4ALD | Genus

Total Genus 138

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	138
sequence length	363
structure length	363
Chain Sequence	PYQYPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFVSNHAY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of human muscle aldolase complexed with fructose 1,6-bisphosphate: mechanistic implications. pubmed rcsb
molecule tags	Lyase
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE
total genus	138
structure length	363
sequence length	363
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	1998-07-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4aldA00

1QO2A 1IIHA 2H3BA 4IMGA 3VE7A 2ZZ2A 2CLOA 1KFCA 4UFIA 1SR9A 5KSWA 2A1YA 3OIXA 3G1AA 1G6CA 3INPA 1VPXA 3DHDA 1JCLA 2HS8A 1AMKA 4UCGA 3W7JA 2QJHA 3QFEA 3QQ0A 3UQNA 4MVAA 5CZJA 2WSYA 1FCVA 3S5YA 3PBVA 3E49A 1FDJA 4CCDA 1WOBA 2JGQA 4TX9A 2Y7FA 3PY2A 1GZGA 1RD5A 1MEWA 1THFD 1VHCA 1VHNA 5CPMA 5F2LA 4UTIA 1H7OA 5D02A 1GG1A 1W5OA 5DXYA 4CCEA 1DJNA 5KZDA 5BNKA 5I3JA 2Y85A 4JTUA 5LGXA 3NL5A 4UTKA 3QW3A 3OHIA 2XFWA 2BSLA 1NEYA 2VELA 1PS9A 1B57A 3UPWA 4YCPA 2R14A 2QCGA 4G1KA 3RU6A 5AC8A 1XUUA 4XTDA 4AHOA 4MYAA 2PCQA 1DBTA 2I14A 5D38A 3L67A 4ZQMA 4IMFA 1X7FA 5HULA 5KTLA 3R13A 1XXXA 2V0TA 3L2IA 3NQ6A 5HWMA 2QUUA 1SPQA 1TV8A 1TCDA 2QUTA 4Z08A 4WOZA 2CZ5A 2NXIA 4RXGA 1ADOA 2QCNA 1TV5A 4ZVJA 2YXGA 3P62A 3H53A 2QJIA 3ANYA 2AAMA 1G4EA 1XBVA 3UY7A 1AW5A 3V75A 4KFOA 5C5YA 2X1TA 2Q8LA 2C0AA 1OX4B 3P5ZA 5HR7A 1O95A 2LLEA 3PSVA 3U2OA 1ZCOA 1H51A 3VCRA 3QSRA 4LUIA 3UXAA 5LKYA 3Q58A 2NLIA 1PCWA 1X8FA 1KM5A 3W1QA 4UTMA 5E1QA 4HSNA 1H7WA 1H7RA 3CHVA 2FIQA 3B04A 1HFBA 3UWZA 5HUOA 3M6YA 4LVGA 3L0NA 4O0ZA 1SFJA 4NXKA 1I2PA 4LC8A 3EXRA 4L4LA 3KVJA 3N2MA 4YCOA 4QISA 3G1HA 5BOOA 3W1MA 3VI2A 3BK0A 4NUWA 1P0NA 1KLYA 3AO0A 3STGA 4GJ1A 4NXSA 1FY6A 5G4WA 3LXBA 4AF0A 4NNCA 4K36A 4NX0A 3SJ3A 3UWYA 5EA9A 3CIXA 4CNNA 4MJMA 1WV2A 3HG5A 1UB3A 1VLIA 1TREA 4O53A 4NZFA 3Q94A 2HSAA 2ZRXA 3QJAA 2X30A 1PVNA 3ABRA 2RHGA 3IV3A 5K9CA 