4YN5A

Catalytic domain of bacillus sp. jamb-750 gh26 endo-beta-1,4-mannanase
Total Genus 146
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
146
sequence length
391
structure length
391
Chain Sequence
IPKDSEGQSFKLVDSNASTLTKSLYAYLQDTSGRQILFGHQHAVDEGLTLTNSGDRVGSTQSEVKNAVGDYPAIFGWDTLSLDGYEKPGNEKNSQAQNRANVVQSMRTVHELGGIIALSMHPENFVTGNQYNDTSGDVVKNILPDGSHHEVFNAWLDNIAAFAHELTDQSTGELIPVIFRPFHEQNGGWFWWGAQTTTASEYKALYRYTVDYLRDVKGVNNFLYAFSPNAPFDGNLTQYLRTYPGDQYVDIFGLDQYDNKANAGQATFLNGLTQDLAMISKLADEKGKIAAFTEYGYSPQGFNETGNYLQWYTAVLEAIKKDPNASRIAYMQTWANFGYPTNMFVPYRDVNGNLGGDHELLPNFVEFYEDDYAAFLTEASGWNLYQDISTI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Bacillus sp. JAMB-750 GH26 Endo-beta-1,4-mannanase
rcsb
molecule keywords Mannan endo-1,4-beta-mannosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp. jamb750
total genus 146
structure length 391
sequence length 391
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4yn5A00
3CLWA 3AZRA 1GOKA 3CHEA 4PTMA 4D6IA 5A2AA 4B9YA 2WMIB 1CECA 2VRJA 1R7AA 1HKJA 3U7VA 4PCTA 1AQHA 3UR8A 3W37A 1TUXA 4UCFA 3GXMA 5EMYA 3CHFA 1X6NA 1OSEA 4TX6A 5A95A 4UZUA 1OINA 3IJ8A 1VRXA 3OB8A 3WD1A 1XRVA 1UHVA 3MS8A 1FP9A 1R85A 3NDZA 2WVVB 3DYOA 2EEXA 3VD5A 3VM5A 3ZOAA 3THCA 1MW1A 4NI3A 2WSKA 2VZOA 4GI8A 4GO9A 3AYSA 4A4AA 1XC6A 2D2OA 1XYFA 4M56A 5HOSA 1NP0A 2V3EA 4BS0A 2OYKA 1OIMA 3SEPA 3W53A 1BG4A 4AIOA 3W6MA 5I3DA 1R7OA 2CXGA 1NOUA 4QP0A 3VINA 2XYLA 1EDTA 1WE5A 2DIEA 4MB3A 2JALA 4PEEA 4W5UA 3UETA 1HXJA 5LA2A 3CH9A 3ZMRA 2DSZA 4WKAA 3WMBA 1CLVA 4PMUA 4GIAA 2YLAA 4MDPA 1H41A 1UR4A 3A3HA 4P8UA 1OIFA 2ZX9A 3OZOA 1VBRA 2EPNA 4JKKA 4EKJA 1OBAA 3PZ9A 4GXPA 2BVDA 2XSAA 1FHLA 4HPHA 2WVTA 4AZ5A 1BFNA 4TVCA 4BA0A 1L0PA 1VJZA 3MV11 3WF2A 3CZKA 3VDBA 3IJ9A 1ITXA 1B0IA 1ZBKA 4WLCA 2WZIA 1G1YA 1H0IA 1PX8A 1J0KA 2GJXA 2CESA 2G3JA 5ECUA 3WH6A 3IJ7A 4AZ7A 1S46A 2XM2A 2E0PA 4HMCA 1EOMA 4ACZA 5E0CA 1PEZA 2D3NA 3VOCA 4JIEA 4WF7A 1I75A 4LPCA 4GQRA 1K9EA 4QFUA 2WPGA 5D4YA 3WQVA 2DIJA 1CBGA 2YL8A 2FH8A 3VGDA 1V3HA 1JL8A 3AIWA 1KGXA 1CGXA 2ZUUA 4FLSA 2CKRA 2W4XA 4JL1A 1G94A 4QCFA 1E56A 