4C6MA

Crystal structure of the dihydroorotase domain of human cad bound to the inhibitor fluoroorotate at ph 7.0
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
363
structure length
360
Chain Sequence
KLVRLPGLIDVHVHLREPGGTHKEDFASGTAAALAGGITMVCAMPNTRPPIIDAPALALAQKLAEAGARCDFALFLGASSENAGTLGTVAGSAAGLLYLNETFSELRLDSVVQWMEHFETWPSHLPIVAHAEQQTVAAVLMVAQLTQRSVHICHVARKEEILLIKAAKARGLPVTCEVAPHHLFLSHDDLERLGPGKGEVRPELGSRQDVEALWENMAVIDCFASDHAPHTLEEKCGRPPPGFPGLETMLPLLLTAVEGRLSLDDLLQRLHHNPRRIFHLPPQEDTYVEVDLEHEWTIPSHMPFSKAHWTPFEGQKVKGTVRRVVLRGEVAYIDGQVLVPPGYGQDVRKWPQGAVPQLPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure, Functional Characterization and Evolution of the Dihydroorotase Domain of Human Cad.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CAD PROTEIN
total genus 116
structure length 360
sequence length 363
ec nomenclature ec 2.1.3.2: Aspartate carbamoyltransferase.
pdb deposition date 2013-09-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01979 Amidohydro_1 Amidohydrolase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.140 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Metal-dependent hydrolases 4c6mA00
3URNA 1PO9A 1UIPA 1K1DA 1NFGA 1EYWA 3MSRA 1ZZMA 2CZVA 4XAZA 4LCQA 4CEUC 4DZIA 4B91A 1FWHC 4J35A 2GZXA 4BJHA 1EJWC 1XRFA 2YB4A 4C6DA 4QTGA 2PGFA 3SO7A 3AU2A 4PBFA 1XWYA 2FTYA 4ERIA 3UR2A 4IF2A 3PANA 1GKPA 4PE8A 1KRMA 1EJVC 4C6FA 2FFIA 4AQLA 4IH3A 3MJMA 4GZ7A 2VC5A 3RN6A 4XD6A 5HMFA 2HQAA 4CNTA 3G77A 1FWAC 4KEVA 2OQLA 4C6EA 4G7EB 4TQTA 2G3FA 3MVTA 2HBXA 5AKQA 4H9UA 3LGGA 4ZSTA 1P6BA 4E3TA 2VR2A 3K2GA 1UMLA 1V51A 3K4WA 4ERGA 1WXYA 2GOKA 2WJDA 3EGJA 5HMEA 2DVUA 3D6NA 4BKNA 4PCPA 3CJPA 4QS5A 4DYKA 3B0YA 4C6OA 1EJXC 1RA0A 4C6MA 1QW7A 3GIPA 1R9XA 4LANA 3URAA 4INFA 4EP8C 3GRIA 4G7EA 3LY0A 3QY7A 4OFCA 4UBPC 4XD4A 2UZ9A 1J5SA 3IPWA 4R85A 1A4LA 3LSCA 3LA4A 4XD3A 2AQOA 3OQEA 1M7JA 1POJA 3F2DA 1I0BA 3R0DA 2D2GA 4BY3A 4DI9A 4NG3A 1K70A 2OGJA 4GXWA 4AC7C 3NURA 1V4YA 3CAKA 