4Z0SA

F96a mutant of plasmodium falciparum triosephosphate isomerase
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
ARKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHAERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Connecting Active-Site Loop Conformations and Catalysis in Triosephosphate Isomerase: Insights from a Rare Variation at Residue 96 in the Plasmodial Enzyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 87
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4z0sA00
4ZQOA 3CEPA 4WXZA 3LHUA 1XCFA 3NZRA 5FEXA 5D2TA 1WV2A 3LHTA 3PC0A 2J27A 2Y62A 4M19A 3TX9A 2ZDRA 1XL9A 1LTDA 3KHJA 4L4LA 4E2BA 1WXJA 1H50A 1TSIA 2Y7EA 4JIQA 2DZVA 2FTPA 1LYXA 1TJRA 2QEZA 3LCFA 1EP3A 3FEMA 2X16A 4UNLA 3DENA 1ICPA 3N2MA 1AG1O 3G1DA 3FLUA 4LY8A 4S2CA 1QWGA 5FF7A 1VPXA 1X6UA 4WD0A 3TR2A 3GX9A 2QF7A 3FIGA 1J5TA 1IXQA 1VHNA 1MSSA 5LHEA 2LLEA 3PULA 3W1RA 5AYZA 3QSRA 5AHNA 4K7YA 3O1NA 1W0MA 3UY7A 1F6PA 2QAFA 1LROA 3QQ0A 3A9IA 1ZHAA 1TIMA 4TIMA 3C2FA 1G67A 1K3UA 4Y9AA 1I8JA 4O10A 4UTIA 1KM6A 3M41A 2ZA2A 1XUZA 1A50A 4TU1A 5CPMA 3L5MA 3N19B 3T44A 3L2IA 3GXPA 2WNZA 2WQPA 4RK8A 4ZQMA 3W86A 1JCLA 1XDMA 4MYAA 5K9XA 3VI2A 3NNTA 3W1PA 1EWDA 4AH7A 3IRDA 2QCEA 2A21A 4O12A 4QIUA 2IQTA 3A5FA 3TW6A 5HR7A 4UFMA 3QFEA 5CPNA 3M9YA 1Q6LA 2J9XA 3TMQA 3G1SA 5LNRA 2NUWA 2ZZ2A 1PCWA 3EWUA 3NPXA 4JDBA 1ALDA 1YPFA 5HR6A 1LP6A 1X1ZA 1GZGA 4NX0A 2FFCA 3QQ1A 2J24A 3I6RA 4C1KA 1K03A 1M6JA 3QEZA 2X2GA 3PB2A 1KV8A 3LHZA 2E77A 1YDVA 3UWVA 4O11A 2NXGA 5F1UA 3S1UA 1FCQA 1OYBA 3BG9A 4X3ZA 1W31A 4N2YA 1JUBA 3M16A 2J6XA 4LNYA 2OT1A 3B0VC 3EWXA 4LT9A 5LGZA 2YW4A 2I1OA 1TPWA 3H54A 4M5PA 1TPVA 3QW3A 3WJZA 3STGA 5CGQA 3EKZA 4GWEA 5G1YA 2NZLA 1I4NA 3UY8A 4RXGA 4N4PA 1CI1A 5BNKA 2PRHA 3DI0A 2AAMA 3NM1A 2QJIA 2VOMA 1VLIA 4UR7A 4FB7A 3OBKA 4Q4KA 5C54A 3P5YA 2G95A 2CFFA 1ZNNA 3NQ8A 4PC8A 1T8XA 2QCDA 3O06A 1QOPA 5FEZA 3BGJA 3P62A 4N9EA 4NZFA 3OIXA 2ZBTA 4I9AA 3QC3A 3I68A 1M7OA 2XFWA 3NR0A 1BKSA 2QCNA 