4Z0SA

F96a mutant of plasmodium falciparum triosephosphate isomerase
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
ARKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHAERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Connecting Active-Site Loop Conformations and Catalysis in Triosephosphate Isomerase: Insights from a Rare Variation at Residue 96 in the Plasmodial Enzyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 87
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4z0sA00
3VKJA 1P4CA 1KM5A 3C52A 4DO5A 2VEMA 2ISSA 4RZ6A 5I3GA 3NM1A 4JX6A 1MZHA 1K8XA 5TBOA 1DVJA 5I3FA 4AHOA 1KM2A 3G18A 3IIZA 3LV6A 5HUPA 5AYZA 3P82A 2ZZ2A 4RX0A 4RZ4A 3CTLA 3KOFA 4FNUA 3O05A 5C5YA 1I2PA 2JGYA 5AYXA 1TPC1 1NF7A 2GQ9A 3HG2A 1BWKA 2J24A 3LCHA 3MI6A 2EAWA 2GUUA 3DFQA 1NF0A 2O7SA 3B0PA 3N2XA 1FDJA 2PCQA 4OQVA 4M6VA 5HWMA 2NV2A 2GVLA 3EWXA 5D37A 4O4VA 1JRCA 4RCXA 1SO4A 2QCHA 4OT7A 2WQPA 3NA8A 4M7TA 3W2MA 1H62A 3MBDA 1QCWA 3QM3A 2QF7A 1YXCA 3HPSA 1VPXA 3W7DA 3NQ8A 1QPNA 3LCLA 1OFDA 3W1RA 4DF2A 5I3JA 1G69A 4M7SA 4N6FA 3LI0A 2QEZA 1LP6A 2ZYFA 3W74A 3VE7A 2J88A 4UUIA 2Z2UA 2E09A 4QIUA 2E6YA 2WNZA 1G4PA 4WOZA 3N14A 4KKXA 1GQNA 1X6UA 3NQDA 1A5SA 3NQCA 1VYRA 2ZFAA 3PBWA 1H61A 1TPH1 2E77A 2ZZ4A 4WZHA 3W22A 5LSMA 3E49A 3P80A 5KSWA 1WYIA 2CLLA 1P0KA 4BI7A 2QJHA 1ZHAA 1J5TA 5F2IA 2ZA3A 1F6PA 3EXRA 3CU2A 1XM3A 5F4XA 4G1KA 3GDMA 3ATYA 4AEOA 3ZWSA 2FIQA 3NZRA 3TV8A 3Q58A 3NL3A 4AF0A 1XFBA 1CW2A 3TKFA 1DBTA 1QO2A 2E1DA 4JTTA 1GVRA 1ME8A 1LBLA 4HNNA 2Z1BA 2VENA 3HBLA 4KWVA 3RNDA 5EKYA 1THFD 1TRIA 3Q37A 1GPWA 1WQ5A 1H63A 2FLIA 2JK2A 1LBMA 3OIXA 3QH2A 1XBZA 4CQ8A 1LOSA 2VFGA 3QMRA 1W8SA 1DQWA 3DAQA 1O5KA 1WBJA 3G1HA 5AHNA 2QCNA 1EUAA 4UTIA 3GYEA 3C8FA 4A21A 4EIVA 2R14A 3BG9A 4NX5A 2ZRZA 4LRTA 1S5TA 2C13A 