4YXGA

F96y mutant of plasmodium falciparum triosephosphate isomerase
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
246
structure length
238
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHYERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWTPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
publication title Connecting Active-Site Loop Conformations and Catalysis in Triosephosphate Isomerase: Insights from a Rare Variation at Residue 96 in the Plasmodial Enzyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
total genus 94
structure length 238
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4yxgA00
1SO6A 3MBDA 1OFAA 5DELA 2R94A 1TTPA 5CSSA 3IIXA 1U83A 3LV6A 4O4WA 1UUMA 3KRUA 3FA5A 1W3IA 5D32A 3RU6A 4LRTA 1TPEA 1YTKA 3U8GA 3GB6A 1W3NA 4CNPA 3TUUA 1A5AA 1QPNA 1ZAJA 2NXGA 2FQIA 1FCBA 4LVBA 4NU7A 4A2SA 4BK9A 3NZRA 2HS6A 2EAWA 4DO6A 4CQ8A 1WV2A 4N2YA 3W22A 2X1SA 4BI5A 4JN6A 1FCVA 1Z48A 3NQGA 2Q3RA 3LLDA 1KLZA 3PR2A 4QJ1A 3WJWA 2A7PA 4GUIA 3TDFA 3GXTA 4RK8A 4MZ8A 4ZQPA 3WK3A 1QFEA 4Z1AA 3GK0A 1B4EA 2O7SA 3VCRA 3UWYA 4IGHA 1QPOA 3CLMA 5EPDA 5HJLA 2DZUA 4NNBA 3LBMA 1VHNA 3W07A 1QOPA 4UFJA 2VFDA 2QUUA 3P84A 2CLIA 3TW6A 1KFKA 5AC7A 3W84A 1YPFA 1EWEA 2C13A 4PC8A 2HS8A 3HGOA 3GDTA 3NM1A 1Q45A 2Y6ZA 3QM3A 3TQ0A 4JTHA 5CPOA 3PS7A 1GG1A 1XL9A 2VOMA 3EX3A 3PG9A 5HULA 2R8WA 4FNQA 1A50A 5I3FA 3DFNA 5IM51 3VKJA 3O6YX 3P61A 4HT3A 4N9BA 1TMHA 4GE8A 4P61A 3FKRA 3MYOA 3BVJA 3QF0A 2CLOA 1W5PA 2B7QA 1TYGA 5AFDA 3TXZA 3LXCA 5MHBA 1X6UA 1G4TA 5BMXA 3O63A 4AEOA 4QAIA 1Q6OA 1D3GA 3LHTA 2YYUA 1KTNA 3LHUA 3R89A 1AG1O 4PCFA 4AHQA 2NUYA 2PCQA 4QM1A 1EP2A 2BTMA 4Y8FA 3ANYA 4KKXA 1JULA 3HPSA 1H1ZA 1RQHA 2A1YA 3SIZA 2VENA 4HIBA 3W1LA 4O1DA 2OT1A 2WPBA 4A22A 4O16A 3P60A 3B05A 4HSNA 3B04A 3GDRA 1XBVA 3W3OA 2YSWA 5A8GA 5LSMA 1YXCA 1K8YA 2O7QA 4HNUA 4CCEA 4KFNA 3TC6A 3W1UA 2PURA 4JIQA 4GRSA 3PSVA 4MY8A 3A22A 4R33A 2Y62A 1XFBA 2VC6A 5IBXA 4JX6A 4FXSA 1JUEA 4LVGA 2ZZ2A 5FF2A 2JK2A 3MYPA 4E38A 5D2XA 1ZHAA 