3ELFA 2CFFA 1F74A 3G18A 1NF7A 1T0OA 3QMTA 4MY1A 4Y9AA 2Q8ZA 4LVFA 1W5NA 2YFOA 3PUDA 3HGOA 4X2RA 1KV8A 1WYIA 2ZTKA 4JX5A 3PB2A 4UMAA 3ZWSA 4PODA 1TPUA 2ZZ4A 5FI8A 5D2VA 3W88A 2HS6A 1J2WA 3NQAA 2V82A 5CZ0A 2NX1A 2FB3A 4ONVA 4YLWA 4X9SA 3L0GA 2QDHA 5EYWA 1SZEA 3WJSA 1AL7A 4UIOA 3L0KA 5F4SA 4QITA 1YDNA 1C29A 4DEFA 5K7JA 4M6QA 4IX2A 4Z1DA 3W1AA 1G4SA 2YZRA 3S1XA 1DJQA 1H62A 2Q3OA 2ZA1A 3EWZA 3O15A 1PIIA 3CC1A 3LLFA 5EL1A 2TPSA 1L9WA 1TPH1 4BR1A 3JR2A 3C61A 4K39A 1PV8A 3KRSA 3O8AA 4O17A 3W2NA 3W7HA 3MP5A 4FXRA 4QJ1A 1EPXA 1OF8A 5LHFA 3V1PA 1OJXA 1GVOA 5D32A 3CEPA 3EWYA 3MBFA 5DY2A 2A5HA 1SO6A 3KRZA 4E0CA 1TQJA 1KBIA 3JS3A 4CQ8A 3LV6A 1GJPA 1UBSA 1F7BA 4IOTA 3TH6A 3PWAA 4LRSA 3N3MA 3GAKA 1DVJA 1W1ZA 4UUIA 3FS2A 4J9JA 3W1NA 2DJXA 3P81A 4RZ6A 4UMBA 7TIMA 1DORA 2E6YA 5K4ZA 1NSJA 4FF7A 1FCBA 3NPVA 5DN1A 4HNVA 1OX6A 4JDBA 3NPUA 1KW1A 1KM6A 3EWWA 1JUBA 3TQKA 4XBSA 3Q37A 1F5ZA 5CGQA 5TBOA 1O94A 4LWWA 3IVSA 4MZYA 5F2IA 2CLLA 1VYSX 3PULA 4LTSA 3S9YA 2TRSA 3W86A 3G3MA 2J24A 1DQWA 1EP2A 3DHFA 1KM0A 3PVFA 4OE7A 3TC7A 3GR8A 1EWDA 5FEWA 1XKYA 3NYZA 3F4WA 3L5MA 3W07A 1W0MA 5E0KA 2PC4A 1VRDA 3LDVA 1OFPA 4AAJA 4D2JA 5LNVA 3G1SA 1I45A 1GVRA 1YTEA 1GOXA 3ABOA 4O12A 2G97A 1IXNA 2GVLA 2ZDRA 4GUJA 3LRLA 3HPXA 3QH2A 3LHVA 1QAPA 3A5VA 2JBMA 2WNZA 3S5NA 3KRUA 3R12A 1HO1A 1ZALA 2E5BA 3G0UA 3K30A 1P4CA 3LCIA 3L66A 1FQ0A 3NPWA 3G8EA 1FWNA 4K37A 1A5AA 1O60A 4QQ3A 4EWND 4M19A 1AW1A 3NQ7A 4RV8A 4WZHA 2V5BA 2B7PA 3S0CA 2C13A 1LBFA 1YXYA 3C2OA 4A21A 2OJPA 1DHPA 5K2ZA 1TO3A 4FB7A 1ZAIA 4AWTA 1AK5A 3IEBA 3I7QA 3NNTA 3GX9A 2R91A 1K3UA 5DCBA 3KHJA 3NXFA 5MHBA 3UNDA 2PRLA 4N2YA 3W75A 2Y88A 3DKJA 1NVMA 4I7UA 1LRQA 5KINA 4CCCA 3CPRA 3QM3A 3P74A 3BG9A 5FF4A 4GWEA 3KVKA 1EP3A 1RQBA 4PL2A 5LNUA 1Q45A 2WO5A 4Y8FA 5G1TA 3MW7A 4JYFA 3W84A 4P2VA 3W70A 1AL8A 4NX5A 3EWBX 1MEHA 2RFGA 4XZ9A 1FUYA 3N14A 4U28A 3T4CA 4WD0A 3FOKA 5L9FA 1YXDA 3R2GA 3PBYA 4X22A 5D30A 4HHPA 1P0KA 1SW3A 3RLVA 3EKZA 2CZEA 2FTPA 8TIMA 4NNAA 3ZWTA 5AHLA 1KTCA 3W1UA 1WAUA 1RQEA 