3E38A 1YMYA 1V7AA 2WJEA 2QT3A 4CQBA 4NI8A 1FWBC 1RJQA 4H9XA 4ICMA 4UB9A 4KF1A 4I6VA 4IG2B 3F2BA 3GU2A 3OODA 4J5NA 4LFYA 4MUPA 3GTXA 3NEHA 2HNHA 1A5LC 4CQDA 4KESA 3GTHA 1EZ2A 2R1NA 4QRNA 3TNBA 4H00A 3ID7A 2R1PA 1A4MA 2OB3A 2ICSA 1NDZA 1V77A 4LCRA 5A6TC 1V79A 3MTWA 1YBQB 2Z2AA 4GOAA 3ITCA 3GU1A 3UR5A 4LCSA 4XAFA 3RHGA 2OODA 4P5UA 3OU8A 4KETA 2Y1HA 4KEZA 4LALA 4JOMA 3B0XA 3S2JA 1YRRA 4DLFA 2PUZA 1M68A 3DCPA 2EG6A 1P6CA 3BE7A 2Q01A 1RA5A 4QS6A 2Z24A 3OOQA 1A5NC 3RCMA 3PBMA 1R9YA 3IJ6A 4C6LA 3HM7A 4GX8A 3S2MA 4ERAA 3S2NA 1UBPC 1KRBC 2HBVA 4DIAA 1W1IE 3HTWA 4EPEC 3A3WA 3LGDA 4GY0A 1RJPA 2QVNA 3KM8A 3GU9A 1R9ZA 1FWFC 4QROA 4CNUA 4H9YA 1A5KC 3EWCA 3S4TA 4H01A 1GKQA 3SFWA 3UPMA 4DZHA 4B90A 1QXLA 2O4MA 3URQA 4B92A 3NQBA 4HJWA 4DLMA 1DPMA 4RZBA 2GWGA 1FKWA 3F4DA 3TN5A 4LAKA 1O5RA 4IFKB 3RYSA 4G2DA 3S2LA 4RDWA 3F4CA 4YIWA 2W9MA 1E9ZB 3QGKC 1RAKA 4LEFA 3IARA 4RDYA 3LS9A 3IV8A 4IFRA 2YXOA 4V1XA 2VUNA 2O4QA 2FVKA 3FEQA 4DNMA 3GTIA 1JGMA 4L9XA 1P1MA 3ISIX 4IFKA 2R1LA 2EG7A 4KEUA 4GY7A 3T81A 4IGNA 2YB1A 2DVXA 4C5ZA 4F0SA 2D2HA 2A3LA 4GX9A 4HK7A 4R7WA 3N2CA 3UBPC 3PNUA 3ICJA 1EJTC 1ONWA 2R1KA 1EJSC 1KRAC 4KERA 2BGNE 1FWIC 2QS8A 1WXZA 4C6CA 4H9MA 2HPMA 1UIOA 3GTFA 2WM1A 2IMRA 3AUOA 4XAYA 4KIRA 2HPIA 4XAGA 1YIXA 4PCNA 3FDGA 2VHLA 3T1GA 1PSCA 4GYFA 3E74A 3MKVA 3ORWA 4IFOA 4C6KA 1J6PA 1I0DA 2YZ5A 3DC8A 4RDVA 3WMLA 1J79A 3OJGA 4IG2A 2QPXA 1ONXA 4H9VA 3HPAA 3QY8A 3TN4A 1NDVA 1IE7C 1RJRA 3PNZA 2Z7GA 1RK6A 1HZYA 2P53A 2PGRA 5G4HC 2GSEA 3IRSA 3B40A 3F2CA 2ANUA 4F0LA 2PAJA 2Z28A 1YBQA 1XGEA 3MVIA 4PBEA 4KQNA 5CH9A 1VFLA 4Z42C 3T8LA 1NDYA 1EJRC 2FVMA 1GKRA 2PLMA 2Z00A 2AMXA 2WJFA 1O12A 4LAOA 1A5OC 2I5GA 1FWJC 5FSDC 2Z2BA 3E2VA 3MDUA 2VC7A 4WHBA 4C6BA 2Z27A 1FWEC 4EPKA 2E1WA 2I9UA 1FKXA 4V1YA 4RDZA 1M65A 2F6KA 1J6OA 2E25A 4IQJA 3IACA 3C86A 1E9YB 1KRCC 4C5YA 4C6PA 3O7UA 2ADAA 4WVXA 4L6DA 1NDWA 2Z29A 2D2JA 2Z4GA 1FWGC 4XD5A 3WZ0E 3TN6A 3URBA 4B3ZA 3O0FA 2Z26A 3OVGA 4D8LA 2KAUC 4GBDA 4I6KA 3K5XA 4CQCA 1EJUC 2BB0A 5FSEC 