X05A 4YN5A 2J7EA 1W9DM 3MUAA 3OA5A 3ZIZA 3GZAA 2QPUA 3G6LA 2DPEA 2W63A 1KXQA 2ZIDA 4D6CA 4IM4A 1CGWA 1UD5A 4LYQA 1W1VA 4DUVA 4FLSA 4JFUA 1G5AA 1EHNA 4BQ3A 2PBGA 5FL1A 1OD0A 4GIAA 3NIYA 4HP5A 3U5YA 2E0PA 1R8LA 1TZ7A 3DYOA 3W28A 1E0XA 2ZX8A 2WCAA 3E1F1 3WQVA 3AMKA 3BSHA 2CBUA 3UERA 1JDAA 1HX0A 3VGHA 1DWIM 2VQTA 1VEOA 2VX7A 3NUKA 1CGXA 2JF6A 3QR3A 3CZLA 2D2OA 1KBBA 5DT7A 4JFVA 1W3LA 1J0IA 1FP8A 4F9DA 1NWRA 1JZ2A 1B1YA 2W67A 4H8VA 2WSKA 1BGGA 3AZSA 5D4YA 2BY2A 5A95A 1OIFA 3RMEA 4CD4A 1WDPA 2PI6A 1FA2A 2YOCA 3VOCA 5A6AA 3FAWA 3ARSA 1QPKA 3IK2A 2DQXA 5EFDA 5FOOA 1C92A 5E6YA 1LF1A 4MADA 4HA3A 4UR9A 2VZOA 1B0IA 1US2A 1I75A 1EA9C 4PCSA 2G3IA 1V3IA 4GO8A 3WD4A 4CN4A 2CCRA 2XYLA 4AZIA 3CHFA 2JIWA 1E3ZA 4R27A 1E6SM 3WQWA 1PX8A 1GZJA 1KGXA 4PMNA 3FW6A 4C7GA 4J28A 1HVXA 1E4MM 1GOOA 2BNJA 4AWEA 2V5CA 1U2YA 4MNJA 4N42A 1LG1A 4UQAA 3NSXA 2HVMA 4JHZA 1CENA 3AXHA 1TUXA 2VRQA 5LA1A 1UR9A 4F8XA 2QHAA 1F4AA 2WVSA 1E40A 2J75A 2ZXDA 4AZBA 5CZKA 1OT2A 2XM2A 1JYNA 3VMNA 2BY0A 3PTMA 3VX0A 3WN6A 1K9TA 1H2JA 2ZUUA 4Z2HA 1V3LA 3B9DA 3ZQ9A 2WVVB 4E8DA 1PIFA 3LMYA 3L4ZA 3CMJA 3CMGA 3F5JA 5TD4A 3MU7A 1E6NA 1E4IA 2J4GA 2X2YA 1E1FA 2FH8A 2A3CA 4KH2A 3T0DA 4D6GA 2CKRA 1GNXA 2A3AA 1B3XA 3RM9A 1W9UA 2XPKA 2VZUA 1UHVA 2EEXA 2XFYA 4NRRA 4PBGA 1CWYA 3EBVA 1V03A 2A3BA 3VGFA 3MANA 3SUUA 3VM5A 1UOKA 1E6QM 1RP8A 4C7FA 4HOXA 1W9PA 1J18A 3ARYA 2CYGA 2ZWZA 2VR4A 2UWFA 3RPMA 1VEPA 2BVDA 5AY7A 2WHMA 4HTYA 2WWCA 5BCAA 4UOQA 3F5LA 3L2LA 5I3DA 1J01A 3AMDA 1NWTA 3SCNA 3M7SA 2WAGA 3CBWA 1XHGA 3PTKA 4AZ7A 4Y7EA 2GJXA 4MNKA 4HPHA 1Q4NX 3B9EA 4DUXA 3N04A 4L4OA 3OGVA 2AMGA 3LPFA 1XSKA 1QNQA 2XWDA 2OSWA 1UD8A 3F5KA 2PB1A 3OG2A 4OJYA 1EQCA 1GONA 3CLWA 5FIPA 3HJEA 1RH9A 5A2AA 3AZTA 3GNOA 1Y7VA 1OM0A 2DSUA 4WKFA 3SUTA 4PMRA 1QI0A 2FH6A 2WLYA 5A6MA 1KXTA 2UY5A 