4ZMGA

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with dh03a338
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of Human Dihydroorotate Dehydrogenase (DHODH) with DH03A338
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
total genus 139
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2015-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4zmgA00
1H7NA 1VPXA 2HSAA 1WX0A 3UNDA 3LHZA 3TV8A 3WFAA 3M9YA 4O18A 4JS3A 3HPZA 4LVDA 3VE9A 4A2SA 3NVTA 4CNPA 1JVNA 4BI5A 2CLHA 3QYQA 1LDCA 3W88A 2FPTA 1FCQA 1W8SA 2BLEA 3L5MA 4Z08A 1SFJA 2A2IA 4HN4A 4Q33A 3GDKA 1UJPA 2Y61A 4AWUA 4JYEA 3W7HA 3QMRA 4A29A 1UBSA 3G1XA 4UFMA 4UTMA 1FCVA 2E5DA 1TQJA 3QH2A 1SU5A 1SO6A 3NQ2A 3S5ZA 1KTNA 4WY0F 1PIIA 3EX6A 4DPQA 1ME7A 4HSNA 2DJXA 3NQMA 1H60A 1G67A 1RVGA 1CX9A 3TAOA 2LLEA 4PTNA 4WXYA 3THAA 1NSJA 5BRBA 5CSSA 1NVMA 1F5ZA 1LROA 3DFOA 4O1AA 3RK8A 3YPIA 3NQVA 1A5BA 1QOQA 3BPWA 3LRKA 1DJQA 5HJLA 3DAQA 3HBLA 5FF7A 2NWRA 3AJXA 4RXGA 3EB2A 4UTUA 1KW1A 1NAL1 4DO6A 1P1XA 4MFDA 4X22A 4PA8A 1FXPA 4L4MA 5G5IA 1DL3A 1JULA 1SO4A 1J5TA 1L6SA 3MP4A 1HO4A 3HB9A 5D04C 5D03A 3O07A 1UB3A 2GVJA 2A5HA 3NZRA 1BTMA 1XI3A 5U4NA 3M5XA 4ONVA 1XL9A 3CEPA 3U2OA 3GAYA 3W2LA 4AVFA 3G8EA 1X8FA 3HG5A 2CLLA 4LS1A 4MY8A 5D33A 3P60A 1JUKA 5FEXA 1GVSA 1LLZA 1VGAA 2TPSA 1HUVA 5DBUA 4OBTA 3E9AA 4XWUA 1H7WA 3W1TA 3W1XA 3RLVA 3NQ7A 1W1ZA 4PL1A 1HFBA 1SUXA 4QIUA 1YPFA 3IIXA 4GNJA 3M47A 3KRSA 4KKXA 1OFAA 4MZ8A 3JR2A 5K9XA 1N7KA 3W07A 4AWTA 3TCEA 4DEFA 4HNNA 2H8XA 3L21A 3TQKA 4G1KA 1A5SA 2CFFA 3W83A 2ZZ7A 4M19A 1JCLA 3HGSA 3HQ1A 4LV9A 4MZ1A 5DBTA 5LSMA 1KFBA 4DPPA 1W0MA 4NJHA 5EA9A 5HINA 4JX5A 4CNOA 3G22A 1TV8A 3M0ZA 2ISWA 4DO5A 3NPWA 3QZEA 1Z42A 3DI0A 5CPMA 3W7NA 1LP6A 1THFD 1LORA 1WA3A 3WJSA 4JGDA 1UASA 1HTIA 3KOFA 3ABSA 3W2MA 3O06A 4LTSA 1LM1A 5U7SA 3HJZA 3W9ZA 5CSRA 1RR2A 1NFBA 4CCDA 4M6VA 2QCDA 3Q58A 4IOTA 1BWLA 5D2XA 1EWDA 1W5NA 3CHVA 1ADOA 4I7WA 4Q4KA 4Y6GA 4QITA 3FYPA 