4ZQMA

Crystal structure of the catalytic domain of the inosine monophosphate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis in the complex with xmp and nad
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
357
structure length
333
Chain Sequence
DPVPTGGDDPHKVAMLGLTFDDVLLLPAASDVVPATADTSSQLTKKIRLKVPLVSSAMDTVTESRMAIAMARAGGMGVLHRNLPVAEQAGQVEMVKRSGGLLVGAAVGVGGDAWVRAMMLVDAGVDVLVVDTAHAHNRLVLDMVGKLKSEVGDRVEVVGGNVATRSAAAALVDAGADAVKVGVGPGSICTTRVVAGVGAPQITAILEAVAACRPAGVPVIADGGLQYSGDIAKALAAGASTAMLGSLLAGTAEAPGELIFVNGKQYKSYRGMGSLGAMLVPEGIEGRVPFRGPLSSVIHQLTGGLRAAMGYTGSPTIEVLQQAQFVRITPAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mycobacterium tuberculosis IMPDH in Complexes with Substrates, Products and Antitubercular Compounds.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase,Inosine-5'-monophosph
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis (strain atcc 25618 / h37rv)
total genus 101
structure length 333
sequence length 357
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2015-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4zqmA00
2E77A 1NEYA 4H3DA 4Z1DA 2BWGA 1TPC1 1TPFA 2QCGA 3MHGA 2ZYFA 4NJGA 2J27A 3GR7A 1H60A 2R94A 4WY0F 4O53A 1W5PA 3LBMA 2R14A 1FWWA 4K37A 1VYSX 3C52A 1GZGA 3G0UA 4XZ9A 3PB2A 2CW6A 5F2LA 4E2DA 3PR2A 4NNCA 5KMYA 4UTWA 4JIQA 1HTIA 5I3GA 3RNDA 4CLMA 5F1VA 4JYFA 2V2HA 3GLCA 1ADOA 3IGXA 1UJPA 3BG5A 1TTIA 1KFJA 3W86A 1RQEA 4LUJA 1AK5A 1VGAA 1DHPA 3NGJA 3N3MA 4YLWA 1L9WA 5BMXA 4P61A 3S5ZA 1ICPA 3TKFA 1LOQA 1TB3A 4JTHA 3QQ0A 2WPBA 5DCEA 4ORIA 3LB0A 2Y7DA 2E68A 4CQ8A 3C6CA 3VE7A 2QCFA 1SZGA 1KM3A 2X16A 1G4TA 2WNQA 3G1VA 2VFGA 4PH6A 4M7SA 1KTBA 4WXYA 5FF3A 5G5IA 4K8HA 3TXVA 3C2RA 3LTYA 2TPSA 3OEXA 1SFLA 1QPQA 3BGGA 1QOQA 3GNDA 3L21A 3NPXA 4FEZA 4HKPA 1JUKA 1NF7A 4O4VA 4BWLC 3W84A 1DJQA 4RCXA 1KLYA 2WO5A 4YL2A 4O11A 4IX0A 5FEPA 5D09A 1SW0A 4UTMA 5HULA 5AOUA 