4Y7E | Genus

Total Genus 117

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	117
sequence length	302
structure length	302
Chain Sequence	VTGLHVQGGRLLEGNGNDFVMRGVNHAHTWYPGQTRSLADIKALGANTVRVVLSDGHRWTRNGPADVAAVIDRCKANRLICVLEVHDTTGYGEEPAAGTLDHAADYWISLMDVLAGQEDYVIVNIGNEPWGNTDPAGWTAPTIAAVKKLRAAGLAHTLMIDAPNWGQDWQGVMRADARSVYEADPTGNLLFSIHMYSVFDTAAEIDDYLEAFVDAGLPLVIGAFGGPPDQWGDPDEDTMLAAAERLRLGYLAWSWSGNTDPVLDLAIGFDPDRLSGWGQRVFHGVHGIGETSREATVFGKLA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The loop structure of Actinomycete glycoside hydrolase family 5 mannanases governs substrate recognition pubmed doi rcsb
molecule tags	Hydrolase
source organism	Streptomyces thermolilacinus
molecule keywords	Endoglucanase
total genus	117
structure length	302
sequence length	302
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2015-02-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4y7eA00

5A6BD 5BXTA 1KGUA 2CBUA 3SCQA 3AIEA 4J27A 3RMEA 3RILA 4HPGA 2JEPA 3FXYA 4U33A 2A3EA 1BSIA 2VRJA 1EHNA 1QHZA 2JIEA 3RM9A 1W2VA 3WKZA 5ABGA 4FLSA 3AMGA 4W5ZA 1GQLA 4P7QA 4ZXOA 1QNSA 4NRSA 4W85A 4LQ1A 1VJZA 3CHFA 3WF2A 1PBGA 1Z32X 8CGTA 3WNKA 4AWEA 1P6WA 4XB3A 3W81A 3SCRA 3OLGA 1DWHM 4BCEA 1BYCA 4PTVA 3ZSSA 5DT5A 3MSDA 3PZUA 2CEQA 1BHGA 3WDIA 2CHNA 1YHTA 1NWRA 1LF1A 1QBBA 5M17A 1B30A 1WDPA 3VDHA 4E8CA 1LWHA 2XM2A 2ZX9A 3VNYA 5HBFA 2W66A 1E71M 4LYRA 4DWSA 3PZNA 2BY3A 4CN1A 3GM8A 2O9OA 3EDEA 1J0ZA 2CBVA 4GPNA 4EAMA 1KQZA 3CPUA 5I79A 1JYVA 3CGTA 2D20A 3LPOA 4J3UA 5IHSA 1B3XA 1C3FA 1JAKA 4ML4A 3WENA 3NYDA 1UQZA 2C8NA 3ARPA 1GJWA 1HVQA 3WF3A 3DECA 2C0HA 2ZUSA 2GFTA 1CXLA 2FHCA 2WNWA 3KWXA 4UQAA 2EPOA 2WZHA 5EB8A 2YKKA 1DEDA 4AZ7A 9CGTA 1H3GA 1DP0A 2Y24A 5A6AA 1M7XA 3WD2A 1FA2A 4PTXA 1EGZA 3N15A 3NDZA 4PMNA 3J7HA 2O9TA 1R86A 1J0HA 1E6RA 4DM1A 1U30A 1J0IA 1C7SA 2TAAA 3DYMA 4MDPA 3MMWA 1ESWA 2CYGA 1QI2A 3AHVA 