4C7DA

Structure and activity of the gh20 beta-n-acetylhexosaminidase from streptomyces coelicolor a3(2)
Total Genus 186
50100150200250300350400450050100150
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
493
structure length
493
Chain Sequence
EPTPLDRVIPAPASVEPGGAPYRITRGTHIRVDDSREARRVGDYLADLLRPATGYRLPVTSHGHGGIRLRLAEGPYGDEGYRLDSGREGVTITARKAAGLFHGVQTLRQLLPAAVEKDSAQPGPWLVAGGTIEDTPRYAWRSAMLDVSRHFFSVDEVKRYIDRVALYKYNKLHLHISDDQGWRLAIDSWPRLATYGGSTEVGGGPGGHYTKADYEEIVRYAASRHLEVVPEIDMPGHTNAALASYAELNCDGVAPPLYTGTKVGFSTLCVDKDVTYDFVDDVLGELAALTPGRYLHIGGDEAHSTPQADFVAFMKRVQPIVAKYGKTVVGWHQLAGAEPVEGALVQYWGLDRTSDAEKAQVAAAARNGTGLILSPADRTYLDMKYTKDTPLGLSWAGYVEVRRSYDWDPAAYLPGAPAEAVRGVEAPLWTETLSDPDQLDFMAFPRLPGVAELGWSPASTHDWDTYKVRLAGQAPHWEAMGIDYYRSPQVPWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces coelicolor
publication title Structure and Activity of the Streptomyces Coelicolor A3(2) Beta-N-Acetylhexosaminidase Provides Further Insight Into Gh20 Family Catalysis and Inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
total genus 186
structure length 493
sequence length 493
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2013-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4c7dA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4c7dA01
1HXJA 3F5JA 4Z2IA 4D6DA 5CGTA 1ZL1A 3G6LA 3VGGA 2JFEX 1XH1A 3PTKA 2VMFA 3N9KA 4JFTA 3ARZA 1OCQA 3AS3A 4CU7A 4MB3A 2E8YA 1JZ7A 1CXFA 4F9JA 4DUXA 2J62A 1EGZA 1V0MA 1E6XM 2WMGA 1V0KA 2E9LA 4PEEA 2OSXA 1UR1A 1V6UA 4JFSA 4BQ3A 1MW2A 5BCAA 2EPKX 3VDAA 1HJUA 1BFNA 1JYXA 4W89A 5A8OA 1EDQA 4W8BA 2PWHA 3AMDA 4IPLA 1ISXA 4UZSA 3GXDA 4TXEA 3TTYA 1R7OA 3ZT5A 4Q7NA 5GNZA 3OB8A 4J3XA 1LL7A 1VAHA 2WMHA 5BXTA 4AWEA 2YLLA 4OBSA 1BTCA 3VGFA 3HN3A 1XSIA 3FY1A 3AIVA 2ZX9A 3HU7A 5JBEA 