4XQ6A 3UQNA 3DFQA 4IMFA 4FIRA 5HWJA 3ELFA 2A7PA 4HPJA 1JR1A 1KFBA 3E0IA 1G7UA 1KTNA 3W7RA 2O7SA 2ATSA 2YFNA 2C1HA 1PS9A 2NUYA 1IXNA 3NQ8A 3SGUA 4DBDA 3CIXA 4A29A 3S1UA 2EKCA 1TV7A 4NNBA 4MY8A 4MYXA 4YWIA 1EX5A 1YDVA 3UZJA 4MPQA 4QITA 3HF3A 1EPXA 4JICA 1S3HA 1YTKA 3DKLA 5HMSA 1LBMA 5HUOA 3QM3A 5FF7A 5AYYA 1YADA 4H6KA 3G0SA 1F2JA 3TROA 3WJYA 1M7OA 5EMUA 1FX6A 3CLMA 4DELA 1EA0A 3DZ1A 4LC6A 2VEMA 5D04C 4ZQPA 2C3ZA 1WA3A 3RLVA 1E51A 3C61A 3HGSA 4JY8A 3N73A 4AXKA 1F73A 2CLFA 3QPYA 5K7JA 1KM6A 4PC8A 1SW7A 1HL2A 3TE9A 1W56A 1EWDA 3GKFA 1F5ZA 1I45A 2BTMA 1X1OA 1UUOA 2VENA 3CT7A 4XWUA 5IBXC 4IWWA 3FJLA 4IGHA 2NUWA 2DZTA 4XKYA 5LGXA 3BW3A 1DQWA 1YDOA 5G1YA 3OA3A 1VR6A 4CNNA 1QAPA 1WBHA 3QMTA 4UFMA 3TQKA 3PY2A 3EXTA 4FIQA 3W2JA 2NX3A 1BTMA 1JCLA 3V75A 2X1UA 4IPIA 2E6YA 3C56A 2Y63A 4E2BA 3O8AA 3QRHA 3W1AA 1Q6OA 4AF0A 1R2SA 2ATMA 2VKZG 3NQAA 4QM1A 4UIOA 2QEZA 4FNTA 3TR2A 3W2UA 1VPXA 4WX2A 2B7NA 1A5BA 3G1DA 3R89A 4UTKA 3HJZA 5K3VA 3FEMA 3WJZA 3LXBA 1OVDA 5D32A 1EP2A 1LRQA 3VCRA 1DOSA 2JK2A 4N4QA 5HWNA 3NZ1A 2AQWA 3FKRA 3PBUA 3HQ1A 3VKJA 4D2JA 2RKXA 3HG4A 2DZWA 4LRSA 2VC6A 3KVLA 3VNDA 3HGRA 2OT1A 3LCLA 3IIOA 1VHCA 2Y89A 1YXCA 1N55A 4S1FA 3CC1A 5AHFA 3SECA 1T96A 2ZZ4A 3F4WA 3IV3A 2B7PA 2OJPA 4OQVA 1GYLA 3FLUA 4M5PA 3IIZA 3N9RA 2ZRYA 4FNSA 2ZDRA 3DI0A 5K4XA 3BLFA 2TMDA 2J9ZA 2WSRA 4RK8A 3GXTA 1HO1A 2VEPA 3HMJG 2TRSA 1P0NA 3GYEA 3LHUA 2PRHA 1I2OA 4HNVA 5K2ZA 1KM5A 1R2TA 1UBSA 2DZXA 3W7GA 3G8EA 4UTIA 3W23A 4O52A 3W1QA 1K8YA 1ONRA 3SZ8A 3OVQA 4S2CA 4GBUA 2QUTA 1TCDA 2VFDA 3M43A 2F7FA 1K8XA 3W1UA 1OFBA 2IQTA 1HFBA 2FB3A 2QJIA 2TYSA 2NWRA 3S5OA 1ZJIA 1WOBA 3VFLA 8TIMA 4NX5A 1XI3A 2H3DA 4Y90A 1LZOA 1A5AA 1YPFA 4ZQRA 1JRCA 3DI1A 4RR4A 4UFLA 1OFEA 3BG3A 4AVFA 2YW3A 4UTTA 3EWUA 3LRLA 5DELA 2B7QA 2Q8ZA 2H90A 4JTTA 3UYCA 1V5XA 3LXCA 1GG1A 4CNOA 4JIPA 2DZSA 1G4PA 3TJXA 3MYPA 3NNTA 3KRZA 1H7OA 3Q58A 4JX4A 1TRDA 3L5LA 2HSAA 2F84A 4JTJA 