5FF7A 2NV2A 2B7NA 2A4AA 3TV8A 5HWNA 4Z0JA 1VZWA 4FIQA 5DELA 2AGKA 2DORA 4YWIA 2XN2A 2Y61A 3LBCA 5AB3A 2JKPA 4XUGA 4JYDA 5AHIA 2BX7A 2CLHA 3TIMA 3N34A 5IBXA 1JVNA 3I68A 3PG9A 3TKFA 2E6AA 3FJ6A 1XC4A 1LDCA 4O16A 2PRMA 5KMYA 1K8YA 5IBXC 3GK0A 3GB6A 3M16A 4GUHA 2ZRZA 4OGZA 4A29A 3TFCA 2DZXA 3HGJA 3NGJA 4M7SA 2GOUA 1Q6OA 1ZAHA 1TPWA 3BG3A 2W0UA 4O50A 3L65A 3U6WA 3GDMA 1DQXA 4DXVA 3A24A 2NX3A 3M5ZA 1XCFA 4RLIA 5HR6A 5FEXA 3W23A 4HPXA 2NWSA 1I4NA 1ZHAA 3W76A 4GBUA 1GYNA 3PR2A 1BWLA 3SSJA 5AHEA 2WNNA 4AEOA 1ML1A 1K7XA 3DXIA 2F7FA 2NXHA 3CWOX 4E2BA 3C0JA 1JULA 1SSDA 2FLIA 4LV9A 4Q32A 3NEVA 1Q3NA 4GNJA 1XBXA 1NFBA 1LP6A 4DQWA 1RQHA 2QCLA 1VJIA 2WPBA 2DZWA 3W7KA 4XBKA 4PH6A 2Y89A 1OVDA 4QIUA 3LCLA 4XWUA 1LOQA 2CZDA 5G4EA 3G0SA 2V8ZA 1FXPA 3N9SA 1LZOA 5D2YA 1DV7A 3STCA 3PS7A 3DBPA 1X1ZA 3EX3A 3I7SA 4A2RA 1DKWA 2NUWA 1VCFA 2QJGA 2VEIA 3E12A 4MZ8A 1LOSA 3FFSA 1DL3A 4ZL1A 1H7PA 4AH7A 1X1OA 4O14A 1FDYA 1EA0A 1SFLA 5EY5A 1V7YA 5H2ZA 4UR8A 3NA8A 5AC7A 1FX6A 5HNRA 1TRDA 3W9ZA 4GE8A 3VNDA 4UTLA 3TDFA 1RZMA 1ME9A 2J6XA 1OYAA 3T55A 3P67A 1KTBA 4JN6A 4R33A 3W1PA 4UMCA 4O11A 5LZLA 2OMAA 1LROA 3MYOA 3CIWA 3W83A 1LOLA 4C1KA 1QMLA 1F05A 3M5YA 1JCYA 2H8ZA 2TSYA 3M41A 1OYBA 4ZQPA 4IMCA 5CSRA 2TYSA 5CG7A 1LBLA 4RZ5A 1MSSA 3NQFA 4JTTA 4O1DA 4H3DA 2QCFA 1G67A 3HBLA 3KVMA 4JIPA 2X1SA 4FNRA 3P80A 1VC4A 3DFTA 5HQEA 4L4MA 1QPOA 3F03K 3GXTA 3M0ZA 4M5PA 2OZ0A 4NJGA 4K8HA 2ALDA 4TO8A 2YR1A 2NUXA 2ZA3A 4RCXA 3PUOA 4UTTA 2CZFA 3D0CA 3WJZA 3L21A 2GQ9A 3EEGA 4JNMA 4MFEA 1JRBA 3CQ0A 3C2RA 2C15A 3WJXA 5HUPA 3ABSA 1LYXA 3TW7A 5K3VA 4AWUA 3NAVA 3OVPA 3L68A 2ZRWA 3EWUA 5I3GA 1M7PA 3EKLA 5LGZA 4R53A 3HO8A 4JTJA 4JY9A 5J5RA 1KFEA 4PC8A 4RK8A 4UR7A 3HGSA 5C54A 3PG8A 1A50A 3WK3A 3W2MA 4N4PA 3HJZA 1SO3A 1H7XA 4EF9A 1M7OA 2O7QA 5G2WA 3IIZA 1K8ZA 1XBYA 3QQ1A 1M5WA 3P5YA 3ABQA 4O4VA 1GTHA 5LSMA 4E2DA 5F4WA 1I2RA 1YYAA 2X2GA 5AHNA 2Y63A 3W73A 1KM4A 3S1WA 1YPFA 1TTPA 2FB2A 3LHTA 3NQ8A 1Y0EA 3B0VC 4AF0B 4ICNA 2QR6A 2JKEA 2FQIA 1B9BA 3LRMA 3NO5A 2V2CA 