3N04A 3RM8A 2EPOA 1E6ZA 2X8RA 4J3UA 5D4YA 4BA0A 1PIGA 4UOQA 3A4AA 2VJXA 1FH9A 4LX4A 4M8UA 1BYAA 1FP8A 1WE5A 3CHCA 1HVXA 1QI3A 5I6SA 3NSNA 2DT2A 1M01A 3GH4A 3CH9A 1UR8A 2D3LA 1E9LA 1SMDA 5A8MA 3WMBA 1LG2A 1C92A 3A4XA 1B0IA 4ZXOA 4V27A 1K9DA 4KMQA 1BHGA 5A2BA 3J7HA 3N1AA 4WF7A 2WMIB 4JHOA 1C7SA 1B30A 3GTNA 3UEQA 3A4WA 1JNEA 1V0LA 1X6LA 3K8MA 3OBAA 3N17A 1BGAA 1J0YA 3QHMA 4NI3A 2WANA 3GBEA 4GZIA 2W62A 4JKMA 1R86A 2WC3A 2VNCA 1Q6GA 5A6KA 2VC9A 4J7RA 2GJXB 3AMCA 2V3GA 2VURA 4UFLA 1J9YA 1ECEA 2W5FA 4TVCA 3MO4A 3ARPA 1OT2A 1UZ1A 1HJXA 5C8BB 3AHYA 4AIOA 1DWGM 5KZ6A 4ACYA 2BHZA 2E3ZA 3I3BA 1VBRA 3WKZA 5DFAA 1CPUA 4QCFA 2X05A 3DHPA 2NT1A 5LYRA 4TX6A 4LYRA 3DECA 1OT1A 1E4MM 3SUUA 4XZBA 2CCRA 1E1FA 5FIPA 3VKKA 4AD0A 2PBGA 3S2CA 1E4NA 1BSIA 1NWRA 3AMLA 2UY2A 1OINA 2W67A 5AY7A 1KGWA 1CLVA 1U2YA 3TA9A 2YBUA 4D72A 1MXDA 5JBDA 2PC8A 1EO7A 2D0FA 2J47A 2YL5A 3QGVA 1VB9A 2ZX8A 1JYNA 2VZUA 3NUKA 2VO5A 1OBAA 3L4XA 3CIVA 1JZ4A 1ESWA 4NSBA 2XVKA 5EFDA 1H09A 1QHOA 1TZ7A 3BLPX 2O92A 3GXIA 3WNKA 1NP2A 4QLLA 3O9NA 3VILA 4AY1A 4F9DA 2FH6A 3AYRA 1MFVA 1B1YA 2ZX7A 1TFVA 2WM0A 1VFMA 3VO0A 1UWUA 4GQQA 3ARWA 4ZEPA 2BXZA 2ZXQA 4YPJA 5IXEA 1FP9A 3FXYA 3WFLA 4W5UA 2CBVA 2JIEA 1X1NA 4ZXLA 4C90A 3PN8A 1WNOA 5D8ZA 1AVAA 1H3GA 5CXPA 3RJYA 1XD0A 2DSUA 3BMVA 4ML4A 2W91A 1XHGA 2A3BA 1FH7A 4OIFA 3U5YA 3LPFA 4MJ4A 2WWDA 3CO4A 3PZUA 3GXMA 4JFUA 2G4FA 1GQKA 4M81A 1VFFA 1WDRA 4UQAA 5AC5A 1W1VA 2UY4A 3VU2A 2WBGA 1JD7A 2XWDA 1G01A 3F5KA 4AZBA 2W92A 2ZICA 4QAWA 1MXGA 1SMAA 2BY0A 1E6PA 1V3KA 1GVIA 1HIZA 3WBAA 3WH5A 1EXPA 5KEZA 3A3HA 1EQPA 4X0NA 2BY1A 2ZXAA 5JUVA 1GONA 1XRVA 2EPMX 4P8UA 1CDGA 1DWIM 1BPLB 3WF3A 4E2OA 2YDQA 3A47A 1C93A 1VJSA 4U3AA 2VCAA 5BXPA 2PWDA 4UQBA 1VENA 2GJRA 4D6IA 2EPNA 3EDDA 2OWXA 2ZWYA 1PEZA 2WAGA 3AI0A 2JALA 5HNNA 2EXOA 3ARXA 2ZUMA 