4XZW | Genus

Total Genus 127

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	127
sequence length	305
structure length	305
Chain Sequence	KTPVAKNGQLQVVGTALLNRDGKPFQLRGISTHGLQWFGQFANKDAFQTLRDDWKANVVRLAMYTDPNANGYIAQPEWLKAKVKEGVEAAKELGMYVIIDWHILNDNDPNLYKEQAKRFFAEMAREYGNTPNVIYEIANEPNGDVTWEEKIRPYADEVIRTIRSIDRDNLIIVGTGTWSQDVDDVASDPLPYKNIMYALHFYAGTHGQFLRDKANYALSKGTPIFVTEWGTSDASGDGGVFLDQSREWLKYLDSKTISWVNWSLCDKNEASAALRPGADPHGGWGDDHLSDSGRFIKAKLIEALE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Endo-glucanase chimera C10 rcsb
molecule keywords	endo-glucanase chimera C10
molecule tags	Hydrolase
source organism	Uncultured bacterium
total genus	127
structure length	305
sequence length	305
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2015-02-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4xzwA00

1CPUA 3AMDA 4ATDA 4WK9A 4PYSA 1UA3A 1TCMA 2ZUVA 5M5DA 5HPOA 4JFWA 4ATWA 4TOQA 4CVUA 1JYVA 4JKLA 1VEPA 1PZ3A 2ESCA 3AIQA 4AW7A 4W85A 1OWQA 3GH4A 2VUYA 4D71A 2WVSA 4QAWA 1BAGA 1EO7A 3RJYA 3BAYA 3S2CA 4R5EA 1PX4A 1JD9A 4GXPA 1BGGA 1W9BM 5HBFA 4HA3A 1US2A 2BXYA 1K9DA 3O2LA 1WNOA 1UKSA 3MKKA 1E4IA 1VB9A 3I3EA 2UY3A 1NOWA 4M1RA 4F9JA 1E3XA 2VRKA 3AISA 3SCPA 4URIA 2VZUA 3EDFA 3VDAA 1OIFA 4A4AA 2BHUA 2BY1A 3U5YA 5HPCA 1E15A 1NARA 3VDBA 3BMWA 3AMGA 3AZSA 3MMUA 5A95A 3N12A 1HKKA 4PSPA 1V3JA 1MXGA 2ZUMA 4PMZA 1QBBA 1NWUA 3WUFA 4JZ5A 1TA3A 5BWFA 3VU2A 1N82A 3ARWA 1J0ZA 4D6GA 3FNDA 3CMJA 3IJ8A 3UEQA 4IPLA 2WNWA 5CLTA 2AMGA 2O9RA 1GPFA 3AI0A 3CZGA 4AYSA 2DSKA 1UKTA 2BFGA 2FGZA 3RIKA 1XSJA 2VQTA 3T08A 2D0FA 1BYDA 1H5VA 3M46A 1O7AA 3GNRA 4P8XA 4UQBA 1E71M 2EXOA 4AZBA 3W28A 4TX8A 1QHOA 1C8YA 1Q6DA 1JNDA 1W1TA 5CPTA 4HOXA 2ZUNA 3ZJKA 1JF6A 4FLRA 3VD3A 4R27A 2VX5A 3AFBA 7TAAA 3WY1A 3SUSA 3T0DA 2WHJA 2X05A 1HJWA 4YHGA 2QF8A 1H49A 1VF8A 1KBKA 1PX3A 1E72M 3MSGA 2NSXA 3CUGA 3T2OA 1BVNP 2C8NA 3CUJA 3SCWA 4W5ZA 3ZSTA 4QDMA 3OG2A 5E70A 2W63A 3NDYA 3UG5A 2HISA 4P7LA 3DHPA 2ZX7A 5I78A 3HMCA 3EMQA 2YIHA 3TTYA 2GSJA 2DDXA 3WBEA 2J8GA 4W8LA 3GXMA 3PZOA 2D24A 1R7OA 1UH2A 4M80A 1W3KA 