4MUZA 5F1UA 3CM4A 5CSRA 4AHQA 1RZMA 4BWLA 2ZZ3A 3C2VA 4IJBA 3LCXA 5U4NA 5LHFA 1A5CA 2NXIA 2A6NA 4ZVJA 2C16A 2GVLA 4RXGA 4HNNA 4WD0A 3NPUA 1A50A 4MKNA 3SI9A 3IGSA 3GR8A 3PSWA 3FIGA 3DH7A 3NQVA 2WNZA 2QKFA 2EPHA 3NPWA 2O7QA 3ABRA 1RVGA 3NQ7A 4G1KA 4LS2A 3OBKA 4N9EA 4O1BA 2YYUA 3PBVA 3S1WA 1YXDA 4BFAA 3W7PA 1WOAA 7TIMA 3SSJA 4ZQCA 3O63A 1VYRA 3G1HA 1IXOA 1I2NA 3DBPA 3DAQA 5IM51 3UWVA 1F76A 4M19A 3QFEA 5DCBA 3P81A 3M47A 3W85A 1LOSA 4O8RA 4OU1A 2ZTJA 2DJLA 3ZFHA 2RDTA 3QEZA 3G0XA 4O17A 1FXPA 2Y70A 2QR6A 2CLIA 1TV5A 3NQMA 3TCEA 5K9XA 3H55A 3KRUA 4QJ1A 4FX6M 2ZZ2A 5F4WA 1KV8A 3DENA 4K38A 4CCDA 4OV4A 3S6DA 5U7SA 1T0OA 1KFCA 3TFXA 3PBWA 3BPWA 3LRMA 4Y96A 3NO5A 1D3GA 1RQBA 1SZEA 1LM1A 4O10A 3GIYA 2GQ8A 3BK0A 1R30A 2FIQA 1NAL1 5K9CA 2J9YA 3WK2A 5DY3A 1TQXA 2V2DA 1ZAJA 1MXSA 4KFNA 4JD4A 1W0MA 3LTPA 1SUXA 2VFFA 1ZCOA 2DU2A 3A5VA 3NYZA 4QISA 1UB3A 4LOCA 1W8SA 3STCA 3MI6A 5E1QA 3L66A 1QPRA 5T26A 5AYXA 5AN7A 1RR2A 3DHFA 5H2ZA 2YYTA 2VFEA 3FOKA 1EUAA 1UCWA 1G7VA 3NL2A 1FWTA 1R47A 4AWUA 4NZJA 4LVGA 5HR6A 4HN4A 4IOTA 3L0GA 3KVJA 3GVGA 1JJKA 1DVJA 3OIXA 4DBEA 3CQ0A 1W31A 4UFHA 1IXPA 2E6AA 4DQWA 5AHLA 1VQTA 1XFBA 5I3HA 4MY9A 1MSSA 2GVGA 1R2RA 2OZ0A 2VEIA 3HPSA 3LLFA 1K7EA 3N9SA 4PODA 4LW7A 4K39A 1S5VA 2YXGA 3P61A 4MYAA 5D2TA 4MIMA 1W5OA 4IX2A 3NM3A 1B3OA 2H3BA 4K7YA 3CWNA 1H63A 2NXHA 2I9EA 4DF1A 4CNPA 1DKWA 2WSQA 3P80A 2RHGA 3P60A 3M7WA 4JR5A 4PTNA 3TU9A 2C15A 4UTLA 1G69A 1AG1O 1IGSA 3KX6A 3NEVA 3W7HA 1JVNA 3O07A 3UWYA 5BOOA 4O1AA 2VELA 2ZZ6A 3N2XA 4JDBA 3MJYA 5KTLA 1K03A 2W79A 3LHTA 1QPNA 5D33A 3GDKA 3KOFA 3GXNA 3P5ZA 4HSOA 2CLKA 3ABSA 3R8RA 3VI2A 1FY6A 3EKZA 3KVKA 4UFIA 3CU2A 1YYAA 2ZRZA 3PBYA 1UASA 2P10A 4QNEA 3M5ZA 3HPXA 1FCVA 3UWQA 4ML9A 3GDMA 3HGOA 3E96A 5D02A 2W6RA 2AAMA 5K9DA 3BLEA 3QQ1A 1B4EA 1K02A 3T78A 3ZWTA 1H7WA 3S5YA 4FB7A 3KHJA 1Q3NA 1NSJA 3LI0A 4O12A 3QH2A 3F03K 1WBJA 4WY0B 3P84A 3RU6A 4JTUA 2D73A 1C9DA 