3PM6A 4ORMA 2QR6A 5DY2A 4IMEA 2A21A 4HKPA 4IUOA 2XN1A 2V81A 3QC3A 4CNNA 4UMCA 3S1XA 5CPOA 5F4SA 4S2BA 3KAOA 4JEQA 3UXAA 3PG8A 2GVLA 1TYGA 3N9RA 3DFPA 5DY3A 1YTDA 3QM3A 3U8GA 2OJPA 3PSWA 1G69A 4LVGA 3S9YA 3PBYA 3NGJA 3G3MA 4DO4A 1AK5A 2W79A 3W22A 1GG1A 1TJRA 3PB2A 4HHPA 2JBMA 3I65A 4C1KA 3F03K 3Q94A 1M7OA 3EX4A 3ZFHA 1AW2A 5CZ0A 2B7NA 3NDOA 3TX9A 2YX0A 3EXTA 4AWSA 4FB7A 3B8DA 1O5KA 1KFJA 1TPUA 2Y63A 1VQTA 3GB6A 1BWKA 3G1DA 5H2ZA 5L6UA 4BK9A 1GVOA 5AC7A 3TSBA 1HL2A 1XBZA 2C13A 3EWZA 4TU1A 2A85A 3PSVA 2WNNA 5A5WA 3PC0A 3NL5A 2V82A 2QAPA 3TMLA 4K7YA 1LRTA 5D2YA 5T26A 1KLZA 4YMZA 2P10A 3NQ6A 1M5WA 1IXPA 3LHYA 4WX2A 5E1QA 4JICA 1I8JA 5C55A 3QRHA 1L9WA 1UUOA 2YFOA 5HR6A 5EY5A 1L6WA 3UPWA 4BI7A 1F2JA 4LVAA 1WDWA 3UY8A 2CW6A 2Z0IA 2A1YA 2NWSA 1D3GA 3M43A 3TKFA 4ADUA 3LM7A 3TR2A 2VKZG 2Q3RA 3DFNA 1P4CA 1I2NA 1WAUA 4JY9A 1FCBA 3IRDA 3CIWA 2ISVA 3W1PA 1LOQA 1ME8A 4CQ9A 1TJPA 1B4EA 2R8WA 1KFLA 3HGJA 2GUUA 3NNTA 3NYZA 2C14A 3Q2DA 2DZXA 1IGSA 3FYOA 4YCOA 3FFSA 4M5PA 1JQVA 4WUIA 5HUPA 4UTHA 3E12A 1ZNNA 4GJ1A 1SW0A 4JDBA 3PUOA 5D37A 4UMAA 1TPDA 5D05A 3OVRA 3W85A 4MYXA 3W76A 4N4PA 5K4ZA 1SSGA 2A7PA 3A23A 4XZ9A 4QM1A 3KVLA 3NQEA 5DELA 2XN2A 1G4SA 3P74A 2I1OA 2ZCGA 3W7DA 5CPNA 4FEZA 1WBHA 1N55A 4KWWA 2PRLA 1FUYA 1K7EA 3L0GA 3DKJA 3F4WA 4GWEA 4HNVA 2NXIA 2WQPA 3E49A 2Q8ZA 1TPB1 2V2DA 1I45A 3LERA 4MLJA 4GFSA 1RQBA 4TIMA 1VYRA 3RLUA 3GR8A 5AFDA 5EBUA 2J24A 2AQWA 4DBDA 3GVGA 3N3MA 4FNUA 4JY8A 4TMBA 3ZWTA 2F7FA 3QMSA 3CLMA 4H4IA 1EUNA 3NPVA 3M44A 3MI3A 3WJWA 5TQLA 4XBKA 4NNAA 3CIXA 3W71A 3BW2A 2CLFA 1PHQA 3ANYA 4DF1A 1XBVA 1VZWA 1G4PA 2I14A 3DI1A 3EX1A 4JYFA 1T8XA 3UXDA 2A7NA 1A50A 3R5EA 4Y8FA 2C18A 3WJXA 5LNSA 3B0UX 4LVBA 3LXBA 2PRMA 2FQIA 3N34A 3KX6A 4R7JA 2Y85A 3NPXA 2A6LA 4KFNA 3V75A 3M41A 4FNQA 2NX3A 5KMYA 1P0KA 4O16A 2Y88A 4JTGA 2Q8LA 3GLCA 3BGJA 3C8FA 1XDMA 1SR9A 4JTFA 1XXXA 3NA8A 1R2RA 1TRIA 2JKEA 2BX7A 3MI6A 3CTLA 1QO5A 4FXRA 4IPIA 1K7FA 1T99A 