5A8OA 2V5CA 1M03A 4UFJA 3AMLA 1QI4A 1XH2A 2DH2A 2EPKX 3OGVA 1E0XA 2WMIA 2EEXA 1JI1A 2PWGA 3M7SA 1CGXA 1OB0A 1MFUA 3CO4A 3WDIA 1ZS2A 3WD3A 4PEEA 1C7SA 1E9LA 1XYFA 4AISA 2WCSA 4HPHA 4HTYA 2NT1A 4NSBA 2OYKA 2WBKA 1WDPA 3SUVA 4BQ3A 1NOUA 1OBAA 4JL2A 4WKFA 1UD2A 5ABHA 4TUFA 2FHFA 4AD5A 3AIBA 1BYAA 3CHCA 4P7NA 2PBGA 4C7DA 4FLSA 5E9AA 3QR3A 1SMAA 1V3KA 1UWRA 2E40A 2D1ZA 3N9KA 5DMYA 1D3CA 3VGDA 1GQLA 3FAXA 3N04A 2JALA 4NRRA 2JEPA 4GO9A 3CZEA 1Y7VA 2DT0A 1V03A 1MQPA 1MWOA 2W92A 3UR7A 1NOFA 1V6WA 3PTMA 3RM9A 4CD5A 1DWGM 4MPKA 1GW1A 2DEPA 5M17A 3CHDA 3PZVA 1CNVA 4S3JA 2X8RA 2YL8A 4ZENA 2WVVA 3L4TA 2XVLA 1W3LA 1TZ7A 1E6QM 1VBUA 1YQ2A 3AS0A 3QHMA 2DIJA 1XSKA 1KQYA 4PMDA 4X0VA 4Q22A 1GOMA 3E1F1 1UOKA 1TFVA 5LA1A 3WQ4A 4XZWA 1XC6A 4OBSA 4WIWA 4CCDA 2WWDA 1XH1A 1G94A 1JZ3A 3W27A 3MUY1 2FHCA 2OSWA 3SCOA 1AQ0A 3PZTA 2A3EA 4UOJA 4LYPA 5JBDA 2XVKA 3I3BA 1A47A 3L4ZA 2BS9A 1CLXA 3IJ9A 1R87A 1B0IA 2E8ZA 5FOOA 2CBIA 1FH7A 3DYMA 4JKMA 1M53A 3AIWA 1H0GA 3UESA 1E5NA 4BCEA 3K8MA 1ZB5A 5D4YA 1MFVA 4RL3A 1OT1A 3IANA 1J0HA 1UWTA 4CKQA 2D0GA 3I3DA 3ZM8A 2VZTA 4AZIA 3DECA 3SUUA 1SFSA 3AZTA 3VGHA 3TOPA 1FFRA 4U2ZA 4AWEA 4A3YA 3L2MA 1OSEA 3VIIA 1UH3A 1B3WA 1L0PA 5A8MA 1V6YA 3T09A 4QLJA 1DWHM 2JIWA 4W8AA 3K8KA 4U5KA 1HVQA 2VVSA 5ABFB 3EDDA 4AD3A 1XRVA 2NT0A 1OT2A 2BV9A 1HP5A 2VO5A 1B1YA 3WQVA 3T2PA 1CECA 1CGUA 2ZX8A 3QHNA 1JD7A 1JAKA 1WDSA 3VIPA 1B9ZA 3W24A 2VCAA 3GYCA 4U5IA 3SCNA 4JHOA 3BCFA 1WE5A 3JUGA 4JCMA 4B3KA 4UFKA 2ZXAA 2VI0A 3SCSA 1QNOA 2DH3A 4NF7A 4CGTA 1DWAM 4XV0A 4LQ1A 3A47A 3VMOA 5HDRA 3SCUA 1FP9A 4BQ2A 3HU7A 2DPEA 3VGGA 4FMVA 1UKPA 1V0NA 1CGVA 2ZX5A 1GQJA 2DSZA 4UR9A 1OGGA 2DGAA 2XM1A 2YLAA 3VD9A 2WWCA 1LG1A 1CGWA 2A3BA 4HMCA 2WHLA 4UFLA 4CU6A 3VIGA 4NRSA 2DSWA 5CLWA 4PRWA 4HP5A 1JYXA 1UKQA 2G3NA 3WD2A 3IJ7A 5A2AA 4AZCA 1ISZA 3WF2A 2GVYA 3VUPA 1Q6GA 1HIZA 2WMHA 4Z2KA 2WMJA 3RILA 3ZJ6A 2YDQA 4GZEA 3VM7A 4DWSC 3TTOA 4UOQA 1V6XA 2GDUA 1VJZA 3OBAA 4CN4A 1VBRA 2J75A 3U7BA 1E4MM 2YKKA 4L4OA 2WLYA 3UG4A 4HZ7A 4MB5A 4CVWA 5A8PA 3O9NA 3RO8A 2Y2WA 1GORA 1XSIA 2WKLA 2YA0A 1JYNA 1C8QA 