1QVBA 3WF1A 4PMDA 2J7EA 1JFHA 3OLIA 1UR0A 1FH7A 2ZXAA 3OZPA 4F9DA 2X2YA 1C7TA 1WNOA 1TG7A 3PZ9A 1CXKA 1KWGA 4CD5A 3M7SA 1SMAA 1UD3A 5GNYA 5GQBA 4C7GA 4OBRA 1UKQA 2ZUNA 2WK2A 1KCLA 4V2XA 1UWSA 7TAAA 3OZOA 4ATLA 3AS0A 3L4XA 1VENA 3L4VA 2PI6A 4MJ4A 1BVNP 2G8ZA 2WC3A 3AI0A 2X1IA 1KB3A 5FL1A 4UOQA 3ARSA 1J01A 4UQBA 1KCKA 4MNJA 4AMCA 4ATDA 3MUY1 1HF6A 2WB5A 5E70A 1KBBA 1U33A 1CECA 4DUVA 3AFBA 1E40A 4LYQA 2BXZA 4J3XA 4R27A 5A2CA 4PBGA 4UFJA 5JBEA 3WQ5A 3QGVA 3T2OA 3ARYA 3UG5A 2YA2A 4Z2JA 5HXMA 2ZX6A 4NRRA 1Y7VA 3A47A 3AZRA 1L0PA 2EPMX 1V08A 2V38A 1ZL1A 3AOFA 2D24A 4OJYA 4AZIA 4AZCA 1E4MM 2FGZA 2WMFA 4AIEA 1MYRA 2DH2A 1R85A 3WD4A 2VZOA 4D6DA 3BSHA 2XVKA 2JFEX 3RPMA 5I24A 3AXHA 1M01A 3CZLA 1OCQA 2ZIDA 1H0GA 1C91A 5DT7A 1V3HA 2ZWYA 1OIFA 1ITXA 4W87A 3UETA 1UWRA 4TX8A 3VDAA 1OINA 1JZ3A 4QP0A 1PIGA 2J7GA 3AIWA 1D7FA 1MFVA 2J79A 2NW0A 1NP2A 1CXHA 2OSYA 5A8PA 4DM2A 1OIMA 2G3JA 3MU7A 2VURA 3OIHA 3WQWA 1MQRA 4MB3A 3D5HA 4CVUA 1ZBWA 2WXDM 3CTTA 3WMSA 2X0YA 4BQ5A 1VB9A 5A3HA 2WYSA 3UCQA 1HJUA 1X6LA 4CCDA 3AHYA 2CERA 7CGTA 3SUUA 1I1XA 2XVLA 4JFWA 5A8OA 8A3HA 2YOCA 1W32A 2WMIB 3HU7A 4EK7A 2WAGA 2OLHA 2PWEA 4MNLA 1W1VA 3UG3A 1UZ1A 3CZEA 2IUZA 3DHPA 4LXFA 4PMUA 4MADA 2OSXA 2GSJA 4L4OA 2BVDA 2ZX7A 4UQ9A 3K46A 4KMQA 3WEMA 1IZKA 2CPUA 3N9KA 2VX5A 3M07A 4ZFMA 1JF5A 1EQCA 2WCGA 3VILA 5A1AA 3RJXA 1V03A 1UZ4A 3VGEA 2XWDA 4UZUA 2XUCA 3GDBA 3ZSTA 3VX1A 3SCPA 3GH7A 3WMCA 4LGXA 2E8ZA 2RGMA 3VIMA 1W9PA 2QHAA 4OUEA 1WZAA 3ZQ9A 3GXFA 4AEEA 1BAGA 2YBTA 2EPKX 1W9DM 3MV01 3MO4A 1KXHA 5DFAA 3PZOA 2BY1A 4D6JA 6CGTA 4UNIA 1E56A 2WKLA 1W1YA 4XUYA 3G6LA 3WDPP 1H1NA 4HMEA 3TONA 1GQIA 1EOMA 4AYSA 2YL6A 3VUPA 5JIWA 3O6AA 3KL5A 1UH3A 2XYLA 1E1EA 2JALA 2C7FA 4U2YA 1W9XA 2ZE0A 2XG9A 4DUXA 4LX4A 2XVNA 2XGBA 1UKOA 4GQQA 3WUBA 3L4ZA 2O9RA 4RL3A 4AIUA 2E9MA 1EHAA 1TCMA 5I77A 3HJEA 3QHOA 4ACYA 3EBVA 1H5VA 2NSXA 1Q6DA 3ZJ6A 4J3VA 2W91A 2DT0A 