2UBPC 1ADDA 3QGAC 2EG8A 2GWNA 5LXXA 4C6QA 2XIOA 4C6NA 2R1MA 3GUWA 3V7PA 3E0FA 3LSBA 3EWDA 4EPDC 2RAGA 4HK5A 3E3HA 2Q09A 1XRTA 3WYZA 2ZC1A 1ITQA 4H9TA 4CEXC 4R88A 4WGXA 2P50A 4GC3A 3DUGA 3LNPA 2OOFA 2AQVA 3IGHX 3A4JA 4IGMA 3UF9A 3LU2A 1BF6A 3QY6A 4ZSUA 4HA0A 3A3XA 4LH8A 3JZEA 3MPGA 3GIQA 3GG7A 4C6JA 3E0LA 3PAOA 4DO7A 1RK5A 1ITUA 2DVTA 1PTAA 4QSFA 1S3TC 4LAMA 4CNSA 1YNYA 1A5MC 4HK6A 2VM8A 1K6WA 3CS2A 4EPBC 4C6IA 4H9ZA 3TN3A 1FWCC 4NP7A 4RE0A 3AU6A 1EF2A 5E5CA 3MDWA 4C60A 1POKA 3FDKA 4M51A 2FTWA 5HMDA 4DI8A 1FWDC 2Z25A 1PB0A 4GK8A 4C65A 4J2MA 4F0RA 1KCXA 4GY1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GHSA 1VC4A 5HMSA 4DXKA 1UIPA 3UXLA 5D8WA 4UNLA 1V3LA 1LLWA 1XRFA 4EWND 3ARTA 4QLKA 1X1ZA 4CVWA 1FTXA 3QSRA 3T2QA 3UR2A 3IJIA 5A6JA 2VRKA 4M7SA 1YDVA 1RLDA 4O54A 2GGGA 1M5WA 3ABQA 3E12A 4O12A 1FWAC 1LL4A 5AHFA 4LYPA 1TV5A 3TYBA 4I8YA 2OZ8A 1OFAA 4X22A 1O5XA 5F2GA 3WKZA 2VR2A 1OC5A 3AYTA 1SUXA 4TX6A 2NX9A 1P0NA 2XZ7A 1AD4A 3LXBA 1ZJAA 2ZBTA 3V36A 3NXFA 1QW7A 4F0HA 3GIPA 4F66A 2R82A 1UP0A 4B2DD 2RJHA 5FEWA 1ZUAX 1A0CA 4XG1A 4N42A 3AALA 3DFPA 2DZUA 3N2BA 2RDTA 4I9MA 1EDQA 4XD3A 2OMAA 1XV8A 3NQ2A 4DI9A 4TU1A 4PUKA 3DFSA 3CZGA 1U1HA 3ZWSA 1XSIA 1KBLA 2DEPA 5HNNA 5TQLA 3VCRA 1JEZA 4E2DA 2V38A 1F73A 2EAWA 1RCXB 2ON3A 1E43A 4KGLA 3CB3A 4O1CA 3MBFA 4H6KA 4ZQCA 3G1AA 2WNWA 1TV4A 3VNIA 8TIMA 1I8JA 3OLEA 3WBYA 3MV11 4HTBA 2R1PA 5AZ0A 4H2HA 1MEHA 3W02A 1NAL1 2PWDA 1FDJA 4YMZA 3VIMA 2DSWA 1AA1B 4JOMA 3VGFA 3U6WA 4LVFA 4UTJA 4GJIA 1TQXA 1CXIA 5E93A 3CLMA 2W62A 3KBSA 4H3DA 1UG6A 2OX1A 3KFTA 4ZODA 4JKLA 5EBUA 3W7MA 1MXGA 1EGZA 1EH9A 1OFRA 1I4NA 3V5CA 2NXIA 4GY0A 2WMFA 4IXXA 3TZFA 2YYTA 4LUTA 6TAAA 1H7XA 4MG4A 2CHOA 3AZRA 3N2MA 1WNOA 4TTGA 4R27A 4CNPA 2XVKA 2INEA 3SFWA 3UPMA 2BY1A 3M0VA 4F79A 5BWAA 4BEQA 4B92A 4HJWA 3VOFA 4J2PA 3WLMA 1Q6QA 3D47A 3BJSA 1EDTA 1SO4A 3WLTA 5EMYA 1SO6A 2PDUA 4J9JA 4GUFA 9XIMA 1PEZA 3NA8A 1OC7A 1P7TA 1B30A 3WLKX 4DN1A 4MWAE 2ZUTA 2NLIA 5CC3A 1HKKA 1T40A 4JTDA 1KKRA 3LPPA 1HL9A 