4YLW | Genus

Total Genus 139

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	139
sequence length	364
structure length	363
Chain Sequence	GDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with No.33 compound rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	139
structure length	363
sequence length	364
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2015-03-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4ylwA00

2J9XA 2Z0IA 3NNTA 3AO0A 5EKYA 1F2JA 2DZVA 3PY2A 4LUIA 1WXJA 1LROA 1EB3A 2JKAA 3N19B 4O13A 4DBEA 1QDSA 3THAA 4UXDA 1LTDA 3PB0A 4NX0A 3GIYA 4UFHA 1Q45A 4JN6A 3U8GA 2X1SA 3TSDA 3UWYA 4BI5A 4XBKA 4LV9A 1R2RA 1T8XA 4R33A 4A22A 5ABTA 3PB2A 4W9TA 1GJPA 2BTMA 3FOKA 5FEWA 3RLVA 3B0UX 1OF6A 2QUTA 4P2VA 4MLRA 3QW3A 5HR6A 3W07A 4HNTA 1B4EA 3S0CA 1P5BA 4K7VA 5G2IA 5C55A 4CCCA 1H7WA 3ABRA 1A5BA 4AWSA 3SY5A 3M9YA 1M5WA 3F1QA 4CCDA 3L21A 4Z1DA 1XBZA 4AF0A 4CLMA 3LHYA 2QEZA 4IMGA 1HO1A 3G1AA 3CPRA 2FB2A 4LT9A 3LTYA 2J9ZA 1TO3A 2GVGA 1G67A 1K8YA 3DENA 3KRZA 1ZAHA 1IXNA 1WOBA 1FCUA 3W7GA 3BGGA 4JDBA 3NPWA 5AN7A 2CW6A 1R2TA 4NNAA 2ZQ0A 2F7FA 4I7UA 1ME8A 1T99A 3E02A 3TXZA 1XUZA 3L5LA 4M19A 5G2WA 1K3UA 1RQHA 3R13A 1KA9F 1ML1A 2VXNA 3RMJA 3W84A 1GVFA 3W6YA 5CSRA 3M47A 2YFNA 4H6KA 3L0GA 3CC1A 3IV3A 1P4CA 4JTTA 2RDUA 3UD6A 1TPC1 3BW3A 3P84A 4QNWA 4N9EA 3NPXA 4BWLC 1X1ZA 4IUOA 2YR1A 1Z44A 1SW7A 3G3MA 5KZMA 3TA6A 5G2HA 1EP2A 5DXYA 1HFBA 1OX6A 4KWWA 3LLFA 1B3OA 2ZZ2A 3S9YA 1CI1A 2C19A 1LRNA 2GQ9A 1L2UA 1R47A 3SZ8A 3SIZA 3PC0A 5FF2A 1H5YA 3GXNA 3LHZA 1T96A 3GDKA 4CCEA 2RDTA 4AF0B 7TIMA 3NOEA 3Q37A 5I3FA 2JKEA 1BEUA 1NVMA 1KBIA 3I6RA 1DQWA 1AMKA 2ALDA 3U6WA 5D32A 3TDFA 3SSJA 4JTKA 5J5DA 3IRDA 3UY8A 2QR6A 1QPOA 1TMHA 4QNEA 3BG3A 1QWGA 3MI2A 1TV7A 5D2YA 3HPZA 4AAJA 4X22A 3R12A 3IIXA 