5FOOA 4P8VA 2J4GA 1WCGA 3SCUA 4E8DA 3ZT6A 4GQRA 2VL4A 1XSIA 5DMYA 1PIFA 4J3SA 3SCVA 2PWFA 5JUVA 1MW3A 3GBDA 2D1ZA 1BQCA 3AS3A 3WEZA 3WFLA 4HA1A 1B2YA 1HKKA 3BCDA 3TTOA 4PUDA 3VTRA 2J62A 2WMHA 2BV9A 4P8WA 2X0HA 2W92A 1OBAA 3GH5A 4RE3A 2VZTA 3ARZA 1ZBCA 3ZO9A 3BAWA 4NI3A 3EMZA 3WDJA 1M53A 2ZUWA 3ZJ8A 5A2AA 4R5EA 1JZ7A 4GI8A 1JXJA 3VD3A 3WNOA 4NF7A 3GYCA 1GOQA 1V6YA 5I6SA 3TOPA 1AQHA 1HJVA 2WVTA 1BLIA 1KXVA 1LG2A 1FH9A 3SCSA 1UD5A 1ZBKA 1ISYA 2OSWA 1NP0A 1UR4A 3ZM8A 3PBGA 3L4YA 3MMDA 4Q7NA 3WELA 1Q6CA 3W6LA 4Z2KA 2WWCA 5ABFB 4AZBA 4KGLA 4UFLA 1UA7A 4M8UA 2ESCA 1OGGA 3BLKA 4LYPA 5ABHA 4FK9A 1J0YA 3PZIA 3VD5A 4TUFA 3M6DA 3WIJA 3LPGA 1OM0A 4GO9A 1LL4A 5BXPA 3DYOA 3WN6A 1J9YA 3ZJKA 4TOQA 3PTKA 1GCYA 3VIJA 3NJ3A 5E9AA 3N11A 5E0CA 2B31A 1ZJAA 1XYFA 3FAWA 4MNKA 3VPLA 4D6FA 2GJXA 4BA0A 2WC7A 1D3CA 3IJ9A 2Q8XA 4H8UA 4Z2HA 2BY2A 2G4FA 3ALFA 3SCOA 1GQKA 3GXDA 4DWSC 3MSGA 1B0IA 3B9AA 1E4NA 3MUAA 3TA9A 2J77A 1H41A 2VO5A 3FHQA 5GPRA 1BPLB 1W91A 4QLKA 2QPSA 2W61A 5BRPA 1E4LA 2YBUA 2V3DA 1TVNA 1I1WA 1XHGA 4PMYA 3UESA 1CGYA 1MVYA 4F9JA 5A69A 4UQCA 2WLYA 2D3NA 3K8LA 4H8HA 2FGLA 4W88A 3CLWA 4HP5A 5D9PA 3AIUA 5D9NA 4D6EA 2BFGA 3TTQA 4IPLA 1TA3A 5BYWA 2OWXA 5HPCA 1LWJA 2AOSA 1XCWA 1GHRA 2WC4A 1GOKA 2Y8KA 2WMGA 2DT1A 3F5KA 1MQPA 3TP4A 3WNNA 5M03A 1WKYA 3O9NA 4CN4A 4KWUA 1UKTA 1CNVA 4XZBA 4UOZA 4J28A 3LPFA 1GOMA 4EANA 1JNDA 1FP8A 4D6HA 1XRVA 4X0VA 1NWUA 3HN3A 1V6WA 3W4RA 4W7UA 2HISA 2PF0A 3W28A 1SR0A 1WPCA 2V3GA 1QI0A 1YQ2A 3NDYA 2GK1B 1UD2A 4JHOA 1V02E 3B9EA 5KEZA 4H2CA 1MWOA 4IM4A 3VD7A 1PX8A 2ZX8A 1DWJM 4KRUA 1UD4A 2YJQA 1R7OA 3PTQA 1VEOA 1BYBA 1JYWA 1MFUA 4AIOA 2IXUA 1IZJA 1GHSA 2A3CA 1TFVA 5DF0A 1VFUA 2DDXA 1GPFA 5C70A 4UR9A 4OOZA 2PWGA 4M81A 4TTGA 3PHAA 1B3WA 5AYIA 2UWFA 3AIVA 3NIYA 5A6JA 2VT0A 3SCWA 3WFZA 5KZ6A 1JZ5A 1IT0A 4CCCA 1UH4A 1MW1A 3W26A 5A6BA 2BY0A 2NT1A 2XFYA 4W93A 1UR1A 3BH4A 2IXVA 4URIA 3SUWA 