4GZJA 4CD4A 4NZCA 4HMCA 4X0VA 3RO8A 1LWHA 3KZSA 3RPMA 4F8XA 2DIEA 1UKQA 4LYQA 4ATLA 5D9OA 1HJQA 4BQ4A 4CD7A 4FF5A 3BXWA 1PJ9A 1I1WA 4TVUA 1FHDA 4GI9A 4OOZA 1HN1A 3W26A 1HX0A 5AYIA 1CXHA 4KGJA 1WB0A 4C91A 3LPOA 1JZ6A 1G5AA 3CMGA 1W1PA 1QNOA 2YA2A 3MMWA 3AXHA 1UKOA 2EQDA 3VOCA 4UQEA 4W93A 5AYBA 1JIBA 3EMZA 5IFPA 2ZE0A 2DH2A 1J01A 1V6YA 4AD3A 1J0IA 4PUDA 1VIWA 1CZ1A 2GK1A 3SUTA 1R7AA 4PMXA 3N15A 2FDMA 2WLZA 4UOJA 5CJ5A 1NM9A 1UD8A 2Y8KA 2XHYA 2WMFA 2XIIA 4AZCB 3AIRA 3EMCA 4MADA 4U5IA 5A6BA 2J7BA 2JF7A 2XGIA 3NSXA 4HA3A 3CHDA 4UFIA 1JAKA 5I79A 3WF1A 3SUSA 4F79A 5AC4A 1GW1A 1W3JA 1ODUA 1MW3A 4FLSA 4M82A 4TUFA 1RH9A 3CTTA 3MANA 4HMEA 4MDPA 5IHRA 2JIWA 1EA9C 2XM2A 3UCQA 1D7FA 2X2YA 4PMOA 2E0PA 4D6FA 2D0GA 3OIHA 3VIHA 2ZX6A 3RM4A 2Y24A 4J3WA 3OG2A 3E1F1 2RGMA 3RM9A 1MW1A 2O9OA 2GJPA 3IANA 3POHA 1GPFA 4ACZB 4PCTA 3MUIA 4GXPA 3AJ7A 5E70A 1B3YA 1ZBWA 4GI8A 1LL4A 2YL9A 4W84A 3RMEA 2CXGA 3TOPA 1CECA 1JI1A 3UERA 3OLGA 1CIUA 4AZCA 4BQ5A 2AAAA 5TD4A 3MS8A 3TTOA 5M5DA 1W9VA 4LYPA 3WSUA 3ARYA 2VQTA 1E5NA 1W2VA 2BS9A 1H5VA 1JZ5A 1ZS2A 4Z2HA 4P7LA 1LL6A 3GH7A 3M7SA 4P7NA 3ZJ6A 2EO7A 4H8HA 4RL3A 1QBAA 3WUFA 2VZVA 3OLEA 3VMNA 1UWTA 3O6AA 2XVLA 1B3WA 1DTUA 3VX1A 3WNNA 1C7TA 1HVQA 1KFWA 2QMKA 2VVNA 3AXIA 4CCDA 1H2JA 3CUGA 2BNJA 1WPCA 1FHLA 2WHMA 5E0FA 2X0YA 3CBWA 3PTMA 2VUYA 2NSXA 3ZT6A 3WH6A 2WKGA 3WMCA 1JDCA 2PF0A 1IZKA 1UD5A 2VT0A 4M24A 2ZUVA 4ACZA 3SCWA 3L4UA 1EDGA 5CG0A 1VEMA 2J8GA 1CGYA 5BRPA 2QPSA 4QLKA 5CQ1A 4JL2A 1GOWA 2IXVA 1KBBA 2EPLX 2WW5A 3L4WA 3CUJA 1LG1A 1RD6A 1NOWA 3OGSA 1PAMA 3I3DA 4DM2A 1BGGA 4J3VA 5ABEA 3GZAA 4UFMA 1XD1A 1RP8A 4IPNB 4PTVA 4W5ZA 9CGTA 1M7XA 2VQUA 4PMUA 3AZSA 2WMJA 4PYSA 3AS2A 3S6TA 1CGVA 1M03A 4QP0A 3WUGA 3W37A 1KBKA 1V6VA 2E9MA 2IXUA 3EYPA 1UQYA 1GOKA 3WD2A 1E72M 2VX7A 5HPOA 5LA1A 4C7FA 1E3ZA 