4F66A 2GK1A 4H41A 2ZX7A 4W87A 3GNOA 1W1TA 2CBJA 1CNVA 4BQ5A 3AIUA 1CGWA 1E5JA 3NSXA 1M7XA 3CGTA 4W7UA 2BS9A 4CN1A 5JIWA 1VEOA 3VIOA 3GXDA 5JBEA 3CUHA 4NZCA 1V6YA 4B16A 2ZX6A 1QNPA 1XSIA 3RM9A 1UKPA 5D8WA 3ARPA 3ZT7A 1E40A 4AD1A 4D6JA 3A47A 3WH5A 4JHOA 4UQDA 4C7GA 1BSIA 3OGRA 4UFMA 1BYDA 3SIMA 1MFUA 3AYRA 1QHPA 2J79A 1HJUA 3PHAA 3K4AA 1UH4A 2D0HA 2Y24A 5A8QA 1EXPA 1BYCA 3UR7A 4AEFA 1CTNA 5D9MA 3OZPA 4LX4A 3BMWA 3MKKA 1PBGA 3BLPX 4PN2A 2D0GA 2YDRA 3G6LA 1JD7A 5ABFB 3I3DA 1HP4A 4ZXLA 3T09A 2NT1A 1VAHA 5A3HA 4JFSA 1GUVA 2W67A 2ZE0A 3DHPA 1V02E 4JFTA 3PZGA 4DWSB 2WBKA 2G8ZA 1B31A 2E8YA 5EB8A 5I6SA 3GNRA 3UG5A 1WDRA 2J25A 4XV0A 1CEOA 3HN3A 2X05A 1XH0A 4D6GA 3M6DA 5CJ5A 2CNCA 1HNYA 1E3XA 2QLYA 5IFTA 1FFQA 4PUDA 1C8YA 3WUGA 3G6MA 3TP4A 1KCLA 2GFTA 1A47A 5GPRA 1EA9C 2BV9A 3WELA 1XSKA 3W6LA 3RILA 4PMRA 1HP5A 1W3JA 5ABEA 1JF6A 1WPCA 3BXWA 4TTUA 1JDCA 3K8KA 1E55A 2WHLA 1SYTA 2WB5A 2ZUSA 1US3A 4MJ4A 5CG0A 4LXFA 1UWTA 4HZ6A 1UR8A 3L4YA 4W7WA 2XVKA 3VDHA 4R27A 3TTQA 3SCUA 1PAMA 1ZJAA 5HXMA 4AIEA 3PZTA 2XM1A 1JI2A 3EMCA 1E6ZA 2ZICA 2ZXBA 3TA9A 3BAJA 3RM4A 1UG6A 3I3BA 2E4TA 1E6XM 1DWFM 4UOJA 3EDDA 1ZS2A 1SMAA 5JBFA 1OT2A 3EMQA 4J7RA 5LYRA 1GHSA 3W29A 4YHEA 4OBSA 3U5YA 1O6IA 1G5AA 4F9JA 1GOQA 4TUFA 3UG4A 3AXXA 1Q6EA 2BY0A 1TVPA 2HVMA 1NARA 1V3MA 1CLXA 1Q6CA 4JCMA 2CCRA 2CIPA 4U2ZA 4MTVA 1GVIA 3MMWA 1JZ3A 1B3XA 1E70M 2FHCA 3NIYA 2DSKA 5AY7A 1PZ3A 3NSMA 1XD0A 3TTYA 2CITA 3IK2A 1CWYA 4Z2JA 3GTNA 1LF1A 1ZL1A 2O92A 2V5CA 3FHQA 1IZKA 5A6SA 4AXNA 1NWRA 5I79A 2WWCA 1V6WA 4C7FA 4CU8A 3O9NA 1QVBA 3AZSA 5BCAA 4IPNB 1K9TA 2V5DA 5A6LA 3BCFA 3WNNA 4HA1A 1UWSA 2WLZA 3AHXA 3T2OA 1GCYA 5GQBA 2WAGA 4GKLA 1BQCA 1OWQA 4PTXA 5FD0A 3A4WA 4CU7A 1JNEA 4CKQA 3D5HA 1J11A 2XFYA 2D22A 3W81A 3LPFA 2XSBA 2ZX8A 2W5FA 3WQ6A 4PMDA 4W8BA 4HOZA 4MAZA 2JF6A 3BAYA 2EQDA 2DT1A 1ODZA 4HP5A 1B1YA 4IUGA 3SCNA 3F5KA 3PZQA 2VRQA 3QOKA 1KB3A 3RDKA 1CGVA 3F5JA 3ALFA 2ZWYA 3RO8A 1BVNP 2Y2WA 4PMOA 5I24A 1E1FA 1V3IA 3VIHA 3N13A 1QNSA 3VIPA 2Y8VA 1UR9A 3N12A 2BHYA 1E4MM 3CUIA 3WNOA 1OCQA 1UD6A 1K9FA 2YLLA 4NRSA 4ZE5A 2DSWA 2WMGA 3WNKA 1CXLA 2PWGA 