3NPUA 3Q2DA 1NAL1 3W73A 5L9FA 3RFAA 5HJLA 4YL2A 3W7RA 2JGQA 3LRKA 1I2QA 2O7QA 4LV9A 3G1DA 2CZDA 4FHAA 5D30A 1GVSA 4ZQCA 2QJGA 2RDTA 1AG1O 3W2NA 3QW3A 3W76A 4M5PA 3TQ0A 4IMGA 3UD6A 2CLHA 5AHLA 2GVGA 4TR9A 3NVTA 1YPFA 4IMFA 3FA5A 5LNRA 3S8HA 1TTQA 1GYNA 3DXIA 3AO0A 2E6FA 4YCPA 4O28A 3LXCA 1ZFJA 2QCDB 3T4CA 3THQA 3M5VA 2W79A 3EXTA 4AB4A 1O94A 4JDBA 4ZQNA 4HNUA 3WJWA 4Y8FA 1GG1A 1GVQA 4N9CA 3CIWA 5IBXA 3TXZA 4MY9A 3LRMA 2CLMA 2BZNA 2YX0A 5AN7A 1GVFA 2QKFA 1FCUA 3PB0A 3T55A 4RJEA 4NZFA 3P84A 4Z1AA 3W71A 4MOZA 4R7JA 2NWRA 3D0CA 3LXBA 2YYTA 3L5LA 1W5QA 1WA3A 4JTJA 4DF0A 4FEZA 2BTMA 2A1YA 1TPUA 1L2UA 1QNVA 2RKXA 1B4EA 3W2UA 5J5RA 3A21A 2EF9A 3W7KA 3S0CA 3HPZA 1VCFA 1ALDA 3C56A 4CQ9A 2Y85A 3LGEA 4GFSA 4HPJA 1FY6A 3VNDA 3PB2A 1EB3A 4UFJA 3EWYA 2P10A 1JJKA 4PCFA 1MSSA 1FDYA 2NUYA 3MUXA 1TPDA 5SWUA 4XWUA 1H7NA 4UMCA 3G0SA 4O11A 5K9XA 4PA8A 1QAPA 3V75A 1ICSA 5CGQA 4HHPA 1Q3NA 1D9EA 3TAKA 4BR1A 3PM6A 2XN1A 4RLIA 4O50A 1MEHA 4IX2A 1BEUA 4ZZ9A 1A5AA 2QCGA 3TROA 5K4ZA 3GDTA 4R33A 4WUIA 2E5CA 4JGDA 5EL1A 5U4NA 3B05A 3W7HA 3EKLA 4NNBA 2Y63A 2ZZ3A 3LM7A 2EPHA 2YFNA 1F05A 2CU0A 3DBPA 3OVRA 4PEKA 2A6LA 1WAUA 3L65A 2VC6A 3LTPA 2Y7EA 2GOUA 1TSIA 3W7EA 4KFOA 4NJHA 3NL6A 1TPVA 3DFSA 3W72A 2X30A 1KLZA 3GNDA 4A29A 2Y61A 3GX9A 1OFOA 3G1YA 3HMJG 3GLCA 1ICQA 1W0MA 1IIHA 3CWNA 2JKAA 4HNTA 1SZEA 3C2VA 4WOQA 1KTBA 3MHUA 5HNRA 1GVOA 1J2WA 3WK0A 4K7YA 5CSRA 1OFEA 3LBMA 4GC4A 2B0MA 1VLIA 4JY8A 1KW1A 4L4LA 2YW4A 1QFEA 2NXGA 3HG3A 4N6EA 4O17A 3W87A 4UFLA 5FF2A 4XZ9A 1YDNA 1GG0A 1F74A 4Z1BA 1OFBA 3TC6A 3G0UA 4Z08A 1DJQA 1VS1A 1B3OA 2P1FA 4CLMA 3NQ7A 1WBHA 3U8GA 1D3HA 2XN0A 1AW2A 4LVAA 3L0KA 2V2CA 1P1XA 3LHVA 4JIQA 1LRNA 4NNAA 4ZMGA 2EKCA 3W1XA 1KFCA 1RR2A 3O6CA 3TXVA 1QOQA 4JTKA 5KTLA 1JCJA 5I3IA 4R34A 8TIMA 1LZOA 3BGJA 3R5EA 