2H3DA 3NL3A 5KITA 4YXGA 3W7OA 1TPVA 2O7SA 1XC4A 3N14A 1K8ZA 4LUJA 2V5LA 2H3BA 5L9FA 4GUHA 1NEYA 2B0MA 5K9CA 1Q6OA 1LBFA 3W6YA 4UIOA 3G1SA 3SW6A 5AYYA 2DZVA 2E5CA 3CB8A 2DZTA 4N9EA 3BG5A 2V2HA 4X3ZA 3W70A 1JR1A 2HMCA 3WJZA 1H51A 2YCEA 4ZL1A 4IWWA 1BEUA 2DJLA 3BG9A 1K3UA 4LC8A 3B4UA 5FF2A 1AL8A 4ZQOA 5ABTA 1A5AA 4P2VA 5G2WA 4N9CA 5DN1A 1LCOA 4FHAA 4Y9AA 4HNUA 4HPXA 3C61A 2Q3OA 3U6WA 3KVJA 4IQLA 2AGKA 4TR9A 3B0PA 3STGA 2VOMA 4QNEA 1H62A 1HO1A 2CZEA 2ISSA 5DXYA 3S1VA 3G0UA 3NOEA 3A22A 1LZOA 2Y7DA 3G0XA 4LNYA 4PL2A 3SSJA 2ZZ4A 4WJEA 3VE7A 3TROA 1XCFA 3NQAA 4ORIA 4IX2A 1SQ7A 4QNWA 1C8VA 2ZA3A 1H5YA 2NXGA 1OFDA 2ZA1A 3TW6A 4FNPA 1TPEA 3NXFA 5I3GA 3PS7A 1KBJA 3INPA 5EKYA 1W56A 4U4MA 2E09A 2WSQA 1EP2A 4O50A 2NUXA 1KA9F 3CM4A 3H53A 4PCFA 4ZVJA 5DCDA 1ZFJA 2WSYA 1QDSA 2OCZA 5LNUA 5E93A 2C0AA 1H7XA 1WOBA 1YXDA 2J9YA 2W0UA 5DLCA 4KWVA 1KM0A 4UFIA 4UTTC 3C2EA 4FNRA 5HNRA 4U28A 1JRCA 2JGYA 3LHWA 1SPQA 3MHGA 1ML1A 1X1ZA 3RU6A 3W1MA 3WK1A 2JKAA 3GX9A 3Q37A 2PURA 4LW7A 2FLIA 2QCHA 1FWSA 3WJYA 2Y7GA 4NZFA 2FB3A 1QO2A 4RJEA 3L66A 3A24A 3NR0A 2BXVA 2B7PA 2QJHA 4UR8A 1OFOA 2RKXA 3L2IA 1FWWA 3IIOA 4FX8A 2V2CA 5G2IA 4WY0A 1TV5A 4MIMA 3GKAA 4BFAA 1GG0A 4S1FA 4UMBA 3O1NA 1EPXA 1YTEA 3HPSA 4UC5A 5FI8A 3FJ6A 3O6CA 3SECA 1C9DA 1ICQA 1QPQA 5FF4A 2YXGA 2R94A 3ABQA 4UTLA 3TXVA 2G96A 5AHMA 4O1BA 4UUIA 3QF0A 4YL2A 2BWGA 4UTIA 3TK7A 3TQVA 1YDVA 3TSDA 4FNTA 1FBAA 2ABAA 1SZNA 4OU1A 1NF7A 3C2OA 1RQEA 3GR7A 3P81A 4CCEA 2Z6JA 1FDJA 4NNCA 1J2WA 1TMHA 3FS2A 3MP5A 4YWIA 1KM1A 5HQEA 3LX9A 1U5JA 3L9CA 1P5BA 3L0NA 2F84A 1F76A 3LDVA 1I2QA 3M5ZA 1H1ZA 3T78A 4ICNA 3E0IA 3CEUA 2FFCA 2FB2A 3GYEA 5LNVA 1ZALA 1KFEA 4YLWA 2C3ZA 3NM3A 4EOUA 2J9ZA 2Z1BA 4JIPA 1LRQA 1WXJA 1X7FA 2GQ8A 4HSOA 3IGSA 4OWGA 3R8RA 4MY1A 3TMQA 1TPWA 3BLIA 4NJKA 4CCCA 4NJGA 4UFLA 3VNDA 5HWMA 1X6UA 4GUIA 2GQAA 2C15A 4PC8A 3P82A 1W3TA 4O57A 4K37A 3KFTA 3N9SA 4JX4A 1JQXA 5SWUA 3LHVA 2ZFAA 1GEQA 3G1HA 1YADA 5AC8A 1DQWA 