4KRTA 4PTWA 3BSHA 3AS2A 1QHOA 5I77A 1XSJA 5AC4A 2EXOA 2WMKA 1J0HA 2E3ZA 1PX3A 1E3ZA 2WWDA 1I1XA 3KWXA 3PZMA 4Z2KA 1ECEA 2VMFA 2EPMX 3SUVA 1BTCA 2W61A 3CMJA 4W85A 4CD6A 1W1PA 4W7VA 1W91A 4B15A 2NSXA 3GXIA 2WC7A 1MQQA 1VFMA 2DGAA 1SMDA 4W84A 1P6WA 4P7OA 3QHOA 4CVUA 1V6VA 4HU8A 1JF5A 1KBKA 2ZUMA 1UR0A 3AI0A 7TAAA 1KGWA 4MNJA 5A2CA 3BAWA 3F5LA 1NWUA 3ZR6A 1GW1A 3RJYA 2BHUA 4AZCB 3OA5A 2O9TA 1B2YA 3I3EA 3VNYA 2JIWA 2JEPA 1EH9A 1QBAA 1WZAA 4W89A 1BGAA 2W92A 1Q6FA 3GXFA 1JIBA 3K4DA 1CENA 1KXTA 2V38A 4X0NA 5FCZA 2DH2A 1W3LA 3GDBA 1QNRA 3AHTA 3VGEA 2PWHA 2J4GA 2W63A 2ESCA 2BY1A 1HKMA 3VGBA 2BXZA 3GH4A 2YKKA 4ATDA 2RGMA 1H0GA 1JAKA 4Q7NA 4IISA 2J62A 1TFVA 2WXDM 1NM9A 5CPQA 2Y5EA 5LA1A 4KWUA 4B3LA 1W9BM 3VIKA 1QI5A 2YBTA 3AJ7A 1H5VA 1E71M 3TOPA 4X9YA 1E43A 3W38A 2XVPA 2VX7A 1TG7A 2VQTA 2YL6A 4AMCA 3VIIA 5M5DA 3QHNA 4BF7A 1FHDA 5FL1A 1QW9A 3MO4A 1XD1A 5BRPA 2CKSA 1ZBVA 3T0BA 4U3AA 2VRKA 1UD5A 1UH3A 1Q6DA 1OT1A 2WC4A 1TVNA 3JUGA 4ATWA 2BHZA 3WFLA 3VGGA 1UD4A 3L4WA 4OJYA 3S2CA 1LL7A 3O2LA 4UQEA 1JZ7A 3WN6A 1W9UA 1UZ4A 1AQ0A 5A6MA 2PC8A 5E6YA 4PMYA 4X0VA 5C70A 3PZOA 3HMCA 3VX0A 1UWRA 4B3KA 1C3FA 4BQ3A 4JKLA 1X1NA 1HKIA 2WKGA 3VNZA 5JIPA 1OGGA 1C8XA 1GPFA 2ZUWA 3ZIZA 1JZ2A 5GNZA 1MFVA 3E1F1 3WNPA 2UWFA 3WDPP 1OM0A 1C7TA 1JNDA 3L4ZA 4MB4A 4J3VA 3DYPA 4JFWA 2XGBA 2E9BA 2VR5A 2J77A 3VMPA 2YL5A 1R8LA 2VC9A 2VCBA 4RE3A 3FAWA 4AISA 3ARTA 2DSVA 5CLTA 2OSYA 1E6QM 2OYLA 1AMYA 1UWUA 4BQ2A 2VI0A 3SUUA 2TAAA 2VL4A 5E0FA 1VEPA 3RIKA 6TAAA 4NSBA 4HU0A 4ZFMA 5HBFA 2E9MA 1C90A 3L2MA 1HJWA 3RM8A 2QMJA 1XCWA 3SCPA 1VF8A 1UA3A 3BAIA 1LJYA 5C71A 3WH9A 1H09A 2G41A 4U5IA 3POCA 1TMQA 4S3KA 1B3YA 2AMGA 2E40A 3WH7A 2J8FA 5A69A 1WZMA 2V3GA 4NF7A 4OUEA 2XJ7A 1HN1A 4J3WA 2WK2A 3MMDA 2FDMA 4AIUA 2YDSA 2J47A 1ZU8A 2W62A 3RCNA 3AXHA 2XVNA 3AHZA 2EJ1A 3VD9A 3VKKA 1NQ6A 2XIBA 1MW2A 5D9OA 1D3CA 1E0WA 1V02A 2BVTA 5HDRA 5EFFA 4MNMA 1EQCA 1KR1A 3WD3A 3W28A 1H11A 5A6KA 3MUAA 3W25A 3KL3A 1B30A 2UY2A 3QR3A 3BMVA 1EHAA 1VEMA 3GYCA 1KFWA 1MWOA 1BF2A 5DF0A 3L4UA 3MUY1 1KXHA 1B90A 3VD4A 5BXTA 1JXJA 3WUEA 2F8QA 3T0AA 3UEQA 2Y4SA 2ZWZA 4TOQA 