3KXQA 1W5OA 1BWLA 3V1PA 1JCMP 1VQTA 4P2VA 3HG4A 2VXNA 3W76A 3L66A 4WY0F 1LBFA 5DBTA 1KA9F 1RR2A 3NQEA 1OK6A 4WD0A 5D09A 1F6KA 2FFCA 3BLEA 2QCMA 1VH7A 5K4XA 2X1RA 3H55A 1GYLA 4D2JA 1F76A 3KVMA 2C16A 2CZEA 2ZTJA 3NPXA 3MI6A 1X7FA 4NQ1A 1MXSA 3EXSA 5CZSA 3B0VC 1F05A 3PY2A 3S6DA 3BGGA 1H7NA 5LZLA 2CLMA 2C15A 3IGSA 4DEFA 4LTSA 1I2PA 2JKPA 3V75A 4O0ZA 1WDWA 3GR8A 4PEKA 4RCXA 1PE1A 1DJQA 2OJPA 5BMWA 3HGSA 3W7GA 3BLIA 1TPVA 1PCKA 1PVNA 4MPQA 3CQ0A 5AHLA 4UNLA 3SJ3A 2QUTA 2Y7EA 4FEZA 4QNEA 3EWXA 1JUKA 4J9JA 3PULA 1TB3A 2ZRUA 3TSDA 3NPUA 3S5YA 1XBZA 2X16A 3PF3A 5J5DA 3S0CA 3NQMA 4LVAA 1YTDA 4AWSA 4A21A 1VC4A 3FLUA 1LP6A 1FBAA 1VCFA 2QCEA 3ABQA 1R2SA 1FQ0A 3TROA 1GJPA 3NQDA 4OBTA 4DQWA 2CW6A 4JXCA 5LNUA 3NAVA 4WX2A 5DY2A 3E0IA 3W23A 5AHNA 2A2IA 3LX9A 3STCA 1H50A 1XI3A 3WJXA 3NG3A 1TPFA 4O12A 1ZALA 4TR9A 1OYBA 4I7VA 2Z0IA 4HN4A 4ORIA 3L5AA 2QCCA 3HBLA 4FX7A 1XBXA 1GTHA 2Z2UA 4K39A 3QJAA 2EGZA 5GVJA 2E5DA 1B9BA 3HB9A 3M9YA 1YLVA 4UMAA 3IV3A 1EPXA 2QCHA 2H8XA 4WXYA 2WOQA 2ZDRA 4FF7A 3TKFA 2VFHA 4QSHA 3HG2A 5CPMA 3E02A 3W7MA 2NXHA 2E6DA 4JYEA 3G0UA 3LV5A 5DCBA 5KITA 4LW7A 5K2ZA 3NL2A 4LY8A 3LCHA 3O05A 3I65A 1SSGA 1O94A 1VS1A 3CB8A 3G8EA 1TSIA 4FB7A 2FTPA 3W9ZA 1FWNA 4DO4A 1KM6A 4XBSA 1TV8A 3QPZA 3T7VA 2FPYA 3IRDA 1AW5A 4MJMA 5FF0A 2ABBA 3GXPA 3GDMA 5LNRA 4JDBA 3GX9A 5E1QA 4M6QA 2Z6IA 2YGYA 1M6JA 4A3UA 3C2VA 3CTLA 3GDLA 5LKYA 1BKSA 5DY3A 3P82A 4H6KA 3PB0A 5D05A 1FWTA 5G1TA 1P1XA 4NVTA 1VYSX 3W7OA 3M1ZA 4OU1A 2FB3A 3W2LA 4YCPA 1AW1A 3B4UA 2F84A 2ZZ3A 2YXGA 2UV8G 4NJIA 2ZQ0A 2X1TA 3C2FA 4OV9A 1F7BA 1QDSA 1H60A 1DVJA 4O17A 2Y85A 3MUXA 3W7JA 4OE7A 1XKYA 4PA8A 1Q6QA 3ATZA 1JCNA 2VFEA 4QISA 4AAJA 2TYSA 3SFKA 3LXBA 5HWNA 2H8ZA 3LDVA 1GT8A 1QPRA 3O6CA 3OEXA 2R91A 2G95A 1TCDA 5FF7A 4BI7A 3FOKA 6ALDA 1R46A 4ZMGA 3QEZA 4Y6GA 5EA9A 3B8DA 3EB2A 2RDUA 3QRHA 1Q6RA 3TQKA 3GAKA 4OQVA 3QZEA 1GQNA 4X3ZA 3LI0A 1SO5A 1OFPA 4XWUA 1NF7A 3LLFA 4NX5A 2QCLA 1PL9A 3OBKA 3EXTA 4OWGA 1A5BA 5L6UA 1F6PA 6TIMA 2YW3A 5K3VA 1FXQA 1LRNA 3EX6A 1FY6A 