1SSDA 2RKXA 3GKAA 2VFEA 1H61A 3SGUA 3I7SA 2DZPA 4AMAA 3IGSA 1S5VA 5K4ZA 1PCKA 3T55A 4CQAA 1WYIA 1SO4A 3NYZA 3NEVA 4UTMA 1OFOA 3CB8A 3IVUA 5E0KA 3VFLA 1YPIA 4UMAA 5FF4A 3RU6A 1F6PA 5KZDA 3TCEA 3UY7A 3KXQA 3VNDA 1SZGA 1TYGA 2GVLA 3W9ZA 5MHBA 5HWJA 2UV8G 4M6QA 3HG3A 2Q8LA 5HJLA 2EPHA 3NQGA 3GKFA 3TX9A 4UTUA 2Y63A 4ALDA 1TQJA 2TRSA 3G1VA 1Z42A 3LV5A 2YXGA 3VE9A 3TIMA 4QIUA 3UWVA 3UXAA 2G95A 4OU1A 3KAOA 4OV4A 3O06A 2O7SA 2ZRZA 4S2BA 3EWYA 2QCNA 2BXVA 3MHFA 1QPQA 2Y85A 4K8HA 3T78A 1MEHA 1YADA 2HS8A 5KSWA 1XXXA 1TPB1 4YWIA 4O17A 3DH7A 4K8EA 1LLZA 3VE7A 3KVJA 1SUXA 2A21A 4FNTA 4K7YA 3PBUA 2DZSA 1X7FA 1XKYA 2B7PA 3EX3A 1H1ZA 4JYEA 3DHFA 4JX4A 2C18A 4AWUA 1OFEA 4LV4A 3WJSA 4NXSA 4RR4A 3TMQA 1JUEA 4K39A 1UASA 1UUOA 1LRTA 2E1DA 3W75A 3JR2A 3O6DA 1Q3NA 3LCHA 3FS2A 2YFOA 3L2IA 3PVFA 4NJJA 2ISWA 1QCWA 4PH6A 2FJKA 2WSYA 3C2VA 2V2CA 4RZ5A 3W7EA 4LNYA 5HULA 3TAKA 3LM7A 5DCEA 2Q8ZA 3ATYA 3OIXA 5AHFA 3BW2A 4O4WA 1FWWA 1O5KA 4WOQA 1MZHA 1RVGA 4UR7A 4ADSA 3FKRA 1TTIA 5D33A 2B7QA 3P81A 5FESA 2HSAA 2ISVA 3EXRA 4Y90A 4R34A 2VKZG 1W3NA 2GVJA 4RK8A 2ZRWA 1TPDA 1L6SA 3QW4B 3CEPA 3QMSA 5D38A 1O95A 4ZMGA 2TMDA 5D02A 2HTMA 4NUWA 4XKYA 3KOFA 4IWWA 1GYLA 3G8RA 5FF3A 5LGXA 5G1YA 1LRQA 1TSIA 5CZSA 3W2LA 5GVJA 4Z0SA 2E5CA 4XZ9A 4UC5A 1L9WA 1FDJA 4HPXA 3LV6A 1ZAIA 4M7TA 5H2ZA 1BKSA 3LCLA 4WUIA 4WXYA 5D04C 1HUVA 4UMBA 5D2TA 4O4VA 3TNOA 4KKXA 3W71A 2RFGA 5AFDA 4Z0JA 3HMJG 3W1TA 2CLOA 4IPIA 1OJXA 3S5ZA 2B7NA 2B0MA 3LBMA 5AHLA 4ICNA 4WY0F 4RJEA 3MYOA 4JX6A 1SU5A 1LORA 1G7VA 1NSJA 1EX5A 4Z1AA 1TPWA 3O6YX 1TJPA 4EVZA 2CWNA 1DL3A 3MP4A 1VLIA 4OT7A 1JCXA 2HS6A 3HPSA 3N14A 4H3DA 4JX5A 2CLIA 4LRSA 3FLUA 2DJXA 3BGJA 4DBDA 1EIXA 1VRDA 3G22A 2ZCGA 4E2BA 5KINA 1R30A 3OVPA 1C9DA 1HO4A 4DF1A 3P8IA 3WK1A 2QCHA 5H91A 2GJLA 1XBYA 3OA3A 2WSRA 