3K30A 3HF3A 3TH6A 2ATMA 5K9CA 1WX0A 1SZGA 4NU7A 3O8AA 3LXAA 3LGEA 2GVJA 3HBLA 4JX6A 1OF6A 3CWOX 4N9DA 3LXBA 3MMTA 2TMDA 3DFPA 4N02A 5D30A 4Z1BA 4E0CA 5J5RA 1GYNA 2B0MA 1B57A 3BG3A 4DPPA 3TFXA 2YXGA 4AHPA 3KXQA 3PY2A 5K7JA 4B5NA 2Y88A 3RFAA 3EX1A 3LI0A 2V30A 3P8JA 2Y63A 2EPHA 2V2CA 3PWAA 4JTKA 3TSDA 4PL2A 1F6KA 1FWTA 4FO4A 1P1XA 3O6CA 3VCRA 1XXXA 3W7CA 3CPRA 1JCMP 1GWJA 3ZFHA 4RLIA 3GKAA 2TRSA 1RV8A 1RQEA 1JVNA 4XKYA 3LHWA 4LVBA 3IGXA 1PV8A 3WK3A 3E9AA 4FX6M 3M5YA 4I7WA 4HT3A 4AWTA 3PBYA 5KZDA 3S5YA 1ME8A 5I3HA 1O94A 3TQ0A 4AWUA 3B06A 3HPSA 4XQ6A 3KRUA 2CLFA 1KM1A 1ADOA 2CLIA 5H91A 4OGZA 3LCXA 5I3IA 4GUIA 4CQAA 1TRIA 1VQTA 4UTTC 3NEVA 4QQ3A 3C6CA 2E68A 1O60A 1PVNA 2A0NA 3TAOA 3TC7A 4MY8A 2E5CA 2NXIA 1W56A 3NQMA 2OMAA 5D2YA 3P7YA 4JTSA 4ADUA 2QJHA 4Z0JA 4QSHA 2ZZ1A 1F74A 2CLMA 3I7RA 3LXCA 4IMFA 1I2OA 1DQXA 5D2XA 1OK4A 2I9EA 1TCDA 2ISVA 1RD5A 4YWIA 3DKJA 3FKRA 4E38A 1C8VA 3GDTA 5CPOA 3W1LA 1G4PA 2E6AA 5I3JA 1KM2A 2BLEA 3MO7A 1XBXA 3M44A 1XC4A 1A5BA 3OVQA 5HMSA 3DI1A 1GVRA 1V5XA 3GK0A 4JTGA 5FF2A 4QJ1A 3O05A 4NT0A 3B8DA 2ATSA 1O4UA 1PHQA 1I2NA 2PRLA 4OT7A 5C6MA 3PF3A 4O17A 5LNSA 3HOJA 1F76A 2QUUA 3HGOA 4DO6A 2VEIA 5CG7A 1JCNA 2E6YA 3ATZA 4O19A 4PODA 3LLDA 3RLVA 2QCMA 4DO5A 2WKJA 5LZLA 4HKPA 1TYGA 1TPDA 3PR2A 5AHIA 4EF9A 5AN7A 2HTMA 1Z42A 4NVTA 4P61A 3GYEA 4Z1DA 1QFEA 2ZQ0A 5DBUA 3S9YA 1OK6A 4NJJA 2WOQA 2VEPA 3KOFA 3R89A 4MPQA 1GTHA 5HWJA 1SW3A 1WBJA 4HNNA 2P10A 3BLFA 2QCFA 5G2HA 2VELA 1H7XA 4O54A 4KWWA 4Y8FA 3G1AA 2Y7DA 4UTLA 4NXSA 1W5QA 1OJXA 2OCZA 5FEPA 3G1HA 4LVDA 1QNVA 5LNWA 3FS2A 1QCWA 2GPTA 3TQKA 4Z0SA 4AXKA 2W79A 4WJEA 3ABRA 3UD6A 3PAJA 3L0GA 4GUJA 3M6YA 4O0KA 3NA8A 1DKWA 5D05A 1K8XA 3C61A 4UFKA 1H63A 4YLWA 1T0OA 1EX5A 2TPSA 3HGSA 4DF1A 5CZ0A 4JY9A 3G8EA 1A5SA 3UWWA 3RF9A 3UZJA 1GVFA 3UPBA 2X1UA 2J88A 2QCDB 2GVGA 4POCA 1VS1A 1K7EA 1VCGA 3W23A 3TSMA 4UFHA 4LUJA 2ZRVA 3LB0A 3F1QA 3W74A 4WX2A 3O6DA 3SGUA 4YCPA 1FDZA 1DL3A 3EEGA 1MEWA 1QPQA 4GXMA 5KINA 5DXYA 2ZZ5A 