3GKFA 3P7YA 1FX6A 3CM4A 5DBTA 4CQAA 4FNTA 4JXCA 2FB3A 2YPIA 4NNCA 5DY3A 3MJYA 1LLWA 4GNJA 2ATSA 4NQ1A 3STEA 2X16A 3S1VA 2A7PA 3W7OA 5E0KA 3TW7A 1SSDA 1FUYA 5K9CA 2DP3A 1P0NA 2ZA1A 1SW3A 3L68A 2QCDA 4TIMA 1O95A 3LHWA 3P5YA 3LB0A 2ISVA 3CT7A 2C16A 1QPRA 2ZRVA 3PF3A 1K8ZA 3CEPA 3L0GA 4GE8A 1JCLA 3PBUA 1Z42A 5AC7A 2OX1A 3C0JA 5DXXA 1OFPA 2LLEA 1OYAA 4FO4A 5HQEA 1G4EA 1HO1A 1TPFA 1XKYA 4OV9A 5LGZA 3W2JA 1D3GA 1PL9A 5H2ZA 3NGJA 3O6YX 4AHPA 3CHVA 5KMYA 3EB2A 3FS2A 1EX5A 3M5YA 3I65A 3GZ3A 3LLDA 4JEQA 5F2MA 4AHQA 1SO6A 4PODA 3ANYA 2E6DA 3A9IA 5LNUA 1ZCOA 1EP1A 5CZ0A 2NX1A 4PL2A 3KRZA 2VOMA 3TSMA 2QJIA 4WX2A 3W7CA 3HGOA 5G1YA 4QITA 4O1AA 1QPQA 3ZR4A 3CIXA 1I2RA 2V30A 3B0VC 3VI2A 4X2RA 4O10A 4Z1CA 1I2OA 2X2GA 3HB9A 4FNRA 3NOEA 1VZWA 1EUNA 4J9JA 1B4KA 3BK0A 3QMTA 3QQ0A 2Y89A 5G5IA 1OX4B 1OHLA 5K2ZA 3I7QA 3LTSA 4ALDA 1R2SA 3BLFA 2FTPA 1TPWA 1ML1A 4ADUA 5AHMA 3UPWA 2VEPA 1JULA 2ZA2A 3NQ6A 4MUZA 4N2YA 1IIGA 2V2DA 4U28A 3IGXA 1NFBA 4XKYB 4JD4A 2ZTKA 4IX0A 3LV5A 4O1CA 4MFEA 1DL3A 3CWOX 1HL2A 1TV7A 5FF7A 2V81A 1PE1A 5LZLA 1LOQA 3PG9A 3W2LA 2Q8ZA 3FKRA 4OHQA 5D2TA 1VJIA 1SUXA 4O19A 4DQWA 4CNOA 2PRMA 4E0CA 1PHWA 1OX5A 3QPYA 1YXDA 3O06A 1SZNA 1F76A 2WPBA 4IUOA 5C2XA 4JTLA 1OF8A 2B7NA 1JRBA 1SO5A 4ICNA 3MI2A 3W1QA 4TX9A 4ML9A 3LCIA 4Q4KA 1SSGA 1UCWA 4O14A 4IJBA 2C14A 4JTFA 4DPQA 1YPIA 5CZTA 3HG4A 3GR7A 1JCYA 4JN6A 3R12A 4HT3A 4MLRA 3NL2A 3M5ZA 4FIRA 4N9BA 3RK8A 3M7WA 1FDZA 2DU2A 3UWYA 2V5BA 3PULA 1HFBA 1SFJA 2RFGA 3KRSA 1GTEA 3G1VA 3TQVA 1KM3A 3OVPA 2OJPA 3OEXA 4O52A 4I7WA 1QMLA 3RU6A 4BI5A 3NQVA 5FEWA 3FLUA 3MWAA 3LI1A 3SFKA 4K6AA 4MVAA 5CSSA 4KWWA 4FNSA 3KVLA 1ZNNA 1CI1A 1H60A 1PCWA 1W5NA 3S1UA 2HS6A 2ALDA 1J4EA 1TQJA 3GNNA 3KFTA 3T40A 4BI6A 5BMWA 2C15A 1A5BA 1R46A 4W9TA 4K37A 5E1QA 3EKZA 1IGSA 1YXYA 3WJYA 