4Y7E | Genus

Total Genus 117

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	117
sequence length	302
structure length	302
Chain Sequence	VTGLHVQGGRLLEGNGNDFVMRGVNHAHTWYPGQTRSLADIKALGANTVRVVLSDGHRWTRNGPADVAAVIDRCKANRLICVLEVHDTTGYGEEPAAGTLDHAADYWISLMDVLAGQEDYVIVNIGNEPWGNTDPAGWTAPTIAAVKKLRAAGLAHTLMIDAPNWGQDWQGVMRADARSVYEADPTGNLLFSIHMYSVFDTAAEIDDYLEAFVDAGLPLVIGAFGGPPDQWGDPDEDTMLAAAERLRLGYLAWSWSGNTDPVLDLAIGFDPDRLSGWGQRVFHGVHGIGETSREATVFGKLA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Streptomyces thermolilacinus
publication title	The loop structure of Actinomycete glycoside hydrolase family 5 mannanases governs substrate recognition pubmed doi rcsb
molecule keywords	Endoglucanase
total genus	117
structure length	302
sequence length	302
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2015-02-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4y7eA00

3MUZ1 3CIVA 2EPNA 2CKSA 2GFTA 2XPKA 2WZHA 5A2CA 3T2PA 2GJRA 5A8NA 1XH2A 2WWDA 1J0KA 1AVAA 6CGTA 1KR0A 5BRQA 4D6DA 1U2YA 2WB5A 1RD6A 8CGTA 1CNVA 3NSNA 1EO7A 3L2LA 4JZ5A 5C70A 4EK7A 4TX6A 2PWGA 4WIWA 2VOTA 5D9PA 4PMDA 5FIPA 3TP4A 4UTFA 4JIEA 1CWYA 4J3UA 2RGMA 4KWUA 5TD4A 1MFUA 3WDPP 3N1AA 3VNYA 1XSKA 1UD2A 2Z1KA 1TVNA 4H04A 3TONA 3UG3A 1Y7VA 2B31A 4RE2A 2ZICA 1CXKA 2J8GA 1W1PA 1C3FA 1NWUA 2QHAA 3IJ8A 1R85A 3WIJA 1W3JA 2GK1A 1ISYA 3BAKA 2ZWYA 4GXPA 2BXZA 1NP0A 3KWXA 3B8SA 4MPKA 3WH6A 2JIWA 4HMCA 2VT0A 3WEOA 4FK9A 3PTKA 2W5FA 1B2YA 1E6SM 5DFAA 3O2LA 5A8MA 1Q6CA 4M1RA 1OB0A 2DT0A 1E55A 2CITA 3VM5A 1GORA 2DT1A 3F5LA 3WNNA 2VCCA 1GOIA 4ZXLA 4A4AA 2YLLA 3PZMA 4DWSD 5CGMA 1UD8A 3N9KA 2D1ZA 4Z2HA 3UR8A 5DEZA 3TTQA 4EKJA 4P8WA 3DECA 2DPEA 3MANA 1KGUA 2JFEX 4OOUA 3W81A 4AZBA 1L8NA 2BVYA 1H0IA 1WCGA 1VAHA 1CGXA 4PCSA 2WVTA 1PIGA 1W32A 2ZXAA 4GQRA 3GZAA 2YL5A 1E4NA 4PCTA 3VTRA 3EDDA 2O9RA 4W8AA 3THDA 4PMXA 4XB3A 