3T0DA 3SCSA 3ZQ9A 1MXDA 1UR2A 2YBUA 4KGJA 3OLDA 2GDUA 3WL0A 2XGIA 3BCDA 4Z2IA 2VCCA 1JZ5A 1UD3A 4H8HA 2DT2A 5I0DA 2PF0A 2NW0A 4DUVA 2VZTA 1QI0A 3W26A 1H49A 2WMHA 1WB0A 2CYGA 2YL9A 2A3EA 2Z1SA 3A4XA 4M24A 3WDHA 4Z2HA 3MV01 1DWIM 2DEPA 4QAWA 4DUXA 3AMLA 3U7BA 3VO0A 3FN9A 3WFZA 3CUFA 3FNDA 2X1IA 1BHGA 6A3HA 4HMEA 1TZ7A 5M3WA 4UQBA 3EYPA 1NWTA 1CXFA 1RPKA 4PBGA 1MYRA 2VZSA 1UH2A 4M81A 1GONA 2XFRA 3CZ8A 1V0LA 4LYPA 3CZJA 1ITCA 3UCQA 3SCTA 2VVNA 3VIFA 3MUZ1 1JXKA 2A3CA 2J8GA 2D23A 2OYMA 4J3XA 2VOTA 4GO8A 2WMIA 1V3JA 5A8NA 1GNXA 4PMZA 4DUWA 1J0IA 3ZSTA 4YHGA 2NT0A 3SUSA 4ZE4A 1E4IA 1VENA 3VTRA 3ZJKA 2QPUA 2XVGA 1NOFA 5A8PA 4HZ8A 3VVGA 1BGGA 2DH3A 3WENA 2XG9A 2WVUA 3KL0A 1VIWA 1TA3B 1JZ8A 3WD0A 2FHFA 5JBDA 1MW0A 4HPGA 2WCAA 2AAAA 5A94A 1JG9A 3ARZA 3PBGA 2OSXA 1SR0A 1KQZA 2WVVA 3BC9A 3MSGA 1ZJBA 4WSKA 2WCSA 4PTVA 1UR1A 1LL6A 4U31A 1DP0A 3PZVA 3GBEA 3PTQA 4PRWA 2CHOA 3CZEA 4KRUA 5BRQA 1EGZA 2GSJA 4EAMA 1B3ZA 3RMEA 3W82A 3PZNA 3NJ3A 5I2UA 4GI6A 3ARWA 5I78A 4CN6A 4UFHA 1XYZA 4H2CA 2JIEA 4PSRA 3WUFA 4LGXA 1GQJA 1XH2A 2JE8A 1MQPA 3ZM8A 3AIBA 4W93A 4AD4A 1C7SA 1QBBA 3B9DA 3W24A 4AZGA 3CUGA 3QGVA 1V6XA 1KXVA 1W9VA 4ATLA 5CGMA 2GJRA 2MANA 2WANA 5FL0A 4YPJA 2ZOXA 1K9DA 1UKSA 1E5NA 2XUCA 1UOKA 3FAXA 1DWHM 5BXSA 3AMDA 1C8QA 1EIBA 2EBNA 4AYSA 3WL1A 4NRRA 5KZ6A 1HVQA 4PUEA 4PSPA 2VJXA 3SCOA 2D0FA 3ZSSA 4QLJA 4HOWA 1M03A 3N15A 3WY1A 1BYBA 5FIPA 1LQ0A 1B3WA 4L4OA 4PMQA 3AHYA 1U30A 1WO2A 3IAQA 2VVSA 3DHUA 4JFVA 3WDIA 3EDFA 4V27A 5CSYA 3EBVA 3PZUA 4XX6A 1TR1A 3ALGA 4D71A 2VO5A 2BNJA 1GOWA 4M29A 3BSGA 3SURA 3M46A 3N18A 3CZGA 3HJEA 1OGBA 2WCGA 4P7QA 1V3LA 1XCXA 1EQPA 2FGZA 4E8DA 4AZBA 4Q22A 4Y7EA 1EO7A 2V3FA 2HISA 2X2YA 2ZX5A 4XB3A 5BYWA 4GZIA 3ZR5A 1PIFA 3WBAA 1EDQA 4Z2LA 1UZ1A 1LG2A 4U33A 3ZJ7A 1F4HA 2GJXB 4CCEA 4M1RA 1E4LA 3ZJ8A 2CEQA 1UUQA 1B3VA 1GHRA 5A6JA 1CDGA 1OB0A 4ACZB 1LWJA 1NP2A 1HJVA 4CUCA 1NOWA 5KEZA 3WF4A 4J3SA 1KWGA 3WKZA 4QLLA 3WDRA 1CGUA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CLW A;  3AZR A;  1GOK A;  3CHE A;  4PTM A;  4D6I A;  5A2A A;  4B9Y A;  2WMI B;  1CEC A;  2VRJ A;  1R7A