3HGSA 2OZ0A 2RDWA 1YYAA 3IIOA 3MP5A 5K4XA 4X9SA 3A22A 2DZWA 3N9SA 2ZZ7A 3UYCA 2TMDA 3KVMA 1IXOA 4LWWA 5D02A 4JS3A 3JS3A 3TAOA 3L21A 1SPQA 1GZGA 1PV8A 3A24A 5DELA 4WY0F 4FX6M 3QSRA 1YTEA 3SECA 4P61A 4MJZA 3TSDA 4TMBA 3NR0A 5LHFA 3OVQA 1W3NA 2ZDRA 4UFHA 1W1ZA 3WJSA 4FF7A 3U2OA 4HSNA 1FCVA 4QNWA 3C2FA 1N55A 2NXHA 2C1HA 2DZPA 4RKAA 3S42A 4UNKA 1VRDA 3NPVA 5DXYA 1TPB1 4NUWA 3LHZA 3CLMA 3NQGA 3N2MA 2VXNA 3C2OA 4MLJA 3W1PA 1YDVA 1Q6RA 1SZGA 3M1ZA 4OWGA 4I7VA 3HJZA 3PSVA 4ZQMA 1SR9A 3BLIA 2IQTA 2Y7DA 4NJJA 3E02A 1W5OA 1EIXA 1T96A 2YDAA 4JDYA 1H50A 5F4WA 2UV8G 5CPLA 4KFPA 3KHJA 1L9WA 5DBUA 2GJNA 1M5WA 3UWUA 3DENA 1FXPA 4Q33A 1W37A 3FJ6A 2I1OA 5HWJA 5E93A 4M6QA 1VHCA 2QAFA 4DPPA 1VHNA 3I7SA 1M6JA 2H90A 2FPYA 4WXYA 4JIPA 3IEBA 2ZRWA 1IXPA 4FX7A 3GAKA 5HINA 3LDVA 1N7KA 3TIMA 1TRDA 2FB2A 4LU0A 2Y6ZA 1OX4A 4C1LA 3TA6A 3HG5A 3PY2A 4POCA 5AHFA 1T0OA 2CLOA 5ABTA 3GIYA 1U83A 2P0OA 3DFOA 5BMXA 3S1XA 1GWJA 3HOJA 3LCFA 1OABA 4XKYA 3W83A 2AQWA 3W1LA 1TCDA 2ZBTA 3W7JA 3HF3A 3S5NA 1MXSA 5BNKA 3MO7A 4AWSA 4H4IA 3UWWA 5D04C 2WJZA 3EWUA 1LROA 2QCFA 3UZ5A 4UFIA 3MYOA 3M6YA 3E12A 1Q45A 2Y7GA 4NU7A 3DGRA 3NPWA 1SW0A 4L4MA 3PBYA 5EYWA 2DZSA 3NL5A 4QNEA 2QCEA 4JTGA 1O4UA 2GQAA 4I7UA 5G4EA 1FXQA 1LM1A 2V2HA 5DN1A 3INPA 3DU0A 3W84A 4YLWA 5D33A 1LRQA 4UMBA 3TX9A 2A7NA 5FEZA 4NT0A 4OBTA 4O16A 4JX4A 4QSHA 2Z6IA 1KTNA 3ABRA 3M0ZA 4BWLC 1KA9F 1W3IA 4RK8A 2XN2A 3UPBA 3A5VA 2Y62A 3PVFA 4ADSA 3EX2A 4MZ8A 4O4WA 5HUOA 1IXNA 2BSLA 4UMAA 2C19A 4IMCA 3F4WA 1XBYA 4MJMA 4E2DA 3BG5A 4LUIA 4PFMA 4UXDA 1TTIA 3GK0A 4MFDA 3TFXA 1LRTA 1LCOA 1UASA 1ZENA 2WSYA 2NX9A 2DJXA 4WY0B 2NV1A 1ME9A 4ZQRA 1XBVA 1X1OA 5D32A 4HNVA 2C18A 3W88A 4LS2A 1SFLA 1C9DA 1SW7A 2HTMA 5BW6A 1MEWA 2VFEA 1I2NA 2TYSA 2DJLA 1VH7A 1EP2A 2DZXA 3P5ZA 4YWIA 1Q6OA 3BLEA 1LBFA 3H55A 