4YN5A

Catalytic domain of bacillus sp. jamb-750 gh26 endo-beta-1,4-mannanase
Total Genus 146
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
146
sequence length
391
structure length
391
Chain Sequence
IPKDSEGQSFKLVDSNASTLTKSLYAYLQDTSGRQILFGHQHAVDEGLTLTNSGDRVGSTQSEVKNAVGDYPAIFGWDTLSLDGYEKPGNEKNSQAQNRANVVQSMRTVHELGGIIALSMHPENFVTGNQYNDTSGDVVKNILPDGSHHEVFNAWLDNIAAFAHELTDQSTGELIPVIFRPFHEQNGGWFWWGAQTTTASEYKALYRYTVDYLRDVKGVNNFLYAFSPNAPFDGNLTQYLRTYPGDQYVDIFGLDQYDNKANAGQATFLNGLTQDLAMISKLADEKGKIAAFTEYGYSPQGFNETGNYLQWYTAVLEAIKKDPNASRIAYMQTWANFGYPTNMFVPYRDVNGNLGGDHELLPNFVEFYEDDYAAFLTEASGWNLYQDISTI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Bacillus sp. JAMB-750 GH26 Endo-beta-1,4-mannanase
rcsb
molecule keywords Mannan endo-1,4-beta-mannosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp. jamb750
total genus 146
structure length 391
sequence length 391
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4yn5A00
3W27A 2OSWA 3U5UA 1NQ6A 3ZJKA 3WUBA 1HXJA 1JF6A 3VKKA 1Q6DA 1W32A 3PZIA 3WDJA 1US2A 3F5LA 1MQRA 3GM8A 3FN9A 2HVMA 2YDRA 1UWQA 1JGIA 2OYKA 3WDPP 3AS0A 2VZSA 3AIBA 2WNWA 3AIEA 1KR1A 5KZ6A 5CSUA 4B3KA 3CUGA 3EYPA 3CZGA 1WPCA 2E0PA 3OG2A 4Q22A 4U2ZA 1GNXA 3EDFA 4P7OA 3AFBA 4RE3A 1FOBA 1BF2A 4UQBA 3EDJA 4PMXA 1TUXA 2WPGA 2JF6A 3MSGA 1XSIA 1E9LA 4JL2A 1M03A 5A69A 3BAKA 4U5IA 4D72A 1BVNP 2ZX8A 3JUGA 4JFVA 3SUUA 1QW9A 1BPLB 4W8LA 4AIOA 4XV0A 5FD0A 3FHAA 3WH5A 4MB1A 3WD3A 5CLWA 2VURA 3WMBA 4YHEA 1F4AA 5A6BD 4MNKA 2IXVA 5A2AA 1CGVA 2PWFA 1VFFA 4BQ3A 2D24A 3GDBA 2BXZA 1E73M 3BAIA 3VIHA 4B9ZA 4MAZA 1F4HA 2PC8A 1XC6A 3SUVA 2CETA 3K8KA 3VILA 4MDOA 4Q7NA 3BXWA 2DT2A 3W4RA 1R85A 2OLHA 1R7AA 3CZEA 4M24A 4LYQA 4UTFA 1BLIA 2WW5A 1W9UA 3UCQA 5CZKA 7TAAA 3PBGA 4MDPA 1U2YA 4JHOA 1UKPA 1TVNA 3GTNA 4QLKA 4AY1A 3M07A 4UQ9A 3GBDA 4KGJA 3MMWA 5D4YA 1NWUA 4WIWA 1FFQA 2J75A 2WVUA 3WDRA 5EB8A 