2OJPA 1DV7A 3IEBA 3G0XA 3U2OA 2P1FA 4U4MA 2CZFA 5D05A 3MWAA 3N2XA 2R14A 3HIJA 1J2WA 3GXTA 5I3HA 1WAUA 5D30A 5CKSA 2H6RA 2V9DA 3HGOA 2E68A 4LRTA 5LNSA 3E96A 4GUGA 3UPWA 3CWOX 3C6CA 3O07A 1EUAA 1IIHA 4E38A 1OX4A 3N73A 1Q6QA 4GBUA 3LRKA 2WSQA 5AHMA 3NXFA 4RXFA 1TPUA 4UMCA 3LXCA 4UR8A 1G4TA 2TYSA 1IXPA 1AK5A 5K2ZA 1M7PA 1GT8A 4O57A 5AC8A 2QCMA 4O1DA 5G4EA 2V2HA 4PC8A 4LVGA 3BLIA 2VEIA 4JTGA 3VCRA 5HUOA 3MW7A 3GZ3A 4LVBA 5HQEA 4QAIA 3TQVA 4NJHA 5DELA 1GOXA 3R5EA 1W5OA 3N9SA 3TU9A 3G1XA 1EA0A 1K8ZA 2DZXA 1FCQA 3NL5A 4JYDA 1KBJA 2V81A 3P60A 1J4EA 4JY9A 1OX5A 4NU7A 2DJLA 3GDTA 1KM1A 1I45A 3B05A 5CPMA 2JKPA 4ADUA 3EWBX 1SQ7A 2PE4A 4XBSA 2FFCA 3DU0A 1KFEA 2Z6JA 3CLMA 3HPXA 5HINA 3B06A 3C3NA 4UTTA 3O8AA 4EOUA 4L4MA 4HSNA 3LRMA 1TPFA 4O18A 5TBOA 5U4NA 2DZWA 5AHEA 1CW2A 2F84A 1YTKA 1WBHA 4GFSA 3B8DA 3LRLA 2C15A 3C2RA 2GOUA 5I3JA 4TU1A 4M6PA 4BI7A 1MXSA 3EB2A 3W85A 4Q4KA 3KFTA 3CWNA 2A6LA 3W2UA 1SFLA 2ZRXA 4TR9A 3UZJA 5KMYA 4CQ9A 2P10A 1VH7A 2QJHA 2RHGA 1SPQA 3USBA 1A5AA 3BG9A 1HL2A 4MFEA 1OX4B 4O12A 3C2EA 4O0KA 3HJZA 1OK6A 3NQMA 1KM2A 2ZZ1A 5LHFA 3W1MA 4N6EA 2C1HA 5HUPA 4AH7A 3IVTA 1VJIA 4YLWA 3OEXA 2H8ZA 1TV8A 3QQ0A 3W88A 1H62A 2E6FA 2PRMA 3O1NA 2ZZ3A 1SSGA 1QOPA 1DHPA 1GPWA 4L4LA 3WJYA 4UIOA 3EWUA 5G4WA 3JRKA 1KLZA 1PCWA 4JGDA 3H55A 5KITA 3SW6A 2X1TA 4HNUA 2ZDRA 1TQXA 2GQAA 4FXSA 4OWGA 2V8ZA 3LCIA 5IBXC 3GK0A 2QCEA 3W2MA 2A1YA 2E09A 2C16A 1ADOA 3L5AA 1DJNA 4EF9A 1TPVA 4LS0A 1WV2A 3LHUA 3W76A 1J5TA 3GDMA 4MPQA 2Y70A 2G97A 4ZQMA 3LBCA 2VFGA 4JTFA 1EWDA 2Y6ZA 3SECA 1ICSA 3HGRA 3NQ2A 1L6WA 3NO5A 2H3DA 1N55A 2CZ5A 5DCBA 1RD5A 2VEKA 1U83A 2P0OA 5F4XA 3BO9A 1XFBA 3F4NA 2NUXA 2VENA 3CHVA 4FX7A 5F2GA 3DGRA 4A21A 5LKYA 3S8HA 3P82A 1KFBA 3GAKA 1GVQA 3VKJA 4XTDA 3DBPA 2NX9A 3GNNA 1JULA 1PS9A 3PG8A 1D3HA 1AL8A 