3BAYA 1JYNA 2XM2A 1ITXA 1ODUA 2WMIB 1DWJM 4PRWA 1QW9A 2J25A 3AXIA 3W29A 1V3HA 3THCA 1JIBA 4AD2A 2YIHA 3BAWA 4XX6A 3CZGA 2V3DA 1B3XA 2YA0A 3WH9A 5DMYA 4PMYA 1K6AA 3AMLA 4PMQA 3WH5A 4WSKA 4E4PA 2VJXA 2A3BA 3B9EA 2WCGA 1GOMA 4HZ7A 4F66A 2OSYA 2OWXA 1E71M 1JNDA 4D6JA 1X1NA 1JD9A 4WSJA 3KL3A 3RM4A 4AZGA 4P7RA 5D8ZA 1ZBKA 3TTYA 1TZ7A 4W88A 4FLSA 2VVSA 4GZEA 2W91A 1AQ0A 5A6BA 1TFVA 4W89A 5E6YA 5D9MA 3SCWA 2DH3A 4E8DA 1NOWA 3JUGA 4JFWA 3L2MA 1OWQA 4BQ3A 1JZ2A 4AZCB 1EQPA 1MW3A 3EBVA 2VO5A 4UFIA 4AD5A 4D1IA 2Y2WA 4URIA 1KQYA 1K9TA 1OD0A 2AAAA 1UKSA 3FXYA 4CUCA 3ZSSA 1OGGA 4QCEA 1C7TA 1MYRA 1LWJA 1PZ2A 2TAAA 4A3HA 4M24A 4KRTA 4GI9A 4P8VA 2ZXDA 3AIBA 1W9BM 3UEQA 3CZEA 3D5HA 3BSHA 2F61A 1E15A 4W87A 3T0DA 1MWOA 2W67A 4X0VA 2BHYA 3T0BA 4NF7A 1PX4A 3F4VA 3PZQA 4C7GA 1KWKA 4PSRA 4PTMA 1JF5A 4JFUA 4H2CA 2JEQA 4R27A 3AQUA 2GJXA 3O9NA 1J9YA 1LL7A 3WNPA 1V3MA 3SCOA 4V27A 5CZKA 1G5AA 3AS0A 2CBVA 1PJ9A 3A47A 2D3NA 1MQPA 3CZ8A 3RM8A 3K46A 1C91A 1IZJA 4KMQA 2WVVA 1GPFA 3EMCA 4J3XA 3CTTA 1HF6A 2JF6A 4U3AA 2BY1A 4CD8A 1E6QM 4WKFA 2CBIA 2A3EA 1LL4A 5CPQA 3AMGA 3WNMA 5IDIA 3T09A 1VFFA 2WMGA 1UR4A 1EA9C 1JI2A 2E4TA 1CLXA 4OJYA 1BVZA 2E9MA 4PUEA 3BC9A 2VTFA 2X2YA 2EPKX 3BAJA 4UOJA 2PI6A 4CGTA 2WCSA 5A6JA 4D6CA 1JI1A 4YHGA 2BY0A 1SFSA 5AYBA 1VJSA 4JHZA 1VBRA 1V3IA 1N82A 3ARQA 9CGTA 3L4UA 3U5YA 3EDFA 3IAPA 3OGRA 1ECEA 2PB1A 1NARA 1UD3A 2FHBA 3VD3A 2WBGA 1NQ6A 2E40A 1BTCA 3VM7A 3I3BA 4JFTA 2AMGA 5BXRA 3OIHA 4D6GA 4ACYA 1QW8A 3CHDA 2IXVA 1QI0A 1W2PA 3LPOA 2VRKA 1ZU8A 1UH2A 3U7BA 3VNZA 3VDHA 4LYQA 3WMSA 1GVYA 2VI0A 7TAAA 2W63A 1HKKA 4J3VA 3AHXA 2DSVA 4NI3A 1BSIA 2E0PA 1J18A 1QBAA 3NUKA 2XM1A 2OLHA 1OT1A 4AZ5A 1XD1A 3MKKA 1WKYA 2ZX8A 5I79A 1QI3A 2PWEA 1JDDA 1P6WA 1KCLA 4J27A 4GIAA 1KXVA 3W4RA 4AC1X 1VJZA 1TA3A 5LYRA 3CZLA 4L4PA 3ARVA 2FDMA 4UFHA 1HT6A 4CU7A 3VGEA 1XC6A 1CXEA 2J7HA 1RH9A 4MNJA 