4WF7A 5E0CA 1AMYA 3L4ZA 1E5JA 4U33A 4B9YA 2AMGA 5A95A 3VO0A 3PHAA 2ZIDA 4Z2KA 1QI2A 2XVGA 3DC0A 4H2CA 2VX5A 1QHZA 3VD7A 4CCCA 1EH9A 2WHKA 4UCFA 1AVAA 1I1WA 5LA2A 2VJXA 3VIPA 1PZ3A 3BAXA 1VEPA 1GHSA 5A8NA 4N0RA 1UG6A 3A47A 3FXYA 1VIWA 2OSYA 5M03A 4PCSA 4FLQA 4ZFMA 1J18A 4AIEA 1B1YA 3RJYA 3BC9A 1W3JA 5CQ1A 2BHYA 4J3SA 1GVYA 5CPTA 4OKDA 1US3A 5CPSA 1UKOA 4ML4A 4KWUA 3WD2A 1E55A 1PJ9A 3CMJA 3VTRA 4CUCA 1GCYA 2C7FA 1CIUA 3AJ7A 4TOQA 4TVUA 3WIJA 3VGDA 4MTVA 1UKSA 1ZB5A 4AD1A 1JNEA 2D2OA 9CGTA 4MNMA 2Y8VA 2WMGA 2WCGA 5E0FA 5A1AA 3GH7A 6CGTA 4BQ2A 3GXFA 1AQHA 1JD9A 1CGXA 1PAMA 4EAMA 4PBGA 1IV8A 4YPJA 5A6LA 4HPHA 3WENA 4GIAA 3WDHA 4MADA 3ZT7A 4CD7A 2WMIB 3MUY1 4P7NA 1WB0A 2XFRA 2W91A 2CHNA 3FAXA 2WKGA 2VT0A 3THDA 4HP5A 2WVTA 4BQ5A 4TVDA 4HMDA 4B3LA 1E6RA 3EDEA 4H8UA 3WH8A 5E09A 2VRKA 1GOWA 2DIJA 2YJQA 4QDMA 2UY2A 2Y24A 5I23A 1V0MA 4OZOA 3AXIA 4J3VA 3NYDA 1EGZA 2C8NA 2O92A 3DYPA 3CTTA 4UNIA 3ZSSA 4YN5A 4M8UA 3D5HA 3T0AA 2XYLA 4XB3A 2WVVA 4LX4A 5DT7A 3T0DA 1JIBA 3ECQA 4CD4A 4DWSB 1EDQA 1V3IA 1ZU8A 1SFSA 3W29A 3PTKA 5IFPA 3OBAA 3UG4A 5HXMA 3VNYA 2JFEX 4Z2JA 1ZBCA 2BY3A 1B90A 3CMGA 3WN6A 2ZX6A 4Z2HA 4A3YA 3WL1A 2J74A 1HJUA 3ARWA 3VDCA 3SIMA 1UR8A 2PWHA 1XGZA 1JDDA 3SCWA 4CCDA 1CXLA 2W61A 1DP0A 3VX1A 3VDAA 4WKHA 3BAJA 1CXEA 1EA9C 1EQPA 1WDRA 3HMCA 4HZ7A 1UWSA 1BVZA 1EO7A 6TAAA 3CHEA 5BXPA 1JZ2A 2DPEA 5CGTA 2WXDM 2ZOXA 3NSXA 2J7FA 2WHLA 3WELA 1DWGM 1JZ4A 1Q6GA 1W1YA 3I3BA 4F66A 1NH6A 2WANA 1E3XA 5A8QA 2GK1A 3VD3A 1JYVA 4JHZA 4PSRA 1W2PA 3KWXA 5IHRA 1JFXA 2WWCA 3ARRA 1E0XA 1C93A 5D8ZA 1TA3B 2JF7A 4CGTA 1W91A 3W28A 4AWEA 1QNRA 3AICA 1G94A 1VFMA 2NT1A 1HF6A 1TZ7A 1HJWA 3K8MA 3LPGA 3VNZA 4D6GA 1HKIA 1PX8A 1QW8A 4MAVA 3VVGA 4JIEA 5A6KA 5ABFB 4W7UA 4MB5A 3W82A 1UD8A 1LL7A 3WQ6A 1E6QM 2GVYA 3AHTA 2VZVA 3RPMA 1GQIA 3CGTA 3L2LA 2XM2A 2ZX5A 1H4PA 2WK2A 1CDGA 5TD4A 2VR4A 2E9BA 1NWSA 1HJSA 3VOCA 1UWUA 1LL6A 3IK2A 