4OBTA 4WJEA 1NF0A 1F5ZA 1XDLA 4Y96A 5DCDA 3I7RA 1KM0A 4NNBA 5FEZA 3EEGA 2VC6A 1O4UA 1DBTA 1YTDA 4ZQOA 4Y9AA 3EKZA 3BLEA 3CQ0A 5FI8A 4OGZA 4MJMA 3GX9A 1DVJA 3PBYA 1VR6A 3P8JA 3QMTA 1LZOA 3MMTA 3QSRA 4PA8A 2AAMA 3OVQA 1LLWA 3IIZA 2XFWA 5L6UA 4OQVA 1LBLA 4IQLA 2FPVA 3TC6A 1JCNA 3EXSA 2BZNA 1YLVA 3DHDA 4FX8A 2NUWA 1R46A 1NEYA 4MYAA 1KTNA 3S42A 2CLFA 4XWUA 1UBSA 3RK8A 1P0KA 3BVJA 4NJKA 1W54A 3UNDA 5G5IA 4O50A 1FQ0A 1CX9A 1EEPA 3W72A 2TPSA 3IVSA 3A23A 3HG4A 3P7YA 1WA3A 1U5JA 5DN1A 2G96A 2NX1A 2Z6IA 3PR2A 3BV4A 4MY1A 2A6NA 3TMLA 2ATSA 1ZALA 3L5MA 2VFHA 1JRBA 1L6YA 3W7OA 3IIVA 5CPNA 1R2SA 4QJ1A 3MHUA 3RNDA 2QDGA 4HN4A 1V5XA 3CTLA 4GWEA 4K6AA 4BWLA 2BWGA 4JTEA 4UNLA 1NF7A 3M41A 4LC8A 2V5LA 4DXVA 4OE7A 4RV8A 3TSBA 4Q32A 1D9EA 2ZA1A 1SW3A 1LOLA 4ML9A 4E2DA 1W5QA 2CLKA 3EX1A 4UTIA 4JR5A 2FQIA 1XM3A 3W74A 3S5YA 2QKFA 1A5SA 1I2PA 1RQBA 3MYPA 2A4AA 4MIMA 4GUFA 2CLLA 2E6AA 4O15A 4N4PA 1KW1A 4NJIA 1PV8A 3LGEA 2ZA2A 2A7PA 2WNQA 2CLMA 1GWJA 1LOQA 3G18A 4AHQA 4A2RA 4IGHA 2E5BA 5AC6A 3M5XA 3PS7A 3FJ6A 4ORMA 1IGSA 2E5DA 1OYCA 2H90A 3QYQA 4KWVA 4N02A 3TFXA 2Y7GA 1OFBA 3S5OA 1PL9A 1W3IA 3UQNA 2ZRYA 3DFOA 4UTWC 3TR2A 1TPEA 4UFLA 3PG9A 3FYPA 3B04A 4LOCA 4ZQNA 2ATMA 3W1UA 4TO8A 2NZLA 3GR7A 5EBUA 3EWXA 1F74A 2O7QA 4TMCA 3LXAA 4YXGA 3NAVA 5AHNA 3T4CA 4AHPA 4HHPA 4AVFA 4PTNA 1RPXA 4UFIA 3P5ZA 2QF7A 4P61A 4JD4A 3UPBA 2CZEA 4FNQA 1MO0A 3NZ1A 4O11A 5J5RA 1TPH1 4JYFA 5CZJA 1WQ5A 4JTJA 1G69A 3A22A 2NLIA 5EY5A 6TIMA 3CIXA 4RZ4A 3C2FA 1X8FA 4WXZA 5A5WA 4C1LA 4CQ8A 2I14A 5FEPA 3W2KA 3O15A 2VEMA 3W7JA 3PUEA 2LLEA 1YTEA 2QCGA 1I2OA 2QAPA 4JTIA 4LS1A 5LNUA 4Y6GA 1O94A 5AYZA 1FXQA 1QAPA 4JY8A 4O1BA 1XCFA 4PL2A 4POCA 3MBDA 3W1RA 4R53A 3FA5A 3ZFHA 3E0IA 3LHWA 3UXDA 4JICA 1ICQA 1KFLA 2H3BA 3OG3A 3IGXA 4LVDA 1OYAA 1GVSA 2E6YA 