4XTDA 3IIVA 3JRKA 3MJYA 3TCEA 3EEGA 2XN0A 2PC4A 3O06A 3DHDA 2V2DA 1GVRA 1G67A 2W0UA 2PRHA 4PODA 4TO8A 3W7PA 1IIHA 3W87A 3G1FA 4O15A 4DELA 1OFOA 2YZRA 1WBHA 5EBUA 2ZRXA 2I14A 1GYNA 1K3UA 1DL3A 1HFBA 2GPTA 3UZJA 1EWDA 1EUNA 4UTJA 5DBUA 1LYXA 2RDWA 4JIPA 4GUGA 4Z1CA 3G1SA 5I3GA 4N4PA 4O11A 5HR7A 3LM7A 4BFAA 1X1ZA 3KOFA 4QNWA 4GUJA 1PHWA 3DFTA 4JTGA 3USBA 1P0NA 3TW7A 1SU5A 2TRSA 4JTKA 3G0SA 3LRLA 1KFJA 3LHZA 4AWTA 2FPVA 1F2JA 3LCGA 4NXKA 2RDTA 5FF4A 4EOUA 2Z6JA 2RHGA 2V8ZA 4JTEA 1PCWA 5FEXA 5EYWA 4MUZA 1AMKA 2DZWA 1KM3A 4O4VA 2J6XA 3LTPA 1OK4A 4NX0A 2QR6A 2A7NA 5AC8A 1ME7A 3BW4A 1K7XA 3P62A 4OHQA 1H7XA 1FX6A 1SSDA 4FIQA 1TQXA 1L6YA 2GJLA 1FXPA 1NVMA 2BZNA 1PHQA 4UCGA 1X1OA 3W70A 3EWYA 1TQJA 3NDOA 3B06A 2YX0A 1DHPA 4GWEA 2TMDA 4ADSA 3HPZA 3I6RA 1DJNA 4K38A 4Q4KA 4DF0A 2E6FA 3DKJA 4RV8A 1QO2A 1VPXA 2V9DA 1FDZA 1S5WA 4AVFA 4WY0B 5D2TA 1K8XA 4XTIA 5G4EA 3W7CA 4L4LA 1ZAIA 1GEQA 5KZEA 4IMEA 4ICNA 3C2RA 3DKLA 1LOLA 2DORA 2QKFA 5F1VA 1VGAA 4RKAA 3TC7A 4Y9AA 3DFPA 3MP5A 4R7JA 4ZZ9A 4NJKA 2QCDA 4IWWA 1YDVA 4RZ5A 1KTBA 1H61A 1OFBA 1P4CA 1H7PA 3S1WA 4HSOA 3CPRA 3BG5A 5DLCA 2NX9A 1TPUA 4JYDA 4ZVJA 2ZZ4A 4FO4A 1HTIA 1TPH1 3UWQA 3C2EA 3DENA 3JS3A 2ZRWA 1TJRA 1KFBA 4XZ9A 3R2GA 4AHPA 3TFCA 3NQ8A 1K02A 1H63A 1LROA 2NX3A 2V5LA 1LM1A 4N4QA 3W88A 1S5VA 3M5ZA 2C18A 3U6WA 3THAA 3UD6A 3G1AA 3HQ1A 2WV8A 1VCVA 2YFOA 5F2IA 4DPPA 3SECA 3L5LA 4FIRA 4UTMA 1NEYA 1RPXA 4NZJA 1U5JA 1VYPX 2CLLA 4MVAA 4TIMA 3SY5A 3W6YA 3QSTA 4O52A 4OGZA 3L68A 1YTEA 1YYAA 1EB3A 2NXIA 1OVDA 3SI9A 2QF7A 2Y7FA 5K7JA 4KWVA 3MP4A 4UTHA 2DZSA 4IPJA 3W73A 5U4NA 3CC1A 2Y61A 2NWSA 5K9CA 2E6AA 3G1HA 3MMTA 4EIVA 1AK5A 3QMTA 4WZHA 5FF3A 3I7RA 1Q6LA 1OX4B 2ISWA 4LS0A 3PAJA 4NUWA 3G0XA 2QAPA 4O53A 1S3HA 1O60A 1WBJA 4DBEA 3NR0A 5HMSA 3LCFA 2FIQA 4HPXA 2VFIA 2J9ZA 2W6RA 3EX2A 4MY1A 4JTJA 5G2WA 4CQ9A 1TRDA 2YDAA 3W1RA 2R14A 4PTNA 4JTIA 4N9EA 1GPWA 1XUZA 4RX0A 4Y90A 4EWND 2QCFA 2F7FA 1RQBA 2HTMA 2ZA3A 3O16A 2E77A 2EHHA 4WY0A 4HHPA 4K37A 3L0NA 3FJ6A 5F2LA 3K30A 3ABRA 