4Y6GA

Crystal structure of tryptophan synthase from salmonella typhimurium in complex with n-(4'-trifluoromethoxybenzoyl)-2-amino-1-ethylphosphate (f6f) inhibitor in the alpha-site and beta-site.
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
268
structure length
257
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Visualizing the tunnel in tryptophan synthase with crystallography: Insights into a selective filter for accommodating indole and rejecting water.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 96
structure length 257
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2015-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4y6gA00
3W07A 2A6NA 4K38A 5L9FA 3NQFA 4JTEA 4NZJA 5CZ0A 3UWZA 2V2HA 5J5DA 3B8DA 3M44A 2RDTA 3LI0A 1DQXA 1TPB1 5BMWA 3FA5A 1SSDA 3SY5A 4ICNA 1GVFA 3MYOA 4IGHA 3CIXA 3NQEA 3MP3A 3DAQA 3KVLA 3W2LA 3N14A 1HUVA 3BW2A 3DU0A 2A5HA 1QPNA 3A5FA 2OT1A 3NM1A 3TW6A 4JEQA 5G2HA 1GT8A 2TMDA 4LTSA 4N9DA 1FWRA 1OX5A 1LBFA 1H7XA 1A5BA 1JQVA 3CIWA 4O57A 2ALDA 3BLIA 1UJPA 3EX3A 3SJ3A 1P0NA 4UNKA 1X1OA 2CLHA 1J4EA 1VR6A 3HGSA 3W7CA 3WK2A 3G1DA 4TO8A 5HWMA 2JBMA 4DBDA 2E6AA 1FXQA 4MYAA 3I65A 1SW0A 1VCGA 2CWNA 4LWWA 2VKZG 3P8IA 2QKFA 2PE4A 1KFBA 1OG0A 1JCYA 3INPA 3W1XA 1LBMA 1OFEA 5HMSA 3IGXA 4EWND 5E0KA 1ZALA 4MZYA 1VRDA 4O4VA 2B7PA 4O0KA 5DN1A 4BI7A 5D02A 4LVGA 1DJNA 1UUMA 3KAOA 1GZGA 5I3GA 1FQ0A 2J24A 2ZRXA 2BWGA 3LV6A 3W7PA 1KW1A 4R34A 3S5ZA 1WOBA 1JQXA 5EMUA 1KFLA 3PBWA 4MUZA 4WJEA 3AJXA 3QRHA 2QCCA 1DQWA 4NVTA 2FPVA 4JTJA 4R33A 1H1YA 1FUYA 3EX4A 4JYFA 4HPXA 4UFIA 4UFMA 5BOOA 2WSQA 2NX1A 3GAYA 1YPFA 2JGQA 3PWAA 3W75A 3JR2A 3LM7A 1G4EA 4GJ1A 1RQHA 4QNWA 1YYAA 3CB8A 3HF3A 3R89A 4IMCA 4AEOA 3C2FA 3PULA 2G97A 3NQ8A 1PCWA 4O16A 1VJIA 1AW5A 2NUYA 1DL3A 4JDBA 1JCLA 3NM3A 4UMAA 2ZZ3A 4MJZA 1EUAA 2B0MA 5FF7A 3S1XA 3LI1A 3NYZA 5CG7A 5KITA 1AW1A 1WDWA 3KOFA 3E02A 4HPJA 2BXVA 2YXGA 2QAPA 3UWVA 3L0GA 5EKYA 1OFOA 4GC4A 4NX5A 1F74A 3SZ8A 1YLVA 1A5AA 4EF9A 2VFDA 3KX6A 3SGUA 2DZXA 1PV8A 