3WNPA 5A2BA 3W53A 5I24A 3I3DA 1JFHA 3A3HA 1V3KA 3CPUA 1SMDA 1E4IA 1J12A 2DEPA 4BQ4A 3AOFA 3T0BA 2WM0A 2ZWZA 3PZVA 2QF8A 5I79A 1CGTA 3FAWA 1JXKA 3T2PA 3CZJA 3W6LA 3QR3A 1X1NA 2CERA 3U7VA 3AQUA 2VX6A 3MUZ1 5JIWA 1UH3A 1ECEA 2D1ZA 2XVPA 5D9NA 2FH8A 2WZEA 1XSJA 4PSPA 1WNOA 2Y4SA 5D9OA 3TTQA 3WQVA 1EIBA 1XH0A 1JZ7A 1H49A 1DTUA 3KL5A 4H7VA 1XSKA 1QI3A 2BVYA 4UQCA 1CXIA 5AC4A 1ISYA 1QHOA 1G01A 1N82A 4MB3A 3MANA 5LA1A 4AZCA 4ZENA 1AQMA 3S2CA 1HIZA 1OM0A 1KGUA 2V38A 3TA9A 3GH5A 3VIKA 1MYRA 3W25A 5FCZA 3AI0A 1EQCA 1GZJA 1D3CA 3MV01 4PMNA 1VBRA 3OIHA 1E6XM 4JFWA 4P7RA 1GQLA 1CEOA 3E1F1 3HN3A 4HA1A 1JD7A 3QHOA 1MQQA 1MWOA 5A8PA 2YOCA 1WKYA 3SEPA 1KGXA 4PRWA 4D6IA 4D6JA 1WCGA 4A4AA 1JAEA 3D3AA 3T2QA 1D7FA 4J3XA 3U5YA 1JDAA 2YKKA 1DEDA 4BF7A 1C3FA 3UESA 1EDGA 1XRVA 3CIVA 3WEMA 2QHAA 1E6SM 3VIMA 1VF8A 3RMEA 4W93A 3ZMRA 2GJXA 1RPKA 2VUYA 4PTMA 3UG5A 2BVDA 2WKLA 3SCNA 4U2YA 4PUDA 2YIHA 2EEXA 4EE9A 2DT1A 4V28A 1VBUA 2GK1B 4B16A 1ZBWA 5DF0A 2F2HA 3VGBA 1Q6CA 3VDHA 2D3LA 4ZXLA 1UZ1A 4D6HA 3WL0A 3QGVA 1OINA 1UZ4A 3SURA 1GOQA 3PTMA 2A3EA 1H3GA 3AXHA 4WK9A 2J8FA 1OGBA 3AMLA 2WMHA 1V6VA 1ZS2A 1JL8A 2QMKA 5ABHA 3AZRA 1VFUA 1W9PA 1Q6EA 2AOSA 3CH9A 3CHCA 1GONA 4FLOA 2VRJA 2CKRA 1UR0A 3ZM8A 4OUEA 4TTGA 5C70A 5HNNA 1DWJM 2BXYA 2EJ1A 3BCFA 5HPOA 1OBAA 4AD5A 2XSBA 2FH6A 1VJSA 2YLAA 1CTNA 5D8WA 3KEHA 1H0IA 4XX6A 4D6DA 4UFIA 1GJWA 4Y7EA 2YA1A 4R27A 3UETA 4OJYA 2J8GA 1J01A 4GI6A 1PX4A 1UR9A 1KFWA 2VZTA 2FHBA 2G3JA 5EFDA 4GXPA 4PMZA 5I3DA 5HBFA 4P8WA 2WMIA 3LPFA 3CUJA 1W9XA 2Y5EA 3AYSA 3VIOA 5HOSA 5I2UA 5A3HA 3VU2A 3W38A 3S6TA 1BGAA 3B9AA 4JCLA 1HT6A 3O6AA 4JKLA 3AZTA 4AMCA 5LA0A 2GDVA 2D0HA 1E71M 2YBTA 5AY7A 3AZSA 2X0HA 4HOZA 1BYAA 4GO8A 1IT0A 1ISXA 2J47A 3WH7A 1W1TA 3GNOA 1CXFA 1E72M 4AZCB 3W26A 2PWDA 1OT2A 2GJPA 2E9MA 2XHYA 3BAWA 1UR1A 3DECA 3RO8A 2J7GA 4W8AA 4AIUA 2J25A 2JE8A 3DHPA 4DWSA 2XJ7A 2WC3A 3OLGA 1UKQA 