5FESA 1HO1A 2CLFA 3HPXA 1W5QA 4FNRA 4BF9A 4ZQMA 1C9DA 3ZFHA 2PRMA 4E2BA 1GVFA 2WO5A 4I9AA 3NO5A 3MI2A 1TO3A 5L9FA 1H51A 3EWZA 2XN1A 3I7QA 3LRKA 3N14A 3M7WA 3NPVA 1XBYA 5BNKA 3NQVA 3QQ1A 1H7RA 3HIJA 1JCXA 3EWWA 1IXPA 3P5ZA 4IX2A 2Y63A 3PBYA 4S1FA 2D73A 5D03A 5KTLA 3UXAA 3M44A 3N3MA 4LRSA 5CZJA 3TSMA 3LHYA 5SWUA 5CZ0A 1WOAA 4IXHA 3S1UA 3KFTA 4YWIA 1R30A 1OX6A 5D2WA 5BW6A 1LOSA 1IXOA 1SZNA 8TIMA 4UTKA 2DZPA 3CEPA 3NL6A 4S2BA 2ATMA 2WNQA 1H1YA 2DZTA 4AF0B 2Y89A 3GDKA 1UBSA 4LOCA 1LTDA 1K8ZA 5F4XA 3TXVA 5AC6A 1AL7A 3HOJA 2C19A 4HPJA 2H90A 1IGSA 3B0UX 5DXYA 3UPWA 4JR5A 3NQFA 4HNTA 4ZQRA 1WXJA 5K4ZA 3QFEA 1LDCA 2AQWA 1YDOA 2XN2A 1JJKA 3LGEA 3W75A 4WOZA 1W1ZA 3IIPA 2CZFA 1TTQA 5CGQA 2QJHA 1PS9A 2Y7GA 7TIMA 4E0CA 1QAPA 5HNRA 1Y0EA 4MKNA 4UFLA 3UWVA 3C56A 3EX1A 3R8RA 1R47A 1B4KA 3TU9A 2NX1A 1OABA 1EP1A 4TU1A 3DGRA 5AYZA 3NGJA 1F73A 1SQ7A 3P81A 3VE7A 3LHWA 2A5HA 2V2HA 3STGA 4RR4A 3GXNA 3P8IA 3G8RA 4M19A 3W7HA 5AHMA 3G1XA 2B7NA 1O4UA 2GVJA 1UASA 1L9WA 2NWRA 2YW4A 2JGYA 4NXSA 5H91A 5J5RA 1MEHA 3MWAA 1G69A 3U2OA 3BG9A 3Q94A 3WK1A 1G6CA 4JNMA 3IIOA 1KW1A 1N7KA 4KFOA 3LRMA 4QIUA 1R2TA 1SZFA 2V82A 2TPSA 3PWAA 2EF9A 2Z1BA 1O95A 1W31A 4Q32A 3S5ZA 3NXFA 3PC0A 3B0PA 3UNDA 3TH6A 4MY9A 5HR6A 1I2QA 3DI1A 2H3BA 3O8AA 3CM4A 4ZL1A 4H3DA 3S1XA 1DORA 3O6DA 3GKAA 3HJZA 3M43A 4JD4A 1YPIA 4R34A 3AJXA 3N2XA 1D9EA 2QJIA 4ORMA 1SO4A 1KTCA 3A9IA 4O1CA 4O8RA 1B3OA 3NL3A 1G4PA 3UWWA 2CZ5A 2Q8LA 1YADA 3ZWSA 5LGZA 3BLFA 4YL2A 4ZQCA 3W1NA 4IQLA 4LC8A 1KFCA 1JVNA 4AF0A 1XCFA 1TREA 2J27A 4K8HA 3C52A 3LTSA 4RLIA 3CWOX 2H6RA 5LNVA 3LCLA 2WQPA 4G1KA 3FS2A 4M7TA 4WQ6A 5LHEA 1KM5A 3M6YA 5KZDA 1FWWA 3UQNA 4GC4A 1M7PA 2X30A 2AAMA 1THFD 2E5BA 2JKEA 1RZMA 1EUAA 4FXRA 1CW2A 5C54A 1KBJA 1KV8A 4AMAA 5TIMA 5CPLA 4Z08A 1YXYA 3UWZA 3NPWA 3LHVA 1OF6A 1KM1A 5F2GA 4GNJA 3W7RA 2VFFA 3W71A 3L65A 5IBXC 4N6FA 3WJZA 5G2HA 3IIZA 1KLYA 3W74A 3QW4B 3TE9A 4L4MA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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