2ZXBA 3GM8A 4XV0A 2FH8A 4PSPA 3AROA 3CGTA 4MJ2A 2YLAA 3CZEA 3L4YA 3RDKA 4AZ6A 1K6AA 4YHGA 1UKPA 4OJYA 4GIAA 4R27A 2UY3A 3FHQA 1AMYA 3DHUA 3WQ8A 4AZGA 3M6DA 3OZPA 7CGTA 4CU8A 1UA7A 3W25A 3W4RA 2A3AA 1EDTA 1H49A 4CKQA 3JUGA 3WD1A 1JAEA 5D8WA 1E0VA 4IISA 1LF1A 1PBGA 1F4HA 4J27A 3SCVA 1JYVA 4P7RA 3SCOA 5E6ZA 1UH2A 2D3NA 3B9AA 4W88A 1EOKA 4KGLA 2J78A 1HKKA 3SCTA 4CN6A 3WUEA 1KGXA 3F5LA 2BHYA 2FHFA 2VOTA 4CU6A 4JL1A 4J3TA 1MQRA 4ZE5A 2FGZA 1H4PA 1LWJA 3CUIA 1QI4A 3VM5A 2Q8XA 1E6RA 1H0IA 1PX4A 3VNZA 4IUGA 4GI6A 1JXKA 3AS1A 5ABFA 1XYFA 1UA3A 2HISA 4R5EA 1K9EA 5I0DA 1UWIA 4F66A 1J0KA 3EMQA 3WF0A 1UR4A 1PZ3A 5A1AA 4PMQA 5A6BD 4V2XA 5CGMA 3WH8A 2OSWA 3NSMA 2VX4A 1VEOA 3MV01 3NCOA 4KH2A 2G41A 2WB5A 3VDBA 2WPGA 1XGZA 4WKHA 4FK9A 1TCMA 4HA4A 3W27A 4CUCA 6A3HA 3IJ7A 1KCLA 4GKLA 2YL8A 1TVNA 1JYWA 5E0CA 4DWSA 1NWUA 4LXFA 4TOQA 1JFXA 2JF6A 3G6MA 5BROA 1E0XA 3CUHA 2XFYA 1WDPA 1B3ZA 1YHTA 1US2A 4AZ5A 3ZO9A 3B9DA 5A8NA 1UWRA 5I77A 2XUCA 3NYDA 3WH9A 5BYWA 3ZJ7A 4UFKA 4IM4A 2FHBA 1A47A 5EBAA 1ZBKA 3ZR5A 5FKYA 4U31A 3ARVA 3QR3A 2HVMA 4M1RA 1Z32X 2GSJA 4W87A 1O7AA 3UESA 5DF0A 4CGTA 1ZB5A 1ZJAA 1UG6A 2XYLA 4MNJA 3PZ9A 1V03A 2V5CA 3D3AA 2VR4A 3OLIA 1EO5A 1X6NA 2VI0A 1NP0A 2CNCA 3VGBA 1BQCA 2CBIA 3K4AA 2ZIDA 3BAIA 1ISWA 2D1ZA 4U33A 1JDDA 4W7VA 1KR0A 1VEPA 3MSDA 1A3HA 4EKJA 2GDVA 3MUAA 3SCRA 5D9MA 3VINA 3I3EA 2EEXA 3OLDA 5I2UA 1ITXA 4P7QA 2J8FA 1JZ2A 3OZOA 3SEPA 1CGWA 3THDA 1QBBA 2VZSA 1ISVA 1UYQA 4AW7A 1U33A 2YIHA 4P8XA 1L0PA 1KXTA 3GYCA 1XSKA 1KR1A 1KQYA 1IT0A 1HP4A 3PZIA 3PTQA 2WSKA 5BXRA 4B9ZA 4D6EA 2WVSA 3AIWA 4WKFA 5FD0A 4W8AA 3ZR6A 1LJYA 2XVGA 2XSAA 2J79A 2GDUA 1VFOA 3ZSSA 4DM1A 2ZUTA 3RIKA 2WNWA 3W82A 3VPLA 1DWAM 2VX5A 4QDMA 2D2OA 4D6HA 3FW6A 2DIJA 2VCBA 1M53A 2BV9A 2WC4A 4HZ7A 4XZWA 2YDRA 4B16A 1AQHA 4MNKA 3VUPA 1UWSA 1JZ8A 