5FL0A 3UETA 2D2OA 1GQLA 3QOKA 1KXQA 3S2CA 1OCQA 3MMUA 1CENA 1E56A 2OWWA 5HDRA 1CDGA 3J7HA 4TVUA 3BAXA 2XFYA 3AHTA 5C71A 1UZ1A 3RPMA 5CLWA 1EDTA 4AZIA 3MMWA 4C7FA 1J0HA 3OZPA 1C8XA 3WF2A 3VIFA 4PSPA 1GONA 2XGBA 5E6ZA 4CN1A 1W9VA 2DIJA 1VFOA 3EDKA 3S6TA 4GO9A 3APGA 3FHAA 1FHLA 3K1DA 5EB8A 1S46A 2W4XA 3GTNA 1MQQA 2XIBA 3DYOA 2CEQA 1BGGA 2X8RA 2PWDA 5A69A 4AZ6A 1W9UA 4AIUA 1OGSA 2WCAA 3PZ9A 1JL8A 4UQEA 5GNXA 4HA3A 3VINA 2VQTA 4PYSA 1VEOA 1EXPA 1H5VA 4ZXOA 4W8BA 4GZIA 1EOMA 3FN9A 3WL0A 1IT0A 1H2JA 3VD4A 5I0DA 3AHYA 1C90A 2OYKA 3MUIA 1PAMA 4JL1A 3HMCA 1FA2A 3W6MA 3ARYA 3SCQA 3VIIA 2ZUVA 4UQ9A 1ZS2A 3A4XA 4M56A 1ZJBA 3CUFA 4UZSA 5M17A 1M53A 3FW6A 3WF4A 4D6IA 3WQVA 3ZJ6A 2UY4A 3RILA 1R8LA 2VX5A 2WKGA 3N12A 2EQDA 1FOBA 3A3HA 5JUVA 3CBWA 1E0WA 2XHYA 4W7WA 2WPGA 4XZBA 5CPSA 3W0KA 3VX0A 4UFLA 1B31A 3WF1A 1HKIA 4W85A 2V38A 2G4FA 3N18A 4CVWA 4ACZB 2O9PA 1E73M 5EFFA 1WZKA 1KWGA 1J11A 2WZIA 1R86A 2YLAA 4M82A 3M7SA 4Y7EA 3ZQ9A 1HJWA 2J7GA 3T08A 2BFGA 3WELA 4M80A 3AS3A 4JKMA 3VIKA 1MXGA 1X6NA 2WC7A 4TTUA 1UWQA 2ZXBA 1LG2A 2EPOA 1M03A 1EDGA 1BFNA 1G9HA 3FHQA 4L4OA 2ZX9A 1Q6FA 1XH1A 2F2HA 1B3WA 2Y5EA 1E6XM 1PEZA 2YDQA 5A6BD 1VIWA 2VNCA 3GNRA 4S3KA 1QNSA 3VDBA 3VGHA 5I2UA 1KXTA 3OZOA 1MW2A 5I24A 1C92A 1US3A 3AISA 4QP0A 2W61A 5A8OA 4AWEA 3WBAA 5E0FA 1DP0A 1QOXA 1TCMA 3WF0A 8A3HA 3WMBA 1QI4A 4PTVA 3GH4A 3WMCA 3U5UA 1OBAA 5ABFB 3AROA 1OD8A 1L0PA 5A8QA 3MSDA 2BNJA 1KGXA 1HKJA 1JFXA 1BYBA 3NCOA 1NWTA 3K4DA 1IZKA 2WNWA 2O92A 1OT2A 1UWIA 3LMYA 1M01A 4PUDA 1LWHA 3IANA 4FLOA 3AIVA 2XTKA 2G3NA 1OINA 4Q22A 4PEEA 1UR9A 2J78A 4Z2LA 3W82A 2FGZA 1H3GA 4B9YA 1ZBCA 3AICA 1CECA 2UY2A 4KH2A 2D0FA 4LYPA 2VQUA 3GXMA 5HNNA 4ZE4A 1V6YA 1UD4A 1ISXA 5A6KA 3ZJ7A 4OIFA 2CBJA 4YPJA 3ARUA 3TOPA 4W5ZA 5DT5A 3ZM8A 2CESA 3WBEA 4RL3A 1Q6DA 4CN4A 2G3JA 1CGUA 1PPIA 3VIHA 2CETA 4KGLA 4CD4A 2VUYA 4GINA 1JGIA 2WVSA 2J47A 