4W8BA 3O2LA 1US2A 1GJUA 2WZEA 3MV11 2F2HA 1PEZA 3M46A 3U5YA 4P7NA 3BXWA 5A2BA 3WF0A 2ZWZA 4OIFA 5E09A 1DTUA 4AY1A 3I3EA 1CIUA 3BC9A 3OA5A 3WEOA 4HU0A 3OGSA 3JUGA 5AC4A 4W7VA 1TR1A 1OT2A 1J11A 4D1IA 3T0BA 5ABEA 2WVVA 1V0NA 3KL0A 4OKDA 4QCFA 1NQ6A 1VEMA 2XM1A 4PN2A 4DUWA 1W9VA 4MDOA 5D8ZA 4UFMA 3MUIA 5TD4A 3THDA 5FL0A 3AROA 1E3XA 4CUCA 1B9ZA 2XVGA 2ZUTA 4D6IA 1E6NA 3AMKA 3PZVA 2WHKA 1OSEA 1UYQA 4JZ5A 4WJXA 1E6PA 1WZLA 3A6OA 2J7HA 4JL1A 3BAYA 1CXFA 1F4AA 4W89A 1PZ2A 3GXIA 2HVMA 3BAKA 5I3DA 1OB0A 1QBAA 4D6GA 2XTKA 1RP8A 6A3HA 2WHJA 2EPLX 2YL5A 3VDBA 3IJ8A 1PX3A 3WSUA 2EO7A 2YLLA 3EDDA 4D1JA 5I5RA 1BYAA 3F5LA 1E0WA 4A4AA 4AZHA 4B3KA 2WPGA 2J47A 4BS0A 1O7AA 1ISZA 1DHKA 1M03A 3WNLA 1GQJA 3MKKA 1EA9C 2PB1A 3I3DA 3W6MA 2ZUVA 4GINA 1NARA 1ZS2A 2PBOA 4PMOA 4AW7A 2UY3A 3THCA 1C92A 3UR8A 4ACZA 5CLWA 1CDGA 1KBKA 3BAXA 3WH9A 4IISA 3IK2A 4D72A 2DEPA 1KGXA 3PZTA 2E9BA 2EEXA 5A6SA 3VU2A 1FFRA 1CZ1A 5A6KA 4PCTA 1LQ0A 2XSAA 4FF5A 2WCAA 3W53A 2ZXDA 3WD3A 3CHDA 3A4AA 3UR7A 2BVYA 1MW0A 4TVUA 4UFKA 2QPUA 4PMRA 1UD6A 1VEPA 3ZJ7A 2WVSA 5CPSA 4DWSB 1E72M 1N82A 3VM7A 1JIBA 3EMCA 1W2PA 3CUIA 5A95A 1TE1A 4CD6A 1WB0A 5BXRA 2D3LA 1G01A 2BHUA 1E73M 5IXEA 3AIRA 3K8MA 3ARWA 1E9LA 1EDTA 1B3YA 4PMZA 1DWGM 1ZJBA 2WSPA 5F7UA 1TVPA 2WBGA 3II1A 2V5DA 1QW8A 4B16A 2E3ZA 3UEQA 3VGBA 2O92A 2DIEA 5CJ5A 2EPNA 2VI0A 3S6TA 2G41A 3AIQA 3CIVA 4HOZA 2BHYA 2VR5A 4A3YA 3RM4A 1BYDA 3AICA 1CEOA 4UOJA 1E43A 3AMCA 3AHZA 3OGVA 3RM8A 1HP4A 2DH3A 2AAAA 3PN8A 1R87A 2XWEA 2PWDA 1UUQA 1UWTA 1E6XM 1EO5A 3U7VA 3T2PA 4QAWA 4K68A 4HZ6A 1OGBA 1CGTA 4CU8A 2UY5A 2VX6A 3WQ4A 2XPKA 5GNXA 4XX6A 2JIWA 3LPPA 4CCEA 5CGMA 3LMYA 4B3LA 1GZJA 1XH0A 3CZGA 4JKLA 1GW1A 4NSBA 3DYPA 5CXPA 5EFDA 1AVAA 1KFWA 5FCZA 3WL0A 4MTVA 1UQYA 2WCSA 4JL2A 3AIBA 5D9MA 3QHNA 2VJXA 1J18A 4EE9A 1C8YA 4GZEA 4C7FA 1CGWA 5LA2A 2E40A 2D22A 1JI1A 2XFFA 4HA4A 5IFPA 3CO4A 1VRXA 3WQ8A 1LLOA 1VBUA 