5GNXA 1V3IA 3T08A 1OIMA 3AIBA 1HJVA 2V3FA 2QV4A 3IJ9A 2F61A 2OYKA 2NT0A 1B3XA 4MTVA 3WD3A 2XIBA 4H04A 1E15A 3T0BA 1PX8A 3BCFA 5IDIA 3FAWA 5D9NA 1DEDA 2CPUA 1HKIA 2VRJA 1G9HA 2J7EA 1JGIA 1Q6EA 1TUXA 5FCZA 2WVVA 3NIYA 4URIA 1G1YA 1GOOA 1YQ2A 1ZBVA 1J12A 4UQ9A 1ZU8A 2QPUA 3HMCA 2BVTA 3U7BA 4FLRA 1W9DM 2Z1KA 2QMJA 1CYGA 2XGBA 4UQCA 2E8ZA 5DT7A 3VNYA 4A4AA 1F4AA 1W9PA 3AQUA 2GK1B 1UD3A 1UR0A 3SUVA 4UFJA 1VRXA 1V3LA 1WDSA 4DUWA 3AIUA 4P7OA 3WMSA 2WXDM 4M80A 3W38A 1BYBA 3OGVA 3VIMA 4AEEA 1W3KA 1J10A 1UWQA 1RP9A 1XC6A 4MPKA 3SIMA 1B9ZA 3BGAA 4HU0A 4JFVA 2J7GA 1PPIA 3ZMRA 4PMZA 3BSHA 4KWUA 3VD5A 3K8LA 1XH0A 1KQZA 5LA2A 1R87A 3ZT7A 3VTRA 1GHSA 1E56A 1XV8A 1OGBA 1GVYA 2X1IA 3BAJA 2BVYA 2CHOA 1UR2A 2AMGA 2W66A 1P6WA 3PZVA 4UCFA 3ARUA 5A2CA 4WSJA 1EOMA 2O9RA 3GH5A 3W29A 3WDQA 2CITA 3WFZA 1UHVA 3WNOA 4Z2LA 4W7UA 1CGUA 2VZOA 1I75A 3U7VA 4PBGA 3II1A 4HOXA 4YN5A 5I24A 3WNPA 1GQIA 2E4TA 4FMVA 3AZTA 3W6MA 1C90A 2CIPA 3MUY1 1EHAA 4UQDA 4OOUA 1TMQA 3M07A 1WKYA 4OBRA 1E0WA 4NRRA 3IAQA 4N42A 3AS0A 1H1NA 2WC7A 2YJQA 3ARSA 5CLTA 3WQ5A 5I5RA 1JFHA 3POCA 2PI6A 5JIPA 4JKLA 3WNLA 2G3JA 1KXQA 2VZTA 3WUBA 3WBEA 4A3YA 3B9EA 3WH7A 1GOIA 4GPNA 1C8YA 5M17A 4UR9A 1E40A 3D5HA 1CNVA 3VGHA 1WDQA 5JBFA 1OGSA 1NH6A 3F4VA 1J18A 1XYZA 3SCSA 3UG5A 2VCCA 2F8QA 5CPSA 3EDEA 1DWHM 1MW0A 2DPEA 3EDKA 5EMYA 3MUZ1 1WP6A 1M04A 3WN6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HXJ A;  3F5J A;  4Z2I A;  4D6D A;  5CGT A;  1ZL1 A;  3G6L A;  3VGG A;  2JFE X;  1XH1 A;  3PTK A;  2VMF A;  3N9K A;  4JFT A;  3ARZ A;  1OCQ A;  3AS3 A;  4CU7 A;  4MB3 A;  2E8Y A;  1JZ7 A;  1CXF A;  4F9J A;  4DUX A;  2J62 A;  1EGZ A;  1V0M A;  1E6X M;  2WMG A;  1V0K A;  2E9L A;  4PEE A;  2OSX A;  1UR1 A;  1V6U A;  4JFS A;  4BQ3 A;  1MW2 A;  5BCA A;  2EPK X;  3VDA A;  1HJU A;  1BFN