4DUVA 4AYSA 5BXTA 2V3EA 2V5DA 1W9VA 2XIBA 4UFJA 5BCAA 1E0VA 2VX4A 3VIJA 3AMDA 1HNYA 1WZAA 3VUPA 3WDQA 4ZEPA 1KWKA 2RGLA 4IM4A 2GJRA 2ZUUA 3AIVA 1BG9A 1FP8A 3CHFA 3HU7A 1CXHA 4GQQA 5GNXA 1CGWA 1V03A 1P6WA 3WQWA 4CN6A 1V0LA 2FHFA 2ZUTA 3SUTA 4LGXA 2GUYA 4E4PA 3VPLA 2VTFA 2GJXB 2ZUVA 3ZIZA 1B0IA 1W3HA 3W6MA 4CU6A 2WCAA 4GPNA 1UR2A 2W62A 5I77A 3OGVA 2D23A 1B30A 1XCWA 2MANA 2V3DA 3AS3A 3WY1A 4LYRA 4KRUA 1KQYA 3ARXA 3NUKA 2OWCA 3OGSA 1MVYA 1V6YA 3ZJ8A 1YQ2A 4E8CA 3B8SA 3QHNA 1DWFM 1UUQA 2DH3A 4CU8A 4CD6A 3KL3A 3A4WA 3T08A 1QPKA 2CBIA 1TA3A 2J7DA 1UQYA 2OWWA 1VFOA 1W9DM 2CKSA 2NT0A 2W5FA 4B15A 2GDUA 1QI4A 2B31A 1J0YA 3L4VA 2WSPA 2UY3A 2OYLA 3CZKA 1EHNA 1BTCA 1O7AA 4AZHA 5ABFA 1GUVA 3NSNA 4OBRA 1KQZA 3PZMA 5F7UA 1VENA 5M5DA 2ZUMA 1JZ8A 1UWIA 3F5JA 3O2LA 2OYMA 1FA2A 4NSBA 2XFFA 4C7DA 4KRTA 1BAGA 1GPFA 2ZX9A 1J0ZA 2J4GA 1RP9A 1GHRA 4M29A 2YL5A 4JFUA 3WNOA 1V02E 1QI0A 3MU7A 1JYWA 1UR4A 4KGLA 1PPIA 4DWSD 3AIUA 2BNJA 4W88A 1LG2A 3L4XA 2NW0A 1J0IA 1UH4A 2DSUA 4UR9A 3CZLA 4W7VA 2XIIA 2XWDA 1EXPA 1UD5A 2EXOA 2YA2A 5HDRA 3WUGA 4Z2GA 1M01A 3RIKA 1PIFA 3T2OA 3WBAA 1GOOA 1SMAA 4P7LA 2VQUA 4JL1A 1HVXA 1UOKA 2Z1KA 1B3WA 5JUVA 4D1JA 4EANA 3N1AA 3ZT5A 3TP4A 3WD1A 4CN4A 3AMCA 3SUSA 1B9ZA 4URIA 3BGAA 3VMPA 2PBOA 1G0CA 4PN2A 5AC5A 2JIEA 4W7WA 4UFLA 4QLJA 4AD0A 5DT5A 1ZBKA 4E8DA 3RCNA 1XH1A 2TAAA 1CGYA 1J0JA 1EO5A 1C92A 1M04A 1MXGA 1WE5A 1GOMA 3ARVA 1V6UA 1WZMA 2J7EA 2EPMX 7CGTA 4FLSA 2A3HA 2JEPA 1HJVA 2DSZA 4ATDA 2VNCA 1UD3A 4F8XA 3PZQA 1UWRA 3AMKA 3CLWA 1U33A 1O6IA 1PZ2A 1FH7A 4L4PA 3CHDA 4TTUA 1FP9A 3DHUA 4WKFA 1WDQA 1QVBA 3GNPA 1RH9A 2YDSA 3U7BA 2BY2A 2J7HA 1UWTA 2VVNA 4UOZA 3PZNA 3WNKA 5A8OA 1VEMA 4W8BA 5JBFA 2DSVA 4HZ8A 2XWEA 3IJ7A 2ZXQA 1TFVA 3SCRA 4AZBA 4ATWA 1JDCA 4GI8A 4GO9A 1IZKA 4PMDA 3OZOA 2EPLX 5ABGA 1V0KA 4HPGA 4GI9A 3AXXA 1PEZA 4J3WA 3ZR6A 3EMCA 1NP2A 1UD4A 1J11A 1BSIA 3MSDA 1E70M 2XPKA 4CN1A 