A;  1HKJ A;  3U7V A;  4PCT A;  1AQH A;  3UR8 A;  3W37 A;  1TUX A;  4UCF A;  3GXM A;  5EMY A;  3CHF A;  1X6N A;  1OSE A;  4TX6 A;  5A95 A;  4UZU A;  1OIN A;  3IJ8 A;  1VRX A;  3OB8 A;  3WD1 A;  1XRV A;  1UHV A;  3MS8 A;  1FP9 A;  1R85 A;  3NDZ A;  2WVV B;  3DYO A;  2EEX A;  3VD5 A;  3VM5 A;  3ZOA A;  3THC A;  1MW1 A;  4NI3 A;  2WSK A;  2VZO A;  4GI8 A;  4GO9 A;  3AYS A;  4A4A A;  1XC6 A;  2D2O A;  1XYF A;  4M56 A;  5HOS A;  1NP0 A;  2V3E A;  4BS0 A;  2OYK A;  1OIM A;  3SEP A;  3W53 A;  1BG4 A;  4AIO A;  3W6M A;  5I3D A;  1R7O A;  2CXG A;  1NOU A;  4QP0 A;  3VIN A;  2XYL A;  1EDT A;  1WE5 A;  2DIE A;  4MB3 A;  2JAL A;  4PEE A;  4W5U A;  3UET A;  1HXJ A;  5LA2 A;  3CH9 A;  3ZMR A;  2DSZ A;  4WKA A;  3WMB A;  1CLV A;  4PMU A;  4GIA A;  2YLA A;  4MDP A;  1H41 A;  1UR4 A;  3A3H A;  4P8U A;  1OIF A;  2ZX9 A;  3OZO A;  1VBR A;  2EPN A;  4JKK A;  4EKJ A;  1OBA A;  3PZ9 A;  4GXP A;  2BVD A;  2XSA A;  1FHL A;  4HPH A;  2WVT A;  4AZ5 A;  1BFN A;  4TVC A;  4BA0 A;  1L0P A;  1VJZ A;  3MV1 1;  3WF2 A;  3CZK A;  3VDB A;  3IJ9 A;  1ITX A;  1B0I A;  1ZBK A;  4WLC A;  2WZI A;  1G1Y A;  1H0I A;  1PX8 A;  1J0K A;  2GJX A;  2CES A;  2G3J A;  5ECU A;  3WH6 A;  3IJ7 A;  4AZ7 A;  1S46 A;  2XM2 A;  2E0P A;  4HMC A;  1EOM A;  4ACZ A;  5E0C A;  1PEZ A;  2D3N A;  3VOC A;  4JIE A;  4WF7 A;  1I75 A;  4LPC A;  4GQR A;  1K9E A;  4QFU A;  2WPG A;  5D4Y A;  3WQV A;  2DIJ A;  1CBG A;  2YL8 A;  2FH8 A;  3VGD A;  1V3H A;  1JL8 A;  3AIW A;  1KGX A;  1CGX A;  2ZUU A;  4FLS A;  2CKR A;  2W4X A;  4JL1 A;  1G94 A;  4QCF A;  1E56 A;  4F66 A;  2GK1 A;  4H41 A;  2ZX7 A;  4W87 A;  3GNO A;  1W1T A;  2CBJ A;  1CNV A;  4BQ5 A;  3AIU A;  1CGW A;  1E5J A;  3NSX A;  1M7X A;  3CGT A;  4W7U A;  2BS9 A;  4CN1 A;  5JIW A;  1VEO A;  3VIO A;  3GXD A;  5JBE A;  3CUH A;  4NZC A;  1V6Y A;  4B16 A;  2ZX6 A;  1QNP A;  1XSI A;  3RM9 A;  1UKP A;  5D8W A;  3ARP A;  3ZT7 A;  1E40 A;  4AD1 A;  4D6J A;  3A47 A;  3WH5 A;  4JHO A;  4UQD A;  4C7G A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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