A;  1JYX A;  4W89 A;  5A8O A;  1EDQ A;  4W8B A;  2PWH A;  3AMD A;  4IPL A;  1ISX A;  4UZS A;  3GXD A;  4TXE A;  3TTY A;  1R7O A;  3ZT5 A;  4Q7N A;  5GNZ A;  3OB8 A;  4J3X A;  1LL7 A;  1VAH A;  2WMH A;  5BXT A;  4AWE A;  2YLL A;  4OBS A;  1BTC A;  3VGF A;  3HN3 A;  1XSI A;  3FY1 A;  3AIV A;  2ZX9 A;  3HU7 A;  5JBE A;  3N04 A;  3RM8 A;  2EPO A;  1E6Z A;  2X8R A;  4J3U A;  5D4Y A;  4BA0 A;  1PIG A;  4UOQ A;  3A4A A;  2VJX A;  1FH9 A;  4LX4 A;  4M8U A;  1BYA A;  1FP8 A;  1WE5 A;  3CHC A;  1HVX A;  1QI3 A;  5I6S A;  3NSN A;  2DT2 A;  1M01 A;  3GH4 A;  3CH9 A;  1UR8 A;  2D3L A;  1E9L A;  1SMD A;  5A8M A;  3WMB A;  1LG2 A;  1C92 A;  3A4X A;  1B0I A;  4ZXO A;  4V27 A;  1K9D A;  4KMQ A;  1BHG A;  5A2B A;  3J7H A;  3N1A A;  4WF7 A;  2WMI B;  4JHO A;  1C7S A;  1B30 A;  3GTN A;  3UEQ A;  3A4W A;  1JNE A;  1V0L A;  1X6L A;  3K8M A;  3OBA A;  3N17 A;  1BGA A;  1J0Y A;  3QHM A;  4NI3 A;  2WAN A;  3GBE A;  4GZI A;  2W62 A;  4JKM A;  1R86 A;  2WC3 A;  2VNC A;  1Q6G A;  5A6K A;  2VC9 A;  4J7R A;  2GJX B;  3AMC A;  2V3G A;  2VUR A;  4UFL A;  1J9Y A;  1ECE A;  2W5F A;  4TVC A;  3MO4 A;  3ARP A;  1OT2 A;  1UZ1 A;  1HJX A;  5C8B B;  3AHY A;  4AIO A;  1DWG M;  5KZ6 A;  4ACY A;  2BHZ A;  2E3Z A;  3I3B A;  1VBR A;  3WKZ A;  5DFA A;  1CPU A;  4QCF A;  2X05 A;  3DHP A;  2NT1 A;  5LYR A;  4TX6 A;  4LYR A;  3DEC A;  1OT1 A;  1E4M M;  3SUU A;  4XZB A;  2CCR A;  1E1F A;  5FIP A;  3VKK A;  4AD0 A;  2PBG A;  3S2C A;  1E4N A;  1BSI A;  1NWR A;  3AML A;  2UY2 A;  1OIN A;  2W67 A;  5AY7 A;  1KGW A;  1CLV A;  1U2Y A;  3TA9 A;  2YBU A;  4D72 A;  1MXD A;  5JBD A;  2PC8 A;  1EO7 A;  2D0F A;  2J47 A;  2YL5 A;  3QGV A;  1VB9 A;  2ZX8 A;  1JYN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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