1YDVA 2CFFA 2QUUA 4BI6A 3O16A 4XTDA 2DORA 3W6YA 3RMJA 4WX2A 1PHQA 4GWEA 4PA8A 5AHMA 3W7LA 4QISA 3WJSA 2EGZA 3M0ZA 1PL9A 2AAMA 3QF0A 4R7JA 4JIPA 3WK1A 1N55A 2VEKA 3T7VA 1LRTA 4UNLA 3EXSA 5D2YA 4GBUA 2Y70A 1JRBA 1WBJA 2ZZ2A 5D2VA 1VYRA 1Q3NA 1SO3A 4LVFA 3DKLA 3O6CA 3S6DA 2NLIA 2H3BA 1F76A 4EIVA 4OGZA 3P67A 1LM1A 3G0UA 1ME9A 3EX6A 4PL1A 3W7DA 2QF7A 4KFPA 1J2WA 3CHVA 2ZZ4A 3NZ1A 1CI1A 3I7SA 1KV5A 1S5WA 3TQ0A 1TPH1 4O4WA 3NQ6A 4XBKA 1FCBA 3B0PA 1UCWA 1L2UA 1I8JA 4ZQNA 4MZ8A 1KM1A 4NJIA 3UWYA 3IVSA 5D2XA 4UR8A 4XTIA 3W2NA 3IGSA 3HIJA 1D3GA 3CTLA 1WYIA 5CPOA 3VI2A 3W71A 3PUEA 2OZ0A 3VE9A 5AYZA 1I2QA 4S2BA 1JVNA 4A2RA 3W73A 4FNTA 5HUPA 1SPQA 1AL7A 2CLIA 2ATSA 1KM5A 1A5CA 2NXHA 4Q32A 5D09A 3MHGA 3W1LA 2DJLA 2NWRA 1K7EA 3LHWA 1VHNA 5KZDA 3EX2A 1TREA 2VFGA 3S5OA 2A21A 4IMFA 2JGYA 2G95A 2TSYA 3IV3A 2J6XA 5C55A 1FDZA 3FLUA 3N19B 4IPJA 4K7VA 4NJGA 2W6RA 3HG3A 3S0CA 4AB4A 1PCKA 4AWUA 1GG1A 1DV7A 3ZR4A 2DZUA 4OBTA 5C2XA 2J27A 1ZAHA 1I45A 2GVLA 4IX0A 2Z1BA 1VLIA 4N9CA 4MLRA 3W1PA 1S3HA 3O6DA 1XFBA 4K8HA 4W9TA 4AAJA 1M7OA 4QM1A 5IBXC 2QCDB 3LTSA 3TXVA 1G7UA 4O1DA 4OQVA 4Z1AA 4NJJA 1I2OA 3OEXA 3OA3A 4HNUA 5AHNA 3P74A 4ALDA 3DHFA 3N9RA 3BG5A 1L6WA 3QMTA 3CLMA 1UASA 4A22A 1W0MA 3FJLA 3QMSA 1ZFJA 1TPEA 1CX9A 3WK3A 2QCMA 3SW6A 2I1OA 1LOSA 3ZWTA 4UFHA 1NF0A 2CZDA 4FO4A 3W1TA 3C3NA 2JKPA 3A24A 4FXRA 5DXXA 3TFXA 3GDKA 4IQLA 1YDNA 2CLOA 1MEIA 3YPIA 3HGRA 1ICSA 3EWBX 1NAL1 1LDCA 4KFNA 4N02A 4XKYA 3EEGA 4RXFA 1H7RA 1QFEA 1OFDA 3TQVA 1QAPA 1GPWA 3LERA 4JX4A 5CSSA 4JXCA 4L4LA 4OV4A 4ZQRA 2VC6A 3MHUA 2Y6ZA 3LCLA 3PR2A 3B06A 3NVTA 2NUXA 3S1UA 1XI3A 3O15A 4Y6GA 1EWEA 3IEBA 4D2JA 1XKYA 1SO5A 1FDJA 3DENA 3GKAA 3P62A 1BWKA 1KM6A 1VS1A 4GUIA 2E6FA 1Z44A 2FB3A 2QAFA 1OFPA 2E5CA 3W2JA 1SW3A 2CZEA 2E6DA 1W5OA 2WPBA 4N4QA 2NZLA 5I3JA 3RU6A 1TRIA 2YCEA 1W37A 3GDRA 4Z0JA 3QSTA 2WNQA 3O05A 3TH6A 3N34A 1ME7A 3DHDA 2QCLA 2E77A 1K7FA 1P4CA 3I7RA 2WNNA 1EA0A 4H4IA 2Q3OA 2F84A 3PVFA 4XUGA 1XL9A 5K4ZA 2C1HA 3LCHA 2Y7DA 5G1YA 5D2WA 5K9XA 5DCBA 4FNUA 1OX6A 