3A9IA 1LCOA 1ZENA 1X1OA 1JUKA 2BLEA 4JTSA 4JIQA 3PULA 4MYXA 2XN1A 4O52A 3SJ3A 3ZS4A 3GNDA 1B4KA 2B4GA 1KM3A 3OHIA 3P74A 3CT7A 4MY9A 1H7NA 1VYRA 1VPXA 2CLEA 1VZWA 3NQEA 1AW2A 2GQ8A 2OZ0A 2V30A 3W7LA 1SO3A 2Y7DA 1YXDA 4O53A 8TIMA 1P0NA 5HWMA 1FBAA 3L67A 5TQLA 1VCFA 1SFJA 3NQDA 3W7RA 1BWKA 1EP1A 2VFIA 4NZJA 3E9AA 4HPJA 1W37A 1XC4A 2Q3OA 4GRSA 4LUJA 1LDCA 4FX6M 1XDMA 3W1PA 1F73A 5DY3A 3NL2A 3MI3A 4IMEA 1B9BA 3O16A 1W0MA 3YPIA 4TMBA 4RXGA 4CNPA 5DLCA 1O5XA 4BI6A 4AEOA 4UFKA 3JS3A 3W7CA 3NM3A 1X6UA 3LCXA 3QF0A 4FEZA 4S2CA 4YCPA 1H7RA 2GUUA 3H53A 2FIQA 2QUUA 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3M1ZA 3QJAA 4O1CA 3SR7A 3W23A 3TJXA 4GNJA 3MP5A 3UWWA 1Z48A 2QDHA 1A50A 4LC6A 3W7NA 3M43A 1ZHAA 3P67A 4ZVJA 1GG0A 4KFPA 5CSSA 1EUNA 3B0PA 4JTHA 3C61A 3W1LA 3EKLA 1E51A 4LTSA 3EWWA 2Q3RA 1G4PA 4DEFA 4HSOA 3W1QA 3M6YA 3G1HA 2ZRVA 3CM4A 4H4IA 3LLDA 3TK7A 4ZQPA 3BARA 4WY0B 4UFJA 1TTJA 3NQFA 1HG3A 1RZMA 3S6DA 1IF2A 3M7WA 5C54A 2FPTA 3W1XA 4ZQRA 1F05A 4LW7A 2RDWA 3C56A 3ZR4A 3RLUA 2J9YA 2J88A 2JGQA 1SO6A 3Q94A 3L66A 3W2NA 3N34A 4PFMA 4X2RA 1JCYA 3HG5A 1EWEA 1OABA 3IGUA 2ABAA 3GYEA 3P5YA 1Q6LA 4RZ6A 4FB7A 5LSMA 3ABSA 1KM5A 5HNRA 4MUZA 3T7VA 3EXTA 2R91A 3MUXA 3D0CA 3A24A 2Y89A 4S1FA 5K9DA 3KVLA 2GPTA 4LVFA 3HF3A 4MY8A 2NWSA 1LP6A 3M5YA 4CNNA 1UCWA 3LTSA 1ZY9A 1QPNA 4FNRA 3EWZA 4M7SA 3SGZA 1WOAA 2C0AA 1I2NA 2WV8A 3DFPA 4JEQA 1VHNA 2X2GA 1D3GA 4A29A 2ZRUA 4FXRA 3LI0A 3QSTA 1K8XA 5AOUA 4TX9A 1VCGA 5IBXA 2PURA 2EF9A 4M5PA 3MBFA 3KRUA 2HMCA 5BMWA 2CFFA 4N9DA 3E49A 1ALDA 3W7MA 3G24A 3GB6A 4MVAA 2ZTKA 1C29A 4RKAA 4WOZA 4BR1A 3TW7A 4HT3A 1F6KA 2C6QA 1Q6RA 2DP3A 1IXOA 4HKPA 2NWRA 3DKJA 3B0VC 4EF8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4YLWA

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