3EXRA 4TIMA 5C55A 4BF9A 3LCWA 3M5VA 3LBCA 2YPIA 1CI1A 2ZCGA 3RMJA 3GDRA 4OGZA 4UC5A 3S0CA 3L5AA 3T44A 3GK0A 3M44A 1T99A 1TIMA 4JX5A 4L4MA 3WJXA 3P5YA 2V8ZA 2A4AA 2ZRUA 3PF3A 1JCYA 2CFFA 1GPWA 3W07A 4O50A 3L67A 4JNMA 4NJJA 3O15A 3HG3A 3A24A 3FKKA 1TMHA 5HJLA 5F2GA 2CWNA 1S5TA 1VLWA 5EA9A 5D30A 4KKXA 2W0UA 4FNQA 3R2GA 1AL7A 1J4EA 1TPDA 3BARA 1TPWA 1MEWA 5D05A 4DXVA 1P5BA 1XC4A 1KBJA 3NAVA 3LCHA 5BW6A 4UMCA 1VZWA 4OE7A 3EB2A 5HNRA 3W1TA 3W1NA 3R13A 5KINA 3CEUA 5MHBA 5CKSA 3NZRA 4NJKA 2R8WA 3L5MA 4NJHA 1AW2A 2YGYA 1KM4A 4U28A 1TTPA 4HHPA 2NUXA 3W2LA 3WK3A 4GUGA 1JUBA 5CG7A 4HNUA 3LI1A 4BK9A 1G4EA 3SIZA 4RXFA 3MI3A 3B06A 2KZHA 2CLMA 1JCNA 3TAKA 3TSDA 3G22A 4UNKA 2G96A 1ZNNA 1OYCA 4GUHA 1QFEA 3UWWA 3P67A 4WUIA 1SO6A 3NQFA 1LRNA 1XBXA 3M5YA 3NQDA 3P7YA 4O0KA 3LV6A 1YTDA 4IUOA 4I7VA 2G5WA 4JS3A 2Q3OA 5LSMA 4X3ZA 1L2UA 4BI5A 5CPLA 1FWRA 1VLIA 1F7BA 3GDTA 3TQ0A 4DO4A 3CHVA 1K8ZA 2WV8A 3DFTA 4LVDA 1MEIA 1LORA 3MMTA 2A2IA 3TIMA 4GUJA 1SO3A 4BI6A 5G2WA 3W1MA 3IVTA 2Z1BA 2E6DA 4GUIA 1FDYA 2Y7FA 1WV2A 2ISSA 2V5BA 2YR1A 4ZZ9A 1M5WA 3EX3A 3HGJA 4NNAA 3LERA 3NXFA 2HTMA 4NT0A 2QJGA 3NL6A 3QW3A 3THAA 4Y6GA 3W87A 3PSVA 1JRBA 4QQ3A 1DV7A 2DZPA 1GTEA 2QUVA 4EF8A 1FXQA 4FNPA 3W1PA 2JKAA 2ZA1A 4MZ1A 3BLIA 1OF6A 3NOEA 3C2FA 1FWSA 4N9BA 1SQ7A 5I3IA 3PULA 4FO4A 1OHLA 3JRKA 3E12A 3GNNA 3H54A 4O28A 1BEUA 3C2OA 4JTIA 4S2BA 3STEA 3N2MA 1TV8A 1WQ5A 4Z1CA 1YDNA 3W75A 3KRSA 3A9IA 3HG5A 1VHNA 2X30A 1LCOA 2BZNA 3GDLA 4R33A 3H53A 2CU0A 3BG9A 4LY8A 1IIHA 2VEKA 3T7VA 4LT9A 3QMRA 2V81A 2V0TA 3Q2DA 4DF0A 4JXCA 1Z42A 2FTPA 3ATYA 3I7SA 1DORA 4MFDA 3EKLA 3EXSA 3OG3A 4FX7A 3SY5A 4B5NA 3B4UA 3S5NA 4XTDA 1H61A 3LTSA 4HNTA 4YCPA 4Y8FA 1XL9A 1Q6QA 4EOUA 4JTFA 3HB9A 2ZZ1A 4CQ9A 3HBLA 3WK0A 1RD5A 3MI2A 4N4PA 3FA5A 4EWND 1VH7A 3UXAA 3M9YA 3MHFA 4MFEA 4ZMGA 4AHPA 3TH6A 4KWVA 1XBVA 3W7CA 1ZFJA 5C2XA 1J5TA 3L68A 4O13A 4JGDA 3BO9A 2P1FA 1LBLA 1QOPA 1K7XA 3G3MA 