2J62A 3VOCA 2DDXA 3CMGA 1F4AA 3WN6A 4IISA 2W66A 1NOUA 3CUGA 1ZBVA 1C7SA 4F9DA 1Z32X 1NWRA 3WQ6A 1UR1A 2PWHA 1HL9A 2GK1B 1W3HA 4JAWA 3WL1A 3ARSA 1B9ZA 2V3GA 1R7OA 4GI8A 2C7FA 4D72A 3RMEA 2NSXA 1FFRA 4QLLA 1V0LA 1O6IA 2HISA 3VPLA 2WM0A 1HVXA 1EHAA 2AOSA 4MB4A 1W2VA 4HP5A 2YOCA 5GQBA 3AXHA 3ARXA 1UOKA 1CGWA 4W7VA 4UNIA 4LGXA 3RJXA 2JE8A 1E6PA 4MJ4A 3W28A 4FLQA 4WKHA 4HPHA 1VEMA 2ESCA 2WMJA 2WBKA 3G6LA 3VD7A 2G8ZA 3GDBA 4HU0A 2QV4A 1VF8A 3WQ8A 3N15A 1NOFA 1JYXA 2ZUUA 4P8UA 2BY2A 1U30A 2D0GA 1KGWA 4HOXA 4TVDA 3AIEA 5I78A 1HXJA 4X9YA 4CCDA 2X09A 2V3EA 3AIWA 1QI2A 1JFHA 3VD9A 2ZUNA 3ARTA 4D6EA 3CUIA 1GOOA 5A6LA 4NZCA 4U31A 1BQCA 2BHZA 3OLEA 2ZUWA 4KGJA 2OYLA 1UWRA 7CGTA 3NDYA 3B9DA 2ZWZA 1UHVA 1VEPA 1GQKA 5BWFA 1WZLA 1EDQA 3W6LA 1ISZA 3SCRA 2HVMA 2NW0A 4DWSC 4JFVA 1SMDA 1FH8A 1C8YA 4DUWA 5HPOA 3PZUA 4WF7A 3AZRA 2YA1A 3VGFA 4Z2JA 4LPCA 6A3HA 4YN5A 1W9PA 5F7UA 4AEFA 3AOFA 1EO5A 3FY1A 1EH9A 2PWFA 1M7XA 1OIFA 1GUVA 4AEEA 1E6NA 2J74A 1E4IA 1X6LA 5GNYA 1E1EA 1JXKA 5I6SA 1TE1A 4W5UA 1XSJA 3AXXA 5JBDA 1U33A 1JNEA 4B9ZA 3W26A 2QLYA 3E1F1 1JXJA 1US2A 4H41A 1E70M 1CXLA 5EMYA 2XGIA 3TTOA 1MVYA 3ZMRA 4HU8A 4WKAA 3QHOA 1VFMA 4TUFA 2FH8A 1R7AA 1B0IA 3GNPA 5CQ1A 4IM4A 4BQ5A 3AJ7A 2DT2A 3MMDA 2VRJA 3GBEA 5I5RA 1E40A 1HIZA 4C7DA 1UYQA 5HXMA 4HZ6A 2UWFA 2Y8VA 4HA4A 1KBKA 3ECQA 1KBBA 3KEHA 1O7AA 1FH7A 2J75A 2GJPA 5I23A 2CPUA 2FGLA 4GZJA 4CU6A 3NSXA 3TTSA 2JF7A 1DWFM 2OSXA 3K8LA 5D4YA 1QI5A 4CN6A 2VCBA 2WHKA 1HVQA 1UR2A 4U5KA 1UZ4A 3VMOA 1HJVA 1PX3A 1GOKA 3POHA 1XYZA 4JKLA 3VDCA 1KCKA 1GQIA 1ESWA 2G41A 1G1YA 2QPUA 4K68A 4DWSA 5A2AA 1AMYA 2BS9A 2DGAA 2GJXB 3GXFA 1CBGA 3PZIA 5C8BB 3EDJA 3DYPA 1QPKA 3BLPX 5GPRA 1V3KA 1BYAA 2WVVB 1C8QA 3WSUA 1UA7A 2GVYA 1E4LA 2PF0A 1Q6GA 1B1YA 1BAGA 4TX8A 3ARWA 1LLOA 3VX1A 1W91A 1IV8A 1J10A 3VIMA 1UQZA 3PZTA 2VR4A 3I3DA 5M3WA 1XD0A 2WANA 3W53A 2VX6A 1VENA 