2CERA 4GZIA 1C8XA 4J28A 3AICA 1PEZA 4MB3A 3ALFA 2O9OA 3VOCA 1KXTA 1J0IA 3NSMA 4PMOA 4QLKA 1V3IA 4WSKA 2XUCA 3THDA 1W2VA 1AQHA 3CIVA 1J10A 1YHTA 1TA3B 4U3CA 1LG2A 3K8LA 4FK9A 3UG3A 4OJYA 5KZ6A 1CDGA 1GOIA 3L4VA 2J8FA 5D8WA 4W7VA 1G1YA 5GNXA 5GPRA 1EOKA 1BPLB 1FP8A 5EFFA 4E4PA 1E1EA 1JG9A 2DT3A 3A4AA 4OBRA 1H0IA 3AIUA 7A3HA 3ZSSA 3ARXA 3ARRA 1JL8A 4PMRA 4WJXA 4PUDA 3L4WA 9CGTA 4PMQA 1X6NA 3O6AA 4IM4A 2NW0A 4E2OA 5DFAA 3ARSA 2VX4A 2WLZA 3GBEA 5A6SA 1RP8A 4D6CA 4D72A 2V3DA 4AD1A 4CN1A 2ZWZA 5AC5A 3PTQA 1E4NA 2EPMX 4IUGA 3GXIA 2PWFA 1DTUA 1NP0A 1NWSA 4TVCA 2UY5A 3VNYA 3WH5A 4NI3A 2J47A 1KR0A 3AROA 4OUEA 1GJWA 3AHYA 3KEHA 1QI2A 3G6LA 3OGRA 2IXVA 1HJVA 3F5KA 1JXKA 4Z2HA 4GPNA 4D6HA 2VQUA 1GCYA 3PZGA 1NM9A 4P7OA 3N18A 2XYLA 4WSJA 5GNYA 1DWIM 1LQ0A 3FN9A 3GXDA 5BRPA 4QCFA 1M04A 1E55A 4A3HA 1CXIA 1GQKA 4ATLA 2VRQA 4B9ZA 2J4GA 1GOWA 4AIOA 1MW2A 4PBGA 1ZJAA 2BY3A 1DWFM 1WZMA 5A69A 4TXEA 1FA2A 3NUKA 3CBWA 4GQRA 3BSHA 3WDPP 3QHOA 4W7WA 1PBGA 4H41A 5FIPA 2CHNA 4J3XA 2RGMA 3OLIA 5E6YA 1OCQA 2JE8A 1HL9A 3B9DA 5CGTA 1ZBCA 3W37A 2QLYA 1BG9A 2YL5A 1EH9A 3W29A 1V3LA 1BYBA 1JXJA 3WH6A 4ACZA 3PZMA 2JF7A 3KE0A 3MUIA 3A6OA 1MW3A 5I23A 3ARUA 2EJ1A 5IHRA 1QNPA 4AD2A 3UERA 2E4TA 5A1AA 1KXVA 1P6WA 4J7RA 2OYLA 1ECEA 5A8NA 2UWFA 4YN5A 1GZJA 3WUEA 5BCAA 3VKKA 2WZIA 4RE4A 1NWTA 2PWEA 2EO7A 3A3HA 1A3HA 3N17A 4UFHA 2V5DA 3AIEA 2WMGA 4W87A 3B8SA 2YOCA 1J11A 3GNOA 4PTMA 1GNXA 1LWJA 1JI2A 1V3MA 4AEEA 1HXJA 2WZHA 2GFTA 3DYPA 2G3IA 2E8YA 3WN6A 3GDBA 1XD0A 2WVVB 1E6NA 3L4YA 2OWCA 1UR0A 1V6VA 3BXWA 1OINA 2QMJA 1EOMA 1CBGA 2O9TA 5GQBA 3AIVA 3F5LA 1FH9A 4P8VA 2YA1A 2DQXA 4EANA 1C7TA 3FW6A 4HMDA 4LYQA 2TAAA 2BVDA 4LXFA 4C7GA 1E56A 4X0NA 1KR1A 2VZVA 4CU7A 2J7GA 4PCTA 5ABEA 1QVBA 4D1IA 1QHPA 1CTNA 4JFTA 3VX1A 1JFHA 1R8LA 3EBVA 3ZT5A 5EB8A 1XGZA 2J7FA 4M29A 1SR0A 2FH8A 3MANA 1LL7A 1VRXA 4B15A 1E70M 1I75A 1UWQA 4DWSA 1PIGA 1X1NA 2D0HA 5FKYA 1TG7A 1SMDA 3NIYA 4MJ4A 4AEFA 1H11A 4BZYA 1BGAA 3W4RA 1QPKA 1W9XA 1E6ZA 3IAPA 3ECQA 7CGTA 2YBTA 3CUHA 3MS8A 5HOSA 1HF6A 4Q7NA 4HPGA 3OA5A 1W9VA 1H09A 1WO2A 1UD6A 3RM8A 