1ZAIA 2C1HA 1LBFA 3LBCA 4JYDA 2ABBA 4UFJA 5CKSA 4A21A 3PS7A 1FCVA 5F4XA 1FBAA 2BX7A 3DZ1A 4JTFA 4XBSA 1PE1A 4DQWA 2JKPA 1L6SA 4DELA 5G2IA 2NV2A 3FJ6A 1KFCA 1W1ZA 1TV7A 3LRKA 1OFAA 3SZ8A 4MFEA 1K8ZA 1OVDA 3L0NA 3GR7A 6ALDA 2HMCA 1VRDA 4O1AA 3W9ZA 2BZNA 3PUDA 1KFKA 2C15A 1NSJA 4K7VA 3KFTA 2YYUA 1TO3A 4FF7A 1OHLA 4RJEA 4MZYA 3GZ3A 1KFBA 3S5OA 2ALDA 4DBEA 5D02A 3NAVA 1TV8A 1P0NA 1TPFA 1N55A 1ICQA 4ADSA 1ZENA 2V2HA 2RHGA 3EWBX 1WQ5A 1G7UA 4NNAA 1KM4A 3NPWA 1SFJA 2DZUA 5HNRA 1KLYA 3M47A 3EXTA 4AB4A 3FJLA 3L66A 3MP4A 5GVJA 5CSRA 3W2KA 2BWGA 2VFIA 3GDMA 3WJYA 1HG3A 3W7DA 2QJGA 5D2WA 3MHUA 4UNKA 4JIPA 5CZJA 1A53A 2C19A 4S1FA 4KFNA 2XN0A 5LHFA 3C2EA 5HUPA 1ME9A 1N8FA 4JX4A 3TE9A 5CPLA 3G1VA 2WNNA 4WOZA 4IXHA 5BRBA 3DHFA 3G0SA 3TXVA 1G4EA 4LC6A 4IPJA 4K8EA 2Q3RA 1VYRA 3LRMA 1TTJA 5LGXA 1SW7A 4LWWA 4IGHA 3GXTA 1MEHA 1DORA 1XUUA 4MLRA 3IGUA 4AMAA 3YPIA 2B4GA 2GQ9A 1K02A 3GDLA 3W75A 3LV5A 3ATYA 4TO8A 2C16A 3S6DA 1MO0A 4O28A 4PEKA 5EYWA 1X1OA 5IM51 4UUIA 3TXZA 2VFGA 4UTJA 5G4WA 1F05A 1X8FA 2GVLA 4NX5A 3G3DA 3V1PA 2ISSA 4OWGA 3NGJA 3IV3A 3DKLA 3IGSA 4BI5A 5AC6A 1B4EA 1I2RA 1JQVA 1QO2A 4W9TA 5I3FA 3BW2A 4LUIA 3T78A 3EXRA 2Q8ZA 4UFLA 2RH9A 1FXQA 1IF2A 1JUEA 3HPZA 4O1DA 4UXDA 3P82A 2DZWA 2ZFAA 4IMCA 2HS6A 2H90A 3TK7A 1H7NA 1NFBA 3G1XA 3KVKA 1LDCA 1V7YA 3W1MA 4XTIA 2QKFA 4IX2A 4WOQA 1H1YA 1VLWA 3L65A 2EKCA 3BK0A 2G5WA 4H3DA 1H51A 3FFSA 4OV4A 2FLIA 3RNDA 1QPOA 5FF3A 5DCDA 3OA3A 2FB2A 3MI6A 2ZRZA 5A8GA 2W6RA 3O16A 4ZZ9A 3STCA 4RV8A 3V75A 1JQXA 2OJPA 3E0IA 1QR7A 3VFLA 1SO6A 5AHMA 3OHIA 1S5TA 1GG1A 2J9YA 3EWZA 3BVJA 5MHBA 3C52A 3IIXA 4OU1A 3QMRA 3AJXA 5BOOA 2GJNA 3LCWA 4KFPA 3G1FA 3GLCA 1U5JA 3NQGA 2RFGA 2YX0A 2DORA 3S1WA 2QCLA 2YFNA 2Z6JA 1PIIA 4UMCA 4M6VA 4UMAA 4IWWA 1EB3A 5E1QA 4JICA 2QAPA 3NPVA 3UXDA 3QJAA 1EEPA 2GQ8A 5BMXA 1BWLA 3Q58A 3SGZA 2ZYFA 3MHFA 3HG2A 3W73A 3R8RA 5AHFA 4NZJA 5EA9A 3W1QA 1QDSA 3PUEA 3KAOA 4JTTA 1CX9A 3W7JA 3F03K 4JYFA 1QAPA 1IIGA 3RU6A 2KZHA 5F2LA 3W72A 1OYCA 