2OWCA 1B3YA 3M46A 2DT3A 2FHFA 5ABHA 2EPLX 4R5EA 3VIOA 2YKKA 1BGAA 2EEXA 3WDHA 3RDKA 2DEPA 2XFFA 3QHNA 4MDOA 3BXWA 3CUHA 5DT7A 1CGYA 1H41A 4U3CA 5IFTA 5IXEA 3VGBA 3WQ5A 4GI6A 1E0VA 4FF5A 1MW0A 3ARZA 3FNDA 1DWIM 4ATLA 1HX0A 1BYDA 3WD4A 1QHZA 1WZMA 2YL6A 1D2KA 3IJ9A 4UFKA 2Y8KA 3VGGA 3WFZA 3UERA 4A3YA 4P8XA 2GUYA 4AMCA 1E1FA 2WC4A 1FH9A 1H49A 1E5JA 1I75A 2IXUA 4AD1A 1UD5A 2VX4A 4H8UA 1G94A 1G0CA 2O9OA 5ABGA 1W1YA 4LQ1A 3EDEA 1C93A 4LYRA 4N42A 1NH6A 1WDPA 1GJUA 3L4XA 2J4GA 1VRXA 1YQ2A 4AISA 3MV01 3WNOA 1CXHA 3LPFA 1CIUA 4ZE5A 3N04A 1QNPA 4ZENA 3PTQA 1V6VA 1E43A 1TA3B 5CGTA 4ZFMA 3M6DA 2W62A 2WLZA 1FP8A 4UQCA 1UG6A 2A3HA 1QVBA 2WHMA 4AZ7A 3WD1A 4UOQA 3VMPA 3ALGA 4HMEA 4W8LA 2VL4A 3QHMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1H4P A;  4U33 A;  1PBG A;  3AIU A;  3DYM A;  2VZU A;  5BCA A;  3WEM A;  5JBE A;  1E3X A;  5A94 A;  2XUC A;  4QLK A;  2XG9 A;  1UWT A;  3LPP A;  4BQ2 A;  1V02 E;  2VZT A;  3ZJ8 A;  2XVG A;  2J79 A;  2VR5 A;  3VVG A;  3ZIZ A;  1GCY A;  3GH5 A;  3PZO A;  3VUP A;  4D6H A;  5M03 A;  3GYC A;  1LG1 A;  3QOM A;  2VUR A;  4J7R A;  4PTX A;  3ZR5 A;  2QMK A;  3SCN A;  3T2Q A;  1QNO A;  2J7F A;  4XV0 A;  1H11 A;  1TVP A;  2DSZ A;  1GJW A;  2XVP A;  3L4W A;  1E72 M;  2VX7 A;  1LQ0 A;  4FMV A;  3SCU A;  3OA5 A;  4F79 A;  1CGV A;  3CHE A;  5CSY A;  3WH7 A;  3OGS A;  4AIO A;  4LXF A;  3BMW A;  1W1T A;  2V5D A;  2C8N A;  1QNQ A;  4M81 A;  3RCN A;  2NT0 A;  2QPS A;  5AY7 A;  4IPL A;  3OGV A;  1HP5 A;  1DHK A;  3HN3 A;  4BQ4 A;  1LL6 A;  4OOZ A;  3ZO9 A;  1V3L A;  1D7F A;  2WKL A;  4UCF A;  3SUV A;  3VGD A;  2WWC A;  1XCW A;  4HPG A;  1KB3 A;  1J0Z A;  5A95 A;  1JAE A;  4B3L A;  3AIR A;  1H1N A;  4J3S A;  4F8X A;  4JCM A;  4F9J A;  2CHO A;  4Z2I A;  2XYL A;  1BLI A;  5JIW A;  2ZID A;  3QGV A;  3M07 A;  3PZG A;  3PTM A;  2E9B A;  4MDP A;  1GOW A;  1G01 A;  