2YSWA 1M7PA 2Y62A 4M7TA 2IQTA 4O1CA 2DZSA 1K8ZA 3TDFA 1TJPA 4NU7A 3TE9A 2RDUA 4JS3A 2CLEA 3DH7A 4EOUA 1PS9A 5DBUA 4PC8A 4LVDA 3N2MA 3L21A 2E09A 3M16A 3R13A 4RR4A 3CPRA 2WSRA 3LGEA 4K36A 3M5ZA 3L2IA 3O1NA 4HNTA 3P82A 3AO0A 4QSHA 4CCCA 4LS2A 3BLEA 1J5TA 4NXKA 3B05A 3P5YA 4LV4A 1O5KA 2C19A 1TTJA 2DZWA 4TIMA 3TROA 3FKKA 4GFSA 2H8XA 4DQWA 2VELA 4NUWA 2Y85A 3G0XA 4WXZA 2QUVA 1GYLA 4RZ6A 5CSRA 3BVJA 3LXCA 1G69A 4FF7A 1G7VA 1TIMA 5EYWA 5LHEA 3FYPA 2Y7FA 3PB0A 3MBFA 3HG4A 1EUNA 1KFJA 4OHQA 5TQLA 4LOCA 5EL1A 4WY0F 3W2KA 3ELFA 1P1XA 2KZHA 4GNJA 1ONRA 4BWLC 3RF9A 1H61A 3CEUA 1OYAA 1KTNA 4XQ6A 3LLDA 3USBA 4BR1A 1ME8A 5SWUA 2A7PA 2XN1A 4MIMA 5DLCA 1IXOA 2C6QA 4LRTA 1U5JA 1XBZA 2DZVA 4MLJA 4AHPA 3M9YA 2QUTA 4BWLA 3KVJA 1E51A 1YXCA 4UXDA 1JUKA 3I7QA 3IVUA 5F4WA 5LNSA 3G1YA 4HNVA 1OVDA 2A4AA 1OF8A 4IXXA 1AG1O 2ZZ5A 2EPHA 4LV9A 3QW3A 4UC5A 2YW3A 1XCFA 5TIMA 3IIXA 3HGJA 2A7RA 2PC4A 3IRDA 3S5YA 1EEPA 1R47A 1SZFA 1NEYA 2C3ZA 3G1SA 5G4WA 3TUUA 4IMGA 3W2UA 3W87A 2ISSA 5C5YA 1DOSA 1DHPA 4JYEA 2Z6IA 5G2IA 2QCHA 4YWIA 4XBSA 2H90A 1C9DA 3TQKA 3PM6A 1UB3A 4JTUA 1KFEA 2E5BA 3RLVA 2ISVA 2NWSA 2YYUA 3QC3A 2QDHA 4NNCA 2ZRZA 3R12A 3BGJA 5F2MA 3ANYA 4ZQPA 5DY3A 1H7WA 5ABTA 2J88A 3FYOA 5FF3A 3LCGA 4IJBA 4MFDA 3BW4A 1M5WA 1MEHA 1RR2A 3LCIA 5K2ZA 2DJXA 4AHQA 3TJLA 3PSVA 5D38A 2X16A 3DFPA 3Q94A 1GVRA 1FWNA 4A21A 1AW2A 4UTHA 4MFEA 4LC6A 4GXMA 4EF8A 3W88A 5LNRA 3LOTA 5HNRA 3W83A 1Q6LA 3GLCA 2YW4A 4NX0A 2VFEA 2A1YA 2QCFA 2R14A 4HNNA 4M6QA 1A53A 4AF0B 2WO5A 2VFIA 1FWTA 1RPXA 1FBAA 3C52A 5F4XA 3LCWA 2J9XA 4ZZ9A 4FB7A 3TK7A 1KM2A 4UFLA 5AHEA 2C16A 4X2RA 4E38A 2DU2A 3NDOA 2AQWA 3QW4B 4A2SA 1SO4A 1SR9A 4ZQCA 4MOZA 2GQAA 4X3ZA 3PAJA 3I6RA 1IXPA 3QSRA 4ZMGA 4O12A 3LRMA 1DBTA 4FXSA 4FX8A 5HULA 1QPRA 3HPSA 3ABOA 4RX0A 3IIOA 4UTIA 4O13A 5AHIA 3CWOX 5FF0A 4N4PA 3V75A 4DF0A 3TXZA 5LNVA 3T4CA 2ATMA 2DZTA 3N73A 4OWGA 4IXHA 3GXNA 1W5NA 2GPTA 2R8WA 4MY9A 3MO7A 1BTMA 1GVOA 4M5PA 3GXTA 3DFNA 5AHFA 2CZ5A 4JDYA 5CZSA 3HG2A 3W9ZA 1TMHA 3M6YA 4JTHA 3VE7A 1YTDA 3OVQA 