4P61A 3MBFA 3GDLA 1HG3A 3O16A 4DXVA 4LUIA 3G3DA 2Y7EA 4AXKA 1PL9A 2ATSA 5MHBA 3PBWA 1LBMA 5KZMA 4H3DA 1ME9A 4O52A 3NL6A 3UY7A 5FF0A 4OE7A 2OMAA 3PAJA 1Y0EA 4JYDA 2VENA 2ZRZA 1QMLA 1TTQA 3S5NA 4N9BA 3UWZA 1C29A 1J4EA 3A5VA 3B05A 3MYOA 4AHPA 1FDYA 3C56A 1W31A 3LTYA 3E02A 4ZMGA 3UWQA 4WOQA 3PY2A 4QJ1A 4HPJA 1GYLA 4EF8A 3OHIA 1DORA 2E6YA 1XKYA 5AHLA 4AF0B 1K8YA 2WNQA 2X30A 3UD6A 1G7UA 3IVUA 1AMKA 4HT3A 3P61A 2V8ZA 1AL7A 1OX4B 4JTJA 3SR7A 1MZHA 1O60A 3HF3A 4XTDA 2RHGA 2R14A 2VFGA 3B03A 1W37A 3M6YA 3CPRA 1VCGA 3IIPA 2QUTA 3LCGA 1MO0A 3W2KA 1I2PA 3DHFA 1IIHA 5CZTA 5D2VA 4GUFA 2Y70A 1TIMA 2PCQA 1H7PA 5C2XA 1XBYA 3BW3A 3S6DA 3OEXA 4NQ1A 1TPFA 1EWEA 5J5RA 1OFBA 5G1YA 2QCNA 1F6KA 4K8HA 2CWNA 2ABBA 5D38A 2NX9A 4QQ3A 4RV8A 1CW2A 3BG3A 1GVQA 2G97A 3EKZA 4K36A 4UNKA 4JXCA 1WV2A 2WV8A 3STEA 1FX6A 3DZ1A 5DCEA 3CC1A 2OZ0A 3T44A 1OYAA 3KRUA 3LTSA 1M7PA 3S8HA 2CZ5A 3FA5A 4ML9A 3SIZA 2KZHA 1QPOA 3DU0A 4HNTA 2RH9A 1QR7A 3FOKA 4PODA 2NLIA 2ZRUA 3UWWA 3C2VA 5J5DA 2FTPA 4IGHA 1PHWA 3PUDA 2NX1A 2ZZ5A 3P8JA 1KM5A 1T96A 3S42A 4S2CA 3NQCA 1IF2A 3S1WA 1PE1A 1DJNA 3M5YA 4FIQA 4D2JA 4IPJA 4AB4A 2BZNA 2QCCA 4EF9A 5HMSA 1N8FA 2NV2A 1JCNA 4GE8A 1H63A 1GTEA 2FPYA 4UXDA 2GQ9A 1R47A 3NQDA 1K7XA 1OFRA 1TPC1 3KXQA 2ZRVA 3ELFA 3JRKA 1XDLA 2QJGA 3I7RA 4NX5A 3SFKA 3UQNA 3O15A 3B04A 3WK3A 5CKSA 3FJLA 1W3IA 4JIQA 2X2GA 2GOUA 2VFFA 1O95A 3W2UA 1OX6A 1G4TA 2I9EA 2ZZ6A 1EEPA 2C6QA 3LLFA 1SSDA 1SZGA 3GKFA 1OF6A 4K38A 3HG2A 4RZ6A 3W7MA 4O4WA 1SW3A 3B06A 3F1QA 1YXCA 3PB0A 1OABA 3W72A 4JTEA 4O0ZA 1YPIA 4NVTA 2E6DA 2EF9A 2NUWA 4UTWA 2PC4A 3TA6A 1VRDA 1O5XA 1DOSA 3BK0A 3LGEA 3LV5A 2G95A 4E2DA 1BKSA 1JJKA 3BO9A 4DF0A 3L65A 1Q6RA 3IV3A 2YDAA 5G2HA 1DKWA 2Y62A 3BGGA 4AMAA 4MJMA 2RDWA 2J6XA 2EAWA 1FWRA 1FY6A 4O8RA 2A7RA 3GIYA 1I2OA 1F7BA 4TMCA 3HG3A 1RZMA 4N6EA 3PWAA 2YYTA 3VI2A 2H6RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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