3AQUA 3CHEA 3GTNA 1G1YA 2X09A 2XVPA 3A4WA 2WVUA 3WMBA 1E6SM 1R7AA 4B15A 5M3WA 4JKMA 1HJQA 1V3LA 4M24A 3WD0A 5CGTA 2FH8A 3IAQA 3G6MA 4TX6A 4KH2A 4D71A 5E6YA 1AQMA 3WUEA 1CXEA 2YDSA 4AZCB 2E0PA 3AHTA 4P7RA 1BF2A 4YHGA 3A4XA 3VMNA 1RPKA 3MMUA 1NH6A 1V02A 3WY1A 4AD3A 1E70M 1PAMA 3BCFA 4WKFA 2F8QA 4D6CA 3WNMA 1V3KA 1UR2A 1XCXA 3WH7A 4ZEPA 1NOFA 3SURA 3AHXA 1JZ4A 5CSYA 3U7BA 3W24A 5LA1A 3FY1A 4JFSA 3PZMA 2WANA 1O6IA 1JXKA 1QW9A 4E2OA 4JAWA 1WAWA 4F8XA 3CUFA 4M82A 4PSPA 1QOXA 1ECEA 3BMWA 1KR0A 2W5FA 4QLLA 2W63A 1PZ3A 4W8AA 1V3IA 1VFMA 2OWWA 5IFTA 5EFFA 2UY2A 1OT1A 1BGAA 4Q22A 4QCEA 2ZOXA 1WDSA 2CETA 3QR3A 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1E55A 5AC5A 1C93A 1V6VA 3VIPA 4TVCA 3AXXA 2ZXBA 2EBNA 1SMDA 1JF6A 1XYZA 3AS1A 1KXQA 4AXNA 3WQVA 4WK9A 2QMKA 4Z2IA 1KR1A 1J12A 1LL7A 2J75A 4HU8A 3BAJA 3SUTA 5CPTA 1OWQA 1V0KA 4TXEA 4W84A 2VC9A 3ARVA 3W38A 4OBSA 4X9YA 3L4TA 3AS2A 3GNRA 1GUVA 3CZ8A 2YLAA 3K8KA 4J7RA 1QI5A 4UQEA 2DIJA 4MB5A 3CZKA 2QV4A 1RH9A 1W1TA 4M80A 5I78A 1H0IA 4S3KA 4MNMA 2OWCA 1OGSA 2XIBA 4GIAA 2WMIA 3HMCA 1FOBA 3NSXA 5AYBA 2DSWA 3WUFA 2VVNA 4JIEA 2CNCA 3WH6A 1EO7A 3ARQA 1NM9A 1UWIA 4ZENA 1E0XA 3K4AA 4U5KA 4HA3A 3KE0A 4Y7EA 1Q6FA 4UFHA 4U2ZA 1HKMA 1JDCA 1K9FA 1XGZA 1WE5A 4IPNB 2E4TA 3D3AA 2AMGA 1EQPA 4U5IA 1V3JA 2WSKA 2Z1KA 3AZTA 3ARRA 1QHPA 1DWIM 5LYRA 3SUVA 2PBGA 4Z2GA 2UY4A 4OOUA 2DQXA 4GI9A 4BQ4A 1KXTA 1ISXA 4RE2A 4JKKA 3VIKA 2X05A 1GNXA 3W25A 2D23A 1VBRA 3VIFA 4QDMA 4V27A 3T08A 3W29A 1FFQA 1HN1A 4B9ZA 2VVSA 1V0LA 2Z1SA 2GJXB 3BLPX 4F66A 1HJXA 4HZ7A 1XSKA 1US3A 4GKLA 3VX0A 6TAAA 2VOTA 1MW2A 4XV0A 1DWAM 2YDRA 3OLDA 1UR9A 4MJ2A 2OYLA 1JYNA 3RIKA 1BFNA 4EKJA 3NUKA 1FHDA 1QI3A 2VCBA 5D8WA 3UERA 1UHVA 3ARXA 4W5UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4Y7EA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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