3MV01 4J3TA 3AHXA 1EQCA 2WC3A 1E6XM 2D23A 1TVPA 2XPKA 1GVYA 2UY2A 2JEQA 1EDTA 1QNSA 5I77A 3M07A 5IXEA 3T2QA 5A6LA 2CESA 2XVPA 3VILA 8A3HA 4AZ5A 2CPUA 1JZ7A 4AZGA 2QMKA 3VNZA 3AQUA 2G3JA 3W0KA 2J7HA 1J9YA 2YDRA 4M81A 1SYTA 2D3LA 5ABGA 1HJSA 1J0YA 1HVXA 4J3WA 1QOXA 3NYDA 4PMVA 5LA2A 1J12A 1I1WA 2XVGA 4OIFA 3EDKA 2CBVA 2CHOA 5CPQA 1HKIA 2VL4A 3IK2A 5BXTA 4MNLA 1B2YA 3K4AA 3ZJ7A 3WH8A 3VD4A 3LMYA 2G8ZA 2XHYA 1ZBKA 2WYSA 2WPGA 1U2YA 5I24A 2VR4A 3CZLA 4V2XA 2OWWA 1UYQA 5DO8A 3W38A 1UQZA 1HL8A 1V02A 4LGXA 1G9HA 2HVMA 4N42A 1XHGA 1EXPA 2G4FA 2WKGA 1UD4A 1VEMA 1RD6A 3BLPX 3VMNA 1TVNA 2XWDA 4V27A 4ZEPA 2WANA 3HN3A 4JFVA 3CLWA 4W86A 4MJ2A 3BAWA 3VTRA 3WF3A 3FAWA 4D6DA 1HT6A 4B3LA 4W5UA 4UQDA 3DC0A 1GOOA 1EQPA 4XUYA 5JIWA 1C91A 1CLVA 1H41A 3AMKA 2XFRA 3WH7A 1UR8A 4V28A 4U2YA 4KGJA 4UZUA 1MQRA 2GK1B 3W25A 1KGWA 1JDDA 3EDEA 5C8BB 3WSUA 4JAWA 2DT2A 1UD3A 1V0MA 5IFPA 4P7RA 5CJ5A 4PCSA 1KGUA 4B9YA 5CQ1A 3OLGA 2WAGA 3ZR6A 2YL9A 1F4HA 2GJXB 1ISWA 2VCCA 5CPSA 3NSNA 1ISVA 1QBAA 5KEZA 5BROA 3MSDA 4ML4A 1KBBA 4ZE4A 2ZUUA 2CBJA 2DIEA 1UKOA 5BYWA 4Y7EA 1MXDA 1CWYA 4UFIA 5I3DA 1J0JA 6CGTA 2QV4A 4MADA 1Z32X 4WKAA 1H2JA 1MW1A 2RGLA 2W4XA 3B9EA 1OM0A 1B3XA 1BQCA 3EMZA 2ZX9A 4WLCA 1R85A 2AAAA 3CMGA 3VD7A 1W1PA 4EAMA 1PIFA 4HZ6A 3U57A 2W91A 4HZ8A 3A4WA 1QHZA 2ZOXA 4E8CA 2IUZA 1UWUA 3GNPA 1ZL1A 2F8QA 3ZIZA 1XYZA 5A2CA 5I79A 1PAMA 1WCGA 5A6AA 1LLOA 3MMDA 2WB5A 3L2LA 1V0KA 1NH6A 2Z1KA 3QOKA 2W62A 4MAVA 3WNMA 2VURA 1KQZA 3WQWA 1JZ6A 2EQDA 2WW5A 4D6IA 4GZJA 1BG4A 3WD1A 5E0FA 4HMEA 4TTGA 1WDQA 4QLLA 2E9MA 1ITXA 1QW9A 2VT0A 3AXXA 4XB3A 3ARZA 1ZBWA 4PMXA 1VFUA 3PTKA 2PBOA 4D6EA 1E6PA 1H4PA 3D5HA 1GOQA 3FY1A 3VVGA 4UTFA 3CPUA 2CBUA 3GZAA 4OKDA 5JUVA 2J7CA 2VX7A 3L4XA 3PZNA 1W3HA 3OLEA 4DM2A 1WKYA 1L8NA 3WNPA 3KWXA 3VDCA 3AYSA 3N1AA 3RJXA 5DF0A 5E6ZA 4Z2JA 3AOFA 2CCRA 2EPLX 2CITA 1HKMA 5D9PA 2XIBA 1W1VA 2CETA 1JDCA 3RCNA 3POHA 3SUTA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4XZWA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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