1WYIA 3L65A 4B9YA 3C5QA 4ZE5A 3U8GA 4WJXA 2FZ9A 1BPLB 1XLDA 1Q3NA 3PTMA 5LIYX 5K3VA 1R8LA 3CNYA 3CQKA 1B4EA 1SO5A 2C14A 4HZMA 3UT0A 3QV7A 1CLXA 3CEUA 4ZMGA 3O1NA 5IFTA 1DJYA 5I3GA 4L56A 1GPWA 4CN4A 4EXQA 3MT1A 4HYWA 1LRQA 5CGTA 2FHBA 5D32A 1NF0A 4PCNA 2V82A 2VFFA 3GH4A 2OYMA 3RDKA 1TZZA 4Q6XA 2ABBA 3C0QA 1UQZA 3THDA 1ONXA 4GA8A 3F1QA 5HNUA 4BI7A 1H0GA 2Z7GA 5I3DA 1MUWA 3I6EA 3BOFA 3NZGA 3UU0A 4AZGA 4E0CA 3FSUA 2ESCA 2CZDA 4IMAA 1DXFA 4MIMA 4UFJA 1HKVA 4PBEA 4KQNA 1TA3B 4JN8A 2ZA2A 1AH0A 3C4UA 3LHTA 1GJUA 2WJFA 2B7NA 3N4AA 1EGVA 3ZR5A 1J12A 3VC5A 2R91A 2W91A 1F9CA 3Q58A 4C90A 1TRIA 2XISA 3VOHA 2NQ5A 4HP5A 1IT8A 3N73A 4B3LA 4OHQA 1EX5A 4ZQRA 1PCKA 1KKOA 4C6PA 4IICA 3LV6A 2GGHA 3F5JA 1E4NA 1OVDA 3DZ1A 3L4XA 4B2DA 1H5VA 2BS9A 3G1RA 3CL6A 4Z1CA 3WUEA 3CHEA 2KAUC 5LIUX 3CZEA 3KL5A 3PULA 4YCPA 1B3WA 1J96A 3K5XA 4CQCA 2BB0A 4W88A 2AGKA 2XIOA 3DECA 1EP2A 3R89A 2F61A 4RV8A 1TE1A 4M8UA 2WO5A 1XPGA 3L9CA 1D8CA 1KLZA 1Q8JA 2IQTA 3S6OA 3G1HA 3M9YA 4XISA 2ONEA 5CQ1A 5FESA 3SCQA 2JKAA 1B54A 5DMMA 2ZKMX 4MNMA 2WHJA 3UCCA 5BXSA 4F48A 4NJGA 2O0TA 3GH7A 3BV4A 3V16A 4YNGA 1R7OA 3TN3A 1GG0A 4RE0A 4L1GA 3CQHA 2WSRA 1XD1A 1W0MA 3BARA 1PB0A 2WHLA 5AYBA 4N6EA 5D2VA 2HROA 3U2CA 1X39A 1JCNA 5M03A 4HA3A 5HUPA 5FAJA 2X1RA 2HDJA 1TJ1A 1XIDA 4S3KA 3EX1A 2D0GA 3W0KA 3H21A 2WMKA 3TW6A 4WEVX 4RL3A 4HPGA 2QUMA 3EMQA 2XVGA 5C9WA 1LRTA 3G77A 3HGJA 4PTDA 3ZVHB 3VXGA 5HINA 5K9CA 4A3UA 2WHMA 3GFXA 5LIKX 4B15A 2F38A 3BLKA 4O4WA 3W1QA 4CCCA 4AF0A 2J9ZA 4PUUA 4I3GA 1AZ2A 4U10A 4W9TA 1XYAA 3ONBA 3HPFA 1RVGA 1N8FA 3I3EA 4ZTYA 3AHVA 3W72A 4O1DA 3QBUA 1XINA 3B4YA 1EEPA 5MKGB 1Q6GA 2QCNA 3OYZA 2VX5A 4MPQA 1SZNA 1GK8A 3EX2A 4LUSA 3EX6A 1ML1A 2ODOA 4GXWA 3GNRA 4JTCA 1OK4A 4WDWA 1CGXA 4X60A 3S9ZA 3VD9A 3MP4A 1H63A 4UB9A 3CZ8A 1F5ZA 4JQ2A 2ZIDA 3KTSA 2JK2A 4PCTA 4GUIA 2E6DA 5HJYA 4DY1A 2FFCA 2GQ8A 1Z3NA 1IR1A 4PB3A 3UFYA 1TPDA 2Z2AA 4GOAA 4XAFA 5CZTA 1X97A 4K37A 4FAMA 4HU3A 3M0MA 4JR5A 3CPRA 1XCWA 3PG9A 3P62A 1E6ZA 3VX0A 3AI0A 3H8AA 3TSDA 