2CIP A;  2WZE A;  4KRU A;  4QDM A;  1KQZ A;  1JZ4 A;  5IHR A;  3WFL A;  2JAL A;  4AW7 A;  2XSB A;  5A6S A;  1B90 A;  4RE3 A;  5DF0 A;  4W84 A;  2XVK A;  5IHS A;  4MAZ A;  1V02 A;  5JBF A;  1UWU A;  1E6R A;  1VFU A;  2BVD A;  1J0I A;  3EMQ A;  4W93 A;  1HL8 A;  1HJQ A;  2CBU A;  2CNC A;  3ZT5 A;  3AI0 A;  4RE4 A;  1EHN A;  1SMA A;  2ZX5 A;  2G3I A;  1QBB A;  4MB1 A;  1V6X A;  2WW5 A;  2MAN A;  1E6Z A;  3AS2 A;  3WUE A;  1MXD A;  4OKD A;  4DUX A;  4BF7 A;  5LA2 A;  2ZUS A;  2C0H A;  1PX8 A;  2D22 A;  2QF8 A;  2YBT A;  1I1W A;  1WDQ A;  3EYP A;  5ABF A;  4MAV A;  3OLG A;  1UKQ A;  4V28 A;  3CO4 A;  4LX4 A;  4ZEP A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1YNY A;  4XSM A;  1HO4 A;  5A8G A;  3NOY A;  3PZM A;  3L65 A;  4GC3 A;  4NAE B;  3BQ6 A;  3SQS A;  2IQ0 A;  3W2L A;  3FVM A;  2DPE A;  2QJI A;  3W81 A;  1F2J A;  3MKV A;  3WLM A;  1V7Y A;  4GQR A;  2YYT A;  3CPG A;  4DJD C;  3FDK A;  3GDM A;  4H4I A;  1QPO A;  1AL7 A;  3S5O A;  2XM2 A;  1ITX A;  1DWJ M;  3AXI A;  1V3H A;  1FCU A;  3CZG A;  4HPJ A;  5DMY A;  4RR4 A;  3AML A;  1F6Y A;  3TVA A;  1Z3N A;  2A3B A;  1FCV A;  3CL6 A;  3JW7 A;  5DMM A;  3B9E A;  1P7T A;  2WCG A;  4ZOE A;  2E28 A;  2OSY A;  3VZY A;  2OWX A;  1JD9 A;  1Q6Q A;  3KL3 A;  4WY0 F;  4AZG A;  4GFS A;  5D8Z A;  3Q67 A;  4LUI A;  1UAS A;  4JNM A;  1ZBK A;  5FEZ A;  2R1P A;  3SCW A;  3N2M A;  3R0U A;  1ZSX A;  2DH3 A;  4ZTY A;  4E8D A;  3JUG A;  3O7U A;  4BQ3 A;  4US5 D;  3PSV A;  1EQP A;  3QR1 A;  2EG8 A;  4MSS A;  3GFZ A;  1QU4 A;  2ZZ5 A;  2Z1V A;  4XIA A;  3QPY A;  3KCJ A;  1NF0 A;  4C6Q A;  1RQB A;  3TZF A;  3N9R A;  4KRT A;  3M1Z A;  1F3X A;  2ATM A;  2XGZ A;  4JTK A;  3BSH A;  2F61 A;  1G4T A;  3T0B A;  1IIH A;  4NF7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4Y7EA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations