4A22 | Genus

Total Genus 117

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	117
sequence length	342
structure length	329
Chain Sequence	PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGVVGGYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGNVHGVYKPGNVKLRPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLT

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Glycolytic and non-glycolytic functions of Mycobacterium tuberculosis fructose-1,6-bisphosphate aldolase, an essential enzyme produced by replicating and non-replicating bacilli. pubmed doi rcsb
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE
molecule tags	Lyase
source organism	Mycobacterium tuberculosis
total genus	117
structure length	329
sequence length	342
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2011-09-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4a22A00

2FIQA 1O5XA 2YGYA 4PL1A 2VFHA 1FQ0A 3LHUA 4IWWA 4BI6A 3SZ8A 2HMCA 2NX3A 5AOUA 3BV4A 4MPQA 1T0OA 3E9AA 4N4PA 2NUYA 3W1MA 2TMDA 2YW4A 3TNOA 3VFLA 1VPXA 3F4NA 5AHLA 3T4CA 1HG3A 2TRSA 4XQ6A 3S1WA 4YCPA 4JTTA 4JTIA 2V81A 5HWJA 4QM1A 2CZFA 1TMHA 2X2GA 1I4NA 1EEPA 3GAKA 1TTPA 1TPUA 1XFBA 2C14A 3N34A 4QSHA 1L2UA 4IPIA 1AG1O 3AJXA 1JRBA 1LLZA 1LRNA 2RDWA 3EXSA 3LHWA 3LHTA 1ALDA 1TYGA 1PVNA 3PUDA 4CCEA 1L6SA 1OJXA 4O57A 5SWUA 4WXYA 4YMZA 3I68A 5F4SA 3SFKA 4JDBA 1P0NA 4NJHA 1XUUA 1Q6OA 4HSOA 4PA8A 5LHFA 3S5NA 5F1UA 5EKYA 3ANYA 2TPSA 5F2IA 1H61A 3M5YA 3E12A 5G2IA 1ML1A 3O05A 4K8EA 3HPXA 4AHQA 3O1NA 5E1QA 5LKYA 4MLRA 4UMAA 1QPOA 2QCMA 2VEKA 4R7JA 3W1TA 4FO4A 3LHYA 3EX2A 3M1ZA 1GTEA 1FWNA 1Z44A 2QDGA 5IBXA 4UUIA 4X3ZA 3NOEA 1ZFJA 3G1DA 1BTMA 1OK4A 3B0PA 4L4MA 2NV1A 1LOLA 2QCCA 4A29A 3OIXA 1UJPA 2GVLA 3V1PA 2P0OA 3C6CA 3RFAA 1PIIA 4GE8A 5DCDA 4DPPA 3TCEA 5I3FA 4JDYA 3N14A 4RZ5A 4NJGA 3FIGA 4UR7A 5J5DA 2ZFAA 4O11A 3KVLA 1D3GA 4ZQOA 1RVGA 3NQAA 3LLFA 4WQ6A 1FX6A 2NXIA 1VYRA 2WSRA 3PY2A 4N02A 5KITA 2QR6A 4AHPA 4ICNA 4UFLA 3W76A 2ZRWA 2YXGA 1F73A 4FX8A 1P5BA 3C0JA 3P67A 3UWUA 2Y62A 3MI6A 4I7WA 4NX0A 3EX6A 1JCJA 4HNVA 3U8GA 1F5ZA 2GQAA 3QW4B 1V5XA 3MW7A 2Y63A 2ZRXA 3F03K 3DFTA 3W1UA 3W7QA 4ZQRA 2IQTA 3BW2A 1SZGA 1FXPA 5FEPA 3KX6A 1OG0A 1FDYA 1VLWA 3RF9A 4LC8A 3EEGA 1XI3A 4WD0A 1RZMA 1WX0A 4QITA 2YZRA 3NQDA 2H90A 3U2OA 3NEVA 5HULA 2HTMA 3A22A 3GX9A 1DL3A 1DOSA 3IGUA 2RFGA 1IXQA 2PCQA 2C18A 1FCQA 3W2NA 3BPWA 3QZEA 3LXBA 4P2VA 3VE9A 4JEQA 1EP2A 5FF3A 7TIMA 2WNZA 1QNVA 4MZ8A 4M6QA 2A21A 4GWEA 1I8JA 3O6CA 3CEUA 3BGGA 3FJLA 4JGDA 1SUXA 3QMTA 3IRDA 1GQNA 5LGXA 4QJ1A 4PEKA 4AF0B 1WQ5A 3QPYA 4HPXA 4M5PA 4NJKA 3CEPA 4Q4KA 1OFEA 2EGZA 5FF2A 1A5CA 3NL5A 1E51A 5CGQA 3FOKA 1H1ZA 4HSNA 1SW3A 4LRSA 3TQ0A 2CFFA 1WA3A 3GB6A 3WJWA 4OV9A 4AXKA 4FNUA 3W7JA 4OBTA 1BWLA 3WJSA 3G0UA 3LERA 5DELA 1NF0A 1B4KA 3INPA 1H7XA 3UXAA 3EWWA 1MEHA 3P60A 3W1NA 1QFEA 2E5CA 4FXSA 3TA6A 1KTNA 1N8FA 5HWNA 1QAPA 3DFOA 1X7FA 3KOFA 3OBKA 3L65A 4JX6A 5LGZA 4K7VA 4BWLC 4Z0JA 5D32A 3LI0A 4ZZ9A 1XDLA 3TV8A 2EHHA 1WYIA 5KMYA 1VLIA 1ZAIA 3G1AA 1RD5A 2A1YA 4NUWA 4NZJA 3GVGA 1GVRA 5FEWA 2DZTA 1LBMA 4JYDA 3MO7A 4GNJA 3GIYA 2F84A 2WJZA 3LRMA 1X1ZA 4X2RA 3LTSA 3BW4A 3G18A 1YTEA 1KLYA 4KKXA 4O52A 3STCA 2YYUA 3P8JA 4EOUA 3MBFA 4LV4A 5CZ0A 4QISA 4ZQCA 4GFSA 4AWSA 3SJ3A 2QAPA 4H4IA 4K6AA 4UC5A 3W7IA 5HJLA 3W9ZA 3LHVA 4UTJA 1I2OA 2ZZ6A 3LCIA 3TSDA 1F7BA 3W1XA 1WDWA 5CSSA 4FNRA 3G1YA 5DY3A 3S1UA 1ZALA 3W72A 2Y6ZA 3BVJA 3G8EA 2A0NA 2B7OA 3P7YA 4LW7A 1KFJA 3MHFA 2CLIA 1JQVA 1EB3A 2W0UA 5K4ZA 2E6AA 1Q6LA 2PRHA 3K30A 4Z1BA 1R2TA 3W7NA 3N2MA 1QOQA 1A5BA 3PULA 1G6CA 3TH6A 2Y7DA 1VZWA 4IJBA 1K3UA 4MKNA 4UMCA 4KFPA 1UBSA 2O7QA 5KZDA 1KTBA 1KFLA 5BOOA 3A21A 2BSLA 2EKCA 1H1YA 2GQ9A 4LY8A 3IVSA 1G4SA 3T55A 1ADOA 3L0GA 3EX3A 1T96A 4MYXA 4UTTA 2Y7FA 2NWRA 1AW2A 4LOCA 2Z0IA 3WK2A 5DCBA 4UNKA 4GJ1A 4NNBA 1KV8A 4WOQA 3STEA 2WKJA 3KHJA 4O53A 1S5VA 3ZWSA 2R8WA 2BTMA 2AGKA 1OFAA 3NPVA 1K8YA 4JTHA 4O1DA 2XFWA 3PBYA 4UFKA 3W2MA 3S42A 1RR2A 3SGUA 2AQWA 4JS3A 4O8RA 1IIGA 1AW5A 4E38A 3MP4A 2XN2A 2CW6A 1KM1A 4UTHA 2YYTA 3G3DA 4OV4A 3DU0A 3LBMA 1EP3A 1KBJA 1GYLA 3TMQA 5CPOA 4O18A 4DO5A 3W86A 3S5ZA 2CZEA 4UIOA 3ZFHA 4RR4A 6ALDA 4DO4A 5D2WA 2RKXA 3FA5A 4EWND 4IQLA 3JRKA 3W7KA 1WV2A 4XWUA 4JD4A 5BMWA 4QIUA 4RK8A 1TCDA 4E2BA 4NNAA 4ADSA 5AC6A 4DEFA 1IGSA 2WNQA 4Z1DA 3FJ6A 1SZNA 2NUWA 4O28A 2CWNA 1RQBA 5D2YA 1GPWA 5LSMA 1VRDA 1VHCA 3DI1A 4IGHA 3UY8A 2QAFA 1OX4A 5AYXA 4R33A 1XXXA 5D30A 4K38A 3QQ1A 1VCVA 1F76A 5CG7A 3B04A 3CB8A 1VS1A 3BG9A 1TV8A 2JGYA 2ZA3A 4RKAA 1GEQA 2NWSA 1SO5A 2X1SA 4CNOA 1GZGA 3G1XA 3UY7A 5H2ZA 4JN6A 3IIOA 4FX6M 1W0MA 1DV7A 4ONVA 1LBLA 2J9ZA 5K9XA 3CLMA 4AF0A 1RPXA 2VFFA 4I7VA 3UYCA 2GVGA 3VNDA 4HNNA 1GVFA 2A7NA 1H7NA 4Q32A 4DF2A 4LS2A 1MZHA 3W23A 3WJYA 1XDMA 3GXPA 3E49A 4DBEA 1TV5A 1OHLA 1H63A 5AC8A 5LHEA 4IOTA 3WK0A 4DF0A 4S2BA 5F1VA 1Z41A 4IX2A 1FWWA 5LNWA 3P81A 3TFCA 1YPIA 1UUMA 3O07A 4MIMA 2ATSA 1K03A 2ABBA 3UWVA 1C9DA 5C2XA 3CPRA 2CLKA 2A4AA 1OFQA 3PBWA 5D38A 1SZFA 3S6DA 1W3IA 3TK7A 5AHNA 1DQXA 3VI2A 2KZHA 5DBUA 4Z1AA 4HHPA 1LBFA 3CTLA 3IIZA 4MFEA 1P0KA 4MYAA 2JKEA 3OEXA 4MY8A 3LHZA 3TIMA 1Q3NA 2DZVA 3HGRA 4UFHA 1RV8A 1FUYA 2ZRZA 3NPXA 1MEWA 1PCWA 1LZOA 4TIMA 2ZZ4A 1OX5A 1Q45A 1JCXA 3DHFA 4LS1A 3W22A 3N9RA 4JTSA 5DY2A 1YDNA 4K39A 4RXFA 4JIQA 1FDZA 1R2SA 3PR2A 1W8SA 4LVBA 1PHQA 2QCDB 3W7EA 4O13A 2BX7A 3PS7A 3STFA 4N6FA 1W5MA 1WBHA 1DBTA 5AN7A 1JCYA 3EWBX 5EA9A 2QUUA 2OZ0A 1H5YA 3O06A 3LCLA 2VC6A 4JTUA 1F6PA 3ABQA 3TU9A 5I3KA 3I7SA 1YYAA 4EF9A 5CZJA 4Y8FA 2WPBA 2H3BA 3TJLA 1WOBA 5KSWA 2NX9A 2FLIA 4O54A 3QM3A 3MYOA 2E6DA 3NPWA 3C2OA 4AMAA 1ZAHA 1YDVA 5HWMA 2CLLA 5AHFA 1BKSA 2ZYFA 2GPTA 4NVTA 3EX1A 2VEMA 1KFKA 1A5SA 4BF9A 1BWKA 4O14A 4LV9A 4QNEA 5D2VA 4KWWA 4EVZA 2YFOA 3LI1A 3HO8A 1GYNA 3DFSA 3HGJA 5CZTA 3PG8A 5DLCA 1VH7A 3L5LA 4KFNA 5GVJA 1AL8A 2WNNA 1GT8A 3QSTA 1QMLA 2VFEA 4MUZA 2RH9A 5HNRA 1TTIA 2RDUA 1X1OA 4NT0A 2QUTA 1XCFA 1VYPX 3QQ0A 3ATYA 1ZJIA 2OX1A 2QUVA 3PSWA 4DQWA 2YCEA 3B0UX 2TYSA 3TJXA 3IGSA 1KM5A 4OE7A 1VCFA 2QJHA 2G96A 3B06A 2JBMA 1LOQA 2NUXA 3OG3A 4ZVJA 1OFDA 3ABRA 3IV3A 4ML9A 3NXFA 3W7HA 1LTDA 1TQJA 1H7PA 3L21A 1I2QA 2E6YA 4W9TA 3W87A 3BW3A 1FWTA 3IIXA 1OVDA 5F4XA 1NEYA 3I7RA 3WK1A 4M7TA 3MP3A 1B3OA 1NSJA 3DH7A 3G0XA 3KXQA 3USBA 4AWUA 2DP3A 4YL2A 3PAJA 3U6WA 3TXVA 3KVJA 4LVFA 3LX9A 4ZQNA 4AAJA 3QF0A 2J9XA 1NVMA 1H7OA 5LNVA 4IMGA 4O4VA 3N19B 3PF3A 5G1YA 5D09A 3R8RA 2NLIA 3GKAA 1JCLA 1JUEA 3OVPA 2B4GA 1J5TA 3NQ7A 4UFMA 3VE7A 2P10A 1R46A 2DORA 4POCA 2VXNA 3O6DA 1SW7A 1T99A 4ADUA 1PL9A 5AHIA 1Z42A 2J6XA 5FEXA 1TPB1 3LTYA 3PWAA 4CCCA 2J27A 3SECA 2B7QA 2E6FA 3OVRA 3W1QA 1QO2A 1JR1A 5MHBA 3BLFA 2VFGA 1I2NA 2QDHA 4O0KA 5K7JA 2J24A 3IIPA 5CKSA 1DORA 4JXCA 1S5WA 2BWGA 2V5LA 5AHEA 5TIMA 3AO0A 3NQ2A 5IM51 2X30A 3LV5A 2ABAA 2ISWA 4RX0A 3KAOA 1EUAA 4AHOA 2C13A 3CC1A 3IIVA 3HJZA 3LGEA 4JIPA 4FNPA 4XTIA 3G22A 4MY1A 5EY5A 3JR2A 4AVFA 3UWWA 2WSYA 3LRLA 3UWZA 2DJLA 4OGZA 1L9WA 4DO6A 2EPHA 3GDRA 4HT3A 3DENA 4JICA 1RQHA 3NQEA 3TAOA 1G4EA 4IMCA 3PUEA 3RK8A 2FFCA 4OWGA 2CZDA 2QCDA 5EL1A 3JS3A 1GVQA 1XBZA 1NF7A 1FCBA 3S1XA 4JR5A 5LNUA 4TMBA 3HGOA 2BXVA 3NL2A 2DZPA 3E0IA 1K02A 2A5HA 4DF1A 3Q37A 1A5AA 3EX4A 4CQ8A 4IUOA 2DZSA 5A5WA 2QCEA 1IF2A 3W73A 3GDMA 4DBDA 3DFNA 2D73A 3P82A 3M5XA 4N9CA 1I45A 1KM4A 2YFNA 4JX4A 2CLMA 4JY8A 3C8FA 3F4WA 3P61A 1W1ZA 2ISSA 3FKRA 3IVUA 3FYOA 4A2RA 1QR7A 3M41A 1IXPA 1TTQA 1CX9A 1GJPA 5CPNA 2PRLA 1EWEA 2QCGA 3MJYA 1TIMA 2H6RA 5K2ZA 5J5RA 3R5EA 2G97A 2Q3RA 2WQPA 5CPLA 2CLOA 4PC8A 3TW6A 2VFIA 4XZ9A 2DZXA 4R34A 1PE1A 3UXDA 3TW7A 5TBOA 3M47A 3G0SA 4ZQPA 3W1PA 3TSBA 3W6YA 1AL7A 3V75A 1S5TA 1QO5A 2ISVA 1Q6RA 2VOMA 4RZ4A 3M0ZA 3EWXA 4ZMGA 4TX9A 3LCXA 3Q58A 1OFPA 1IXOA 5D37A 1F6KA 1LCOA 2C6QA 3HG4A 4S1FA 4LU0A 1UASA 2C19A 2Q8ZA 3MP5A 3LCHA 2V30A 2ZCGA 4WXZA 2FB2A 3O63A 3E02A 2DJXA 2Q8LA 3W7RA 2QCFA 1CI1A 2ALDA 3S1VA 3TFXA 3SSJA 2A2IA 1YXDA 3KVKA 3T78A 4IXHA 2Y7EA 2OMAA 3HG2A 2GJLA 3QH2A 1W37A 2WV8A 3KRZA 2HS8A 4AWTA 2W79A 2ZQ0A 2EAWA 4GUHA 3T44A 3W1AA 1Z48A 3W74A 3LV6A 4FXRA 1O60A 2C1HA 3RLVA 1XM3A 2ZZ3A 3CIWA 4UXDA 4Z0SA 3SGZA 5FF4A 3G1HA 5I3GA 1SU5A 3WK3A 1WBJA 3P80A 1ME7A 1J4EA 4GC4A 4GRSA 4RXGA 3QJAA 3ELFA 5EPDA 1B57A 4N6EA 3G3MA 4O12A 1MEIA 3GNNA 4MFDA 2E09A 1H60A 3UWYA 3O8AA 4PL2A 3CHVA 1UUOA 4M19A 4IMFA 4O4WA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4A22A

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