4W86A 1ZBKA 4GINA 4UFHA 2VRKA 5E09A 1HKIA 1BVNP 5BXSA 5D8WA 4TX6A 1OWQA 2WC3A 3WSUA 3WNKA 3CPUA 3AMLA 5I77A 4D6IA 2NT1A 5DEZA 5D9PA 3WD2A 3AMGA 2XJ7A 4UNIA 1CYGA 4PTWA 3WNLA 3NCOA 2Y24A 1KB3A 3W27A 2J78A 3WD1A 2CXGA 4YHEA 1CXLA 2WB5A 4JKKA 4GQRA 5I79A 3VMOA 2D0GA 4ACYA 4CD6A 5EB8A 5CGMA 2OWXA 3AOFA 2YJQA 5A1AA 1TE1A 4BF7A 5JBEA 9CGTA 1VFOA 2C7FA 1CGYA 3F4VA 3UG5A 1B3YA 2YKKA 3CUFA 2OSXA 5EFFA 1XH1A 4U2YA 3KE0A 3SUWA 4HA4A 3VKKA 1E70M 1E1EA 3K8LA 3SCSA 3T2OA 2OLHA 5BXPA 1UD4A 2VZSA 3EDFA 1QVBA 1E0VA 4P8WA 1EOKA 2J79A 3U57A 4CKQA 2GK1B 1GJWA 4QFUA 2WLZA 4NI3A 1ISWA 1PZ2A 1V0KA 6TAAA 1WZMA 4UZSA 4MB5A 3M07A 5CPSA 3O9NA 1JD9A 2VO5A 2YA0A 1UR4A 4M8UA 1JF6A 1KCKA 5HXMA 1GPFA 1S46A 3N15A 3ZSSA 2GDUA 3B9AA 1BAGA 1NP0A 1UR0A 1E6RA 3WL0A 3MV01 4LYPA 2VVSA 3BLPX 3VGEA 4MTVA 4N0RA 4V27A 3BXWA 3OBAA 3ZR5A 3ZT7A 4AC1X 1B3WA 1B3ZA 4CCEA 1YQ2A 4M1RA 3O6AA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3G6M A;  3WEN A;  4S3K A;  1QNS A;  3PZ9 A;  1EDT A;  1ISZ A;  4Z2J A;  1HVQ A;  5AYB A;  3A4X A;  1PPI A;  1U30 A;  4CD8 A;  2E9L A;  4D72 A;  1GOM A;  2V3G A;  2CES A;  1BFN A;  2WMF A;  8A3H A;  4K68 A;  4PTM A;  3ZT6 A;  5CJ5 A;  1CGU A;  1IT0 A;  1A47 A;  2YDR A;  3SUS A;  4WKH A;  4KGL A;  1UR1 A;  1HN1 A;  2DSW A;  3GBE A;  2AOS A;  2D0F A;  3ECQ A;  4OBR A;  4DWS C;  4HZ7 A;  1ITX A;  3N18 A;  1AQ0 A;  1QW9 A;  1DWJ M;  4ZE4 A;  2V3D A;  1UWI A;  1JZ7 A;  1X6L A;  2DEP A;  3D5H A;  3ARX A;  2GDV A;  4B9Y A;  5BXT A;  5CPT A;  1C93 A;  2QLY A;  4ML4 A;  2ZX6 A;  3K8K A;  3WFL A;  2DIJ A;  3W53 A;  3WDI A;  1DHK A;  1LJY A;  4PMX A;  2D24 A;  1QI2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4XZBA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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