4PFMA 1R30A 4A3UA 4LUJA 2PURA 4FX7A 2CWNA 1JCMP 3USBA 2DZSA 5BMWA 1SZNA 1Z44A 2VENA 4R7JA 4MLJA 4KKXA 3LXCA 4O1BA 5L6UA 1CX9A 3EX6A 3LBMA 1K7EA 3FYOA 1JCJA 4JTHA 2D73A 5C2XA 4IMDA 1WA3A 2CW6A 4BK9A 3LHWA 4YL2A 4DPQA 2Y7EA 2ZRYA 1CI1A 4GUFA 4X3ZA 3M43A 1IXQA 5AFDA 4IJBA 1TIMA 1TPEA 3M5XA 3TSBA 2QAPA 3L9CA 1H1YA 4O28A 3OVRA 1H63A 2NXGA 4NU7A 3G1VA 2DZTA 1Q6RA 1RV8A 4I7VA 4CNOA 5ABTA 3S1VA 1EWEA 2P0OA 5HWJA 2EAWA 4ORMA 3T78A 1WBHA 1D9EA 3P84A 5D2XA 3A22A 2VOMA 1YTKA 4Z1AA 2A7PA 4RJEA 1FWRA 4MYXA 3UWVA 3B05A 2VFIA 3STEA 2A0NA 1PHQA 1QO5A 3TAOA 3HF3A 3LHUA 6ALDA 3UY8A 4JXCA 2ATSA 1K03A 3W22A 4IX0A 1Q6QA 5D09A 5CPOA 3TXVA 3W3OA 4JTKA 3TQ0A 5CKSA 2BLEA 1S5VA 3BGJA 1VYPX 3LCGA 4UTJA 1SO5A 2X1UA 1TYGA 3SECA 1J5TA 4PA8A 2C16A 4BWLA 3C4UA 1JCXA 1OFAA 3MHUA 2IQTA 2YX0A 4MY9A 4WUIA 4WX2A 5DCDA 4AMAA 3TSDA 3T44A 2GVJA 3C52A 1YTDA 1ICQA 1SW0A 4UC5A 4BFAA 1QOPA 4FEZA 1H5YA 2NX9A 2YSWA 4JTIA 4OWGA 1OFQA 2C1HA 2BTMA 2FPTA 4EVZA 5DBUA 3DU0A 4FO4A 1XFBA 3LTYA 3F1QA 5DXXA 1TV7A 2V30A 2P10A 1UASA 2VXNA 4N6EA 3LXAA 4O4WA 5FESA 2QAFA 3EXSA 3QMRA 1G4TA 3MWAA 2XN0A 5K9XA 1PCKA 1G4PA 3E02A 1UUOA 3PF3A 4UFHA 5FF2A 1R2SA 1VS1A 1D3GA 3UZJA 4IXHA 1OFRA 4LVAA 1MZHA 1VR6A 2A7RA 4ADTA 4HSOA 4QNWA 3RNDA 2VEKA 1HTIA 3DFQA 1GG0A 3P7YA 3W1TA 4JTSA 4ZZ9A 2WJZA 4NJHA 3BPWA 2EF9A 5I3FA 5KZMA 2FJKA 3GXPA 1JQXA 5F4XA 3NQ2A 2BZNA 3M5VA 1IGSA 4JICA 3W1RA 1JUKA 3GAYA 4DELA 4GUGA 4FHAA 2Y70A 1LBMA 3NZ1A 3QF0A 3BW3A 4OU1A 4UFLA 5HMSA 3TX9A 2DZUA 2ISSA 1WDWA 3B8DA 2NUYA 2ZRVA 3O6DA 3TE9A 3B03A 3O05A 2A2IA 1TPB1 1S5WA 2J9YA 4HKPA 1TPC1 3IGSA 1GVFA 1QNVA 3NL2A 1L2UA 4OQVA 2QCDA 4N9CA 3W7CA 3SGZA 2Z2UA 3IIOA 1Z42A 3BW4A 3S5ZA 2G95A 3MI6A 3OG3A 3P82A 4IQLA 5D03A 2B7OA 3TQVA 2ATMA 3FEMA 4MFDA 3DGRA 3TK7A 2KZHA 3MI2A 3KVLA 2NWRA 2VFHA 1EUAA 2E6FA 2UV8G 3DKLA 3N2XA 1AW2A 2BXVA 3PBWA 2VFEA 4NT0A 3FA5A 4IMEA 1H60A 2J27A 3RMJA 1VGAA 3IIXA 4I7WA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4ALDA

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