3W70A 4EF8A 2HSAA 3F4NA 3WK0A 3NM3A 3PB0A 3LERA 5E0KA 1OABA 3E02A 1I45A 3UXAA 3H53A 4Q33A 1P0KA 3NQVA 4LRSA 3HO8A 4R53A 2X1RA 3P8IA 4CNNA 4XUGA 2ZZ7A 5A5WA 1W5OA 4BFAA 1SFLA 2RDTA 4O4VA 4Y96A 1L2UA 5HJLA 3EX2A 1U83A 3S1XA 4DBDA 3R13A 2YFOA 3ANYA 1MZHA 4PCFA 3EX6A 3S1VA 1LOSA 3C0JA 3IIPA 1OFEA 3DXIA 4DXVA 1SSGA 1JULA 1WDWA 1LRQA 4ONVA 1YTEA 3HB9A 1WAUA 4X9SA 2WV8A 4GE8A 5FI8A 4ZMGA 3KVMA 4K8HA 5G4EA 4WUIA 3LV6A 3KX6A 1UASA 3EWWA 4ML9A 1K7FA 2YGYA 6TIMA 3CT7A 4AHOA 1KM3A 1YTDA 3DFOA 4N4QA 1QPRA 5TQLA 3UYCA 2H8ZA 3W2NA 2DU2A 2Y85A 4RCXA 2V2DA 4MY9A 2WNQA 3SW6A 3RLUA 1GQNA 4JY8A 4O13A 2UV8G 3CU2A 2A7NA 1Q45A 2QDHA 2JGYA 4UTWC 4LS2A 5HULA 4QM1A 4QITA 4IMGA 3NQDA 4A3UA 2W0UA 1F7BA 3N9SA 4IX0A 4GUFA 3B03A 4U4MA 1THFD 1AW5A 1EWEA 1VHCA 4BI6A 2VEKA 4Q32A 3C56A 2CZ5A 3G22A 1AMKA 2QR6A 4RZ6A 3GR8A 1M5WA 2CU0A 2VEMA 2FDSA 2P0OA 1YXCA 3LTPA 1QO5A 1T96A 1VH7A 3I7SA 4MKNA 1VCFA 3O6YX 1H7RA 3GXNA 3N14A 1KV5A 3CC1A 4WY0F 1DJNA 1GVOA 3U8GA 1AL7A 5LNVA 2A1YA 1KLZA 4NQ1A 2V9DA 3G1YA 3L0KA 3NL3A 5F2IA 3SR7A 3VNDA 2NUYA 4TX9A 3C8FA 4BI7A 3W76A 1LLWA 1G6CA 4OE7A 1SO5A 3PG8A 3UWZA 1SUXA 3DGRA 2E5BA 2J9ZA 1Z44A 4ICNA 1H5YA 1QMLA 3ELFA 1LOLA 4JGDA 2PE4A 2DJLA 1F2JA 1AK5A 3KRSA 1ZJIA 4ZVJA 1PHWA 3TV8A 4CCCA 1RQBA 5TIMA 3TW7A 1KTBA 1GTEA 3RMJA 3GIYA 2O7SA 4FNTA 4JS3A 4JEQA 1GVQA 3PBWA 1FCBA 1H62A 2DJXA 1KBIA 4DF0A 3G3MA 1LCOA 3W07A 3N73A 4UCGA 2E6FA 2V0TA 2GQAA 4JN6A 1FDYA 4RX0A 5F2GA 1SO3A 3W7KA 2PRMA 1H1ZA 1DHPA 2RDUA 2BSLA 2A7RA 4PH6A 3N9RA 2QCGA 1SZNA 3NL6A 4LC8A 4BR1A 5HUOA 4LVAA 1TPH1 1XBYA 1G7VA 2VFHA 5DY2A 2FPVA 4MOZA 1Q6RA 1VR6A 3B04A 1PCKA 1MXSA 1BWKA 1YPIA 2OZ0A 3G24A 2YR1A 3P81A 2ZTKA 4LS0A 3TFCA 3LCHA 3GAKA 3WJSA 4AVFA 1TJPA 1O95A 3Q37A 4LV9A 4QNWA 2Y7GA 2NX3A 3I7QA 1KFJA 4JTLA 5AYXA 2NWSA 1GEQA 4OBTA 2ZA3A 5CZSA 3STFA 5SWUA 2GJLA 4PFMA 3M5ZA 4Y90A 1LM1A 3R2GA 4LU0A 3R12A 4IOTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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