2W66A 3GH4A 2CBUA 2YDQA 2QPSA 1X6LA 1W2VA 2DSKA 1QNQA 2WMJA 2ZICA 3AS2A 3G6LA 3M6DA 4UQEA 2EPNA 3AIRA 2E4TA 3NDZA 1VJZA 1DWAM 1RP8A 1E6ZA 3OLIA 5EMYA 1LG1A 3TOPA 1H1NA 1E1FA 2ZE0A 1QNOA 2IXUA 4CU7A 1BG4A 1HP4A 1A3HA 1HVQA 5JBEA 3IJ9A 3KE0A 4PUEA 2J77A 2XUCA 1JZ6A 1H41A 2WB5A 4DM2A 2CEQA 2BV9A 1UA7A 1K9TA 3ZO9A 3ARTA 4MJ4A 4HU8A 4TXEA 4D6CA 2ZXBA 4PTVA 4JFTA 3ZT6A 3F4VA 1TG7A 3SCTA 1I1XA 4AEFA 3WNNA 1NM9A 3POHA 2YLLA 3WQ8A 1V6XA 3MV11 1HJXA 2X09A 3VGFA 5BXRA 1M7XA 3RJXA 2VI0A 2WZHA 4DUXA 4K68A 2CIPA 3GXDA 4R5EA 4W87A 3UR7A 5ABEA 4AD3A 4P8XA 4FF5A 4QLLA 3VGGA 1DWHM 2WMFA 3L4YA 2PF0A 3NIYA 2WC7A 3VIGA 2D22A 2QLYA 3OLEA 3N15A 1ISVA 2Y8KA 2JIWA 3IJ8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3W27 A;  2OSW A;  3U5U A;  1NQ6 A;  3ZJK A;  3WUB A;  1HXJ A;  1JF6 A;  3VKK A;  1Q6D A;  1W32 A;  3PZI A;  3WDJ A;  1US2 A;  3F5L A;  1MQR A;  3GM8 A;  3FN9 A;  2HVM A;  2YDR A;  1UWQ A;  1JGI A;  2OYK A;  3WDP P;  3AS0 A;  2VZS A;  3AIB A;  2WNW A;  3AIE A;  1KR1 A;  5KZ6 A;  5CSU A;  4B3K A;  3CUG A;  3EYP A;  3CZG A;  1WPC A;  2E0P A;  3OG2 A;  4Q22 A;  4U2Z A;  1GNX A;  3EDF A;  4P7O A;  3AFB A;  4RE3 A;  1FOB A;  1BF2 A;  4UQB A;  3EDJ A;  4PMX A;  1TUX A;  2WPG A;  2JF6 A;  3MSG A;  1XSI A;  1E9L A;  4JL2 A;  1M03 A;  5A69 A;  3BAK A;  4U5I A;  4D72 A;  1BVN P;  2ZX8 A;  3JUG A;  4JFV A;  3SUU A;  1QW9 A;  1BPL B;  4W8L A;  4AIO A;  4XV0 A;  5FD0 A;  3FHA A;  3WH5 A;  4MB1 A;  3WD3 A;  5CLW A;  2VUR A;  3WMB A;  4YHE A;  1F4A A;  5A6B D;  4MNK A;  2IXV A;  5A2A A;  1CGV A;  2PWF A;  1VFF A;  4BQ3 A;  2D24 A;  3GDB A;  2BXZ A;  1E73 M;  3BAI A;  3VIH A;  4B9Z A;  4MAZ A;  1F4H A;  2PC8 A;  1XC6 A;  3SUV A;  2CET A;  3K8K A;  3VIL A;  4MDO A;  4Q7N A;  3BXW A;  2DT2 A;  3W4R A;  1R85 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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