1I8JA 5D09A 4FNQA 4CCCA 3OBKA 2H8XA 1OJXA 1RZMA 3NQMA 1S3HA 3KVKA 1RVGA 1UUMA 3E96A 1VC4A 4EOUA 4HPXA 1KM1A 3LXAA 4H6KA 3C61A 3JRKA 3S5OA 3IV3A 5EA9A 4DO6A 4QQ3A 1GEQA 1Z44A 2ZQ0A 4DF1A 1VQTA 1XL9A 2ZRYA 1Z41A 1U5JA 4KFNA 3SIZA 3MBFA 3NG3A 3YPIA 1OK4A 3TQKA 2JKEA 1W5MA 2QUUA 3T78A 4IQLA 2D73A 2OT0A 1WX0A 3P60A 3A5FA 2GPTA 1S5VA 3W75A 2NWSA 2BLEA 2J9XA 3N73A 2DZVA 1XUZA 1LDCA 2R91A 4RR4A 5F4SA 1L6YA 3B4UA 3L5AA 4O53A 5DCEA 5D03A 3W7MA 1X8FA 3M5XA 1A50A 3BPWA 1TYGA 4X3ZA 5CZSA 1OF6A 1L6SA 4Y6GA 4JX5A 3WK2A 2HSAA 3PBVA 4LC8A 3F4NA 1HUVA 1WXJA 2F84A 2YSWA 3FJLA 2QR6A 1A53A 1KBIA 4IWWA 2RDUA 4M19A 5C6MA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ARZ A;  5M3W A;  2VEM A;  2EPM X;  3VKD A;  1PDZ A;  1DVJ A;  4AHO A;  2PDB A;  3G18 A;  3CV6 A;  1UWI A;  2E25 A;  5HUP A;  3II1 A;  4KET A;  1JI1 A;  3P82 A;  2VRK A;  2P88 A;  3PJX A;  3AHY A;  1NF7 A;  3Q45 A;  1RP8 A;  3HG2 A;  3LCH A;  3FW6 A;  3PZV A;  1J9Y A;  4Q6X A;  2PF8 A;  2E9L A;  4M6V A;  4MWA B;  2GVL A;  4O4V A;  2JAL A;  4IFO A;  3CHD A;  7A3H A;  4AIE A;  2WQP A;  1UD2 A;  4V2X A;  3NA8 A;  4M7T A;  4OTK A;  1Q2R A;  1H62 A;  1BXN A;  1QPN A;  2OWC A;  3KTS A;  5E70 A;  4N6F A;  5CPS A;  3THD A;  1LP6 A;  3W74 A;  3VE7 A;  1GK8 A;  4XV0 A;  2FH8 A;  4KKX A;  1GQN A;  2W27 A;  1EYW A;  4HA1 A;  1VYR A;  4MWA D;  4XAG A;  2E77 A;  4DXX A;  4WZH A;  3W22 A;  2ONE A;  2OVL A;  2QJH A;  4HU3 A;  3W00 A;  3CU2 A;  2VGF A;  4G1K A;  3GDM A;  4QGC A;  1S2A A;  3QV7 A;  3ZWS A;  4AEO A;  2BOF X;  2DT1 A;  5A8O A;  2Z1W A;  1JFX A;  1O6I A;  2DIK A;  2GK1 B;  3TKF A;  4JTT A;  5GNX A;  1GVR A;  1ME8 A;  1TWZ A;  3Q4D A;  4X60 A;  1J8V A;  5FL1 A;  3C3U A;  3BSG A;  1OT1 A;  3MVI A; 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