1PHQA 2WQPA 4IPJA 1SZNA 4LS0A 4RZ5A 3UPWA 3O16A 3O6CA 4MJZA 1LOLA 2CZEA 3TDFA 3M1ZA 1LLWA 4O15A 4HPXA 3KXQA 3NPVA 4I7UA 4NZFA 1TO3A 2GOUA 4LVFA 1N8FA 1KTCA 2GPTA 1WYIA 3I65A 1H51A 1XKYA 2C19A 2P0OA 3PUDA 1SSGA 2PE4A 2NX9A 2FLIA 3SR7A 1CW2A 3W1LA 4GC4A 5KZEA 2A0NA 3NG3A 3ZR4A 3LXAA 4QNWA 3R5EA 5FEZA 1GT8A 4NVTA 1WDWA 1SU5A 3TQVA 5KITA 5DLCA 4AWTA 5SWUA 3NQEA 3LM7A 2ISVA 2Y85A 2ZRVA 1OK4A 3EWZA 3QSTA 3PWAA 4LWWA 4O4WA 2VOMA 2FFCA 1QO2A 4E0CA 3UWUA 2J6XA 5J5RA 1G6CA 4O1DA 1KM2A 2XN0A 5KZDA 1ZAHA 3TXZA 4PL1A 3U8GA 5E0KA 4NU7A 1Y0EA 4LV9A 2CLEA 3IGUA 2Q8LA 3L65A 3IEBA 5C5YA 4JN6A 1X7FA 4DEFA 4C1KA 5KSWA 1SSDA 2NLIA 5H91A 4O16A 1I2PA 1PL9A 2I14A 2YX0A 4Z08A 1YXYA 3W7EA 3TUUA 2LLEA 5AHMA 3W2KA 2ZFAA 3MP5A 1UUMA 3BVJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3WQP A;  4HA3 A;  1ZSX A;  1M04 A;  2BWG A;  1TPC 1;  3MHG A;  4NY2 A;  2R94 A;  1KCK A;  4O53 A;  2R14 A;  1BRL B;  1FWW A;  3T0C A;  2QPU A;  4BQ3 A;  4KWU A;  3UG5 A;  3QTP A;  5F2L A;  4E2D A;  7PTD A;  2WZT A;  5IXE A;  3NWR A;  5KMY A;  3D47 A;  2WM1 A;  4PCT A;  5I3G A;  4L7Z A;  2PP0 A;  4MB5 A;  3KHD A;  2V2H A;  3GLC A;  1ADO A;  3IGX A;  1OIF A;  3BG5 A;  4LH8 A;  3RIK A;  2IQ0 A;  1DHP A;  3NGJ A;  1UZ1 A;  3GIP A;  1V03 A;  3CMJ A;  1LOQ A;  2YLA A;  3W26 A;  4O8A A;  3LB0 A;  1Q6F A;  2FZM A;  4CQ8 A;  4D1J A;  2QCF A;  1SZG A;  2X16 A;  2XH7 A;  3AHX A;  1G4T A;  3ZZ1 A;  2PWE A;  4KW2 A;  4PH6 A;  5G5I A;  4K8H A;  3TXV A;  3C2R A;  3LTY A;  4F40 A;  3OEX A;  4Z2J A;  1VEN A;  1QOQ A;  3NPX A;  4BCE A;  3B9E A;  4HKP A;  1UIP A;  2Y1H A;  2YBU A;  4DZ5 A;  4HTY A;  4RCX A;  4KIE A;  1KLY A;  2WO5 A;  3PTK A;  1Q65 A;  4PUE A;  2ZUU A;  4I6K A;  4OOZ A;  3GIQ A;  3A4W A;  3EA1 A;  3ELF A;  1E15 A;  1V93 A;  3GTN A;  1EOM A;  1KFB A;  2CKS A;  1G7U A;  8XIM A;  2OR2 A;  3GRI A; 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