1DVJA 1TTPA 5AHLA 3SSJA 2RFGA 1S5TA 3DFSA 1ALDA 3UPBA 2GQ9A 4HSOA 3UXAA 1YTKA 2YR1A 2P0OA 1ADOA 4JIQA 2FLIA 1TPFA 2CZFA 4MKNA 3TAKA 1WX0A 4NNBA 3HOJA 3U6WA 1X1ZA 3FFSA 1G67A 3MJYA 4OT7A 4IMDA 1H7PA 3BW3A 4UTWC 3W2MA 3W3OA 2ZTJA 5HINA 4Z1CA 3ZWSA 4PH6A 4AWSA 3W7HA 5F1VA 1ZNNA 2CU0A 2CW6A 4QJ1A 2WSYA 4K8EA 4LU0A 3GB6A 4UTWA 5EY5A 2ZZ7A 3GXPA 4OV9A 1MEWA 1SO6A 3QZEA 5HR6A 3MMTA 4JTFA 1WOAA 4M6PA 3W1AA 3H55A 3WJZA 3MP5A 5A5WA 4JYDA 3N9SA 3NQGA 2QCDA 1I4NA 3NL5A 1FY6A 3BG3A 3A23A 4UTJA 2PURA 1SU5A 2B7NA 4K39A 2O7QA 4RK8A 2G96A 1V7YA 4CLMA 2DZPA 4ADSA 1H5YA 7TIMA 1CW2A 3FKRA 3KHJA 3A22A 2E68A 2VXNA 1G4SA 1KM4A 3HG5A 2FTPA 4FIRA 2VEPA 1ZY9A 2Q8LA 3SFKA 1L6SA 3ATYA 2ZRVA 5KMYA 3TJXA 1YXYA 3NZRA 3QJAA 4N6FA 3M47A 5K3VA 1OFRA 1I2PA 1YPIA 1P5BA 1QCWA 1O4UA 3GZ3A 3TCEA 3L66A 2V5BA 1F5ZA 3DKJA 3NOEA 4HSNA 5D2TA 5KSWA 1FWSA 2GVJA 3U2OA 4IOTA 1SW7A 3MW7A 3KRUA 3W7IA 4ML9A 1T8XA 3W72A 2V8ZA 1LZOA 5LGZA 1W54A 2V5LA 1RVGA 3S1WA 3SI9A 3W7NA 3KRSA 4O8RA 4WZHA 1SQ7A 2WNZA 2YX0A 1T96A 3HJZA 1F2JA 3KVKA 1XXXA 3DFQA 4MYXA 5AN7A 3NQDA 2ZCGA 4YMZA 1KFKA 1TRDA 4O28A 3T78A 3NPWA 2OX1A 3QQ0A 3L5LA 1TV7A 4CQAA 2A0NA 2EHHA 1JJKA 3B04A 2ZZ6A 2ZTKA 4O52A 3CWNA 4N9EA 3TR2A 3EWZA 3L5MA 1WBHA 3BGGA 3CM4A 3NXFA 3RK8A 3UPWA 1EPXA 1TPDA 3P7YA 3G22A 1EX5A 1W56A 3L0KA 2GQ8A 5D05A 2Y89A 1YDOA 5KZMA 1A5SA 1GVQA 1XUZA 5CKSA 4DPPA 2QJIA 3P61A 4IWWA 1T0OA 3TSMA 3QEZA 3EWWA 3PY2A 2BLEA 3HGOA 5IBXA 3W7JA 2ZA1A 1TV5A 1X8FA 3SECA 1R30A 1R46A 1H60A 1IGSA 3CC1A 4UMCA 2EF9A 4UTTC 3OVRA 2P1FA 2BX7A 3DGRA 3I68A 1WXJA 2R91A 4DXVA 4S2CA 4Z0SA 1TYGA 1EP3A 3CQ0A 4I7WA 4CNNA 2I9EA 1ZHAA 3PC0A 1XBVA 3DXIA 3L68A 4A3UA 4ONVA 4M19A 5CZJA 1XDMA 2Y61A 1Q6RA 4JICA 1OK4A 4CNOA 3LX9A 3L67A 5DBTA 2ISWA 2GJLA 2NX3A 5I3HA 2PRHA 2ZA3A 3HMJG 1PVNA 2OT0A 1QWGA 3THQA 3SR7A 3MP4A 1IIHA 1VYPX 4FNQA 3KFTA 2YYTA 3S1VA 1OYCA 4O14A 3M43A 1THFD 5K9DA 4UTKA 3WJYA 1TO3A 2Y7GA 3E9AA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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