3CMFA 4W4QA 3P80A 4JIQA 1Q66A 4XZHA 3STEA 1R0MA 4C7GA 3RR4A 4CCEA 4JYDA 2PC4A 5EKYA 4QDMA 1UP3A 2CETA 1UBPC 3OVPA 4YS1A 3FY1A 3LLDA 2DT1A 3ITLA 1E5NA 4NU7A 4ZO8A 3LCIA 6A3HA 3KM8A 3QC3A 2ZWYA 3CMJA 3TROA 3SY1A 1BG4A 3S46A 1VEOA 3HOJA 3C2FA 2VQUA 3FA4A 2RDWA 5M5DA 1G6CA 3PUOA 1F3WA 1BYAA 1PVNA 1W1B1 4PGLA 2G4FA 2ZXQA 3VUPA 1BXBA 1F76A 3AFBA 5HK4A 3OZMA 3SUTA 1O5RA 4IFKB 1JDDA 2RGLA 2QDEA 2D20A 3RAOA 2OWCA 1O95A 3R7MA 5EMLA 5HWNA 3CYJA 4O19A 1OEPA 4NNCA 2BVTA 2YXOA 2YA0A 2ZZ1A 3GFYA 4XUGA 2E5DA 2IKIA 1UD4A 2W67A 2VWTA 4O16A 3VOJA 3VTRA 2DVXA 4FXJA 4UTMA 2ISWA 3UG4A 1HKIA 4XTIA 1V03A 3F4VA 3UPBA 1K4GA 2VX7A 2AKMA 4AUBA 3GDBA 4WY0A 1K6AA 2ZUWA 4C6CA 1BRLA 1DJZA 1BD0A 4NHVA 3VOIA 5EBAA 1ELSA 3S0CA 1J8VA 3WQ4A 3CIXA 3B0UX 2VHLA 2DZAA 3E74A 3GDKA 1PIIA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1GHS A;  1VC4 A;  5HMS A;  4DXK A;  1UIP A;  3UXL A;  5D8W A;  4UNL A;  1V3L A;  1LLW A;  1XRF A;  4EWN D;  3ART A;  4QLK A;  1X1Z A;  4CVW A;  1FTX A;  3QSR A;  3T2Q A;  3UR2 A;  3IJI A;  5A6J A;  2VRK A;  4M7S A;  1YDV A;  1RLD A;  4O54 A;  2GGG A;  1M5W A;  3ABQ A;  3E12 A;  4O12 A;  1FWA C;  1LL4 A;  5AHF A;  4LYP A;  1TV5 A;  3TYB A;  4I8Y A;  2OZ8 A;  1OFA A;  4X22 A;  1O5X A;  5F2G A;  3WKZ A;  2VR2 A;  1OC5 A;  3AYT A;  1SUX A;  4TX6 A;  2NX9 A;  1P0N A;  2XZ7 A;  1AD4 A;  3LXB A;  1ZJA A;  2ZBT A;  3V36 A;  3NXF A;  1QW7 A;  4F0H A;  3GIP A;  4F66 A;  2R82 A;  1UP0 A;  4B2D D;  2RJH A;  5FEW A;  1ZUA X;  1A0C A;  4XG1 A;  4N42 A;  3AAL A;  3DFP A;  2DZU A;  3N2B A;  2RDT A;  4I9M A;  1EDQ A;  4XD3 A;  2OMA A;  1XV8 A;  3NQ2 A;  4DI9 A;  4TU1 A;  4PUK A;  3DFS A;  3CZG A;  1U1H A;  3ZWS A;  1XSI A;  1KBL A;  2DEP A;  5HNN A;  5TQL A;  3VCR A;  1JEZ A;  4E2D A;  2V38 A;  1F73 A;  2EAW A;  1RCX B;  2ON3 A;  1E43 A;  4KGL A;  3CB3 A;  4O1C A;  3MBF A;  4H6K A;  4ZQC A;  3G1A A;  2WNW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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